MLB 6001 Üldbioloogia 1
Ettevalmistus üldbioloogia eksamiks Aine kood: MLB 6001
Ainepunkte: 3 AP
Õppejõud: lekt Tõnu
Ploompuu Eksam: 25.01.2005
Kell: 11.00
Aud: ?
1. Mitmekesine ja ühtlane elu Bioloogia – teadus, mis tegeleb eluga.
Elu määratlemine on võimalik vaid mitme tunnuse koosesinemise kaudu.
Biomolekul – ained, mis väljaspool organismi ei moodustu, nt
sahhariidid ,
lipiidid ,
valgud ,
nukleiinhaooed ,
vitamiinid jt. On keerilise ehitusega.
Elusorganismi tunnused:
1)
Toimub aine ja energia vahetus (
elusorganism on avatud süsteem, vajab
keskkonda).
2)
Paljuneb – paljunemine on omasuguste taastootmine.
•
Suguline paljunemine, nt
hulkraksed organismid,
•
Mittesuguline paljunemine – nt osad taimed – vegetatiivselt, eostega või
üherakulised –
poolduvad .
Keemiline paljunemine – olemasoleva kopeerimine
Bioloogiline paljunemine – alguses teistsugune järglane, hiljem sarnane
3)
Arenemine – elusorganismid muutuvad.
4)
Reageerinime ärritusele. 5)
Sisekeskkonna stabiilsus ehk homöostaas. 6)
Rakuline ehitus Rakulise ehituse ajalugu:
• 1665.a ehitas Robert Hook esimene mikroskoobi ning kirjeldas siis korgi
rakke.
• Neben Kuhle ??? seostab rakku bioloogiaga.
Rakk – üks võimalik elu
näitaja.
• Schleiden Schwan – kõik elusorganismid koosnevad rakkudest.
• Konstrueeritakse esimene elektronmikorskoop.
Elu omadused: 1)
Elu on pidev – eluprotsessid võivad olla peatunud, kuid peatumine on väga
täpne. Elu tekkis ca 4 miljardit aastat tagasi. DNA hoiab elu pidevana.
MLB 6001 Üldbioloogia 2
2)
Elul on palju organiseerumistasemeid – kõrgem tasand sisaldab madalamaid,
kuid igal tasandil on uus võimalus, mitte madalamate tasandite summa.
3)
Elustruktuuride ülesanded on tihedalt seotud – evolutsioon – elu püsivuse
tuum. Elu lõppeks ilma evolutsioonita, st ressursid lõpeksid.
Evolutsioon – geneetiline varieerumine, pärilikkus põlvkondade vahel, looduslik
valik.
2. Elu organiseerumise tasemed
1)
Aatom – sellel tasemel elu tunnused puuduvad.
2)
Molekulaarne tasand – esmane organiseerituse tase. Molekulaarbioloogia
- palju ühist füüsika ja keemiaga.
3)
Makromolekul – biomolekulid.
4)
Organell – tuum,
ribosoomid ,
mitokondrid . Moodustuvad üksnes
rakkudes ja iseseisvalt elu ei kanna, kuid koostöös annavad elu talitluse
küll.
5)
Rakk – ilmnevad kõik elu omadused. Tsütoloogia.
6)
Kude – sarnase ehitusega ja talitlusega
rakud koos vaheainega. Koe ehitust
uurib
histoloogia . Nt nutthallitusseeneniidi rakkudel puuduvad raku
vaheseinad.
7)
Organid ehk elundid – koed on koondunud organitesse ehk elunditesse, st
organ on kudede kogum, mis täidab mingit kindlat funktsiooni, nt süda,
juur , vars, leht, õis. Organitega tegeleb eelkõige
meditsiin , nt südant uurib
kardioloogia.
8)
Elundkond ehk organsüsteem– organid koonduvad elundkonda ühise
talituse alusel. Taimedel need puuduvad. Nt seedeelundkonda kuulub suu,
neel , söögitoru,
magu , peen- ja jämesool.
9)
Organism – organismist eraldatuna ei suuda ükski kude, organ või
organisüsteem täita talle
omaseid ülesandeid. Üherakuliste organismide
puhul raku ja prganismi tase kattuvad.Täiendavad elutegevuse iseärasused
ilmnevad seetõttu alles hulkraksetel. Füsioloogia – teadusharu, mis
käsitleb organismi talitlusi ja nende regulatsiooni. Tihedas seoses
organismi ehituse uurimisega ehk anatoomiaga.
Geneetika jt teadusharud.
10)
Koloonia – pered,
parved või
karjad . Nt ühes tarus elavad
mesilased või
ühe pesa
sipelgad . Kolooniast eraldatuna isendid hukkuvad.
11)
Populatsioon – ühel asustusalal elavad sama liiki organismid. Seega
jaguneb liik populatsioonideks. Nt ühes
tiigis elavad
karpkalad on üks
populatsioon . Üheks elu avalduseks, mis avaldub ainult populasioonis on
suguline paljunemine.
12)
Liik – populatsioonidest koosnev organiseerituse tase. Üheks liigiks on nt
mesilased, kitsed jne. Loomade käitumist
uuriv teadusharu nimetatakse
etoloogiaks. Iga liigi organismidel on iseloomuli sise- ja välisehitus,
talitluste eripära, kromosoomides paiknev spetsiifiline geenide kogum ja
kindlad nõudlused elukeskkonnale.
MLB 6001 Üldbioloogia 3
13)
Kooslus ehk ökosüsteem – erinevad liigid ühel alal. St ühisel erritooriumil
omavahel toitumissuhetes olevad organismid moodustavad koos
ümbritseva eluta keskkonnaga ökosüsteemi. Nt oja, jõgi, tiik, järv.
Ökosüsteem on isereguleeriv süsteem, millesse kuuluvate populatsioonide
koosseis ja arvukus säilib pikema aja jooksul stabiilsena. Selle tasandiga
tegeleb ökoloogia.
14)
Ökosüsteem – kõige suurem ökosüsteem. Hõlmab kogu Maad ümbritsevat
elu sisaldavat kihti. Biosfäär on kõige kõrgem elulooduse organiseerituse
tase.
Neuraalne regulatsioon – elunkondade talituse kooskõlastamine närvisüsteemi
abil.
Humoraalne regulatsioon – elundkondade talituse kooskõlastamine käib veres
esinevate hormoonide ja teiste keemiliste ühendite vahendusel.
3. Elus ja eluta loodus
Elus ja eluta loodus koosnevad anorgaanilistest ja orgaanilistest ainetest. Eluta
looduses esinevad peamiselt anorgaanilised ühendid. Orgaanilised ühendid on
iseloomulikud elusloodusele, sest valdav osa neist moodustub organismide elutegevuse
käigus.
Iga organismi ehituses leiame nii anorgaanilisi kui ka orgaanilisi aineid, mis
koosnevad mitmesugustest keemilistest elementidest.
Organismides leiduvad peaaegu kõik keemilised elemendid, mis eluta looduseski.
Erinevate rakkude keemiliste elementide sisaldus on üldiselt ühesugune.
Makroelemendid – O, C, H, N, P ja S. Nad moodustavad üle 98 % raku keemiliste
elementide kogumassist. Organismid vajavad neid kõiki suhteliselt suurtes
kogustes .
Mikroelemendid – K, Cl, Ca, Na, Mg, Fe, Zn,Cu, I, F jt. Kokku on organismides
avastatud 16 sellist keemilist elementi, mis esinevad küll väga väikestes kogustes, kuid
on siiski hädavajalikud enamiku organismide normaalseks elutegevuseks.
• O 65-75 %
• C 15-18 %
• H 8-10 %
• N 1,5-3,0 %
• P 0,2-1,0 %
• S 0,15-0,2 %
Organismides on kõige enam anorgaanilisi aineid. Nende sisaldus on enamasti üle 80
%.
Anorgaaniliste ainete põhiosa moodustab vesi. Enamiku organismide veesisaldus
jääb vahemikku 70-95%, kuid näiteks mõnede meduuside rakkudes on vett 98 %.
Orgaanilistest ainetest on rakkudes kõige rohkem valke. Ilmselt on põhjus selles,
et neil on rakus täita palju ülesandeid. Valkude kõrval on enim
esindatud lipiidid (
rasvad ,
õlid, vahad) ja
sahhariidid (glükoos, tärklis,
tselluloos ). Need ühendid kuuluvad mitmete
rakustruktuuride koostisse ja on ka organismi põhilisteks energiaallikateks.
MLB 6001 Üldbioloogia 4
4. Elule vajalikud lihtsamad molekulid
Anorgaanilised ained
Vesi
Organismide peamiseks koostisosaks on vesi. Tal on mitmeid häid omadusi:
• Vesi on hea lahusti – enamik aineid on organismis lahustunud olekus.
• Vee molekulid osalevad paljudes rakus toimuvates keemilistes reaktsioonides
– nad esinevad nii lähteainete kui ka lõpp-produktide hulgas.
• Veel on suur
soojusmahtuvus – soojeneb ja jahtub aeglasemalt võrreldes
enamiku teiste looduses esinevate vedelate ja tahkete ainetega – aitab säilitada
organismisisest püsivat temperatuuri.
Vee omadused tulenevad H2O molekuli ehituslikest iseärasustest. H ja O aatomite
elektronegatiivsuste erinevus on suur ning seetõttu vee
molekul on dipoolne. Polaarse
lahustina
lahustab vesi hästi anorgaanilisi aineid ja paljusid orgaanilisi polaarseid
ühendeid. Mittepolaarsed ained, nt õlid ja rasvad, lahustuvad veel vähesel määral.
Katioonid
Positiivselt laetod ioonidest ehk
katioonidest on organismis olulisel kohal H+, NH +4 , K+, Na+, Ca2+, Mg2+, Fe2+ ja Fe3+. Kaalium ja naatriumioonid osalevad närviimpulsi moodustumises, neid leidub veres
ja kõigi rakkude tsütoplasmas. Valkude ja teiste lämmastikku sisaldavate ühendite
lagundamise käigus eraldub
ammoniaak (vesilahus), mis rakus teiseneb
ammooniumiooniks (NH +
4 ).
Kaltsiumsoolad annavad
luudele tugevuse ja seetõttu on Ca aatomeid luukoe
koostises. Suur osa magneesiumi aatomitest on rakkudes seotud nukleiinhapetega: DNA
ja RNA-ga. Taimedes kuulub
magneesium rohelise
pigmendi klorofülli koostisse.
Raua
aatomid esinevad punaliblede ehk erütrotsüütide valgu hemoglobiini koostises.
Anioonid
Negatiivselt laetud ioonidest ehk
anioonidest on olulised hüdroksüül- (OH-), karbonaat- (HCO -2--2-3 , CO3 ), fosfaat - (H2PO4 , HPO4 ), kloriid - (Cl-) ja jodiidioonid (I-). Hingamise käigus koguneb rakkudesse süsihappegaas. See lahustub vees ja
tulemusena moodustuvad karbonaatioonid (HCO -
2-
3 ja CO3 ). Inimesel
kanduvad need
rakke ümbritsevasse koevedelikku ja edasi
vereringe kaudu kopsudesse, kus organism
süsihappegaasist vabaneb.
Fosfaatrühmad (H
2-
2PO4 ja HPO4 ) on kõigi nukleiinhapete ja fosfolipiidide põhilised
koostisosad. Seejuures kuuluvad
fosfolipiidid rakumembraani ehitusse. Joodi on vaja
kilpnäärmehormoonide sünteesiks.
