trikarboksüülhappe tsükli kooskõlastatud sünteesi. ArcA-P on aeroobselt ekspresseeritud sihtmärk geenide repressorvalk ja anaeroobselt ekspresseeritud sihtmärk geenide aktivaator. ArcAB on ka roll raku kaitsmisel oküsdatiivse stressi eest. ArcAB roll kõikide bakterite puhul ei ole ühesugune. Kaitse oksüdatiivse stressi eest Enamik aeroobseid organisme on kaitstud superoksiidi ja vesinikperoksiidi toksilisuse eest ensüümide superoksiidi dismutaasi (SOD) ja katalaasi abil. Levinud arvamus oli, et obligatoorseid anaeroobid ei salli hapniku, kuna neil puudvad vastavad ensüümid nagu SOD ja katalaas selleks, et elimineerida hapniku ja ennetada toksiliste hapniku produktide tekkimist. See vaade osutus valeks juba seetõttu, et alati pole võimalik hoida keskkonda täielikult hapniku vabana ning võib esineda juhuslikku hapniku sattumist keskkonda, mis ei tähenda kõigi bakterite hävinemist sealt keskkonnast
laktoosist D-maletsitoolist maltoosist D-sorbitoolist sukroosist D-trehaloosist D-mannoosist D-ksüloosist D-rafinoosist glütseroolist D-ramnoosist salitsiinist Prevotella multiformis (biokeemia) Eskuliini ei hüdrolüüsi Indooli ei tooda Lagundab zelatiini Katalaasi ja ureaasi ei produtseeri G+C sisaldus 51,1-51,3% Prevotella multiformis (taksonoomia) Regnum: Bacteria Phylum: Bacteroidetes Classis: Bacteroidetes Ordo: Bacteroidales Familia: Prevotellaceae Genus: Prevotella Species: Prevotella multiformis Prevotella multiformis (fülogenees) 16S rRNA analüüs genus Prevotella Alguses arvati, et P. Denticola. Prevotella multiformis P.multiformis P.denticola P
Fermetatsiooni test oli negatiivne gaasilisi käärimisprodukte ei leidnud. Nende olemasolul oleks agarikork surutud üles. Indikaatorvärv muutus mõlemas katseklaasis. Erinevaid suhkruid sisaldavate söötmetega tuvastasin mikroobi suhkrukasutamist aeroobses keskkonnas. Sahharoosi, D-fruktoosi, L-arabinoosi, D-ksüloosi, D-mannitool, maltoosi kõikides nendes söötmetes oli indikaatorvärv muutnud. 4. ensüümid Tsütokroomi c oksüdaasi test oli negatiivne. Katalaasi test seevastu tundus esmalt negatiivne, kuid mõne aja möödudes hakkas aeglaselt mulle ilmuma (küll vähe). Samuti tundus esmapilgul, et trüptofanaasne aktiivsus puudub minu uuritaval mikroobil. Siiski hakkas vaikselt tekkima veekihile õrnalt punakas alkoholkiht, kuigi see oli väga nõrk. Seega ei osanud täpselt hinnata, kas on olemas trüptofanaas või mitte. Indooltesti tuleks korrata, et veenduda täiesti ensüümi olemasolus.
Varud pole pikaaegseks puuduseks piisavad. Ensüümide ja hormoonide tööd häirib nii puudus kui ka liig. Raud Raua metabolism on kinnine, s.t. toimub pidevalt varude uuesti kasutamine. Rauda on mikroelementidest kehas kõige rohkem: Naistel kokku 45 mmol, 2,5 grammi = 2500 mg Meestel 60 Sellest · 60-70 % on seotud hemoglobiiniga (Hb) · 16-29 % on rauavarudes ( valgud ferritiin, hemosideriin) · funktsionaalne Fe on müoglobiini, katalaasi, peroksüdaasi jt. porfüriinensüümide koostises Imendub ~10 %, vajadus ~1mg Vajadus toidus: naistel 15 mg rasedatel 20-25mg meestel 10 10 mg rauda saab normaalsest toidust, 15 hea dieediga, 20-25 ei saa kuidagi. Raua imendumist soodustavad · vit C · Cys ja Met · Cu, Ca, Co · Alkohol · Liha või kala soodustavad ka taimse raua imendumist Imendunud raud seostub vereseerumis transferriniga, mis transpordib selle, kuhu vaja
JA MITOKONDRID Carol Tamm Integreeritud loodusteadused Peroksüsoomid Nendeks on D-aminohapete oksüdaas, Peroksüsoomid on väikesed (ca 0.2-1 uraatoksüdaas ja lutsiferaas. Erinevates µm läbimõõdus), ühekordse kudedes võib peroksüsoomide membraaniga ümbritsetud organellid, ensüümkomplekt erineda, kuid kindlasti mis esinevad kõikides loomsetes sisaldavad peroksüsoomid katalaasi, rakkudes (v.a. erütrotsüüdid) ja paljudes mis lagundab tekkivat taimerakkudes. vesinikperoksiidi. Pikka aega peeti neid lüsosoomideks. Peroksüsoomides olevad ensüümid Kuid peroksüsoomid sisaldavad võivad olla nii kõrges ensüüme, mis erinevad lüsosomalsest kontsentratsioonis, et osa neist esineb ensüümkomplektist, nimelt leidub seal isegi kristallidena, mis on
