TARTU ÜLIKOOL
BIOMEEDIKUM
Biokeemia osakond U.
Soomets , K.
Kilk , A. Ottas,
R. Porosk, R. Mahlapuu, M.
Zilmer Inimese ainevahetusega seotud metaboliitide
struktuur,
reaktsioonivõime ja biofunktsioonid
Biokeemia I osa
(Sissejuhatavad peatükid)
Tartu
2018 BIOKEEMIA OSAKOND
BIO– JA SIIRDEMEDITSIINI INSTITUUT
MEDITSIINITEADUSTE VALDKOND
TARTU ÜLIKOOL
Inimese ainevahetusega seotud metaboliitide struktuur, reaktsioonivõime ja biofunktsioo-
nid. Biokeemia I osa. (Sissejuhatavad peatükid)
Toimetajad : Rando Porosk, Riina Mahlapuu, Kalle Kilk, Ursel Soomets
Disain : Mihkel Zilmer, Ursel Soomets
Autoriõigus © U. Soomets, K. Kilk, A. Ottas, R. Porosk, R. Mahlapuu, M. Zilmer
Kõik õigused antud väljaandele on seadusega kaitstud. Ilma autoriõiguse omaniku kirjali-
ku loata pole lubatud ühtki selle
väljaande osa paljundada ei mehhaanilisel, elektroonilisel
ega muul viisil.
2
Sisukord
Sissejuhatuseks
1
Orgaaniliste ühendite klassifikatsiooni põhialused
5
2
Orgaaniliste ühendite nomenklatuuri põhialused
10
3
Orgaaniliste ühendite konfiguratsioon ja
konformatsioon 17
4
Orgaaniliste ühendite
isomeeria põhialused
20
5
Konjugatsioon ja
aromaatsus 23
6
Inimorganismi metabolismi keskseid reaktsioone
26
7
Heterofunktsionaalsed orgaanilised ühendid
31
8
Heterotsüklilised orgaanilised ühendid
37
9
Lisamaterjalid
41
Soovitatav kirjandus täiendavaks lugemiseks: 1.
M. Zilmer, A.
Rehemaa , U. Soomets, K. Zilmer.
Inimkeha põhilised
biomolekulid (meditsiiniliselt tähtsamad ülesnded). Inimorganismi
metabolism (biokemism ja
kliinilised aspektid). Tartu, TÜ Meditsiiniteaduste valdkond, Bio– ja siirdemeditsii-
ni instituut, biokeemia osakond, 2015
2.
M. Zilmer, E.
Karelson , T. Vihalemm, A. Rehemaa, K. Zilmer. Inimorganismi bio-
molekulid ja nende meditsiiniliseltolulisemad ülesanded. Inimorganismi metabo-
lism, selle häired ja haigused. Tartu, TÜ
Arstiteaduskond , Biokeemia Instituut,
2010
3.
Talvik , A.-T., Orgaaniline keemia, TÜ kirjastus, Tartu 1996
3
Sissejuhatuseks
Arstiteaduskonna õppeplaani prekliinilised ained peavad olema
meditsiinikesksed. See on
vajalik, et anda meditsiiniüliõpilasele lõppkokkuvõttes nüüdisaegne erialane
haridus .
Seetõttu on ka õpetatav
kursus selgelt meditsiinikeskne, st biomolekulid ja nendele vastavad
reaktsioonid on
eelistatult seotud inimorganismi metabolismiga. Kuna kursuse olulisim
eesmärk on baasi loomine meditsiinilise biokeemia põhiteemade jaoks, siis selle raames:
a) omandatakse põhiliste
baas-biomolekulide ehitus;b) pööratakse põhitähelepanu
elutegevuseks vajalike orgaaniliste ühendite struktuuri
ja reaktsioonivõime tihedale seostamisele nende biofunktsioonidega inimorganismis.
Antud õppevahend hõlmab meditsiinilise biokeemia
kursuse sissejuhatava osa, mis on
vajalik biomolekulide ehituse ja funktsioonide ning nende metabolismi mõistmiseks.
4
1 Orgaaniliste ühendite klassifikatsiooni põhialused
Orgaanilisi ühendeid iseloomustab suur
struktuurne varieeruvus, mistõttu neid on klassifitseeritud
erinevate põhimõtete alusel. Kõige üldisem
klassifikatsioon baseerub:
•
süsinikuahela (-skeleti) ehitusel;
•
funktsionaalse (-te) rühma (-de) olemasolu arvestamisel.
Orgaaniliste ühendite klassifikatsioon süsinikuahela ehituse järgi (joon. 1):
Joon.1
O R G AAN ILIS E D Ü H E N D ID(n atu raalsed /sü n teetilised )Atsü klilised eh k alifaatsedT sü klilised(avatu d ah el)(su letu d ah el)K arb o tsü klilisedH etero tsü klilisedK ü llastatu d K ü llastam ata (ainult C -
aatom id)
(C -aatom id ja
heteroaatom id)
( alkaan id ja n en d e(alkeen id ja alkü ü n id- kü llastatu dd erivaad id )ja n en d e d erivaad id )(alitsü klilised )- kü llastatu d- kü llastam ata- kü llastam ata(m ittearo m aatsed )(m ittearo m aatsed )- aro m aatsed- aro m aatsedJärgnev
on
lühiinfo
biomeditsiini
seisukohalt
olulisematest orgaanilistest
ühenditest .
Joon. 2
Alifaatsed (atsüklilised) orgaanilised ühendid
COOHH NCH2Küllastatud alifaatsed orgaanilised ühendid
CH3Nende hulka kuuluvad
alkaanid ja nende
derivaadid . Alkaanid on
Alaniin süsivesinikud , milles kõik
süsinik -süsinik sidemed on üksiksidemed (nt
metaan ,
etaan ,
propaan jne, vt tabel 2). Metaan (CH4) on loodusliku
COOHgaasi põhikomponent. Meditsiinis kasutatav
vaseliin kujutab endast
H NCHkõrgemate alkaanide segu (süsinikuaatomite arv on 12…25 vahel).
2Madala reaktsioonivõime (üldise keemilise inertsuse) tõttu kasutatakse
HCCH3vaseliini paljude salvide
alusena . Etaani
derivaat etüülkloriid
CH3(
kloroetaan ) (CH3CH2Cl) leiab kasutamist
lokaal -anesteetikumina.
Paljud inimorganismis esinevad bioaktiivsed molekulid on vaa-
Valiin (asendamatu aminohape )deldavad alkaanide derivaatidena, nt
aminohapped (alaniin, valiin jne,
joon. 2), küllastatud
rasvhapped (palmithape,
stearhape jne, joon. 3) jt.
5
Küllastamata alifaatsed orgaanilised ühendid
J o o n . 3
Sisaldavad vähemalt ühte kaksiksidet (-C=C-) või
kolmiksidet. Kaksiksidet sisaldavaid süsivesinikke nimeta-
C O O HH Ctakse alkeenideks (nt
eteen ), kolmiksideme puhul on nime-
3tuseks alküünid (nt
etüün ehk
atsetüleen , NB! Inimorganis-
P a lm ith a p e (1 6 :0 ) mis leiduvates ühendites väga
haruldane , võib esineda ravi-
mite struktuurides).
C O O HH C Kaksiksideme sisseviimine molekuli võib oluliselt muuta
3selle füsioloogilist aktiivsust. Näiteks 1,1,2-trikloroeteen,
S te a rh a p e (1 8 :0 )CHCl=CCl2, on tugevama anesteetilise toimega kui kloro-
form (
CHCl3 ) või kloroetaan (etüülkloriid, CH3CH2Cl).
H CC O O H3 Inimkehas on mitmeid küllastamata alifaatseid orgaanilisi
ühendeid. Näiteks kõrgemad küllastamata rasvhapped nagu
O le h a p e (1 8 :1 9)olehape (joon. 3), linoolhape, linoleenhape, arahhidoon-
(p a lm ith a p e ja s te a rh a p e o nhape .
in im o rg a n is m i p õ h ilis e dk ü lla s ta tu d ra s v h a p p e d ; o le h a p eo n k e s k n e m o n o k ü lla s ta m a tara s v h a p e )Tsüklilised orgaanilised ühendid
Karbotsüklilised orgaanilised ühendid
Tsüklid (ringstruktuurid) moodustuvad vaid C-aatomitest.
• Tsükloalkaanid (küllastatud karbotsüklilised orgaanilised
J o o n . 4
ühendid: struktuuri kõik või mõned süsinikuaatomid on
organiseerunud tsükliks/rõngaks). Tsükloalkaanid on:
tsüklopropaan , tsüklobutaan, tsüklopentaan, tsüklohek-
saan (joon. 4). Sarnanevad füsiko-keemilistelt omadustelt
T s ü k lo p ro p a a nT s ü k lo b u t a a nalifaatsetele alkaanidele, kuigi omavad ka teatud tsükli-
lisest loomusest tulenevaid erinevusi.
• Küllastamata mittearomaatsed karbotsüklilised ühendid:
väga kõrge bioaktiivsusega, kuna nende
tsükkel sisaldab
T s ü k lo p e n t a a nT s ü k lo h e k s a a nvähemalt ühte kaksiksidet. Nad on väga heterogeense
ehitusega ühendid ja on
esindatud väga rohkearvuliselt.
Paljud
ravimid kuuluvad
ka
küllastamata
mittearomaatsete karbotsükliliste ühendite hulka (nt
verelipiidide taset langetavavad ravimid lovastatiin, sim-
J o o n . 5
vastatiin jt).
Tuleb rõhutada, et inimorganismis on palju küllastamata
mittearomaatseid karbotsüklilisi ühendeid, mis on
kesksed metabolismis, näiteks
H O⇒ steroolid (nt
kolesterool , joon. 5);
⇒
vitamiinid (nt
vitamiin A, joon. 9);
K o le s t e r o o l⇒ prostaglandiinid.
( b io m e m b r a a n id e e h it u s k o m p o n e n t ja s t e r o id h o r m o o n id e e e lla n e )6
• Aromaatsed karbotsüklilised ühendid: selle klassi spet-
siifiline süsivesinik on
benseen (C6H6), mille 6-lülilises
rõngas sisaldub 3 konjugeerunud kaksiksidet.
Benseeni Benseenja tema derivaate nimetatakse aromaatseteks, kuna
mõned asendatud benseenid on tugeva aroomiga.
Aromaatsete karbotsükliliste ühendite klassi kuulub terve
rida kõrge bioaktiivsusega esindajaid, mis on kasutusel
ravimitena või funktsioneerivad inimorganismi biomole-
Joon. 6
kulidena.
Katehhoolamiin epinefriin (
adrenaliin , joon. 6),
O Hmis põhjustab vererõhu tõusu, südametegevuse kiirenemist
O Hja bronhide dilatatsiooni, on üheks näiteks. Benseenituuma
E p inefriinsisaldavate ravimite tüüpnäiteks on palavikkualandav ja
(adrenaliin )valuvaigistav
aspiriin (atsetüülsalitsüülhape, joon. 6), mis
H CO Hon ühtlasi mittesteroidsete põletikuvastaste ravimite
H CN HC H(NSAID, non
steroid antiinflammatory drug) esindaja.
23C O O HOOCC H3AspiriinHeterotsüklilised orgaanilised ühendid
Nendes ühendites võtavad tsüklite moodustamisest peale C
-aatomite osa ka mitmed heteroaatomid (N, O, S, jt). Neid
jaotatakse:
• küllastatud heterotsüklilised orgaanilised ühendid (nt
pürrolidiin, joon. 7);
J o o n . 7
• küllastamata mittearomaatsed heterotsüklilised orgaa-
nilised ühendid (nt pürroliin, joon. 7);
NN• aromaatsed heterotsüklilised orgaanilised ühendid
HH(pürrool, pürimidiin,
puriin , joon. 8). Terve rida bio-
P ü r r o l id ii n2 - P ü r r o l ii nmolekule on
aromaatse heterotsüklilise struktuuriga
(NB! see tagab olulise termodünaamilise stabiilsuse).
Mõned inimorganimi baasil toodud näited on järgmised.
⇒ 4
aromaatset heterotsüklilist pürrooltuuma on proto-
porfüriin IX koostises (vt peatükk 8). Viimane oma-
J o o n . 8
korda on heemi baasstruktuuriks.
Heem on inimese
kromoproteiini
hemoglobiini mittevalguline osa.
N⇒
puriini ja pürimidiini derivaadid on nukleotiidide
NHNehituslikud baaskomponendid.
Nukleotiidid on ehi-
tusüksusteks desoksüribonukleiinhappe (DNA) ja
P ü r r o o lP ü r im id iinribonukleiinhappe (RNA) jaoks.
NNNNHP u r iin7
Klassifikatsioon funktsionaalsete rühmade (FR) iseloomu alusel
Funktsionaalsed rühmad on mittesüsivesinikulise
iseloomuga aatomid või aatomite grupid, mis
asendajatena süsivesnikahelas määravad orgaanilise ühendi keemilised omadused ja kuuluvuse kind-
lasse ühendite klassi.
Tähtsaimad orgaaniliste ühendite klassid ja neile vastavad funktsionaalsed
rüh -
mad on toodud tabelis 1.
Tabel 1. Klassifikatsioon funktsionaalsete rühmade (FR) alusel.
FR nim etus FR ehitus O rgaaniliste ühendite rühm (näide inim organism is)Karboksüülrühm -CO O H Karboksüülhapped (rasvhapped)Aldehüüdrühm -CHO Aldehüüdid (glütseeraldehüüd)Karbonüül (
keto )rühm
Ketoonid (dihüdroksüatsetoon)C OH üdroksüülrühm
-O H Alkoholid ( glütserool , kolesterool)Am inorühm
-NH Am iinid
(glükoosam iinid)2Tiool (m erkapto)rühm
-SH Tioolid ( tsüsteiin )Am idorühm
C O Am iidid
(asparagiin)NH2OHFosfaatrühm
või - P Fosfaadid
(rida m etaboolseidO P O vaheühendeid)OHSulfaatrühm
-O SO H Sulfaadid (fosfoadenosiin-3 fosfosulfaat) Funktsionaalsete rühmade arv ja iseloom liigendab orgaanilisi ühendeid kolme rühma:
• monofunktsionaalsed orgaanilised ühendid (üks FR; nt karboksüülrühm palmithappes, joon. 3);
• bifunktsionaalsed orgaanilised ühendid (kaks FR; nt karboksüül- ja aminorühmad alaniinis, joon.
2);
• polüfunktsionaalsed orgaanilised ühendid (rohkem kui kaks sama või erinevat FR; nt
hüdroksüülrühmad ja
sekundaarne aminorühm epinefriinis, joon. 6).
Kui bi- või polüfunktsionaalne ühend sisaldab vähemalt kahte erinevat funktsionaalset rühma, siis
nimetatakse teda heterofunktsionaalseks.
8
Lisaks: Kesksemad funktsionaalsed fragmendid/seosed ja neile vastavad orgaaniliste ühendite
klassid.
Sideme/fragmendi Sideme/fragmendi Orgaaniliste ühendite klassnimetus ehitus (näide inimorganismis)Üksikside
Alkaanid (
alaniin)
CCKaksikside
Alkeenid (
olehape)
CCAromaatne rõngas (tuum )
Aromaatsed ühendid (
fenüülalaniin )
OAm iidside
Am iidid
R
CNR
HEeterside
R
O R
Eetrid (
mõned membraansed lipiidid )
1
2
Tioeeterside
Tioeetrid (
metioniin )
R
SR
1
2
OEsterside Estrid (
triglütseriidid)
R
COR
1
2
OTioesterside*
Tioestrid (
atsetüül -CoA)
R
CSR
1
2
OFosfaatesterside
Fosfaadid (
rida metaboliite)
R
OPO1
OOOR
OPOPOFosfoanhüdriidside*
1
Nukleotiidid (
ATP)
OOOFosfodiesterside
Nukleiinhapped , fosfolipiidid R
OPOR
1
2
ODisulfiidside
Disulfiidid (
tsüstiin)
R
SSR
1
2
* "makroergiline (energiarikas) side"
Enamiku
ester -, eeter- ja amiidsidemete teke vajab 1...5kcal/mol. Niisama suur energiahulk vabaneb
ka nende hüdrolüüsil. Anhüdriidsideme ja tioestersideme energeetiline väljund on aga üle 5 kcal/mol
ja seetõttu nimetatakse neid energiarikasteks (makroergilisteks) sidemeteks.
9
2 Orgaaniliste ühendite
nomenklatuur Nomenklatuur tähendab orgaanilisele ühendile nimetuse andmise süsteemi. Kasutatakse erinevaid
nomenklatuure. Lisaks süstemaatilisele nomenklatuurile (vt. allpool) kasutatakse lihtsuse mõttes
sageli ühendite triviaalseid nimetusi. Alljärgnevalt tutvustaksime
mõningaid nomenklatuure.
Triviaalne (tavaline) nomenklatuur
See on ajalooliselt vanim nimetuste andmise süsteem. Vastavalt triviaalsele nomenklatuurile võivad
orgaanilise ühendi nimetused pärineda erinevatest “mitte-keemilistest” algallikatest, st pole süsteemi-
pärased. Orgaanilise ühendi nimetus võib tuleneda:
• ühendi looduslikust allikast. Nimetus
laktoos tuleneb sõnast lactum (lad.k. = piim); palmithape on
rasvhape , mis on isoleeritud palmiõlist;
äädikhape tuleneb sõnast acetum (lad.k. = äädikas) jt;
• ühendi iseloomulikest omadustest. Nimetus glütserool- sõnast glycys (kr.k. = magus);
• ühendi kasutusalast (askorbiinhape, skorbuudivastane);
• ühendi isoleerimisviisist (püroviinamarihape ehk
püruvaat saadi viinamarihappe ehk D,L-2,3-
dihüdroksübutaandihappe pürolüüsil).
Triviaalnomenklatuur ei arvesta orgaanilise ühendi struktuuri ega keemilisi omadusi. Siiski lihtsuse
tõttu kasutatakse seda igapäevatöös. Seetõttu ongi vajalik teada kõige tavalisemate orgaaniliste
ühendite (nt aminohapete, aromaatsete ühendite, ravimite jt) triviaalnimetusi.
Radikaal -funktsionaalne nomenklatuur
Sel puhul peegeldab nimetus orgaanilise ühendi üldstruktuuri ning on seetõttu sageli kasutusel
tööstuslikus biokeemias ja keemias. Ta ei võimalda ühendite struktuuri universaalselt arvestada (tema
reeglite süsteem on mõnevõrra eklektiline). Paljusid antud nomenklatuuri järgseid nimetusi
aktsepteeritakse
IUPAC -i poolt (vt allpool). Nomenklatuurireeglitest arusaamine nõuab antud juhul
lisaks funktsionaalsete rühmade nimetuste tundmisele veel järgmisi baasarusaamu.
• Orgaaniline radikaal: see on orgaanilise ühendi molekuli jääk, millest on elimineeritud üks
vesinikuaatom (radikaal omab vähemalt ühte vaba sidet). Nii näiteks saadakse metaanist
metüülradikaal, etaanist etüülradikaal jne, tabel 2.
CH4 või CH3-H (metaan) CH3- (metüülradikaal)
CH3CH3 või CH3CH2-H (etaan) CH3CH2- (etüülradikaal)
Mitme vesinikuaatomi elimineerimine annab mitmevalentse radikaali.
NB! Mõistet
”orgaaniline radikaal” ei tohi segi ajada mõistega ”vaba radikaal”. Viimane on ühe või
mitme paaristumata elektroniga osakene.
• n-Alkaanide (CnH2n+2) ja nende radikaalide nimetused (vt tabel 2).
10
• Teised
enamlevinud süsivesinikradikaalid (-grupid) (vt tabel 3).
• Süsinikuaatomite tüübid.
Primaarne C-aatom: nt otsmised C-aatomid (1 ja 3) propaanis, mis on otseselt seotud ühe C-aato-
miga .
1232H C CHCHH C CHCH33323CH3Propaan Isobutaan Sekundaarne C-aatom: nt keskmine C-aatom propaanis, mis on otseselt seotud kahe C-aatomiga.
Tertsiaarne C-aatom: nt keskmine C-aatom (2) isobutaanis, mis on otseselt seotud kolme C-aatomiga.
Radikaal-funktsionaalse nomenklatuuri põhiprintsiibid
• Baas-nimetuse(-struktuurina) käsitletakse vastava homoloogilise rea lihtsaima võimaliku liikme ni-
metust (struktuuri).
H C CH33(ühendit vaadeldakse
metaani derivaadina)
MetüülmetaanTabel 2. Normaalsed alkaanid ja nende
radikaalid (alküülgrupid). n on C-aatomite
arv.
H C CHCH(ühendit vaadeldakse
eteeni 32derivaadina)
n Alkaan Alküülgrupp Metüületeen1
m etaan
m etüül
2
etaan
etüül
3
propaan
propüül
4
butaan butüül (ühendit vaadeldakse
eteeni 5
pentaan pentüül
H C CHCHCH336
heksaan heksüül
derivaadina)
7
heptaan
heptüül
8
oktaan
oktüül
α,β
-Dimetüületeen9
nonaan
nonüül
10
dekaan detsüül
11 undekaan
undetsüül
12 dodekaan
dodetsüül
• Funktsionaalse rühma või
asendaja nimetus lisa-
13 tridek aan
tridetsüül
takse baas-nimetusele.
14 tetradekaan
tetradetsüül
20 eik osaan
eikosüül
21 heneikosaan
heneikosüül
22 dokosaan
dokosüül
O23 trikosaan
trik osüül
24 tetrak osaan
tetrakosüül
C H O HH CCC H336530 triakontaan
triak ontüül
31 hentriakontaan
hentriakontüül
M e tü ü lfe n ü ü lk e to o n40 tetrak ontaan
tetrakontüül
M e tü ü la lk o h o l50 pentakontaan
pentakontüül
100 hektaan
hektüül
C H 3C H C H O H32H CC HC l3E tü ü la lk o h o lIs o p ro p ü ü lk lo riid11
• Nimetuse andmisel arvestatakse ühendi sümmeetrilisust.
H C CH CH CHDivinüül22• Asendajate asukoht ja
paigutus lisandub baas-nimetusele.
Kasutakse eesliiteid
orto , meta ja
para (lühendid vastavalt o-, m– ja p-) või kreeka tähti (α, β, γ jne).
CH3CHCH33ClH N-CH -CH -CH -COOH2222ClClo
-Klorotolueenm
-Klorotolueenp
-Klorotolueenγ-
Aminobutaanhape ( GABA )Tabel 3. Enamlevinud süsivesinikradikaalid (-grupid).
Radikaali ehitus Radikaali nimetus(Orgaaniline radikaal)
Süstemaatiline
Triviaalne
metüül metüül
CH3CH CH31-metüületüül
isopropüül CH3CH CH CH232-metüülpropüül
(primaar)isobutüül
CH3CH CH CH231-metüülpropüül
sekundaarbutüül (sek-butüül)
CH3CH3 1,1-dimetüületüül
tertsiaarbutüül (
tert -butüül)
C CH3
CH3CH CHetenüül
vinüül
2CH CH CH2-propenüül
allüül
22 tsüklopentüül
tsükloheksüül
C H - fenüül
65C H -CH - bensüül
65212
Süstemaatiline (rahvusvaheline) nomenklatuur Selle nimetuste süsteemi esitas International Union of
Pure and Applied Chemistry (IUPAC). Süsteemi põhisei-
Tabel 4. Bioloogiliselt tähtsamate ühen-
sukohaks on: “igal orgaanilisel ühendil peaks olema ühe-
dite iseloomulike rühmade eelisjärjestus
ne nimetus”. Nomenklatuuri põhiprintsiibiks on
ühendi ja terminoloogia (ees– või järelliitena)
põhinimetuse (baasstruktuuri) leidmine. Põhinime-
tusena kasutatakse kreeka päritolu
“tüvi”-sõna, mis ree-
Rühm
glina näitab
süsinikuaatomite arvu pikimas ahelas.
Eesliide
Järelliide (grupp)
Näiteks, viie süsinikuaatomiga järjestuse nimetamisel ka-
R-COOH
karboksü -
-hape
sutatakse tüve
pent -. Moodustamaks
alkaani põhinime-
O
tust lisatakse tüvisõnale lõpp
-aan: saame
pentaan.
R C
halokarbonüül-
alkanoüül
Orgaanilise ühendi nimetamisel süstemaatilises
nomen -
(klorokarbonüül-)
halogeniid X
klatuuris kasutatakse järgmist üldreeglistikku.
amido-,
R-CONH2
-amiid
karbamoüül-
• Tehakse kindlaks
eelistatuim asendaja/funktsionaal-okso -,
R-CHO
-aal
ne rühm (tabel 4).
formüül-
•
Eelistatuim asendaja lubab määratleda ühendi põhi-
C O
okso- (keto-)
-oon
struktuuri ehk skeleti (
peaahela või baastsükli)
struktuuri. Põhistruktuur määratakse kindlaks
kahe R-OH
hüdroksü-
-ool
põhireegli alusel (esitatuna tähtsuse järjekorras):
merkapto-,
R-SH
-tiool
sulfanüül-
⇒ põhistruktuur peab omama
suurimat võimalikku
R-NH2
amino-
-
amiin arvu funktsionaalseid rühmi (radikaale, asenda-
R-C
N
tsüano-
-nitriil
jaid) ja
pikimat C-aatomite ahelat ;
⇒ põhistruktuur peab sisaldama
suurima arvu kord-R-O-R
-
-eeter
seid sidemeid (võrdse arvu puhul eelistatakse kak-
-OCH3
metoksü-
-
siksidemeid kolmiksidemetele).
