Lisaülesanne praktikumist puudunutele Koostage õigusalase sisuga või õiguslikku kontekstiga väitlause (kui peate tegema kaks lauset, siis peavad need olema erinevat tüüpi). Teostage selle lause ümberpööramine, muutmine, vastandamine ja transpositsioon. Asetage lause loogilisse ruutu ja omistage talle tõeväärtus (seda tuleb põhjendada). Koostage laused loogilise ruudu ülejäänud nurkade jaoks ning näidake loogilise ruudu omaduste abil, millised on nende lausete tõeväärtused. 1) Ükski kuritegu pole õigustatud (E) Ümberpööramine: Ükski õigustatud tegu pole kuritegu. Muutmine: Kõik kuriteod on mitteõigustatud. Vastandamine: Mõni mitteõigustatud tegu on kuritegu.
Transkribeeritakse ja transleeritakse palju geene korraga. Transkriptsioon ja translatsioon toimuvad üheaegselt ning samaaegselt mRNA degradatsiooniga 8. Kirjelda bakterite paljunemise võimalusi? - Bakterite paljunemine toimub peamiselt pooldumise teel, kuigi on olemas ka midagi sugulise paljunemise sarnast. Plasmiidid -- muutuvad episoomideks, kui ühinevad bakteri-DNA-ga. Transposoonid ehk "hüppavad" DNA lõigud -- transpositsioon on protsess, mille käigus liikuvad DNA fragmendid sisenevad peremehe genoomi järjestusse DNA muutlikkus! 9. Bakteri genoomi iseloomustus? - vt punkt 7 10. Geeniülekande viisid bakteritel (3) ja nende lühike iseloomustus? - Geneetilise info ülekandeks bakterite vahel on 3 võimalust: Transformatsioon doonori DNA satub retsipienti väliskeskkonnast. Transduktsioon bakteri DNA kandub ühest rakust teise faagide abil.
Farmakogeneetika aitab valida patsiente, kelle jaoks ravim effektiivne (rohelised) ja kes on ülitundlikud (sinine). Ebaeffektiivselt vastavate patsientide (punane) väljaselekteerimine võimaldab edasised katsed muuta effektiivsemaks ja odavamaks. Momendil 10-15 aastat! --- Geeniduplikatsioonide tekkemehhanismid *Tandeemne geeniduplikatsioon ebavõrdse ristsiirde või õdekromatiidide vahetuse kaudu. *Duplikatiivne transpositsioon retrotransposonite poolt vahendatud. *Horisontaalne geeniülekanne geeniülekanne erinevate genomide vahel nt. (bakteritelt selgroogsetele). *Segmentaalne duplikatsioon duplikatsioon suurte blokkidena. *Polüpoidsuse teke terve genoomi ploidia kordistumine Selgroogsete genoom on arenenud läbi ploidsuse kasvu duplikastioonide teel. *Enamik tänapäevaseid liike omavad degenereerunud polüploidiat või on polüploidsed.
praegu. Siiski ei pea esinema kõik kolm varianti. Hea näide on uudised. Uudisteformaat muutub läbi aja, algselt olid esindatud vaid siin ja praegu, nüüd tuuakse järjest rohkem sisse mina. Ajaloo aktualisatsioon - kindel maailm, koht. 0-aktualisatsioon - kehtib väljaspool kõneakti, väljaspool olemasolevat maailma, teadus kitsendab järjest seda piirkonda, väga väheste asjade kohta saab öelda, et need kehtivad väljaspool meie aega ja ruumi. meta-aktuaalsus - keeleline, meta-keel. Transpositsioon - loomuliku keele abil võime öelda kõike, võime valetada ka grammatika tasemel. Kasutada olevikku tuleviku tähenduses (mitte küll eesti keeles, vaid teistes indoeuroopa keeltes).
(inverted repeat) ehk 9 50 bp otsmised pöördkordusjärjestused (vastassuunalised, palindroomsed). Järjestused, mis on ühesugused 5' 3' suunas lugedes Otsekordusjärjestused (DR järjestused, nt IS elemendil) - IS-elemendi insertsioonil tekivad elemendi otstes 2 13 bp pikad DR- (direct repeat) ehk otsekordusjärjestused (vt. AH lk. 591, joon19.2) Palindroomne järjestus ehk vastassuunaline järjestus Transpositsiooniimmuunsus - nähtus, kus transpositsioon muutub harvemaks, kui sama TE on juba DNA -s cDNA dna molekult, missünteesitakse rna-lt ning siseneb uude kohta genoomis. 11. liigiti konserveerunud järjestused - Genoomides erinevatel liikidel sarnased piirkonnad, mis sisaldavad tavaliselt elutähtsaid geene. Nende alade vahele jäävad suhteliselt muutlikud genoomi regioonid. Muutuvas alas on iseloomulikud nn. "hüppavad geenid" ehk
Suures hulgas teatud korduvaid DNA järjestusi sisaldavad piirkonnad · kõrgelt korduvad järjestused DNA lihtjärjestused (ingl simple sequence DNA) paiknevad kromosoomide tsentromeerides ja telomeerides tandeemselt üksteise järel (= satelliit-DNA) · Mõõdukalt korduv DNA (=mobiilsed DNA elemendid, dispergeerunud DNA) paiknevad genoomis hajali Transposoonid (Transpositsioon toimub DNA vahendusel) Viiruste retrotransposoonid (Transpositsioonis osaleb RNA) Mitteviiruslikud retrotransposoonid (Transpositsioonis osaleb RNA) Pikad dispergeerunud elemendid (LINE-d -long interspersed elements 6-7kb) Lühikesed dispergeerunud elemendid (SINE-d 100-500 bp) Mittekodeeriv DNA (geenide regulaatorpiirkonnad, intronid, geenidevaheline DNA)
I: Mõni S on P O: Mõni S pole ¬P I: Mõni P on S O: Mõni S pole P I: Mõni S on ¬P I: Mõni ¬P on S O: Mõni ¬P pole ¬S 6_fl_vi-x ÜLESANDEID: 6. Teostage otsustuse muutmine, ümberpööramine, vastandamine ja transpositsioon. 6.1. Kõik intellektuaalid on skeptikud. See on üldjaatav otsustus SaP. S intellektuaalid, P skeptikud. Muutmine (S e ¬P): Mitte ükski intellektuaal ei ole mitteskeptik. Ümberpööramine (P i S): Mõni skeptik on intellektuaal. (Lim!) Vastandamine (¬P e S): Mitte ükski mitteskeptik ole intellektuaal. Transpositsioon (¬P a ¬S): Kõik mitteskeptikud on mitteintellektuaalid. 6.2. Tõeline õpetlane on tagasihoidlik. (Ilmutatud kujul: Kõik tõelised õpetlased on
- Telomeerid - DNA ahela piirkond, mis asub kromosoomi otstes - Polüploidsus - kromosoomikomplektide paljukordsus - Karüotüüp - Kromosoomistik ehk karüotüüp on kromosoomide kogum indiviidi keha- või generatiivse raku tuumas - Karüogramm - kromosoomipilt ehk kromosoomistiku süstematiseeritud kujutis metafaasi kromosoomidest suurus, kuju, muster - Transposoon - mobiilne DNA element, mis kannab mingit geneetilist markerit - Transpositsioon - protsessi, mille käigus järjestusi kopeeritakse ja uude kohta sisestatakse - Retrotransposoon - DNA segmendid, mis amplifitseeruvad ensüüm pöördtranskriptaasi vahendusel ja liiguvad iseseisvalt genoomi ühest piirkonnast teise - Pseudogeen - ekspresseeruva geeniga homoloogne (sarnane) geen, mis ei ekspresseeru. Funktsiooni kadumise põhjuseks on üks või mitu inaktiveerivat mutatsiooni, mis: termineerivad translatsiooni, blokeerivad mRNA protsessingu
Lihtne kategooriline süllogism. - Induktsioon – Induktiivne arutlus on arutlus, milles tuletis on kehtiv mingi tõenäosuse või tõesusastmega. Enamasti üksikult üldisele. - Analoogia – Arutlus analoogia põhjal on järeldamine, mis on enamasti suunatud üksikult üksikule. Arutluse aluseks on arutlusobjektide samasus. Arutlusobjektide suure hulga korral võib muutuda analoogiaarutlus induktiivseks. 11. OTSENE JÄRELDUS; VÄITE ÜMBERPÖÖRAMINE, MUUTMINE, VASTANDAMINE JA TRANSPOSITSIOON. Otsese järelduse eelduseks on üks kategooriline lihtväide. ! ! 1. muutmine: ! ! ! eitav väide jaatavaks (või vastupidi); ! ! ! predikaat vasturääkivaga. ! 2. ümberpööramine: ! ! ! Subjekti ja predikaadi asukoht muudetakse; ! ! ! üldjaatavast lausest tuleneb limiteeritud osaline järeldus; ! ! ! osaeitavast väitest pole võimalik !järeldada. ! 3. vastandamine: muutmine + ümberpööramine !
Lihtne kategooriline süllogism. - Induktsioon Induktiivne arutlus on arutlus, milles tuletis on kehtiv mingi tõenäosuse või tõesusastmega. Enamasti üksikult üldisele. - Analoogia Arutlus analoogia põhjal on järeldamine, mis on enamasti suunatud üksikult üksikule. Arutluse aluseks on arutlusobjektide samasus. Arutlusobjektide suure hulga korral võib muutuda analoogiaarutlus induktiivseks. 11. OTSENE JÄRELDUS; VÄITE ÜMBERPÖÖRAMINE, MUUTMINE, VASTANDAMINE JA TRANSPOSITSIOON. Otsese järelduse eelduseks on üks kategooriline lihtväide. ! ! 1. muutmine: ! ! ! eitav väide jaatavaks (või vastupidi); ! ! ! predikaat vasturääkivaga. ! 2. ümberpööramine: ! ! ! Subjekti ja predikaadi asukoht muudetakse; ! ! ! üldjaatavast lausest tuleneb limiteeritud osaline järeldus; ! ! ! osaeitavast väitest pole võimalik !järeldada. ! 3. vastandamine: muutmine + ümberpööramine !
Hull - loogiline positivism, mehhanistlik lähenemine, füsioloogilised muutujad. siimul drive vastus. Skinner- teadvust kui mittemat nähtust pole, operantne käitumine, kinnitus, keskkond, kinnituse defineerimine läbi käitumise efektiivsus. Geštaltpsühholoogid Wertheimer - phi-fenomeen, näiv liikumine. illusioon, et valgus liigub ühelt positsioonile teisele. Koffka - geograf. ja käitumislik keskkond. Köhler - tasakaal, pregnantsuse seadus. taju konstantsus. insight transpositsioon. Lewin - väljateooria. eluruu. sub reaalsus. grupidünaamik. Teadvustamata materjali ei saa mõjutada inimese käitumist <> psühhoanalüüs. Psühhoanalüüs - Freud - teadvuses represseeritud traumaatiline sündmus. seksuaalsus. vabade assotsiatsioonide meetod. Instinkt. libiido. alatadvus. lapsepõlv Id – primaarne psühholoogiline reaalsus; juhtiv jõud, instinktid, libido (instinktide energia); reflektoorne vajaduste rahuldamine, objekti
Wertheimer (founded gestaltpsyuch with his paper on phi phenomenon)- phi-fenomeen (the phi phenomen indicates that conscious experiance cannot be reduced to sensory experience), näiv liikumine. illusioon, et valgus liigub ühelt positsioonile teisele. Koffka - geograf. ja käitumislik keskkond. Köhler - tasakaal, pregnantsuse seadus(mentaalne kogemus organiseeritud lihtsaimal viisil, mis antud tingimustes on võimalik). taju konstantsus. insight transpositsioon. Lewin - väljateooria. That branch of physics that studies how energy distributes itself within physical systems. Some systems energy can move freely (solar systems) and in some systems energy must pass thru wires, consensers, resistors etc(electric circuit). However energy will always distribute itself in the simplest most symmetrical way possible. According to gestaltspsy. Brain is physical system whose activity could be understood in terms of field theory
23. Homoloogid, ortoloogid ja paraloogid. Homoloogid on väga sarnase järjestusega liigisisesed geenid ( ja globiinid). Ortoloogid on erinevate genoomide geenid, mis on seotud ühise eellase kaudu (inimese ja hiire müoglobiinid). Paraloogid on ühe genoomi geenid, mis on tekkinud duplikatsiooni tulemusena (inimese müoglobiin ja tsütoglobiin). Geeniduplikatsioonide tekkemehhanismid: Tandeemne geeniduplikatsioon ebavõrdse ristsiirde või õdekromatiidide vahetuse kaudu, Duplikatiivne transpositsioon retrotransposonite poolt vahendatud, Horisontaalne geeniülekanne geeniülekanne erinevate genoomide vahel (nt. bakteritelt selgroogsetele), Segmentaalne duplikatsioon duplikatsioon suurte blokkidena, Polüploidsuse teke terve genoomi ploidia kordistumine. 24. Kromosoomide ja genoomide evolutsioon. Võrreldes H.influenza ja M.genitaliumi on minimaalse genoomi suurus 300 geeni (arvestatud ortoloogsete geenide hulka ja geeniasendusi s.t. samaseid funktsioone kannavad mitteortoloogsed
2. VÄITE ÜMBERPÖÖRAMINE - vahetatakse omavahel eelduses subjekti ja predikaadi rolli täitvad terminid. Väite kvaliteet ei muutu. Nt. Ükski tudeng pole kala.-------Ükski kala pole tudeng. 3. VÄITE VASTANDAMINE – alguses teostatakse eelduse muutmine ning seejärel muudetud väite ümberpööramine. Väite kvaliteet muutub esialgsega võrreldes vastupidiseks. Nt. Kõik tudengid on inimesed.------Ükski mitteinimene ei ole tudeng. 4. Väite transpositsioon – kõigepealt teostatakse väite muutmine, seejärel muudetud väite ümberpööramine ning seejärel ümberpööratud muudetud väite veelkordne muutmine. Nt. Kõik tudengid on inimesed. Kõik mitteinimesed on mittetudengid. KATEGOORILINE SÜLLOGISM SÜLLOGISM on arutlus, mis koosneb kahest eeldusest ja ühest lõppjäreldusest. Lihtne kategooriline süllogism – moodustavad kolm atributiivset lihtväidet,
Need liikumised tekitavad liikumisparalla. Lähedasemad esemed näivad liikuvat kiiremini seejuures vaatleja liikumisele vastassuunas. Samuti tekitab liikumine nn optilise voolu mustreid · tekstuurigradient 2. Tervikliku vormi tajumine. Tajulise grupeerimise printsiibid. Kuidas seostub maksimaalse sarnasuse/tõenäosuse printsiip tajulise grupeerimisega? · Nägemise puhul toimub objektide ära tundmine peamiselt nende vormitunnustel. Vormi transpositsioon : tajutud vorm jääb samaks isegi siis kui kõik tema osad muutuvad, st vaatamata teatavale variatiivsusele esinemisviisis või teatavate osade varjatusele · Gestaltpsühholoogia rõhutas et organisatsioon ja struktuur on kogu vaimse tegevuse aluseks. Rõhutab eelkõige tervikliku vormi tajumise tähtsust, kusjuures selle terviku kujunemises on tähtsad terviku osade vahelised suhted ja nende kujunemise printsiibid.
· tarkvarapõhine pääsu reguleerimine andmetele ja infosüsteemidesse + autentimistehnika · krüptograafia võtted teabe teisendamine loetamatule kujule 64. Krüptograafia (cryptography) oli ajaloolises plaanis teadus, mis tegeles teabe (andmete sisu) peitmisega võõraste pilkude eest selle "kentsaka" üleskirjutamise teel Kaks põhivõtet: · substitutsioon (substitution) olemasolevate märkide asendamine teiste märkidega · transpositsioon ehk permutatsioon (transposition, permutation) olemasolevate märkide järjekorra muutmine 65. Kreeka krüptograafia: Polybiose ruut : Iga täht asendati kahekohalise numbriga, nt EESTI asendus järjendiga 5151344442 67. Kreeka transpositsioonisiffer : Tuntud nime Skytale all · esmamainitud ca 500 a. e.Kr. · sisaldab linti (rihma), millele on kantud tähed ja õige jämedusega pulka · linti pulgale kerides saab teksti lugeda ja kirjutada 69
(üldine) rekombinatsioon võib toimuda iga kahe DNA molekuli vahel, millel esineb järjestuste homoloogiat. Eukarüootides sagedane meioosis. Kõikides organismides roll replikatsioonis DNA vigade parandamisel. Asendispetsiifiline rekombinatsioon rekombinaasid lõikavad DNA-d spetsiifiliste järjestuste juurest ning ligeerivad väljalõigatud lõigud teise DNA molekuli. Võib toimuda igas rakus. Funktsioonideks DNA integratsioon ja geeni ekspressiooni regulatsioon. Transpositsioon mobiilsete DNA segmentide lülitamine uude asukohta genoomis, seda nii kromosoomi piires kui kromosoomide vahel. DNA vigade tüübid: replikatsioonivead, kühmud liigsete või puuduvate jääkide tõttu, UV indutseeritud muutused nagu pürimidiini dimeerid, fosfodiestersidemete või desoksüriboosi katkestused ja kovalentsed ristsidemed ahelate vahel.
võib olla toimunud ühe perekonna liikide vahel. Kahel C. albicans isolaadil 301 isolaadi seas tehti kindlaks genotüüp, millises 25S rRNA geeni I grupi intronisse oli transponeerunud C. dubliniensis introni sarnane insertsioon (Tamura et al., 2001). Transposoonid on geneetilised elemendid, mida on leitud nii pro- kui eukarüootides. Erinevalt teistest geenidest on nad võimelised liikuma peremeesgenoomi sees uude asupaika. Transposoonide transpositsioon kodeerivatesse DNA järjestustesse ja nende poolt algatatud kromosoomide ümberkorraldustel on suur mõju geeniekspressioonile ja genoomi evolutsioonile. Kuigi hüüfe moodustavatel seentel avastati transposoonid alles hiljuti, leitakse neid üha enam ja seostatakse HGT-ga (Kempken & Kuck, 1998) (joonis nr 2 tähistatud TY). Viimased uuringud on näidanud, et kuigi 20% kirjeldatud seentest on arvatud olevat mittesuguliselt ja
Paratekst-põhiteksti ümbritsev abitekst, epigraafid(illustratsioonid) (annutatsioon(lühikokkuvõtte) Metatekst-kriitilised,kommenteerivad artiklid, silub ilukirjanduslikule tekst teed Arhitekst-teksti tüübi v zanri määratlus,laulud Hüpertekst- olemasolu sõltub originaaltekstist- paroodia, pastiöhe?-teiste tekstide katkenditest koostatud tekst Genette'i hüpertekstid Transformeerivad: mänguline (paroodia), satiiriline (travestia), tõsine (transpositsioon) Imiteerivad: mänguline (pastiche), satiiriline (sarz), tõsine (võltsing) 5.Narratoloogia e jututeooria, ühendab psühhe,teadlasi,kino jne, palju laiem kui lissalt kirj teksti haru,tnp narratoloogia algas muinasjutu uurimisest Vladimir Propp "Võlumuinasjutu morfoloogia" (1928; ingl. 1958) Muinasjutt on elementaarne kirjanduslik (fiktsionaalne) vorm Muinasjutu minimaalseks ühikuks on funktsioon
Aktiivsem praegu visuaalne kunst, mitte kirjandus (siiani rääkisime signifatiivsest+? Vm semantikast, mis väljendab mingit tähendust) Referentsiaalne (osutav) semantika 2 võimalust seletada asju: kirjeldamine osutus on lihtsam võimalus. Osutus kui index (väliste parameetritega seotud) (see, too, mina, sina, meie teie, siin, seal, nüüd, siis) Kõneakti aktualiseerimine Tekstuaalsus tekst kui signaal Osutus: märk -> signaal > referent Struktuuri aktualiseerimine Vilem Mathesius Transpositsioon Valgusfoor- miks tänaval ja raamatus erinev? Kui raamatul valgusfoori pilt, siis see ei tähenda et me edasi ei loe ega puutu. Kui aga tänaval, siis peatume Märgil on tähendus, vastavalt see kuidas reageerime, on osutus Erinevatel märkidel võib olla sama tähendus. Nt valgusfoor ja ka stopp- märk mõlemad tähendavad "stopp edasi ei sõida". Aga osutus on teine. Ühel muutub punane värv roheliseks, läheb üle st. Sellel märgil ei lähe üle,
Geenide aheldus Geenide aheldus – samas kromosoomis ehk samas füüsilises üksuses paiknevad geenid jäävad kokku ka pärast meioosi Jaguneb kaheks: - Füüsiline aheldus – geenid asuvad samas kromosoomi DNA niidis - Geneetiline aheldus – lahknevad sõltumatult teineteisest Rekombinatsioon – vanematel mitteesinevate geenikombinatsioonide teke mittehomoloogsete kromosoomide ümberkombineerumisel ja homoloogsete kromosoomide ristsiirdel meioosis – krossingover ja transpositsioon - kui geenid avalduvad samas kromosoomis siis päranduvad nad koos samasse gameeti - Aheldunud geenide dihübriidsel ristamisel saame samad lahkenmissuhted kui monohübriidsel ristamisel Homoloogiliste kromosoomide sõltumatu lahknemine Nelja gameetide tüübi moodustumine dihübriidsel ristamisel geenide sõltumatul lahkenmisel - Kui geenid asuvad erinevates kromosoomipaarides siis lahknevad teineteisest sõltumatult
tähendusega, arutlus peab olema deduktiivselt kehtiv ning väited tõesed. Väidete tõesus pole oluline, kui eesmärgiks ongi üksnes kindlaks teha, mis millest deduktiivselt järeldub, sõltumata eelduste ja lõppjärelduse tõesusest või väärusest. 5.2. OTSESED JRELDUSED (immediate inference) Otsese (vahetu) järelduse eelduseks on üks kategooriline väide. Tuntuimad otsese järelduse tüübid on muutmine (obversion), ümberpööramine (conversion), vastandamine (contraposition) ja transpositsioon (transposition). Neile lisandub veel väite vastasseisude (opositsioonide) tuletamine loogilise ruudu abil. 9 Vt Mereste, 2001: 46jj. 6 Järgnevates järeldusskeemides on joone peal eeldus, joone all tulem. 1. Väite muutmine (obversion). Jaatav väide muutub eitavaks, eitav jaatavaks, predikaat asendatakse endisele vasturääkivaga. Järeldus muutmise teel on tegelikult ühe ja sellesama sisu ütlemine teisel viisil. A: Kõik S on P Kõik tudengid on inimesed.
· Homoloogiline ehk üldine rekombinatsioon võib toimuda iga kahe DNA molekuli vahel, millel esineb järestuse homoloogiat. Sagedane meioosis. Roll DNA vigade parandamisel. · Asendispetsiifiline rekombinatsioon rekombinaasid lõikavad DNA'd spetsiifiliste järjestuste juurest ning ligeerivad väljalõigatud lõigud teise DNA molekuli. Võib toimuda igas rakus. Roll DNA integratsioon ja geeni ekspressiooni regulatsioon. · Transpositsioon mobiilsete DNA segmentide lülitamine uude asukohta genoomis, seda nii kromosoomi piires kui ka kromosoomide vahel. DNA vigade tüübid ja nende parandamine Vigade tüübid: replikatsioonivead, kühmud liigsetest või puuduvatest jääkidest, UV-indutseeritud vead. Valesti paardunud lõigud ja kahjustada saanud lõigud asendatakse uutega. DNA mutatsioonid Spontaansed või indutseeritud päritavad muutused kromosoomi nukleotiidide järjestuses. Jagunevad
segregatsiooni ja geneetilise mitmekesisuse tagamisel. Kõikides organismides roll replikatsioonis DNA vigade parandamisel. · Asendispetsiifiline (site-specific) rekombinatsioon: ensüümid rekombinaasid lõikavad DNA-d spetsiifiliste järjestuste juurest ning ligeerivad väljalõigatud lõigud teise DNA molekuli. Võib toimuda igas rakus. Funktsioonideks DNA integratsioon ja geeni ekspressiooni regulatsioon. · Transpositsioon mobiilsete DNA segmentide lülitamine uude askohta genoomis (nn "hüppavad geenid"). Toimub nii kromosoomi piires kui kromosoomide vahel. Mutatsioonid spontaansed või indutseeritud päritavad muutused kromosoomi nukleotiidide järjestuses Mutageenid indutseeritud mutatsioonide esilekutsujad: * ioniseeriv kiirgus * UV-kiirgus * keemilised mutageenid · Asendimutatsioonid ühe aluspaari asendamine teisega
§ Plasmiidide poolt kodeeritavateks toksiinideks on E. coli termostabiilne enterotoksiin, Staphylococcus aureus'e eksfoliatiivne toksiin, Clostridium tetani toksiin. § Osa plasmiide krüptilised, mistõttu ei avaldu fenotüüpiliselt. § Plasmiidiprofiili uurimine on vahend epidemioloogilistel uuringtel seose hindamisekssoleeritud tüvede vahel. Transposoonid § Transposoonid on DNA segmendid, mis on võimelised liikuma ühest kohast teise sama või erineva DNA molekuli piires - transpositsioon. § Transpositsioon on sõltumatu rekombinatsioonist. § Transposoonid põhjustavad mutatsioone, põhjustavad geneetilisi ümberkorraldusi, uute geenide viimist genoomi, tagavad geenide disseminatsiooni bakterite populatsioonis. § Transposoonide insertsioon (sisse viimine) põhjustab geeni lineaarse organisatsiooni muutuse läbi geeni inaktivatsiooni. § Trasposoonid on üheks olulisemaks ravimiresistentsuse levikufaktoriteks.
kaitsemehhanismide kasutusele võtmine. Bobile.4) Bob avab oma salajase võtmega sessioonivõtme ja 56. Krüptograafia on teksti salastamine võõraste eest. Kaks kasutab seda allkirjastatud ning tavalise teksti avamiseks. põhivõtet krüpteerimiseks – 1. substitutsioon – olemasolevate PGP(Pretty Good Privacy) on e-maili krüpteerimise skeem. märkide asendamine teiste märkidega 2. transpositsioon – Kasutab sessioonivõtit, avalikke võtmeid, räsifunktsiooni ja olemasolevate märkide järjekorra muutmine. Kasutatakse digiallkirja nagu eelnevalt seletatud. PGP on tänapäeval sümmeetrilise võtme ja avaliku võtme krüptograafiat. standard. PGP pakub turvalisust rakenduste tasemel. Sümmeetrilise võtme puhul on sama võti nii saatja kui 66. Transpordikihi turvalisus, SSL töötab transpordi kihil, vastuvõtja
tähendusega, arutlus peab olema deduktiivselt kehtiv ning väited tõesed. Väidete tõesus pole oluline, kui eesmärgiks ongi üksnes kindlaks teha, mis millest deduktiivselt järeldub, sõltumata eelduste ja lõppjärelduse tõesusest või väärusest. 5.2. OTSESED JÄRELDUSED (immediate inference) Otsese (vahetu) järelduse eelduseks on üks kategooriline väide. Tuntuimad otsese järelduse tüübid on muutmine (obversion), ümberpööramine (conversion), vastandamine (contraposition) ja transpositsioon (transposition). Neile lisandub veel väite vastasseisude (opositsioonide) tuletamine loogilise ruudu abil. 9 Vt Mereste, 2001: 46jj. 6 Järgnevates järeldusskeemides on joone peal eeldus, joone all tulem. 1. Väite muutmine (obversion). Jaatav väide muutub eitavaks, eitav jaatavaks, predikaat asendatakse endisele vasturääkivaga.
komöödia; võib sisaldada autori või lugeja hinnangut; 5) hüpertekst: teise järgu tekstid. Tekst, mille olemasolu sõltub täielikult teisest tekstist, nt paroodia, pastiss. Eristab tekstide reziimi (mänguline, satiiriline, tõsine) ja suhet (transformatsioon eeldab teksti muutumist tervikuna, imitatsioon teksti osade muutmine). Suhe/reziim Mänguline Satiiriline Tõsine Transformatsioon Paroodia Travestia Transpositsioon Imitatsioon Pastiss Sarz Võltsing Paroodia on stiili muutumine ilma süzee muutumiseta. Transpositsioon on tõsise teksti muutumine, terve teksti transformatsioon; teksti süzee ülekandumine teise aega ja ruumi, nt Joyce'i Ulysses või Romeo ja Julia ekraniseering Leonardo di Caprioga. Pastiss on väära teksti katkenditest kokkupandud tekst. 11. Luuletekst. Rütm ja meetrum. Värsisüsteemid Luulekeele tunnuseks on värss
terved naised helelillalt. Sugulasabielud on tähistatud kahe horisontaaljoonega vanemate vahel. 20. Geneetilise konsultatsiooni uued meetodid 5. PPT 1. Geeni aktiivsuse regulatsioon 1. Geneetiline regulatsioon Viirustel Prokarüootidel Eukarüootidel 2. Rekombinatsioon Krosiingover (homoloogiline rekombinatsioon) Transpositsioon (mittehomoloogiline rekombinatsioon) 2. Gripiviirused, tüübid 1. Gripp A alatüüp H1N1(inimese, ka seagripp) Hemaglutiniin H1 Neuraminidaas N1 2. Pandeemiad Hispaania gripp (1918-1919) 50-100 miljonit inimest 3. Gripp A alatüüp H5N1(linnugripp) Genoomi fragmentatsioon Antigeensed klaadid 3. Papilloomiviirused
Eukarüootide meioosis toimub homoloogiline rekombinatsioon →kaheahelaline kromosoomistik → liituvad Spo 11 (katked) ja MRX (tunneb ära kaheahelalise katke, lagundab ära 1 DNA ahela 5’ → 3’ suunas, tekivad üheahelalise DNA 3’ vabad otsad) → Spo 11 eemaldub → Dmc 1 ja Rad 51 liituvad. RuvA – tetrameer seondub Holliday ühendusega ja katalüüsib selle liikumist. 3 domääni, mis kõik seonduvad NDA-ga. Koht-spetsiifiline rekombinatsioon ja transpositsioon 1. Konservatiivne koht-spetsiifiline rekombinatsioon – fosfodiestersidemete vahetus. Tekib, kui lagunevad P-O-P sidemed. Genoomi struktuur muutub, DNA lõik lahkub kohalt või pöördub ringi. Ühest kohast võetakse lahti ja viiakse teise kohta asemele. Ei vajata lisaenergiat, DNA lagundamist. Toimub sidemete asendamine. 1) insertsioon – üks DNA ahel läheb teise vahele 2) deletsioon – kustutamine 3) inversioon – DNA lõik pöördub ümber. DNA järjestuse ümberpaiknemine. Identsed
telomeerid 500-3000 TTAGGG kordust. Organismi vananedes telomeerid lühenevad. Samal ajal ei toimu telomeeride lühenemist tüvirakkudes ega vähirakkudes. 88. DNA kordusjärjestused. -DNA lihtjärjestused = satelliit-DNA = kõrgelt korduvad järjestused -paiknevad tsentromeerides, telomeerides tandeemselt üksteise järel (rohkem kui 105 koopiat genoomi kohta) -Mõõdukalt korduv DNA (=mobiilsed DNA elemendid) paiknevad genoomis hajali (10...105 koopiat genoomi kohta) Transposoonid (Transpositsioon toimub DNA vahendusel; inimesel 44% kordusjärjestustest) Viiruste retrotransposoonid (Transpositsioonis osaleb RNA) Mitteviiruslikud retrotransposoonid (Transpositsioonis osaleb RNA) - unikaalne e. üksikkoopialine DNA (1-10 koopiat genoomi kohta) Pikad dispergeerunud elemendid (LINEs-long interspersed elements 6-7kb). L1,L2, L3 - 20% genoomist Lühikesed dispergeerunud elemendid (SINEs 100-400bp). Ainus aktiivelement e. Alu, ca 1milj. koopiat ja 10% genoomist
Seejärel moodustatakse pöördtranskriptaasiga RNAst tagasi DNA ning see siseneb uude positsiooni genoomis. Retrotransposoone on kahe tüüpi: pikkade otsmiste kordusjärjestustega (LTR) ja LTR puuduvad. LTR puudulikud jaotatakse LINEdeks ehk pikkadeks genoomi sisenenud elementideks ja SINEdeks ehk lühikesteks genoomi sisenenud elementideks. LINEsid umbes 17% ja SINEsid 11%. LINEd kodeerivad ise oma pöördtranskriptaasi, kuid SINEde transpositsioon sõltub teistest mobiilsetest elementidest. • • Genoomi transposon-elementide kompositsioon inimese genoomi näitel, rõhuasetusega retrotransposonidel Alu (SINE) ja LINE (L1) elementidel: päritolu, suurus, struktuur, omadused, jaotuvus genoomis, retropositsioneerumise mehhanismid, Alu-de roll primaatide evolutsioonis. • U 45% inimese genoomist on transposoon-elementidega seotud. Suurem osa neist on mitteLTR retrotransposoonid: LINE1 (L1) ja SINE (Alu)
teiste organismide genoomidega varieerub suuresti, seost genoomi suuruse ja organismi keerukuse vahel pole. 5. Liikuv DNA (transposoonid). DNA järjestused, mis suudavad ühe raku piires genoomis ümber paigutuda. Erinevad klassid. Klass I ehk retrotransposoonid (retroviiruse tüüpi, tuntud ka kui LTR-tüüpi ja mitte-LTR-tüüpi (LINEd ja SINEd)) ning klass II ehk DNA transposoonid. Evolutsiooniline tähtsus. Transpositsioon võib esile kutsuda mutatsioone ja geenide duplikatsioone. 6. Kuidas tekkisid pseudogeenid? Eellasgeeni korduvate duplikatsioonide tulemusena, samas on aga evolutsiooni käigus lisandunud neisse geenidesse geneetilise triivi tulemusena rida muutusi, mis transkriptsiooni enneaegselt termineerivad või inhibeerivad mRNA protsessingut, nii et need alad on muutunud mittefunktsionaalseks ehkki neilt transkribeeritakse RNAd. Teine võimalus pseudogeenide tekkeks on RNA
kromosoomides ristsiirdeid Spo11 katkestab DNA ahela ja Mre11 nukleaasi kompleks lõikab katkestatud DNA lühemaks. RecA taoline valik katalüüsib ahealte vahetuse. DNA ahelaosade vahetus ja nende ligeerimine, edasi toimub Holliday ühenduste liikumine ehk harude migreerumine. Geeni konversiooni ja ristsiirde erinevus- konversioonis toimub väikeste DNAosade vahetamine, ristsiirdes vahetatakse suuri DNA lõike Mutatsioonide teke nukleotiidide keemilise muutmise tagajärjel. Transpositsioon ja konservatiivne saitspetsiifiline rekombinatsioon . Transposoonide kolm põhiklassi : DNA-ainult transposoonid- esinevad ainult DNA kujul, liikumiseks on vajalik transposaas, sisenevad retsipenti lõika ja kleebi viisil. Transposoon võib olla korduv ümberpääratud DNA järjestus, transposaasid kinnituvad järjestusele ja moodustavad transposoomi, mis eemaldatakse ahelaase (doonor koromosoon parandatakse, kuid sinna võivad jääda augud.
Nimeta selle alarühma kolm enim kirjeldatud mobiilset elementi. - Retroviiruslikud - Mitte-retroviiruslikud Mitteviiruslikud retrotransposonid on ainsad transponeeruvad DNA elemendid, mis tänapäeval inimeses transponeerumise aktiivsuse on säilitanud. 2. LINE elemendid 3. Alu elemendid 4. Sva elemendid Kas transponeeruvate elementide aktiivsus on hea või halb? Põhjendage vastust. Kuigi transpositsioon pole sage, võib sisestumine teatud kohta DNAs toimuda mõnda geeni ja põhjustada seeläbi geeni funktsiooni häirumise. Ent samas on mutatsioonid geenides evolutsiooni aluseks, seega võib toimuda ka harvasid positiivseid mutatsioone. Milleks rakutuuma olemasolu hea võiks olla? Tuuma olemasolu tõttu on eukarüootidel DNA replikatsioon ja RNA transkriptsioon tsütoplasmas olevast translatsiooni masinavärgist ja teistest metaboolsetest protsessidest täiesti eraldatud. RNA ja
vormingusse, mida kutsutakse sifreeritud tekstiks (siffertekstiks) ja mida saab desifreerida (dekrüpteerida) ainult salajase võtme omanik. Krüpteeritud sõnumeid saab mõnikord lahti muukida krüptoanalüüsi ehk koodimuukimise teel, kuid kaasaegsed krüpteerimisviisid on praktiliselt muukimiskindlad. //// ==> Kaks põhivõtet krüpteerimiseks 1) substitutsioon olemasolevate märkide asendamine teiste märkidega; 2) transpositsioon olemasolevate märkide järjekorra muutmine. ==> Krüptograafiasüsteeme võib jämedalt jaotada sümmeetrilise võtmega süsteemideks, kus sõnumi saatja ja vastuvõtja kasutavad üht ja sama võtit, ning avaliku võtmega süsteemideks, kus kasutatakse kaht erinevat võtit. Avalik võti on kättesaadav kõigile, privaatvõtit teab aga ainult sõnumi vastuvõtja. ==> Asendussiffer mingi asi asendatakse teisega. Jaguneb mono- (nt. üks täht asendatakse
Nimeta selle alarühma kolm enim kirjeldatud mobiilset elementi. - Retroviiruslikud - Mitte-retroviiruslikud Mitteviiruslikud retrotransposonid on ainsad transponeeruvad DNA elemendid, mis tänapäeval inimeses transponeerumise aktiivsuse on säilitanud. 1. LINE elemendid 2. Alu elemendid 3. Sva elemendid 40. Kas transponeeruvate elementide aktiivsus on hea või halb? Põhjendage vastust. Kuigi transpositsioon pole sage, võib sisestumine teatud kohta DNAs toimuda mõnda geeni ja põhjustada seeläbi geeni funktsiooni häirumise. Ent samas on mutatsioonid geenides evolutsiooni aluseks, seega võib toimuda ka harvasid positiivseid mutatsioone. 41. Milleks rakutuuma olemasolu hea võiks olla? Tuuma olemasolu tõttu on eukarüootidel DNA replikatsioon ja RNA transkriptsioon tsütoplasmas olevast translatsiooni masinavärgist ja teistest metaboolsetest protsessidest täiesti eraldatud.
loetamatusse vormingusse, mida kutsutakse šifreeritud tekstiks (šiffertekstiks) ja mida saab dešifreerida (dekrüpteerida) ainult salajase võtme omanik. Krüpteeritud sõnumeid saab mõnikord lahti muukida krüptoanalüüsi ehk koodimuukimise teel, kuid kaasaegsed krüpteerimisviisid on praktiliselt muukimiskindlad. //// ==> Kaks põhivõtet krüpteerimiseks – 1) substitutsioon – olemasolevate märkide asendamine teiste märkidega; 2) transpositsioon – olemasolevate märkide järjekorra muutmine. ==> Krüptograafiasüsteeme võib jämedalt jaotada sümmeetrilise võtmega süsteemideks, kus sõnumi saatja ja vastuvõtja kasutavad üht ja sama võtit, ning avaliku võtmega süsteemideks, kus kasutatakse kaht erinevat võtit. Avalik võti on kättesaadav kõigile, privaatvõtit teab aga ainult sõnumi vastuvõtja. ==> Asendusšiffer – mingi asi asendatakse teisega. Jaguneb mono- (nt. üks täht
asja seedida. Aheldatuse tasakaalutus (esinevad mõlemad alleelid koos, mittejuhuslik). Multiplikatiivsed kohasused on teineteisest sõltumatud, üks mõjutab ellujäämist 1-6 elukuul, teine 6-12 elukuul. Aheldatuse tasakaal (juhuslikkus, kas üks või teine lookus). 1. Nimeta vähemalt neli genoomievolutsiooni põhimehhanismi. eksonite ümbersegamine, geeniduplikatsioon koos divergeerumisega, retropositsioon revertraasi abil, transpositsioon transposoonide abil, horisontaalne geeniülekanne (erinevate organismide (liikide) vahel, geeni liitumine/lagunemine, geeni uusteke eelnevast mittekodeerivast DNA-st 2. Mille poolest erinevad bakterite operonide ja loomade geeniklastrite nagu globiini geeniklaster teke. Bakteritel sama biokeemilise raja geenid tavaliselt koos operonides, reguleeritud samade regulaatorelementide poolt. Sarnase biokeemilise raja, funktsiooniga geenidel on kalduvus
kaugemale. Katedraalide kunst päädib lihaks saanud Jumala ülistamises ja püüab kujutada Looja ja loodute rahulikku liitu. 12801420 (palee) Kunstnikud ja nende metseenid, inimesed, kes pidasid end ajaga kaasas käivaks, ei pidanud enam kunsti üheks vahendiks maailma salapära hajutamisel ja selle sisemise korra ilmutamisel. Kunst oi nende silmis illustratsioon, pajatus, jutustus. Tema eesmärk: vahetult loetav transpositsioon mingist loos või pigem lugudest Jumalast, aga ka ümarlauarüütlitest või Jeruusalemma valutamisest. See on põhimõtteline muutus. Kunstnik loobus preestri saatmisest liturgiateenistusel. Ta ei ole enam vaimulikonna abiline. Ta asub inimese teenistusse. Inimene, kes ihkas näha ja tahtis, et temale esitatakse kindlasti mitte igapäevaelu tõelust kunst oli rohkem kui kunagi varem häälestatud pagemisele , vaid tema unelmaid. 14. saj muutub kunstilooming immaginaarse tagaajamiseks
võimalikest. Subjektiivsed kontuurid võivad olla suletuse, lihtsuse ja hea jätkuvuse näiteiks. Helmholtzi (1910) maksimaalse tõenäosuse printsiip: Taju püüab proksimaalset stiimulit interpreteerida kõige tõenäolisema distaalse stiimuli poolt tekitatuna. 2.5. Kujutiste äratundmine Kujutise äratundmine seisneb praegu tajutava objekti samaseks tunnistamine mingi varemtajutuga. Vormi või mustri transpositsioon tähendab seda, et näiteks kolmnurka tajutakse kolmnurgana vaatamata © AAVO LUUK 2003 - 2004 Psühholoogia alused 28 värvile, suurusele, kontuuri iseärasustele jne. Kujutiste tajumist on püütud seletada malliteooriaga, prototüübiteooriaga ja tunnuste avastamise teooriatega. Malliteooria kohaselt me jätame mällu asjade