Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse

Viiruste geneetika (0)

1 Hindamata
Punktid

1.VIIRUSTE 
   GENEETIKA

 
 
Viiruste definitsioon
Viirused  on obligatoorsed rakusisesed 
parasiidid

Viiruspartiklid assambleeritakse 
eelnevalt valmissünteesitud 
komponentidest

Viiruspartiklid ei kasva ega jagune
Puudub geneetiline info energia 
tootmiseks ja valgusünteesiks

Viirus on võimeline nakatama teatud tüüpi rakke, 
seondudes rakupinna spetsiifiliste retseptoritega:

Loomaviirused
Taimeviirused
bakteriviirused e. bakteriofaagid

Bakteriofaag  T4 E. coli rakke 
nakatamas

 
 
 
 
Viiruste avastamine
Nimetus “viirus” tuleneb ladinakeelsest sõnast  virus , mis tähendab mürki
Viiruseid  õpiti bakteritest eristama alles 20. sajandi künnisel 

Keskmise  bakteriraku  pikkus on 2 - 3 μm
Keskmise viirupartikli suurus on 20 – 400 nm

Viirused tuvastati kui haigusi tekitav toimeaine, mis läbib bakterifiltreid, mille 
pooride läbimõõt on  400 nm – pikka aega peeti graam-
positiivseks kokiks

Seni suurima genoomiga viirus – 1 181 404 bp (1,2 Mb)
Kodeerib  erinevalt teistest  viirustest :
1) mitmeid translatsiooniga seotud faktoreid ja 

Mimiviirus  amööbi rakus
tRNA-sid
2) Topoisomeraase
3) DNA reparatsioonivalke
4) Polüsahhariidide sünteesiga seotud ensüüme 

Mimiviirust eristab 
parasiitsetest rakusisestest 
mikroobidest vaid 
ribosoomide puudumine 

Mimiviirus on oma suuruselt 
 
 
võrreldav bakterirakuga
 Gripiviirus
Pinnavalgud  hemaglutiniin  (H) ja 
neuraminidaas (N) muteeruvad kiiresti

Hemaglutiniin – seostumise raku 
retseptoritega ja viiruse rakku 
sisenemine

Gripiviiruse  genoom  koosneb 8-st 
Neuraminidaas – viiruse nakatunud 
erinevast RNA segmendist, mis pakitakse 
rakust  vabanemine  ja edasikandumine 
valkkesta viiruse assambleerimisel
Oseltamivir (Tamiflu)  on 
Geneetilise materjali segunemine (ingl. 
neuraminidaasi inhibiitor
k. reassortement) võib toimuda siis, kui 
2 sarnast viirust nakatavad sama rakku

Peatab viiruse leviku kehas 
Toimib mitte hiljem kui 2 päeva 
 
pärast   sümptomite ilmnemist
Linnugripp  H5N1 kandub lindudelt 
inimestele

Kardeti viirustevahelist 
rekombineerumist – uus tüüp, mille 
vastu puudub täielikult  immuunsus

Gripi pandeemia –  Hispaania   gripp  
1918, suri 40 miljonit inimest

H1N1 tüvi – seaviirus (swine flu, swine 
influenza
), “uut tüüpi” viirus
RNA  segmendid  on segunenud
Segunenud segmendid on pärit erinevatelt 
gripiviirustelt (kahelt seaviiruselt, inimese 
viiruselt ja linnuviiruselt)

Hakkas levima Mehhikos
Kandub  inimeselt  inimesele
Kardeti pandeemiat  
 
Gripiviirus
Pinnavalgud hemaglutiniin (H) ja 
neuraminidaas (N) muteeruvad kiiresti

Linnugripp H5N1 kandub lindudelt 
inimestele

Kardetakse viirustevahelist 
rekombineerumist – uus tüüp, mille 
vastu puudub täielikult immuunsus

Gripi pandeemia – Hispaania gripp 
1918, suri 40 miljonit inimest

 
 
 
 
PB1 – viiruse  polümeraas
Retroviirused
RNA genoomilt sünteesitakse pöördtranskriptaasi (revertaasi) abil DNA, mis 
integreerub raku genoomi

Raku kromosomaalse DNA koostises olevalt viiruse genoomilt toimub RNA süntees:
mRNA – viiruse geenide avaldumine
genoomne RNA – viiruse genoomi paljundamine

AIDS –  acquired  immune deficiency 
syndrome

1981. aastal kirjeldati USA-s 
homoseksuaalsetel meestel 
immuunpuudulikkusest põhjustatud 
haruldast  kopsupõletiku  vormi ja Kaposi 
sarkoomi; 

Ilmselt levis inimestele 60-80 a. varem 
Haigust põhjustas HIV – human 
immunodeficiency virus

HIV nakatab T helperrakke (aktiveerivad 
teisi immuunrakke), seondudes nende 
pinnal olevatele CD4/CCR5 retseptoritele

 
 
Bakteriofaagide geneetika
Bakteriofaage loodeti rakendada meditsiinilistel eesmärkidel – bakteriaalsete haiguste 
(koolera, tüüfus) ravi

Takistuseks osutus organismi immuunsüsteem
Bakteriofaagide geneetikaga asuti tegelema 1930-ndatel aastatel:
Bakteriofaagide lihtsus võrreldes teiste 
organismidega

Geenide kaardistamised bakteriofaagide abil
Võimaldas täpsemalt defineerida geenide olemust 
Bakteriofaagid ründavad E. coli rakke
 
 
Bakteriofaagide elutsükkel
Virulentsed  faagid  – põhjustavad 
peremeesraku surma

Mõõdukad faagid – võivad püsida 
rakus ilma seda hävitamata

Virulentse  faagi paljunemistsükkel
Sel viisil paljuneb bakteriofaag T4
 
 
Bakteriofaagide elutsükkel
Mõõduka  bakteriofaagi  elutsükkel: valik lüütilise ja lüsogeense tsükli 
vahel

Lüütiline  tsükkel : paljuneb kui 
virulentne  faag , surmates peremeesraku

Lüsogeenne tsükkel: faagi genoom lülitub 
bakteri kromosoomi ja kandub 
kromosoomi koostisosana 
tütarrakkudesse

Kromosoomiga integreerunud faag – 
proofaag

Profaagi vabanemisel kromosoomist 
käivitub lüsogeenne tsükkel

 
 
Sel viisil paljuneb bakteriofaag lambda
Bakteriofaag  T4 ja tema sugulased
E. coli T-faagide genoom on dsDNA, lineaarne
T2, T4, T6 – 167000 bp
T7 – 39000 bp

T-faagide partiklid on teadaolevatest viiruspartiklitest kõige komplekssemad
Kapsiidi struktuurvalgud ja assambleerumisel osalevad  valgud  võtavad enda alla 40% 
geneetilisest informatsioonist

Ikosaeedriline pea, helikaalne  tupp , kuusnurkne 
basaalplaat

Tupp ja pea on ühendatud kaelusega
Basaalplaadile kinnituvad sabakiud ja nõelad

 
 
Bakteriofaag T4 infektsioonitsükkel
Varajane infektsioonistaadium – avalduvad varajased 
geenid
1) Inaktiveeritakse faagi poolt kodeeritud valkude abil 

raku geenide transkriptsioon ja  translatsioon
2) Toimub faagi genoomi paljundamine
Hiline infektsioonistaadium – 
avalduvad hilised geenid
1) Kapsiidivalkude ja faagi 
DNA-d protsessivate 
valkude süntees

2) Faagipartiklite 
assambleerimine
3) Faagi poolt kodeeritud 
lüsotsüüm lõhub 
rakuseina 

 
 
Bakteriofaag T4 assambleerimine
Kapsiidi komponentide 
assambleerimisrajad on üksteisest 
sõltumatud

 
 
Restriktsiooni-modifikatsiooni süsteem  bakterites
Kaitseb bakterirakku bakteriofaagide eest
W. Arber leidis, et T4 paljunemine on osades E. coli tüvedes restrikteeritud (piiratud)
E. coli tüve B rakkudes 
paljundatud faagi edasine 
paljunemine on takistatud tüve K 
rakkudes ja vastupidi  

 
 
Restriktsiooni-modifikatsiooni süsteem bakterites
Restriktaasid – endonukleaasid, mis fragmenteerivad DNA-d spetsiifilistest kohtadest 
Metülaasid – modifitseerivad nukleotiide restriktaaside poolt äratuntavatest 4 – 6 bp 
pikkustest DNA järjestustest, kaitstes DNA-d restriktaasi eest

Rakus lagundatakse võõrast DNA-d, mis ei ole antud bakteritüve restriktaasi eest 
kaitstud

E. coli  tüves RI on kirjeldatud 
restriktaas  EcoRI ja sellele vastav 
metülaas, mis metüleerib adeniini 
restriktaasi poolt äratuntavast 
järjestusest GAATTC

 
 
Bakterifaagi DNA modifitseerimine
Vahetult pärast faagi varajaste geenide avaldumist lagundatakse bakteri DNA faagi poolt 
kodeeritud endonukleaaside abil

Faagi enda DNA on lagundamise eest kaitstud, kuna sisaldab hüdroksümetüültsütosiini 
(HMC) tsütosiini (C) asemel 

Faagi poolt kodeeritud  ensüüm  viib tsütosiini 
HMC-ks

Faagi DNA replikatsioonil osaleb valk, mis 
takistab C lülitumist HMC asemel DNA 
ahelasse

Et kaitsta faagi DNA-d restriktaaside eest, 
glükosüleeritakse see faagi 
glükosüültransferaasi poolt

 
 
CRISPR – uus kaitsemehhanism bakteriofaagide vastu
CRISPR – clustered, regulatory 
interspaced short palindromic 
repeats

Segment bakteriofaagi genoomist 
integreerub bakteri kromosoomi 
spetsiifilisse CRISPR lookusesse

CRISPR  lookus sisaldab peaaegu 
identseid kordusjärjestusi ja 
nende vahele jäävaid vahealasid 
(spacers
), mis pärinevad 
erinevate viiruste genoomidest

CRISPR lookuselt 
transkribeeritud RNA (crRNA) ja 
CAS geenide poolt kodeeritud 
valkude vahel moodustub 
kompleks , mis seondub rakku 
nakatava viiruse genoomile ja 
lagundab  selle

Repeats – 24-47 bp
Spacers – 26-72 bp

 
 
CAS –  CRISPR-associated proteins
Erinevalt konserveerunud
Konserveerunud kõigis (cas)
Ainult osades (cs
)
Cse – cas subtype E. coli
 
 
Bakteriofaagi fenotüüp
Faagide puhul saab nende fenotüüpi 
kirjeldada faagi ja peremeesraku 
interaktsioonide kaudu

Üks põhilisi tunnuseid on faagi laikude 
morfoloogia 

Faag nakatab tardsöötmele külvatud 
baktereid ja lüüsib need – tekivad 
rakuvabad laigud (plaagud)

Laigud võivad olla erineva suurusega, 
servadega  (säbrulised või ühtlased), 
läbipaistvusega (selged või hägused)

 
 
Bakteriofaagide fenotüüp
Faagilaikude morfoloogia:
Metsiktüüpi faag T2r+ –  väikesed säbrulised laigud
T2 kiirelt rakke lüüsiv mutant T2r – suured 
teravaäärelised laigud

Faagi peremeesring:
Metsiktüüpi faagid nakatavad E. coli tüve B
Metsiktüüpi T2 (T2h+) ei nakata  B tüve mutanti B/2 :
 B + B/2 segu puhul on laigud hägusad
T2 mutant h (T2h) nakatab tüvesid B ja B/2:
 B + B/2 segu puhul on laigud läbipaistvad
 
 
Metsiktüüpi faag T2r+ –  
väikesed säbrulised laigud

T2 kiirelt rakke lüüsiv mutant 
T2r
 – suured teravaäärelised 
laigud

 
 
B + B/2 segu puhul saadakse 
metsiktüüpi faagiga h+
 
hägusaid laike ja mutandiga h
 
läbipaistvaid

 
 
Faagide ristamine: geneetilise rekombinatsiooni 
toimumine faagidel

1946. aastal teatasid Delbrück ja Hershey geneetilise rekombinatsiooni toimumisest 
faagidel 

Ristati faage, mis erinesid 
teineteisest laikude morfoloogia ja 
peremeesringi poolest

Selleks nakatati tüve B rakke 
mõlema faagiga

B tüves paljundatud faagide 
Vanemtüüpi
Rekombinandid
järglaskonnaga nakatati tüvede B ja 
B/2 segu

Suured hägusad
Suured läbipaistvad
Saadi vanemtüüpi ja rekombinantse 
fenotüübiga  faagi laike  

Väikesed läbipaistvad 
 
Väikesed hägusad
 
Vanemtüüpi ja  rekombinantse 
fenotüübiga faagid tekitavad 
erinevaid laike 

 
 
Faagi geenide peenstruktuur
Benzer kaardistas faagi T4 rII lookuse 
mutatsioone  kahes järjestikku paiknevas geenis 
rIIA
 ja rIIB
rII mutandid põhjustavad suuri terava servaga 
laike ja ei paljune tüves K12 

Algsel T4-l on laigud väiksemad ja säbruliste 
servadega

Tüves B ristatud rII mutantide järglaskonnaga 
nakatati tüve K12

Tüves K12 paljunesid ainult rekombinandid, 
kus oli taastunud algne fenotüüp

Tüve K-12 nakatamisel saadud faagilaigud 
loendati  ja arvutati rekombinatsioonisagedus:

 
 
Rekombinatsioonisageduse arvutamine
Rekombinatsioonisagedus:
2 x metsiktüüpi rekombinantide arv
      Faagide üldarv

Metsiktüüpi rekombinantide arv on vaja 2-ga 
korrutada, kuna lisaks neile tekib sama palju ka 
topeltmutante

Rekombinatsioonisageduse arvutamiseks 
määratakse faagi tiiter – baktereid nakatavate 
faagide (infektsiooniühikute) üldarv 
ruumalaühikus

Näiteks kui preparaat sisaldas 109 faagi ja 
sellega saadi tüves K12 kaks metsiktüüpi 
rekombinanti:

rekombinatsioonisagedus on 4 x 10-9
Geneetiline distants:
      2 x laikude arv tüves K12
      Laikude arv tüve 
 s B
x 100
 
Deletsioonmutantide kasutamine geneetilises  analüüsis
Kui mutatsioonikohad paiknevad geneetilsel kaardil lähestikku, on 
rekombinatsioonisagedus madal:

1) Rekombinatsioonisagedusest tuleb maha arvata spontaansete revertantide 
tekkesagedus

2) Kaardistatakse deletsioonmutante, mis ei ole võimelised spontaanselt  
                    metsiktüübiks reverteeruma
Rekombinante ei saada, kui 
punktmutatsioon on tekkinud 

Rekombinante saadakse ainult siis, 
asukohas, mis teisel faagil on 
kui deletsioonid ei kattu
deleteerunud
 
 
Faagide geneetiline kaardistamine – geeni peenstruktuuri 
määramine Benzeri laboris

Põhitulemused:
1) Kõige väiksemaks mutatsiooniüksuseks  on üks aluspaar (bp)
2)  Rekombinatsioon  võib toimuda kahe külgneva aluspaari vahel
3) Lükati ümber varasem seisukoht nagu oleks geen jagamatu ja seega kõige väiksem  
     mutatsiooni ja rekombinatsiooni üksus

 
 
 
 
Faagi T4  rII lookuse geneetiline kaart
Lookus koosneb kahest geenist rIIA ja rIIB
Osades kohtades toimuvad mutatsioonid sagedamini – kuumad punktid
 
 
Faagi T4 geneetiline kaart on esitatud rõngasmolekulina, kuigi 
kromosoom  on lineaarne

 
 
Miks on T faagide geneetiline kaart esitatud rõngasmolekulina?
Lineaarse genoomi replikatsioonil jäävad DNA molekulide otstesse üksikahelalised 
alad, sest DNA süntees toimub ainult 5´- 3´suunas:

Geneetiline info lineaarsete DNA molekulide  otstest  läheb replikatsiooni 
käigus kaotsi 

Lahendus:
Kapsiidi pakitud DNA 
molekulid sisaldavad 3 – 5% 
ulatuses terminaalseid  kordusi  

Terminaalsete kordustega DNA 
molekulid rekombineeruvad, ja tekivad 
konkatemeerid (sama genoomi 
lineaarsed kordused)

 
 
T4 DNA molekulid on otstest redundantsed  ja tsirkulaarselt 
permuteeritud 

Redundantsed – sisaldavad otstes samu järjestusi
Tsirkulaarselt permuteeritud – algavad suvalisest 
geenist

Põhjus:
Faagi genoomi kapsiidi pakkimisel 
lõigatakse konkatemeerid lahti kindla 
pikkuse tagant, mis ületab genoomi  suuruse

 
 
Faagidel esineb geenide kattuvus
Iseloomulik faagidele, kelle genoom on väike
Faagi ΦX174 genoomiks on ssDNA rõngasmolekul, 
mis koosneb 5386-st nukleotiidist, kuid kodeerib 11 
erinevat valku

Geen E (rakkude lüüs) sisaldub 
geenis D (viiruspartikli 
assambleerumine)

E ja D asuvad erinevates 
lugemisraamides

Geen J (valkkesta komponent) 
asub kolmndas lgemisraamis

 
 
Retroviirused
RNA genoomilt sünteesitakse pöördtranskriptaasi (revertaasi) abil DNA, mis 
integreerub raku genoomi

Raku kromosomaalse DNA koostises olevalt viiruse genoomilt toimub RNA süntees:
mRNA – viiruse geenide avaldumine
genoomne RNA – viiruse genoomi paljundamine

AIDS – acquired immune deficiency 
syndrome

1981. aastal kirjeldati USA-s 
homoseksuaalsetel meestel 
immuunpuudulikkusest põhjustatud 
haruldast kopsupõletiku vormi ja Kaposi 
sarkoomi; 

Ilmselt levis inimestele 60-80 a. varem 
Haigust põhjustas HIV – human 
immunodeficiency virus

HIV nakatab T helperrakke (aktiveerivad 
teisi immuunrakke), seondudes nende 
pinnal olevatele CD4/CCR5 retseptoritele

 
 
DNA süntees retroviiruse 
genoomselt RNA-lt on 
mitmeetapiline protsess

HIV evolutsioneerub kiiresti:
1. Pöördtranskriptaas teeb DNA 
sünteesil palju vigu

2. Viiruse kapsiidi pakitakse  2 
koopiat RNA molekuli → DNA 
sünteesil võib toimuda matriitsi 
vahetus 

→ Tekib rekombinantne viirus, kui 
genoomi koopiad ei ole identsed

 
 
HIV-i geenid, mis on seotud viiruse paljunemisega ja 
geeniregulatsiooniga

gag – kapsiidivalk
pol
 – pöödtranskriptaas ja integraas
Need geenid on kõigil retroviirustel
env – ümbrise glükoproteiin
HIV-i genoomilt sünteesitud DNA molekuli otstes on pikad terminaalsed 
kordusjärjestused LT 
 R (long terminal repeats), mille va  hendusel integreerub viirus 
raku genoomi 
Retroviiruse DNA integreerumine raku genoomi 
Endonukleaasse aktiivsusega integraas tekitab 
LTR-desse üksikiahelalised katked – tekivad 
kleepuvad  otsad , kus 3´otsad on 5´otstest 
lühemad (3´recessed ends
)
3´otste kaudu atakeeritakse 
fosfodiestersidemeid märklaud-DNA-s

Moodustuvad uued fosfodiestersidemed HIV-DNA 3
´otste ja peremeesraku genoomse DNA 5´fosfaatide 
vahel

Üksikahelalised alad sünteesitakse täis DNA 
reparatsiooniensüümide poolt

 
 
HIV elutsükkel
Lisaks CD4-le on HIV-il veel lisaretseptorid (koretseptorid) CCR5 ja CXCR4
CCR5 deletsiooniga alleeli homosügootses olekus kandvad indiviidid ei nakatu HIV-ga
 
 
Eestis on 23% heterosügoote, kes kannavad inaktiivset CCR5 alleeli
Superinfektsioon – kaks erinevat HI viirust nakatavad sama rakku → rekombinantsete 
viirustüvede teke

 
 
HIV-ga nakatunute ravi
Pärast nakatumist järgneb akuutne faas –  palavik , peavalu, veres palju HIV partikleid
Järgneb  latentne  periood (8-10 aastat) – viirus lokaliseerub lümfisüsteemi
Lõppfaas – T helperrakkude arv on langenud > 75%, immuunsüsteem ei toimi enam

Ravimeid HIV-ist vabanemiseks ei ole leitud
Erinevad  ravimid   pärsivad  viiruse 
elutsükli erinevaid etappe:

Võimalik on pikendada latentset faasi
Epvir ja Retrovir – 
pöördtranskriptaasi inhibiitorid

Crixivan –  proteaasi  inhibiitor
(primaarne translatsiooni-
produkt  lõigatakse 
proteaasi abil erinevateks 
viirusvalkudeks) 

Close-up view of   
an infected T cell, showing HIV particles  → 
budding from its surface
APOBEC → viirusevastane kaitsemehhanism
APOBEC valk deamineerib viiruse  genoomis  tsütosiini uratsiiliks, 
põhjustades mutatsioone → viirus nõrgeneb

Virion Infectivity Factor Vif – kodeeritud HIV-i poolt 
kaitseb viirust APOBEC toime vastu
 
 

Document Outline

  • Slide 1
  • Slide 2
  • Slide 3
  • Slide 4
  • Slide 5
  • Slide 6
  • Slide 7
  • Slide 8
  • Slide 9
  • Slide 10
  • Slide 11
  • Slide 12
  • Slide 13
  • Slide 14
  • Slide 15
  • Slide 16
  • Slide 17
  • Slide 18
  • Slide 19
  • Slide 20
  • Slide 21
  • Slide 22
  • Slide 23
  • Slide 24
  • Slide 25
  • Slide 26
  • Slide 27
  • Slide 28
  • Slide 29
  • Slide 30
  • Slide 31
  • Slide 32
  • Slide 33
  • Slide 34
  • Slide 35
  • Slide 36
  • Slide 37
  • Slide 38
  • Slide 39
  • Slide 40
  • Slide 41
  • Slide 42
  • Slide 43
  • Slide 44
  • Slide 45
  • Slide 46
  • Slide 47
  • Slide 48
  • Slide 49
  • Slide 50
Vasakule Paremale
Viiruste geneetika #1 Viiruste geneetika #2 Viiruste geneetika #3 Viiruste geneetika #4 Viiruste geneetika #5 Viiruste geneetika #6 Viiruste geneetika #7 Viiruste geneetika #8 Viiruste geneetika #9 Viiruste geneetika #10 Viiruste geneetika #11 Viiruste geneetika #12 Viiruste geneetika #13 Viiruste geneetika #14 Viiruste geneetika #15 Viiruste geneetika #16 Viiruste geneetika #17 Viiruste geneetika #18 Viiruste geneetika #19 Viiruste geneetika #20 Viiruste geneetika #21 Viiruste geneetika #22 Viiruste geneetika #23 Viiruste geneetika #24 Viiruste geneetika #25 Viiruste geneetika #26 Viiruste geneetika #27 Viiruste geneetika #28 Viiruste geneetika #29 Viiruste geneetika #30 Viiruste geneetika #31 Viiruste geneetika #32 Viiruste geneetika #33 Viiruste geneetika #34 Viiruste geneetika #35 Viiruste geneetika #36 Viiruste geneetika #37 Viiruste geneetika #38 Viiruste geneetika #39 Viiruste geneetika #40 Viiruste geneetika #41 Viiruste geneetika #42 Viiruste geneetika #43 Viiruste geneetika #44 Viiruste geneetika #45 Viiruste geneetika #46 Viiruste geneetika #47 Viiruste geneetika #48 Viiruste geneetika #49 Viiruste geneetika #50
Punktid 50 punkti Autor soovib selle materjali allalaadimise eest saada 50 punkti.
Leheküljed ~ 50 lehte Lehekülgede arv dokumendis
Aeg2015-11-08 Kuupäev, millal dokument üles laeti
Allalaadimisi 9 laadimist Kokku alla laetud
Kommentaarid 0 arvamust Teiste kasutajate poolt lisatud kommentaarid
Autor RViikoja Õppematerjali autor
Viiruspartiklid assambleeritakse eelnevalt valmissünteesitud komponentidest

Viiruspartiklid ei kasva ega jagune

Puudub geneetiline info energia tootmiseks ja valgusünteesiks

Sarnased õppematerjalid

Viiruste geneetika
6
doc

Viiruste geneetika

15. Viiruste geneetika Viiruste definitsioon. Viirused on obligatoorsed rakusisesed parasiidid. Samas on rakusisesed parasiidid ka mitmed prokarüootsed organismid, näit. bakterid perekonnast Rickettsiae ja Chlamydiae, mis suudavad rakuväliselt eksisteerida ainult väga lühiajaliselt. Seetõttu on viiruste defineerimiseks vaja juurde tuua veel lisaparameetrid: 1) Viiruspartiklid assambleeritakse eelnevalt valmissünteesitud komponentidest 2) Viiruspartiklid ei kasva ega jagune 3) Puudub geneetiline info energia tootmiseks ja valgusünteesiks. Viiruste spetsiifika: Iga viirus on võimeline nakatama ainult teatud tüüpi rakke. Vastavalt sellele klassifitseeritakse viiruseid loomaviirusteks, taimeviirusteks ning bakteriviirusteks e. bakteriofaagideks. Viirusega nakatamiseks on

Geneetika
7 loeng-Kordamisküsimused geneetikas ja mõisted
4
doc

7 loeng. Kordamisküsimused geneetikas ja mõisted

Kordamisküsimused geneetikas loeng 7 kohta: 1. Iseloomusta viiruste eripära? - Viirused on mitterakulise ehitusega obligatoorsed rakusisesed parasiidid. Definitsiooni juurde käib veel kitsendusena: viirusosad pannakse kokku eelnevalt rakus sünteesitud komponentidest viirused ei kasva ega jagune viiruse genoomis puudub geneetiline info energia tootmiseks ja valkude sünteesiks. Esineb DNA (kaksik- ja üksikahelalise) ja RNA (üksik- ja kaksikahelalise) genoomiga viirusi. viirustel on üks erineva suurusega kromosoom

Geneetika
Geneetika eksam
69
pdf

Geneetika eksam

o Gripiviiruse genoom koosneb 8-st erinevast RNA segmendist, mis pakitakse valkkesta viiruse assambleerimisel o Geneetilise materjali segunemine võib toimuda siis, kui 2 sarnast viirust nakatavad sama rakku Rekombinantsed girpiviirused ja nendega seotud ohud: Linnugripp ​(H5N1)​: o Kandub lindudelt inimestele o Kardeti ​viirustevahelist rekombineerumist – uus tüüp, mille vastu puudub täielikult immuunsus o Hispaania gripp 1918 – pandeemia; viirus suutis välja lülitada RIG1 geeni, mis põhjustab immuunsüsteemi ülereageerimise H1N1 tüvi – seaviirus, „uut tüüpi“ viirus: o RNA segmendid on segunenud o Segunenud segmendid on pärit erinevatelt gripiviirustelt ​(kahelt seaviiruselt, inimese viiruselt ja linnuviiruselt) o Hakkas levima Mehhikos o Kandub inimeselt inimesele o Kardeti pandeemiat 3. Selgitage retroviiruse paljunemist HIV näitel. HIV-ga nakatunute ravi Retroviirused:

Kategoriseerimata
Viroloogia
54
docx

Viroloogia

Viroloogia Viiruse definitsioon Viirused on rakulist ehitust mitteomavad obligatoorsed endoparasiidid. Erinevad rakulise ehitusega parasiitidest selle poolest, et :  Viirus ei ole iseseisvalt aktiivse eluga väljaspool rakku. Viiruse bioloogiline aktiivsus avaldub ainult nakatunud rakus.  Viiruse geneetiline materjal asub vahetult rakus, ei ole ümbritsetud mingi membraaniga.  Viirus ei paljune pooldumisega vaid sünteesitakse ta struktuurseid osasid ja pakitakse jälle kokku.  Ükski teadaolev viirus ei kodeeri tervikliku translatsioonisüsteemi.  Viirus on võimeline peremeesrakust lahkuma ja nakatama teisi rakke. Virion- viiruse osake  Virion- viirus-spetsiifiline struktuur , mis on ette nähtud viiruse genoomi toimetamiseks ühest rakust teise. Erinevused virioni struktuuris kajastavad enamasti erinevusi viiruste elutsüklites.

Bioloogia
Bakterid-geneetika-immunoloogia
38
docx

Bakterid, geneetika, immunoloogia

erinevate rakkude membraanile. Mikroobide tundlikkust MAC-ile nim seerumtundlikkuseks. Humoraalne immuunsus – antikehade poolt vahendatud immuunsus IMMUNOGLOBULIINID on antikehad, mille spetsiifiline antigeen on kindlaks tehtud (IgG, IgA, IgM, IgD, IgE). * Seotud B-lümfotsüütidega. (tüümusest sõltumatud lümfotsüüdid) Rakuline immuunsus – immuunvastus, mille tagavad peamiselt T8- lümfotsüüdid ja tsütokiinid; suunatud eeskätt viiruste ja kasvajate vastu Rakulises immuunvastuses osalevad lümfotsüüdid diferentseeruvad tüümuses – tüümusest sõltuvad Immunoglobuliinid - antikehad, mille spetsiifiline antigeen on kindlaks tehtud Opsonisatsioon - protsess, kus mikroob vm osake kaetakse antikehade või komplemendiga, tehes selle äratuntavaks ja fagotsüteeritavaks fagotsüütidele. kr keeles „söödavaks tegema“. Opsoneerivat toimet omavad osad IgG, IgM

Mikrobioloogia
Mikrobioloogia
39
docx

Mikrobioloogia

kiirguse. Kiirguse baktereid kahjustava toime mehhanismid § Adsorbeerunud valgus (peamiselt tsütokroomides) põhjustab liigse energia vabanemise tõttu molekulaarse hapniku tekke - tegemist on väga tugeva oksüdeerijaga, mis põhjustab kahjustusi. § UV kiirgus põhjustab DNA-s spetsiidilisi kahjustusi, tekivad tümiini dimeerid. § Ioniseeriv kiirgus põhjustab: H-sidemete katkemise, paljude ühendite oksüdeerumise, DNA katkemise. Balterite geneetika Bakterite geneetika § Haploidsed, enamasti tsirkulaarse genoomiga (E. coli 4.5 X 106 bp.) § Kiire kasv (E. coli 20 minutit generatsiooniaeg; seepärast, 1 rakust 1000000 7 tunni vältel.) § Vedelsöötmes ~109- 1010 küllastustasemel, bakterite sademes ~ 1012 rakku/g. § Rakutuuma puudumine; § Monokromosomaalsus ja haploidsus; § DNA on kogu oma pikkuses funktsionaalne; § Prokarüootsed rakud poolduvad mitoosita Nukleiinhapped DNA ­ info kandja, säilitaja ja vahendaja; (bakterites,

Mikrobioloogia
Putukate-vetikate ja ainuraksete suured DNA genoomsed viirused
36
docx

Putukate, vetikate ja ainuraksete suured DNA genoomsed viirused

Putukate, vetikate ja ainuraksete suured DNA genoomsed viirused Baculoviirused moodustavad suure viiruste sugukonna (teada üle 500 liigi). Neile kõigile on iseloomulikud suured tsirkulaarsed dsDNA genoomid, mis on virionis pakitud kepikesekujuline nukleokapsiid (lad. baculum – kepike, siit ka sugukonna nimetus). Baculoviirustele on iseloomulik nakatunud rakkudes spetsiifiliste inklusioonkehade moodustamine. Baculoviiruseid on kõige enam teada liblikalistel, kuid neid on leitud ka kahetiivalistel, ehmestiivalistel ja ka krevettidel. Baculoviirustel esineb kahte tüüpi virione:

Bioloogia
Viirused
58
pdf

Viirused

Varased geenid stimuleerivad rakukasvu, mis võimaldab viiruse genoomi replikatsiooni peremehe DNA polümeraasi poolt, kui rakud jagunevad. Viirus-indutseeritud rakkude arvukuse tõus põhjustab naha basaal- ja ogakihi (stratum spinosum) paksenemist. Basaalrakkude diferentseerudes põhjustavad erinevates nahakihtides ja –tüüpides ekspresseeritavad tuumafaktorid erinevate viirusegeenide transkriptsiooni. Hiliseid geene ekspresseeritakse ainult lõplikult diferentseerunud pealmises nahakihis, viirus pakitakse kokku tuumas. Kasutades naharakkude küpsemist, saab viirus naha pinnale ja eritatakse/irdub koos nahapinna surnud rakkudega. Patogenees. Infitseerivad ja paljunevad lameepiteelis, indutseerides epiteeli proliferatsiooni: nahas tüükad, limaskestadel genitaalsed, oraalsed, konjuktiivipapilloomid. Tüügas areneb viiruse poolt indutseeritud raku kasvu ja basaal-, granuloos- ja ogakihi paksenemise tõttu

Bioloogia




Meedia

Kommentaarid (0)

Kommentaarid sellele materjalile puuduvad. Ole esimene ja kommenteeri



Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun