Kiipide tüüpid I Analüütilised ● Antikehad kinnitatakse pinnale ● Lisatakse valgu lahus (nt lüüsunud rakkudega) ● Saab määrata ekspressiooni, afiinsust, aktiivsust ● Eriti hea ekspressiooni võrdlemiseks erinevate lahuste puhul Kiipide tüüpid II Funktsionaalsed valgukiibid ● Kasutatakse puhtaid valke ● Uuritakse valk-valk, valk-DNA, valk-RNA, valk-fosfolipiid vastastikmõju ● Samuti hindamaks ensüümide aktiivsust, leidmaks antikehasid ja näidata nende spetsiifilisust Kiipide tüüpid III Pöördfaasi valgukiibid ● Kasutatakse lüüsitud koeproovi ● Eksponeeritakse uuritavale valgule vastava antikehaga ● Tuvastatakse luminestsentsiga ● Prinditakse alusele, et määrata koguseid ● Saab tuvastada modifitseeritud valke Antikehadel baseeruvad valgukiipid ● Pinnale immobiliseeritakse antikeha ● Märgistatud proov kantakse kiibile ● Seondumine detekteeritakse fluorestsentsi mõõtmisega
Nimetage kaks aminohappejääki, mis vahendavad ensüümides üldise happe-aluse katalüüsi. Histidiin ja tsüsteiin. 37. Nimetage kaks aminohappejääki, mis vahendavad ensüümides kovalentset katalüüsi. Seriin, tsüsteiin ja histidiin. 38. Millisel juhul on katalüüs kõige efektiivsem? Ensüümi aktiivtsenter on komplementaarne; a) üleminekuolekuga 39. Mida võimaldas seletada Fischeri ,,luku ja võtme" hüpotees? Fischeri ,,luku ja võtme" hüpotees võimaldas seletada ensüümide spetsiifilisust ehk katalüüsi spetsiifilisust. 40. Seriin proteaasid: Seriini proteaasid katalüüsivad peptiidsideme hüdrolüüsi seriinijäägi kõrvalt. 41. Kirjutage Michaelis-Menteni võrrand. Märkige juurde konstantide nimetused ja ühikud. V=kcat (E)t(S)/(KM + (S)) k katalüütiline konstant catKM= michaelise konstant (Mool) on substraadi kontsentratsioon, mille juures ensüümkatalüüsitav reaktsioon on saavutanud poole oma piirkiirusest. (S)=substraadi kontsentratsioon (M)
ensüümi afiinsus vastava substraadi suhtes · ühik kontsentratsiooni ühik (M) Katalüütiline konstant kcat · vastab maksimaalsele substraadi molekulide arvule mille reageerimist on üks ensüümimolekul ajaühikus võimeline katalüüsima · ühik aja pöördväärtus (s-1) Spetsiifilisuse konstant kcat/KM · mida suurem kcat/KM seda efektiivsem on katalüüs · peegeldab ensüümi spetsiifilisust konkreetse substraadi suhtes · ühik aja pöördväärtus korda kontsentratsiooni pöördväärtus (s-1M-1) Ensüümkineetika parameetrite, kcat, KM ja kcat/KM väärtused Ligikaudsed väärtuste vahemikud: · kcat 10-2 106 s-1 · KM 10-1 10-13 M · kcat/KM ülempiir ca 109 M-1s-1 on määratud difusiooni poolt Ensüümkineetika mõõtmine · Alustuseks küsimus mis meid tegelikult huvitab? lihtsalt ensüümi aktiivsus
o Konkurentne inhibiitor (I) konkureerib S-ga ensüümi aktiivtsentrisse seostumisel (I on S struktuuranaloog ja E ei oma reeglina absoluutset spetsiifilisust!). Konkurentseks inhibiitoriks võib olla ka produkt (P pärsib metaboolse raja võtmeensüümi tööd; negatiivne tasasisidestus). Konkurentne inhibitsioon on pöörduv. Afiinsus
·kogub standardiseeritud infot (st kasutades samu instrumente ja küsimusi kõigi osalejate puhul) ·kogub andmeid avatud või suletud küsimustega ·annab kirjelduslikku, järelduslikku ja selgitavat infot või arvulisi andmeid ·kogub andmeid, mida saab statistiliselt töödelda ·tavaliselt toetub mitmekesiste andmete kogumisele, selleks et oleks võimalik teha üldistusi ·uurija on tavaliselt kõrvalseisj Puudused: ei uuri olukorra spetsiifilisust, selle ainulaadsust · väikese valimi puhul on andmete üldistusvõime väike Ankeedi koostamise põhimõtted: vastaja peab mõistma, milleks ankeet on koosatud, ankeedil peab olema sissejuhatus või kaaskiri, kus on uurimuse eesmärki vastajale selgitatud; küsimus peab olema üheselt arusaadav ning küsida tuleb ühte asja korraga; rohkem vastusevariante; küsimuste järjestus peab olema