-OC2H5
etoksü-
-
-C=C-
-
-een
kloro-, bromo-,
Halogeniidid
-
jodo-,
fluoro -
CCCCCC6R-NO2
nitro -
-
11CCCCCAlküül
radi -
8alküül-
-
CCCCkaalid
R-CH3
metüül-
-
R-CH2CH3
etüül-
-
61pikimad R-C3H7
propüül-
-
C-aatomite aheladCCCCCC1-metüületüül-
R-CH(CH3)2
-
(isopropüül-)
• Põhistruktuuri
C-aatomid numereeritakse kindlas järjekorras,
kusjuures numeratsiooni
al- guse (C-aatomi väikseima numbri)
määravad asendajad (radikaalid, funktsionaalsed rüh-
mad) ja/või
kordsed sidemed. Mitme erineva asendaja (kordse sideme) puhul määrab peaahela
(või baastsükli) numeratsiooni alguse neist eelistatuim (vt ülaltoodud näiteid ja alljärgnevat
probleemanalüüsi).
• Koostatakse
ühendi nimetus, mis
koosneb eesliitest (näitab ära radikaalid ja funktsionaalsed
rühmad),
baastüvest (tuleneb põhistruktuurist) ja
järelliitest (näidatakse kordsed sidemed ja
eelistatuim funktsionaalne rühm).
13
Üldmärkused eesliidete kasutamise kohta (vt selgituseks probleemanalüüsi):
• kõigepealt antakse hargnemata ahelaga alküülrühmade ja/või funktsionaalsete rühmade asukoha
numbrid ja nimetused;
•
teisena antakse hargnenud ahelaga alküülrühmade ja funktsionaalsete rühmade asukoha numb-
rid ja nimetused;
• kolmandana näidatakse tsükloalküülrühmade asukoha numbrid ja nimetused;
• viimasena antakse küllastamata süsivesinikest pärinevate asendajate nimetused.
Kui identseid asendajaid on ühendis kaks või rohkem, lisatakse kordsust näitav eesliide:
di =2,
tri =3,
tetra =4,
penta =5, jne.
Üldmärkused järelliidete kohta (vt selgituseks probleemanalüüsi):
•
identsete funktsionaalsete rühmade, kordsete sidemete puhul kasutatakse vastavaid
järel-liiteid: di- (=2), tri- (=3) jne.
• kaksiksideme ja kolmiksideme üheaegse esinemise puhul
eelistatakse (nimetatakse esimesena)
kaksiksidemest tulenevat järelliidet.
Probleemanalüüs:
• Aminohappe glutamiinhappe (glutamaadi) nimetus rahvusvahelises nomeklatuuris on järgmine:
kõrgeima eelistusega funktsionaalne rühm15põhistruktuur HOOC CHCHCHCOOH22 (peaahel)
NH2funktsionaalne rühm (asendaja)2-Aminopentaan-1,5- dihape ÜLESANNE:
Andke joon. 9 toodud orgaaniliste ühendite nimetus rahvusvahelise nomenklatuuri järgi.
J o o n . 9
C H OC H O H2R e tin o o lR e tin a a l(v ita m in A a lk o h o lv o rm ; v a ja lik(v ita m in A a ld e h ü ü d v o rm ;n ä g e m is p ro ts e s s is ja n o rm a a ls e k sv a ja lik v a lg u s im p u ls i v a s tu v õ tu k s s ilm a s )k a s v u k s ) 14
Nimetamise näide -
adrenaliin
hüdroksüülrühmad
1. Jagada struktuur väiksemateks struktuurideks ja
funktsionaalseteks rühmadeks.amiin
benseen
etaan
2. Leida põhistruktuurmetaan
a. Määra struktuur, mille küljes on olulisim asendaja
-OH rühmad olulisimad asendajad
b. Määra struktuur, mille küljes on enim asendajaid
1
c. Määra suurim (rohkemate süsinikega) struktuur
1
Need
struktuurid võivad olla erinevad ning mitu struk-
1
3
asendajat 3
asen -
tuuri võivad omada võrdseid näitajaid. Kui Te ei tea,
dajat
2
millist peaks eelistama, siis valige see, mille alusel võiks
suurim struktuur
1
nimetamine olla lihtsam. Antud näites tuleks eelistada
põhistruktuurina benseeni, kuid mõeldav on ka etaanist
lähtumine.
3. Numereerida aatomid põhi- ja külgahelates
Põhiahelas numereeritakse nii, et olulisim asendaja saaks
hüdroksüülrühmad
võimalikult väikese numbri.
Võrdsete asendajate korral nii, et mõlemad saaksid või-
malikult väikese numbri.
2
3
Kõrvalahelas alustatakse nummerdamist alati peaahelaga
1
4
1
seotud aatomist.
6 5
amiin
2
Kui alamstruktuuris on vaid üks heteroaatom (nt. läm-
benseen
mastik), siis seda ei nummerdata ning vajadusel kasu-
etaan
tatakse numbri asemel elemendi sümbolit (N).
metaan
1-hüdroksü-2-(metüülamino)etaan
ehk 2-(metüülamino)etaan-1-ool
4. Kirjutada välja nimetus kasutades ees- ning kor-
dsete sidemete/olulisima põhistruktuuri asen-daja
jaoks järelliiteid. Gruppide asukohad tuleb täpsustada
2
3
1-hüdroksüetaan
numbritega, millise põhistruktuuri või põhistruktuurile
1
4
1
lähemal oleva alamstruktuuri küljes antud rühm on.
6 5
2
metüülamiin
1,2-dihüdroksübenseen
ehk benseen-1,2-
diool 5.
Lõplik nimetus: 4-[1-hüdroksü -2-(metüülamino) etüül]-benseen-1,2-diool
Kui oleksime valinud põhistruktuuriks etaani või kirjutaksime rohkem rühmi eesliidetena, saaksime
ametlikult mitte päris korrektsed, kuid antud kursuse raames aktsepteeritavad variandid:
4-[1-hüdroksü-2-(metüülamino) etüül]-1,2-dihüdroksübenseen
1-(3,4-dihüdroksüfenüül)-1-hüdroksü-2-(metüülamino)etaan
1-(3,4-dihüdroksüfenüül)-2-(metüülamino)etaan-1-ool
15
Nimetamise nä ide -
ibuprofeen
1. Jagada struktuur väiksemateks struktuurideks japropaan
funktsionaalseteks rühmadeks.propaan
O
benseen
H O
hape
metaan
2. Leida põhistruktuursuurim struktuur
a. Määra struktuur, mille küljes on olulisim asendaja
b. Määra struktuur, mille küljes on enim asendajaid
c. Määra suurim (rohkemate süsinikega) struktuur
2 asen-
2 asen-
2 asen-
dajat
dajat
Need struktuurid võivad olla erinevad ning mitu struk-
dajat
tuuri võivad omada võrdseid näitajaid. Kui Te ei tea,
1
millist peaks eelistama, siis valige see, mille alusel
1
võiks nimetamine olla lihtsam. Antud näites tuleks
-COOH on
eelistada põhistruktuurina propaanhapet, kuid mõeldav
eelistatuim asendaja
on ka benseenist lähtumine.
3. Numereerida aatomid põhi- ja külgahelates3
Põhiahelas numereeritakse nii, et olulisim asendaja
1
saaks võimalikult väikese numbri.
4
1
2
Kõrvalahelas alustatakse nummerdamist alati pea-
3
2
1
ahelaga seotud aatomist.
2
Kui lähtuksime benseenist, tuleks propaanhappe osa
1
etaan
4
1
1
jagada tükkideks, sest põhistruktuuri ehk benseeniga
3
2
seotud süsinik peab olema number 1:
4. Kirjutada välja nimetus kasutades ees- ning kordsete sidemete/olulisima põhistruk-
tuuri asendaja jaoks järelliiteid. Gruppide asukohad tuleb täpsustada numbritega, millise
põhistruktuuri või põhistruktuurile lähemal oleva alamstruktuuri küljes antud rühm on.
Lõplik nimetus: 2-[4-(2-(metüülpropüül )fenüül)] propaanhape
Antud kursuse raames oleks aktsepteeritavad veel variandid:
1-(1-karboksüetüül)-4-(2-metüülpropüül)benseen
1-(2-metüülpropüül) -4-(1-karboksüetüül)benseen
16
3 Orgaaniliste ühendite konfiguratsioon ja konformatsioon
Orgaaniliste ühendite ehitust iseloomustab molekulide mitteplanaarne ruumiline kuju: konfiguratsioon
ja konformatsioon. Inimorganismi biomolekulide ja ravimite konfiguratsioon/konformatsioon määrab
nende funktsiooni. Siit ka vajadus konfiguratsiooni ja konformatsiooni mõistmiseks.
Konfiguratsioon
J o o n . 1 0
Orgaaniliste molekulide mitteplanaarsuse peamisteks
põhjusteks on:
S ü s in ik u a a to m m e t a a n is ( C H )4 o n s p 3 - h ü b r id is e e r u n u d o le k u s • süsinikuaatomi hübridisatsioon, nt sp3-hübridisatsioon
loob ruumis korrapärase "tetraeedri" võrdsete nurka-
Hdega (109°28') 4 hübridiseerunud orbitaali (üksik-
Hsideme) vahel (joon. 10);
• aatomitevahelised
interaktsioonid molekulis.
HHCHHH Konfiguratsioon on aatomite või aatomigruppide ruu-
Hh ü b r id is a t s io o nmiline paiknemine
molekulis
üksteise
suhtes.
t e t r a e e d e rKonfiguratsiooni skemaatilise esitamise põhireeglid on
Hjärgmised (vt joon. 10 ja etanoolamiini konfiguratsiooni
o1 0 92 8 'joon. 11):
• sirgjoon tähistab paberi
tasapinnal asuvat sidet;
Hk o n fig u r a ts io o nH• täiskiil (3) on sideme tähis, mis projitseerub paberi
Htasapinnast vaatleja suunas;
• punktiirkiil ( x) tähistab sidet, mis projitseerub
tasapinna taha.
Joon. 11
Inimorganismi fosfolipiidides
leiduv kolamiin (
etanool -
H O CHC HN Hstru ktu u ramiin) sisaldab kahte sp3-hübridiseerunud C-aatomit)
222ehitus ja konfiguratsioon on toodud joon. 11.
HHCCKonformatsioon
HHko n fig u ratsio o nH ONHAatomite (aatomigruppide) ruumiline paigutus
moleku -
2lis üksteise suhtes on suhteline. C-aatomi sp3-hübridi-
Etan o o lam iinseerunud olek võimaldab teatavat vaba pöörlemist
(in im o rg an ism i fo sfo lip iid id e ümber σ-sidemete. Nii võib
molekul omandada ruumi-
ko m p o n en t;liselt erinevaid geomeetrilisi vorme (konformatsioone).
sisaldab kahte sp3
olekus süsinikuaatom it)
Erinevad konformeerid ei ole erinevad ühendid vaid
ühe ja sama molekuli energeetiliselt erinevad
seisundid .
Konformeeride energeetiline erinevus pole suur. See-
tõttu on pidevalt võimalik üleminek ühest konformat-
sioonist teise (kui pole suuri asendajaid) ja praktiliselt
J o o n . 1 2
võimatu konformeeride kui stabiilsete isomeeride
eraldamine teineteisest (spektraalsete meetoditega saab
CC=2 konformeere siiski tuvastada). In situ püüab molekul
2C 1alati võtta stabiilseima (natiivse) konformatsiooni,
C=1 milline on tema funktsiooni aluseks.
17
Atsükliliste orgaaniliste ühendite konfor-
J o o n . 1 3
matsioonid
O HKonformeeride ehitust saab esitada graafiliselt, nt
HHNewman’i projektsioonide abil. Sel puhul vaadel-
T ra n s -k o n f o rm a ts io o ndakse orgaanilist ühendit (või tema fragmenti) piki
HHo n e ta n o o la m iin iühte C-C sidet (vt. joon. 12).
ja o k s s o o d s a imN H Joon. 13 illustreerib etanoolamiini konformatsioone
2Newman’i projektsioonis. Energeetiliselt soodsaim (sta-
T ra n s -biilseim) on etanoolamiini sulustatud trans- (vastas-,
O Hanti-) konformatsioon. Sel puhul on asendajate vaheline
O H N HN H2H2kaugus
maksimaalne,
st
asendajate
tõukumised
(repulsiooni jõud) on vähimad. Sulustatud kald kon-
formatsioon on vahepealse stabiilsusega ja varjestatud
HHHHHH(cis-) konformatsioon on ebasoodsaim.
H Sulustatud trans-konformatsioon pole alati siiski
molekuli stabiilseim seisund. Mõnikord on selleks su-
C is -K a ld -lustatud kaldkonformatsioon tänu molekulisiseste vesi-
niksidemete lisa-stabiliseerivale efektile (nt makromo-
lekulide puhul).
Orgaaniliste ühendite konformatsiooni stabiilsus sõl-
Joon. 14
tub mitmetest faktoritest. Pika süsivesinikahela sta-
111obiilseim konformatsioon on sulustatud sik-sakkonfor-
C O O Hmatsioon, mis garanteerib ka ruumilise
ökonoomika (vt
H C3seda inimorganismi rasvhapete palmithappe ja olehappe
konformatsioonide
varal , joon. 3 ja 14).
P alm ith ap e (16:0) H CC O O H3Tsükliliste orgaaniliste ühendite konformat-
sioonid
O leh ap e (18:19) Monosahhariidide konformatsioon. Molekuli kon-
formatsiooniliste muutuste ajal on võimalik
mole -
kulisiseste
funktsionaalsete
rühmade
vaheline
interaktsioon . “
Look ”-konformatsiooni puhul viivad
Joon. 15
need tavaliselt kas furanoosse (5-
lüliline ) või püra-
noosse (6-lüliline) tsükli tekkeni (joon. 15). Inim-
tsüklilisekonformatsiooni tekeorganismi
monosahhariidid võivad olla furanoosses või
püranoosses konformatsioonis. Viimane on levinum.
O Suurte tsükliliste orgaaniliste ühendite (monosahha-
Furanoosneriidid) jaoks on stabiilne mitteplanaarne konformat-
tsükkelsioon . Torsioonpinged (molekuli energia suureneb σ-
sidemete varjestatud konformatsiooni tõttu), Van der
Waals’i
pinged (mahukate asendajate vastastikused
66tõukumised) ja Bayer’i pinged (nurgapinged) teevad
OHO OHtasapinnalise (planaarse) vormi energeetiliselt eba-
5O5soodsaks (ebastabiilseks). Näiteks, tsükloheksaani pla-
1Püranoosne1naarses vormis peaks valentssidemete vaheline nurk
Htsükkelolema 120° ideaalväärtuse (109°28’) asemel ja see vorm
Holeks energeetiliselt ebasoodne. Mitteplanaarses konfor-
glükopüranoosi formeerumine:matsioonis (tugitool,
vann , twist jne) on
tsükloheksaan (reageerivad hüdroksüül-
või
monosahhariid väga stabiilsed (joon. 16), sest
ja aldehüüdrühm)
nurgapinged on välditud.
18
Mitmete tsükliliste ühendite jaoks on
soodsaim
”tugitool” konformatsioon
J o o n . 1 6
(puuduvad nurgapinged). Üheks näiteks
inimorganismis on
glükoos ehk vere-
s ü m m e e tria te lgsuhkur (joon. 16).
HCOA
Joon. 16 illustreerib, et sidemed paik-
HCO HE
E
nevad aksiaalselt (paralleelselt molekuli
H OCHOsümmeetriateljega) ja ekvatoriaalselt
HCO HA
A
E
(109°28' sümmeetriatelje suhtes). Suu-
HCO HE
red asendajad paiknevad maksimaalselt
C H O HA
E
üksteisest eemal (ekvatoriaalselt) ja
2A
molekul on energeetiliselt stabiilseim
F is c h e ri p ro je k ts io o n(joon. 16). NB! Hemiatsetaalse hüdrok-
(g lü k o o s iG lü k o o s ik o n fig u ra ts io o n )süülrühma (asendis C1) ekvatoriaalsuse
tu g ito o l-k o n fo rm a ts io o ntõttu on glükoosi β-glükopüranoosne
E = e kv a to ria a ls e d s id e m edvorm stabiilsem kui α-glükopüranoosne
A = a ks ia a ls e d s id e m e dkonfiguratsioon.
Steroidid /steroolid on inimorganismi
Htähtsad biomolekulid. Nende hulka
HC H O Hkuuluvad
steroidhormoonid , kole-H O2C H O HH O2Osterool, sapphapped jne. Nende tsük-
OHHliliste molekulide baas-skeletiks on
ste-H OHHH Oraantuum, mis evib inimorganismis
HHO Herinevaid konformatsioone (joon. 17).
O H1HO HSteraantuum sisaldab kolme konden-
1O HHseerunud tsükloheksaanitsüklit ja ühte
tsüklopentaanitsüklit. Kõik need tsüklid
α
-G lü k o p ü ra n o o sβ
-G lü k o p ü ra n o o son tugitool-konformatsioonis. Loodus-
like steroidide puhul on B ja C tsüklid
alati trans-asendis, D tsükkel enamasti
trans-asendis ning A ja B tsüklid kas
trans- või cis-asendis (joon. 17).
Joon . 1 7
CDCDABABtrans A/B Steraan CDABcis A/B19
4 Orgaaniliste ühendite isomeeria põhialused
Isomeerid on
ühesuguse elementaarkoostisega, kuid erinevate füüsikaliste
ja keemiliste oma-
dustega orgaanilised ühendid. Isomerism suurendades ühendite heterogeensust on aluseks ka
rohkearvulistele spetsiifilistele biofunktsioonidele. Isomeere jaotatakse:
•
struktuursed (koostis-)
isomeerid;
•
stereoisomeerid.
Struktuursed (koostis-) isomeerid
Aluseks on koostisaatomite erinev seostatus. Eristatakse:
•
ahel-isomeere:
H C CH CH33 CH -CH -CH -CHC H3223410CH3 n-ButaanButaanIsobutaan •
asendi-isomeere:
⇒ isomerism tuleneb kaksik- või kolmiksideme
erinevast paigutusest
CH =CH-CH=CHC HCH =C=CH-CH224623 1,3- Butadieen Butadieen1,2-Butadieen ⇒ isomerism tuleneb samasuguste funktsionaalsete rühmade (asendajate) erinevast paigutusest
CH -CH -CH -OHCH - CHOH -CH 32233 1- Propanool 2-Propanool Br BrBr Br BrBr 1,2-Dibromobenseen1,3-Dibromobenseen1,4-Dibromobenseen ⇒ isomerism tuleneb aatomite erinevast lokalisatsioonist funktsionaalsetes rühmades (üldine
empiirvalem on identne, nt C2H6O)
CH -CH -OHCH -O-CH3332Etanool ( alkohol )Dimetüüleeter (eeter)20
Stereoisomeerid
Stereoisomeerid on sama molekulaarse valemi ja samasuguse aatomite (seostus-) järjestusega orgaa-
nilised ühendid, millel on aga aatomite erinev paigutus ruumis. Üldiselt jaotatakse stereoisomeerid
kahte kategooriasse: enantiomeerid ja
diastereomeerid .
• Enantiomeerid:
Need on stereoisomeerid, mis on teineteise peegelpildid.
Joon. 18
Nad sisaldavad kiraalset (asümmeetrilist) süsinikuaatomit.
HCOTema
tähistus on C* ja ta on seotud nelja erineva aatomi
HCOvõi grupiga (joon. 18). Võimalike enantiomeeride arv
HO C*HHOHorgaanilise ühendi puhul võrdub 2n, kus n on kiraalsete
CH O HC H O H22süsinikuaatomite arv.
Enantiomeere vaadeldakse kui D- ja L-isomeere. Kui
L-G lü tseeraldehüüdglütseeraldehüüd on kujutatud nii, et aldehüüdrühm paik-
neb C* suhtes üleval, siis L-isomeeri puhul asetseb OH-
H COrühm asümmeetrilisest süsinikust vasakul pool, D-isomee-
HCOris aga paremal pool (joon. 18). Glütseeraldehüüdi selline
HC*O HHO Hkonfiguratsioon ongi võetud D- või L-isomeeri etaloniks
CH OHCH O Hmitmete teiste orgaaniliste ühendite (nt karboksüülhapete
22hüdroksüderivaadid, aminohapped jt) jaoks.
D-G lütseeraldehüüd Enantiomeerid on optiliselt aktiivsed (neid nimetatakse
ka optilisteks isomeerideks). See tähendab, et nad
pööra -
C ahn-Ingold-Prelog'i sü steem isvad polariseeritud valguse tasapinda kas paremale (tähistus
o n need tähistused S (sinister, vasak)on “+”) või vasakule (tähistus on “-”).
ja R (rectu s, parem ), vastavalt L ja D Enantiomeerid võivad omada erinevaid biofunktsioone.
asem elNii on valkudes aminohapped vaid L-vormis.
Inimorganismi makromolekulid, mis moodustuvad
kiraalsetest monomeeridest on ka ise kiraalsed. Nende
J o o n . 1 9
biosüntees inimorganismis on reeglina stereospetsiifiline,
C O O HC O O Hkuna
ensüümid on samuti kiraalsed molekulid, st et vastav
H NC HH NC Hensümaatiline süntees vajab substraatide vastavaid
22H CO HH OC Hisomeere ja ka tekkiv
produkt on kindel
isomeer .
C HC H 33• Diastereomeerid:
L -T re o n iinL - A llo tre o n iinDiastereomeerid on stereoisomeerid, mis pole teineteise
peegelpildid. Nad ei pruugi alati ka sisaldada kiraalseid
süsinikuaatomeid.
J o o n . 2 0
Epimeerid on sellised diastereomeerid, mis pole peegel-
pildid, sisaldavad üle ühe kiraalse süsinikuaatomi ja
C O O HC O O Herinevad konfiguratsioonilt ainult ühe süsinikuaatomi juu-
H CO HH OC Hres (vt epimeeride näitena aminohapet treoniin, joon. 19).
H OC HH CO H Kui molekulil on sümmeetria võimalus (sümmeet-
C O O HC O O Hriatelg), siis vaatamata asümmeetriliste süsinikuaatomite
olemasolule tekivad optiliselt inaktiivsed isomeerid. Neid
D -V iin h a p eL -V iin h a p evorme nimetatakse akiraalseteks mesovormideks (vt
näitena tartraati ehk viinhapet, joon. 20).
s ü m m e e tria ta s a p in d
C O O HC O O HH CO HH OC H--------------------------------
H CO HH OC HC O O HC O O HM e s o v iin h a p e21
Cis- ja trans-isomeerid (tähistatakse vastavalt ka E
Joon. 21
ja Z) on diastereomeerid, mis tekivad, kui on
piiratud vaba pöörlemine ümber süsinik-süsinik
sidemete. Kaksiksideme puhul kujuneb cis- või trans
H CCHH CH333-isomeer. Ladina k. termin “cis” tähendab samal
CCCCpool ja termin “trans” tähendab vastaspool (vt
HHHCH3vesinikuaatomite või metüülrühmade paigutust
cis-2- Buteen trans-2-Buteenkaksiksideme tasapinna suhtes cis-2-buteenis ja
trans-2-buteenis, joon. 21).
Cis-trans isomerism võib esineda ka kondensee-
runud tsükliliste süsteemide puhul (nt steroidhor-
moonide baas-struktuurid), st kaksiksideme olemas-
olu pole reegel. Nii on steroidide ehituses esinev
Joon. 22
dekaliin (joon. 22) kahe tsükloheksaani molekuli
1810kondensatsiooniprodukt, millel on trans- ja cis-iso-
meer , sõltuvalt vesinikuaatomite paigutusest tsüklite
tasapinna suhtes. Steroidides esineb just trans-
945dekaliin, mis on stabiilsem.
DekaliinHH1010H99Htrans-Dekaliincis-Dekaliin22
5 Konjugatsioon ja aromaatsus
Kaksiksidemete paigutust molekulides võib klassifitseerida järgmiselt:
• isoleeritud (>C=C-(CH2)n-C=CC=C=CC=C-C=C δ'-
Lisagem, et kordsete sidemetega orgaanilistes ühendites polariseeruvad induktsiooni-
mehhanismi alusel mitte ainult σ-sidemed, vaid ka π-sidemed (π-induktsiooni efekt, Iπ-
efekt).
46
Resonants (mesomeerne) efekt (M-efekt) Mesomeersed
efektid peegeldavad asendaja võimet
tõmmata enda poole elektrone
konjugeeritud molekulaarsest π-elektronsüsteemist või
anda elektrone sellesse süsteemi.
Kuna M-efekt ilmneb ainult konjugeeritud süsteemis, nimetatakse teda ka resonantsefektiks.
Efekt
kantakse vaibumata edasi molekuli kogu π
-elektronsüsteemi ulatuses. Seetõttu mõ-
jutatakse resonantsefektidega orgaaniliste ühendite
omadusi tugevamini kui induktiivse efektiga. M-efekti
puhul
toimub
elektrontiheduse
ebaühtlane
väljatõrjumineπ-
elektronsüsteemis. Graafiliselt kujutatakse M-
efekte kõverdatud nooltega (vt. skeemi), mis
tähistavad efektide suunda:
p- või π-elektronide liikumisi vastava sideme või aatomi suunas
(vt. akrüülaldehüüdi või dimetüülvinüülamiini).
-M-efekti (kaasatõmbav resonantsefekt) omavad karbonüül-, karboksüül-, sulforühm jt.
Need asendajad sisaldavad π-sidet, mis osaleb konjugatsioonis π-sidemetega vastavas
põhiühendis
(π
, π
- konjugatsioon; vt
akrüülaldehüüd). See põhjustab vastava põhiühendi
elektrontiheduse languse.
Tingituna märkimisväärselt kõrgemast elektronegatiivsusest
(võrrelduna süsinikuaatomiga), tõmbab hapnikuaatom kõrvalrühmast elektrone välja ühise
π-elektronpilve kaudu (loob konjugeeritud süsteemi). Sellest tulenevalt -CHO grupp avaldab
-M-efekti, mille tagajärjel hapniku aatomil ilmneb negatiivne
osalaeng .
+M-
efekti (äraandev resonantsefekt) osutavad halogeeniaatomid, NH2, N(Alk)2
OH, O- jt. Sellised asendajad (aatomid) omavad vaba elektronpaari p-orbitaalil, mis
konjugeerub π-elektronidega põhimolekulis (
p,π
-konjugatsioon, vt.
dimetüülvinüülami-in). Antud juhtumil põhiühendi elektrontihedus tõuseb. Lämmastikuaatom annab elektrone
molekulaarsesse π-elektronsüsteemi (+M-efekt), mille tulemusena lämmastikuaatomil ilm-
neb positiivne osalaeng.
δ+
δ-
δ-
δ+
H
..H C
CH
C
O
H
2
C
CH
N CH
2
3 2
sp2
sp2
π
,π
- konjugatsioon
p,π
- konjugatsioon
(akroleiin, akrüülaldehüüd) (dimetüülvinüülamiin)
47
Probleemanalüüs: asendajate elektroonsete efektide mõju orgaaniliste molekulide oma-dustele. Analüüsi põhireegel on järgmine: Et määrata elektrontiheduse väljatõrjumist molekulis,
tuleb summeerida asendajate induktiivsed ja resonantsefektid (vt. allpool olevat tabelit).
Summaarsete efektide alusel asendajad jaotatakse järgmiselt:
elektronodonoorsed asendajad: tõstavad molekuli elektronitihedust (alküülrühmad,
negatiivse laenguga rühmad, vaba (
paardumata ) elektronpaariga rühmad, milledel on ai-
nult +I-efekt või prevaleerib +M-efekt) (vt. tabel).
Tabel. Asendajate elektroonsed efektid
======================================================
Asendaja
Induktsiooniefekt
Mesomeerne efekt
I- ja M-efekti suhe konjugee-
(I)
(M)
nud süsteemides
================================================================
Alküülid
+I
pole
elektronidoonor (+I)
(CH3,
C2H5 jt.)
O-
+I
+M
elektronidoonor (+I, +M)
-NH2, -N(Alk)2
-I
+M
elektronidoonor (+M >> -I)
-OH
-I
+M
elektronidoonor (+M > -I)
-OAlk
-I
+M
elektronidoonor (+M > -I)
Halogeenid -I
+M
elektroniaktseptor (-I > +M)
>C=O
-I
-M
elektroniaktseptor (-I, -M)
-COOH
-I
-M
elektroniaktseptor (-I, -M)
-SO3H
-I
-M
elektroniaktseptor (-I, -M)
=================================================================
Märkus: Alküülrühmade +I-efekt kasvab koos nii süsinikuaatomite arvuga kui ka hargnevusega
grupis .
elektronoaktseptoorsed asendajad: langetavad molekuli elektronitihedust (halogeenid,
karbonüül-, karboksüül-, sulfo-, nitro- jt. rühmad, milledel on valdavalt -I-efekt ja -M-
efekt) (vt. tabel).
Probleem 1. Asendajate efektid atsükliliste orgaaniliste ühendite omadustele. Lüsiin on inimesele essentsiaalne aminohape. Oma metaboliidi (krootonaldehüüdi derivaa-
di) kaudu lüsiini
katabolism toodab ketokehi.
Ketokehad on tähtsad kliinilised markerid.
Analüüsiksime krootonaldehüüdi asendajate summarseid efekte ja reaktiivsust, kasutades
Paulingi
elektronegatiivsuse skaalat ja ülalantud tabelit.
48
δ+
δ-
H
H C
CH
CH
C
O
3
Selles molekulis mää-
ravad elektron -tiheduse ümberjaotumise valdavalt karbonüülrühma
elektroonsed efektid (vt. tabel). Karbonüülrühma elektronoaktseptoorsed omadused (-M-
efekt) antakse edasi kogu π-sidemete konjugeeritud süsteemis (-C=C- ja >C=O). Antud el-
ektronide dislokalisatsiooni soodustavad ka metüülrühma (+I) ja karbonüülrühma enda (-I)
in-duktiivne efekt (vt. tabel), mis põhjustab π-elektronide veelgi olulisema nihke kar-
bonüülrühma hapnikuaatomi suunas (NB! hapnikuaatomi
elektronegatiivsus on kõrgem kui
süsini-ku aatomil).
Järeldus: Sellise asendajate elektroonsetest efektidest põhjustatud elektronide dislo-
kalisatsiooniga võiks seletada krotoonaldehüüdi kaksiksideme langenud reaktiivsust tema
reaktsioonides mitmete elektronoaktseptoorsete reagentidega (
oksüdatsioon , elektrofiilne
assotsiatsioon).
Probleem 2. Asendajate efektid aromaatsete ühendite omadustele. Paljud
biomoleku-lid ja
ravimid sisaldavad
aromaatset tsüklit (tsükleid). Asendaja(te) elektroonsed efektid
aromaatses tuumas võivad põhjustada elektrontiheduse ümberjaotumise sellises süsteemis.
Teisisõnu, elektrontihedus asendatud benseeni tuumas erineb elektrontihedusest asendamata
benseeni tuumas (lihtsaimas aromaatses ühendis). Sõltuvalt asendaja loomusest (elektrono-
doonor või elektronoaktseptor) võib asendaja toimel aromaatse tuuma elektrontihedus tõusta
või langeda. Sellest tulenevalt orgaaniliste ühendite (
biomolekulide, ravimite)
reaktiivsus sõltub asendaja elektroonsest efektist.
a) p-Aminobensoehape (PABA) on vitamiinitaoline
orgaaniline ühend, samal ajal ka
foolhappe kui olulise vitamiini sünteesi eelvorm; mõned PABA estrid, näiteks anestesiin ja
novokaiin , on kasutusel lokaalanesteetikumidena.
O
..p-aminobensoehape
H
N
C
2
OH
49
Ülaltoodud tabelist näeme, et -COOH avaldab -I- ja -M-efekti. (
Valents -)
elektronpaar , mis
moodustab kovalentse sideme benseenituuma ja karboksüülrühma vahel, nihkub asendaja -I-
efekti tõttu -COOH suunas, alandades benseenituuma elektronitihedust. Seda efekti tugev-
dab asendaja -M-efekt, kuna π-elektrontihedus langeb
orto- ja
para-asendites ning kasvab
meta-asendis. Viimasele efektile aitab kaasa ka -NH2 elektronodonoorne efekt (vt. tabel).
Karboksüülrühma C-aatomi juures tekib positiivne osalaeng, kuna elektronegatiivne hap-
nikuaatom tõmbab elektrone piki C-O sidet enda suunas. Seetõttu
astub PABA karbok-
süülrühm kergesti esterifikatsioonireaktsioonidesse alkoholidega (nukleofiilsete ühen-
ditega). Sellist tüüpi reaktsioonide produktideks on ka
anestesiin ja novokaiin (vastavalt
PABA etüül- ja dietüülaminoetüülester).
Järeldus: Elektronoaktseptoorsete asendajate (-CHO, -COOH, -SO3H, halogeenid,
jt.) efektid on järgmised: alandavad aromaatse süsteemi elektronitihedust, seda eriti
orto- ja
para-asendites. Seetõttu neid asendajaid nimetatakse desaktiveerivateks või meta-
suunavateks asendajateks (meta-orientantideks). Kõik selle grupi asendajad omavad osalist-
või täispositiivset laengut aatomil, mis otseselt seostub aromaatse tuumaga. Elektronoaktsep-
toorse asendaja seostumine benseeniga vähendab benseeni reaktiivsust, võrreldes asenda-
mata benseeniga.
b)
Fenooli , toksilist ühendit võidakse genereerida valkude
abnormsel seedimisel soolestikus .
Fenool on ka
lähteühendiks paljude ravimite sünteesil.
+ M
fenool
..O
H
- I
+ M
> - I OH
OH
Hüdroksüülrühm (fenoolis) omab nii induktiivset kui ka mesomeerset efekti, kuna O-aatom
omab suuremat elektronegatiivsust kui sp2-hübridiseerunud C-aatom (vt. Paulingi skaala).
Selliselt , hüdroksüülrühma -I-efekti tõttu, peaks elektronitihedus nihkuma -OH suunas.
Vastupidiselt, mesomeerses vastastikuses toimes, annab O-aatom oma vaba elektronpaari
benseenituuma ühtsesse konjugeerunud π-elektronpilve (
p,π-konjugatsioon) ja elektroniti-
hedus peaks nihkuma benseenituuma suunas (+M-efekt, vt. tabel). Siiski on teada, et OH-
grupi +M-efekt > -I-efekt ( vt. tabel), mis tähendab, et -OH omab kogu süsteemi suhtes el-
ektrone-vabastavaid omadusi. Antud ühendis negatiivne osalaeng dislokaliseerub aga
orto-ja
para-asenditesse (vt. skeemi). +M-efekt seletab ka fenoolse OH-rühma prootoni suurt
liikuvust (kõrget happesust), võrreldes näiteks etanooli OH-rühmaga. See annabki fenoolsele
OH-
rühmale suhteliselt kõrge reaktiivsuse asendus- ja oksüdatsioonireaktsioonides.
50
Järeldus: Fenool on heaks näiteks, illustreerimaks elektronodonoorsete asendajate
(alküülid, -NH2, -OH, -OR, -NR2 jt.) efekte, mis seisnevad aromaatse tuuma elektron-
tiheduse tõstmises, eriti
orto- ja
para-asendites (asendaja suhtes). Antud tüüpi asendajad
viivad negatiivsete osalaengute tekkele benseenituuma
orto- ja
para-asendites, millega soo-
dustatakse neis asendites elektrofiilsete reagentide rünnakut (asendusreaktsioone). Seetõttu
seda tüüpi asendajaid nimetatakse benseenituuma
orto-ja
para-orientantideks. Need asenda-
jad kannavad aktiveerivate gruppide
nimetust , kuna nad muudavad benseenituuma mit-
teasendatud benseeniga võrreldes aktiivsemaks.
51
Orgaaniliste ühendite
happelised ja
aluselised omadused
Happelisus /
aluselisus on
biomolekulide reaktiivsuse olulised determineerijad ja seetõttu ti-
hedalt seotud mitmete biomeditsiiniliste probleemidega, k.a. ensümoloogia, imendumine,
ravimite toime ja
biotransformatsioon , füsioloogiliste protsesside
regulatsioon jne.
Orgaanil -
iste ühendite happelisust/aluselisust hinnatakse kahe paralleelse teooria alusel.
Happelisuse ja aluselisuse Brønsted- Lowry teooria (protolüütiline teooria) See teooria
jaotab orgaanilised ühendid
hapeteks ja
alusteks prootoni (H+) ülekandevõime
järgi:
happed (
prootoni doonorid) on molekulid/
ioonid , mis annavad ära prootoneid (
H+);
_A
H + B
:A
+ B
H
hape
alus
alus
hape
(konjugeerunud)
Reaktsioon näitab, et
deprotoneerimine konverteerib happe vastavaks konjugeeritud aluseks
ja vastupidi. Happe-alus paaride (vastavalt AH-A- ja :B-BH) vahel tekib tasakaaluline
pöör -
duvus: mida tugevam (nõrgem) on hape, seda nõrgem (tugevam) on konjugeerunud alus.
Brønstedi hapete dissotsiatsioonil vesilahustes toimib vee molekul alusena ja ülaltoodud
reaktsiooni võib ümber kirjutada järgmiselt:
..A
H
+ H O
A
+ H O+
2
3
..B
:B
H
+ H O
+ H O+
2
3
Tugevam hape deprotoneerub (annab aniooni) kergemini kui nõrk hape. Happelisust vesi-
lahuses (vesi on sel puhul aluseks) määratakse happelisuse konstandi abil, st. AH ja H2O va-
helise reaktsiooni tasakaalulise dissotsiatsioonikonstandi (Ka) abil:
[A ] [H O ]
[ B
: ] [H O ]
3
3
K
K
a (AH)
a
[AH]
(B - H )
[B - H ]
52
Lihtsustamaks opereerimist arvuliste astendajatega kasutatakse Ka väärtuse negatiivset
loga -
ritmi, s.o. pKa (näiteks äädikhappe Ka= 1,75 x 10-5, pKa= 4,75).
Mida suurem on Ka ehk mida väiksem on pKa, seda tugevam on antud hape (vastupidi, kõrge pKa vastab nõrgale hap-
pele ).
Brønsted-Lowry järgi ja aatomi alusel, mis kannab dissotsieeruvat prootonit, jao-
tatakse happed nelja põhirühma (vt. tabel):
Tabel. Happed Brønsted-Lowry järgi ===========================================================
C-H
N-H
S-H
O-H
happed
happed
happed
happed
Alkaanid
Amiinid Tioolid
Alkoholid, Fenoolid, Karboksüülhapped
(ja deri-
(
amiidid ,
(ja deri-
(ja derivaadid)
vaadid)
imiinid)
vaadid)
R-C-H
R-N-H
R-S-H
R-O-H Ar-O-H
R-COO-H
pKa (keskmistatud arvuline väärtus)
40-50 30 12 18 10 4,7 Teooria võimaldab kõiki vesinikku-sisaldavaid orgaanilisi ühendeid käsitleda hapetena (s.t.
C-H, N-H, S-H, O-H hapetena). On aga selge, et ühendi reaalne ionisatsioonivõime, s.o. re-
aalne happesus kõigub, laiades piirides. Selgitagem alljärgnevalt põhireegleid, mille alusel
saab võrrelda erinevate orgaaaniliste ühendite happelisust.
Orgaanilise ühendi happelisuse määrab
tema aniooni stabiilsus, st. vastava
konjugeeritud aluse stabiilsus. Mida stabiilsem on
anioon , seda tugevam on vastav hape, s.t.
seda kergemini dissotsieerub antud orgaanilisest ühendist
prooton (üle kantuna alusele). Ani-
ooni stabiilsuse määrab negatiivse laengu delokalisatsioon (dispersioon, jaotuvus): mida
delokaliseeritum on negatiivne laeng, seda stabiilsem on anioon.
Negatiivse laengu delokalisatsioon aga sõltub reast faktoritest:
•
vesinikuga seotud aatomi võimest
kinni hoida elektronpaari pärast H+ eraldumist
(mida suurem on selle aatomi
elektronegatiivsus (takistab H+
liitumist !), seda suurem
on laengu delokalisatsioon ja seda stabiilsem on anioon);
•
vesinikuga seotud aatomi suurusest (mida suuremad on selle aatomi valents-
orbitaalid , seda suurem on negatiivsete laengute delokalisatsioon anioonis);
53
•
funktsionaalse rühmaga seotud radikaali omadustest:
ahela pikkus, konjugatsioon, asendajate elektroonsed efektid (s.t. negatiivse laengu jaotuvuse võimalused teiste
aatomite vahel);
•
lahusti omadustest: mida paremini lahusti aniooni
lahustab , seda stabiilsem on ani-
oon.
Analüüsigem järgnevalt orgaaniliste ühendite happelisuse laia varieeruvust.
C-H happed Süsiniku madala elektronegatiivsuse tõttu (süsiniku võime elektronpaari kinni hoida on
väike) on karbanioonide moodustumine energeetiliselt ebasoodne ja tekkinud
anioonid on
ebastabiilsed. Vesilahustes C-H happed dissotsieeruvad vähesel määral. Seetõttu on
küllastunud süsivesinikud nii nõrgad happed, et praktiliselt on võimatu leida alust, mis oleks
võimeline neist lahti rebima prootoni. Asendades C-H hapetes vesinikuaatomi(d) elektroni
(de) aktseptori (te)ga (suurendavad delokalisatsiooni!) kasvab C-H hapete happelisus.
Näiteks, meditsiinipraktikas kasutatav
triklorometaan (
kloroform), milles
metaani kolm H-
aatomit on asendatud klooriga (vt. kloori elektrone äratõmbavat -I-efekti
skeemil ), on ligi-
kaudu 30 suurusjärku tugevam hape kui
metaan (metaani pKa = 48-60 ja kloroformil ~ 15).
Cl
Cl C
H
Cl
C
+ H
3
Cl
kloroform
karbanioon (püsivam kui metüülanioon)
C-H hapete happesust mõjustab ka
süsinikahela pikkus ja hargnevus. Mida pikem (harg-
nenum) on alifaatne ahel, seda nõrgem on orgaanilise ühendi happelisus (alküülgruppide el-
ektrone-vabastav +I-efekt destabiliseerib anioone). Järelikult metaan on tugevam hape kui
etaan. C-H hapete happesus kasvab ka ühendi küllastamatuse suurenemisega: sp2-(või sp-)
hübridiseerunud süsiniku elektronegatiivsus on suurem kui sp3-hübridiseerunud süsinikul.
sp2 - (või sp-) süsinikuaatomid on enam võimelised kinni hoidma elektrone, mis viib vasta-
va orgaanilise aniooni stabiilsuse kasvule (võrreldes sp3 -hübridiseerunud süsinikuga).
N-H happed Kuna N-aatomi elektronegatiivsus on suurem kui C-aatomil, on N-H hapete anioonidel
suurem võime hoida kinni elektronpaari pärast prootoni eraldumist kui C-H hapetel. Jä-
relikult omavad N-H happed suhteliselt suuremat happesust kui küllastamata süsivesinikud
(vt. tabel).
S-H happed Tioolid on tugevamad happed kui vastavad hapniku ja lämmastiku analoogid (vt. tabel), kui-
gi väävli elektronegatiivsus on väiksem kui
hapnikul või lämmastikul. Lisagem, et tioolide
puhul aitab lisaks elektronegatiivsusele aniooni oluliselt stabiliseerida väävli aatomi
54
suurus. Kuna
väävel on perioodilisuse tabeli kolmanda perioodi (horisontaalrea) element, on
tema valentsorbitaalid tunduvalt suuremad kui hapnikul või lämmastikul. Seetõttu on
negatiivsete laengute delokalisatsioon anioonis märkimisväärsem ja tekkinud anioon stabiil-
sem.
R-CH2 - S-
R-CH2 - O-
O-H happed Hapnikuaatomi elektronegatiivsus on suurem kui süsinikul. Seetõttu omavad O-H hapete
anioonid märkimisväärselt suuremat võimet hoida kinni elektronpaari pärast prootoni
lahkumist kui C-H happed, millest tulenevalt O-H happed omavad suhteliselt suurt happe-
lisust juba küllastatud ühenditena. O-H hapete happelised omadused suurenevad veelgi juh-
tumil, kui anioon kujutab endast konjugeeritud süsteemi. Sel puhul hakkab
toimima veel kol-
maski aniooni stabiliseeriv faktor (vt.
eespool ), kuna konjugatsiooniga kaasub terve rida
spetsiifilisi efekte, k.a. elektrontiheduse ühtlane delokalisatsioon kogu süsteemis.
O
H
O
H
Konjugatsiooniga on
seletatav aromaatsete ühendite suurem happelisus võrreldes ali-
faatsetega. Nii on fenool tugevam hape kui etanool. Põhjuseks on fenolaataniooni parem sta-
biliseeritus: negatiivne laeng delokaliseerub kogu molekuli ulatuses (
p,π-konjugatsioon).
Just konjugatsioonist tulenevalt on karboksüülhapped tugevaimad O-H happed. Negatiivse
laen-gu võrdne
jaotumine karboksüülrühma kahe hapnikuaatomi vahel (mõlemad C-O side-
med on konjugatsioonist tingituna võrdväärsed, resonantsi efekt!) teeb karboksülaataniooni
teiste orgaaniliste anioonidega võrreldes stabiilseimaks.
R
C
O
O
O
R
C
O
R
C
O
O
Orgaaniliste ühendite happelisust mõjustavad elektroonsete efektide kaudu ka radikaalis(des)
olevad asendajad. Elektronoaktseptoorsed asendajad suurendavad negatiivse laengu deloka-
lisatsiooni anioonis, järelikult stabiliseerivad aniooni ja seeläbi suurendavad happelisust; el-
ektronodonoorsed vastupidiselt vähendavad happelisust.
Illustreerimaks ülaltoodud teooriat võrdleksime kahe erineva OH-rühma sisaldava ühendi
happesust: kolamiin ehk etanoolamiin (fosfolipiidide
komponent ) ja narkolaan (
mittelenduv narkotiseeriv
meditsiiniline vahend).
55
Etanoolamiin (kolamiin) ja narkolaan on etanooli derivaadid (OH happed, vt. skeemi), mis
elektronegatiivsemate (kui C) elementide (N ja Br vastavalt) sisalduse tõttu annavad stabiil-
sema aniooni kui etanool, s.t. on seega etanoolist tugevamad happed.
BrH N CH CH O-22 2 Br C CH O-2kolamiinBrnarkolaan Kolamiinil on kaks
happelist tsentrit: N-H ja O-H. N-H happed on umbes 10 suurusjärku
nõrgemad happed kui O-H happed (alkoholid), kuna N-aatomi elektronegatiivsus on
väiksem kui O-aatomil. Seega võib kolamiini vaadelda põhiliselt O-H happena ja võrrelda
narkolaaniga, mis on ka O-H hape. Viimases on kolm Br, mis elektronide äratõmbamise (-
I) efekti tõttu (vt. skeemi) oluliselt stabiliseerivad vastavat aniooni, s.t. narkolaan on tuge-
vam hape kui kolamiin.
Brønstedi-Lowry teooria järgi peab
alus omama kas
vaba elektronpaari või kaksiksideme
π
-elektrone kovalentse sideme moodustamiseks prootoniga. Sellele tingimusele vastavad
kaks orgaaniliste ühendite gruppi:
p-alused: orgaanilised ühendid, mis sisaldavad vaba elektronpaariga heteroaatomeid (O,N,S
jt.) ja saavad seetõttu oma
p-elektrone ära anda kovalentse sideme moodustamiseks. Sõl-
tuvalt prootonit siduvast heteroaatomist alustsentris eristatakse: ammoonium-, oksooni-
um-, sulfooniumaluseid;
π-alused: orgaanilised ühendid, mille prooton-siduvaks alustsentriks on kaksiksideme π-
elektronid: alkeenid,
alkadieenid jne. π-aluste aluselisus on suhteliselt madal, kuna
prootoni sidumine alustsentriga toimub pärast π-kompleksi teket, s.o. pärast π-
elektronide lülitumist kompleksi.
Ka aluselisuse kvantitatiivseks hindamiseks kasutatakse suurust pKa: mida väiksem on pKa,
seda nõrgem on vastav alus. Kõik ülaltoodud
faktorid , mis mõjustavad happesust (asendajate
elektronegatiivsus, suurus, elektroonsed efektid ja ka konjugatsioon), mõjutavad ka
aluselisust, kuid vastupidises suunas, s.t. faktorid, mis vähendavad happesust, suurendavad
aluselisust ja vastupidi.
Illustreerimaks seda teooriat võrdleksime kolme aromaatset tuuma sisaldavate orgaaniliste
ühendi nagu
aniliin (aromaatne amiin),
noradrenaliin (
bioaktiivne amiin,
mediaator /
hormoon ) ja
adrenaliin (noradrenaliini derivaat, bioaktiivne amiin, hormoon) aluselisust.
Kõigis neis esineb lämmastikuaatom, mille vaba elektronpaar määrabki antud ühendite
aluselisuse (vt. joonis ).
56
Aniliini puhul N-aatomi vaba elektronpaar konjugeerub aromaatse tuuma π-elektron-
süsteemiga ja on raskesti kättesaadav sideme moodustamiseks prootoniga.
Noradrenaliinis,
vastupidi, ei saa vaba elektronpaar konjugeeruda benseenituumaga ja on kättesaadavam
prootoni jaoks kui
aniliinis. Teisalt, molekulis oleva OH-rühma elektrone äratõmbav (-I)
efekt N-aatomi elektrontihedust oluliselt ei mõjuta, kuna N-aatomi ja OH-rühma vahel on
kolm üksiksidet.
