Bioloogia SKT kordamisküsimused 1. Rakubioloogia ajalugu: nimeta 3 olulisemat isikut ajaloos ja kirjelda lühidalt nende
panust Robert Hooke aastal 1665 (ajakirjas
Micrographia) alustas sõna cel a ('kambrike')
kasutamist,
Antoni van Leeuwenhoek Alates
1674 esimesed
mikroskoobid , avastas suu- ja
soolebakterid , ainurakseid ja
spermatosoidid .
Matthias Schleiden väitis 1838, et kõik taimed koosnevad rakkudest.
Theodor Schwann väitis 1838-39, et kõik loomad koosnevad rakkudest. Avastas
rakumembraani ja Schwanni
rakud Louis Pasteur 19. sai töötas välja pastöriseerimise, vaktsi ni
marutõve, Siberi katku
vastu
Karl Ernst von Baer kirjeldas 1827 esmakordselt
imetaja munarakku
2. Molekulaarbioloogia ajalugu: nimeta 3 olulisemat isikut ajaloos ja kirjelda lühidalt Gregor Mendel - 1865 - Mendeli geneetilise pärilikkuse seadused
- Esimene Mendeli seadus ehk ühetaolisusseadus - Kahe homosügootse isendi ristamisel
on järglaspõlvkonna isendid geneetiliselt sarnased.
- Teine Mendeli seadus ehk lahknemisseadus - Ristades heterosügoote tekib
järglaspõlvkonnas ni genotüüpiline kui ka fenotüüpiline
lahknemine .
- Kolmas seadus ehk Sõltumatu lahknemise seadus - Kaks tunnust (geeni) päranduvad
üksteisest sõltumatult.
- Dominantsuse seadus
Hugo de Vries mutatsiooniteooria
- Uurides taimi leidis, et võivad tekkida uued päritavad tunnused (
mutatsioonid )
Thomas Morgan ja kromosoomiteooria
- Uurides Drosophilat avastas, et
kromosoomid on pärilikkuse aluseks
Friedrich Miescher ja DNA
- Avastas 1869 aine mil e nimetas nuclein. Hiljem hakati kutsuma nuklei nhappeks
3. Nimeta elusrakkude üldprintsiipe ● Kõik rakud säilitavad oma pärilikkuse informatsiooni DNA kujul lineaarse geneetilise
koodina
● Kõik rakud taastoodavad pärilikkusainet (ja sel es olevat informatsiooni)
matri tssünteesi abil
● Kõik rakud transkribeerivad oma pärilikkuse informatsiooni RNA kaudu
● Kõik rakud transleerivad RNA valkudeks kasutades sama printsi pi
● Kõik rakud koosnevad sarnastest “ehitusblokkidest“ (nukleoti did,
aminohapped ,
rasvhapped ● Kõik rakud kasutavad funktsionaalsete ülesannete täitmiseks valke
● Kõik rakud vajavad eluks energiat
Kõik rakud on kaetud rakumembraaniga
4. Prokarüootse ja eukarüootse raku peamised tunnused ja erinevused
Prokarüoot Sarnasused Eukarüoot Puudub
rakutuum -
Ühised on umbes 200
Geneetiline informatsioon
geneetiline informatsioon
geeniperekonda
asub
suuremal määral katte
koondunud peamiselt
prokarüootide ja
poolt ümbritsetud
nukleoidi
eukarüootide vahel.Olemas
tuumas.(ka mitokondrites)
geneetiline info, rakud
Membraanseid struktuure
jagunevad, toodavad ja
Biokeemilised protsessid
(v.a.
membraan ofc) ei leidu. tarbivad energiat, toimuvad toimuvad ni tsütosoolis kui
Biokeemilised protsessid
biokeemilised protsessid.
ka spetsialiseerunud
toimuvad tsütosoolis
organel ides (i.e
mitokonder )
Mõlemal on
ribosoomid , mis
Suur kohanemisvõime
osalevad valkude sünteesis. Reeglina rohkem
(peamiselt tänu
diferentseerunud rakud -
plasmi didest tingitud
seega
vähenenud võime
geenide ülekandest).
kohaneda erinevates
keskkondades.
Suhteliselt väike
genoom -
Genoom tunduvalt suurem
ligi 1000-6000 geeni.
ja komplekssem - ligi 25 000
geeni.
Lihtsa struktuuriga, aga
Raku ehitus on keeruline.
suure biokeemilise
variatsiooniga.
Tsütoplasma on jäik.
Tsütoplasma on li kuv.
Iseloomuliku kuju annab
tsütoskelett .
Bakterid ja arhed.
Ainuraksed , taimed, seened,
loomad.
5. Raku tuum ja tuumamembraan Tuum on geneetiline komponent, mis koosneb tuumakattest ja karüoplasmast e
tuumaplasmast, mis sisaldab kromati nainet, mil est moodustuvad kromosoomid.
Kromosoomid koosnevad põhiliselt
DNAst ja valkudest.
Tuumas toimuvad D
NA
replikatsioon , g
eenide r
egulatsioon j a t ranskriptsioon. Enamik D
NAst
on
rakutuumas kromati ni kujul. Kaetud tuumamembraaniga, mil es on tuumapoorid.
Akti vsetel rakkudel moodustunud RNA rikas ala –
tuumake , nukleool. Tuumaskelett toetab
tuuma struktuuri. Tuumas on p
alju s
truktuure, m
il e kohta e
i o
le p
i savalt i nformatsiooni: PML
kehad, Cajal kehad, splaisingu speklid.
Tuumaümbrise e tuumakatte moodustavad
välismembraan ja sisemembraan ning nende
vahele jääv perinukleaarruum. Tuumaümbrises paiknevad
poorid , läbi nende toimub
makromolekulide li kumine tsütoplasmasse ja vastupidi. Välismembraan on otseselt seotud
endoplasmaatilise reti kulumiga ning sisemembraanile kinnituvad interfaasi kromosoomid.
Tuumas võib eristada eu- ja heterokromati ni.
6. Kirjelda rakutsüklit ja mitoosi
Rakutsükliks nimetatakse raku eluringi mitoosi lõpust läbi interfaasi kuni järgmise mitoosi
lõpuni. Tsükliks kuluvat aega nimetatakse generatsiooniajaks, mis on erinevatel
organismidel väga erineva pikkusega.
Rakutsükkel koosneb interfaasist (G1-, S- ja G2-
periood), mitoosist ja tsütokineesist.
G1-periood – presünteetiline periood, kus toimub ettevalmistus DNA sünteesiks,
rakk kasvab
ja toodab ekskretoorseid aineid.
S-periood – sünteesiperiood, kus toimub DNA replikatsioon, kromosoomivalkude süntees ja
tsentrosoomi duplikatsioon.
G2-periood – postsünteetiline periood, kus sünteesitakse peamiselt käävimaterjali ja
mitoosiks vajalikku ATP-d.
Mitoosi teel jagunevad organismide
keharakud . Sel e tulemusena tekib kaks tütarrakku, mis
erinevad eel asrakust vaid mõõtmete poolest. Mitoosi
eelduseks on, et interfaasi
sünteesiperioodil (S) toimub DNA replikatsioon ning moodustub igas kromosoomis teine
kromati d. Tähtis on ka raku käävisüsteemi valkude süntees ja tsentrosoomi pooldumine
enne mitoosi algust.
Mitoos koosneb profaasist, metafaasist, anafaasist ja telofaasist.
Profaas :
· algab kromosoomide
kondenseerumine (keerduvad kokku st. lühenevad ja tihenevad),
mis tagab kromosomaalse aine täpse jaotumise tütarrakkudesse.
· kaob tuumake ja tuumakate laguneb + tsütoskeleti osaline
lammutamine .
· Lagunenud tsütoskeleti osadest moodustatakse käävisüsteem (
mikrotorukesed +
nendega seotud
valgud )
· käävisüsteemi
moodustumise organiseerivad 2 tsentrosoomi, mis li guvad raku
poolustele .
· tsentrosoomid koosnevad loomsetel rakkudel 2 tsentrioolist ja neid ümbritsevast
peritsentriolaarsest materjalist.
· tsentrosoomide baasilt toimub tubuli ni polümerisatsioon=mikrotorukeste moodustumine.
· mikrotorukeste kimbud ehk käävini did paiknevad raku kesktasapinna suunas, kuhu
li guvad ka kahekromati dilised kromosoomid.
· profaasi lõppu nimetatakse prometafaasiks.
Käävisüsteem:
· Kinetohoorsed käävini did – kinnituvad kinetohooridele (ala kromosoomide kromati dide
tsentromeeride läheduses)
· Käävini did, mis kinetohooridele ei kinnitu jagunevad:
o pikad käävini did - polaarsed ehk mittekinetohoorsed käävini did
o
lühikesed käävini did – moodustavad astri ümber tsentrosoomi
Metafaas :
· sel e alguseks on kromosoomid maksimaalselt lühenenud
· kromosoomide tsentromeeripi rkonnad on li kunud raku kesktasapinnale – moodustub nn.
metafaasiplaat
· iga kromosoomi kinetohoorile on kinnitunud poolustelt lähtuvad mikrotorukesed.
Anafaas :
· algab, kui kromosoomi paarilised
tsentromeerid eralduvad teineteisest, käävini did
hakkavad kinetohoori baasilt lühenema (tubulin laguneb) ja tütarkromati did (tegelikult
ühekromati dilised kromosoomid) li guvad, tsentromeer ees, raku eri poolustele.
· Mittekinetohoorsed mikrotorukesed venitavad rakku piklikumaks.
· Sel e lõpuks on poolustel täielik kromosoomide komplekt.
Telofaas :
·
Rakk muutub veel piklikumaks, et saaksid hakata moodustuma uued tuumakatted
(sel eks kasutatakse vanemraku tuumakatte fragmente ja endoplasmaatilise reti
kulumi osi)
· Tekib 2 geneetiliselt identset tuuma, moodustuvad tuumakesed ja kromosoomid
dekondenseeruvad.
· Sel ele järgneb
tsütokinees :
o raku tsütoplasma jagunemine ja kahe
tütarraku teke.
o loomsetel rakkudel-
§ toimub sissenöördumise teel
§ seda protsessi vi vad läbi akti nist
mikrofilamendid (pindmine osa
tsütoskeletist)
o taimsetel rakkudel –
§ tsel uloosse rakukesta tõttu on tsütokinees oluliselt erinev.
§ telofaasi ajal Golgi kompleksis tekkinud vesi kulid li guvad raku
kesktasapinnale ja li tuvad nn rakuplaadiks.
§ rakuplaat suureneb kuni on moodustunud kaks iseseisva
plasmamembraaniga tütarrakku.
§ edasi toimub tsel uloosi ladestamine ja rakukesta teke.
7. Matriitssünteesid
Matriitssüntees – geneetilise info edasikandmine. Molekulaar-bioloogi klassikaline
põhidogma väidab:
● DNA – DNA ehk DNA taastoodab ennast (replikatsioon)
● DNA – RNA ehk DNAst sünteesitakse RNA (
transkriptsioon )
● RNA – valk ehk
RNAst sünteesitakse valk (
translatsioon )
Vi rustes on võimalik ka info kandumine RNAlt DNAle pöördtranskriptsioon ning RNAlt
RNAle – RNA replikatsioon
Info on struktuursetes ühikutes ehk geenides. On vaja alguspunkti, praimerit või promootorit
– oleneb kas DNA või RNA
8. Kirjelda DNA ja RNA koostisosasid ja nende vahelisi keemilisi sidemeid ,
lämmastikalused, nukleosiidid, nukleotiidid DNA ja RNA on nukleoti dide polümeerid. DNA sisaldab valkude sünteesiks vajalikku
informatsiooni, mis on geenides. RNA on vajalik valkude tootmiseks.
DNA: lämmastikalused - A adeni n, G guani n, C tsütosi n, T tümi n, suhkrujääk
desoksüriboos , fosforhappejääk
RNA: lämmastikalused - A adeni n, G guani n, C tsütosi n, U uratsi l, suhkrujääk
riboos ,
fosforhappejääk
Sidemed: lämmastikaluse ja suhkru vahel on glükosi dne side, nukleoti dide vahel on
fosfodiester sidemed, vesinikside on H ja O vahel – mis kaob esimesena kuumutamisel.
DNA
paardumine vesiniksidemete abil: A ja T → kaksikside; G ja C → kolmikside.
Nuklei nhapete ehituskomponendid (
monomeerid )
● puri n- ja pürimidi nalused. Inimorganismi nukleoti dides e
sinevad p
uri ni j a pürimidi ni
põhiderivaadid on adeni n, guani n, tsütosi n, uratsi l ja tümi n.
● Nukleosi did = alus + suhkur. Need on puri n- või pürimidi naluse ja pentoosi
kompleksid.
● Nukleoti did = alus + s
uhkur +
1
-3 f osfaatrühma. N
ukleoti did o
n n
ukleosi dide
mono -,
di- või trifosfaaterid.
Nt: N-alus → adeni n. Nukleosi d → adenosi n. Nukleoti d → AMP. ADP. ATP.
N-alus → guani n. Nukleosi d → guanosi n. Nukleoti d → GMP, GDP. GTP.
9. Võrdle RNA ja DNA struktuuri
DNA struktuur RNA struktuur kaheahelaline
üheahelaline
DNA on paremale pöörduv kaksikheeliks
RNA on üheahelaline ja vähem stabi lne
mil e
ahelad on antiparal eelsed ja
komplementaarsed.
Lämmastikalusteks on A, T, G, C.
Lämmastikalusteks on A, U, C, G.
Monosahhari diks on desoksüriboos
Monosahhari diks on riboos.
Mõlemal nukleoti did seonduvad üle suhkru ja fosfaatrühma ni - 1) esimese nukleoti di
suhkru 5`C juures asetseb vaba
fosfaatrühm . 2) Sama nukleoti di 3`C juures
asetseva OH
juurde seotakse järgmise nukleoti d tema fosfaatrühma kaudu. Moodustub suhkur-
fosfaat selgroog. Looduses sünteesitakse DNA alati 5-3 suunas
Mõlemad on polümeersed makromolekulid, mis kuuluvad nuklei nhapete klassi.
10. Mis on DNA superspiralisatsioon?
Superspiralisatsioon (superkeerud) on DNA
tertsiaarstruktuur ja on vajalik, et DNAd
võimalikult kompaktselt kokku
pakkida . Tekib ainult si s, kui DNA
otsad on fikseeritud
topograafiliselt – kas DNA rõngasmolekul v
õi l ineaarsed, m
il e o
tsad o
n f ikseeritud v
alguliste
struktuuridega.
DNA supraspiralisatsioonil osalevad
ensüümid , mida nimetatakse topoisomeraasideks
(tekitavad DNA kaksikahelasse katkeid; lõdvestavad või pinguldavad DNA kaksikheeliksit).
● Positi vne spiralisatsioon – kui
keerdumine on samas suunas
heeliksi suunaga
(paremale), tekib tihedam DNA struktuur.
● Negati vne spiralisatsioon – kui keerdumine on vastassuunas (vasakule), tekib
lõdvem DNA struktuur.
11. Genoomid. Võrdle bakteri ja inimese genoomi
Genoom - organismi kõigi kromosoomide DNA. Organismi terviklik kromosoomikomplekt.
Geneetilise info terviklik koopia.
Bakteri genoom
Inimese genoom
Suhteliselt väike g
enoom. Suurus 10astmes Reeglina suur genoom.
Genoomis on
6- 10
astmes 7 nukleoti di.
geenidele lisaks palju mittekodeerivat
DNA-d
-
ca
98%
genoomist
on
mittekodeeriv (aka “
junk DNA”). Suurus
(DNA
pikkus)
on
3
x
10’9
alusnukleoti dipaari. Lisaks nukleaarsele
DNA-le esineb ka
mitokondriaalne ja
kloroplastide DNA. Genoom on pakitud 23
paarilisse
kromosoomi.
Suure
osa
genoomist moodustavad kordusjärjestused.
Genoom koosneb ühtest või mitmest
Kromosoom on
lineaarne.
Pakitud
tsirkulaarsest kromosomoomist. Ei ole kromati niks.
pakitud kromati niks.
Sisaldab 1000 - 6000 geeni.
Sisaldab 25 000 geeni.
Genotüüp on haploidne, st. genoom on Genotüüp on diploidne, st. genoom on
esindatud ühe koopiana (iga viga, mis esindatud kahe koopiana. Geen on rakus
kromosoomiga
tekib,
satub
koheselt olemas kahe al eelina.
loodusliku valiku al a).
Pole histoone v.a. arhedes
DNA
kromati n
koosneb
peamiselt
histoonist.
12. Kirjelda eukarüootse (ka inimese) raku kromatiini struktuuri.
Kromati n on DNA-st ja valkudest koosnev pakitud
kompleks , mil est moodustuvad
kromosoomid. Kromati ni al mõistetaksegi rakutuumas olevat DNA-d, mis on seotud
valkudega. DNA-ga
seonduvaid valke on
laias laastus kahte sorti: struktuursed ja
regulatoorsed.
Kromati ni koostises olevad valgud jaotuvad kahte suurde klassi:
1.
Histoonid -
aluselised valgud. (neutraalse pH juures posti ivselt laetud).
2. Mittehistoonsed kromosoomivalgud - tugevalt
happelised valgud (neutraalse pH
juures negati vselt laetud).
Struktuur (kondenseerumise astmed):
Kromati ni struktuur rajaneb järjestikulistele DNA kokkupakkimise tasanditele. Eukarüootne
kromati n koosneb enamjaolt DNA-st ja histoonidest. Ümber histoonide
keerdunud DNA-d
nimetatakse nukleosoomiks, mis on kõige lihtsam DNA kokkupakkimise ühend.
DNA nukleosoomne struktuur - iga 2
00 n
ukleoti di p
ikkuse D
NA lõigu kohta o
n moodustunud
1 nukleosoom, mis sisaldab 146
aluspaari . Nukleosoomid on ühendatud linkeraladega.
Linkeralade pikkus võib varieeruda ni li
giti kui ka erinevates rakutüüpides li gisiseselt.
(varieerub 8 aluspaarist 114-ni).
13. Mis on histoonid, oktameer, nukleosoomid
Histoonid
struktuurselt tugevalt aluselised valgud, suure hulga positi vselt laetud
aminohapetega. Osalevad kromosoomide DNA kokkupakkimisel ja geenide
akti vsuse
regulatsioonil .
Histoone on 5 tüüpi mis jagunevad 2 rühma:
1) nukleosoomsed histoonid (H2A, H2B, H3, H4 - osalevad nukleosoomi
moodustamises);
2) histoon H1 -
seondub linker-DNA-ga.
Need valgud on erinevatel li kidel väga sarnased ja esinevad peaaegu igas
rakutüübis, välja arvatud spermatosoidid- seal on asendatud protami nidega
Oktameer
histoonidest moodustunud nukleosoomi südamik, mis koosneb kahest H2A-H2B
dimeerist ja H3-H4 tetrameerist. Nad on DNA- ga spetsi filiselt seotud, m
oodustades
nukleosoome
Nukleosoomid
oktameer + 146 DNA nukleoti dipaari. Eukarüootse kromati ni sfäärilised üksused,
mis koosnevad põhipartiklist ja sel e ü
mber k
eerdunud 1
46-st D
NA nukleoti dipaarist.