Gynocritics (naiskriitika4) mõiste kirjeldab kirjanduskriitikat naiste vaatepunktist. Eesmärgiks on rajada raamistik naiste kirjanduse analüüsiks, et arendada uusi mudeleid, mis põhinevad naiste kogemusel selle asemel, et mugandada meeste mudeleid ja teooriaid. Naiskriitika algab sellest, kui me vabastame end absoluutsest meeste kirjanduse ajaloost ja keskendume hoopis selgelt nähtavale naiste kultuurile. Selle põhieesmärk on mõista naiste kirjutamise spetsiifilisust mitte seksismi produktina vaid naiste loomuliku elu fundamentaalse aspektina. Showalter arvab, et naiskriitika on viis õppida midagi kindlat, kestvat ja tõelist naiste ja kirjanduskultuuri suhtest5 4 Töö koostaja vaba tõlge 5 http://en.wikipedia.org/wiki/Elaine_Showalter 7 3. Feministlik kirjanduskriitika
koosnevad kolmest alfa-heeliksist, mis on ühendatud omavahel hüdrofoobsete sidemete abil. 3. Leutsiini tõmbluku valgud koosnevad kahest alfa-heeliksist, mida hoiavad koos hüdrofoobsed AH (leutsiin) külgmised sidemed. 4. -lehe tüüpi DNA-d äratundvad valgud 5. Tsink-sõrme valgud struktuuris üks või rohkem tsingi aatomit. * Milleks on oluline transkriptsiooni regulaatorite dimeriseerumine? Transkriptsiooni regulaatorite dimeriseerumine suurendab nende afiinsust ja spetsiifilisust DNA suhtes. 15. Nukleosoomide mõju transkriptsiooni regulaatorite seondumisele * Nukleosoomide 'hingamine' Nukleosoomi äärealal DNA n.ö. ,,hingab" st ajutiselt eksponeerib DNA-d, mis võimaldades transkriptsiooni regulaatoritel kergemini seostuda Seetõttu võimaldab nukleosoomi hingamine transkr. regulaatoril seostuda; 16. Transkriptsiooni repressorid. Transkriptsiooni regulaatorid: transkriptsiooni aktivaator lülitab geenid sisse ja repressor välja.
Eesmärk: Paljundada valitud valku või valgu mõnda domääni kodeerivat DNA järjestust ehk inserti PCR meetodiga. Materjalid: 11,3 MQ eriti puhas vesi lahusti µl 2,0 µl 10x polümeraasi puhvrit loob sobiva keskkonna, et polümeraas töötaks 2,0µl 25mM MgCl2 on polümeraasi ko-faktoriks, seega (lõppkontsentratsioon 2,5mM) mõjutab reaktsiooni spetsiifilisust 2,4µl 2mM dNTP et segus oleks vabu nukleotiide (lõppkontsentratsioon 240µM) 1,0µl Pärisuunalist praimerit Polümeraasi seondumiseks 5´ (lõppkontsentratsioon 0,5µM) poolele 1,0µl Vastassuunalist praimerit Polümeraasi seondumisesk 3´ (lõppkontsentratsioon 0,5µM) poolele 0,2µl template-DNA sisaldab regiooni, mida tahetakse
Laboriarstid õpivad arstiks ja pärast spetsialiseeruvad laborile, saades keemia poolest aru ja seletades selle arstile arusaadavalt ära (ja vastupidi). Reeglina arstid, eriti perearstid, ei oska labori tulemusi interpreteerida (eriti need, kes paarkend aastat tagasi med.kooli lõpetasid). 4. Kõigil peab olema pikem ja säravam kui naabril haigekassa maksab sigakallid masinad kinni, mitte et keegi neid kasutada oskaks. Spetsiifilisust on võimalik tõsta, tundlikkust mitte eriti (matemaatiline). Testide kombineerimine tõstab spetsiifilisust. 24. Kas molekulaardiagnostika turg võiks olla investori jaoks atraktiivne? Miks? Jah, sest ravimitööstus, sh diagnostika, on üks maailma juhtivatest majandusharudest ja seal liiguvad vähemalt sama suured summad kui teises juhtivharus sõjatööstuses. Kuna