Adrenaliin on metüülitud
noradrenaliin. Metüülrühm annab
adrenaliinile elektrontihedust juurde (-CH3 elektrone vabastav (+I)-efekt, vt. tabel) suurendades sellega
tema aluselisust (võrreldes
noradrenaliiniga).
Seega, kolmest amiinist on kõige aluselisem
adrenaliin,
noradrenaliin omab keskmist ja
aniliin väikseimat aluselisust.
HO
..HO
CH
CH
NH
2
2
noradrenaliin
OH
..NH2
aniliin
HO
..HO
CH
CH
N
CH
2
3
OH
H
adrenaliin
Lewise happelisuse ja aluselisuse teooria See teooria on
Brønsted-Lowry teooria laiendatud variant, mis väidab, et
orgaaniliste ühendite happelised omadused määrab aatomi võime vastu võtta ja aluselised omadused te-ma võime ära anda elektronpaari.
Lewise happed (aatomid, molekulid, katioonid) iseloomustuvad vakantse (vaba) el-
ektronorbitaaliga ja on seetõttu võimelised
vastu võtma elektronpaari kovalentse sideme
moodustamiseks. Seega,
Lewise happeid ei iseloomusta ainult prootonite loovutamine, s.t.
kovalentse sideme moodustamiseks nad peavad siduma elektrone (toimima kui
elektrofiilid ).
Vastavalt
Lewise definitsioonile on
Lewise hapeteks metallide katioonid, prootonid , haloge- niidid , jt. elektrofiilid. Lewise alused (aatomid, molekulid, anioonid) peaksid omama
vähemalt ühe paari
valentselektrone seostumaks vakantse orbitaaliga substantsile (
Lewise hape). Selle
definitsiooni kohaselt on kõik
Lewise alused nukleofiilid (moodustavad kovalentse sideme
substantsidega, millel on positiivne laeng).
Lewise alusteks on
amiinid, alkoholid, tioolid ja konjugeerunud orgaanilised ühendid. Lewise ja
Brønstedi aluseid ei saa eristada: mõlemad on elektronpaari doonorid.
Lewise ja Brønstedi happed on aga erinevalt defineeritavad. Kui
Lewise teooria käsitleb
happena mistahes orgaanilist ühendit, millel on vakantne elektronorbitaal sidumaks elekt-
ronpaari, siis
Brønstedi hapeteks peetakse orgaanilist ühendit, mis on vaba orbitaali
omandanud prootoni eraldumise tulemusena.
Lewise teooria plussiks on asjaolu, et teda saab
rakendada peaaegu kõikide orgaaniliste reaktsioonide jaoks, milles orgaanilised ühendid
võivad moodustada happelis-aluselisi komplekse.
57
PRAKTILISTE TÖÖDE JUHENDID 1. ORGAANILISTE ÜHENDITE AROMAATSUS Pineeni kerge oksüdeeruvus (kvalitatiivne reaktsioon küllastamatusele) Võtke kahte katseklaasi 1 tilk 0,1 M KMnO4 lahust ja 10 tilka vett. Tekkinud roosale lahusele
lisage ühte katseklaasi 2 tilka tärpentiini ja teise 2 tilka tolueeni ning loksutage.
Miks ja kuidas muutub lahuse värvus? Reaktsioon tärpentiiniga: CH3
O
H
CH3
O
H
+ KMnO
CH
4
3
CH3
CH3
CH3
2 KMnO
K
4
2MnO4 +
MnO2 + 2H2O
Mida märkate, kui katses asendate tärpentiini tolueeniga? Miks? CH3
Tolueen 2. FENOOLIDE VÄRVUSREAKTSIOONID RAUD(III)KLORIIDIGAErinevaid fenoole on võimalik eristada iseloomuliku värvuse alusel, mis tekib reageerides
raud(III)kloriidiga (FeCl3).
Antud praktilises töös tutvume järgmiste fenoolidega:
OH
OH
OH
OH
OH
OH
KatehhoolResortsiin Hüdrokinoon Võtke 3 katseklaasi. Esimesse katseklaasi viige 5 tilka 1% katehhooli, teise 5 tilka 1% resortsiini,
kolmandasse 10 tilka 1% hüdrokinooni lahust. Igasse katseklaasi lisage 1 tilk 0,1 M FeCl3.
Esimeses katseklaasis tekib roheline, teises violetne ja kolmandas ka roheline, mis küll kiiresti
muutub kollaseks (hüdrokinoon oksüdeerub kinooniks).
Kolmandas katseklaasis (hüdrokinoon) tekkinud rohelist värvust õnnestub täheldada ainult FeCl3
tilga kukkumise
momendil hüdrokinooni lahusesse, kui katseklaasi vaadeldakse valge paberi
foonil . Värvus on seda intensiivsem, mida küllastatum on hüdrokinooni ja mida lahjem on FeCl3
lahus.
Kiiresti muutuva rohelise värvuse tekkimine näitab seda, et hüdrokinooni oksüdatsioonil
kinooniks tekib hüdrokinooni ja kinooni vahel vaheühend, mida nimetatakse kinhüdrooniks:
H
OH
O
OH
O
OH
O
OH
O
H
Hüdrokinoon
Kinhüdroon Kinoon
(värvusetu)
(roheline)
(kollane)
Millistes biomolekulides esineb nn. katehhoolne fragment?
Selgitage, kuidas osaleb hüdrokinoonse ehitusega ühend redoksreaktsioonides(tooge ka konkreetne näide inimorganismist).PEPTIIDSIDEME JA AMINOHAPETE TÕESTUSREAKTSIOONID Värvusreaktsioone kasutatakse valkude avastamiseks ja valkude koostises esinevate
aminohapete tõestamiseks. Mõnede värvusreaktsioonide põhjal (
biureedireaktsioon ) on välja
töötatud ka valkude ja aminohapete kvantitatiivse määramise meetodid.
3. Biureedireaktsioon
a. Biureedireaktsioon biureediga
Võtke kuiva katseklaasi spaatliga natuke kusiainet (ca 0,1 g) ja kuumutage lahtisel leegil.
Kusiaine algul sulab. Kui edasisel kuumutamisel katseklaasi sisu hakkab tahkeks
muutuma ,
lõpetage
kuumutamine . Kuumutamisel tekib kusiainest biureet ja NH3, viimast võib ķa tunda
lõhna järgi. Pärast jahtumist lisage biureedile katseklaasis 1-2 ml 10%-list
NaOH lahust ja
loksutage. Aluselisele biureedilahusele lisage 1-2 tilka 1%-list
CuSO4 lahust. Tekib
punakasvioletne (või
roosakas ) värvus – Cu
kompleks biureediga. Hoiduge CuSO4 ülehulgast,
kuna sel puhul tekib sinine vaskhüdroksiidi liig, mis maskeerib reaktsiooni.
NH2
NH2
O
C
C
O
NH
N
H
O
C
C
O
NH2
NH2
2+
NH
Cu
2
NH
O
C
NH
NH
2
2
2
180 oC
C
O
NH
Cu2+
O
C
C
O
NH
O
C
NH
N
H
2
NH2
O
C
C
O
NH2
NH2
Uurea (ülehulgas) Biureet
Cu-kompleks
b. Biureedireaktsioon
Valgus või peptiidis olevad
peptiidsidemed põhjustavad amiidse lämmastiku regulaarse
kordumise, mis võimaldab analoogset kompleksi vasega, nagu seda täheldasime biureedi puhul.
Võtke katseklaasi 2 ml valgulahust, lisage 1 ml 10%-list NaOH lahust ja segage hästi. Lisage
sellele 1-2 tilka 1%-list CuSO4 lahust. Tekib taas punakasvioletne värvus näitamaks
biureedireaktsiooni
toimumist .
4. PliiatsetaadireaktsioonPliimürgitus on ajaloo eri
aegadel olnud levinud oht. Plii ning ka mitmete teiste
raskemetallide üledooside üheks esmaseks mõjuks organismis on interaktsioon valkude tioolrühmadega (Cys
aminohappe jääk) ning nende valkude normaalse biofunktsiooni nõrgenemine.
Võtke katseklaasi 2 ml valgulahust, lisage 1 ml konts. NaOH lahust ja 1 tilk (
CH3COO )2Pb
lahust. Loksutage ja kuumutage tulel. Sisu värvub aegamööda mustaks (PbS sademe teke).
Katseklaasi ava kohal hoitud punane lakmuspaber muutub siniseks eralduva NH3 tõttu.
5. Ksantoproteiini (Mulderi) reaktsioonSee reaktsioon on spetsiifiline nendele valkudele, milles esinevad benseenituuma sisaldavad
aminohapped (Phe, Tyr, Trp). Kuumutamisel
HNO3 -ga tekivad kollase värvusega aromaatsed
nitroühendid (sellest ka reaktsiooni nimetus -kollane).
O
O
OH
+HNO3
-H O
2
NH2
O
H
Mõõtke katseklaasi 1 ml valgulahust ja lisage tilkhaaval kontsentreeritud HNO3 kuni valge
sademe tekkeni. Keetke ettevaatlikult katseklaasi sisu, katseklaasi pidevalt raputades. Sade
värvub kollaseks ja lahustub osaliselt. Pärast katseklaasi sisu jahtumist leelistage see, lisades
tilkhaaval konts. NaOH lahust kuni kollane värvus muutub oranžiks (nitrotürosiini Na-sool).
6. Ninhüdriinireaktsioon
Ninhüdriinireaktsioon on iseloomulik α-aminorühmale. Positiivse reaktsiooni (sinine või violetne
värvus) annavad kõik α-aminohapped,
peptiidid ja
valgud .
O
O
H
O
OH
COOH
N
OH
-CO -RCHO
2
2
-3H O
H N
2
2
R
O
O
O
violetne
Mõõtke katseklaasi 1ml valgulahust, lisage sellele 5-6 tilka ninhüdriini 0,2%-list alkoholilahust
ja soojendage.
Millist erinevust märkate, kui valgulahuse asemel kasutada aminohappelahust (türosiinilahus)?
7. Hüdroksüülrühmade tõestamine glükoosis
Viia katseklaasi 4 tilka 0,5%-list glükoosilahust ja 6 tilka 2M NaOH. Saadud
segule lisada 6 tilka
0,1 M CuSO4 lahust. Algul tekkiv Cu(OH)2 sade lahustub koheselt, kuna moodustub kompleks
glükoosis olevate hüdroksüülrühmade ja vase vahel, mis viib viimase tagasi lahusesse ja annab
lahusele nõrga sinise värvuse. Saadud lahus säilitada järgmise katse jaoks.
HO
-O
OH -
Cu2+
O
Cu2+
HO
-O
-O
Vask (II) hüdroksiidi taandamine glükoosiga leeliselises keskkonnas
Eelmises katses saadud lahusele lisada vett nii, et vedeliku nivoo kõrgus oleks ca 20 mm.
Kuumutage katseklaasi põletileegil,
hoides seda kaldu nii, et soojeneks ainult lahuse ülemine
osa.
Soojendada ainult keemiseni (mitte
keeta , kuna glükoos taandab vask(II)hüdroksiidi ka ilma
keetmata). Mida märkate? Tähelepanu! Kui redutseerijat on vähe, võib pikemal kuumutamisel
Cu(OH)2-st vee eraldumisel moodustuda CuO must sade mis
segab teiste värvuste nägemist.
2 Cu(OH)2 +
redutseeriv sahhariid Cu2O + 2 H2O + O
punakas sade
Vask (II) hüdroksiidi taandumisel eralduv hapnik oksüdeerib glükoosi. See on küllaltki keerukas
protsess. Oodatud glükoonhappe asemel avastati reaktsiooniproduktides glütseriin -, glükool- ja
sipelghapet. See näitab, et glükoosi oksüdeerumisel leeliselises keskkonnas toimub tema põhjalik
lõhustumine . Fakt, et glükoos leeliselises keskkonnas oksüdeerub nõrkade oksüdantide (Cu(OH)2
või Ag O) toimel juba nõrgal soojendamisel, viitab , et glükoosi lõhustumisega kaas2neb tugevate taandavate omadustega ühendite moodustumine. Sellisteks on näiteks glükool- ja formaldehüüd ,
mis edasisel oksüdeerumisel muutuvad vastavalt glükool- ja sipelghappeks. CHO
COOHCOOHHCOOH sipelghape
H
OH
H
OH
H
OH
COOH
HO
H
O
HO
H
HO
H
O
CH2OH H
OH
H
OH
H
OH
glükoolhape
COOH
H
OH
H
OH
H
OH
CHOH
CH2OH
CH
COOH2OH
CH2OH
D-glükoos
suhkurhape
glükoonhape
(sahharaat)
glütseriinhape
Vask (II) hüdroksiidi taandumist glükoosi toimel vask (I) oksiidiks nimetatakse ka Trommeri
reaktsiooniks ja seda rakendatakse kliinikus glükoosi avastamiseks uriinis. See reaktsioon on
veelgi tundlikum , kui Cu(OH)2 asemel kasutada Fehlingi reaktiivi, mis on Cu(OH)2 ja Seignette’i
soola lahustuv kompleks: H
H
HO
C
COONa
O
C
COONa
Cu2+, OH -
Cu
HO
C
COOK O
C
COOK
H
H
Fehlingi
reaktiiv (tumesinine)
Monosahhariidide tõestamist Fehlingi reaktiivi abil tuntakse Fehlingi reaktsioonina ja
rakendatakse samuti glükoosi avastamiseks uriinis jt. bioloogilistes vedelikes. 8. Hõbeoksiidi ammoniakaalse lahuse taandamine glükoosiga
Viia katseklaasi 2 tilka 0,1 M
AgNO3 . Leelistage lahus, lisades 4 tilka 2 M NaOH. Lisada 4-5
tilka (tilgakaupa) 2 M NH OH kuni tekkiva hõbeoksiidi sademe lahustumiseni.
4
Saadud läbipaistev hõbeoksiidi ammoniakaalne lahus on glükoosi oksüdeerimise
reaktiiviks (”
hõbepeegli reaktsioon”). Reaktsiooni teostamiseks lisada reaktiivile 1 tilk glükoosi
0.5%-list lahust ja soojendada katseklaasi nõrgalt, hoides teda
põleti leegi kohal kuni lahuse
keemiseni. Reaktsioon jätkub ka ilma soojendamiseta ning metalliline
hõbe eraldub kas musta
sademena või läikiva peeglina. Sellest ka ”hõbepeegli” reaktsiooni nimetus. NB! Hõbe eraldub
peeglina kui katseklaasi seinad on puhtad ning sadenemiprotsessi ei häirita näiteks
loksutamisega.
Hõbeoksiidi taandumisel vabaneva hapniku toimel glükoosimolekul oksüdeerub, mis kaasneb
keerukate lõhustumisprotsessidega nagu
näidatud Trommeri reaktsiooni juures.
Hõbeoksiidi
ammoniakaalse lahuse taandamist glükoosiga kasutati vanasti peeglite valmistamisel. s.
a l e
h
a d
u t a v a i l u k e l
mo
si
o o k ü l g u l
maso
e l o
ma
h ü r d ü ü h e d l a b a t i ä n e n
mi
e g l u k i n o o
si t k a e r i l g e e p e b õ h a j e n i m
a d n a a t i d i i s k o r d ü h ) I I ( k s a
V . 8 - 7.
! a n n a i e i n o o
si t k a e
sr
u v r ä v d u t n
m a
h ü r o n i m
a e n r a a i s t r e t a j - e n r a a d n u k e S ! u l
maso
e l o
ma
h ü r o n
mi
a se
r a
ma
i r p se
k a t a r ä
mä
a g i n o o i s t k a e r i n i i r d ü h n i N
. 6
! l u l
maso
e l o a
m
u u t i n e
se
n e b
sü
k o r d ü h d i a v b i k e t
s u v r ä v ž n a r O . i g n i r i n e
se
n e b e n i m i i v
sse
i s
ma
h ü r o r t i n
sa
a a k b o o t se
u v r ä v e n a l l o
K . d i
mas
u u t d i se
t
maa
o r a b e n
si
s e
i d n e h ü
s a k , a d i e l n o k
smär
e e i n o o
si t k a e r i r e d l u
M
. 5
! s u
g l a
v t l u
n i a e t t
mi
, s i d
n e h
s ü
se
i l l i m k i õ k s k ü u l
maso
e l o
ma
h ü r l ü ü r d ü h f l u s k h e - l o o i t b a t i ä n e k e t e l l se a j
…
ö ö u g a n t s u
m n o d i i f l
su
i i l P . 4
! si
k e l p
m
o k se
a n r a s a g ä v d a v a n n a s
mi
, d i
me
e d i s d i i t p e p u j l a p n
s o
e d u k l a v a
K
s) i n o o j . t v ( t e k e t si
k e l p
m
o k se
a v b a d
mal
i õ v e e S . ) ! s k
me
e d
si
d i i t p e p se
k a t a t
me
i n l u h u p e d u k l a v ( t e d
si t se
d i
mi
a 2 n o s u k , i d n e h ü
me
a t i k e t a g e k k e t i d e e r u i B . 3
. d i o n i k e n i l i v r ä v b i k e t a g a , b o a k
s
u s t
maa
o r A . i n o r t k e l e 2 a j t i n o t o o r p 2 st i d n e h ü
s e d a d
mal
e e i l o o i d se
t
maa
o r a b i r e e d ü s k o n o o i a u a
R . d
se
i l i v r ä v n o a j st
u g l a v d a v a l e e n u t t õ t e
se g n i n a g i n o o i s t a g u j n o k - π , π e r u
su
d u t e a k i n e l ü n o d i r u u t k u r st d
se
d i o n i K
. 2
. ) d
n a r r õ v . t v ( a j l ä v st
se
u h a l b e n e d
sa a j i v r ä v i n u u r p n
s o
i m , d i si
k o i d n a g n
ma
b i k e t a n i t k u d o r p e h ü a j s k i l o o i d se
k a t i r e e d ü s k o e d i s k
si
k a k v e n
si
s e
i n i i t n e p r ä T
1.
VALGU KVANTITATIIVNE MÄÄRAMINE LOWRY MEETODIL
Meetodi põhimõte
Lowry meetod on üks enim kasutusel olevaid biokeemilisi
meetodeid valgu üldhulga määramiseks
uuritavas lahuses. Lowry meetod on väga tundlik, sest see põhineb kahe kvantitatiivse
värvusreaktsiooni samaaegsel
kasutamisel . Need on:
1) biureedireaktsioon, mille käigus Cu2+ reageerib aluse juuresolekul peptiidsidemega,
andes sügavsinise värvusega kompleksi;
2) Folin-Ciocalteau reaktsioon, kus anorgaaniliste soolade kompleks-segu reageerib türosiini-
ja trüptofaani-jääkidega andes intensiivse
sinakas -rohelise värvusega kompleksi.
Kahe reaktsiooni samaaegne kasutamine tõstab meetodi tundlikkust võrreldes üksikute nimetatud
reaktsioonidega.
Lowry meetod pole aga kahjuks probleemivaba. Antud meetod on väga tundlik kõrvalistele
värvusreaktsioonidele, mida põhjustavad lisandid, mis võivad sisalduda uuritavas proovis.
Kliiniline tähtsus
Üldvalgu hulga vähenemist veres täheldatakse mitmete patofüsioloogiliste
seisundite puhul nagu
alatoitlus (toiduga saadakse valke ebapiisavalt), aminohapete alaabsorptsioon
peensooles (steatorröa
ehk
rasv väljaheites), renaalne proteinuuria (albumiini oluline väljutamine uriiniga, näit. teatud
nefriitide korral), valgusünteesi langus
maksas (maksatsirroosi puhul), suurenenud valgu katabolism
(kõrge palaviku korral) jt. Suurenenud üldvalgu sisaldust on täheldatud krooniliste
infektsioonide (tuberkuloos, äge bakteriaalne
endokardiit jt), reumatoidartriidi, müelomatoosi jt korral.
Üldvalgu normiväärtused vereseerumis 63-85 g/l
Töö eesmärk
Tavaliselt koosneb kvantitatiivne analüüs, sõltumata määratavast komponendist ja kasutatavast
meetodist, kahest etapist: standardlahuse valmistamisest ja standardgraafiku konstrueerimisest.
Kindla
kontsentratsiooniga lahust nimetatakse standardlahuseks. Standardlahuse lahjendamisel
saadakse rida teatud kontsentratsiooniga lahuseid. Selles töös mõõdetakse lahjendusterea lahuste
ekstinktsioonid, konstrueeritakse standardgraafik ja selle abil leitakse valgu kontsentratsioon
uuritavas lahuses.
Töövahendid
•
Statiiv ja plastviaalid
•
klaasviaal reaktiiv C valmistamiseks
•
automaatpipetid
•
mikser •
spektrofotomeeter
Uuritav lahus: Tundmatu kontsentratsiooniga valgulahus
Standardlahus ja kasutatavad
reaktiivid 1. Valgu standardlahus:
albumiinilahus , milles üldvalgu kontsentratsioon on 320 µg/ml (lahus
on valmis).
2. Reaktiiv A: 2% Na2CO3 lahus 0,1 M NaOH-s (lahus on valmis).
3. Reaktiiv B: 0,5% CuSO4 . 5 H2O lahus 1% K-tsitraadis (lahus on valmis)
4. Folin-Ciocalteau reaktiiv
Üliõpilasel valmistada
5. Reaktiiv C: Reaktiiv C on ebapüsiv, seetõttu tuleb ta valmistada ex tempore. Segage reaktiivid
A ja B vahekorras 50:1. Selle katse tarvis tuleks valmistada vähemalt 10 ml reaktiivi C.
TÖÖ KÄIK
Valgulahuse lahjendusterea valmistamine standardlahusest (üldvalgu kontsentratsioon on 320
µg/ml):
võtke 4 viaali, nummerdage need ja pipeteerige igasse neist 1 ml destilleeritud vett;
lisage 1. viaali 1 ml standardlahust ja segage hoolikalt mikseril;
võtke 1. viaalist 1 ml lahust ja viige 2. viaali. Segage hoolikalt viaali sisu;
võtke 2. viaalist 1 ml lahust, viige see 3. viaali ja segage viaali sisu hoolikalt;
võtke 3. viaalist 1 ml lahust, viige see 4. viaali ja segage hoolikalt.
Nii saitegi valgulahuse lahjenduste rea 1:2, 1:4, 1:8 ja 1:16.
Standardgraafiku konstrueerimine ja valgu kontsentratsiooni määramine
1) Võtke 6 viaali, nummerdage need ja pipeteerige
lahused ,
järgides alltoodud skeemi:
Lahused, reaktiivid
Viaalid
(pipeteeritava lahuse ruumala, ml)
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Lahjendus 1:2
0,3
-
-
-
-
-
Lahjendus 1:4
-
0,3
-
-
-
-
Lahjendus 1:8
-
-
0,3
-
-
-
Lahjendus 1:16
-
-
-
0,3
-
-
Uuritav lahus
-
-
-
-
0,3
-
Destilleritud vesi (kontroll-lahus)
-
-
-
-
-
0,3
Reaktiiv C (lisage minutiliste vahe-
aegadega, aeg fikseerige 1. lisamise
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
järel; segage hoolikalt)
Folin-Ciocalteau reaktiiv (täpselt
10 minuti pärast lisage minutiliste
0,1
0,1
0,1
0,1
0,1
0,1
vaheaegadega; segage hoolikalt)
Pärast 20 minuti möödumist Folin-Ciocalteau reaktiivi lisamisest mõõtke minutiliste vaheaegadega
lahuste ekstinktsioon lainepikkusel 750 nm (küvett läbimõõduga 10 mm, ruumalaga 1,5 ml).
Spektrofotomeeter nullistage destilleeritud veega.
Arvutused
Mõõdetud ekstinktsioonide väärtustest lahutage kontroll-lahuse ekstinktsiooni väärtus. Arvutage
valgu kontsentratsioonid lahjendusterea lahustes ja konstrueerige standardgraafik lahuse
ekstinktsiooni
sõltuvuse
kohta
valgulahuse
kontsentratsioonist
(abstsisstelg
–
valgu
kontsentratsioon, ordinaattelg – ekstinktsioon). Kasutades koostatud
graafikut leidke valgu
kontsentratsioon (µg/ml) uuritavas lahuses.
Märkused:
1)
Kui uuritavas lahuses on valgu kontsentratsioon madal, segatakse reaktiivid A ja B vahekorras 10:1.
2)
Rida ühendeid segavad seda meetodit, Segava mõju vältimiseks tuleks nende kontsentratsioone
vähendada alltoodud piirideni:
Karbamiid -0,5%, ZnSO4-0,1%, triklooräädikhape-0,5%, (NH4)
2SO4 -0,2%, atsetoon- 0,5%, Ba(OH)2-
0,5%,
sahharoos -3,5%, Na2SO4-1,0%, etanool-5,0%, NaNO3-1,0%, guanidiin-0,5%, eeter-5%.
Document Outline
- Eelraamat 2018-1
- Prax tekst parandatud koos NO2
(meditsiiniliselt tähtsamad ülesanded). Inimorganismi metabolism (biokemism ja kliinilised
aspektid). B
Kõik kommentaarid