Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse

Molekulaar- ja rakubioloogia KT II (2)

5 VÄGA HEA
Punktid

Esitatud küsimused

  • Mis on sigma faktori funktsioon?
  • Mis juhtub sigma faktoriga initsiatsiooni lõppedes?
  • Mis on peamine erinevus prokarüootse mRNA ja eukarüootse mRNA vahel?
  • Mis on TBP funktsioon initisiatsioonikompleksi tekkes?
  • Missugused TAFid on TBPga vahetus interaktsioonis?
  • Missugune TFII valk hüdrolüüsib ATPd ja mis protsessiga on tegu?
  • Kus toimub transkriptsioon?
  • Kus transkriptsioonifaktorid rakus paiknevad?
  • Mis on sidumissait?
  • Mille poolest ta a sarnaneb b erineb TATAbox-st?
  • Kuidas tuvastada transkriptsiooniregulaatorite märklaud geene?
  • Miks kasutatakse "heat-shock" geenide promootoreid?
  • Mida tähendab väljend "kasutades lacZ reporterina" ja mis analüüsimeetodiga on tegu?
  • Mis roll on histoondeatsetülaasidel HDAC ja mis funktsioon on histoonatsetülaasidel HAT?
  • Mis on nukleosoom?
  • Kuidas mõjutab kromatiini struktuur transkriptsiooni?
  • Mida siin tahetakse kas kaksiheeliksi mõju v?
  • Mis on kromatiini metüleerimise tähtsus?
  • Milleks kasutatakse FISH analüüsi?
  • Mis on MARide funktsioon?
  • Mida katalüüsib splaisosoom?
  • Missugused U snRNAd osalevad pre-mRNA splaisingu regulatsioonis?
  • Mis on GT-AG reegel?
  • Millest selline geeni versus mRNAde pikkuse erinevus on tingitud?
  • Mida näitab rakule antud ajahetkes iseloomulik mRNA tase?
  • Mis on RNA editing?
  • Mis ensüümid katalüüsivad protsessi RNA editing?
  • Mis vahe on inteiinil ja intronil?
  • Mis juhtub kui polüadenülatsiooni motiivis AAUAAA või RNAPolII CTD alas on mutatsioon?
  • Mis vahe on miRNAl ja siRNAl?
  • Missugused valgud selles osalevad?
  • Mis on genoom proteoom?

Lõik failist

MIHKEL HEINMAA 2010
TRANSKRIPTSIOON ja RNA PROTSESSING
15
MOLEKULAAR -
JA RAKUBIOLOOGIA | YTM0011

II
KONTROLLTÖÖ KORDAMISKÜSIMUSED | MIHKEL HEINMAA TTÜ YAGB31 |
08/10/10
TRANSKRIPTSIOON
JA GEENI REGULATSIOON

  • Missuguseid geneetilise infovahetuse protsesse tähistavad a) transformatsioon , 2) transkriptsioon 3) translatsioon .
    Transformatsioon
    on geneetilise info ülekandumine ühest bakterirakust teise rakust
    isoleeritud DNA abil.
    Transkriptsioon
    ehk RNA süntees on DNA ühe ahela (matriitsahel) alusel
    komplementaarse RNA ahela süntees.
    Translatsioon
    on mRNA põhjal ribosoomides valguahela süntees.
  • Võrdle transkriptsiooni initsiatsiooni protsesse prokarüootidel ja eukarüootidel.
    Prokarüoodi
    transkriptsiooni initsiatsioon
    :
    RNA
    polümeraas seondub ühega paljudest spetsiifilistes tranksriptsiooni
    faktoritest (σ-faktor) moodustades holoensüümi. Sellises vormis
    suudab ta ära tunda ja seonduda promootor-piirkonnaga DNA’l. -35 –
    -10 regioon sisaldab prokarüootset promootorit. DNA matriitsahel,
    mis on +1 ja terminaatori vahel transkribeeritakse RNA’sse, mis
    siis transleeritakse valku. Selles staadiumis DNA on kaksikheeliks
    (suletud). DNA põimub lahti üksikahelaks initsiatsiooni saidi
    lähedal (+1). RNA-polümeraas transkribeerib DNA’d (β-alaühik
  • Vasakule Paremale
    Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #1 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #2 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #3 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #4 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #5 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #6 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #7 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #8 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #9 Molekulaar- ja rakubioloogia KT II #10
    Punktid 100 punkti Autor soovib selle materjali allalaadimise eest saada 100 punkti.
    Leheküljed ~ 10 lehte Lehekülgede arv dokumendis
    Aeg2012-10-15 Kuupäev, millal dokument üles laeti
    Allalaadimisi 290 laadimist Kokku alla laetud
    Kommentaarid 2 arvamust Teiste kasutajate poolt lisatud kommentaarid
    Autor Mihkel Heinmaa Õppematerjali autor
    Valkna loetava aine teise tesi kordamisküsimuste vastused