MLB 6001 Üldbioloogia 5
Inimene saab organismile vajalikud anorgaanilised ühendid peamiselt igapäevase
toiduga. Suur osa
sooli omandatakse joogveest.
Orgaanilised ained
Valdav osa orgaanilisi aineid koosneb süsinikust, vesinikust ja hapnikust. Nende
kõrval on
enamlevinud N, S ja P. Seega leiduvad orgaaniliste ühendite koostises kõik
makroelemendid.
Organismide koostisse kuuluvateks põhilisteks orgaanilisteks
aineteks on:
• sahhariidid,
• lipiidid,
• valgud,
•
nukleiinhapped .
Neid nimetatakse ka biomolekulideks. Nad kuuluvad rakkude ehitusse, reguleerivad
rakkude talitlust ja omavahelist koostööd ning osalevad organismi aine- ja
informatsioonivahetuses ümbritseva keskkonnaga.
Biomolekulide all mõistetakse orgaanilisi ühendeid, mis moodustuvad organismide
elutegevuse tulemusena. Peale eelnimetatute kuuluva biomolekulide hulka mitmed
madalmolekulaarsed ained (
aminohapped ,
nukleotiidid , vitamiinid jt).
Bioaktiivsed ained – orgaaniliste ühendite eri klassidesse kuuluvad ühendid, mis
juba väikeste kontsentratsioonides mõjutavad organismide ainevahetust ning reguleerivad
nende elutalitlusi.
Põhilisteks bioaktiivseteks aineteks on ensüümid, vitamiinid ja
hormoonid. Enamik neist kuulub valkude ja lipiidide hulka, kuid bioaktiivse toimega on
veel mitmed teised orgaanilised ühendid – nt
antibiootikumid ja paljud mürkained.
5. Elu makromolekulid Sahhariidid
Sahhariidid ehk süsivesikud on orgaanilised ühendid, mille koostises esinevad
süsinik,
vesinik ja hapnik. Neid on kolme tüüpi:
1)
monosahhariidid ,
2)
oligosahhariidid ,
3) polüsahhariidid.
Mono - ja oligosahhariidid on magusamaitselised, nimetatakse ka suhkruteks.
Monosahhariidid ehk lihtsuhkrud on madalmolekulaarsed orgaanilised ühendid,
milles süsiniku aatomite arv on enamasti kolmest kuueni. Viiesüsinikulistest
monosahhariididest on olulisimad
riboos ja
desoksüriboos. Need kuuluvad
nukleiinhapete koostisse. Riboosijäägid erinevad RNA-s ja desoksüriboosijäägid
esinevad DNA-s.
MLB 6001 Üldbioloogia 6
Kuuesüsinikulistest
suhkrutest on looduses olulise tähtsusega
glükoos ehk
viinamarjasuhkur ja
fruktoos ehk puuviljasuhkur. Mõlemad on organismide põhiliste
energiaallikate hulka.
Oligosahhariidid on madalmolekulaarsed orgaanilised ühendid, mis organismides on
valdavalt moodustunud kahe-kolme monosahhariidi omavahelisel ühinemisel. Nt
glükoosi ja fruktoosi omavahelisel liitumisel saame
sahharoosi, mis on roo- ja
peedisuhkru peamine
koostisosa . Linnasesuhkur ehk
maltoos koosneb aga kahest
glükoosijäägist. Piimas sisalduv oligosahhariid
laktoos ehk
piimasuhkur on samuti
disahhariid , mille molekul koosneb glükoosist ja galaktoosist. Organismis
energiaallikana.
Polüsahhariidid on kõrgmolekulaarsed orgaanilised ühendid (polümeerid), mille
ehituslikeks lülideks (monomeerideks) on monosahhariidid. Põhilised looduslikud
polüsahhariidid on tärklis, tselluloos ja glükogeen.
Tärklis – fotosünteesi tulemusena moodustunud glükoosivarud, mida
talletatakse taimede säilitusorganites (mugulas, sibulas, risoomis). Keskmine
molekulmass on
1 000 000. Tärklise molekulid sisaldavad
erineval arvul monomeere. Kui fotosüntees
pidurdub või lakkab, siis kasutavad taimed tärklist energia saamiseks. Selleks lagundavad
nad tärklise uuesti glükoosi molekulideks.
Tselluloos – võib moodustada kuni poole
puitunud varrega taimede massist,
rakukesta peamine koostisosa.
Glükogeen –
loomorganismides säilitatakse glükoosivarusid peamiselt
maksas ja
lihases loomse tärklisena.
Sahhariididel on kaks põhilist ülesannet: energeetiline ja ehituslik.
Lipiidid
Lipiidid on orgaaniliste ühendite klass, kuhu kuuluvad rasvad, õlid, vahad, steroidid jt
vees enamasti
mittelahustuvad ühendid. Nad lahustuvad aga mitmetes orgaanilistes
lahustites (alkoholis ja eetris).
Lipiidid on organismide energiaallikas. Nende oksüdeerumisel vabaneb kaks korda
rohkem energiat kui sama koguse sahhariidide või valkude lagundamisel.
Lipiidide ülesanne on olla energiaallikaks ja kaitse eesmärk (kaitseb, pehmendab lööke vastu elundeid). Lipiidideks ehk rasvadeks nimetatakse propaantriooli ja rasvhapete estreid.
Lihtlipiidide ühinemisel teiste keemiliste ühenditega moodustuvad
liitlipiidid.
Näiteks kuuluvad rakumembraani koostisse
fosfolipiidid.
Steroidid on madalmolekulaarsed tsüklilised ühendid, mis vees peaaegu ei lahustu.
Steroidide hulka kuuluvad
kolesterool ja mitmed hormoonid (nt suguhormoonid ja
neerupealise hormoonid), aga ka
vitamiin D (kaltsiferool).
Hormoonid on bioaktiivsed ained, mis põhiliselt moodustuvad loomorganismide
sisesekretsiooninäärmetes.
MLB 6001 Üldbioloogia 7
Valgud
Valgud ( proteiinid ) on aminohapetest moodustunud polümeerid. Nende
molekulmass varieerub väga suurtes vahemikes, sest eri valkude koostisse kuuluvate
aminohappejääkide arv algab mõnekümnest ja võib ulatuda tuhandetesse.
Aminohappeid on kokku 20, kuid harva on need kõik ühes valgus koos. Valgud moodustuvad vaid
elusorganismides. Seetõttu nimetatakse neid koos polüsahhariidide ja nukleiinhapetega
biopolümeerideks. Aminohapete omadused:
• kõigi aminohapete koostisse kuuluvad aluseliste omadustega
aminorühm (-NH2) ja happeliste omadustega
karboksüülrühm (-COOH). Molekuli
ülejäänud osa tähistatakse R-ga (R varieerub).
• Aminohapped omavahel üldjuhul ei reageeri.
• Aminohappeid sünteesitakse raku tsütoplasmas paiknevates ribosoomides.
• Aminohappe omavahelisel reageerimisel moodustub ribosoomis nende vahele
kovalentne side, mida nimetatakse
peptiidsidemeks. Nii ühendatakse sadu või
tuhandeid aminohappejääke.
• Valdav osa valke koosneb ühest, kuid osalt ka kahest või enamast
ahelast .
• Valgud omavad mitmesuguseid ruumilisi struktuure.
Aminohape Lühend
Aminohape Lühend
Alaniin Ala
Leutsiin Leu
Arginiin Arg
Lüsiin Lys
Asparagiin Asn
Merioniin Met
Asparagiinhape Asp
Proliin Pro
Fenüülalaniin Phe
Seriin Ser
Glutamiin Gln
Treoniin Thr
Glutamiinhape Glu
Trüptofaan
Thp
Histidiin His
Türosiin Tyr
Isoleutsiin Ile
Valiin Val
Glütsiin Gly
Tsüsteiin Cys
Valgu molekulide struktuur
Valkude omadused tulenevad molekuli koostisse kuuluvate aminohappejääkide
järjestusest ja nende hulgast.
Esimest järku struktuur ehk primaarstruktuur – aminohapete järjestus. Annab
üksnes ülevaate, kui palju aminohappejääke ja millises järjestuses on polüpeptiidahelasse
lülitunud.
Teist järku struktuur ehk sekundaarstruktuur – tekib polüpeptiidi keerdumisel
kruvikujuliseks
heeliksiks või kõrvuti asetsevate
ahelate voltumisel. Moodustunud
MLB 6001 Üldbioloogia 8
struktuuri hoiavad koos vesiniksidemed. Nt: sekundaarstruktuur on juuste, küünte
valkude ja ämbliku niidi ning
siidi koostises olevate valkude lõplikuks tasemeteks.
Kolmandat järku struktuur ehk tertsiaalstruktuur – molekuli edasine
kokkukeerdumine. Enamasti on see
keraja kujuline ja kannab seetõttu
gloobuli nimetust .
Valgu kolmandat järku struktuuri stabiliseerivad mitmesugused keemilised sidemed, mis
moodustuvad molekuli eri osades paiknevate aminohappejääkide vahele.
Neljandat järku struktuur ehk kvaternaarne struktuur – kui omavahel ühinevad
kaks või
enamat polüpeptiidi.
Valgud võivad ühineda ka teiste orgaaniliste ainetega.
Nukleoproteiin – valgu
kompleks nukleiinhappega .
Lipiididega
seostunud valke nimetatakse lipoproteiinideks. Need kuuluvad
rakumembraani koostisse. Membraanis esineb ka valke, millega on liitunud
oligosahhariidid. Selliseid ühendeid nimetatakse glükoproteiiniks.
Denaturatsioon – kui valk kaotab
esmalt kolmandat järku struktuuri ja seejärel
teistjärku struktuuri. Denaturatsiooni pähjustavad:
• kõrge temperatuur,
• mehhaanilised tegurid (munavalge
vahustamine ),
•
happed (eriti kontsentreeritud),
•
raskmetallid (nt elavhõbe, plii),
• ioniseeriv (
gamma , alfa, beeta, röntgen) ja UV kiirgus
• jne.
Denaturatsioonil hävivad üksnes valgu kõrgemat järku
struktuurid , kuid
peptiidsidemed ei katke. Organismis lagundatakse valgu molekulid aminohapeteks
vastavate ensüümide toimel.
Renaturatsioon – denaturatsiooni pöördprotsess, kus denatureeriva teguri lakates
võib valgu
sekundaar - ja tertsiaalstruktuur
taastuda . Renaturatsioon toimub enamasti vaid
siis, kui denatureeruvate tegurite mõju pole olnud liiga suur ja valgu struktuurid ei ole
veel lõplikult lagunenud.
Valgu ülesanded
1) Ensüümaatililne funktsioon – valdav osa organismides toimuvadid keemilisi
reaktsioone ei kulge iseeneslikult: neid on vaja kas kiirendada või aeglustada.
Biokeemiliste reaktsioonide kiirust reguleerivad valgud, mida nimetatakse
ensüümideks.
Bioaktiivne aine.
MLB 6001 Üldbioloogia 9
Mõnede ensüümide aktiveerimiseks on vaja vitamiine.
Vitamiinid on bioaktiivsed
madalmolekulaarsed orgaanilised ained. Taimed sünteesivad neid ise,
loomorganismid saavad aga vitamiine põhiliselt toiduga.
2) Ehituslik funktsioon – ainult valgulise ehitusega on
nahatekised : karvad, suled,
küünised, sõrad, kabjad.
3) Transportfunktsioon – rakumembraani koostises esinevad
transportvalgud ,
mis juhivad kindlat tüüpi molekule nii rakku sisse kui ka sealt välja.
Hemoglobiin O ja
CO2 transportimiseks.
4) Retseptorfunktsioon – rakumembraanis esineb mõningaid valke, mis edastavad
väliskeskkonnainfot raku sisemusse.
5) Regulatoorne funktsioon – seda täidavad mitmed
valgulised hormoonid.
6) Katisefunktsioonid – kõrgematesse loomorganismidesse, sh ka inimorganismi
sattunud võõrvalkude, -nukleiinhapete jt organismile mitteomaste orgaaniliste ühendite
vastu moodustuvad veres
antikehad .
Antikehadele on iseloomulik kõrge
spetsiifilisuse aste. See väljendub selles, et iga
antikeha seostub ainult seda tüüpi molekulidega, mille vastu ta on sünteesitud. Antikehad
moodustuvad vere leukotsüütide hulka kuuluvates lümfotsüütides. Organismi sattunud
võõraineid, mis tingivad antikehade tekke, nimetatakse
antigeenideks. Nendeks on
organismile võõrad valgud, nukeliinhapped jt.
HIV toimel lakkab inimese vererakkudes (lümfotsüütides) antikehade teke.
Liikumisfunktsioon – valgud on võimelised
muutma oma struktuuri ja sellega
kaasneb molekuli mõõtmete muutumine. Teolisi valke nimetatakse
kontraktsioonivalkudeks. Neist kõige tuntumad on lihasvalgud.
8) Energeetiline funktsioon.
Organism peab tagama valgu molekulide kaitse nii väliste kui siseste mõjutuste eest.
See
saavutatakse eelkõige molekuli esimest järku struktuuri püsivusega:
aminohappejääke ühendav peptiidside on küllaltki stabiilne.
Valgu teist ja kolmandat järku struktuure kooshoidvad keemilised sidemed on üsna
nõrgad ning need tekivad ja
katkevad juba väikeste rakusiseste tingimuste muutuste
käigus.
Kõige ilmekamalt avaldub struktuurimuutuste tähtsus liikumisfunktsiooni näitel.
Lihasraku ehituses olevad valgud (müofibrillid) muudavad välismõjutuste tagajärjel oma
mõõtmeid ja selle tulemusena lihasrakk kas lüheneb või pikeneb.
Nukleiinhapped MLB 6001 Üldbioloogia 10
Nukleiinhapped on biopolümeerid, mille monomeerideks on nukleotiidid. Eristatakse kahte tüüpi nukleiinhappeid: desoksüribonukleiinhape (DNA) ja
ribonukleiinhape (RNA). Vastavalt sellele on ka kahesuguseid monomeere – DNA
ehituses on desoksüribonukleotiidid ja RNA koostises
ribonukleotiidid .
DNA
Desoksüribonukleiinhape ehk DNA on biopolümeer, mille monomeerideks on desoksüribonukleotiidid. DNA molekulid võivad olla eri pikkusega, neist suurimates on
reastunud sadu
miljoneid nukleotiide .
Molekulide omadused sõltuvad monomeeride järjestusest ja hulgast. DNA koostises
on neli erinevat nukleotiidi:
adenosiinfosfaat , guanosiinfosfaat, tsütidiinfosfaat ja
tümidiinfosfaat.
Desoksüribonukleotiid on keeruka struktuuriga ühend, mis on
moodustunud kolme molekuli – lämmastikaluse, desoksüriboosi ja fosfaatrühma –
liitumisel. Et fosfaatrühm ja desoksüriboosijääk on kõigis neljas nukleotiidis ühesugused, siis
tulenevad monomeeride erinevused üksnes nende ehitusse kuuluvast lämmastikalusest.
Iga desoksüribonukleotiidi koostises esineb üks neljast lämmastikalusest:
adeniin (A),
guaniin (G), tümiin (T) või tsütosiin (C). Need on tsüklilised keemilised ühendid, mille
molekulide ehituses on peale süsiniku, vesiniku ja hapniku ka lämmastik.
DNA struktuur
Nukleotiidide omavahelisel liitumisel tekib DNA üksikahel. Kuid
desoksüribonukleiinhappe molekul koosneb kahest omavahel ühinenud ahelast. Nende
koospüsimise aluseks on
komplementaarsusprintsiip – nukleotiidide üksteisele
vastavus. Kui DNA ühes ahelas paikneb A, siis teises ahelas on selle vastas alati T ning G
vastas C. Seejuures moodustub A ja T vahele kaks ningG ja C vahele kolm vesiniksidet.
Nukleotiidide järjestust molekulis nimetatakse DNA esimest järku struktuuriks. Seda võib esitada kas ühe või mõlema ahela monomeeride järjestusena.
Teist järku struktuur ehk sekundaarstruktuur – vesiniksidemetega ühendatud
kaheahelaline DNA keerdub kruvikujuliselt
biheeliksisse.
Kolmandat järku struktuur ehk tertsiaalne struktuur – võib DNA molekul olla
küllalt eriilmeline ja see moodustub koos
molekuliga seostunud valkudega.
DNA ülesanded
Desoksüribonukleiinhape on kromosoomide põhiline koostisosa. Päristuumsete
organismide peaaegu rakkudes on
rakutuum – selles paiknevadki
kromosoomid . Suurem
osa rakus leiduvatest DNA molekulidest ongi
rakutuumas . Vähemal määral esineb neid
kahes rakuorganellis – kloroplastis ja mitokondris.
DNA põhiülesanne on päriliku informatsiooni säilitamine. Rakutuumast saadava info
põhjal reguleeritakse raku kõiki elutalitlusi. Kui rakud jagunevad, siis peavad
moodustunud tütarrakud saama samasuguse päriliku info, kui lähterakus. Seetõttu toimub
enne jagunemist DNA kahekordistamine.
MLB 6001 Üldbioloogia 11
DNA ei ole pärilikkuse
kandjaks mitte üksnes päristuumsetes organismides. Kuigi
bakterites rakutuum puudub, on neis igaühes üks rõngaskromosoom. Viirused pole küll
iseseisvalt elavad ja paljunevad organismid, kuid ka igas viiruseosakeses on pärilikkuse
kandja – DNA või RNA.
DNA tähtsus seisneb päriliku info säilitamises ja selle täpses ülekandmises raku jagunemise käigus moodustuvatele tütarrakkudele. Kogu pärilik info paikneb üksnes DNA molekulides. Seetõttu on oluline, et ta
säilitaks oma nukleotiidse järjestuse sõltumata rakusiseste või –välistingimuste
muutustest. Päristuumsete organismide kromosoomid paiknevad rakutuumas ja seda
ümbritsevad membraanid
kaitsevad DNA-d.
Seejuures kaheahelaline biheeliks on
paljude füüsikaliste ja keemiliste tegurite suhtes ka ise küllalti vastupidav. Ehkki üksiku vesiniksidemeenergia on suhteliselt väike, võib neid ühes DNA molekulis olla
miljoneid. See muudabki biheeliksi äärmiselt stabiilseks.
Biheeliksi kaheahelalisus tagab kogu päriliku info esinemise vähemalt kahes koopias. Üks DNA ahel on teise ahela „pöördpilt”. See tuleneb
komplementaarsusprintsiibist. Kui ühes ahelas tekib ebasoovitav muutus, siis teise ahela
nukleotiidne järjestus võib säilida ning selle alusel saavad rakus esinevad ensüümid vea
ära parandada.
DNA molkuli biheeliksi kujuline struktuur on oluline ka pärilikkuse avaldumise
seisukohalt.
RNA
Ribonukleiinhape on biopolümeer, mille monomeerideks on ribonukleitiidid. Ribonukleotiidid koosnevad lämmastikalusest, riboosist ja fosfaadist. RNA kolm
lämmastikalust on samad, mis DNA koostises, kuid tümiini asemel on
uratsiil (U)
nukleotiidi nimetusega uridiinfosfaat.
Monomeeride ühinemisel tekibRNA molekul, mis koosneb ühest ahelast. RNA
molekulide omadused tulenevad monomeeride järjestusest ja hulgast molekulis.
Primaarstruktuur – nukleotiidide järjestus.
RNA osaleb pärilikkuse avaldumises . Erinevad RNA molekulid taganav geneetilise
info realiseerumise. Enamiku rakus leiduvast RNA-st võime jaotada molekulide
funktsioonide alusel kolmeks:
1) informatsiooni-RNA (mRNA),
2) transport-RNA (tRNA)
3) ribosoomi-RNA (rRNA).
mRNA toob geneetilise info rakutuumas asuvatest kromosoomidest valgusünteesi
toimumise paika – tsütoplasmas olevatesse ribosoomidesse.
tRNA ülesandeks on mRNA molekuliga ribosoomidesse saabunud geneetilise info
lahtmõtestamine. Vastavalt sellele toovad tRNA molekulid kohale „õiged” aminohapped
ja lülitavad needsünteesitava valgu ahelasse.
rRNA kuulub ribosoomide ehitusse ja osaleb valgusünteesis.
MLB 6001 Üldbioloogia 12
Erinevalt DNA-st ei ole RNA molekulidel ühesugust ruumilist struktuuri. Iga molekul
koosneb vaid ühest ahelast, kuid molekulisiseselt võivad ribonukleotiidid omavahel
paarduda vastavalt komplementaarsusprintsiibile. Nii moodustub RNA-s
teist järku nt
„ristikulehe” kujuga struktuur.
6. Raku ehitus Vastavalt rakutuuma esinemisels jaotatakse kõik organismid kahte rühma:
eeltuumsed ehk prokarüoodid ja päristuumsed ehk eukarüoodid. Prokarüootide
hulka kuuluvad
bakterid . Neil puudub membraaniga
piiritletud tuum ning raku sisemuses
on tunduvalt vähem erinevaid organelle ja membraanseid struktuure. Eukarüoodid
jaotatakse protistideks, taime-, seene- ja loomariigiks. Et viirused ei ole rakulise
ehitusega, siis ei kuulu nad ei eel- ega päristuumsete hulka.
Iga rakk on ümbritsetud rakumembraaniga. Eukarüootse raku sisemus on täidetud
poolvedela tsütoplasmaga, milles leidub arvutkalt mitmesuguseid organelle. Enamikus
rakkudes on üks tuum, mis reguleerib kogu raku elutegevust
Eukarüoodid
Tsütoplasma
Raku sisemus on täidetud poolvedela aine- tsütoplasmaga. Selle peamiseks
koostisosaks on vesi 60-90% ning lahustunud paljud anorgaanilised (katioonid ja
anioonid dissotsieerunud olekus) ja orgaanilised (aminohapped, nukleotiidid, mono- ja
oligosahhariidid, orgaanilised happed, polüsahhariide, valke ja nukleiinhappeid) ained.
Anorgaanilised ained osalevad paljudes biokeemilistes reaktsioonides ja tagavad ka raku
sisekeskkonna püsiva pH. Tsütoplasmas leiame veel ainevahetuse produkte, pigmente,
regulaatoreid ja lahustunud
gaase .
Tsütoplasma on pidevas liikumises ja seob kõik rakuorganellid ühtseks tervikuks. Rakutuum
Tuumaümbris koosneb kahest membraanist. Nendes paiknevad
poorid , mille kaudu
toimub ainete liikumine tuuma sisemusse ja sealt välja.
Tuumamembraanid on ehituselt
sarnased teiste rakumembraanidega.
Tuumasisest
plasmat nimetatakse
karüoplasmaks. See sisaldab DNA-d, valke,
RNA-d ja mitmesuguseid madalmolekulaarseid ühendeid. Kromosoomid on tuuma kõige
olulisemad osad.
Tuumas võib mikroskoobi all näha ühte või mitut
tuumakest. Need on piirkonnad,
kus kromosoomidel toimub intensiivne rRNA süntees ja ribosoomide moodustumine.
Rakutuum reguleerib kõiki rakus toimuvaid protsesse. Enamasti on igas rakus üks tuum,
erandina mõnedes mitu.
Kromosoomide arv ja kuju on ühe liigi piirides enamasti muutumatu, Paarilisi
kromosoome nimetatakse homoloogilisteks.
Homoloogilised kromosoomid sisaldavad MLB 6001 Üldbioloogia 13
samu pärilikke tunnuseid määravaid geene. Erandi moodustavad vaid mehe
sugukromosoomid.
Kui inimese keharakkudes on 46 kromosoomi, siis igas muna- ja
seemnerakus on
üksnes 23 kromosoomi.
Eukarüootsete rakkude kromosoomides on DNA seotud valkudega. Peamised
kromosoomivalgud on
histoonid . Need kaitsevad DNA-d ning aitavad kromosoome
rakujagunemise ajal kokku
pakkida . DNA, mis on
keerdunud ümber histoonide
molekulidest
koosnevate kerakeste, moodustab nendega
nukleosoomse fibrilli. Ühe
kromosoomi moodustab histoonide ja teiste valkudega seotud üks DNA molekul. Seega
koosneb üks kromosoom ühest nukleosoomsest fibrillist.
Rakumembraan Kõik rakud on ümbritsetud membraaniga.
Membraan eraldab raku sisekeskkonda väliskeskkonnast, kaitseb seda kahjulike mõjutuste eest ja ühendab rakke
omavahel. Rakumembraanivahendusel toimub aine-, energia- ja
infovahetus raku ja
väliskeskkonna vahel.
Rakumembraan koosneb põhiliselt fosfolipiididest ja valkudest. Fosfolipiidid
moodustavad kaks kihti. Valgu molekulid aga paiknevad hajusalt kas nende peal või
vahel. Fosfolipiidide ja valkude massi suhe on membraanide koostises enamasti
ühesugune.
Tsütoplasmat läbib membraanidest moodustunud
kanalite süsteem. Neid mööda
liiguvad ained raku ühest otsast teise. Membraanidega on ümbritusetud ka rajutuum ja
mitmed rakuorganellid.
Rakusisesed membraanid on oma ehituselt sarnased raku
välismembraaniga: põhiosa sisemebraanidest on üles ehitatud fosfolipiidsest kaksikkihist,
millega on seostunud mitmesuguseid ülesandeid täitvad valgud.
On olemas kahte liiki transporti:
aktiivne ja passiivne transport.
Ainete aktiivseks transpordiks on vaja kulutada energiat, passiivseks seda vaja ei ole. Mõned ained liiguvad läbi membraani difusiooni või
osmoosi teel (vesi, gaasid (O2,
CO2),
etanool ja teised väiksemad molekulid) – passiivne transport.
Osa rakumembraani koostisse kuuluvatest valkudest on varustatud kanalikestega.
Membraaniehituses olevad
transportvalgud osalevad ka ainete aktiivses
transpordis .
Need valgud ei juhi l’bi membraani mistahes ainet, vaid üksnes
kindlaid ühendeid.
Fagotsütoos – kui osake jõuab rakumembraanile, sopistub see sisse ja omistatav aine
liigub membraaniga ümbritsetud põiekeses tsütoplasmasse. Järgnevalt lisanduvad
põiekesse ensüümid, mis lagundavad fagotsüteeritud ained (amööb, „õgivad” vererakud –
kaitse!!!).
Sarnaselt kirjeldatuga toimub ka
pinotsütoos – selle käigus omastab rakk
vedelikes lahustunud aineid.
Retseptorvalgud – osalevad infovahetuses väliskeskkonnaga. Seovad rakku
ümbritsevast keskkonnast erinevaid molekule (nt hormoone) ja vallandavad seejärel
mitmesuguseid rakusiseseid biokeemilisi reaktsioone.
MLB 6001 Üldbioloogia 14
Rakuorganellid
Päristuumse raku tsütoplasmat läbib
membraanse ehitusega kanalikeste ja
tsisternikeste süsteem, mis moodustab
tsütoplasmavõrgustiku. Lisaks transpordile on
võrgustik seotud ainevahetuslike protsessidega.
On olemas
sileda - ja karedapinnaline tsütoplasmavõrgustik. Karedapinnalisel
paiknevad valke sünteesivad
organellid –
ribosoomid.
Siledapinnalise võrgustiku membraanidel paiknevad ensüümid, mis võtavad osa
lipiidide ning sahariidide sünteesist. Selle tulemusena moodustunud ained liiguvad
mööda kanalikeste ja tsisternikestesüsteemi erinevatesse rakuosadesse.
Iga
ribosoom on kaheosaline. Mõlemad osad koosnevad ribosoomi-RNA (rRNA) ja
valgu molekulidest.
Ribosoomid pannakse kokku rakutuumas olevates tuumakestes. Sünteesijärgselt
liiguvad nad läbi tuumamembraanide pooride tsütoplasmasse. Seal kinnitub osa neist
tsütoplasmavõrgustikule.
Ribosoomides toimub valkude süntees. Ühe mRNA
molekuliga seotud ribosoomide kogumikke nimatatakse
polüsoomideks.
Ka mõned suuremad rakuorganellid – mitokondrid ja kloroplastid – sisaldavad
ribosoome. Seal sünteesitakse nendele organellidele vajalikke valke.
Lüsosoomid on ühekordse membraaniga ümbritsetud põiekesed, milles lõhustatakse mitmesuguseid aineid. Nendes lagundatakse ka makromolekule ja oma
otstarbe kaotanud rakustruktuure, samuti fagotsüteeritud aineosakesi.
Golgi kompleks – koosneb üksteise kohal asetsevatest plaatjatest tsisternikestest,
põiekestest ning neid ühendavatest kanalikestest. Kõik nimetatud osad on ümbritsetud
membraaniga.
Loomarakkudes on Golgi komplekse kümmekond,
taimerakus aga
mõnisada. Sinna satuvad ained tsütoplasmavõrgustiku kanalikestest.
Golgikompleksis
jõuab lõpule valkude töötlemine ning nende pakkimine sekreedipõiekestesse ja
lüsosoomidesse. Lisaks sellele osaleb Golgi kompleks rakumembraani uuendamises ja
taimerakkudes ka rakukesta moodustamises.
Mitokondrid – kujult ümar või
lapik , ümbritsetud kahe membraaniga. Sisemembraan
moodustab arvukalt kurde ja sopistusi, mida nimetatakse
harjakesteks.
Organelli sisemuses leidub mitokondrile omaseid DNA ja RNA molekule. Mitokondri DNA
sisaldab geneetilist informatsiooni organellile vajalike RNA ja valkude sünteesiks. Valke
sünteesitakse mitokondri sees olevates ribosoomides.
Mitokondri põhiülesandeks on raku varustamine energiaga. Neid viiakse lõpule
glükoosi ja teiste ainete lagundamine. Selleks vajavad mitokondrid hapnikku, protsessi
käigus eraldub süsihappegaas. Koos sellega vabaneb energia, mis osaliselt kasutatakse
ära makroergiliste ühendite (ATP) sünteesiks.
Mida rohkem energiat rakk vajab, seda rohkem on selles ka mitokondreid.
Tsütoskelett
Päristuumsete organismide rakud on mitmesuguse väliskujuga. Organellid võivad
rakus asukohta muuta, samamoodi võivad rakud organismi
piire ümber paikneda. Kõiges
selles – rakkude kuju püsimises või muutumises, ninde liikumises ja organellide
ümberpaiknemises – osaleb tsütoplasmas paiknev tsütoskelett.
MLB 6001 Üldbioloogia 15
Tsütoskelett koosneb niitjatest valkudest. Ta moodustab tsütoplasmas võrkja
struktuuri, mis ühendab omavahel rakumembraani, tuuma välismembraani,
tsütoplasmavõrgustiku ja enamiku rakuorganelle.
Tsütoskeletti võib lugeda raku tugi-
ja liikumissüsteemiks. Vastavalt tsütoskeletti moodustavate valguniidikeste läbimõõdule eristatakse
fibrille, mikrofilamente ja mikrotuubuleid. Raku jagunemisel on oluline osatsentrosoomil.
Tsentrosoom koosneb kahest teineteise suhtes risti paiknevast silindrilisest tsentrioolist. Kumbki tsentriool koosneb
mikrotuubulitest. Igas loomarakus on ainult üks tsentrosoom, mis paikneb rakutuuma
läheduses. Raku jagunemisel lähtuvad neist valgulised
fibrillid –
kääviniidid. Need
osalevad kromosoomide või kromatiidide jaotamises tütarrakkude vahel. Bakterite ja
kõrgemate taimede rakkudes tsentrosoom puudub.
Tsütoskeletti koostisse kuuluvad valgud võimaldavad rakkudel muuta oma kuju.
Taimerakk
7. Biomembraanid
Vt lk 13 Rakumembraanid
8. Sümbiogenees Endosümbioositeooria, hüpotees, mille järgi päristuumsete rakkude organellid
(mitokondrid,
plastiidid , tsentrosoom jt) on fülogeneesis arenenud nende rakkude eellaste
ja lihtsamate eeltuumsete organismide (nt bakterite) pideva sümbioosi tagajärjel.
Fülogenees – põlvnemiskäik, mingi organismirühma (populatsiooni, liigi, seltsi,
klassi vms) või üksikelundi või elundkonna
evolutsiooniline areng.
9. Hulkraksus
Hulkraksed – paljudest ehituselt ja talitluselt erinevatest, iseseisvuseta rakkudest
koosnevad loomad. Rakud moodustavad vähemalt 2 lootelehte, enamasti kudesid,
elundeid ja elundkondi. Hulkraksete hulka kuuluvad kõik loomad peale ainuraksete.
1)
Kolooniad .
Paljunemine – hulkraksuse kinnistumine, püsimine
2) Tõelise hulkraksuse teke – loomadel kujuneb välja tööjaotus. Nt mesilased.
Taimedel kujunevad kinnitusorganid (nt vetikad), maismaataimedel veejuhtumine.
3) populatsioon
... liigi isendid, kes elavad samal ajal samal alal & nende vahel peaks toimuma
geneetiline info vahetamine.
4) Ökosüsteem
MLB 6001 Üldbioloogia 16
5) Biosfäär
Vt lisaks küs 2 lk 2-3.
11. Energiavoo vajalikkus
Energiat on vaja:
1) hoida elustruktuuri piisaval tasemel, väliskeskkonnast tekitatud häirete
kõrvaldamiseks,
2)
ainevahetuseks ,
3) paljunemiseks.
Organismid jaotatakse kahte rühma:
autotroofid ja
heterotroofid.
Autotroofide põhiosa moodustavad rohelised taimed. Nad saavad esmase orgaanilise
aine fotosünteesiprotsessis.
Autotroofid – on organismid, kes sünteesivad elutegevuseks vajalikud orgaanilised
ühendid väliskeskkonnast saadavatest anorgaanilistestainetest.
Kemosünteesijad – erinevat liiki bakterid, kes toodavad orgaanilist ainet
anorgaanilistest ühenditest, seejuures kasutavad nad
valgusenergia asemel anorgaaniliste
ainete keemilist energiat.
Heterotoroofide hulka kuuluvad eluslooduse kõigi riikide esindajad, kes ei sünteesi
ise foto- või kemosünteesil orgaanilist ainet.
Heterotroofid – on organismid, kes saavad oma elutegevuseks vajaliku energia
toidus sisalduva orgaanilise aine oksüdatsioonil.
Metabolism – organismis aset leidvad sünteesi- ja
lagundamisprotsessid , mis tagavad
tema aine- ja energiavahetuse ümbritseva keskkonnaga.
Metabolism jaguneb kaheks:
1) dissimilatsioon,
2)
assimilatsioon .
Dissimilatsioon – on organismi kõik lagundamisprotsessid. Toiduga saadavad
orgaanilised ühendid lõhustatakse ensüümide abil järk-järgult
lihtsama ehitusega
molekulideks.
Enamiku dissimilatsiooniprotsessidega kaasneb energia
vabanemine . See talletatakse
energiarikastesse ehk
makroergilistesse ühenditesse (ATP, GTP, CTP, UTP).
Assimilatsioon – on organismis kõik sünteesiprotsessid. Saadakse
sahhariide , lipiide,
valke nukleiinhappeid jt. Vajatakse ATP-d.
12. Heterotroofne energiavarustus: hingamine ja käärimine
Enamikus organismides talletatakse glükoosivarud polüsahhariididena – tärklise
(taimedes) või glükogeeni (
loomades ) kujul. Glükogeen lagundatakse glükoosiks, seejärel
MLB 6001 Üldbioloogia 17
toimub glükoosi järk-järguline oksüdatsioon, mille käigus vabanev energia salvestatakse
ATP molekulidesse. Selline dissimilatsiooniprotsess on universaalne, sest kulgeb taime-
ja loomarakkudes ühtemoodi.
Ühe glükoosimolekuli täielikul lagundamisel on organism võimeline sünteesima kuni
38 ATP molekuli. Protsess on 40 % kasuteguriga, ülejäänud 60 % hajub soojusena.
Glükoosi lagundamisel võime eristada kolme etappi : 1) glükolüüs,
2) tsitraaditsükkel,
3) hingamisahela ehk gaasivahetus reaktsioon .
Glükolüüs
Glükoosi algne lagundamine ehk glükolüüs toimub päristuumsete rakkude tsütoplasmavõrgustikus. Seal paiknevad ensüümid, mis katalüüsivad ligikaudu kümmet
üksteisele järgnevat reaktsiooni. Protsessi tulemusena saadakse ühest kuuesüsinikulisest
glükoosi molekulist kaks kolmesüsinikulist
püroviinamarihappe molekuli
(CH3COCOOH) ja eraldub neli vesiniku aatomit. Sünteesitake 2 ATP-d.
glükoos → 2
püroviinamarihape + 4
H Püroviinamarihappe lagundamine jätkub glükolüüsile järgnevas tsitraaditsüklis.
Eraldunud 4 H aatomit seostuvad vesinikukahdjaga
NAD (nikotiinamiidadeniindinukleotiid), mis võimaldab H aatomeid järgnevalt kasutada
hingamisahela reaktsioonides:
2
NAD + 4
H ↔ 2
NADH 2
Sellise tulemusega lõpeb glükolüüs
vadi tingumustes, kus rakus on küllaldaselt
hapnikku. Seepärast nimetatakse taolist glükolüüsi ka
aeroobseks. Hapniku puudumisel
toimub
anaeroobne glükolüüs ehk
käärimine. Käärimine
Anareoobne glükolüüs ehk käärimine lõpeb kas piimhappe või etanooli moodustumisega. Piimhappe käärimine toimub hapniku puudusel lihaskoe rakkudes, aga
ka
piimhappebakterite elutegevuse käigus. Sel juhul saadakse ühest glükoosi molekulist
kaks
piimhappe (C2H4OHCOOH) molekuli, kuid H aatomeid ei eraldu ning kogu
protsess piirdub kahe ATP molekuli sünteesiga:
glükoos → 2
piimhape Võib saada ka etanool ja süsihappegaasi – pärmseente toimel. Pärmseened ja mõned
bakterid teostavad anaeroobsetes tingimustes
etanoolkäärimist. Ka sel juhul ei eraldu H
aatomeid ja moodustub vaid kaks etanooli ja kaks ATP molekuli:
MLB 6001 Üldbioloogia 18
glükoos → 2
e tan
ool + 2
CO ↑
2
Tsitraaditsükkel
Glükolüüsi tulemusena saadud püroviinamarihappe edasine lagundamine toimub mitokondri sisemuses. Et ühe vaheproduktina moodustub
sidrunhape , mille
happejääki nimetatakse tsitraadiks, siis nimetatakse ka kogu protsessi
tsitraaditsükliks. Tsitraaditsükkel koosneb ensüümide poolt katalüüsivatest reaktsioonidest, mille käigus eralduvad järk-järgult CO2 molekulid ja H aatomid. Süsihappegaas on
dissimilatsiooni jääkprodukt ja difundeerub mitokondritest välja – välja hingatav
süsihappegaas. Eralduva H aga püüab kinni NAD (10), mis suunatakse edasi
hingamistsüklisse.
Hingamisahel ehk gaasivahetus
Hingamisahela reaktsioonid toimuvad mitokondrite sisemembraanide harjakestes, kus glükolüüsil ja tsitraaditsüklis moodustunud NADH2 energia arvel saab
täiendavalt sünteesida ATP molekule.
Et glükolüüsil saadakse ühe glükoosimolekuli lõhustumisel 2 ATP molekuli ja
hingamisahela reaktsioonide tulemusena veel 36, siis kokku võib aeroobsetes tingimustes
ühe glükoosimolekuli lõplikul lagundamisel
moodustuda kuni 38 ATP molekuli.
Lisaks sellele toimub
tsitraadi tsükli reaktsioonides ka lipiidide ja aminohapete lõplik
lagundamine.
13. Autotroofne energiavarustus: Fotosüntees
Rohelised taimed fotosünteesivad süsihappegaasist ja veest suhkru molekule. Selleks
kasutavad nad
valgusenergiat . Fotosünteesi lisaproduktina eraldub molekulaarne hapnik.
Kloroplastides asuvad klorofülli molekulid ergastuvad valgusenergia toimel.
Kõik järgnevad fotosünteesi reaktsioonid toimuvad klorofülli ergastunud elektronide
energia arvelt. Fotosünteesi võib tinglikult jagada kaheks: valgus- ja pimedusstaadium . Valgusstaadiumi reaktsioonide toimumiseks on vajalik valguse olemasolu. Klorofülli
ergastunud elektronide energia arvel lagundatakse vee molekule ja eraldub gaasiline
hapnik. Reaktsioonide käigus moodustunud vaheühendeid ja salvestatud ATP energiat
kasutatakse fotosünteesi pimedusstaadiumis (mis valgusest vahetult ei sõltu). Selles
seotakse süsihappegaasi molekule ja moodustuvad kolmesüsinikulise suhkru molekulid.
Viimaste ühinemisel saadakse glükoos.
Valgusstaadiumirreaktsioonid
MLB 6001 Üldbioloogia 19
Kloroplastide sisemuses paiknevates lamellimembraanides moodustavad klorofülli
molekulid koos teiste pignemtide ja valkudega valgusenergia muundamiseks vajalikke
kogumikke – fotosüsteeme. Vastavalt neis teomuvatele protsessidele eristatakse
fotosüsteem I ja
fotosüsteem II.
Fotosüsteem II kasutab ergastunud elektronide energiat vee molekulide lagundamiseks – vee fotooksüdatsiooniks (ehk vee fotolüüsiks) – ja ATP sünteesiks.
Vee fotooküdatsioonil moodustub molekulaarne hapnik, eralduvad elektronid ja
vesinikuioonid. Hapnik väljub õhulõhede kaudu ümbritsevasse keskkonda.
Energia ülekanne ATP-le on kaheastmeline. Fotosüsteem II ergastunud elektronid
haaratakse
elektronitranspordiahelasse. Nende asemele tõmmatakse uued elektronid
vee fotooksüdatsioonil lõhustatavatest vee molekulidest.
Fotosüntees I vee fotooksüdatsioonis ei osale, selle põhiülesandeks on NADPH2 moodustamine. Süsteemis valgusenergia toimel ergastunud elektronid liiguvad vesinikukandja NADP
molekulidele, mis seejärel seovad ümbritsevast keskkonnast H+ ioone. Moodustunud
NADPH2 on vesiniku allikaks fotosünteesi pimedusstaadiumis toimuva
sahhariidi sünteesil.
Valgusstaadiumi reaktsiooni tulemusena saadakse ATP ja NADPH2 molekulid, mis on vajalikud fotosünteesi pimedusstaadiumi reaktsioonide toimumiseks. Pimedusstaadiumi reaktsioonid
Pimedusstaadiumi reaktsioonide toimuvad kloroplasti lamellidest väljaspool
(
stroomas ). Sahhariidide sünteesiks süsinikuallikana vajalik CO2 siseneb õhulõhede
kaudu taime ja difundeerub kloroplastidesse. Edasine protsess koosneb järjestikulistest
reaktsioonidest, mis moodustavad tsükli –
Calvini tsükli. Calvini tsükkel – selles seotakse CO2 ja vesinikuallikaks on NADPH2.
Pimedusstaadiumi lõpptulemusena moodustuvad kolmesüsinikulised suhkru molekulid.
Nende omavahelisel ühinemisel saadakse glükoos. Calvini tsüklis kasutatakse
valgusstaadiumis salvestatud ATP energiat ja NADPH2 molekule. Calvini tsükli
reaktsioonide käigus tekkinud NADP ja ADP on uuesti kasutatavad valgusstaadiumi
reaktsioonides, glükoosi molekulid aga väljuvad kloroplastidest või moodustavad esmase
säilitustärklise.
14. Kromosoomid
Kromosoom – DNA ja valgu molekulide kompleks (nukleoproteiin), milles
sisalduvad
geenid määravad pärilikke tunnuseid.
Pärilikkus – looduse üldine seaduspärasus, mille kohaselt järglased sarnanevad
ehituselt ja talitluselt vanematega.
Geneetika – teadusharu, mis uurib organismide pärilikkuse ja muutlikkuse
seaduspärasusi.
Pärilikkuse
kandjad on
kromosoomid. Päristuumsetel organismidel paiknevad need
rakutuumas.
MLB 6001 Üldbioloogia 20
Genoom – liigiomases ühekordses kromosoomikompletis sisalduv geneetiline
materjal.
Hulkraksete organismi kõigis keharakkudes on enamasti ühesugune arv kromosoome.
Igas kromosoomis asuvad geenid määravad ära hulga tunnuseid. Geen võib osaleda
ka mitme tunnuse määramisel ja mõne tunnuse määramisel osaleb mitu geeni.
Genotüüp – ühele isendile omaste geenide ja nende
erivormide kogum.
Fenotüüp – ühe isendi vaadeldavate tunnuste kogum.
Keskkond kas soodustab või pidurdab geenide poolt määratud tunnuste väljakujunemist.
15. Mitoos
Hulkraksetel organismidel järgneb nii sugulisele kui ka mittesugulisele paljunemisele
rakkude jagunemine, mis tagabki organismi
kasvamise ja arengu. Lisaks sellele on
rakkude jagunemine vajalik organismi
hukkunud rakkude asendumiseks ja vigastuste
paranemiseks. Uued rakud saavad alguse lähterakkude jagunemisest. Sel viisil
moodustunud rakke nimetatakse
tütarrakkudeks.
Eukarüootsete rakkude jagunemisel eristatakse teineteisele järgnevat tuuma ja
tsütoplasma jagunemist. Esmalt toimub rakutuuma jagunemine ehk
karüokinees. Selle
käigus tagatakse kromosoomides oleva geneetilise info võrden jaotumine tuumade vahel.
Karüokineesi lõpus algab tsütoplasma jagunemine ehk
tsütokinees, mille tulemusena
moodustub kaks tütarrakku.
Päristuumsete rakkude jagunemise viisi, millega tagatakse kromosoomide arvu püsivust tütarrakkudes, nimetatakse mitoosiks. Kahe mitoosi vahele jäävat raku eluperioodi nimetatakse
interfaasiks. Raku eluringi
ühe mitoosi lõpust läbi interfaasi järgmise mitoosi lõpuni nimetatakse
rakutsükliks.
Interfaas Raku ainevahetuse põhiprotsessid toimuvad mitoosieelses
interfaasis . Organellide arv
suureneb, toimub ATP ja teiste makroergiliste ühendite süntees. Sellega valmistub rakk
järgnevaks jagunemiseks. Interfaasis algab loomarakkudes ka tsentrioolide kahestumine.
Selle tulemusena on mitoosieelses tsentrosoomis kaks paari tsentrioole. Kõigi nende
protsesside käigus suurenevad raku mõõtmed. Kui rakk jaguneb, on oluline, et
moodustuvatesse tütarrakkudesse jääks ühesugune
kromosoomistik . Selleks toimub enne
raku jagunemist DNA kahekordistumine.
Mitoos
Interfaasis on kromosoomid lahtikeerdunud ja seetõttu ei ole nende kuju
mikroskoobis vaadeldav. Sel perioodil esinevad kromosoomid rakutuumas
nukleosoomsete fibrillidena. Seejuures on iga kromosoomi ehituses üks DNA molekul.
Interfaasi lõpus toimuva DNA kahekordistumise tagajärjel on kromosoomid
MLB 6001 Üldbioloogia 21
rakujagunemise alguseks
kahekromatiidilised. Nende koostisse kuulub kaks DNA
molekuli, mille nukleotiidse järjestused on üldjuhul identsed ja sisaldavad seetõttu samu
geene.
Alles mitoosi alguses keerduvad kromosoomid sedavõrd kokku, et neid saab
mikroskoobis vaadelda. Ühe kromosoomi
kromatiidid on omavahel ühendatud
tsentromeeri abil. Ühtlasi
jagab tsentromeer kromatiidi kaheks osaks. Neid osasid
nimetatakse
kromosoomi õlgadeks. Ühe kromosoomi õlad ei pruugi olla alati
ühepikkused – sellest tuleneb ka eri kromosoomide erinev kuju.
Rakujagunemisel lahknevad kõigi kromosomide kromatiidid ja moodustavad
tütarrakkudesse jäävad
ühekromatiidilised kromosoomid.
Mitoosile järgnevad
interfaasis on nad taas lahtikeerdunud kujul – nukleosoomsete fibrillidena. Alles järgmise
rakujagunemise eel
taastub kromosoomide kahekromatiidilisus.
Mitoosi võime jagada tinglikult
neljaks osaks:
1)
profaas ,
2)
metafaas ,
3)
anafaas ,
4)
telofaas .
Profaas – kromosoomid keerduvad sedavõrd kokku, et muutuvad mikroskoobis
nähtavaks. Rakutuum suureneb ja tuumakesed kaovad. Tsentrioolipaarid liiguvad
vastassuunas – selle tulemusena rakk
polariseerub .
Poolustele liikuvate tsentrioolide
vahele moodustuvad
kääviniidid. Need koosnevad niitjatest valkudest ja osalevad
kromosoomide täpses jaotamises moodustavate tütarrakkude vahel.
Profaasi lõpus
tuumamembraanid lagunevad.
Metafaas – kromosoomid liiguvad raku
keskossa ja paigutuvad ühele ekvatoriaalsele
tasandile . Metafaasis on kromosoomid maksimaalselt kokku keerdunud ja on
mikroskoobis just siis kõige paremini vaadeldavad. Kääviniidid kinnituvad
kromosoomide tsentromeeridele. Osa neist jääb ühendama poolustel paiknevaid
tsentrioole.
Anafaas – tsentrioolidelt lähtuvad kääviniidid lühenevad ja kõigi kromosoomide
kromatiidid eralduvad teineteisest. Selleks peavad
tsentromeerid kahestuma. Anafaas
algab kromatiidide lahknemisega ekvatoriaaltasandil ja lõpeb nende jõudmisega
rakupoolustele.
Telofaas – kääviniidid kaovad ja sünteesitakse tuumamembraanid. Kromosoomid
keerduvad järk-järgult lahti ja tekivad tuumakesed. Loomaraku membraan nöördub
keskosast sisse, tsütoplasma jaguneb kaheks ja selle tulemusena moodustub kaks
tütarrakku. Mitoosi lõpus tsütoplasma
jaotumist tütarrakkude vahel nimetatakse
tsütokineesiks.
Kõik hulkraksed organismid ei ole jagunemisvõimelised.
Hulkraksetes organismides ei saa rakud piiramatult jaguneda, sest organismi
mõõtmed ei saa lõputult suureneda.
Interfaasis enamik rakke diferentseerub: nad omandavad vastava koe tüübile
iseloomuliku kuju ja talitluse.
Diferentseerumisega kaotavad paljud rakud pöördumatult oma jagunemisvõime. Seetõttu ei saa paljuneda närvi- ja vöötlihasrakud. Jagunemisvõime
MLB 6001 Üldbioloogia 22
puudub ka erütrotsüütidel, mis oma arengu käigus kaotavad raku tuuma. Neid tekib
pidevalt juurde luuüdis.
Teise rühma moodustavad rakud, mis tavaliselt ei pooldu, kuid teatud tingimustes on
selleks siiski võimelised.
16. Meioos
Igale liigile on iseloomulik kindel kromosoomide arv. Et sugulise paljunemisel
kromosoomide arv viljastumise tulemusena kahekordistuks, selleks peab nende arv
sugurakkudes vähenema kaks korda. See toimub sugurakkude arengu käigus.
Raku
jagunemise viisi, mille käigus kromosoomide arv tütarrakkudes väheneb kaks
korda, nimetatakse meioosiks. Meioosis kaks korda vähenenud kromosoomistikku nimetatakse
haploidseks. Seega
on organismide sugurakkudes enamasti haploidna kromosoomistik (tähistus –
n).
Munaraku viljastumisel ühinevad kahe suguraku kromosoomid ja taastub liigile omane
kahekordne ehk
diploidne kromosoomistik (tähistus –
2n). Näiteks on inimesel kõigis
keharakkudes ehk
somaatilistes rakkudes diploidne kromosoomistik 2n=46 ja
sugurakkudes ehk
gameetides haploidne kromosoomistik n=23.
Meioos kaasneb sugurakkude küpsemisega ning eoste moodustumisega. Protsess
koosneb kahest järjestikulisest jagunemisest, mille tulemusena tekib neli tütarrakku.
Sarnaselt mitoosiga eristatakse meioosi mõlemas jagunemises nelja faasi.
Meioosile eelnev interfaas sarnaneb mitoosi omaga: toimub DNA kahekordistumine,
suureneb rakuorganieelide arv ja sünteesitakse makroergilisi ühendeid. Tsentrosoomi
koostisse kuuluvad
tsentrioolid kahestuvad ja sellega on meioosieelses tsentrosoomis
kaks paari tsentrioole.
Kõigi nimetatud protsesside poolest sarnaneb meioosi esimese jagunemise profaas
mitoosi algusega. Põhiline erinevus seisneb aga selles, et meioosi
profaasis liibuvad
homoloogilised kromosoomid paarikaupa ja vahetavad omavahel võrdse pikkusega osi.
Sellist nähtust nimetatakse
kromosoomide ristsiirdeks. Viimasega kaasneb
geenivahetus, mis on üheks päriliku
muutlikuse allikaks.
Võrreldes mitoosi esimese faasiga vältab meioosi esimene jagunemise profaas
tunduvalt kauem – see võib mõnikord kesta päevi või isegi aastaid. Viimane on
iseloomulik paljude imetajate munarakkudele.
Metafaasiks ei ole homoloogilised kromosoomid teineteisest veel täielikult
eraldunud ka liiguvad paarikaupa ekvaatoritasandile. Nende tsentromeeridele kinnituvad
kääviniidid.
Anafaasis – kääviniidid lühenevad ja homoloogilised kromosoomid lahknevad
poolustele. Faas algab
homoloogiliste kromosoomide eraldumisega teineteisest
ekvaatoritasandil ja jõuab lõpule nende jõudmisega poolustele.
Telofaas – nöördub rakumembraan sisse, koos sellega kahestub ka tsütoplasma ja
tsütokineesi tulemusena moodustub kaks tütarrakku. Tsentroolid kahestuvad jällegi ning
seega on tsentrosoomi koostises kaks paari tsentrioole. Erinevalt mitoosist ei keerdu
kromosoomid täielikult lahti, tuumamembraane enamasti ei teki ja tuumakesi ei
moodustu.
MLB 6001 Üldbioloogia 23
Esimese jagunemise tulemusena on kromosoomide arv kaks korda vähenenud.
Mõlemasse tütarrakku jäänud kromosoomid koosnevad aga kõik kahest kromatiidist ning
DNA kahekordistumist ei järgne.
Interfaas meioosi kahe jagunemise vahel on mitoosiga võrreldes tunduvalt
lühiajalisem ja liitub teise jagunemise profaasiga.
Profaasis liiguvad tsentrioolide paarid jällegi raku poolustele ja
nendest lähtuvad
kääviniidid.
Metafaasis – paiknevad kromosoomid ekvatoriaaltasandile ja kääviniidid kinnituvad
tsentromeeridele.
Anafaas – kromosoomi tsentromeerid kahestuvad. Selle tulemusena lahknevad
kromatiidid teineteisest ja liiguvad koos kääviniitide lühenemisega raku poolustele.
Telofaasis – keerduvad raku poolustele jõudnud kromatiidid lahti, moodustavad
tuumamembraanid ja tuumakesed. Sel ajal toimub ka tsütokinees ja kokku tekib neli
tütarrakku. Kääviniidid lagundatakse ja taastub rakule omane tsütoskelett.
Meioosi tulemusena tekib ühest diploidsest rakust neli haploidset tütarrakku. Homoloogiliste kromosoomide
ristsiire ja üksteisest sõltumatu lahknemise tõttu on
tütarrakud geneetiliselt erinevad.
17. Pärilikkuse seadused
Mendeli I seadus ehk ühetaolisuse seadus:
Homosügootsete vanemate ristamisel saadakse esimeses põlvkonnas genotüübilt identsed ja fenotüübilt sarnased järglased.
Alleel – ühe geeni
erivorm (A või a)
Homosügootsus – geenipaari seisund, mille puhul mõlemas homoloogilises
kromosoomis paikneb vaadeldava tunnuse suhtes sama alleel (nt AA, aa).
Heterosügootsus – geenipaari seisund, mille puhul homoloogilistes kromosoomides
paiknevad vaadeldava tunnused suhtes erinevad
alleelid (nt Aa, Bb).
Mendeli II seadus ehk lahknemise seadus:
Homosügootsete vanemate monohübriidsel ristamisel toimub teises hübriidpõlvkonnas genotüüpide ja fenotüüpide lahknemine seaduspärastes suhetes.
Mendeli III seadus:
Homosügootsete vanemate dihübriitsel ristamisel lahknevad mõlemad tunnusepaarid teises hübriidpõlvkonnas teineteisest sõltumatult ja kombineeruvad
omavahel vabalt.
Dihübriidne ristamine – ristamine, mille korral vanemvormid erinevad kahe
tunnusepaari poolest.
Morgani seadus:
Ühes kromosoomis lähestikku paiknevad geenid on lineaarses ahelduses ning päranduvad järglastele enamasti üheskoos. MLB 6001 Üldbioloogia 24
18. DNA teabe realiseerumine
Molekulaargeneetika – on teadusharu, mis uurib pärilikkuse seaduspärasusi
molekulaarsel tasemel. Molekulaargeneetika keskendub oma uurimissuundades peamiselt
kolmele universaalsele protsessile:
• DNA sünteesile ehk
replikatsioonile, • RNA sünteesile ehk
transkriptsioonile, • valgu sünteesile ehk
translatsioonile.
DNA
replikatsioon eelneb raku jagunemisele. Sellega saadakse lähteraku igast DNA
molekulist kaks ühesuguse nukleotiidse järjestusega koopiat, mis mitoosil tütarrakkude
vahel värdselt ära jaotatakse.
DNA lõiku, mis määrab ühe RNA molekuli sünteesi, nimetatakse geeniks. Enamikult geenidelt toimub informatsiooni-RNA (mRNA) molekuli süntees.
Transkriptsiooni tulemusena saadakse DNA nukleotiidsele järjestusele vastav mRNA
nukleotiidne järjestus. Sellele järgneb mRNA transport rakutuumast tsütoplasmas
paiknevatesse ribosoomidesse, kus toimub valkude süntees.
Matriitsüntees – DNA, RNA ja valgud sünteesitakse olemasolevate molekulide (DNA või RNA) ahelate alusel, mis määravad sünteesitavate molekulide
monomeeride järjestuse. Replikatsioon on matriitsüntees, mille tulemusena saadakse ühest DNA molekulist kaks ühesuguse nukleotiidse järjestusega DNA moelkuli. Replikatsioon on kõigis organismides toimuv universaalne molekulaargeneetiline protsess, mis tagab rakujagunemise käigus päriliku info
võrdse ülekande lähterakust tütarrakkudesse.
Transkriptsioon on matriitsüntees, mille käigus saadakse DNA molekuli ühe ahela nukelotiidse järjestusega komplementaarne RNA molekul. Promootor – DNA nukleotiidne järjestus, millega ensüüm sünteesi alustamiseks peab
ühtima.
Terminaator – DNA nukleotiidne järjestus, kus ensüüm lõpetab RNA sünteesi.
Transkriptsioonil saadakse nii nRNA, rRNA kui ka tRNA molekulid. RNA süntees on universaalne protsess, sest see toimub nii eel- kui ka päristuumsete
organismide rakkudes. Kui mingilt geenilt toimub RNA süntees, siis öeldakse, et see geen avaldub. On
leitud, et üheaegselt avaldub rakus umbes 10 % geenidest.
Erinevus rakkude ehituses ja talitluses tulevad geenidest, mis neis ühel või teisel ajahetkel evalduvad. Raku elutegevuse etappidel toimub transkripstioon eri geenidelt.
Vastavalt avaldumisele eristatakse nelja gruppi geene:
1) geenid, mis avalduvad üheaegselt organismi kõigis rakkudes,
2) geenid, mis avalduvad ühe kindla koe rakkudes,
3) geenid, mis avalduvad ainult rakkude elutegevuse kindlal etapil,
4) geenid, mis ei avaldu mitte kunagi.
MLB 6001 Üldbioloogia 25
Valgusüntees
19. Geenide regulatsioon
Geeni avaldumine sõltub RNA-d sünteesiva ensüümi (RNA-polümeraasi)
seostumisest DNA promootorpiirkonnaga. Kui ensüüm ühineb promootoriga, siis
transkriptsioon toimub ja vastupidi: kui ensüüm ei seostu, siis transkriptsiooni ei järgne.
Ensüümi ühinemist promootoriga võib takistada mõni teine valk –
repressor .
Repressorvalgu seostumiskoht DNA
molekulil võib ka osaliselt või täielikult kattuda
promootorpiirkonnaga ja seetõttu ei saa ensüüm transkriptsiooni alustada. Et selline geen
jälle avalduda saaks, peab promootor vabanema repressorist.
Osa geenide avaldumiseks on vaja erilist aktivaatorvalku. Sellise mehhanismi korral
on transkriptsiooni läbiviiv ensüüm võimeline promootorpiirkonda kinnituma alles siis,
kui
aktivaator on sellega juba seondunud. Mõningatel juhtudel on repressor- ja
aktivaatorvalkude seostumiseks vaja täiendavate
regulaatorite liitumist . Need võivad
olla raku enda ainevahetuse produktid või pärineda väljaspoolt (hormoodin, vitamiinid,
toitained jt.)
Eristatakse kahte tüüpi geene: struktuur- ja regulaatorgeene.
Struktuurgeenid määravad raku ehituses ja ainevahetuses olevate rakkude, tRNA ja
rRNA sünteesi.
Regulaatorgeenid kontrollivad struktuurgeenide avaldumist. Osa neist kodeerib
vähesel hulgal sünteesitavaid tuuma regulaatorvalke.
Geeni regulatsioon
1)
RNA baasil – kui palju RNA-d sünteesida, kas sünteesida.
2)
RNA ja valgu üleminek – kas võtta sünteesitud RNA kasutusele.
3)
Valk on sünteesitud, kui miks sünteesitud valku kasutada ei saa: võib
puududa koeensüüm või pole komponentne (komplementaarne?)
tertsiaalstruktuuri jaoks.
20. Geenitehnoloogia
Geenitehnoloogia ehk tehnogeneetika - biotehnoloogia haru, mis tegeleb geenide
ülekandmisega ühest organismist teise. Geenitehnoloogia abil püütakse taimesortide ja
loomatõugude aretamist kiiremaks ja rahaliselt kasutoovamaks muuta. Geneetilise
muundamise käigus paigutatakse üks või mitu geeni ühest organismist teise,
kusjuures geene on võimalik üle kanda omavahel mittesuguluses olevate organismide vahel – nt.
võivad geneetiliselt muundatud põllukultuurid (GM-kultuurid)
sisaldada geene, mis on
pärit viirustelt, bakteritelt, loomadelt või teistelt taimedelt.
MLB 6001 Üldbioloogia 26
21. Evolutsiooni tõendid Evolutsioon – ajaline areng
Bioevolutsioon – elu ajaline areng liikide üksteisest põlvnemise kaudu.
1) Bioloogilised tõendid
Erineva vanusega geoloogilised kivistised sisaldavad erinevate organismide
kivistisi.
Liikide vahevormid nagu puuduksid: • Keskaegkonna kivimid hävinenud, puuduvad vahevormide ajast
tekkunud kivimid antud punktis.
• Liigitekke mehanism
peidab vahevormid ära (hüppeline
rühmaesindajate vahetus). Nt
roomajad →
imetajad 2) Võrdlev anatoomia • Homoloogilised elundid,
• lootelise arengu võrdlus.
3) Keemilise koostise võrdlus
Näide: analoogilise keemilise koostisega
Kapsauss sööb mõ-
lemaid valimatult
Ristõielised
Mungalill ehk
kress N: kapsas
4) Biogeograafia & ökoloogia Põhejndatav
ajalooga .
N: Austraalias on omapärane loomastik, mis on tingitud sellest, et on olnud
kõige kauem geograafilises isolatsioonis (N: hulkurloomad)
5) Koduloomad , kultuurtaimed 22. Evolutsioonilised muutused populatsioonis Evolutsiooniastmed
4 järku
1) Kosmiline evolutsioon
Kestis 13,7 miljardit aastat.
5 miljardit aastat Päike
4,5 miljardit aastat Maa
MLB 6001 Üldbioloogia 27
Kestis kuni elu tekkeni maal.
Maal kivististe hulk
sulas ära → kui gravitatsioonijõust sai energia otsa (oi-oi-oi ???)
→ Maa
jahtus → elu tekkis 100 °C juures.
Tingimused elu tekkeks: • Elu ei saa tekkida iga tähe juures – täht peab olema stabiilne, piisavalt aeglase
evolutsiooniga.
• Mõistusega elu tekkeks peab täht olema tunduvalt stabiilsem, kui elu tekkeks
vajalik.
• Atmosfäärid – Marsil väga hõre ja süsihappegaasi rikas atmosfäär, Veenusel
väga tihe ja süsihappegaasist koosnev atmosfäär, koos väävelhappe pilvedega,
valgustatus 100 korda nõrgem. Rõhk 90 atm – nagu 2 km sügavusel ookeanis
Maal. Liiga suur
kasvuhooneefekt – krge temperatuur. Seevastu Maal on
õhem atmosfäär kui veenusel ning oksüdeeruva toimega.
• Kuni 4. milrjardi aastani tabasid Maad asteroidid → Maa temperatuur tõusis
hüppeliselt
2) Keemiline evolutsioon
Lühiajaline, lõi eeldused elu tekkeks. Eluks vajalike orgaaniliste molekulide teke.
Monomeerid (võimaldavad eluks vajalike molekulide sünteesi → biopolümeerid
(polümeriseerumine toimus mineraalide pinnal).
Kaks erinevat biopolümeeri on omavahel seotud: nukleohapped + valgud
Elu tekkis: Mis temperatuuril?
100 °C juures
„-„ 100 °C juures mõned nukleotiidid on ebapüsivad,
„+” hüpertermofiilsed – põlvnemispuu alused.
Normaalsel temperatuuril – põlvnemispuu tipud.
Kus elu tekkis?
Veepiiril:
„-„ UV kiirgus oleks kõik
elualged hävitanud,
„+” 100 °C juures vesi
keeb → veeaur veekohal püüdis UV kinni.
Ookeani sügavustes:
Elualged
kolisid rannikuvetest ookeanisügavustesse (kui vesi jahtus).
Ookeanirannikul soodsamalt
kohastunud jäävad ellu:
2 tingimust:
1) lained – pidev vee liikumine,
2) ookeani lained vaheldusid
soolase ja mageda veega.
Elu tekke eelduseks olisümbioos kahe molekuli vahel:
nukleohape valku
kodeeris
⎯
← ⎯ ⎯
⎯ →
valk t
nukleohape
kaitses
MLB 6001 Üldbioloogia 28
3) Bioloogiline evolutsioon
Maal toimunud umbes 4 miljardit aastat
Esimene tõend elust – 3,8 miljardit aastat vanad vahad (Gröönimaalt)
Esimene elujälg – kildkivi grafiidi
kristallid , grafiidi
isotoop (C isotoopide suhe),
lademe struktuur sarnaneb
hilisemate bakterikolooniate poolt sünteesitud strukturile.
4) Sotsiaalne evolutsioon
Kestis ainult paarkümmend miljardit aastat.
Esimesed sotsiaalsed ilmningud – info efektiivne/tugev ülekanne.
Need jäid ellu, kes suutsid paremini arusaadavalt, kiiresti keskkonna kohta infot edasi
anda.
• Kõne – sotsiaalse info edasi
andmiseks oluline,
• kiri,
• trükikunst,
• arvuti.
Raku evolutsioon:
1) Rakueelne evolutsioon = RNA maailm
Toimus geneetilise materjali vaa kombineerimine (
mutatsioonid tugevad, kaitse
väike)
2) Tekkisid rakud, mis sarnanesid bakterirakkudega.
RNA → DNA
Rakud kasutasid orgaanilisi molekule toiduks → orgaanilised molekulid vähenesid →
peaaegu lõppesid → rakud oskasid muundada aineid → rakud hakkasid kasutama
anorgaanilisi aineid/molekule ja muundasid neid energiaks.
Kemosünteesivad bakterid kasutasid H ja S ühendeid.
Bakterid läksid ookeani sügavustesse. Tekkisid rakud.
Tekkisid valguspigmendid – neil oli valgust tõkestav (???) toime → hakkasid
sünteesima ATP-d → fotosünteesivõime, orgaaniliste ainete süntees → tekkis vee
fotosüntees – murrang eluarengus.
Elu hulk suurenes tänu fotsünteesile.
Sünteesitud hulk
kogunes madalasse vette ranniku äärde.
Fotosünteesivad bakterid – heterotroofsete bakterite eelased (O2 tarbivad bakterid).
Mineraalained said piiramatuks ressursuks, sest ei toimunud erosiooni, kuna
maismaad oli vähe. Rakud läksid maismaale.
3) Fotosünteesiv toime suurenes – maismaa osatähtsus suurenes (2 miljardit aastat tagasi). 2,5 miljardit aastat tagasi → eukarüootide ehk päristuumsed
Vabasüntees – sest konkurente vähe, kaitsemehhanisme vähe, loobusid limakapslist.
Rakud pidid oskama kõike seedida – mitmekesised rakutuuma pärilikkuse info kogus
kasvas.
MLB 6001 Üldbioloogia 29
Hulkraksete organismide evolutsioon
Tekkisid kambriumi ajastul maismaale umbes 700 miljonit aastat tagasi.
Loomariigi hulkraksete arengu plahvatuslik kasv- Kambriumi (umbes 100kond
miljonit aastat tagasi kõik hõimkonnad olemas) ajaks olid kõik hõimkonnad äkitselt
olemas.
Evolutsiooni mõjutavad asjaolud • Kliima muutus lokaalselt – mandrite
triiv (mõjutasid kindla koha kliimat).
Kliima muutused mõjutavad teatud määral, kuid nr 1 on mandrite triiv.
• Kliimamuutused vähetähtsad, sest Maa temperatuur on küllalt stabiilne.
• Ookeanide tase –seotud kuidas mandrid paiknevad.
• Mäestikud, mäestike teke – seotud mandrite triiviga.
Umbes 600 miljonit aastat tagasi – algas
Kambriumi ajastu – Põhja- Eesti sinisavi
ajastu.
Kambrium – Põhja-Eesti sinisavi ajastu
Ordoviitsium – Põhja-Eesti
paekivi , lõpus
ilmusid esimesed hulkraksed
maismaataimed –
kaldataimed .
Silur – esimesed maismaa
selgrootud (Kesk-Eesti paekivi)
Devon – Lõuna-Eesti ja Põhja-Läti
liivakivi (???). Esimesed
kahepaiksed ,
tänaü’eva tüüpi
kalad , sõnajalad (
vanima kahepaikse kivistise leiukoht, Lõuna-
Eestis, Põhja-Lätis)
Karboni ehk Kivisöe ajastu – kivisüsi –
sõnajalataimede jäänustest. Maal sai otsa
CO2 sisaldus atmosfääris – O2 sisaldus
atmosfääris, tänapäeva sarnane. Kivisöe
ajastu lõpus – esimesed paljasseemne
taimed, esimesed roomajad.
Vanaaegkond
Permi ajastu – roomajate ajastu,
paljasseemne taimed domineerivad.
Tiiras – roomajate
aegkond . Esimesed
imetajad.
Keskaegkond Juura – esimesed
linnud Kriit – kriidi lademed, hästi toimiv
ökosüsteem. Dinosaurused. Domineerivad
õistaimed
Uusaegkond (60 miljonit aastat tagasi)
Paleogeen – õistaimede aegkond
Neogeen Kaasaegkond
Kvaternaar – 2 miljonit aastat tagasi.
Evolutsiooni materjal
MLB 6001 Üldbioloogia 30
Geneetiline varieeruvus – mutatsioonid
Geenitriiv – juhuslik, ettenägematu muutumine.
Mehhanismi poolest 3 loodusliku valiku tüüpi:
1)
Stabiliseeriv valik – äärmuslikud variandid kõrvaldatakse, keskmine
domineerib .
2)
Suunav valik – valik teatud tunnuse poolest, tunnuse keskväärtuse muutumine.
3)
Lõhestav valik – äärmused soosingus võrreldes keskmisega.
Evolutsioonilise valiku tulemusena toimub
kohastuminekindlate
keskkonnatingimustega. Kohastumused pole absoluutsed.
23. Liikide teke
Populatsioonid moodustavad liigi.
Liigi tunnus – kaks organismi kuuluvad ühte liiki, kui nad annavad omavahel
potentsiaalselt elukõulisi järglasi (paljunemisvõimelisi).
•
Geograafiline isolatsioon – erinevatesse
kohtadesse sattunud organismid
„võõrduvad”. Nt mäestik võib eraldada liigid – eeldused geograafiliseks
isolatsiooniks.
•
Bioloogiline isolatsioon – tekib küllaltki järsku. Nt putukad- muutused
suguorganites.
•
Polüploidsus – taimedel.
Areaalide piiril on kerge
tekkima isolatsioon → geenitriiv.
Väikeste populatsioonide suunav valik. Äärealadel võib kiiresti toimuda liigi teke.
Organismid peavad piisavalt paljunema.
24. Süstemaatika teaduse alused
Iga organism on milleski ainulaadne ja teistest erinev.
Süstemaatika – elusolendivormide teaduslik esitus ja kirjeldamine.
Süstemaatika on teadusharu, mis tegeleb elusolendite rühmitamispõhimõtete ja -
meetodite põhjendamisega ning arendamisega.
Takson – süstemaatika ühik, mis ühendab organisme
mingite sarnaste omaduste
alusel ühte gruppi.
Klassifitseerimise mõte on võimaldada järelduste ja ennustuste tegemist organismide
ehituse ja
funktsioneerimise kohta.
Bioloogilise süstemaatika ülesanne on luua süsteem, mis võimaldaks taolisi järeldusi
teha võimalikult palju ja täpsel.
Taksoneid ehk süstemaatilisi ühikuid on mitut
järku. Neist peamised on, kõrgemast
madalamale loetledes: RIIK → HÕIMKOND → KLASS → SELTS → SUGUKOND →
PEREKOND → LIIK.
MLB 6001 Üldbioloogia 31
Peale põhiühikute kasutatakse ka vahepealseid
taksonite järke, eesliitega
ülem- ja
alam-, näiteks ülemsugukond, alamperekond jne.Tihti eristatakse ka liigisiseseid ühikuid
– näiteks alamliik, teisend ehk varieteet jt.
Enamasti kasutatakse
hierarhilist süsteemi. See tähendab, et iga takson kuulub ainult
ühte temast vahelult kõrgemat järku taksonisse.
Taksonite nimetamiseks kasutatakse
teaduslikke ladinakeelseid nimetusi, mille
moodustamine ja fikseerimine toimub vastavalt
rahvusvahelistele nomeklatuuri
koodeksitele. Seejuures on olemas eraldi koodeksid loomade, taimede ja bakterite
nimetamiseks. Ladinakeelsed liiginimed on kahesõnalised (binaarsed). Liigist kõrgemate
taksonite nimetused on ühesõnalised.
Peale teaduslike nimede on paljudel rühmadel olemas ka
rahvapärased nimed.
Looduses leidub üksteisega väga sarnaseid organisme, kes erinevad selgesti teistest
omavahel sarnaste isendite gruppidest. Vahevorme selliste gruppide vahel peaaegu ei
esine. See nähtus ongi olnud aluseks organismide rühmitamisel
liikideks.
Bioloogiline liigikontsenptsiooni kohaselt koosneb liik reaalselt või potentsiaalselt
ristuvate isendite populatsioonidest. Liigikaaslased
tunnevad üksteist ära ja liik kujutab
endast looduses samaviisi reaalset üksust nagu näiteks rakkudest koosnev organism või
omavahel suhtelvaist indiviididest moodustunud
parv . Bioloogilise liigi aluseks on
suguline äratundmine, geneetiline, füsioloogiline ja käitumuslik
sobivus .
Nominalistliku kontseptsiooni kohaselt on liik kokkuleppeliste piiridega, sarnaste
isendite kogum. Nominalistliku
vaate järgi on
reaalsed üksnes isendid, mistahes
taksonid on aga inimeste poolt ette nähtud tunnuste alusel moodustatud abstraktsioonid.
Liikide ühendamisel kõrgematesse taksonitesse on aluseks
homoloogia ehk
ehitusplaaniline sarnasus.
Homoloogiline ehitus on olnud võrdlevas anatoomias aluseks organismi
fülogeneetilise
suguluse kindlakstegemisel.
Arvatavasti on kõik praegu
Maas elavad organismid omavahel sugulased, s t nad on
ühiste eellaste kaudu fülogeneetiliselt seotud. Kuna enamikul organismidel on kaks
vanemat nin vanemail leidub kunagi elanud ühine esivanem, siis kujutab fülogenees
endast genealoogilist võrgustikku ehk päritoluvõrgustikku.
Genealoogiliseks võrgustikuks nimetatakse fülogeneesi niisugust kujutust, mis
näitab organismide geneetilise materjali päritolu ehk kõigi teadaolevaid eellasi.
Fülogeneesipuuks nimetatakse organismirühmade põlvnemissuhete lihtsustatud
kujutust, milles iga haru lähtub vaid ühest eelasharust.
Ka
taksonite hierarhiline süsteem on
kujutatav puuna – taksonoomilise puuna.
25. Liigi mõiste. Liik bakteritel, eukarüootidel, apomiktilistel organismidel. Võimalikud raskused liigi (mõste) piiritlemisel Esmane liigi
kriteerium :
Samasse liiki kuuluvad isendid, kes (potentsiaalselt)
suudavad omavahel ristudes anda täisväärtuslikke (paljunemisvõimelisi) järglasi.
Kõigil organismidel ei saa liigi mõistet edukalt rakendada:
1. Suguline paljunemine puudub,
a)
Esmaselt: sugulist paljunemist pole
....
Kõik kommentaarid