aktiivsus oli 10 000 korda madalam kui natiivsel ensüümil. Mis juhtub kui muteerida kogu katalüütiline triaad? "Jääkensüüm" ilmutab ikkagi mõningast katalüüsivõimet - sidumisvõime ja aktiveeritud olekut solvateerivad rühmad jäid ju alles. · keskkonnaefektid, · substraadi struktuuri mõju, · inhibiitoranalüüs. · Ensüümkatalüüsi teooriad. · Ensüümide spetsiifilisust ja katalüütilist aktiivsust määravad tegurid. · Ensüümide regulatsioon ja multiensüümsed kompleksid metabolismis: regulatsiooni erinevad tasemed - allosteerika, kofaktorid, post-translatoorne modifitseerimine. · Ensüümide biomeditsiinilised rakendused paljud ensüümid on higuste markeriteks nt. kreatiini kinaas. Ravimid kui ensüümide inhibiitorid:
sensoorse sisendi töötlemist ja integratsiooni ajukoore aistinguspetsiifilisel alal Sensoorsete retseptorite liigitus: · sensoorsete närvirakkude vabad närvilõpmed valu, temperatuuri, kõdi, sügelemise ja mõned puuteaistingud · sensoorsete närvirakkude sidekoelisest kapslist ümbritsetud närvilõpmed somaatilised ja vistseraalsed surve, vibratsiooni ja teatud puuteaistingud. Erinevad kapsli tüübid suurendavad retseptori tundlikkust või tundlikkuse spetsiifilisust · spetsiaalsed meelerakud karvrakud kuulmis- ja tasakaaluelundis, maitserakk maitsmiskühmus, valgusretseptorrakk silma võrkkestas, mis on sensoorse närvirakuga sünaptilistes ühendustes. Retseptorrakud reageerivad stiimulitele astmeliste potentsiaalidega: · generaatorpotentsiaal tekib vabade närvilõpmete, kapsliga ümbritsetud närvilõpmete või haisteretseptori retseptiivse osa stimulatsioonil
36. Nimetage kaks aminohappejääki, mis vahendavad ensüümides üldise happe-aluse katalüüsi histidiin ja tsüsteiin 37. Nimetage kaks aminohappejääki, mis vahendavad ensüümides kovalentset katalüüsi Seriin ja lüsiin 38. Millisel juhul on katalüüs kõige efektiivsem? Ensüümi aktiivtsenter on komplementaarne üleminekuolekuga 39. Mida võimaldas seletada Fischeri ,,luku ja võtme" hüpotees? Katalüüsi spetsiifilisust 40. Seriin proteaasid katalüüsivad peptiidsideme hüdrolüüsi seriinijäägi kõrvalt 41. . Kirjutage Michaelis-Menteni võrrand. Märkige juurde konstantide nimetused ja ühikud. v= v = algkiirus [S] = substraadi kontsentratsioon (M) Vmax = piirkiirus. (M/s) Vmax = K [E] ([E] on vaba ensüümi kontsentratsioon) Km = Michaelise konstant. (M) 42. Milliste ühikutega võiks põhimõtteliselt mõõta katalüütilist konstanti? 1/s 43
ekspresseerub pidevalt, kodeerib Trp sünteesi raja 5 ensüümi. Trp repressor avaldub, kuid ei seostu ise operaatoriga. Kui trp on kõrgem kui rakul vaja, moodustub repressor kompleksi Trp-ga. See seostub operaatoriga blokeerides ekspressiooni ja Trp sünteesi. Attenuatsiooni mehhanism: lisakontroll, võimaldab moduleerida ekspressiooni tasete, „fine tuning“; toimub translatsiooni tasemel. Sigma-abifaktoridmääravad RNA polümeraasi spetsiifilisust eri geenidel, reguleerides korraga paljude geenide ekspressiooni (tavaliselt lähedase funktsiooniga geenid). Bakteriviirustel on sigma-sarnased geenid oma varaste- hiliste geenide ekspressiooni reguleerimiseks. Transkriptsiooni regulatsioon eukarüootidel ühisjooned- suur genoom (inimene 3*10^9 aluspaari, 35000 geeni); monotsistoorne (1 RNA1valk); kordus järjestused (kuni pool genoomist); geenid koosnevad eksonitest-intronitest.
------Fragmendid eraldatakse suuruse järgi, märgistatakse ja hübridiseeritakse kiipidega 24 L-DNA-l baseeruv universaalne kiip: Algne hübridisatsioon toimub lahuses, mille järel märgistatud proovid deotakse kiibile. Proovid koosnevad spetsialiseeritud D-DNA osast ja n.ö. koodi osast L-DNAst, mille kaudu toimub tahkele kandjale sidumine. Vähendab olulist müra ja tõstab spetsiifilisust. Kromatiini immuunsadestamine kiipidel (ChIP-on-chip): Genoomne DNA inkubeeritakse valguga ning stabiliseeritakse cross-linkimise teel. Valk pretsipiteeritakse spetsiifilise AK-ga ning lagundatakse. DNA ahel märgistatakse ja hübridiseeritakse kiibile. Tundmatute eksonite identifitseerimine kiipidel: RNA või cDNA hübridiseeritakse kiibile seotud eksonispetsifiliste praimeritega. Amplifikatsioonisignaali tugevus kiibil näitab uute eksonite olemasolu. 9.Koekiibid
36. Nimetage kaks aminohappejääki, mis vahendavad ensüümides üldise happe-aluse katalüüsi. V: histidiin, asparagiinhape 37. Nimetage kaks aminohappejääki, mis vahendavad ensüümides kovalentset katalüüsi. V: seriin ja lüsiin 38. Millisel juhul on katalüüs kõige efektiivsem? Ensüümi aktiivtsenter on komplementaarne; a) üleminekuolekuga b) substraadiga c) produktiga 39. Mida võimaldas seletada Fischeri ,,luku ja võtme" hüpotees? a) katalüüsi efektiivsust b) katalüüsi spetsiifilisust c) katalüüsi sõltuvust temperatuurist 40. Seriin proteaasid: a) katalüüsivad peptiidsideme hüdrolüüsi seriinijäägi kõrvalt b) katalüüsivad ainult seriinijääkidest koosnevate polüpeptiidide hüdrolüüsi c) omavad katalüütiliselt olulist seriinijääki 41. Kirjutage Michaelis-Menteni võrrand. Märkige juurde konstantide nimetused ja ühikud. v= v = algkiirus [S] = substraadi kontsentratsioon (M) Vmax = piirkiirus
Esile kerkivad tinglikkus ja teatri väljendusvahendite eriline keel. Teater on fragmentaarne, eklektiline ja killustatud. Teatri väljendusvahendid pole hierarhilised. · Simultaansus paljude mängusüsteemide ja tähendusliinide samaaegne koostoimimine. · Muud väljendusvahendid muusika, visuaalne ja kehaline pool tõusevad esile. · Palju tehnoloogilisi vahendeid multimediaalsus. · Teatraalsus näitamise ja vaatamise akti rõhutamine. Rõhutatakse ka teatri spetsiifilisust, teatrina toimimist. · Tekstuaalsus dünaamilise tähistamisprotsessi ja kommunikatsiooniprotsessi esiletõus. Tekst on strukturalismis alustatud ja lõpetatud üksus. Tähendus tekib teksti-vastuvõtja protsessis, st see pole paika pandud. Tekste ei looda tavapärasel viisil, esile tõusevad kõne ja esitusviis. Dialoogid on kas väga pikad ja ülepaisutatud või napid. · Performatiivsus etenduslikkus. Sooritusest ollakse teadlik, mida näidatakse ka välja, viidates endale.
retseptorid on blokeeritud. Kuna neuroleptikumide afiinsus retseptori suhtes on oluliselt suurem kui DA-l, ei suuda virgats tavalistel tingimustel retseptoreid hõivata. Positrone kiirgava süsiniku isotoobi lisamine suure afiinsusega D2-retseptoritele seonduvale raklopriidile võimaldab inimese ajus retseptorid nähtavaks muuta - neid on eriti tihedalt basaaltuumades. Annusest sõltuv konkurents aripiprasooliga retseptorite pärast näitab seondumise spetsiifilisust. Amfetamiin suudab vähendada [123I]IBZM seondumist DA-retseptoritele, massiivse DA vabanemise esilekutsumisega - see efekt on suurem SCH- patsientidel haigushoo ajal, kuid mitte remissioonis. Närvikoe arenguhäire seletamaks skisofeeniat Psühhoosivastase toime aeglase arenemise põhjuseks võib olla dopamiin- & glutamaatergilise närviülekande tasakaalu muutumine. Imetajate, sealhulgas inimese ajus on neli psühhoosiravimite toime aspektist olulisemat dopamiinergilist
nuumrakust kui ka koereaktsiooni mediaatoritele · Epikutaan e aplikatsioon e lapitest , mida tehakse aeglast tüüpi ja kombineeritud allergia korral (atoopiline ja kontaktdermatiit) · IgE antikehade määramine vereseerumis RAST, ELISA, CLA - Esineb kvalitatiivne seos testi tulemuse ja kliiniliselt olulise allergia vahel: kõrgem tiiter suurem allergia tõenäosus, ei sõltu ravimitest, naha reaktiivsusest, uuritava seisundist. Omab väiksemat tundlikkust ja spetsiifilisust kui nahatestil. Puuduseks on see, et on kallim, seetõttu kasutatakse, kui nahatest pole võimalik või nahatesti tulemus ei rahulda · Provokatsioontest - allergeeni manustatakse sokkorganisse: nahale, silma, ninna, bronhidesse või suu kaudu. Esineb veenvaim tõestus, et antud allergeen vallandab haigusnähte. Samas negatiivne test ei välista täielikult ülitundlikkust ja samuti võib olla valepositiivne platseebo. On kallis, keeruline, aeganõudev, esineb anafülaksia oht.
geenisegmentides, mis kodeerivad CDR3 alasid ja tõstavad antikeha afiinsust antigeeni suhtes. Selle kaudu paraneb oluliselt antikehade afiinsus antigeeniga seondumisel. Isotüübi vahetuse käigus vahetatakse antikeha konstantset regiooni kodeeriv segment. Algul on kõik antikehad IgM konstantse regiooniga, isotüübi vahetamise käigus toimub B- rakus genoomne reorganiseerumine konstantse regiooni kodeerivate geenide piirkonnas. Isotüübi vahetus muudab Ab effektor funktsiooni muutmata Ab spetsiifilisust ag suhtes. 22. Kirjelda I ja II tüüpi ülitundlikkuse reaktsioone. Tüüp I IgE vahendatud ülitundlikkus. Tüüp II IgG vahendatud tsütotoksiline ülitundlikkus (näiteks reesus konflikt). Allergia, ülitundlikkus: Immuunsüsteemi sobimatult suur reaktsioon väikesele ja ohutule tekitajale. Tüüp I: tekib väliskeskkonnast organismi sattunud antigeenide toimel juba varem nende antigeenide suhtes sensibiliseerunud isikutel, kellel on vastavad IgE- klassi antikehad. 1
(kovalentne katalüüs). Vaheühendite esinemisel asendub üks kõrge energeetiline barjäär, ensüümi juuresolekul kahe madalama barjääriga ja reaktsioon on kiirendatud. 41. Millisel juhul on katalüüs kõige efektiivsem? Ensüümi aktiivtsenter on komplementaarne; a) üleminekuolekuga b) substraadiga c) produktiga 42. Mida võimaldas seletada Fischeri ,,luku ja võtme" hüpotees? a) katalüüsi efektiivsust b) katalüüsi spetsiifilisust c) katalüüsi sõltuvust temperatuurist 43. Seriin proteaasid: a) katalüüsivad peptiidsideme hüdrolüüsi seriinijäägi kõrvalt b) katalüüsivad ainult seriinijääkidest koosnevate polüpeptiidide hüdrolüüsi c) omavad katalüütiliselt olulist seriinijääki 44. Seriin proteaasid erinevad üksteisest: a) substraadi spetsiifilisuse poolest b) katalüüsi üldise mehhanismi poolest c) hüdrolüüsitava keemilise sideme tüübilt 45. Kirjutage MichaelisMenteni võrrand
Geneetilise materjali funktsioonid: 1.genotuubiline funktsioon (replikatsioon). 2. Fenotuubiline funktsioon (geeni avaldumine e. geeni ekspressioon). 3. evolutsiooniline funktsioon (mutatsioonid). 79. Milles seisneb DNA ahelate antiparalleelsus? DNA spetsiifilisuse näitajad. 5' - 3' keemiline polaarsus (fosfodiesterside) Antiparalleelsus (vastaspolaarsus): uks ahel on 5'->3' ja teine on 3'<-5' suunaline. Peegelpildi efekt. DNA spetsiifilisuse näitaja : A + T / G + C. DNA spetsiifilisust tõendab see, vesiniksidemed saavad moodustuda ainult kindlate paaride korral. 80. Valkude ehitus ja struktuursed vormid. Valk koosneb aminohappe jääkidest, mis on ühendatud peptiidsidemetega. Primaarne struktuur - aminohapete järjestus. Sekundaarne struktuur - alfa-heeliks ja beeta- sheets. Tertsiaarne struktuur - kolmemõõtmeliseks voldinud. Kvaternaarne struktuur - 2 või enama polüpeptiidi assotsiatsioon.
regulatoorne). Nt. Valguline antikeha seostub spetsiifiliselt vastava antigeeniga. Valkude spetsiifilisuses eristatakse: · Liigispetsiifilisus liigile iseloomulike valkude spekter · Organismispetsiifilisus liigi erinevate organismide valkude spekter · Koespetsiifilisus erinevate kudede valgud erinevad immunoloogiliselt, st ühe koe valgud kutsuvad teise koesse sattumisel esile antikehade tekke Juba ühe aminohappejäägi asendus muudab valgu spetsiifilisust. Primaarstruktuur on ,,baasinformatsiooniks" kõrgemate struktuuritasemete kujunemisel See tähendab, et aminohappejääkide kindel järjestus antud valgus on baasiks antud valgu kõrgemate struktuuritasemete kujunemisele. Primaarstruktuur ja molekulaarhaigused Geneetilise päritoluga haiguste põhjuseks on enamasti mõne aminohappejäägi asendumine primaarstruktuuris. Sel puhul räägitakse molekulaarhaigustest ehk geneetilistest haigustest.
tôestuseks pikaajalisest kooseksisteerimisest. Lôplik pôhjus, miks môni parasiit esineb vaid ühel vôi väga kitsal ringil peremeestest, pole alati teada. Ometi on kindel, et parasiidid on arenenud koos oma peremeestega. Nematoodid Dichelyne (Cucullanellus) minutus ja Cucullanus heterochrous on Läänemeres lestlastele väga spetsiifilised parasiidid. Veel on lestal esinevateks kitsa peremeeste ringiga liikideks monogenea´d (Cyrodactylus spp.) ja trichodinidae´d. Peale peremehe spetsiifilisust määravate faktorite, on lesta parasitofauna kujundajaks soolsus ja temperatuur. Soolsus muutub Läänemere edelaosa 20 -st Soome arhipelaagis 5 -ni. Soolsusel on tähtis osa parasiitide esinemises ning nakatumise levikus ja intensiivsuses. Läänemere lôunaosa on soodne kindlatele Digenea´dele, pôhjapool esineb palju koorikloomi (Crustacea). Soolsuse muutuse drastiliseks näiteks on mereliste trematoodide peaaegu täielik kadumine Läänemere lôunaosas
Rab efektoriks võivad olla mootorvalgud, mis transpordivad vesiikuleid piki mikrotorukesi või filamente märklaudmembraanini. Rab valgu seostumisel Rab efektoriga saab võimalikuks vesiikuli membraani integraalse valgu V-SNARE seostumine märklaudmembraani T-SNARE valguga. V- SNARE tüüp on iga transportvesiikuli tüübi puhul spetsiifiline ja tagab kokkusulamise kõige märklaudorganelliga, millel esineb üldine ühildumist tagav valk SNAP25 ja üks või mitu spetsiifilisust tagavat valku T-SNARE. Seega spetsiifilisus on kindlustatud ka V-SNARE – T-SNARE vastastikuse toimega. Millistesse membraanidesse võib sekretoorne rada vesiikuleid toimetada? Rakumembraan, lüsosoom, vakuool, peroksüsoomid, Golgi kompleks, ER, endosoom Nimetage organelle mis on ümbritsetud poolega lipiidsest kaksikkihist. Kuidas ja kus sellised kompleksid tekivad, mis on nende ülesanded? - VLDL – sekreteeritakse maksarakkudest ja kannavad sünteesitud triglütseriidid
O H2C HC OH O ICH2-C(=O)-R-C(=O)-O-CH2-C(=O)-R + I- OH C(=O)-O- + - C(=O)-O + epoksiid CH2-O-CH-R (CH2-CH vahel ka side, kolmnurk)(H+ juurde)-C(=O)-O-CH 2-CH(-OH)-R Aktiivtsentrisse suunatud pöördumatud inhibiitorid ehk afiinsusmärgised Sisaldavad endas reaktiivset rühma ja kasutavad ära ensüümi spetsiifilisust. Matkivad oma struktuurilt substraati. OH OH O O P OH O O P OH C CH2 O C CH2 O H2C H2C I Ntx trioosfosfaadi isomeraas (oluline ensüüm glükolüüsis DHAPGAP), OH tasakaaluline reaktsioon, substraatideks:
kombineeritud allergia korral (atoopiline ja kontaktdermatiit). Nahateste ei saa teha allergia ägenemise, oluliselt kahjustatud naha, teatud ravimite kasutamise korral. Üks test mida tehakse on IgE antikehade määramine vereseerumis. Meetoditeks on RAST, ELISA, CLA. Esineb kvalitatiivne seos testi tulemuse ja kliiniliselt olulise allergia vahel: kõrgem tiiter suurem allergia tõenäosus, ei sõltu ravimitest, naha reaktiivsusest, uuritava seisundist. Omab väiksemat tundlikkust ja spetsiifilisust kui nahatestil. Puuduseks on see, et on kallim, seetõttu kasutatakse, kui nahatest pole võimalik või nahatesti tulemus ei rahulda Provokatsioonitest on test, mille korral allergeeni manustatakse sokkorganisse: nahale, silma, ninna, bronhidesse või suu kaudu. Esineb veenvaim tõestus, et antud allergeen vallandab haigusnähte. Samas negatiivne test ei välista täielikult ülitundlikkust ja samuti võib olla valepositiivne platseebo. On kallis, keeruline, aeganõudev,
Rab efektoriks võivad olla mootorvalgud, mis transpordivad vesiikuleid piki mikrotorukesi või filamente märklaudmembraanini. Rab valgu seostumisel Rab efektoriga saab võimalikuks vesiikuli membraani integraalse valgu V-SNARE seostumine märklaudmembraani T- SNARE valguga. V-SNARE tüüp on iga transportvesiikuli tüübi puhul spetsiifiline ja tagab kokkusulamise kõige märklaudorganelliga, millel esineb üldine ühildumist tagav valk SNAP25 ja üks või mitu spetsiifilisust tagavat valku T-SNARE. Seega spetsiifilisus on kindlustatud ka V-SNARE T-SNARE vastastikuse toimega. 15. Millistesse membraanidesse võib sekretoorne rada vesiikuleid toimetada? Rakumembraan, lüsosoom, vakuool, peroksüsoomid, Golgi kompleks, ER, endosoom 16. Nimetage organelle mis on ümbritsetud poolega lipiidsest kaksikkihist. Kuidas ja kus sellised kompleksid tekivad, mis on nende ülesanded?