ja rakust väljuma. Selle tulemusega hakkab rakus kuhjuma (akumuleeruma) modifitseeritud molekul. Sellist meetodit kasutavad bakterid just erinevate suhkrute transportimisel rakku. 19. Millised väited on õiged? Katalüsaator: Katalüsaator kiirendab keemiliste reaktsioonide toimumist ja kiirendab spetsiifiliselt just pärisuunalist reaktsiooni. 20. Katalaas katalüüsib vesinikperoksiidi lagundamist. Kas katalaasi hulk reaktsiooni käigus: Katalaasi hulk vesinikperoksiidi lagundamisel ei muutu, sest katalaas on katalüsaator ja katalüsaatori hulk reaktsiooni käigus ei muutu. 21. Ensüüm katalüüsib pöörduvat reaktsiooni A B. Mis hakkab toimuma ensüümi lisamisel aine B lahusele? Hakkab moodustuma ainet A, sest katalüsaator suurendab eelkõige pärisuunas toimuvat reaktsiooni. 22. Vaatame pöördumatut reaktsiooni A B. Kuidas avaldub reaktsiooni kiirus aine A kontsentratsiooni kaudu? V= 23
molekulile ühekaupa? Millal võib toimuda elektronide liikumine fotosünteetilises elektronide transpordiahelas õhuhapnikule, mitte NADP-le? Osooni tekke, kui NADP kontsentratsioon on madal Kuidas taimedes kahjutustatakse superoksiidne anioon ·O2? Superoksiidse dismutaasi abil. Dismutaasi korral reageerivad kaks superoksiidset aniooni. Üks oksüdeerub, teine redutseerub. Järelikult saadakse hapnik ja vesinikperoksiid. Vesinikperoksiidist saadakse lahti katalaasi abil (2H2O2 2H2O + O2 ) (see kloroplastides hästi ei tööta, sest katalaasi pole). Milline tähtsus on violaksantiini zeaksantiiniks muutumisel ksantofüllide tsüklis? Et liigne energia, mida klorofüll ei suuda ära kasutada, saaks eralduda soojusenergiana ja fotosüsteem ei kahjustuks. Valgusenergia mittefotokeemiline kustutamine. Mis on fotokeemiline ergastusenergia kustutamine fotosünteesi valgusreaktsioonides? Soojuse eraldumine.
Biokatalüsaatoreid iseloomustab · kõrge spetsiifilisus · kõrge efektiivsus Biokatalüsaatorid on efektiivsed Vesinikperoksiidi lagunemine veeks ja molekulaarseks hapnikuks: 2H2O2 2H2O + O2 · reaktsioon on termodünaamiliselt soodne · katalüsaatori puudumisel aeglane (stabiilne mitu kuud) · rauaioonide (Fe3+) juuresolekul kiireneb 1000 korda · hemoglobiini juuresolekul kiireneb 1 000 000 korda · katalaasi juuresolekul kiireneb 1 000 000 000 korda Keemilise kineetika alused Keemiline kineetika uurib keemiliste reaktsioonide toimumist ajas Mis on keemilise reaktsiooni kiirus? Kiirus on millegi muutumine ajas t Keemilise reaktsiooni kiirus V reagentide kontsentratsioonide muutumine ajas AB A lähteaine B produkt V = d[B]/dt = - d[A]/dt Keskmine kiirus Vkeskm = [B]/t
Naturaalses mees on keskmiselt 17,2% vett, 0,40,8% täisväärtuslikku valku ja 81,3% igasuguseid suhkruid. Suhkruga võrreldes on mesi loomulikult oluliselt kasulikum, sest peale kergesti imenduva glükoosi ja fruktoosi sisaldab ta veel teisigi toitaineid. Vitamiinidest on mees leitud C, B1, B2, B6, PP ja Kvitamiini, biotiini, fool ja pantoteenhapet, samuti mitmeid mineraalaineid. Väga olulised komponendid on fermendid, millest mees leidub diastaasi, invertaasi ja katalaasi. Nende ülesandeks on kiirendada kas otseselt või kaudselt toitainete keemilist muundamist organismis. On arvatud, et ilma fermentideta ei omastu ka kõige toitvam toit. Fermendid ja ensüümid ei talu kõrgeid temperatuure. Et mee väärtus säiliks, tuleb vältida selle kuumutamist üle +40oC, samuti ei tohi mett hoida külmkapis. Mee pikemaks säilimiseks tuleb seda hoida kuivas ja jahedas ruumis. Arheoloogilised kaevamised Egiptuses
Tsütoskelett *Lüsosoomid - lagundaja Autofagosoom- lagundab raku enda vananenud osi Fagosoom- lagundab rakku pinotsütoosi teel/fagotsütoosiga haaratud materjali *Peroksüsoomid Tuum Substraat taandatakse katalaasi jt ensüümide toimel. Tekib toksiline OH. INKLUSIOONID Etanoolist, formaldehüüdist, fenoolist vabanemine varuained rakus (glükogeen, lipiidid), sekretoorsed (näärmerakkudes), ekskretoorsed (väljutamisele Maksa ja neeru kuuluvad), pigmentinklusioonid (melaniin, lipofustsiin, rakkudes peamiselt hemosideriin)
TSINK (Zn) Tsink kuulub mitmesaja metallofermendi struktuuri aktiivsüdamikku. Ta on hädavajalik DNA ja RNH- polümeraasi funktsioneerimisel, osaledes pärilikkuse informatsiooni ülekandeprotsessides ning valkude biosünteesis ja samaaegselt ka organismi separatiivsetes protsessides. Ta osaleb heemi biosünteesi võtmefermendi tekkeprotsessis, kuuludes seeläbi hemoglobiini koostisesse, ta on vajalik mitokondrite hingamisahelate tsütokroomides, tsütokroom Р-450-, katalaasi- ja müeloperoksidaasi koostises. Tsink kuulub võtme-antioksüdantfermendi Zn ja Cu – superoksiid dismutaasi koostisesse ja indutseerib raku kaitsevalkude metallotienoeniinide biosünteesi olles seeläbi reparatiivse toimega antioksüdandiks. Tsingil on tähtis roll organismi hormonaalfunktsioonide täitmisel. Ta mõjutab vahetult insuliini tootmist ja funktsionaalset aktiivsustja seeläbi kogu insuliinisõltuvate protsesside spektrit. Meestel osaleb tsink
Naturaalses mees on keskmiselt 17,2% vett, 0,4-0,8% täisväärtuslikku valku ja 81,3% igasuguseid suhkruid. Suhkruga võrreldes on mesi loomulikult oluliselt kasulikum, sest peale kergesti imenduva glükoosi ja fruktoosi sisaldab ta veel teisigi toitaineid. Vitamiinidest on mees leitud C-, B1-, B2-, B6-, PP- ja K-vitamiini, biotiini, fool- ja pantoteenhapet, samuti mitmeid mineraalaineid. Väga olulised komponendid on fermendid, millest mees leidub diastaasi, invertaasi ja katalaasi. Nende ülesandeks on kiirendada kas otseselt või kaudselt toitainete keemilist muundamist organismis. On arvatud, et ilma fermentideta ei omastu ka kõige toitvam toit. Fermendid ja ensüümid ei talu kõrgeid temperatuure. Et mee väärtus säiliks, tuleb vältida selle kuumutamist üle +40oC, samuti ei tohi mett hoida külmkapis. Üldiselt loetakse maitseomadustelt paremaks heledat, läbipaistvat, aromaatset mett. Selline on nt pärnaõie mesi ja pärnaõie-ristiku mesi
ATP vahendusel toimub tioestrisideme moodustumine rasvhappekarboksüülrühma ja CoA sulfhüdrüülrühma vahel. Pikad rasvhapped ei suuda vabalt läbi mitokondri membraani minna, selleks kasutatakse karnitiini. Paarituarvulise ahelapuhul toimub sarnaselt niikaua kuni jääb järgi 3-süsinikuline propionüül- CoA, mis muunudb suktsionüül-CoA-ks ning lülitub tsitraaditsüklisse Peroksüsoomides beeta oksüdatsioonis saab vähem ATP kui maatriksis. Tekkinud vesinikperoksiid lõhustatakse katalaasi toimel veeks ja hapnikuks. Ketokehad Olukord,kus nälgime. Siis tuleb energia ketokehadest mida saab lipiididest. Tekkinud glükoosi defitsiit, sel juhul on raskendatud CoA lülitumine tsitraaditsüklisse, samal ajal on intensiivistunud rasvhapete lõhustumineatsetüül-CcoA. Ketokehade süntees (slide 32). 8. Mis on ajukoe peamine energiallikas? Miks? Glükoos. Ajus puuduvad energiavarud ja glükoosi tsükliline vorm on väga stabiilne. Ta on suht. inertne ja ensümaatiliselt kontrollitav
mida mikroorganism toodab. Happe moodustamisele viitab söötme värvi muutus punakasvioletsest kollaseks. Gaasi tekkele viitab gaasi kogunemine Durhami torukestesse. 11. Mida näitab oksüdaastest? Oksüdaastesti puhul määrab oksüdaas ära, kas mikroob on võimeline oksüdeerima teatud aromaatseid amiine. 12. Mida näitab katalaastest? Selle abil saab kindlaks määrata mikroorganismid, kes on võimelised tootma katalaasi. Ensüüm katalaas aitab kõrvaldada lähiümbrusest vesinikperoksiidi, mis on tugev oksüdeerija ja võib vigastada või surmata rakke. SÜGAVKÜLVI ARVUTAMINE: n= C V d1,1 C kolooniate summa V külvatud materjali hulk (1ml) d lahjendus (10-2) 1,1 koefitsent, kuna meil C kahe lahjenduse peale kokku 10 -2 ja 10-3 PINDKÜLVI ARVUTAMINE: C n= V d C kolooniate arv V külvatud materjali hulk (0,1ml) d suurim lahjendus (10-2)
a. erütrotsüüdid) ja paljudes taimerakkudes. Pikka aega peeti neid lüsosoomideks. Kuid peroksüsoomid sisaldavad ensüüme, mis erinevad lüsosomalsest ensüümkomplektist, nimelt leidub seal mitmeid oksüdatiivseid ensüüme: D-aminohapete oksüdaas, uraatoksüdaas, lutsiferaas (viimane esineb jaanimardika vastsetel e. 'jaaniussidel' ning põhjustab helendumist). Erinevates kudedes võib peroksüsoomide ensüümkomplekt erineda, kuid kindlasti sisaldavad peroksüsoomid katalaasi, mis lagundab tekkivat vesinikperoksiidi. Vakuoolid- kujutab endast membraaniga ümbritsetud põiekest, mis perioodiliselt ilmub tsütoplasmasse ja täitub vedelikuga. Tekkimise ajal haaratakse väliskeskkonnast toitaineid, mis vakuooli rändamise ajal raku sees imenduvad läbi membraani. Teises suunas, vakuooli sisse toimetatakse organismi elutegevuse jääkaineid. Lõpuks tühjeneb vakuool väliskeskkonda. Ribosoomid- on nii eel- kui ka päristuumse raku tsütoplasmas esinev kaheosaline
pigmendimolekulilt teisele, kuni ta kas jõuab aktiivtsentrisse ja indutseerib fotokeemilise reaktsiooni, või kiirgub poolel teel välja fluoestsentsikvandina või hajub soojusena. Neelatud ja fotokeemilistesse tsentritesse üle antud kvantide energia muundatakse keemiliste sidemete energiaks reaktsioonide süsteemis, mis moodustavad fotosünteetilise elektronide ülekande ahela. Süsteem sisaldab kaht fotokeemilist reaktsioonitsentrit: lühemalaineline P680 (H2O2 laguneb katalaasi osavõtul veeks ja O2-ks. Plastokinoonses ahelas toimub ADP fosforüleerimine, mille juures moodustuv ATP kasutatakse CO2 assimilatsiooni süsteemis.) ja pikemalaineline P700 (moodustunud NADPH kasutatakse ära CO2 assimilatsiooni süsteemis). Need protsessid kulgevad kloroplastides. Fotokeemiliste reaktsioonide produktid ATP ja NADPH võimaldavad CO2 redutseerimist ja selle arvel orgaanilise aine sünteesi de novo. Fotokeemilised reaktsioonid on lokaliseeritud graanulitesse
MESI Mesi on mesilaste poolt taimedelt kogutud nektarist või eritistest spetsiifiliste ainete lisamisega toodetud ja kärjekannudes valminud enamasti magus toiduaine. Naturaalses mees on keskmiselt 17,2% vett, 0,4-0,8% täisväärtuslikku valku ja 81,3% igasuguseid suhkruid. Vitamiinidest on mees leitud C-, B1-, B2-, B6-, PP- ja K-vitamiini, biotiini, fool- ja pantoteenhapet, samuti mitmeid mineraalaineid. Väga olulised komponendid on fermendid, millest mees leidub diastaasi, invertaasi ja katalaasi. Nende ülesandeks on kiirendada kas otseselt või kaudselt toitainete keemilist muundamist organismis. Mett tarbitakse kõige rohkem töötlemata vedelana, kristalliseerununa või koos kärgedega. Mett lihtsalt süüakse, kasutatakse mitmesuguste toiduainete valmistamisel ja tarvitatakse meditsiinilise preparaadina. On näiteks tõestatud, et mesi aitab ravida haavu. Mesi on: energia allikas (mett kasutatakse ka energia allikana, kuna see sisaldab ühes täies teelusikas
81,3% igasuguseid suhkruid. Suhkruga võrreldes on mesi loomulikult oluliselt kasulikum, sest peale kergesti imenduva glükoosi ja fruktoosi sisaldab ta veel teisigi toitaineid. Vitamiinidest on mees leitud C-, B1-, B2-, B6-, PP- ja K- vitamiini, biotiini, fool- ja pantoteenhapet, samuti mitmeid mineraalaineid. Väga olulised komponendid on fermendid, millest mees leidub diastaasi, invertaasi ja katalaasi. Nende ülesandeks on kiirendada kas otseselt või kaudselt toitainete keemilist muundamist organismis. On arvatud, et ilma fermentideta ei omastu ka kõige toitvam toit. Fermendid ja ensüümid ei talu kõrgeid temperatuure. Et mee väärtus säiliks, tuleb vältida selle kuumutamist üle +40oC, samuti ei tohi mett hoida külmkapis. Üldiselt loetakse maitseomadustelt paremaks heledat, läbipaistvat, aromaatset mett. Selline on nt pärnaõie mesi ja pärnaõie-ristiku
toodangut. Naturaalses mees on keskmiselt 17,2% vett, 0,4-0,8% täisväärtuslikku valku ja 81,3% igasuguseid suhkruid. Suhkruga võrreldes on mesi loomulikult oluliselt kasulikum, sest peale kergesti imenduva glükoosi ja fruktoosi sisaldab ta veel teisigi toitaineid. Vitamiinidest on mees leitud C-, B1-, B2-, B6-, PP- ja K-vitamiini, biotiini, fool- ja pantoteenhapet, samuti mitmeid mineraalaineid. Väga olulised komponendid on fermendid, millest mees leidub diastaasi, invertaasi ja katalaasi. Nende ülesandeks on kiirendada kas otseselt või kaudselt toitainete keemilist muundamist organismis. On arvatud, et ilma fermentideta ei omastu ka kõige toitvam toit. Fermendid ja ensüümid ei talu kõrgeid temperatuure. Et mee väärtus säiliks, tuleb vältida selle kuumutamist üle +40oC, samuti ei tohi mett hoida külmkapis. Mee pikemaks säilimiseks tuleb seda hoida kuivas ja jahedas ruumis. Arheoloogilised kaevamised Egiptuses (surnukambrites oli mitu vaasi meega) on
18. . Seletage modifitseerimise kaudu toimiva transpordi põhimõtet. Rakku sisenenud molekul ei ole enam võimeline rakumembraani läbima ja rakust väljuma. Selle tulemusena hakkab rakus sees akumuleeruma modifitseeritud molekul. (Sellist meetodit kasutavad paljud bakterid just erinevate suhkrute importimiseks rakku.) 19. Katalüsaator kiirendab keemiliste reaktsioonide kiirust, kiirendab spetsiifiliselt just pärisuunalist reaktsiooni 20. Katalaas katalüüsib vesinikperoksiidi lagundamist. katalaasi hulk reaktsiooni käigus ei muutu, sest katalaas on katalüsaator ja selle hulk ei muutu. 21. . Ensüüm katalüüsib pöörduvat reaktsiooni A B. Mis hakkab toimuma ensüümi lisamisel aine B lahusele? Hakkab moodustuma ainet A 22. Vaatame pöördumatut reaktsiooni A B. Kuidas avaldub reaktsiooni kiirus aine A kontsentratsiooni kaudu? v=d(A)/-dT 23. Mitmendat järku reaktsiooniga on tegemist? E+L=EL 2.järku EL=E+L 1 järku 24
Butzleri agar (tabel 3.5). Pärast inkubatsiooni uuritakse bakterirakke kahtlustata- vatest kolooniatest mikroskoopiliselt tüüpilise korgitseri morfoloogia suhtes. Tüvesid diferentseeritakse nende kasvuvõime järgi 25 °C juures mikroaeroobsetes tingimustes; H2S produktsiooni alusel kolmiksuhkru-raua agaril (triple-sugar-iron) ning nalidiksiinhappe tundlikkuse alusel. Teha tuleb ka hipuraatide hüdrolüüsi test ning määrata katalaasi ja oksüdaasi aktiivsus ning nitraatide reduktsioon. Tabel 3.5. Söötmed Campylobacter jejuni isoleerimiseks Inkubeerimine Toiming Sööde Temp °C Kestus h Rikastamine Prestoni puljong 42 2448
keemiline modifitseerimine nii, et see molekul ei ole enam võimeline rakumembraani läbima ja rakust väljuma. 19. Millised väited on õiged? Katalüsaator: a) kiirendab keemiliste reaktsioonide toimumist b) suurendab reaktsiooni kiiruskonstanti c) suurendab reaktsiooni tasakaalukonstanti d) muudab reaktsiooni tervikuna termodünaamiliselt soodsamaks e) kiirendab spetsiifiliselt just pärisuunalist reaktsiooni ? 20. Katalaas katalüüsib vesinikperoksiidi lagundamist. Kas katalaasi hulk reaktsiooni käigus: a) suureneb b) väheneb c) ei muutu katalüsaatorid reaktsiooni käigus ise ei muutu! 21. Ensüüm katalüüsib pöörduvat reaktsiooni A B. Mis hakkab toimuma ensüümi lisamisel aine B lahusele? a) mitte midagi b) hakkab moodustuma ainet A c) hakkab kasvama aine B kontsentratsioon 22. Vaatame pöördumatut reaktsiooni A B. Kuidas avaldub reaktsiooni kiirus aine A kontsentratsiooni kaudu? V= 23. Mitmendat järku reaktsiooniga on tegemist
2-1 µm läbimõõdus), ühekordse membraaniga ümbritsetud organellid, mis esinevad kõikides loomsetes rakkudes (v.a. erütrotsüüdid) ja paljudes taimerakkudes. Peroksüsoomides esineb mitmeid oksüdatiivseid ensüüme: D- aminohapete oksüdaas, uraatoksüdaas, lutsiferaas (viimane esineb jaanimardika vastsetel e. 'jaaniussidel' ning põhjustab helendumist). Erinevates kudedes võib peroksüsoomide ensüümkomplekt erineda, kuid kindlasti sisaldavad peroksüsoomid katalaasi, mis lagundab tekkivat vesinikperoksiidi. Ensüümide import peroksüsoomi. Peroksüsoomides vajaminevad ensüümid korjatakse kokku tsütoplasmast. Äratundmissignaaliks on tripeptiid Ser- Lys-Leu. Peroksüsoomide funktsioneerimise häiretest tingitud haigus (Zellwegeri sündroom). Neil haigetel on aju, maksa ning neerude talitluse häired ning nad surevad varsti peale sündi. Üks selle haiguse vormidest on tingitud mutatsioonist peroksüsoomi membraanivalku
2-1 µm läbimõõdus), ühekordse membraaniga ümbritsetud organellid, mis esinevad kõikides loomsetes rakkudes (v.a. erütrotsüüdid) ja paljudes taimerakkudes. Peroksüsoomides esineb mitmeid oksüdatiivseid ensüüme: D-aminohapete oksüdaas, uraatoksüdaas, lutsiferaas (viimane esineb jaanimardika vastsetel e. 'jaaniussidel' ning põhjustab helendumist). Erinevates kudedes võib peroksüsoomide ensüümkomplekt erineda, kuid kindlasti sisaldavad peroksüsoomid katalaasi, mis lagundab tekkivat vesinikperoksiidi. Ensüümide import peroksüsoomi. Peroksüsoomides vajaminevad ensüümid korjatakse kokku tsütoplasmast. Äratundmissignaaliks on tripeptiid Ser- Lys-Leu. Peroksüsoomide funktsioneerimise häiretest tingitud haigus (Zellwegeri sündroom). Neil haigetel on aju, maksa ning neerude talitluse häired ning nad surevad varsti peale sündi. Üks selle haiguse vormidest
• sanitaarse näidustuse korral uuritakse kaabet kätelt ja ninalima stafülokokkide kandluse suhtes. Samastamine ALGMATERJALI MIKROSKOOPIA. Stafülokokid on Gram+ kokid ühe- või paarikaupa, lühikeste ahelatena ning kõige sagedamini ebaregulaarsete, viinamarjakobarat meenutavate kogumikena. NB! Alati ei ole võimalik eristada stafülokokke streptokokkidest mikroskoopia abil – morfoloogia võib olla suhteliselt sarnane! KATALAASI PRODUKTSIOON. Kasutatakse stafülokokkide ja streptokokkide diferentsiaaldiagnostikas. Stafülokokid on katalaaspositiivsed, streptokokid – katalaasnegatiivsed. Esemeklaasil suspendeeritakse tahkel söötmel kasvanud uuritavast pesast külvinõelaga võetud kultuuri 3% vesinikperoksiidi lahusesse. Katalaaspositiivsete mikroobide puhul hakkab erituma gaasimulle, katalaasnegatiivsete mikroobide puhul mulle ei eraldu. KASV VERIAGARIL JA NOVOBOTSIINTUNDLIKKUS
glükoosi fosforüleerimist. Kas tegemist on: a) aktiivse transpordiga b) passiivse difusiooniga c) vahendatud passiivse difusiooniga 22. Millised väited on õiged? Katalüsaator: a) kiirendab keemiliste reaktsioonide toimumist b) suurendab reaktsiooni kiiruskonstanti c) suurendab reaktsiooni tasakaalukonstanti d) muudab reaktsiooni termodünaamiliselt soodsamaks e) kiirendab spetsiifiliselt just pärisuunalist reaktsiooni 23. Katalaas katalüüsib vesinikperoksiidi lagundamist. Kas katalaasi hulk reaktsiooni käigus: a) suureneb b) väheneb c) ei muutu Katalaas on katalüsaator. Ja katalüsaatori hulk reaktsiooni käigus ei muutu. 24. Ensüüm katalüüsib pöörduvat reaktsiooni A B. Mis hakkab toimuma ensüümi lisamisel aine B lahusele? a) mitte midagi ??? b) hakkab moodustuma ainet A c) hakkab kasvama aine B kontsentratsioon katalüsaator ainult kiirendab reaktsiooni aga ei muuda selle tasakaaluolekut 25. Vaatame pöördumatut reaktsiooni A B
mükoplasmade väljauhtumist. Mükoplasmal peab adhesiiniks olema mõni rakumembraani komponent (näiteks lipoglükaan). Tema membraan kleepub peremeesraku membraanile. See tihe kontakt toob kaasa selle, et mükoplasma poolt toodetud NH3, H2O2 ja superoksiidradikaalid saavad kergesti tungida peremeesrakku ja kahjustada selle kudesid. Mükoplasmade poolt toodetud H2O2 ja superoksiidradikaal tungivad peremeesrakku. Superoksiidradikaal inhibeerib peremeesraku katalaasi, mis viib H2O2 kuhjumisele ja see omakorda põhjustab SODi (superoksiiddismutaasi) tagasisidestusliku inhibitsiooni. See toob kaasa rakus H2O2 ja superoksiidradikaali kontsentratsiooni tõusu ja membraanid saavad oksüdatiivselt kahjustatud. Order Bacillales *Bacillus, suurim perekond (114 liiki), kuigi osa liike on perekonna Bacillus alt viidud uutesse perekondadesse. On tehtud juurde näiteks perekonnad *Paenibacillus, kuhu on kuuluvad näiteks P. polymyxa ja P. macerans
õlle maitse. Kergemini saastub madala alkoholisisaldusega õlu. Zymomomas mobilis'e abil toodetakse etanooli suhkruroost. Saadavat etanooli kasutatakse ka autokütusena. Bioetanool. Ta on olulisim etanolitootja bakterite hulgas, kellel suhkrud katabooluvad Entneri-Doudoroffi rajas ja etanooli moodustub püruvaadist atseetaldehüüdi redutseerimisel. Ta on GN pulkbakter, rakkudes leitud tsütokroome, katalaasi ja osa TCA tsükli ensüüme, kuigi terviklik TCA tsükkel puudub. Pärineb ilmselt aeroobsetest eellastest. Kasutab suhkrutest vaid sahharoosi, glükoosi ja fruktoosi. Kuna etanoolikääritamise protsessi energeetiline efektiivsus on madal, peab palju suhkrut kataboolima, et 18 ära elada. Kõrvalproduktina moodustub palju etanooli ja vähe rakke. Rakus on suurel hulgal käärimise võtmeensüüme. Miks hea etanooli kääritaja?
2-1 µm läbimõõdus), ühekordse membraaniga ümbritsetud organellid, mis esinevad kõikides loomsetes rakkudes (v.a. erütrotsüüdid) ja paljudes taimerakkudes, peeti pikalt lüsosoomideks. Uued peroksüsoomid tekivad vanadest lihtsa jagunemise teel. Nad on ise- replitseeruvad organellid. Sisaldavad ensüüme, mis erinevad lüsosomalsest ensüümkomplektist, ka leidub seal mitmeid oksüdatiivseid ensüüme: D- aminohapete oksüdaas, uraatoksüdaas, lutsiferaas. Sisaldavad peroksüsoomid katalaasi, mis lagundab tekkivat vesinikperoksiidi. Peroksüsoomides olevad ensüümid võivad olla nii kõrges kontsentratsioonis, et osa neist esineb isegi kristallidena, mis on elektronmikroskoobis nähtavad elektrontiheda südamikuna. Peroksüsoomides toimuvad oksüdatiivsed reaktsioonid. Nimelt peroksüsoomid on põhilised organellid, kus toimub teatud tüüpi rasvahapete oksüdeerimine. Peroksüsoomides ei ole elektroni transpordi ahelat ja rasvhapete oksüdeerumine ei ole seotud
Kas tegemist on: a) aktiivse transpordiga b) passiivse difusiooniga c) vahendatud passiivse difusiooniga 22. Millised väited on õiged? Katalüsaator: a) kiirendab keemiliste reaktsioonide toimumist b) suurendab reaktsiooni kiiruskonstanti c) suurendab reaktsiooni tasakaalukonstanti d) muudab reaktsiooni termodünaamiliselt soodsamaks e) kiirendab spetsiifiliselt just pärisuunalist reaktsiooni 23. Katalaas katalüüsib vesinikperoksiidi lagundamist. Kas katalaasi hulk reaktsiooni käigus: a) suureneb b) väheneb c) ei muutu Katalaas on katalüsaator. Ja katalüsaatori hulk reaktsiooni käigus ei muutu. 24. Ensüüm katalüüsib pöörduvat reaktsiooni A B. Mis hakkab toimuma ensüümi lisamisel aine B lahusele? a) mitte midagi ??? b) hakkab moodustuma ainet A c) hakkab kasvama aine B kontsentratsioon katalüsaator ainult kiirendab reaktsiooni aga ei muuda selle tasakaaluolekut 25. Vaatame pöördumatut reaktsiooni A B
oksüdeerijad. Toksilised lipiidid: Eruuk-(erucic) hape. Rapsi ja sinepi õlid sisaldavad eruukhapet (cis-13- docosanoic hape). Kui emapiimast vahetult võõrutatud rottide dieedis oli kaloritepõhiselt üle 20% eruukhapet, täheldati rottidel kasvupidurdust, südamelihase rasvast infiltratsiooni, mononukleaarsete rakkude infiltratsiooni ning fibroosi. Fütaan- (phytanic) hape. Refsumi tõbi on geneetiline haigus, mille põhjustab peroksüsoomaalse rasvhappe oksüdaasi ja katalaasi puudulikkus. Sellise indiviidi organism ei saa metaboliseerida piimatoodetes ja mäletsejate rasvas sisalduvat fütaanhapet (3,7,11,15-tetrametüülheksadekaanhape, mis on klorofülli metabolismi produkt mäletseja vatsas. Sterkul(sterculic)-hape (C19) ja malv(malvalic)-hape (C18) on seltsi Malvales (Kassinaerilaadsed) taimede nagu näiteks puuvillapõõsa (Cossypium sp.) või kapokipuu (Ceiba pentandra) seemnetest saadavate õlide looduslikud komponendid
§ Noored kultuurid Gram- positiivsed, vananedes muutuvad Gramnegatiivseteks. § Liikumatud, eoseid ei moodusta. S. aureus kasv ja elutegevus 3 § Kasvavad lihtsöötmetel, aeroobsetes ja mikroaerofiil-setes tingimustes. § Optimaalne kasvutemperatuur 37ºC, pesad siledad, hallikast kuldkollase värvuseni ( S. aureus), S. epidermidis tavaliselt hallikas või valge pesa. § Veriagaril annab S. aureus sageli hemolüüsi. § Stafülokokid produtseerivad katalaasi aitab eristada stretokokkidest. § Lõhustavad mitmeid süsivesikuid. Vastupanuvõime väiskeskkona teguritele § Ühed resistentsemad eosteta mikroobidest, suhteliselt vastupidavad kuumusele ja kuivamisele. § Säilivad 50°C juures vähemalt 0,5 tundi. § Kasvavad 10% NaCl vi 40% sappi sisaldavas keskkonnas. § 3% fenool ja 1% klooramiin surmavad 2-3 minuti järel. Epidemioloogia § Stafülokokid nahal, ninaneelus, suus, seede- ja urogenitaal-traktis. S.
Naturaalses mees on keskmiselt 17,2% vett, 0,4-0,8% täisväärtuslikku valku ja 81,3% igasuguseid suhkruid. Suhkruga võrreldes on mesi loomulikult oluliselt kasulikum, sest peale kergesti imenduva glükoosi ja fruktoosi sisaldab ta veel teisigi toitaineid. Vitamiinidest on mees leitud C-, B1-, B2-, B6-, PP- ja K-vitamiini, biotiini, fool- ja pantoteenhapet, samuti mitmeid mineraalaineid. Väga olulised komponendid on fermendid, millest mees leidub diastaasi, invertaasi ja katalaasi. Nende ülesandeks on kiirendada kas otseselt või kaudselt toitainete keemilist muundamist organismis. On arvatud, et ilma fermentideta ei omastu ka kõige toitvam toit. Fermendid ja ensüümid ei talu kõrgeid temperatuure. Et mee väärtus säiliks, tuleb vältida selle kuumutamist üle +40oC, samuti ei tohi mett hoida külmkapis. Mee pikemaks säilimiseks tuleb seda hoida kuivas ja jahedas ruumis. Arheoloogilised kaevamised
ROS-id osalevad inimestel mitmetes haigustes ning ka vananemises. Antioksüdandid osalevad nende radikaalide kahjutustamises! Vitamiinid E (membraanide kaitsja) ja C (laia toimega antioksüdant) ning mitmed taimsed ained (karotinoidid, flavonoidid jne). Bakteritel kaitsevad rakku hapnikuradikaalide eest näiteks pigmendid. Värvilistes marjades, puu- ja juurviljades, aga ka näiteks orasheinas on palju antioksüdante Hapnikust moodustuvad kahjulikud produktid likvideeritakse katalaasi, peroksidaasi või SOD'i (superoksiidi dismutaas) mehhanismide kaudu. Hellusebakter- Lactobacillus fermentum ME-3. Antioksüdantsed omadused- aitab toime tulla oksüdatiivse stressiga. 46 CO2 on vajalik suuremas koguses autotroofsetele bakteritele, aga ka heterotroofid vajavad seda, sest ka nendel toimub metabolismis karboksüülimisreaktsioone, kus CO2 laheb vaja.
ROS mitteensümaatiline kahjutustamine toimub glutatiooni toimel. O2- , OH ja H2O2 redutseerimisel glutatiooni abil tekib H2O. Glutatiooni rakusisene kontsentratsioon on kõrge (kuni 10 mM). VAATA MARKUSE ARVUTIST SEDA KOHTA ROS ensümaatiline kahjutustamine Põhiline reaktiivse hapniku detoksifitseerimine toimub ensümaatilisel teel. 1)O2- konverteeritakse superoksiidi dismutaasi (SOD) abil vesinikperoksiidiks, mis on vähem toksiline. 2) Katalaasi reaktsiooni tulemusena moodustuvad H2O2-st vesi ja hapnik: H2O2 2 H2O + O2 Hüdroksüülradikaali OH kõrvaldamiseks ei ole spetsiifilist ensüümsüsteemi välja kujunenud, kuna see ühend on keemiliselt liiga reaktiivne. Hüdroksüülradikaalid moodustuvad siis, kui vesinikperoksiid reageerib Fe2+-ga (H2O2 + Fe2+ OH + Fe3+ (Fentoni reaktsioon)). Fe2+ on enamasti seotud valkudega, asudes nende aktiivtsentris OH märklauaks on ensüümi aktiivtsentris asuvad aminohapped.
Mürgituse sümptomid: oksendam., valud maos, kõhulahtisus, “metalli maitse” suus, naha külmenemine sümptomid olenevad märgatavalt doosist vastumürgid: Na2S2O3 lahus, MgO jt. kaseiini sisaldavad toidud (piim, kohupiim) spetsiaalsed vastumürgid Kohtumeditsiiniliselt on As lihtne määrata: Marshi reaktsioon juuste neutroaktivatsioonanalüüs (Napoleoni juhtum) mürgituse põhjus: blokeerib ensüümide SH - rühmad AsH3 blokeerib ensüüm katalaasi, → H2O2 kogunem. organismis (As-immuniteet on doosi aeglase tõstmisega treenitav) Kasutamine meditsiinis 1%-line NaAsO2 [naatriumarsenaat(III)] lahus: kasutusel meditsiinis (alates 1786, Th. Fowler) üldtugevdava ja toniseeriva vahendina XX sajandil võetud kasutusele palju As-ühendeid (org.) (saj. alguses P. Ehrlich: salvarsaan jt.), praegu tuntakse tuhandeid As-preparaate Kui organismide koostisosa Elemendina leidub As väikestes kogustes
ROS mitteensümaatiline kahjutustamine toimub glutatiooni toimel. O 2- ·, ·OH ja H2O2 redutseerimisel glutatiooni abil tekib H2O. Glutatiooni rakusisene kontsentratsioon on kõrge (kuni 10 mM). ROS ensümaatiline kahjutustamine Põhiline reaktiivse hapniku detoksifitseerimine toimub ensümaatilisel teel. Selleks on katalaasid, peroksüdaasid ja superoksiidi dismutaasid. O 2- · konverteeritakse superoksiidi dismutaasi (SOD) abil vesinikperoksiidiks, mis on vähem toksiline. Katalaasi reaktsiooni tulemusena moodustuvad H 2O2-st vesi ja hapnik: H2O2 2 H2O + O2 Hüdroksüülradikaali ·OH kõrvaldamiseks ei ole spetsiifilist ensüümsüsteemi välja kujunenud, kuna see ühend on keemiliselt nii reaktiivne, et teoreetiliselt reageeriks ta alati enne aktiivtsentrisse jõudmist muude potentsiaalsete märklaudadega. Hüdroksüülradikaalid moodustuvad siis, kui vesinikperoksiid reageerib Fe2+-ga. H2O2 + Fe2+ ·OH + Fe3+