Koosneb 8 histooni valgust, mil e ümber on keritud 146 aluspaari pikkune lõik DNA
kaksikahelast.
14. Kuidas toimub DNA replikatsioon? Kirjelda replikatsiooni protsessi suundi ja
osasid. Tee joonis.
DNA replikatsiooni käigus sünteesitakse ühest DNA m
olekulist k
aks ühesuguse n
ukleoti dse
järjestusega DNA molekuli. DNA replikatsioon on ki re protsess: sünteesi käigus lisatakse
eukarüoodi rakus 3000 nukleoti di
minutis (bakteris võib
ulatuda 30000 nukleoti dini minutis)
DNA replikatsioon on ka erakordselt täpne protsess: ni prokarüootide kui eukarüootide
replikatsioonil tekkiv viga on umbes 1 nukeoti d 109 nukleoti di k
ohta –
see t eeb 3 n
ukleoti di
inimese genoomi kohta ühes rakujagunemises.
DNA replikatsioon on poolkonservati vne – see tähendab, et replikatsiooni käigus
sünteesitakse (kopeeritakse) mõlema vanemahela pealt uus komplementaarne tütarahel.
Sünteesi käigus lisatakse desoksüribonukleosi d trifosfaate, lühendatult dATP, dGTP, dCTP
ja dTTP.
Lisamise käigus lõigatakse ära 2 fosforhappejääki ja DNA ahelasse li tub
desoksüribonukleosi d monofosfaat, lühendatult dAMP, dGMP, dCMP, dTMP. Süntees on
alati 5’-3’ suunas. Uue nukleoti di suhkrujäägi 5’ ots li detakse eelmise nukleoti di 3’ otsaga
fosfaatjäägi kaudu.
Samaaegselt toimub DNA lahtikeerdumine ja replikatsioon. O
ri-
regioonid o
n alati A
-T r
ikkad,
praimeriks DNA või RNA või valguga seondunud nukleoti did, praimerit on vaja sel eks, et
polünukleoti dahelal oleks vaba 3-OH ots, kuhu DNA-
polümeraas saaks li ta nukleoti de.
15. Milline ülesanne on replikatsioonis helikaasidel ja topoisomeraasidel
Helikaasid - ensüümid, mis vastutavad DNA k
aksikheeliksis v
esiniksidemete l õhkumise e
est
aluspaaride vahel
Topoisomeerid - ensüümid, mis leevendavad torsiooni jõude sinna katkeid tehes (et nö
pinge välja lasta). Kõrvaldab superspiraale ja soodustab DNA kaksikahela lahtikeerdumist.
16. Mis on replikon? Replikon on replitseerunud DNA-
segment , mis o
n lähtunud ühest a
lguspunktist (
koht, m
is o
n
läbi teinud replikatsiooni ehk koht, kust algab kaksikahelalise DNA lahtiharutamine). Hiljem
li detakse kõik replikonid tagasi kokku. Replikatsiooni ajal on inimese kromosoomides kuni
10 000 replikoni.
17. Kirjelda replikatsioonikahvli liikumist
Struktuur, mis moodustub sünteesilookuse juures, kus kaheahelaline DNA läheb üle
üheahelaliseks, kannab
nimetust replikatsioonikahvel. Replikatsioonikahvel li gub ahela
sünteesiga samas suunas, alati suunaga 5’-3’ e
hk n
ukleoti de l isatakse ainult k
asvava a
hela
5’ otsa. Replikatsioonikahvli ette tekib positi vne superspiraal,
kahvli taha tekib negati vne
superspiraal.
DNA süntees alati 5’ – 3’
suunaline . See tähendab, et :
·
Juhtival DNA
ahelal (li derahel) (
leading strand) toimub DNA süntees järjepidevalt, t eda
pikendatakse järjepidevalt. Süntees 5’-3’ suunas.
· Mahajääval ahelal(vi visahel) (lagging strand) toimub DNA süntees katkendlikult, teda
saab pikendada RNA praimerite ja spetsiaalse ensüümi praimaasi abil. Süntees toimub
3’-5’ suunas (
fragmendid sünteesitakse 5’ - 3’ suunas).
18. Kuidas sünteesitakse liiderahel ja viivisahel
Li derahela sünteesimine
katkematult 1 praimeriga
Vi visahela sünteesimine
DNA praimaas sünteesib DNA järjestuse pealt
lühikese RNA praimeri.
DNA polümeraas jätkab DNA sünteesi- moodustub Okazaki fragment.
Eesolev RNA
praimer asendatakse DNA-ga.
Okazaki
fragmentide katkekohad li detakse DNA
ligaasi abil.
19. Mis on Okazaki fragment ja millest ta koosneb? Okazaki fragmendid on lühikesed DNA fragmendid, mis tekivad sünteesi tagajärjel
vi visahelal. Koosneb RNA praimerist ning järgnevast DNA polünukleoti dist. Need
lõigud li detakse DNA ligaasi poolt ja saadakse teine DNA ahel.
20. Milline ülesanne on DNA praimaas ensüümil? Mida teeb replikatsioonis DNA
ligaas ?
DNA praimaas sünteesib DNA järjestuse pealt lühikese RNA praimeri, et sünteesida
vi visahelat. Praimaasi töö tulemusena moodustub DNA-RNA hübri dahel, kus uuesti
sünteesitud RNA aluspaarid on seotud DNA aluspaaridega vesiniksideme kaudu.
DNA ligaas aitab li ta Okazaki fragmentide katkekohtasid.
Praimaas jätab 3` OH
otsa vabaks
21. Kirjelda DNA polümeraasi tööd ja sünteesi suundi. Millised DNA polümeraasid
esinevad inimeses?
DNA polümeraas -
ensüüm , mis sünteesib DNA
ahelale komplementaarse DNA ahela.
Polümeraas vajab sünteesil praimerit, mis on
paardunud matri tsahelaga. Sel eks, et DNA
reprodutseerimise käigus ei tekiks vigu, on DNA polümeraasil lisaks sünteesi funktsioonile
ka korrigeeriv akti vsus, mil e tulemusena ensüümi töö täpsus tõuseb mitu suurusjärku (1
viga 0
1 8 nukleoti di kohta).
Sünteesiks on vajalik vaba 3’OH otsa olemasolu, süntees toimub 5’-3’ suunas. Inimesel on
13 erinevat DNA polümeraasi, neist olulisemad on α, β
, δ
, ε
. D
NA p
olümeraas γ on v
ajalik
mitokondriaalse DNA sünteesiks.
22. Mis on telomeerid ja kuidas töötab telomeraas ? Telomeerid asuvad kordusjärjestustena kromosoomide otstel ja lühenevad iga k
ord, kui rakk
jaguneb.
Kaitsevad kromosoome lühenemise eest (ilmselt üks vananemise põhjustest).
Telomeraas aitab sünteesida kromosoomide otsasid ehk telomeere. RNA alusel sünteesib
telomeraas 5’3’ suunas kordusjärjestusi, pikendades ni kromosoomi kui ka DNA ahela otsa.
23. DNA reparatsiooni kaks peamist mehhanismi. 1) Homoloogne rekombinatsioon (HR) - tütarkromati dilt saadud info järgi parandatakse
viga.
Puuduv DNA osa kopeeritakse vigastamata kromosoomi pealt. Taastatakse
mutatsioonideta.
2) Mittehomoloogsete
DNA otse ühendamine (NHEJ) - sel e puhul pole vaja
tütarkromati di, mil e järgi
parandust teha. DNA ligaas ühendab katkenud ahelad,
tekivad reeglina mutatsioonid.
24. Kirjelda transkriptsiooni tsükli osasid ja RNA polümeraasi tööd
Transkriptsioonitsükkel
1. RNA polümeraas ja sigmafaktor seondub promootoriga
2. DNA lahti harutamine
3.
Initsiatsioon - transkriptsioonifaktorid vahendavad RNA polümeraasi seondumist ja
transkriptsiooni initsiatsiooni, ehk al es pärast kindla transkriptsioonifaktori
ühendumist promootorjärjestusele seondub RNA polümeraas sel ele. Tulemuseks on
initsiatsioonikompleks (transkriptsioonifaktorid ja RNA polümeraas)
4. Elongatsiooni algus
5.
Elongatsioon e
pikendamine - DNA ahelalt komplementaarse RNA ahela
sünteesimine RNA polümeraasi abil
6. Terminatsiooni
signaal destabiliseerib polümeraasi- sünteesi lõpp
7. RNA eraldumine
RNA polümeraasi ehk holoensüümi töö
● RNA polümeraas katalüüsib ribonukleoti dide sidemeid
● RNA polümeraas li gub DNA
molekulil 5’ --> 3’ suunas, harutades samal ajal lahti
DNA molekuli
● Polümeraasi sünteesi ki rus on ca 20 nukleoti di per sekund
● RNA sünteesi saab indutseerida ilma praimerita.
● Eukarüootses rakus on kolm RNA polümeraasi, mis transkribeerivad erinevaid geene
25. Millised erinevad RNAd on olemas. Nimeta vähemalt 4. ●
mRNA – informatsiooni RNA (messenger RNA). Peamine RNA
molekul , mis
transleeritakse valguks.
●
tRNA – transpordi RNA (
transfer RNA). Madalmolekulaarsed RNA-d, mis on
vajalikud translatsiooni läbivi miseks.
Toimivad adapteritena mRNA
koodonite ja
aminohapete vahel.
●
rRNA – ribosoomi RNA (ribosomal RNA). Ribosoomi struktuuri osad, ka
funktsionaalse tähtsusega.
●
miRNA –
mikro RNA (microRNA). Väikesed, 20-25 nt. Reguleerivad geenide
avaldumist (mõjutab mRNA akti vsust ja stabi lsust)
26. Kirjelda RNA protsessingu kolme peamist osa
Esineb eukarüootides.
● mRNA esmase transkripti 5’-otsa
müts (cap),
tagurpidi RNA 7-metüülguanosi n-5’-müts. Side on 5’-5’ fosfaatside. Lisatakse elongatsioonil.
Funktsioon on kaitsta lagundamise eest (ribonukleaasid), ol a signaalmolekul transpordil
ning anda märku ribosoomile, kus on õige koht alustada translatsiooni.
● mRNA
splaissing Intronite kõrvaldamine geeni splaissingul. Teatud regioonid lõigatakse v
älja lariaat-struktuuri
abil. Eksonid - järjestuse osa, mis jääb al es.
Intronid - väljalõigatud järjestuse osad.
● mRNA polüadenüleerimine
Lisatakse
ahela
3’
otsa
polü(A)
saba
(polüadenüleerimine).
Teostatakse
polü(A)-polümeraasi abil. Funktsioon on kaitsta lagundamise eest ning ol a signaaljärjestus
translatsiooni õigeaegseks lõpetamiseks. Polü(A) saba moodustumiseks on vaja spetsi filist
3’ otsa. 3’ ots moodustub umbes 11-30 nukleoti di kaugusel AAUAAA järjestusest.
27. Millised (valke moodustavate) aminohapete rühmad on olemas? 1) Polaarsed ehk hüdrofi lsed (laenguga)(Ser,Thr,Cys,Pro) ja mittepolaarsed ehk
hüdrofoobsed (Gly, Ala,Val,Leu);
2) Happelised (neg laenguga, Glu,Asp) ja alusel sed (pos laenguga Lys,His,Arg);
3) Asendamatud ja asendatavad aminohapped(His,Val,Leu,Lys, Thr).
28. Kirjelda peptiidset sidet Pepti dside on
kovalentne side valgu molekuli ehitusse kuuluvate aminohappejääkide v
ahel.
See on neljast aatomist koosnev funktsionaalne rühm (-CO-NH-), mida nimetatakse
ami drühmaks või pepti drühmaks. Moodustub amino- (-NH2) ja karboksüülrühmade
(-COOH) kaudu. Eraldub H2O.
29. Geneetiline kood ja selle lugemine ● Geneetiline kood antakse edasi DNA triplettidena/koodonina (3 nukleoti di), mis
vastab mRNA koodonile. mRNA
koodon vastab polüpepti dahelas ühele
aminohappele . DNA triplett → mRNA koodon → üks
aminohape ● Universaalne kood eluslooduses (kuid mõningate eranditega)
● Geneetilist koodi loetakse lugemisraamis ni , et üks mRNA nukleoti d saab
kuuluda ainult ühe koodoni juurde; loetakse suuna 5’-3’, loetakse triplettide kaudu.
● Koodonite kombinatsioone on 64, aminohapped 20, seega mitu
koodonit kodeerib ühte aminohapet (v.a. Met ja Trp). Seega geneetiline kood = kogum 64 koodonist
(triplet 3 nukleoti dist), mis määravad 20 aminohapet ning translatsiooni alguse ja
lõpu.
● Paljud koodonid on sünonüümsed, ehk mitu eri koodonit võib määrata sama
aminohappe.
● Olemas on
algus- (AUG (metioni ni sünteesikoodon)) ja
lõpukoodonid (UGA, UAA,
UAG (neile ei vasta ükski aminohape ning nendeni jõudes kukub
ribosoom mRNA
molekulilt maha, nad on stop-koodonid)).
30. Kirjelda valgupeptiidi sünteesi etappe ja tRNA liikumist ribosoomis
Translatsioon on protsess, mil e käigus sünteesitakse mRNA kui matri tsilt koodi alusel
aminohapetest valgu polüpepti dahel. RNA m
olekulil o
n 3 e
rinevat f unktsiooni t ranslatsioonis
- mRNA kui geneetilise informatsiooni kandja,
tRNA kui translatsiooni protsessi l äbiviija,
rRNA kui ribosomaalse struktuuri ja funktsiooni osa.
Translatsioon jaguneb 3 osaks:
1. Translatsiooni initsiatsioon ehk pepti dahela alustamine
Translatsioon algab AUG koodoniga. tRNA seondub vastava aminohappega. mRNAs
olevale k
oodonile v
astab tRNA
antikoodon . A
minohape k
innitub tRNA 3’ otsa. I nimesel o
n c
a
500 tRNA geeni, aga nad esindavad ainult 48 erinevat antikoodonit.
2. Translatsiooni elongatsioon ehk pepti dahela pikendamine
Toimub aminohapete li tmine ahelasse. Translatsiooni elongatsioon vajab energiat, mil e
tagab GTP
hüdrolüüs GDP-ks. Kaks kesksemat elongatsiooni
faktorit on EF1 ja EF2.
Mõlemad seonduvad GTP-ga. Elongatsioon toimub ki rusega umbes 2 aminohapet
sekundis.
3. Translatsiooni terminatsioon ehk pepti dahela lõpetamine
Stoppkoodoni (UGA, UAG, UAA) esinemisel ribosoomi A-saidis ühineb sinna
vabanemisfaktor. Vabanemisfaktorid (eRF -
Release Factor ) on valgud, mis katalüüsivad
pepti dahela vabanemist ribosoomist. Nad jagunevad kahte klassi: klass 1 (RF1, RF2), ja
klass 2 (RF3). Esimese klassi vabanemisfaktorid osalevad terminatsioonis ning teise klassi
vabanemisfaktor osaleb ribosoomi taaskasutamisel. RF1 tunneb ära UAG koodonit ja RF2
tunneb ära UGA koodonit, mõlemad
tunnevad ära UAA koodonit. Vabanemisfaktor li gub
A-saiti, kus nende valguline
antikoodoni pi rkond interakteerub mRNA koodoni pi rkonnaga.
Vabanemisfaktori õnnestunud seondumisel katalüüsib ta pepti dahela vabanemist
ribosoomist.
tRNA li kumine ribosoomis:
Ribosoomil on mRNA seondumissait ja 3 t RNA s
eondumissaiti. t RNA s
eondumissaidid o
n E
ehk väljumissait (exit), P ehk peptidüülsait ja A ehk aminoatsüülsait Ribosoomi mõlemate
subühikute seondumine on vajalik tRNA seondumisaitide moodustumiseks
1. A-
sait 2. P-sait
3. E-sait - väljub ribosoomist.
31. Mis on polüsoom ?
Polüsoom on polüribosoom, mis tekib, kui ühe mRNA’ga seondub mitu ribosoomi, mis
sünteesivad sama valku.
32. Too näiteid antibiootikumidest, mis blokeerivad ribosoomi tööd
Mõjuvad ainult bakteritele -
Tetratsükliin (blokeerib aminoatsüül-tRNA seondumist
A-saitega),
erütromütsiin,
streptomütsiin,
klooramfenikool (blokeerib
peptidüül-transferaasi reaktsiooni ribosoomides)
Mõjuvad ni bakteritele kui ka eukarüootidel - Puromütsi n; aktinomütsi n D- blokeerib D
NA
polümeraasi li kumist;
Mõjub ainult eukarüootidel alfa-amaniti n - blokeerib mRNA sünteesi, seondudes
spetsi filiselt RNA polümeraasiga.
33. Kuidas toimub valgu moodustumine peale translatsiooni Valkude
konformatsioon hakkab moodustuma kohe peale sünteesi (struktuuri
moodustumine). Peale translatsiooni lisatakse valgule posttranslati vsed modifikatsioonid
(lisatakse aineid, mis määravad valgu funktsiooni). Osade valkude funktsionaalse
konformatsiooni saamiseks on vaja šaperone (tugivalgud).
34. Millised valgu posttranslatiivsed modifikatsioonid esinevad. Nimeta vähemalt 4. Peale translatsiooni lisatakse valgule posttranslati vsed modifikatsioonid. Vi mased on
kovalentne keemiline valkude modifikatsioon peale polüpepti dahela sünteesi ribosoomi
peal. Samuti, nagu alternati vne splaissing – suurendab see valkude mitmekesisust
organismis. Mõned valgud vajavad funktsionaalse konformatsiooni saamiseks
šaperone e
tugivalke – need on nt kuuma-šoki valgud Hsp60, Hsp70.
Peaahela
modifikatsioonid:
peptiidsideme lagundamine (metüoni ni N-otsjäägi
kustutamine, pi ratud proteolüüs);
väikeste keemiliste g ruppide l isamine (
N-atsetüülimine,
C-amideerimine);
hüdrofoobsete rühmade lisamine lokaliseerimiseks membraanis
(N-müristoüleerimine);
Aminohapete kõrvalahelate modifikatsioonid: glükosüleerimine,hüdroksüleerimine,
atsetüülimine, metüleerimine.
35. Mis on kuumašoki (šaperoonid) valkude ülesanded translatsiooni järgselt. Nimeta
olulisemad kuumašoki valgud.z
Aitavad osade valkude funktsionaalset konformatsiooni saavutada, ol es tugivalkudeks.
Pakivad eelnevalt pakkimata/valesti pakitud valke õigesti. Olulisemad kuumašoki
valgud on Hsp60 ja Hsp70, mis kaitsevad kõrges temperatuuris teisi valke.
36. Kuidas toimub valkude lagundamine Valkude lagundamine toimub polüubikvitineerimise kaudu. Lagundamisele mõeldud valgud
märgistatakse unikaalse markervalguga ubikviti n ning neid suunatakse proteasoomidesse,
kus toimub nende lagundamine. Polüubikvitineeritud valgud lagundatakse proteasoomides.
Umbes 30% valkudest on valesti pakitud (vale konformatsiooniga) ja suunatakse
proteasoomidesse lagundamiseks.
37. Kirjelda valkude kahte peamist sekundaarset struktuuri ja sidemeid mille abil need
moodustuvad
Peamised sekundaarsed
struktuurid :
● alfa-
heeliks ○ moodustub NH- ja CO-rühmade
vesiniksidemete abil, iga
neljanda aminohappe vahel on seosed.
○ paremalt poolt rul is või spiraalne konformatsioon, kus on selgrooks N-H
grupp, mis
domineerib vesiniksideme C=O grupile aminohappes.
● beeta-leht
○ b-lehe korral tekivad
vesiniksidemed kahe või enama polüpepti dse b-ahela
vahel
○ b-leht võib ol a vastassuunaline (antiparal eelne) või samasuunaline
(paral eelne)
38. Iseloomusta valgudomeeni. Too näiteid valkude suuruse ja tertsiaarsete
struktuuride kohta Valgu
domeenid on funktsionaalsed üksused suurusega 40 aminohapet ja enam. Valgu
domeen – valgu tertsiaarstruktuuri element, mis kujutab endast üpris stabi lset ja
iseseisvat struktuuri, mil e kokkupanemine toimub sõltumatult teiste osade moodustamisest. Domeen
sisaldab tavaliselt mitut sekundaarstruktuuri elementi. Sarnased domeenid on leitavad mitte
ainult sarnastes valkudes ühest
perest , vaid ka täiesti erinevates valkudes. Tihti antakse
domeenidele täiesti
omaette nimetusi, kuna nende olemasolu määrab valgu bioloogilist
funktsiooni. Näiteks, Ca2+ seostuv kalmoduli ni domeen, homeodomeen, vastutab DNAga
seostumise eest erinevates transkriptsiooni faktorites.
Näited: Erinevate valkude α-heeliksi ja β-lehtede kombinatsioonidest moodustunud
domeenid: tsütokroom b562, laktoosdehüdrogenaas, lg kerge ahel.
Valkude suurust mõõdetakse kilodaltonites (
kDa). Suurus on v
äga v
arieeruv, k
eskmiselt jääb
5 kDa ja 500 kDa vahele. Keskmine aminohappe jäägi mass on 110 Da. See tähendab, et
100 aminohappeline valk on umbes 11 000 Da ehk 11 kDa. Tertsiaarsetes struktuurides on
lisandunud hüdrofoobsusest ja -fi lsusest (jms jõududest) tekkinud konformatsioon.
39. Mis on disulfiidsed sidemed? Disulfi dsed sidemed on ni öelda väävlisil ad (
S-S), m
is moodustuvad t süstei nide v
ahele. O
n
ainuke kovalentne side valkude konformatsiooni määramisel.
40. Kuidas tekib funktsionaalne insuliini valk? Toimub proteolüütiline lõikamine – valgu üks o
ts j a t eine o
ts ühenduvad d
isulfi dsidemetega,
keskmine osa eemaldatakse.
Funktsionaalne insuli ni valk tekib kui üks osa proinsuli nist (mil el puuduvad S-S sil ad)
eemaldada
ahelast ja si s kaks al es jäänud
ahelat li tuvad. Pepti dsidemed eemaldatakse
ning moodustuvad ainult disulfi dsidemed.
41. Kirjelda geeni mõistet, eukarüootse geeni struktuuri ja seda reguleerivaid
elemente
Geen kui geneetilise informatsiooni üksus. Geen – kromosoomi kindlas lookuses paiknev
pärivustegur, mis määrab otse või kaudselt ning tihti koostoimes teiste
geenidega ühe või
mitme tunnuse arengu; DNA-molekuli funktsionaalne lõik, mis tavaliselt sisaldab infot ühe
valgu või teiste molekulide sünteesiks. Geen on reeglina (tuumas oleva genoomi või
mitokondri) DNA nukleoti dne järjestus, mis on vajalik:
a) valgu polüpepti di sünteesiks
b) RNA molekulide (nagu tRNA ja rRNA) sünteesiks
Eukarüootse genoomi
geenid on sagedasti ümbritsetud mittekodeerivate aladega.
Eukarüootse geeni osad on:
-
promootor - määrab, kui palju tehakse transkriptsiooni (ja enhaanser - peab
tulema promootori juurde, et valk hakkaks tööle)
- ekson(id) - moodustavad lõpliku mRNA molekuli -
kodeeritav osa.
-
intron (id) - mittekodeeritav osa
- 5’ mittetransleeritav osa (5’ UTR)
- 3’ mittetransleeritav osa (3’ UTR)
- terminaatorala
42. Nimeta geeni ekspressiooni regulatsiooni tasemeid Eukarüootide geeni ekspressiooni reguleeritakse 3 tasandil: transkriptsioonil, sel e järgsel
protsessingul ja translatsioonil. Geenide ekspressiooni reguleeritakse ka mitmel muul
tasandil – Genoomse DNA avatus – RNA protsessing – mRNA transleeritavus valguks –
mRNA stabi lsus – microRNA – Valgu stabi lsus.
43. Kirjelda alternatiivset splaissingut
Geneetika sõnastiku vaste - Samalt geenilt kodeeritud pre-mRNA erivi siline (alternati vne)
splaissing, mil e tulemusel saadakse ühe geeni alusel valgu paljusid isovorme (nt.
koespetsi filisi).
Toimub eukarüootsetel geenidel. Transkriptsioonijärgne R
NA tükeldatakse j a s
el e tulemusel
pannakse kokku mitmed erinevad erisuguse kombinatsiooniga eksonid. Tekivad erinevate
omadustega mRNAd.
44. Transkriptsioonifaktorite funktsioon, sidemed DNA-ga, 4 peamist DNA seonduvat
struktuuri
Funktsioonid:
●
Üldised transkriptsioonifaktorid on vajalikud transkriptsiooni a
lustamiseks- aitavad
RNA polümeraasil seonduda DNA’ga. Universaalsed ehk toimivad kõikide geenide
peal.
●
Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid võimendavad ekspressiooni erinevates
rakutüüpides või vastusena rakuvälistele signaalidele
Sidemed DNA’ga: aminohappe ja lämmastikaluse vesiniksidemed
Tavalisemad struktuurid:
1) Heeliks-pööre-heeliks
2) Tsinksõrm- metal iaatom valgu sees (raua-aatom hemoglobi nis)
3) Leutsi nizipper
4) Heeliks-ling-heeliks
45. Kirjelda eukarüootse geeni promootorit ja selle osasid. Enhaanser.
Promootor on DNA järjestus, mis on võimeline algatama transkriptsiooni. Inimese genoomi
tähtsaimaks promooterjärjestuseks on TATA-kast (TATAAA järjestus). Oluline valk
transkriptsiooni algatamiseks on TATA-
seonduv valk TBP, mis on osa TFIID kompleksist,
ning seejärel TFIIA ja TFIIB. TATA järjestus asub transkriptsiooni alguskohast umbes 30
nukleoti di eemal. Sageli on TATA-järjestusest 5’-suunas CAAT ja GC järjestused. Peale
RNA polümeraasi seondumist kompleksiga vabanevad üldised transkriptsioonifaktorid ja
RNA polümeraas fosforüleeritakse ning algab RNA süntees. Lisaks sel ele seonduvad
promootoriga ka regulaatorvalgud, mil e DNA järjestused paiknevad promootorist veel
kaugemal. Vi masena seonduvad tekkinud valkude komplektiga
enhancer valgud, mis
omakorda seonduvad DNA järjestusega tuhandeid nukleoti de eemal promootorist. (DNA
keerab ennast ümber promootoril paikneva valgukompleksi).
Enhancer e võimendaja – väike DNA pi rkond, mis peale transkriptsiooni faktoritega
seostumist stimuleerib transkriptsiooni põhiliste geenipromootorite pealt. Enhaanser peab
tulema promootori juurde. DNA-järjestus, mis võimendab transkriptsiooni ühel või mõnel
geenil, isegi kui asub transkribeeritavast
geenidest kaugel. Võimendaja toime
molekulaarne mehhanism seisneb sel es, et tänu valkude kompleksile tema sees ta lähendab RNA
polümeraasi 2 ja transkriptsiooni kofaktoreid promootori aladega.
46. Epigeneetika mõiste üldkirjeldus
Epigeneetika reguleerib geenide ekspressiooni, mis ei tulene muutustest DNA
järjestuses Epigeneetilised
mehhanismid jagunevad kolmeks: DNA metülatsioon, RNA-ga seonduv
vaigistamine (miRNA-d ja siRNA-d) ja histoonide modifikatsioon.
47. Histoonide modifikatsioonid, nende funktsioon ja neid muutvad ensüümid
Translatsioonijärgsed histoonide muundamised mõjutavad histoonide akti vsust.
● atsetüülimine - ensüümid histooni atsetüültransferaasid HAT-id. Funktsioon:
nõrgendab DNA ja histoonide vahelist sidet.
● fosforüülimine - ensüümid
kinaasid , kannavad üle fosfaatgruppe.
● deatsetüülimine - ensüüm HDAC. Funktsioon: tugevdab DNA ja histoonide
seondumist.
48. DNA metülatsioon, selle toimumiskohad ja mõju geeni ekspressioonile, CpG
saared. DNA metülatsioon on biokeemiline protsess, mis on olulise tähtsusega kõrgemate
organismide normaalses arengus. See hõlmab metüülrühma lisamist tsütosi ni pürimidi ni 5'
süsiniku või adeni ni puri ni kuuenda lämmastiku külge (tsütosi n ja adeni n on kaks DNA
neljast alusest). Raku jagunemisel võib sel ine DNA modifikatsioon edasi kanduda.
DNA
metülatsioonil
on
ülioluline
ülesanne
kõrgemate
organismide rakkude
diferentseerumisel ja normaalsel arengul. DNA metülatsioon modifitseerib stabi lselt geeni
ekspressioonimustreid rakkudes ni , et rakud "mäletaksid, kus nad on olnud" või
vähendaksid
geeniekspressiooni . Näiteks rakud, mis on määratud olema embrüonaalsed
pankrease saarekesed jäävad pankrease saarekesteks organismi kogu eluks, ilma et
signaalid peaksid seda neile ikka ja jäl e meelde tuletama. DNA demetüleeritakse tavaliselt
sügoodi arenemisel ning metüleeritakse uuesti arengu jooksul üksteisele järgnevate
rakujagunemiste jooksul. Ent vi maste uuringute põhjal toimub sügoodis pigem
metüülrühmade hüdroksülatsioon kui metüülgruppide täielik eemaldamine.[1][2] Osa
metüleerimisel tekkinud modifikatsioone, mis mõjutavad geeniekspressiooni, on päritavad,
ning seda nähtust nimetatakse epigeneetiliseks regulatsiooniks.
Lisaks
surub DNA metülatsioon al a aja jooksul genoomi sisenenud vi ruslike geenide ja
muude kahjulike elementide ekspressiooni. L
isaks l uuakse D
NA metülatsiooni a
bil k
romati ni
baasstruktuur, mis võimaldab rakkudel moodustada lõputuid iseloomulikke tunnuseid, et
saavutada hulkrakset elu vaid ühe ainsa muutumatu DNA ahela põhjal. DNA metülatsioon
on oluline ka pea-aegu kõigi vähkkasvajate
tekkes .
DNA metüülimisel on tähtis osa geeni epigeneetilisel regulatsioonil, ni normaalses arengus
kui haiguste puhul. Imetaja genoomis on u 3 miljardit aluspaari, neist 40-65% on G:C ja
vi mastest 2-7% on modifitseeritud. Lämmastikaluste modifikatsioonil lülitatakse lisa
metüülgrupp (-CH3) tsütosi ni koosseisu (mod 5-metüültsütosi n e MC). Reaktsiooni
läbivi jateks on DNA metüültransferaasid. Enamik metüülitud tsütosi ne paikneb dipletsetes
aluspaarides.
● Genoomis on alad, kus mittemetüülitud CpG-nukleoti dide kontsentratsioon on
vastandina väga kõrge. Neid, tavaliselt 1-2kb
pikkuseid CpG rikkaid alasid nim
CpG-saarekesteks ning nad asuvad paljude akti vsete geenide 5’
alas (transkriptsiooni algussaidi läheduses). Inimese genoomis on u 30000
CpG-saarekest. Nende naabruses olev DNA on ülitundlik DnaasI põhjustavate
katkestuste suhtes ja lisaks sisaldab ta muutunud nukleosoome
● Histoonide atsetüülimine soodustab transkriptsiooni aktivatsiooni.
Metüülitud DNA põhjustab vastupidiselt astetüülimisele geeniekspressiooni pidurdamist. Geeniekspressioonile mõjub ka valkude metüülimine e posttranslatsiooniline
modifikatsioon, kus valgu aminohapetele argini nile või lüsi nile lisatakse 1,2 või 3
metüülrühma, mil ega valgu akti vsusomadused muutuvad.
● DNA metülatsioon põhjustab geenide avaldumise pidurdamist, CpG a
la m
etülatsioon
promootoralas vaigistab geeni ekspressiooni (vähkkasvajate tekkes oluline - on
täheldatud, et kasvajate puhul on geeni ekspressioonide vähenemine tingitud ni
mutatsioonidest kui ka CpG alade hüpermetülatsioonist, isegi rohkem vi masest).
49. Too näide epigeneetilise imprintinguga seotud haigusest
Genoomne
imprinting põhineb DNA metülatsioonil. Genoomse imprintingu al mõeldakse
vanemspetsi filist geenide, kromosoomide või kogu genoomi ekspressiooni või repressiooni
järglastel. Mutatsioonidki võivad seetõttu avalduda erinevalt, sõltuvalt sel est, kas nad
pärinevad emalt või isalt. Genoomse imprintingu korral avaldub arengus ainult kas isa
(paternaalne) või ema (maternaalne) poolt päritud al eel.
● Kallutatud metülatsioon – X-liiteline ihtüoos e kalasoomustõbi. Sagedus
1:2000 kuni 1:6000 poisi kohta põh X-kromosoomis paiknev arüülsulfataasi
C
e steroidsulfataasi Sts-geeni mittefunktsionaalsusega kaasnevaid muutuseid
mitmete kudede ja organite talitluses
● Angelmani
sündroom : Intellektuaalse ja füüsilise arengu mahajäämus,
krambid , jõnksulised liigutused (eriti käte plaksutamine), sage naeratamine,
õnnelik käitumisviis. Deletsiooniga kromosoom emalt, imprintitud kromosoom
pärineb isalt. Defektne geen on UBE3A
50. Võrdle kromatiini struktuuri poolest eukromatiini ja heterokromatiini Eukromatiin : asetseb peamiselt kromosoomide õlgades, geenid väga akti vsed, interfaasi
rakutuumas on avatumad (heledamad alad), dekondenseerunud, vähem kompaktne,
sisaldab transkripteeritavaid järjestusi, toimub geenide ekspressioon.
Heterokromatiin: asetseb peamiselt kromosoomide tsentromeerides/telomeerides, geenid
pole akti vsed, interfaasi rakutuumas on tihedamalt pakitud ja tumedamad alad, tugevalt
kondenseerunud, sisaldab mittetranskrpteeritavaid kordusjärjestusi.
51. Heterokromatiniseerumine Heterokromati ni moodustumiseks on vaja H3K9- metüleerimist (histooni H3 üheksandas
positsioonis asuv lüsi n) ja kindlate valkude, nagu HP1 (
heterokromati ni v
alk1), seondumist.
H3K20me3 (Histooni H3 kahekümnenda positsiooni lüsi ni kolmekordne metüleerimine)
vastutab kromati ni lokaalse kondenseerumise struktuuride eest.
7
52. miRNA, nende struktuur ja funktsioon ● miRNA molekulid on väikesed üheahelalised RNA molekulid, mis võivad seonduda
mRNA’ga ja neid inhibeerida.
● miRNA geenid transkribteeritakse RNA molekuliks, moodustavad nõelapea
struktuure.
● Võivad lagundada mRNAd või blokeerida nende translatsiooni → inhibeerivad
geenide ekspressiooni. (kui mRNAst leitakse sama järjestus, mis on antud miRNA’l,
si s läheb miRNA m
RNA asemele n
ing translatsiooni j a s
eega k
a geeni ekspressiooni
ei toimu)
53. Inimese genoom, geenide arv Inimese genoom on inimese liigiomases haploidses kromosoomistikus sisalduv geneetiline
materjal.
Ainult 0,1% inimese DNA järjestusest on
unikaalne !
Geenide arv:
● Inimene ~23 000
● Ümaruss ~19 000
● Pärm ~6000
● Äädikakärbes ~13 000
● Hi r ~25 000
54. Mutatsioon ja polümorfism
Mutatsioon- harv
marker , sagedamini geenide kodeerivas pi rkonnas, sageli
haigusseoselised
Polümorfism- DNA sage variant, sagedus populatsioonis >1%
55. Mis on SNP?
Ühenukleoti dne polümorfism ehk DNA järjestuse variatsioonid, mis on toimunud ühe
genoomi nukleoti di muutumisel.
56. Inimese Genoomi Projekt Inimese Genoomi Projekt (Human Genome
Project ) oli rahvusvaheline uurimisprojekt, mida
koordineeris Inimese Genoomi
Organisatsioon . Projekt algas aastal 1990 ning sel e eesmärk
oli kaardistada kogu inimese genoom ehk tuvastada DNA molekuli primaarse struktuuri
nukleoti dne järjestus sekveneerimismeetodil. Genoomi kaardistamiseks kulus 13 aastat.
Järjestuse analüüs paljastas, et inimesel on umbes 20 000-25 000 geeni. Inimese terve
nukleoti dse järjestuse teadmine annab võimaluse leida haiguse tekkes osalevaid geene
ning õppida paremini tundma haiguste tekkemehhanisme. Samuti aitab see teadmine
tulevikus võimaldada personaalset meditsi ni ehk genotüübist sõltuvat ravistrateegiat.
57. Mis on massiivne paralleelne sekveneerimine (massive parallel sequencing) NGSi ehk massi vse paral eelse sekveneerimise esimeseks etapiks on genoomse DNA
fragmenteerimine väiksemateks lõikudeks, mil est seejärel koostatakse raamatukogu.
Raamatukogu lõigud kantakse kandjale, kus toimub DNA fragmentide seondumine kindlate
proovidega ja kaksikahela denaturatsioon üheahelaliseks. Edasiselt sünteesitakse uuritavale
üheahelalisele DNA järjestusele vastasahel. Iga
üksiku nukleoti di lülitamisel
sünteesitavasse ahelasse saadakse valgussignaal, mis registreeritakse arvuti abiga. Sel isel
vi sil toimub sekveneerimine ja DNA süntees üheaegselt.
58. Mida tähendab GWAS
Ülegenoomne assotsiatsiooniuuring (inglise genome-
wide association study ; lühend GWAS)
on uuringutüüp, kus uuritakse erinevaid indivi de paljude levinud geneetiliste variantide
suhtes, et leida, kas mõni variant on seotud mingi kindla tunnusega. Ülegenoomsed
assotsiatsiooniuuringud keskenduvad peamiselt üksiku nukleoti di polümorfismide (SNP-de)
ja laialt levinud haiguste vaheliste seoste uurimisele.
GWAS seisneb kahe uuritava grupi DNA võrdlemises juhtkontrol uuringuga. Üks grupp
koosneb haigust põdevatest inimestest (juhud) ja teine grupp inimestest, kel el uuritav
haigus puudub (kontrol id). Iga inimene annab DNA proovi, mil elt loetakse SNP-de analüüsi
ki pe (SNP array) kasutades
miljoneid geneetilisi markereid. Kui üht tüüpi
varianti esineb
haigust põdevate inimeste hulgas tihemini, peetakse antud SNP-d seostatuks sel e
haigusega. Haigusega
seostatud SNP-sid loetakse inimese genoomi kindla regiooni
markeriks, mis mõjutab riski haigestuda.
59. Tsütogeneetika kui teadus kromosoomidest
Teadus kromosoomidest ja rakkude jagunemist. 1950ndatel.
60. Peamised tsütogeneetika meetodid; Giemsa, FISH , võrdlev genoome
hübridiseerimine
GIEMSA: ● Töötati välja keemiku Gustav Giemsa poolt 70ndatel
● Kromosoomid töödeldakse trüpsi niga, mis lõhub histoonid ja si s värvitakse Giemsa
värviga (metüleensinine, eosi n ja ažuur B)
● Giemsa värv seondub DNA fosfaatrühmadega
● Esile tulevad mittetranskribeerivad alad
● Kasutatkse karüotüübi analüüsiks. Saadud korrastatud pilt on karüogramm.
FISH: fluorestsentsi
in situ
hübridiseerimine ● Kasutatakse üheahelaliste DNA
proovide hübridiseerimist
metafaasi kromosoomsele
DNA-le
●
Proov seondub ainult sinna, kus on tema järjestusele vastav k
omplementaarne DNA
järjestus metafaasi kromosoomis
●
Proovid on märgistatud fluorokroomidega ja s
eda o
n v
õimalik v
aadelda f luorestsentsi
mikrosoobis
● Kasutatakse tsentromeeridele ja igale kromosoomile spetsi filisi proove.
Võrdlev genoomne hübridisatsioon: ● Metafaasi kromosoomidele hübridiseeritakse kaks erinevat genoomset DNA’d,
kumbki eraldi värviga märgistatult
● Värvi intensi vsuse järgi on võimalik hinnata, kas proovis on konkreetse pi rkonna
DNA’d rohkem või vähem.
61. Inimese kromosoomid, osad, arv
Struktuur:
● kaks kromati di
● Lühike (p-petite) ja pikk (q, g-grande)
õlg
● Tsentromeerid, telomeerid ja
satel i did.
Inimesel erinevaid kromosoome 24: 22
autosoomi ja 2 sugukromosoomi. Kõigis
keharakkudes on 46 kromosoomi- diploidne
kromosoomistik . Sugurakkudes 23
kromosoomi- haploidne kromosoomistik.
62. Mis on karüotüüp ja kuidas seda tähistatakse? Karüotüüp on raku või indivi di kromosoomistik, kromosoomi kujutised korrastatakse
vastavalt nende pikkuse ja tsentromeeri asukoha järgi. Kasutatakse kromosoomide arvu ja
võimalike muutuste analüüsiks. Tähistatakse naisel 46,XX; mehel: 46, XY. Kui on
lisakromosoom, si s tähistatakse mitmes: 47, XY + 21
63. Mitoos, meioos
Mitoosi teel jagunevad somaatilised- ehk keharakud. Mitoosi tulemuseks on 2 tütarrakku,
kes on mõõtmetelt väiksemad eelasrakust, kuid sama feno-ja genotüübiga. Mitoosi
eelduseks on, et interfaasi sünteesiperioodil (S) toimub DNA repilikatsioon ja igas
kromosoomis moodustub teine kromati d. Samuti on oluline, et toimuks käävisüsteemi
valkude süntees ja tsentrosoomi pooldumine enne mitoosi algust.
Profaasis algab kromosoomide kondenseerumine, mil e tulemusena moodustuvad X
kujulised kromosoomid, kaovad tuumakesed ja laguneb tuumakate. Samaaegselt toimub
tsütoskeleti lammutamine, mil est pannakse kokku käävisüsteem (mikrotorukesed, valgud).
Tekib 2 tsentrosoomi, mis koosnevad 2 tsentrioolist, periotsentriolaarsest materjalist ja
käävini tidest. Kinetohoorsed käävini did kinnituvad tsentromeeride läheduses olevatele
aladele
ehk
kinetohooridele.
Käävini did
jagunevad
polaarseteks
(pikad)
ja
mittekinetohoorseteks (lühikesed, moodustavad astri ümber tsentrosoomi). Tsentrosoomid
li guvad raku poolustele.
Metafaasi alguseks on kromosoomid lühenenud ja li kunud raku kesktasapinnale, mida
kutsutakse
metafaasiplaadiks.
Iga
kromosoomi
kinetohooridele
on
kinnitunud
mikrotorukesed mõlemalt pooluselt.
Anafaas algab, kui tsentromeerid hakkvad teineteisest eralduma, käävini did alustavad
lühenemist ning kromosoomid alustavad li kumist raku eri poolustele. Mittekinetohoorsed
käävini did teevad samal ajal rakku piklikumaks.
Anafaasi lõpuks on raku poolustel täielik
kromosoomide komplekt.
Telofaasis muutub rakk veelgi piklikumaks ning algab tuumakatete moodustumine.
Tulemuseks on 2 geneetiliselt identset tuuma.. Telofaasile järgneb
tsütokinees ehk raku
tsütoplasma jagunemine ja kahe tütarraku teke (seda põhjustab loomarakus
nöördumisvagu). Taimsetel rakkudel li guvad Golgi kompleksi vesi kulid raku
kesktasapinnale ja li tuvad rakuplaadiks, mis suureneb ja moodustab 2 iseseisva
plasmamembraaniga tütarrakku. Sel ele järgneb tsel uloosi ladestumine ja rakukesta teke.
Meioos on
rakujagunemine , kus diploidsest eelasrakust tekib neli haploidse
kromosoomistikuga tütarrakku. Enne meioosi toimub
interfaas . Meioos I ja II vahel DNA
replikatsiooni ei toimu, vaid ainult tuumade ja tuumakeste reformeerumine.
Reduktsioonijagunemine (meioos I) algab
profaasiga (I), mis on suhteliselt pikk (90%
ajast) ja koosneb vi est staadiumist:
leptoteen , sügoteen, pahhüteen, diploteen j a d
iakinees.
I profaasis toimub
krossingover ehk ristsi re, mis eeldab kromosoomide kondenseerumist ja
homoloogiliste kromosoomide paaride (bivalendid ehk tetraadid) moodustumist. Bivalendis
on 4 DNA molekuli ehk kromati di. Leptoteenis hakkavad kromosoomid teineteist
otsima ja
kondenseeruma. Seejärel kinnituvad kromosoomide telomeerid tuumakattele, moodustades
sügoteenis sünaptoneemilise kompleksi (koosnev kromati nainest, v
alkudest, D
NA sünteesi-
ja reparatsiooniensüümidest). Krossingover toimub pahhüteenis ning sel e vi vad läbi
kopleksi rekombinatsioonisõlmed. Ristsi rde ajal vahetavad tütarkromati did homoloogilisi
segmente. Sel eks et meioos õnnestuks, peab igas bivalendis toimuma vähemalt üks
krossingover. Sünaptoneemiline k
ompleks j a r
ekombinatsioonisõlmed l agunevad p
ahhüteeni
lõpus. Diploteenis stabiliseerivad bivalente
kiasmid , mis on krossingoveri toimumiskohas
olevad sidemed. Diakineesis li guvad bivalendid raku k
eskele. R
istsi rde p
eamine t ähtsus o
n
see, et kromati dides toimub geneetilise materjali ümberkombineerumine.
I metafaasis li guvad bivalendid ekvatoriaaltasapinnale ja käävini did kinnituvad
unipolaarselt, et tagada 2 kromosoomi lahknemine.
I anafaasis katkevad kiasmid homoloogiliste kromosoomide vahel ja kahekromati dilised
kromosoomid li guvad raku poolustele. Tütarrakkudel on poole vähem kromosoome kui
eelasrakul.
I telofaasis moodustuvad tuumakatted ning järgneb tsütoplasma pooldumine. Meioos I
jooksul moodustub ühest diploidsest 2n4c rakust kaks haploidset 1n2c tütarrakku.
Ekvatsioonijagunemine (meioos II) on analoogne mitoosiga, erinevuseks on see, et
jagunevad 2 haploidset rakku. Meioosi lõpuks on tekkinud neli haploidset tütarrakku
(sugurakku ehk gameeti või spoori ehk eost) valemiga 1n1c.
Vead meioosi I profaasis vi vad enamasti vigadeni meioosi I metafaasis ja II metafaasis,
tagajärjeks aneuploidsete sugurakkude teke.
64. Kaksikud
Kaksikute tekkimise sagedus on
ca 1 laps 50st. Ühemunakaksikute (monosügootide)
sagedus on väiksem, kui kahemunakaksikute (disügootide), umbes 1:300. Monosügootidel
toimub varajane (1-2 nädalat peale viljastumist) viljastatud rakujagunemine kaheks
embrüoks, nende genoom on identne. Kui s
ügoot j aguneb embrüoks h
iljem k
ui k
aks nädalat
peale viljastumist, võivad tekkida Si ami kaksikud.
65. Kromosoomide peamised aberratsioonid ja arvulised muutused (triploidia,
trisoomia jne Euploidia: normaalne kromosoomide arv
Aneuploidia: ebanormaalne kromosoomide arv
Polüploidia: ühe lisa kromosoomistiku olemasolu
Polüsoomia:
normaalsest rohkem kromosoome
Triploidia: 69 kromosoomi, tekkimine sage, peaaegu alati raseduse katkemine
Monosoomia: 1 kromosoom (vähem kui normaalne)
Disoomia: 2 kromosoomi (normaalne)
Trisoomia 3 kromosoomi (üks rohkem), tekib, kui kromosoomid ei lähe meioosis lahku
Tetrasoomia 4 kromosoomi (kaks rohkem)
66. Downi sündroom
Kromosoom 21 trisoomia, esmakirjeldus aastal
1844 dr Langdon Down. Esinevus sõltub
väga palju ema
vanusest ,
praeguseks on tavaline teha sõeluuring prenataalselt. Sagedus
1:800 elussünni kohta.
Iseloomulikku:
● Omane teatud näo, pea, käejoonte ja silmade kuju
● Hammaste
anomaaliad ● Suu poolavatud, keel väljatungiv
● Vaimne alaareng
● Sage südamerike
● Suurenenud risk haigestuda autoimmuunsetesse haigustesse, infektsioonidesse
67. Translokatsioonid (retsiprookne, Robertsoni, Philadelphia kromosoom) ja
inversioonid
Retsiprookne translokatsioon -
translokatsioon kahe mittehomoloogse kromosoomi vahel,
kus rekombinatsiooniprotsessis geneetilist materjali ei kaotata, st translokatsioon on
DNA- ahelate vahel vastastikune.
Robertsioni translokatsioon-
translokatsioon, kus kaks mittehomoloogset kromosoomi
ühinevad ja moodustavad uue üksikkromosoomi.
Philadelphia kromosoom t(9:22)-
krooniline müeloidne leukeemia , ph.kromosoom ca 9 5% patsientidest. Tekib enamasti li tgeen BCL-ABL1, türosi nkinaas, mis on pidevas
aktivatsiooni olukorras. Tekib enamasti hematopoieetilises tüvirakus või müeloidses
tüvirakus.
INVERSIOONID: kromosoomi regioon on ümberpöördunud, eeldab kahte lõikepunkti Peritsentriline inversioon -
inversioon, mis sisaldab tsentromeeri, seega inversiooni on
haaratud mõlemad kromosoomi õlad
Paratsentriline inversioon-
inversioon, mis on täielikult ühes kromosoomi õlas ning mis ei
haara endasse tsentromeeri. 68. Sugukromosoomid ja peamised sugukromosoomide anomaaliad 23. kromosoomipaari inimese genoomis moodustavad sugukromosoomid X ja Y, mis
erinevad üksteisest ni kujult kui suuruselt. Y kromosoom määrab mehe arengu. Naistel on
kaks X-kromosoomi, meestel on X ja Y. Kromosoomivalem ehk karüotüüp naise jaoks on
46,XX ja mehe jaoks 46,XY. X ja Y-kromosoomide arvu muutus ei põhjusta suuri
kõrvalekaldeid vaimses ja füüsilises arengus, peamiseks probleemiks on lastetus ja
suguorganite arenguhäired.
Sugukromosoomide anomaaliad:
● 47;XXY - trisoomia, kus on üks lisa X kromosoom - Klinefelteri sündroom.
● 47;XYY - trisoomia, kus on üks lisa Y kromosoom - XYY sündroom
● 45;X0 - monosoomia, kus X kromosoom on puudu -
Turneri sündroom.
69. SRY geen
Y- kromosoomi
aheldunud geen, mis kodeerib valgulis testise moodustamise faktorit
(SRY-valk), m
il el o
n v
õtmerol i sasorganismi arenemises j a s
uguorganite k
ujunemises. A
sub
Y- kromosoomi lühikeses õlas. Määrab suure osa testosterooni tootmise ni lootes kui ka
hilisemas elus.
70. X - kromosoomi inaktivatsioon
X kromosoomi inaktivatsioon on protsess, mil e käigus inaktiveeritakse emastel imetajatel
üks X kromosoom, võimaldades X-li teliste geenide doosikompensatsiooni sugude vahel.
Sel e tulemusena avalduvad X-li telised geenid võrdses koguses ni emastel kui isastel.
Inaktivatsiooni protsess on suhteliselt universaalne kõigis imetajates, ent teatavad
erinevused li giti eksisteerivad.
Barri kehake ehk sugukromati n on tume keha i nimese r
akus,
mis moodustub ühest kahest X-kromosoomist, mis i naktiveeritakse imetajatel e
mbrüonaalse
arengu väga
varajases etapis . Barri k
ehakest s
aab t uvastada i nterfaasi a
jal n
aisterahval, k
ui
tugevalt värvuvat ala tuuma perifeerias. Varem kasutati Barri kehakest kromosomaalse soo
määramiseks. Kui naisel puudub Barri kehake, si s see vi tab ainult ühele X kromosoomile
tuumas - Turneri sündroom või kui on kaks Barri kehakest, si s on
tegemis X-trisoomiale
(47XXX). Mehe rakkudes Barri kehakese leidumine vi tab Klinefelteri sündroomile (47XXY).
71. Mendeli seadused Mendeli 1. seadu s: Kahe erineva homosügootse (AA, aa) isendi ristamisel tekivad
heterosügootsed (Aa) järglased, kes on geneetiliselt identsed ja fenotüübilt sarnased.
Tuntakse ka dominantsuse või ühetaolisus printsi bina
Mendeli 2. seadus: Heterosügootsete F1-isendite ristamisel toimub F2-põlvkonnas geeni
al eelide lahknemine ning järglaste tunnused on kindlas lahknemissuhtes. Tuntakse ka kui
al eelide lahknemisprintsi bina. Domineerimise korral (üks al eel surub teise al eeli m
aha) on
F -põlvkonnas kolmveerand järglastest dominantse tunnusevariandiga, v
eerand retsessi vse
2
tunnusevariandiga (fenotüübiline lahknemissuhe 3:1 ja genotüübiline lahknemissuhe 1:2:1).
Kodomineerimise korral on fenotüübiline lahknemine 1:2:1. Sama lahknemissuhe kehtib ka
semidomineerimise (ehk intermediaalsuse) korral. Kodomineerimuse puhul on
heterosügootide
fenotüübis mõlema vanema tunnusevariant (nt AB0-veresüsteemi puhul
AB-vererühm). Intermediaalsuse puhul on heterosügootide fenotüübiks mõlema vanema
vahepealne tunnusevariant (nt roosaõielised lõvilõuad, kui vanemad on punase- ja
valgeõielised).
Mendeli 3. seadus: Erinevate geenide al eelid lahknevad sõltumatult teineteisest. Seadus
kehtib ainult sel juhul, kui geenid, mis vastutavad tunnuse kujunemise eest, ei ole
aheldunud. Tuntakse ka kui sõltumatu lahknemise printsi bina
72. Dominantsus, retsessiivsus, kodominantsus, semidominantsus
Dominantne geenial eel avaldub fenotüübis ning varjutab teise al eeli
fenotüübilise tunnuse
Retsessiivne geenial eel ei avaldu fenotüübis teise, dominantse, al eeli
esinemise korral
Kodominantsuse korral mõlemad geenial eelid osalevad fenotüübilise
tunnuse avaldumises teineteisest sõltumatult,
andes iseseisva tunnuse
Semidominatsuse (ka intermediaarsus) korral avaldub vahepealne
tunnus
73. Homosügootsus , heterosügootsus , hemisügootsus Homosügootsus- esineb, kui diploidses
rakus/organismis on mõlemas kromosoomis
olev geen esindatud
identse al eeliga
Heterosügootsus- esineb, kui diploidses
rakus/organismis on mõlemas kromosoomis
olev geen esindatud
erineva al eeliga
Hemisügootsus- sel e korral on kromosoom või geen esindatud diploidses rakus/organismis
ainult ühe koopiana 74. Sugupuud ja nende põhjal geneetilise riski leidmine
Vajalik, et teada saada, k
as h
aigus o
n geneetiline v
õi m
itte. S
amuti kui on g
eneetiline kuidas
pärandub, kas on X-li teline Y-li teline, või autosoomne või kas dominantne või retsessi vne.
75. Autosomaalne dominantne pärandumine (näide haigusest)
Autosoomdominantse haiguse käes kannataval indivi dil pi sab haiguse esinemiseks ühest
muteerunud geenikoopiast. Igal haigel isikul on tavaliselt üks haige vanem, seega esineb
50% võimalus, et lapsele pärandub muudetud geen.
Huntingtoni tõbi -
mutatsioon 4. kromosoomi lühikeses õlas. Mutatsioon põhjustab
ebanormaalselt huntingti ni valgu tootmist, mis kahjustab närvirakke ajus. sümptomid
ilmnevad 20+ aastaselt - tantstõbi, dementsus, kõnevõime kaotamine
76. Autosomaalne retsessiivne pärandumine (näide haigusest) Autosomaalretsessi vse haiguse esinemiseks peavad indivi dil olema muteerunud kaks
geenikoopiat.
Tsüstiline fibroos - m
utatsioon 7.kromosoomi p
ikas õ
las. S
ümptomid i lmnevad v
arajases e
as
- a
eglane kasv, e
i s
uuda kaalu j uurde v
õtta, soolane n
ahk, t ihti esinevad k
opsupõletikud, tihe
kõhimine, hingamisraskused
77. X - liiteline dominantne ja retsessiivne pärandumine
X-li teliseks pärandumiseks nimetatakse geenide pärandumist, mis asuvad X-kromosoomis.
Poegadel avalduvad kõik X-kromosoomi geenid, sest p
ole teist k
romosoomi k
õrval. Tütardel
retsessi vsed geenid ei avaldu, kui teises X-kromosoomis on
dominantsed geenid. Meestel
on suurem tõenäosus X-kromosoomis asuvate retsessi vsete haiguste avaldumiseks kui
naistel, sest neil on ainult üks X kromosoom.
Dominantsed haigused:
● Fragi lne X
● Ihtüoos
Retsesi vsed:
● Hemofi lia (A ja B)
● Daltonism
78. Hemofiiliad kui X - liitelise pärandumise näited
Hemofi liad on X li telised haigused, mil e defekti põhjustav geen (retsesi vne al eel) asub
X-kromosoomi mittehomoloogilises alas. Seetõttu avalduvad sel ised
defektid tavaliselt
poisslastel, kes saavad geeni retsesi vse al eeli koos X-kromosoomiga oma emalt (emal ei
pruugi defekt avalduda, on haiguse kandja).
Hemofi lia A- vere hüübimisfaktor VIII alanenud tase veres põhjustab vere hüübimatust. On
ulatuslikult levinud Euroopa kuningakodades. Sagedus on 1:5000-1:10000.
Hemofi lia B- põhjustatud hüübimisfaktor IX alanenud tasemest. Kahjulik toime avaldub
nõrgemini kui hemofi lia A puhul.
79. Y - liiteline pärandumine
Y-li telisi haigusi põhjustavad mutatsioonid Y-kromosoomis. Kuna Y
-kromosoom e
sineb v
aid
meestel, on nemad ainukesed haiguste
kandjad ning haigus pärandub edasi vaid isalt
pojale. Y-li telised haigused on harvad n
ing põhjustavad ü
ldiselt v
iljatust, sest Y-kromosoomi
geenid on paljud seotud meeste viljakuse ja gonaadide (sugunääre) arenguga. Tuntuimaks
Y-li teliseks geeniks on SRY-geen, mis määrab embrüonaalse arengu käigus
meessugupoole kujunemist.
80. Mitokondriaalne pärandumine
Mitokondriaalne või emapoolne pärandumine rakendub mitokondriaalse DNA geenidele.
Kuna arenevale embrüole annavad mitokondreid vaid munarakud, saavad sel iseid haigusi
edasi pärandada vaid emad. Haiguse raskusaste sõltub sel est, kui suur osa mitokondreid
on
kahjustunud . Mitokondriaalse haiguse näide on Leberi pärilik optiline neuropaatia ehk
silma võrkkesta ganglionirakkude degeneratsioon, mis vi b nägemise järsule halvenemisele.
81. Uniparentaalne disoomia Uniparentaalne disoomia esineb, kui laps saab ainult
ühelt vanemalt 2 kromosoomi (
teiselt vanemalt kromosoome ei pärita). Põhjustajateks on meioosis esinevad vead. Kui laps saab
2 erinevat homoloogilist kromosoomi ühelt vanemalt, si s on tegu heterodisoomse UPD-ga
(näitab viga meioosi I l ahknemises). K
ui aga laps s
aab 2
i dentset h
omoloogilist k
romosoomi,
si s on tegu homoloogse UPD-ga (viga meioosi II lahknemises).
82. Hardy - Weinbergi printsiip ja tasakaal Briti
matemaatik Goldfrey.H.Hardy(1877-1947) ja saksa arst Wilhelm
Weinberg (
1862 -1939)
avaldasid 1908. aastal sõltumatud uurimustööd, kus esitati populatsioonides
al eelisageduste ja genotüübisageduste vastastikused sõltuvussuhted. Vastavat suhet
nimetatakse tänapäeval
Hardy-Weinbergi seaduseks või
printsiibiks ja see võimaldab
vabalt ristuvad populatsioonis ennustada genotüüpide sagedusi järglaspõlvkondes,
lähutudes vanempõlvkonna al eelisagedustest.
83. Polügeenne pärandumine
Polügeenne pärandumine (epistaas) tähendab, et mitu geeni mõjutavad teatud tunnust.
Tänapäeval seotud mõistega nagu kvantitati vse tunnuse
lookus . Geen või lookus, mis
mõjutab teatud tunnuse kvantitati vset
variatsiooni , mis reeglina al ub normaaljaotusele
Eesmärk leida, mis geenid mõjutavad ja kui palju mõjutavad teatud tunnust.
Polügeensed haigused on m
õjutatud m
itmete g
eenide p
oolt, n
t h
üpertensioon, s
kisofreenia,
diabeet . Polügeenseid haigusi ja defekte on 4-10% inimestel, seejuures mõni neist
haigustest on populatsioonis ni laialdaselt levinud, et seda ei peetagi haiguseks ja j äetakse
seetõttu arvestustest välja (lühinägelikkus, al ergiad jt).
84. Multifaktoriaalsed haigused, mõned näited haigustest Multifaktoriaalsed ehk kompleks-geneetilised haigused on haigused, mis on tekkinud
geneetiliste ja keskkonna mõjude toimel. Seda mõjutavad paljud interakteeruvad haiguse
riski variandid. Samuti mõjutab seda al eelide erinev arv (doosi efekt). Kõiki neid
efekte mõjutavad ka arengu, elusti li ja keskkonna
faktorid . Näiteks
maolukuti stenoos ja
II tüüpi
diabeet,
vähk , astma, viljatus ja rasvtõbi.
Südame haigused,
depressioon on mõjutatud ni geneetika kui ka keskkonna poolt
Bronhi t, pärasoole vähk- keskkond
Hüpertensioon , diabeet, Alzheimer, Parkinson, eesnäärme vähk- geneetika
85. Rakumembraani ehituslikud komponendid. ●
Rasvad (lipi did) 50% massi järgi on rasvad väiksemad ja neid on rohkem
● valgud 50%
●
süsivesikud (glükolipi did ja glükoprotei nid)
86.Membraani lipiidide omadused ja funktsioonid ning seos koolera patogeneesiga.
Kõik membraani lipi did on
amfipaatilised (e amfifi lsed) st neil on hüdrofi lne pea ja
hüdrofoobne saba. Enimesinevad lipi did membraanis on fosfolipi did, mis moodustavad
ümber raku pideva bilipi dse kihi.
Lipi dide li gid:
● fosfolipi did - moodustavad ümber raku bilipi dse kihi.
●
kolesterool ● glükolipi did
Membraani lipi dide funktsioonid:
● tagavad rakkude kuju
● isoleerivad raku väliskeskkonnast
Lisafunktsioonid (tingitud ebasümmeetrilisest paigutusest)
● tekitavad raku sisemembraanil negati vset laengut
● osalevad signaalülekandel raku sees 1) ankurdades spetsi filisi valke, 2) on
ise signaaliülekande mediaatoriks.
● osalevad rakkudevahelises kommunikatsioonis.
Koolera:
Rakku tungimiseks peab koolerabakter kinnituma spetsi filisele rakumembraani
glükolipi didele (GM1 gangliosi d). GM1 gangliosi d esineb ainult peensoole epiteelis. Ol es
epiteelile kinnitunud, hakkab koolerabakter
tootma toksi ni, mis tungib rakku ja val andab
püsiva
cAMP tõusu. cAMP tõus põhjustab ioonkanalite a
vanemise j a e
lektrolüütide ning v
ee
li kumise rakust peensoole valendikku. Surm saabub vedeliku kaotuse ja elektrolüütide
imbalansi tõttu :’(
87.Liposoomid; nende olemus ja kasutusvõimalused .
Olemus - bilipi dse membraaniga ümbritsetud sünteetilised vesi kulid. Baseerub võimel
moodustada iseeneslikult sfääre.
Kasutusvõimalused - võimaldavad manustada preparaate.
88.Membraani valkude omadused ja funktsioonid.
Omadused:
● teostavad rakumembraani spetsi filisi funktsioone
● funktsioneerivad suurte valgukompleksidena (valgudomeenid)
● on membraanilipi dides lahustuvad ja võivad seal li kuda
Üldistatult on membraanivalkude funktsiooniks transport:
toitainete
laguproduktide
ioonide
informatsiooni
1. transmembraansed valgud (läbi membraanikihi)-
transpordis /raku signalisatsioonis
osalevad valgud
2. täielikult tsütosoolis asetsevad valgud - tsütoskeleti valgud
3. täielikult raku väliskeskkonnas asetsevad valgud - adhesioonis osalevad valgud
89.Glükokaalüksi mõiste ja põhifunktsioonid.
Paljud membraani välisküljel o
levad v
algud o
n glükosüleeritud -
g lükokaalüks e s
uhkrurikas
raku välispinna osa, mil e moodustavad proteoglükaanid ja glükoprotei nid.
Funktsioonid:
kaitseb rakku
mehhaanilise ja keemilise kahjustuse eest
osaleb rakkudevahelistes kontaktides
90.Rakumembraani läbitavus erinevatele madalmolekulaarsete ainetele.
Madalmolekulaarsete ainete transport:
● vabas keskkonnas li guvad molekulid kõrgemalt kontsentratsioonilt madalamale
● samas on paljude ioonide kontsentratsioon raku sees ja väljas väga erinev (sel el
põhinevad ATP süntees, närvi +
lihasraku erutus , optimaalne pH erinevus,
optimaalne osmolaarsus)
● eeldab akti vseid transport mehhanisme
Rakumembraani läbitavus sõltub:
● rasvlahustuvus - mida rohkem rasvlahustuv, seda paremini läbib
● molekuli suurus - eriti halvasti läbivad
ioonid 91.Transportvalkude põhiklassid (vi vad läbi transporti läbi membraani)
Kaks põhi klassi:
● transporterid - muudavad transporditava
molekuliga seondudes konformatsiooni
● kanalivalgud - moodustavad läbi bilipi dkihi (vajadusel avatava)
poori Transport võib ol a:
1. passi vne e madalama kontsentratsiooni/elektrokeemilise g
randiendi s
uunas. E
i v
aja
lisaenergiat. Si a kuuluvad ni osad transporteritest kui ka kõik kanalivalgud.
2. akti vne ehk madalamalt kontsentratsioonilt kõrgemale. V
ajab lisaenergiat ning s
eda
teostavad transporterid, mida kutsutakse ka pumpadeks.
92. Seoselised transporterid ja ATP-käitatud pumbad : olemus, jaotus ja haigusnäited
(prootonpump, tsüstiline fibroos, ravimite multiresistentsus).
Akti vne transport vajab lisaenergiat, mida saadakse:
1. seoselised transporterid (
coupled transporters) - t ranspordivad kahte m
olekuli koos e
seotult. Seejuures kasutatakse madalama elektrokeemilise
gradiendi suunas
transportimisel saadav energia teise molekuli “
vastuvoolu ”.
Jagunevad omakorda:
● Sümporterid (
symporters) - mõlemad molekulid li guvad ühes suunas,
seejuures üks al a ja teine vastuvoolu
● antiporterid (
antiporters) - üks molekul li gub ühes suunas teine teises suunas.
2. ATP käitatud pumbad - kasutavad ATP hüdrolüüsil saadavat energiat vastuvoolu
transportimiseks.
Struktuuri alusel jaotuvad ATP käitatud pumbad 3ks:
● P-type pumps - nimetud tuleneb n
ende o
madusest ennast f osforüülida. S
i a k
uuluvad
paljud ioonpumbad, mis vastutavad Na+, H+ ja Ca2+ gradiendi eest.
● F-type pumps - si a kuulub mitokondri membraanidel asuv ATP sünteaas, mis
kasutab H+ gradienti ATP sünteesiks
● ABC transporterid - nimetus tuleneb sel est, et nende struktuur sisaldab kahte ATP
binding cassettes. Kõige suurem grupp. Transpordivad ka väikseid molekule.
3. Valgus-käitatud pumbad - kasutavad
valgusenergiat , esinevad vaid taimedes,
bakterites .
93.Kanalivalgud: nende põhiomadused ja jaotus. Närviimpulsi leviku ja ülekande
põhimõte.
Kanalivalgud - teine li k transportvalke ehk poorid. Moodustavad läbi bilipi dkihi poorid.
Ühe olulisema grupi kanalivalkude hulgas moodustavad nn ioonkanalid
● on kümneid tuhandeid
kordi suurema läbilaskvusega kui transporterid
● on selekti vsed ühte tüüpi ioonidele
● on suletavad
● reeglina avanevad
vastuseks spetsi filisele signaalile
Ioonkanaleid võib li gitada avanemist põhjustavad signaali alusel:
●
Voltaaz -tundlikud kanalid e pinge-tundlikud
●
Ligandi -tundlikud kanalid (nt
neurotransmitterid jms)
● Mehhaanilise stressi-tundlikud kanalid
on kirjeldatud enam kui 300 erinevat ioonkanalit,
ioonkanaleid leidub kõikidel rakkudel
kõige levinum on K+ spetsi filine kanal, mis suuresti vastutab püsiva
membraanipotentsiaali eest
närvi ja lihasrakkudes toimub ioonkanalite vahendusel signaali vastuvõtt, levik ja
ülekanne.
Närvi mpulsi levik:
● närvi mpulsi levik on aktsioonipotentsiaal
● aktsioonipotentsiaali vi vad läbi Voltaaz-tundikud kanalid
● plasmamembraani
depolarisatsioon ehk muutus membraani potentsiaalis val andab
aktsioonipotentsiaali
● Na+ kanalid avanevad ja Na+ tungib rakku
Neuromuskulaarne ülekanne (närvilt lihasele) eeldab (vähemalt) 5 erineva kanali
koordineeritud tegutsemist:
● närvi mpulss avab voltaaz-tundlikud Ca2+ kanalid närvirakus > vabaneb
neurotransmitter
● transmitteri seondumine retseptorile avab l igandi-tundlikud N
a+ k
analid >
m
embraani
depolarisatsioon
● depolarisatsioon avab voltaaz-tundlikud Na+ kanalid > kogu plasmamembraani
depolarisatsioon
● plasmamembraani depolarisatsioon avab ka voltaaz-tundlikud Ca2+ kanalid > Ca2+
influx
● esmane Ca2+
sissevool avab sarkoplasmaatilises reti kulumis Ca2+ tundlikud Ca2+
kanalid > järsk Ca2+ sissevool ja
lihaskontraktsioon .
94.Ioonkanalite defektist põhjustatud haiguste olemus ja ioonkanaleid mõjutavad
ravimid ( lidokaiin ).
Ioonkanalite defektsest funktsioonist põhjustatud haigused (channelopathies)
● Suhteliselt suur hulk harvaesinevaid haiguseid (va tsüstiline fibroos, mida vahest
li gitatakse ka kanalopaatiaks)
● Enamikel juhtudel on
patoloogia keskmes närvi – või närvi-lihas ülekanne.
● Domineerib epilepsia – häirunud, ülemäärane ja sünkroonne kortikaalneuronite
erutus, mis väljendub krambihoogudena
● Amelogenesis imperfecta (e. emaili formeerumise häire) võib ol a põhjustatud
mutatsioonis geenis SLC24A4 (kodeerib valku, mis transpordib kaltsiumit hamba
emaili formeerumisel
Lidokai n (xylocaine, lignocaine)
● Enim kasutatav lokaalne anesteetik
● Blokeerib spetsi filised voltaaz-tundlikud Na+ kanalid (Nav1.7) valu aistingut
vahendavates neuronites (notsitseptor e. valuretseptor)
● Sel e tulemus notsitseptor ei depolariseeru ja valuaisting ei teki
● Lidokai ni kasutatakse ka spetsi filiste rütmihäirete raviks
95.Raku organellid ja nende põhifunktsioonid. ● tuum - genoom, DNA, RNA süntees, 2 membraani
●
mitokondrid - energia (ATP) genereerimine
● peroksüsoomid - oksüdati vsed reaktsioonid
● endoplasmaatiline reti kulum - kare, sile - valkude süntees, lipi dide süntees, Ca2+
ladustamine
● Golgi kompleks - valkude ja lipi dide sorteerimine,
modifitseerimine ja valikuline
transport
● endosoomid - makromolekulide modifitseerimine ja transport
● lüsosoomid - makromolekulide ensümaatiline lagundamine
96. Rakusisese transpordi põhiliigid.
3 valkude rakusisese transpordi põhili ki:
1. väravtransport (gated transport) - t uuma j a t sütoplasma vaheline transport l äbi t uuma
poori komplekside
2. transmembraanne
transport
- membraanseoseliste translokaatormolekulide
vahendatud transport läbi membraanide
3. vesikulaartransport - osalevad membraaniga ümbritsetud transpordivesi kulid
97.Transpordimehhanismid tsütosoolist t uuma, mitokondritesse, p eroksüsoomidesse, ERi. ● Tsütosool – tuum (väravtransport), läbi tuumapooride 2 kihti
tuumamembraani .
Määrab tuuma signaaljärjestus NLS, mis seondub kas otseselt või läbi adaptorvalgu
tuumapooril paikneva tuuma
import retseptoriga. Enamasti transporditakse
lahtipakkimata valgud.
● Tsütosool – mitokondrid (transmembraanne) enamik valke imporditakse, sise-ja
välismembraanil
spets . valkude translokaatorid TIM;TOM;SAM,OXA. Toimub
spetsi filise signaaljärjestuse alusel.
Eeldab valkude lahtipakkimist. Signaaljärjestus s
eostub r
etseptoriga välismembraanil
ning translokaator
aktiveerub . Seondumine TIM kompleksiga toimub kohe, kui
välimine membraan on läbitud. Transport lõppeb signaaljärjestuse eemaldamise ja
valgu pakkimisega mitokondrites.
● Tsütosool – peroksüsoomid (transmembraanne) kasutavad hapnikku orgaaniliste
ainete oksüdeerimiseks tekitades vesinikperoksi di H2O2. Katalaasid kasutavad
tekkivat H2O2 mitmete ainete – fenoolid, sipelghape, formaldehüüd,
alkohol ,
oksüdeerimiseks.
Transport
toimub
signaaljärjestuse
alusel,
membraani
translokaatorite vahendusel, ei vaja lahtipakkimist, on posttranslatsiooniline.
● Tsütosool – ER (transmembraanne),
transpordiks on vajalik ER signaaljärjestus,
lisaks on vajalik signalrecognition particle SRP, mis tunneb ära ühelt poolt ER-I
järjestust ja teiselt poolt seondub SRP retseptoriga ER-I
membraanil . Valkude
transport ER-I on ko-translatsiooniline.
98.Vesikulaartranspordi põhimõte; sekretoorne ja endotsütootiline rada. Vesikulaartransporti suunavad valgud (Rab, SNARE) ja nende roll botulotoksiini
toimemehhanismis.
Vesikulaartransport -
retseptor -vahendatud
Membraaniga ümbritsetud transportvesi kulid kannavad laadungi ühest kohast teise. Sel ine
transport käib ER-i ja Golgi kompleksi vahel, Golgi kompleksi ja lüsosoomide ning
välismembraani vahel. Sel e transpordi puhul toimub transportvesi kuli pungumine
lähtekompartmendist, sel e li kumine mikrotuubulite abil teise kohta ning lõpuks ühinemine
sihtkompartmendi mebraaniga.
Toimub membraaniga ümbritsetud organel ide vahel; organel ide ja väliskeskkonna vahel
Sekretoorne e eksotsütoos
Endotsütootiline
Rab - transporti suunavad spets valgud vesi kulil
SNARE - membraani fuseerumisel olulised valgud
Botulism - botulotoksi n toimib kui
proteaas , lõigates SNARE valkusid neuromuskolaarsetes
ühendustes, atsetüülkoli ni sisaldavad transport vesi kulid ei s
aa ühineda r
akumembraaniga,
erutus ei levi närvilt lihasele
99.Golgi kompleksi ja lüsosoomide olemus, funktsioon ja osalemine vesikulaartranspordis. Lüsosomaalsete haiguste olemus.
Golgi kompleks - ülesandeks on süsivesikute süntees, karedapinnalisest ER-ist saabuvate
valkude ja lipi dide modifitseerimine,
sortimine , pakkimine ja edasitoimetamine: 1)
lüsosoomidesse; 2) plasmamembraanile; 3) sekretoorsetesse vesi kulitesse. Pakitud valgud
li guvad vesi kulitesse rakust v
älja, jäävad rakuseina koostisesse v
õi asuvad f unktsioneerima
raku sees. Golgi membraanis esinevad spetsi filised transportsüsteemid, transportimaks
tsütoplasmast suhkruid Golgi kompleksi.
Ühekordse bioloogilise membraaniga organel . Igas rakus on ca 20 diktüsoomi – Golgi
kompleksi elementi, igaühes 5-10 tsisterni. Kumer pind tuuma poole suunatud, nõgus pind
plasmamembraani poole. 3 funktsionaalset osa:
● cis-Golgi – valkude ja oligosahhari dide fosforüülimine
● kesk-Golgi – lipi dide ja glükoprotei nide glükosüülimine
● trans-Golgi – lipi dide, valkude ja glükoprotei nide glükosüülimine, makromolekulide
sorteerimine vesi klitesse, mis hiljem eralduvad.
Golgi kompleksi funktsioonid: 1. Valkude kogumine ja keemiline modifitseerimine
2. Sekretoorsete graanulite tootmine ja
eritamine (eksotsütoos)
3. Plasmamembraani regeneratsiooniks vakuoolide tootmine
4. Lüsosoomide tootmine
5. Mukopolüsahhari dide ja lima süntees (seda tehakse vaid GK-s)
6. Vee sisalduse
regulatsioon rakus
7. Taimerakus pekti ni ja hemitsel uloosi süntees
Peamised funktsioonid on valkude ja lipi dide modifitseerimine ja sorteerimine ja pakkimine.
Need on omavahel tihedalt seotud, sest just valgu modifitseerimine on tihti eelduseks sel e
valgu õigele rakusisesele paiknemisele.
Vesikulaartransport - Golgi kompleksi sisenevad karedapinnalise ER-i eksportpi rkonnalt
punguvad sekreteeritavat valku sisaldavad
põiekesed , mis ühinevad Golgi cis-tsisternide
membraaniga. Põiekesed tühjendavad oma sisu Golgi kompleksi luumenisse, kus toimub
valkude modifitseerimine, sortimine ning pakkimine. Lõpuks on v
esi kulitesse p
akitud v
algud
trans-Golgi pi rkonnas, kust nad
saadetakse lüsosoomidesse. Vesi kulid moodustuvad
transporditava valgu signaaljärjestuse ja ER/Golgi kompleksi membraani retseptorvalkude
vastavuse baasil.
Lüsosoomid - makromolekulide ensümaatiline lagundamine. Ensüümid sisenevad
lüsosoomidesse ER-ist läbi Golgi kompeksi. Seeditavate makromolekulide sisenemiseks 3
põhilist teed: 1)
endotsütoos , 2)
fagotsütoos , 3) autofaagia. Autofaagia - rakule ebavajalike
struktuuride hävitamine.
Lüsomaalsed haigused- kokku umbes 50 haruldast haigust, mil es enamik
autosomaalretsessi vsed. Põhjustatud mõne lüsomaalse ensüümi defektist. Lagundamata
molekul kuhjub ning põhjustab raku k
ahjustust. A
valduvad v
arases e
as n
ing
lõppevad s
ageli
surmaga. Esinevad vaimne mahajäämus ja neuroloogilised probleemid. Näiteks T
ay-Sachs’i
haigus- mutatsioon HEXA geenis.
100.Fagotsütoos, pinotsütoos ja retseptor vahendatud endotsütoos.
Endotsütoos (raku pinnalt algab, lüsosoomis lõppeb) III tüüpi
1) Fagotsütoos - suurte osakeste, bakterite, rakkude endotsütoos, makrofaagid,
ülesanne mikroorganismide hävitamine, vananenud ja kahjustatud rakkude
ärasöömine
2) Pinotsütoos - vedelike ja sel es lahustunud osakeste endotsütoos.
3) Retseptor-vahendatud endotsütoos - retseptorile kinnitunud makromolekulid, klatri n
kattevalkude abil, nt
kolesterool rakku (hüperkolesteroleemia)
101. Pidev ja reguleeritud eksotsütoos.
Sekretoorne e biosünteetiline rada e eksotsütoos
Transport trans-golgi kompleksist väliskeskeskkonda
1) pidev (e. konstituti vne) membraanivalkude pidev transport Golgi kompleksist
välismembraani, läbi mil e toimub membraanivalkude uuendamine
2) reguleeritud- Transporditavad ained kogutakse sekretoorsetesse vesi kulitesse, mis
vabastatakse raku väliskeskkonda peale signaali. Sekretoorsetes vesi kulites toimib
pidev küpsemine ning transporditava molekuli kontsentreerumine ning proteolüütiline
modifitseerimine.
102.Eksotsütoosi roll närviimpulsi ülekandel, allergiate tekkel ja tsütotoksilistes
T-rakkudes. Närvi mpulsi ülekanne - sekretoorne vesi kul ootab rakumembraani lähistel signaali
ning paiskab si s transporditava raku välisruumi.
Al ergiad - nuumrakud deponeerivad histami ni, mis eksotsütoosi teel ümbritsevasse
keskkonda vabaneb; al ergeen val andab histami ni vabanemise nuumrakkudest,
tekib al ergiline
reaktsioon tsütotoksilised T-rakud - toodavad tsütotoksi ne, mis stimulatsioonil paisatakse
naaberrakku. Kinnitudes kahjustatud rakule puurib tsütotoksiline rakk sel e
membraani
kanaleid ja transpordib sinna eksotsütoosi teel tsütotoksi nid, mis
kahjustunud raku hävitavad.
103. Mitokondrite ehitus ja organiseerumine rakus.
Mitokondrid – ehitus: Välismembraan - sisaldab palju pori ne (kanaleid moodustav valk) ja
laseb läbi kõik, mis
kontraktsioon ja rakk li gub.
2) lihaskontraktsioon – müosi n li gub
akti ni suhtes.
Koolnukangestus (rigor mortis), 2-4h peale surma. ATP sünteesi lõpp -> Ca+ ei tule
akti n-müosi n k
ompleksi →
k
ontraktsioon j ääb faasi, kus m
üosi n o
n seotud a
kti niga. K
estab
48-60h.
112. Intermediaarsete filamentide spetsiifilised omadused ja funktsioonid. Seos
haigustega.
Omadused:
köiesarnane struktuur - annab tugevuse
polümeer pole
polaarne (vähene dünaamilisus)
koosneb suurest perekonnast erineva funktsiooniga valkudest
erinevate tüüpide ekspressioon sageli raku- ja koespetsi filine
suur hulk erinevate mutatsioonide poolt põhjustatud patoloogiaid
spetsi filine patoloogia väljendub koes, kus antud filament ekspresseerub
Funktsioon - enamasti funktsioon seotud rakustruktuurile mehhaanilise stabi lsuse ja
tugevuse andmisega.
113.Tsütoskeleti mürgid. Paljud seente ja taimede enesekaitsesüsteemid on a
kti ni v
õi m
ikrotuubulite v
astu (
mitoosi ei
toimu!). Fal oidi n on valges kärbseseenes ja seondub akti nifilamentidega. Osad on võetud
kasutusele kasvajate
ravis . Nt. Taxol (jugapuust)
114.Rakukontaktid: üldiseloomustus ja jaotus.
Multitsel ulaarse organismi ülesehitus sõltub kontaktidest:
1) Rakkude vahel (rakk-rakk)
2) Raku ja ekstratsel ulaarse maatriksi (ECM) vahel (rakk-ECM) *ECM – e.
rakuvaheaine ,
mis koosneb erinevatest rakkude valmistatud ja sekreteeritud polüsahhari didest ja
valkudest. NT Epiteel – peamiselt rakk-rakk
ühendused .Sidekude – peamiselt rakk-ECM
ühendused.
Funktsiooni alusel võib eristada nelja tüüpi ühendusi:
1) Ankurühendused (adherence junctions) – ni rakk-rakk, kui rakk- ECM – seotud
tsütoskeletiga.
2) Tiheli dused (tight juctions, occluding juctions) - epiteelis rakk-rakk – takistavad lekkeid
epiteeli rakkude vahelt.
3) Kanal- e. auk li dused (channel or gap junctions) – loovad ühendusi kõrvuti
asetsevate rakkude vahel
4) Signaliseerivad ühendused (communicating or
signal -relaying junctions) – loovad
eeldused signaali ülekandeks
rakult rakule (plasmamembraani vahendusel).
115.Kadheriinid: spetsiifilised omadused ja funktsioonid.
Kadheri nid:
Rakk-rakk
ühendused.
Seonduvad
kas
akti ni
filamentidele või
intermediaarsetele filamentidele. Ca2+ sõltuvad.Moodustavad homofi lse takjas-tüüpi
ühenduse. On selekti vsed ja sageli tagavad samatüübiliste rakkude adhesiooni. On
kirjeldatud >100 erineva kadheri ni. Kadheri nide abil toimub samatüübiliste rakkude
adhesioon (sceplenije) – nende süstematiseeritud ekspressioonimuster tagab kudede
differentseerumise embrüogeneesi käigus. Epiteelis moodustub k
adheri ni a
nkurli dustest (
ja
nendega seotud rakusisestest akti nifilamentidest nn adhesioonivöö (zonula adherens).
Adhesioonivöö koordineeritud (
ja mootorvalkude p
oolt v
ahendatud) k
ontraktsioon o
n aluseks
kõigi toru ja kerakujuliste organite morfogeneesis. Omaette grupi moodustavad
intermediaarsete filamentidega (nt kerati niga) ühenduses olevad nn ebatüüpilised
kadheri nid (desmoglei n, desmokol i n). Nende põhifunktsiooniks on rakkude sidumine
ja koele (nt nahale) mehhaanilise tugevuse andmine.
Pemphigus e vil tõbi
Haruldane (1:1000000) autoimmuunhaigus, mil e puhul tekib
immuunsüsteemi reaktsioon normaalse kehavalgu – desmoglei ni vastu. Keratinotsüütide
vahelised li dused hävivad, mis väljendub vil idena nahal ja l imkaskestadel. Raviks –
vedelik
ja elektrolüüdid, immuunsupressandid.
116.Integriinid: spetsiifilised omadused ja funktsioonid.Tähtsus füsioloogilistes
protsessides ja haiguste patogeneesis.
Integriinid: Rakk-ECM ühendused. Seonduvad
ECMi eri komponentidele (fibronekti n,
fibrinogeen , kol ageen, lamini n). On Ca2+ sõltuvad, suur grupp (imetajatel 24) erinevaid
molekule. On
alpha ja
beta subühikust koosnevad heterodimeerid. Sageli heterofi lne
ühendus. Tsütoplasmas seonduvad integri nid seoseliste valkude abil kas: a) Akti ni
filamentidele või b) Intermediaarsetele filamentidele (nt kerati nile).
2 põhifunktsiooni: 1) Kinnitumine ECM-ile 2) Signaali ülekanne ECM-ilt rakule ja s
ignaalist
lähtuvalt: - Raku kasv - Raku jagunemine - Migreerumine - Diferentseerumine - Apoptoos
Osalevad väga paljudes komplekssetes füsioloogilistes ja patoloogilistes protsessides nt:
immuunrakkude migreerumine põletikukoldesse ja sel e häired; vere
hüübimine ja trombide
teke; angiogenees ja vähi metastaseerumine.
Adhesioonikaskaad: põletiku koest vabanevad põletikumediaatorid põhjustavad
adhesioonimolekulide ekspressiooni endoteeli rakkudel ja põletikurakkudel. Valged
verelibled seonduvad
kõigepealt endoteeliga nõrgalt – (vahendavad selekti nid) ja seejärel
tugevalt (vahendavad integri nid), misjärel toimub põletikuraku migreerumine põletiku
pi rkonda.
Leukocyte adhesion deficiency (LAD) Haruldane autosomaal-retsessi vne haigus.
Sagedus 1:100 000 Põhjuseks mutatsioon integri n beta 2 subühikut (CD18) kodeerivas
DNAs. Osaleb adhesioonimolekul LFA1 integri ni struktuuris. LFA1 ei funktsioneeri
leukotsüütidel ning leukotsüüdid ei kinnitu endoteelile ega migreeru põletiku koldesse.
Sümptomid: Sünnijärgselt rasked ja korduvad kopsupõletikud, kõrvapõletikud, peritoni did
jne. Standardravi – luuüdi transplantatsioon.
Vere hüübimine: Val andajaks on
veresoone seina (endoteeli) kahjustus ning koefaktori
(tissue factor) jt ECMi komponentide (kol ageen)
kokkupuude verega. See val andab
hüübimiskaskaadi, mis lõppeb trombotsüütidest ja fibrinogeenist koosneva trombi
kleepumisega kahjustatud kohale. Integri nid vahendavad trombotsüütide kleepumist
kol ageenile ja fibrinogeenile ja omavahel.
Tromboos: Veresoone ummistus, mis on põhjustatud vere hüübimisest veresoone s
iseselt.
Tekkiv
tromb blokeerib verevoolu ja antud koe verevarustuse. Tähtsamad k
omplikatsioonid:
müokardi
infarkt , aju infarkt. On Eestis vastavalt esimene ja t eine s
urma p
õhjus. Spetsi filise
integri ni αIIbβ3 blokeerimine on andnud väga häid tulemusi tromboosi profülaktikas, aga
tänu ohtlikele kõrvaltoimetele (veritsus), hetkel praktikas ei kasutata.
Integriinid ja kasvajad : Ka
kasvaja kasvuks on vaja
verevarustust – angiogeneesi. Lisaks
peab kasvaja metastaseerumisel vähirakk kinnituma ja prolifereeruma. Mõlemaid protsesse
vahendavad integri nid. *Teatud integri ni - ανβ3 ekspressioon kasvajas on halva
prognostilise tähendusega kuna peegeldab kasvaja võimet tungida kudedesse ja
prolifereeruda. *Integri nid on oluliseks märklauaks tuleviku kasvajavastaste ravimite
väljatöötamisel.
117.Selektiinid ja Ig perekonna adhesioonimolekulid.
Selekti nid: Immunoglobuli n (Ig) perekonna adhesioonimolekulid. Selekti nid (E-selectin,
L-selectin, P-selectin) ja Ig perekonna adhesioonimolekulid: Intercel ular Cel Adhesion
Molecule (ICAM-1) – seondub LFA1-le, Vascular Cel Adhesion Molecule (VCAM-1),
Platelet-endothelial Cel Adhesion Molecule (PECAM-1) jt.
Osalevad pigem rakk-rakk ühenduste loomises ja on olulised eelkõige põletikurakkude
migreerumisel põletikulisse koesse.
118.Tiheliidused ja nende üldine iseloomustus.
Esinevad epiteelis, lokaliseerudes epiteelirakkude apikaalsesse osasse. Seovad epiteeli
rakke omavahel ja takistavad vedelike j a molekulide l i kumist läbi rakkudevahelise r
uumi. O
n
homofi lselt seotud naaberraku tiheli duse valguga. On rakusiseselt seotud akti ni
filamentidega. Moodustavad epiteelirakkudevahelise tihendi ja tagavad molekulide gradiendi
väliskeskonna/luumeni ja sisekeskonna vahel. Peamised tiheli duse valgud on klaudi nid ja
okludi nid.
Eriti olulised on tiheli dused kohtades, kus tuleb välistada ioonide jt madalmolekulaarsete
ainete lekkimine rakkude vahelt - neerudes, sapiteedes, sisekõrvas.
Mutatsioonid tiheli duse valke kodeerivates geenides on haruldased ja põhjustavad sageli
häireid ioonide (Mg++) tasakaalus,
sapi formeerumise häireid ja kurtust.
119.Kanalliidused;nende üldine iseloomustus ja tähtsus.
Kanal- e. aukli dused (channel or gap junctions). Esinevad enamikes imetaja rakkudes.
Loovad ühenduse väikeste (1%.
135. PCR - i etappide kirjeldus
PCR ehk polümeraasi ahelreaktsioon (polymerase chain reaction) on DNA paljundamise
meetod, mis võimaldab uurida ühte kindlat DNA järjestust. PCR-i käigus on reaktsiooni läbi
vi v ensüüm, DNA polümeraas, võimeline „tootma“ mõnesajast (tehniliselt kas või ühest)
DNA molekulist miljoneid
koopiaid .
Sealjuures on PCR-iga võimalik uurida paarikümne kuni
mitmetuhande nukleoti di pikkuseid regioone.
PCR-i tööpõhimõte – DNA „paljundamine“ toimub tsükliliselt
kolmes etapis :
1) Tsükli esimeses etapis toimub DNA kaksikahelate denatureerimine – kõrge temperatuuri
(95°C) toimel katkevad ahelatevahelised vesiniksidemed ja tekib 2 üheahelalist DNA
molekuli;
2) Teises etapis seonduvad mõlemale tekkinud üheahelalisele DNA molekulile neile
vastavad praimerid (56 °C);
3) Kolmandas etapis sünteesitakse ensüümi töötemperatuuril (~72 °C) uued DNA ahelad,
kasutades lahuses olevaid
vabu nukleoti de.
Sel ist temperatuuride tõstmise ja langetamise skeemi korratakse 30-40 korda sel eks, et
analüüsi jaoks
sünteesitaks pi savalt DNA-d (uute ahelate süntees on eksponentsiaalne
protsess – igas
tsüklis DNA molekulide arv kahekordistub).
136. PCR - i segu komponendid ja nende roll ● Matri ts-DNA – DNA, mil e järjestust PCR-il „paljundatakse“
● DNA polümeraas – ensüüm, mis vi b reaktsiooni läbi (sünteesib uusi DNA lõike)
● Praimerid – lühikesed DNA lõigud, mis märgistavad huvipakkuva regiooni sel ele
seondudes ja mil est algab uute ahelate süntees
●
MgCl2 – Mg2+ ioonid on vajalikud DNA polümeraasi töö jaoks
● Vabad nukleoti did – ehituskivid uute DNA molekulide sünteesiks
● PCR
puhver + vesi – keskkond reaktsiooni läbi vi miseks.
137. Restriktaasid, nende funktsioon bakterites ja nende kasutus DNA analüüsimisel
Tegemist on bakteriaalset päritolu ensüümidega, mis on bakterites oluliseks v
i rusvastaseks
kaitsemehhanismiks. Restriktaasid tunnevad ära
kindlaid DNA järjestusi ja järjestusega
seondumise järel lõikavad DNA ahela katki. Näiteks tunneb tuntumaid sedalaadi ensüüme
EcorI DNA ahelas spetsi filiselt ära järjestuse GAATTC, seondub ning lõikab DNA G ja A
nukleoti dide vahelt katki.
Kuna DNA koosneb kõigis organismides samadest nukleoti didest, on restriktaase võimalik
kasutada ka imetajate genoomi
analüüsimiseks . Restriktaasiga töödeldud DNA ahelast
tekkinud erineva pikkusega fragmendid lahutatakse teineteisest geelelektroforeesi (vt
al pool) abil. Sel moel on võimalik teha indivi diti kindlaks, kas vaadeldud pi rkonnas esineb
indivi dide vahel erinevusi. Mõnel juhul on neil väikestel erinevustel väga suur mõju
konkreetse indivi di fenotüübile. Näiteks on võimalik tuvastada inimese vastuvõtlikkust
HIV-ile (ühele tüvele), kuidas inimene tunneb vi endat põhimaitset – umamit, sugulusastet
jne.
138. DNA - geelelektroforeesi põhimõtted
Geelelektroforeesil pannakse DNA fragmendid li kuma elektriväljas poorses geelis. DNA
proovid sisestatakse geeli ühte serva ja
geel a
setatakse elektrit j uhtiva vedeliku s
isse (
sama
puhverlahus , mil ega algselt geel valmistati). Sel iselt valmistatud süsteemis on ni geel kui
seda ümbritsev lahus sarnase elektrijuhtivusega (mõlemates on samad lahustunud soolade
ioonid sisuliselt samas kontsentratsioonis). Kui nüüd sel isest
süsteemist juhtida läbi
elektrivool (nimetatakse ka geeli voolutamiseks), hakkab DNA li kuma läbi geeli + laenguga
elektroodi poole. Kõik DNA lõigud aga ei li gu geelis sama ki rusega – mida suuremad on
DNA fragmendid, seda enam takerduvad n
ad g
eeli võrgustikku j a l i guvad seetõttu v
õrreldes
väiksemate DNA molekulidega geelis aeglasemalt. Kindla pikkusega DNA lõigud li guvad
geelis aga enam-vähem sama ki rusega, moodustades korrapärase vöödi
139. Geeli koostis ja struktuur Geel valmistatakse tüüpiliselt agaroosist – p
olümeersest
suhkrust , m
is l ahustatakse kuumas
puhverlahuses ja mis moodustab hangudes tahke geeli, mil e sisemine mikroskoopiline
struktuur meenutab tihedat võrgustikku.
140. DNA - markeri kasutus
Kui tahetakse teada uuritava DNA fragmendi pikkust, lisatakse geeli ühele „rajale“ ka segu
kindla meile teadaoleva pikkusega DNA fragmentidest, nn DNA marker. Kõrvutades oma
proovi meile teadaoleva pikkusega vöötidega, saame sel e kaudu tuletada ligikaudse
fragmendi pikkuse.
141. DNA visualiseerimine geelil Kuigi geelis olev DNA on palja silmaga nähtamatu, on võimalik seda teatud keemiliste
ühenditega nähtavaks muuta. Kõige levinumaks
ühendiks on
etiidiumbromiid, m
is s
eostub
kaheahelalise DNA molekuliga ning kompleksis sel ega
helendab ultraviolettvalguse käes.
PIIRSOO OSA
Loeng 2. Rakkude proliferatsioon , rakutsükkel ja selle regulatsioon
1.Rakutsükkel ja rakutsükli faasid
Rakutsükkel – raku
eluring mitoosi lõpust läbi interfaasi järgmise mitoosi lõpuni.
Faasid: G1 - postmitootiline e presünteetiline
period interfaasis , rakk kasvab, toodab
ekskretoorseid aineid. S – DNA - replikatsioon, kromosoomivalkude süntees j a t sentrosoomi
duplikatsioon. G2 – sünteesitakse peamiselt käävimaterjali ja mitoosiks vajalikku ATPd. M
–
mitoos (profaas,metafaas,anafaas,telofaas). Olemas ka G
0 p
unkt, et p
arandada vigu e
nne S
faasi või kui rakul ei ole vaja jaguneda hetkel. G1 ja G2 kontrol punktid, mil e läbides rakk
satub järgmisse faasi kui on terve ja kahjustusteta.
2.Rakkude j aotus p roliferatsiooni j ärgi: Mitteuuenevad rakud, Potensiaalselt uuenevad rakud, Pidevalt uuenevad rakud. Näited
Proliferatsioon – rakkude paljunemine.
Mitteuuenevad rakud – neuronid, kardiomüotsüüdid. Koes ei oma mingit proliferati vset
akti vsust, ei jagune enam. Asenduvad koes väga aeglaselt ja seda tüvirakkude arvel. Neil
on pikk eluiga ja nad on kaitstud mitmeti, nt hematoentsefaalbarjäär ajus. Neis tekib
vananemisega seotud muutuseid. (Neuroneid ei teki pärast sündi).
Potentsiaalselt uuenevad rakud – hepatotsüüdid. Normaalselt ei jagune, on G0 faasis.
Võivad minna uuesti akti vsesse rakutsüklisse. P
roliferatsiooni i nduktoriks
maksas o
n maksa
kasvufaktor HGF. Maksa regeneratsioon võib t oimuda o
lemasolevate r
akkude a
rvel. N
ÄIDE:
Maksa kahjustusel Kupfferi rakud aktiveeruvad ja hakkavad produtseerima tumori
nekroosifaktorit TNF ja interleukin 6. Lisaks mõjuvad ka insuli n, epidermaalne kasvufaktor
EGF, norepinefri n, T3, HGF poolt toodetud ained. Nende faktorit e
koostoime vi b
hepatotsüüdidtagasi G0 - st G1 - te.
Pidevalt uuenevad rakud – epidermis, vererakud. Neis kudedes on olemas lokaalsed
tüvirakud, mis pidevalt uuendavad kudet. Tüvirakud ei ole diferentseerunud, neil on
pi
ramatu paljunemisvõime kui nende arv hoitakse koes konstantsena, kuna pärast
jagunemist 1
tüvirakk diferentseerub ja teine säilitab
tüviraku staatuse.
3 . Millistes organites - kudedes rakud paljunevad kiiresti ja millistes aeglaselt?
Ki resti –
veri , sooleepiteel, epidermis.
Aeglaselt – Närvikude,
reetina , süda.
4.Rakutsüklit kontrollivad järgmised faktorid: tsükliinid /Cyclins / ja tsükliinidest
sõltuvad kinaasid /Cyclin dependent kinases (Cdk’s). Nende funktsioonid rakutsüklis.
+Tsükli nid
on valgud, mis reguleerivad r akutsüklit ensüümide k
inaaside a
ktivatsiooni k
audu;
regulatoorne valk
Kinaasid on ensüümid mis fosforüülivad valke, kannavad energeetiliselt kõrge energiaga
molekulidelt / ATP, GTP/ fosforhappe jäägi teistele molekulidele - näiteks valkudele.
Tsükli nidest sõltuvad kinaasid on akti vsed kui nad on seotunud tsükli nidega. Akti vse
tsükli nist sõltuva kinaasi võib inhibeerida rida i nhibi toreid, m
is s
amuti o
n v
ajalikud r
akutsükli
regulatsiooniks. Kinaasne akti vsus ja valkude fosforüülimine on vajalikud rakutsükli
jätkumiseks - üleminekuks ühest tsükli faasist teise.
5. Tsükliinid ja tsükliinist sõltuvate kinaaside komplekside muutus rakutsüklis.
Tsükli nid ja tsükli nist sõltuvate kinaaside kompleksid muutuvad rakutsüklis/ kinaaside
akti vsuse järgi. G1 - cdK4 - Cyclin D
; S
– c
dK2 -
Cyclin E; G
2 –
c
dK2 -
C
yclin A
; M
– c
dK1 -
Cyclin B. Mitte ainult positi vne kontrol olemas: p21 valk seostub CDK(1,2,3,4,6) v
alguga ja
inaktiveerib ta. Nt DNA kahjustuste korral p53 onkovalk aktiveerub ning p21 sünteesitakse
pi savalt, et blokeerida ülemineku järgmisse faasi.
6. Valk p21 kui universaalne inhibiitorvalk. Tema sünteesi regulatsioon ( kuidas p53
valk mõjutab seda ekspressiooni).
Akti vne p53 onkovalk seostub p21 geenile ning ekspresseerib ta. Seejärel sünteesitakse
p21 geeni pealt p21 valke, mis on rakutsükli peatajaks. P21 seostub CDK1, CDK2, CDK3,
CDK4 ja CDK6 - ga ning inaktiveerib neid. Tulemusena on see, on rakk ei saa üle minna
järgmisesse tsüklisse. See toimub, et ära hoida vigase raku funktsioneerimine.
7. Tuumori supressorvalk p53 ja tema funktsioon rakutsüklis
DNA k
ahjustus i ndutseerib kasvaja s
upressorgeeni p53 aktivatsiooni, s
ee o
makorda g
eenide
BAX ja BAK valkude ekspressiooni. BAX/BAK valgud indutseerivad mitokondrite pooride
tekke, kust valk tsütokroom C
lekib välja stimuleerides apoptosoomide moodustumise (cyt
ochrome c, A
paf -
1, c
aspase - 9
). Aktiveeruvad k
aspaasid/ c
aspases . Aktiveeritud C
aspase
9 märkmolekulid on procaspase 3 ja procaspase -
7
, mil e polüpeti dahelat t a lõikab, m
uutes
need akti vseteks ensüümideks caspase - 3 ja caspase - 7, mil e märkmolekulideks on rida
ensüüme, sealhulgas poly ADP ribose polymerase . Kõik need ensüümid vastutavad
apoptoosi aktiveerimise eest.
Või aktiveerib p21 valku sünteesi tsükli peamiseks G0 faasis.
8. Retinoblastoomi valk pRb ja tema funktsioon rakutsüklis pRB e retinoblastoomi valk, mis seostub transkriptsioonifaktori E2Figa ja inaktiveerib sel e.
Sel ega blokeeritakse rakkude proliferatsiooni. G1 faasis toimuv pRb fosforüülimine
tsükli nist sõltuva kinaasi/ CDK/ toimel, vabastab seosest ka transkriptsioonifaktor E2F.
9. Transkriptsioonifaktor E2F ja tema funktsioon rakutsüklis
E2F on transkriptsioonifaktor paljude rakutsüklis osalevate geenide aktivatsioonil. A
ktiveerib
paljusid S faasi geene, sealhulgas ka polümeraase, mida on vaja sünteesiks.
10. pRb ja E2F seos rakutsüklis. – vaata 8.
11. Kasvufaktorid FGF, EGF, PDGF, EPO, HGF, GM - CSF12. Milliste katsetega tehti
kindlaks tsükliinide ja tsükliinist sõltuvate kinaaside toime rakkudele?
- FGF – Fibroblastide kasvufaktor – monotsüüdid, makrofaagid toodavad. Tüvirakke,
fibroblaste, endoteeli mõjutab.
- EGF – Epidermaalne kasvufaktor – Monotsüüdid, makrofaagid toodavad. Endoteeli,
epiteeli mõjutab.
- PDGF – Trombotsüütidest pärit kasvufaktor – monotsüüdid , makrofaagid toodavad.
Endoteeli, epiteeli mõjutab.
- EPO – Erütropoeti n – Sünteesitakse neerudes, indutseerib erütropoeesi
- HGF – hepatotsüütide kasvufaktor – Hüpofüüsirakud toodavad. Mõjutab hepatotsüüte ,
luurakke, fibroblaste.
- GM - CSF 12 – Granulotsüütide -
m
akrofaagide kolooniat s
timuleeriv f aktor –
makrofaagid,
fibroblastid , endoteel toodavad. Mõjutab vereloomerakke.
Loeng 3. Rakkude signalisatsioon. Signaaliülekanne
1. Rakkude kommunikatsiooni viisid: endokriinne, parakriinne - autokriinne,
neuraalne , kontaktne /contact - dependent
Endokri nne – signaaliks on hormoonid. Hormoonid toodetakse ja väljutatakse verre
endokri nsetest e sisesekretsiooninäärmetest. Hormoonid transporditakse vere kaudu.
Tegemist on kaugsignalisatsiooniga kuna märkrakud asuvad tavaliselt kaugel. NÄITED:
kilpnäärmehormoonid sünteesitakse kilpnäärmes. M
ärkrakkudes o
n enamuse k
udede rakud,
eriti aga maksarakud, neerukoe rakud, soolerakud, spdame ja skeletilihaskoe rakud.
Parakri nne - autokri nne – Signaalmolekul toimib lokaalselt, signal mõjub lähisrakkudele
(signaalrakk toodab signaalmolekulit, mis mõjub märkrakkule) . NÄITED: glükagooni toime
insuli ni produktsioonile pankrease
Langerhansi saarte beta rakkudes. Vererakkude poolt
toodetud ainete mõju teistele vererakkudele põletiku ja immuunreaktsioonides.
Neuraalne – rakkudevahelise kontakse suhtluse 1
k
õige t untumaid vorme. T
oimub n
euronite
ja märkrakkude vahel. S
ignaaliks o
n n
eurotransmitterid (atsetüülkoli n, G
ABA, dopami n j ne),
mis toodetakse ja väljutatakse neuronitest sünapsites.
Sünapsid on spetsi filised seosed
rakkude vahel.
Kontaktne – esineb rakkude vahel kudedes, eriti tähtis arengus. Otsene kontakt. NÄITED:
Rebukoti vereloomes on vererakkude ja stroomarakkude kontakt signaaliks erütrotsüütide
diferentseerumisele. Rakkude otsene kontakt ja rakkude ja rakuvälise maatriksi kontakt on
signaalideks rakkudele.
2. Kas rakud reageerivad ühele ja samale signaalile ühtmoodi või erinevalt. Näited.
Rakud võivad reageerida s
ignaalidele erinevalt.
Retseptorid t unnevad ä
ra unikaalse s
ignaali,
retseptori valgud võivad pärast seostumist signaaliga põhjustada erinevaid muutusi rakus.
Kui rakul pole spetsi filist retseptorit, si s ta ei tunne ära signaali.
Näide neurotransmitter atsetüülkoli ni toimest erinevatle rakkudele: Südame lihasrakkuga
seostumisel vähendab kokkutõmbe jõudu ja ki rust. Skeletilihas rakkuga seostudes toimub
kontraktsioon. Süljenäärme rakul kutsub esile sekretsiooni.
3. Rakkudevahelise signalisatsiooni etapid:
- Signaaalmolekulide süntees signaalrakkudes.
- Signaalmolekulide väljutamine ja ringlusse saatmine .
- Signaalide transport märkrakuni.
- Signaalide äratundmine märkraku retseptori poolt .
- Märkrakkude metabolismi, funktsiooni , arengu muutused signaalide toimel.
- Signaalide kõrvaldamine, mis tavaliselt ka lõpetab raku reaktsiooni signaalile .
4. Mis on ligand, agonist , antagonist?
- Ligand - rakule loomulik ja spetsi filine sti mul , mis mõjutab retseptorit .
- Agonist - sti mul, mis ei ole rakule omane signaal, kuid indutseerib samuti rakureaktsiooni .
- Antagonist - ühend, mis seostudes blokeerib kül retseptori, kuid ei kutsu esile
rakureaktsiooni .
5. Milles seisneb steroidsete ja peptiidsete hormoonide erinev toimemehhanism?
Steroidne
hormoon seostub rakusisese retseptoriga ja kompleks seostub DNAga
aktiveerides geene. Valguline hormoon seostub rakupinna retseptoriga, mis seejärel
aktiveerib järjestikku rida signaali edasikande molekule.
6. Millised ained on signaalideks rakkudele?
Ligandid e signaalmolekulid on väga erinevad ained : valgud (kasvufaktorid, tsütoki nid);
pepti did (signaalid immuunsüsteemis); aminohapped (hormoonid T3,T4); nukleoti did
(cAMP);
steroidid (hormoonid); rasvhapped ja derivaadid (prostaglandi nid); lahustunud
gaasid (NO).
7. Signaalmolekulide näited – eelmine küss.
8. NO kui signaal silelihasrakkudele. Toimemehhanism
NO on signaalmolekul silelihaste lõõgastumiseks. NO seostub otseselt rakusisese ensüümi
guanolüültsüklaasiga j a a
ktiveerib sel e, m
is k
atalüüsib omakorda c
GMP t ekke G
TPst. c
GMP
toimib vasodilaatorina – veresoonte laiendajana. See ei tohi kaua kesta ning lagundatakse
GMP molekuliks.
cGMP tagatakse veresooni ümbritsevate silelihasrakkude kontraktsiooni.
9. Milline toime on kasvufaktoritel?
Seostub retseptoriga (rakumembraanil), toimub signaali ülekanne (
hunnik kinaase
kordamööda), mingi
kinaas aktiveerib lõpuks transkriptsioonifaktori tuumas. Edasi
sünteesitakse mingi geeni mRNA jne.
Need on rakkude kasvu, proliferatsiooni ja diferentseerumist mõjutavad ained. Enamasti on
need valgud või hormoonid. Mõjutavad väga erinevaid bioloogilisi protsesse ja rakkude
akti vsusi. Need on signaalmolekulid rakkude vahel, kus üks rakk neid toodab ja väljutab,
teine rakk – märkrakk - neid seostab oma retseptoritega ja aktiveerub. Näited: FGF -
fibroblastide kasvufaktor (fibroblastic
growth f actor), B
MP - l uu morfogeneeetiline v
alk ( b
one
morphogenetic protei n), VEGF - vaskulaarse endoteeli kasvufaktor ( vascular endothelial
growth factor) jt.
10. Signaalretseptorite tüübid: Ioonkanalite retseptorid, G - valguga seotud
retseptorid, Ensüümi türosiinkinaasi aktiivsusega retseptorid, Rakusisesed
retseptorid
Esimesed 3 on rakupinna retseptorid.
Ioonkanalite retseptorid – neurotransmitter atsetüülkoli n seostub retseptoriga ja ioonkanal
avaneb . Ioonid tungivad rakku sisse ja muutub rakumembraani elektriline potentsiaal kuna
ioonide kontsentratsioon raku sees ja väljas on erinev. Elektrilise potentsiaali muutus
antakse edasi ja see toimib nt närvirakkudes erutuvusena või lihasrakkudes
kontraktsioonina.
G - valguga seotud retseptorid – rakupinnal on retseptor, mis pärast signaali vastuvõtmist
seostub rakus oleva G - valguga. GDPga seoses olev G valk on inakti vne. G - valk, mis
koosneb 3st pepti dist aktiveeritakse GDP fosforüülimistega,
kusjuures 3 osast koosnev G
valk jaguneb seejärel
osadeks , mil est igaüks muutub akti vseks ensüümiks. G valgud on
raku membraaniga seotud guanosi n nukleoti de siduvad valgud, mis osalevad
signaaliülekandes.
Ensüümi türosi nkinaasi akti vsusega retseptorid – nendel aktiveerub pärast signaaliga
seostumist rakusisene domään, mis muutub akti vseks türosi nkinaasiks (ensüümiks, mis
fosforüülib valgus aminohapet türosi ni). Ligand aktiveerib retseptori n
t kahe retseptori ahela
seostamise kaudu.
Rakusisesed retseptorid – nendega seostuvad hormoonid.
11. Millal on G valk aktiivne ja millal inaktiivne?
Kui nad seovad GTP – guanosi n trifosfaati, si s on nad akti vsed, kui nad seovad GDP –
inakti vsed.
12. Mis on cAMP ja cGMP, millest n ad moodustatakse j a miks ei t ohi n ende s ignaalide mõju olla pikaajaline ?
cAMP – cyclic adenosine monophosphate. On ATP derivaadiks. cGMP – cyclic guanosine
monophosphate, GTP derivaadiks. Need väikesed molekulid on sekundaarsed
messengered ning nad aktiveerivad uusi ensüüme. Sekundaarsed signaali ülekande
molekulid. Aktiveerivad paljusid kinaase, mis võivad seejärel li kuda rakutuuma ja
fosforüülide geeniregulaator - valke.
NÄIDE m
iks e
i t ohi ol a pikaajaline: A
drenali ni k
ui s
üdamelihasele m
õjuv s
ignal intensi vistab
südame töö. Efekt jääb püsima pikemaks ajaks kui signaalid e cAMP säilivad rakus. Võib
südant ja teisi organeid üle koormat.
13. Mis on erinevat ja ühist kõigil ensüümretseptoritel? Signaali seostumisel ensüümretseptoritega, aktiveerub retseptori rakusisene osa, m
uutudes
akti vseks fosforüülivaks ensüümiks e kinaasiks – ühine tööprintsi p. Neil on kõigil omad
domäänid.
14. Mis tähendab ensüümretseptori aktivatsioon ?
Ensüümretseptori aktivatsioon tähendab, et pärast signaaliga seostumist rakusisene
domään aktiveerub ning muutub akti vseks ensüümiks.
15. Milles seisneb rakusisene signaaliülekanne ja mis tähendab signaali
amplifitseerumine?
Signaalid, mis saavad a
lguse j a t oimivad r
akkude s
ees. V
alkudel o
n s
ignaaljärjestused, mil e
abil toimub nende seostumine erinevate rakuruumide membraanidega. ER - i ribosoomidel
sünteesitud valgud saavad signaaljärjestuse ER rakuruumi sisenemiseks.
Ligand seostub retseptoriga, see vi b valkude konformatsiooni m
uutumiseni, n
eed o
makorda
aktiveerivad teisi valke raku sees, järgnevalt on võimalikud väga erinevad signaaliülekande
teed, saab sünteesida DNAd, RNAd, valke ja muid aineid.
Signaali amplifitseerumine e signaali võimendumine signaalteel. Iga keemiline reaktsioon
signaalitee ahelas põhjustab aina rohkemate ainete/signaalmolekule aktiveerimist ja sel ega
kaasneb ka signaali võimendumine.
16. Kuidas rakk reageerib signaalidele? Millise mehhanismi kaudu?
Retseptorid tunnevad ära unikaalse signaali, retseptori valgud võivad pärast seostumist
signaaliga põhjustada erinevaid muutusi rakus.
Signaali vastuvõtt, ülekanne, vastus. Signaal peab mõjutama geeniregulatsiooni.
17. Mis mõjutab signaalteedes geeniekspressiooni?
Geeniekspressiooni mõjutavad transkriptsiooni faktorid – valgud, mis seonduvad DNAga
vastuseks ekstratsel ulaarsetele signaalidele. Samuti ka posttranskriptsioonilised faktorid –
alternati vne splaissing, posttranslati vne modifikatsioon (insuli ni näide 38 küssis).
18. Miks on vajalik signaal kiirelt kõrvaldada - inhibeerida?
Signaalide ki re kõrvaldamine on vajalik homeostaasi taastamiseks.
19. Kuidas inhibeeritakse cAMP ja cGMP kui aktiivsete signaalmolekulide toime?
cAMP k
ontsentratsiooni suurenemisel v
õib r
akus toimuda membraanide j a t eiste s
truktuuride
fosfolüürimine, mil e tulemusena tsütoplasmas kasvab Ca2+ ioonide kontsentratsioon.
Vi mane omakorda seondub kalmoduli niga tingib cGMP - nukleoti di kontsentratsiooni, mis
ki rendab cAMP hüdrolüüsi fosfodiesteraasi abil. cAMP kogus väheneb. See mehhanism
töötab ka teiste agentide aktiveerimisel, mis suurendavad Ca2+ suhtes permeaablust. Nt
atsetüülkoli n võib inhibeerida cAMPi. cGMP molekuli toimet inhibeerib samalaadselt
fosfodiesteraas type 5.
Loeng 4. Onkogeenid ja onkovalgud. Kasvajarakud
1. Proto - onkogeenid, Onkogeenid, Tuumori suppressorgeenid Proto - onkogeenid – rakkude normaalset talitlust tagavad geenid, mis aga geneetilisel
muutumisel mutatsioonide korral võivad esile kutsuda kasvajate tekke. Geenid, mil est
võivad saada onkogeenid kas mutatsiooni teel oma tavalises asukohas või asukoha
vahetuse teel. Normaalselt on nende
produktid olulised signaalide ülekandekaskaadides,
transkr. läbivi jatena ja apoptoosi regulaatoritena. Geenmutatsioonid põhjustavad
dominantse al eeli tekkimise, mis kutsub esile kasvaja tekke.
Onkogeenid – muteerunud normaalsed geenid (proto - onkogeenid) või r
etrovi ruste geenid,
mida vi rused on rakkudesse
toonud ja mis seejärel
kutsuvad esile normaalsete rakkude
muutumise kasvajarakkudesse oma vigaste produktide onkovalkude või li gse akti vsuse
kaudu.
Tuumori supressorgeenid - kasvajat põhjustavad nende retsessi vsed al eelid. geen, mis
normaalsena juhib oma produktide kaudu rakujagunemist. Kutsutakse ka anti -
onkogeenideks – suruvad al a0 onkogeenide talitlust ja takistavad kasvaja tekkimist mitoosi
inhibeerimise kaudu.
2. Mis on onkoviirused ja retroviiruste onkogeenid ( v - onc)
Onkovi rused on kasvajaid põhjustavad vi rused.
Retrovi ruste onkogeenid v - onc on DNA fragmendid, mil edel on rakke transformeeriv e
kasvajaliseks muutev omadus ja mis on mil algi rakust kaasa võetud retrovi ruste poolt.
3. DNA viiruste onkovalgud ja nende seostumine rakuvalkudega inimese
papilloomiviiruse valkude E6 ja E7 näitel
Ka DNA vi rustel on omad onkovalkude geenid , m
il e p
roduktid s
eostuvad r
akuvalkudega j a
mõjutavad nende funktsiooni. Papil oomivi ruse valgud interakteeruvad rakutsüklit
reguleerivate valkudega p53 ja pRB.
E6 seostub p53 - ga ja vi mast degradeeritakse. E7 seostub pRBga ning inaktiveerib ta,
vabastab transkriptsioonifaktor E2F ja see hakkab
toimima .
Meenutan, et p53 vastutab rakutsükli p
eatumise j a k
a a
poptoosi e
est, p
RB s
eostub a
ga E
2F
ja inaktiveerib ta, transkriptsioon ei saa toimuda. Kui aga need E6 ja E7 tulevad mängu –
vigane rakk hakkab jagunema ja see vi b kasvaja tekkeni.
4. Protoonkogeenide funktsioonid rakus
Proto - onkogeenid stimuleerivad proliferatsiooni, inhibeerivad differentseerumist,
inhibeerivad apoptoosi. Nende produktid on olulised signaalide ülekandekaskaadides,
transkriptsiooni läbivi jatena ja apoptoosi regulaatoritena.
5. Normaalsete tuumori supressorgeenide funktsioonid rakkudes.
Tuumori supressorgeenid inhibeerivad proliferatsiooni, indutseerib differentseerumist ning
stimuleerib apoptoosi. Proto - onkogeenidega vastupidised funktsioonid.
6. Miks tekivad kasvajarakkudes rakkude proliferatsiooni kontrolli häired.
Kasvajarakkudes on toimunud mutatsioonid (onkogeenide ekspressiooni puhul või si s, kui
tekivad mutatsioonid/vead proto - onkogeenides v nende asukoht muutub, tuumori
supressorgeenides mutatsioonid). Kuna 2 vi mast on väga tähtsad apoptoosi,
transkriptsiooni jne vajalikude protsesside seisukohalt, si s raku normaalne talitlus e
rakutsükkel häirub.
7. Onkogeenid kui dominantsed geenid
Onkogeenid on dominantsed geenid – kahest al eelist 1 mutatsioon on pi sav akti vsuse
muutumiseks – muutunud al eeli akti vsus domineerib nn metsiku üle. Mutatsioonid tekivad
somaatilistes rakkudes ja ei pärandu. Teatud kudede rakkudel on eelisvõime
muteerumiseks.
8. Tuumori supressorgeenid kui retsessiivsed
Need on retsessi vsed. Akti vsuse muutumiseks p
eab m
utatsioon t oimuma m
õlemas a
l eelis.
Seejärel toimub vastava valgu funktsiooni kadu või muutus. Mutatsioonid toimuvad ni
sugurakkude eelasrakkudes kui somaatilistes rakkudes. Esineb oluline k
oeeelistus –
nt R
B1
geeni muutuse akti vsus avaldub suht ainult reetinas.
9. Onkogeenid kui kasvufaktorid ( sis onkogeen ja PDGF)
Onkogeenide valgud kui kasvufaktorid e signaalid. Vi ruselise päritoluga kasvufaktori geen
sis on 88% homoloogne trombotsüütidest pärit kasvufaktori PDGF geeniga. Sis geeniga
infitseeritud rakud toodavad ülehulgas sis valku, mis seostub PDGF retseptoritega ja
autostimuleerib neidsamu rakke paljunema.
PDGF stimuleerib mesenhümaalsete rakkude – fibroblastid, rasvarakud, silelihasrakud,
endoteelirakud, proliferatsiooni.
10. Onkogeenid kui kasvufaktorite retseptorid (onkogeen erb,HER2)
Muteerunud retseptor v - erbB indutserib proliferatsiooni ilma kasvufaktorita.
Onkogeenide produktid on kasvufaktorite retseptorvalgud. Umbes 20% naistest omab
metastaseeruvate rinnakasvajate tekkes olulist osa mängivat onkovalku e
rb p
erekonna E
GF
retseptori HER2 üleekspressiooni, vi mased annavad li ga palju signaale sel eks, et rakud
jaguneksid – tekib vähk.
11. Onkogeenid kui signaaliülekande valgud ( ras onkogeen kui G valk)
Onkogeenide valgud kui signaaliülekande teede valgud. Ras geen on muteerunud väga
paljudes kasvajates. R
as o
n G -
valk. G
-
v
alkudest o
n t untuim o
nkogeen r
as, mil e mutantne
vorm on
püsivalt rakus seoses GTPga (ras - GTP) ja mis on seetõttu akti vne ning mis
omakorda aktiveerib paljusid teisi valke - ensüüme signaaltees, mis lõppkokkuvõttes
aktiveerib transkriptsioonifaktoreid. Muteerunud Ras geeni valk on hüperakti vne ja
aktiveerib signaaltee ilma, et rakk vajaks kasvufaktorit, mis indutseeriks raku jagunemist.
Ras onkogeeni aktiveerib punktmutatsioonid – ühe nukleoti di asendused DNAs.
12. Onkogeenid kui transkriptsioonifaktorid ( myc onkogeen ja myc valk , E2F kui
transkriptsioonifaktor
Onkogeen c - MYC. Geeni MYC poolt kodeeritav valk on 1 transkriptsioonifaktoritest
(transkriptsioonifaktorite kompleksi MAX osa), mis põhjustab paljude geenide akti vsust. Osa
geene aktiveeritakse, osa aga inaktiveeritakse. Sel e onkogeeni erinevad vormid MYCN,
MYCL on tekkinud mutatsioonide tulemusel esmase geeni eri pi rkondades. Aktiveeritakse
translokatsiooni tulemusena.
Produktiks on onkovalk, mis töötab samuti transkriptsioonifaktorina, kuid mõju on
normaalsest erinev. See aktiveerib li gseid mitmeid geene, mis stimuleerivad rakkude
jagunemist ja surub maha geene, mis
kodeerivad rakutsüklit pidurdavaid valkusid. Sel e
onkogeeni olemasolu on tuvastatud paljude k
asvajatüüpide p
uhul –
rinnavähk, p
õievähk, B -
rakuline leukeemia, melanoom jne.
E2F on transkriptsioonifaktor, kui sel e geeni akti vsus on pärsitud, si s hakkavad rakud
kontrol imatult prolifereeruma.
13. Onkogeenide ja tuumori suppressorgeenide aktivatsiooniteed - mehhanismid: a.
Aktivatsioon mutatsioonide kaudu b . Aktivatsioon kromosoomide translokatsiooni
kaudu c. Aktivatsioon geenide amplifikatsiooni kaudu d. Aktivatsioon retroviiruste abil
- Aktivatsioon mutatsioonide kaudu – näiteks muteerub normaalne proto - onkogeeni ras
geen – tekib 1 nukleoti di asendus ning tekib mutantne ras, mis on hüperakti vne ning
aktiveerib signaaliteed.
- A
ktivatsioon kromosoomide t ranslokatsiooni k
audu –
Myc p
rotoonkogeeni v
algu süntees o
n
oluliselt tõusnud translokatsiooniga Burkitt´ I lümfoomi B lümfotsüütides – translokatsioon
t(8;14). Aktiveeritakse püsivalt onkogeen c - myc, mis indutseerib rakkude proliferatsiooni.
- Aktivatsioon geenide amplifikatsiooni kaudu – HER 2 valgu üleproduktsioon on tingitud
vastava geeni amplifikatsioonist. Normaalsete geenide üleekspressioon.
- Aktivatsioon retrovi ruste abil
– näiteks: papil oomvi ruse valgud interakteeruvad r akutsüklit
reguleerivate valkudega p53 ja pRB . Igastahes viraalne DNA tungib peremeesrakku,
vi rused ja nende v - onc produktid seostuvad rakus tähtsate ensüümidega ja pärsivad
nende toimet jne .
14. Burkitti lümfoom, translokatsioon ja c – myc geeni aktivatsioon
Epstein - B
arr v
i rus, o
nkovalk L
MP1 seostub r
akuvalk TRAF1 -
ga. Translokatsioon (
8 -
14/8
- 22) vi b c - myc onkogeeni immunoglobuli nide raske ahela geenide lähedale ja sel e
ekspressioon tõuseb. Normaalses rakus toodetakse c - myc veidi rakutsükli algatamiseks
aga IgH läheduses ekspesseerub see v
astavalt I gH tootmisele. Ü
heks p
õhjuseks on E
pstein
-
Barr virus . Vi ruse tõttu hakatakse LMP1 tootma ja edasi läheb c - myc üleproduktsioon.
15. Krooniline lümfoidne leukeemia C ML ( chronic M yeloid L eukemia), T ranslokatsioon ja liitgeeni ning liitvalgu (uudisvalgu) teke. Cleevec kui spetsiifiline liitvalgu bcr - abl
aktiivsuse inhibitor . Onkogeenide seos kasvajate tekkega. Näited onkogeenidest
kasvajates.
Translokatsioon 9nda ja 22se kromosoomi vahel. Tekib li tgeen BCR - ABL, ning rakk
hakkab tootma samanimelist li tvalku. Hübri dse valgu produktsiooni ei saa kontrol ida.
Gleevec on edukas
ravim , mis on
sünteetiline inhibitor .
Onkogeenid kutsuvad esile kasvajaid. Käärsoolevähki tekitab onkogeen src.
Kopsuvähki erbB.
16. Mis on kasvajarakkude metastaseerumine?
E kasvajarakkude invasion – kasvajarakkude tungimine teistesse kudedesse.
17. Rakkude adhesioon, invasioon , proliferatsioon, angiogenees kui tähsad faktorid
kasvajarakkude metastaseerumisel.
- Adhesioon – kokku kleepumine, on rakkude võime kleepuda teine
teisega ning erinevate
substraatidega, mis on tingitud spetsi filistest valkudest adhesi nidest. Kleepuvad tervete
rakkude külge,et veres li kuda.
- Proliferatsioon – raku jagunemine, on häiritud kasvajarakkudes mutatsioonide tõttu.
-Invasioon – tungib teistesse kudedesse ja organitesse. Peab tungima verre ja
lümfisoontesse, et li kuda ja toituda.
- Angiogenees – v
õime o
lemasolevate veresoonte baasil moodustada u
usi. Et e
nnast t oita j a
sealt edasi levida.
Et kasvajarakud metastaseeruksid on vaja kõikide ülaltoodud protsesside olemasolu.
18. Miks on kasvajarakud kasvajakoes tavaliselt geneetiliselt heterogeensed?
Vajalik, kuna kasvajarakkude heterogeensuse tõttu on nende kasvu
pidurdamine keeruline.
19. Kasvajarakkude järjestikused mutatsioonid kui alus kasvajate heterogeensusele
Kasvajad tekivad rakkude klonaalse paljunemise ja mitmete järjestikuste mutatsioonide
tagajärjel, mil e tulemusena tekib rakkude
heterogeensus kasvajas. Heterogeensus
tähendab mitmete mutatsioonide olemasolu ning mutatsioonide diferentseerumist (mida
rohkem erinevaid variante, seda keerulisem kuidagi nende produktide akti vsust peatada).
U DID IT BRO! EDU EKSAMIL! :)
Kõik kommentaarid