Vaheühendite esinemisel asendub üks kõrge energeetiline barjäär, ensüümi juuresolekul kahe madalama barjääriga ja reaktsioon on kiirendatud. 41. Millisel juhul on katalüüs kõige efektiivsem? Ensüümi aktiivtsenter on komplementaarne; a) üleminekuolekuga b) substraadiga c) produktiga 42. Mida võimaldas seletada Fischeri ,,luku ja võtme" hüpotees? a) katalüüsi efektiivsust b) katalüüsi spetsiifilisust c) katalüüsi sõltuvust temperatuurist 43. Seriin proteaasid: a) katalüüsivad peptiidsideme hüdrolüüsi seriinijäägi kõrvalt b) katalüüsivad ainult seriinijääkidest koosnevate polüpeptiidide hüdrolüüsi c) omavad katalüütiliselt olulist seriinijääki 44. Seriin proteaasid erinevad üksteisest: a) substraadi spetsiifilisuse poolest b) katalüüsi üldise mehhanismi poolest c) hüdrolüüsitava keemilise sideme tüübilt 45
: Rab valgu seostumisel Rab effektoriga saab võimalikuks vesiikuli membraani integraalse valgu V-SNARE seostumine märklaudmembraani T- SNARE valguga.(SNARE ingl Soluble NSF Attachment Protein). V-SNARE valk lülitub vesiikuli membraani koostisesse pungumisel doonororganellilt (17-58 lk 741) V-SNARE tüüp on iga transportvesiikuli tüübi puhul spetsiifiline ja tagab kokkusulamise õige märklaudorganelliga, millel esineb üldine ühildumist tagav valk SNAP 25 ja üks või mitu spetsiifilisust tagavat valku T-SNARE. Rab valgud seostuvad märklaudmembraani Rab effektoriga, mis vajalik membraanide kokkusulamiseks. Rab effektoriks võivad olla mootorvalgud, mis transpordivad vesiikulid piki mikrotorukesi või mikrofilamente märklaudmembraaninimembraani. (lisa!) 15.)Millistesse membraanidesse võib sekretoorne rada vesiikuleid toimetada? Vesiikulite liikumine on täpselt organiseeritud, see toimub ER-st Golgi suunas ja sealt edasi raku välispinnale. (i sure hope so) 16
Paraneb aeglaselt. Immuunsus pole täielik, sekundaarsed infektsioonid võivad tekkida. Teised mükoplasmad – roll ebaselge. • NGU - M. genialium, U. urealyticum • M. hominis – püelonefriit, PID, sünnitusjärgne palavik. Diagnostika. M. pneumoniae • Mikroskoopial diagnostiline väärtus puudub • Kultuur – aeglane (2-6 nädalat positiivse diagnoosini) ja väikse tundlikkusega • Molekulaarmeetodid – PCR: spetsiifilisust ei teata, aga tundlikkus on väga hea • Seroloogia: (1) komplemendi sidumine – kehv tundlikkus ja spetsiifilisus, (2) ensüümmeetodid – erineva tundlikkuse ja spetsiifilisusega, P1 vastased testid kõige spetsiifilisemad, (3) külmaaglutinatsioon – ristreaktsioonid teiste respiratoorsete patogeenidega, tundlikkus 65% (kasutatakse tihti, aga ei soovitata) Ravi ja profülaktika. Valikravimid M. pneumoniae vastu on erütromütsiin, uuemad fluorokinoloonid, tetratsükliin
Osad sisaldavad ka kaitsemehhanisme UV kiirguse vastu, repellente munasööjate vastu ja antibiootikume Morfogeenid Faktorid, mis mõjutavad morfogeneesi – transkriptsioonifaktorid, parakriinsed faktorid Morfogenees on seotud mitmete protsessidega: 1) Rakkude adhesioon – rakkude kinnitumine üksteise ja ECM külge läbi erinevate adhesioonimolekulide (muutused adhesioonimolekulides raku pinnal muudavad rakk-rakk kontaktide tugevust ja spetsiifilisust) 6 Rakkude adhesioon üksteisega (adherentsed liidused) ja ekstra- tsellulaarse maatriksiga läbi rakupinna valkude on võtmetähtsusega erinevate organite moodustumisel Erinev rakkude adhesiivsus (vahendatud nii erinevat tüüpi kui ka erineva kogusega adhesiooni molekulidega, nt. kadheriinid) aitab säilitada erinevate kudede vahelisi piire ja struktuure,
glükoos (negatiivne mõju). RpoS ei ole ainuke faktor, mis kontrollib statsionaarses faasis indutseeritud geenide avaldumist. Rakkude süsiniku-nälgimisel on tuvastatud 20 S-st sõltumatu valgu induktsioon. Mis põhjustab promootori äratundmise ES poolt? ES poolt transkribeeritavad promootorid on sageli äratuntavad ka E70 poolt (v. a. fic promootor). Osade S-st sõltuvate promootorite puhul on leitud spetsiifilisust määravaid determinante promootori -10 regioonist. Võrreldes erinevate S-st sõltuvate promootorite järjestusi, on välja pakutud konsensusjärjestus CTATACT. Andmed on mõnevõrra vastuolulised. Mitmed katsetulemused viitavad sellele, et tegelikult S- spetsiifilist konsensusjärjestust polegi teatud tingimustel on teatud promootorid ES poolt paremini äratuntavad kui E70 poolt. Näiteks geenide osmY ja osmB puhul on näidatud, et 0,5 M või
annaabi.ee 