    Sarnased õppematerjalid

    thumbnail
    8
    doc

    Molekulaarbioloogia teise KT vastused

    ­ introni 5' otsa lahtilõikamine, mille tagajärjel introni ees olev ekson lahutatakse ülejäänud mRNA järjestusest. Introni 5' ots keeratakse aasana tagasi ja ühendatakse introni sees olevasse kindlasse järjestusse nukleotiidiga A, mis asub 18-38 nukleotiidi introni algusest 3' suunas. 2 etap ­ introni 3' otsa lahtilõikamine, mille tulemusena intron vabaneb pre mRNA koosseisust. 3 etap ­ allesjäänud eksonite alad ühendatakse ligaaside abil ning tekib ainult eksonitest koosnev mRNA molekul. Intronid degradeeritakse. 36. U snRNAd osalevad pre-mRNA splaisingu regulatsioonis: 5 snRNPd: U1, U2, U4, U5, U6. 37. GT-AT reegel ­ on selline vaatlus, et kõik intronid DNAs algavad GT nukleotiitudega (guaniin, tümiin) ja lõppevad AG nukleotiitidega (adeniin, guaniin). Kui DNA on transkribeeritud RNAsse, intronid on eemaldatud RNAst mehaniismi abil, mis tunneb ära neid nukleotiitide alguseid ja lõppe ­ RNAs nad oleksid CU (tsütosiin, uratsiil) ja AC (adeniin, tsütosiin). 39

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    thumbnail
    20
    docx

    Molekulaar- ja rakubioloogia konspekt

    substraadina. Ribosoomi subühikute vahele jääb põhiline aktiivtsenter, mis moodustab tRNA'de sidumiskohad: · A-saiti seondub aminoatsüül-tRNA - paikneb nii väiksemal kui suuremal subühikul. · P-saiti seondub peptidüül-tRNA. · E-sait on deatsüleeritud tRNA spetsiifiline. TRANSKRIPTSIOON on matriitssüntees, mille käigus sünteesitakse DNA molekuli ühe ahela nukleotiidse järjestusega komplementaarne RNA molekul. Transkriptsioon toimub eukarüootidel tuumas, prokarüootidel tsütoplasmas. Prokarüoodi transkriptsiooni initsiatsioon: RNA polümeraas seondub ühega paljudest spetsiifilistes tranksriptsiooni faktoritest (-faktor) moodustades holoensüümi. Saab seonduda promootor-piirkonnaga DNA'l. -35 ­ -10 regioon sisaldab prokarüootset promootorit.. Selles staadiumis DNA on kaksikheeliks. DNA põimub lahti üksikahelaks initsiatsiooni saidi lähedal. RNA-

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    thumbnail
    54
    pdf

    MOLEKULAARBIOLOOGIA ja RAKUBIOLOOGIA

    1 MOLEKULAARBIOLOOGIA. 1. Kui aatom loovutab elektroni täielikult teisele aatomile, missugused keemilise sidemega on tegemist? Ioonside, sellised ained lahustuvad hästi, kuna ioonide hüdratatsioonienergia on suurem kui kristalli võreenergia 2. Miks vesi on hea lahusti (solvent)? Vesi on hea lahusti, sest ta lahustab nii tahkeid, vedelaid kui ka gaasilisi aineid. Vee molekul moodustab dipooli ning aatomid omandavad osalise laengu. Polaarsete ühenditega moodustab vesiniksidemeid, mis tagavad stabiilsust. 3. Termodünaamika II seadus. Kõik protsessid kulgevad tasakaalu e. minimaalse potentsiaalse energia poole e. entroopia kasvu suunas. Entroopia (S) on korrastamatuse mõõt [J/mol*K], korrastatud ­ madal entroopia. Isoleeritud süsteemid püüavad korrastatud olekust korrastamata poole. Tasakaal on siis, kui entroopia on maksimaalne.Entroopia muutus on

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    thumbnail
    7
    doc

    Nimetu

    MOLEKULAARBIOLOOGIA. 1. Missugusi geneetiliseinfovahetuse protsesse tähistavad 1) transformatsioon, 2) transkriptsioon 3) translatsioon. Transkripitsioon ­ RNA molekuli sünteesimine vastava DNA molekuli pealt RNA-polümeraasi abil. Translatsioon ­ valgu sünteesimine vastava mRNA molekuli pealt, toimub ribosoomide abil. Transformatsioon ­ pärilik muutus eukarüootse raku omadustes (geneetilise info kadndumine ühest bakterirakust teise, rakust isoleeritud DNA abil). 2. Mis on TBP funktsioon initisiatsiooni kompleksi tekkes? TBP ­ TATA Binding Protein TBP seondub DNA TATA-box saidi külge painutades DNA molekuli nurga alla 3. Kas transkriptsioonifaktorid (aktivaatorid) interakteeruvad otse (vahetult) TBPga? Mitte kõik, interaktiveeruvad vaid TFIIB ja TFIIF+polII. 4. Mis on transkriptsiooni aktivaatori 2 funktsionaalset domääni ja kuidas mutatsioonid ühes või teises neist mõjutavad

    Kategoriseerimata
    thumbnail
    23
    docx

    Nimetu

    viimane veel eriti kondenseerunud vormiks ning lõpptulemus on metastaasi kromosoom. Kromatiini pakkimine: nukleosoomid koosnevad valgulisest tüvest, millele DNA on keermeliselt ümber keeratud, oktameerne tüvi koosneb iga histooni (H2A, H2B, H3 ja H4) kahest koopiast, 30-nm fiibrid, neis on nukleosoomid pakitud irregulaarse struktuurina või solenoidi struktuuri, H1, viies histoon, on solenoidi sisemuses otseses kontaktis DNAga, nii et iga H1 molekul on assotsieeritud ühe nukleosoomiga. Eu- ja heterokromatiin. Eukromatiin on ala, kus kromatiin on vähem kondenseerunud, annab värvimisel heledaid vööte, suurem osa transkriptsioonist toimub eukromatiini piirkondades. Heterokromatiin on ala, kus kromatiin on rohkem kondenseerunud, annab värvimisel tumedaid vööte, esineb sagedamini tsentromeeride piirkonnas ja telomeeride aladel. Kromatiid. Iga metafaasi kromosoom koosneb kahest tsentromeerile kinnitunud tütarkromatiidist. 9

    Kategoriseerimata
    thumbnail
    8
    docx

    Molekulaarbioloogia II osa

    laengud, aga nii c. pea kui tugevad laengud on ära lõigatud, siis kromatiini sidemed lõdvened, ja bio- d. molekulid saavad siis sinna ligi pugeda. 15. Milleks kasutatakse FISH analüüsi? a. FISH ­ fluorescence in situ hybridisation b. Kasutatakse erinevate DNA ja RNA järjestuste detekteerimiseks rakkudes ja kudedes. 16. Mis on MARide funktsioon? a. Iga kromosoom on üks DNA molekul, mis on pakitud nukleosoomidesse ja keeratud 30 b. nm kiududeks. Viimased kinnituvad valgumaatriksile spetsiifiliste järjestuste (MARide) c. abil. 17. Kuidas tuvastada transkriptsiooniregulaatorite märklaud gene? a. Footprinting. Märklaud geenid ei sisalda TATAboxi. 18. Miks kasutatakse "heat-shock" geenide promootoreid? a. Sidumine proksimaalse elemendi teatud järjestusele stimuleerib

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    thumbnail
    2
    doc

    Spikker molekulaarbioloogia teiseks kontrolltööks

    Cappimine- Kui RNAPolII on jõudnud sünteesida uuest transkriptist 25-30 nukleotiidi, siis 7metüülguanosiin ja teised 5'cap komponendid on juba mRNAde 5' otsa küljes. Seda algset staadiumi RNA protsessingus katalüüsib dimeerne capping ensüüm, mis seostub RNAPolII fosforüülitud CTDgaPolI- sünteesib ribosomaalset RNAd. CTD saba polII´l karboksüterminaalne domään, PolII- võib reguleerida väikesi tuuma RNAsid.PolII omab forforüleerivat karboksüterminaalset domääni.Osaleb lühikeste RNAde sünteesis( U6, 7s) Poly(A) saidid- elemendid ( konkreetsed järjestused) mille peale istub RNA sünteesi lõpetav/termineeriv kompleks lisatakse u 200bp adeniini saba. Pre-mRNA- 5'müts, eksonid, intronid, kaitsev 3' saba millel Poly(A) järjestus. Pre-mRNA allutatakse splaissingule-tekib küps mRNA mille tunnuseks on 5' cap ja 3' saba. RNProteins tunnevad ja detekteerivad RNAd tekib RNParticle. AG reegel- Ülavoolu: Intron algab GUga, eks

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    thumbnail
    5
    pdf

    Molekulaar- ja rakubioloogia KT 2

    box’ile. • “capping” on struktuur maatriks RNA 5’-otsas. • Poly(A) on suure hulga adenosiinmonofosfaadi jääkide kinnitamise protsess primaatse mRNA 3’-otsa külge. • Splaising on protsess, mille käigus lõigatakse rakutuumas asuvast RNA molekulist välja intronjärjestused ning allesjäänud otsad ühendatakse. • RNAi on süsteem elavates rakkudes, mis osaleb geeniaktiivsuste määramisel. • miRNA on mikroRNA, üheahelaline RNA molekul 21-23 nukleotiidi pikkune. Peamine funktsioon: geeni regulaator. • siRNA on silencingRNA – 2ahelalilised RNA molekulid, 20-25 nukleotiidi pikkused. • RNA editing - RNA järjestuse redigeerimine. Protsess, mille tagajärjel muudetakse pre-mRNA järjestust. ApoB geen mis kodeerib kahte alternatiivset seerumvalku apoB100 ja apoB48. Uus nukleotiid, uus aminohape, tekib teistsugune valk. Osata joonistada:

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud




    Meedia

    Kommentaarid (2)

    on1on profiilipilt
    on1on: Tänud! Oli abiks.
    06:30 11-11-2012
    noncan profiilipilt
    noncan: väga hea konspekt
    14:53 13-01-2013



    Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun