Chlorotoxin – klorotoksiin Mis see on? Klorotoksiin on 36 aminohappest koosnev peptiid, millest kaheksa aminohapet on nelja disulfiidsidemega seotud tsüsteiinid. Tegemist on väikesemõõdulise toksiiniga, mis neutraalses keskkonnas (pH=7) on tugevalt positiivse laenguga. Mida see teeb? Klorotoksiin muudab sellega mürgitatud saaklooma liikumisvõimetuks. Paralüüsi kestus oleneb klorotoksiini hulgast. Klorotoksiin on esimene teadaolev kõrge afiinsusega ligand Cl- kanalitele ning blokeerib madala juhtivusega Cl- kanaleid. Ühe kanali sulgemiseks kulub üks ligandmolekul. Kus seda leidub? Leiurus quinquestriatus skorpionides, inglise keeles Deathstalker Scorpion, tuntud ka kui Palestiina kollane skorpion, Omdurmani skorpion, Iisraeli kõrbeskorpion jt, mis on seotud loomaga kaubitsemisega. Leiurus quinquestriatus tähendab laias laastus ingliskeelde tõlgituna viietriibulist silesaba
Ülikool Jevgenia Bredihhina, magistrikraad, 2010, (juh) Asko Uri, Darja Lavõgina, Isoquinolinesulfonamide-oligoarginine Conjugates: Affinity Enhancement by Variation of Linker Structure, and Design of High-affinity Fluorescent Probe (Isokinoliinsulfoonamiidi konjugaadid:afiinsuse suurendamine linkeri variatsiooni kaudu ning kõrge afiinsusega fluorestsentsmarkeri disain), Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut 2. « 24 ? » 3.12.2010 « 24- , » 11. 2013 « : » 12.01.2011 « » 27.05.2011 3. - , . , , , 4. , , , , . , .
kontraktsiooni, taasliitumine lõdvestab lihase. Kanali avamine võib olla kas pinge- või Ca2+ tundlik (vt. pilt slaidilt 30). Ca2+ kanalid on ebahariliku kujuga jalgstruktuurid (vt. pilt slaidilt 32), läbi nende liigub Ca2+ lihaskiududesse. Uuringutest antagonistidega (mis blokeerivad Ca2+ kanali aktiivsuse) selgus, kuidas vabaneb Ca2+ vastuseks närviimpulsile: Nifedipiini molekulid seostuvad DHP-retseptorite (Ca2+ vabanemise kanal) t- tuublis. Rüanodiin seostub kõrge afiinsusega Ca2+ vabanemise kanaliga sarkomeeri terminaalsetes tsisternides. 3
(otsast 5'-3' lõikavad) tulevad lõikama, aga see on 5'-5' 3) translatsiooni promootor 4) 5' lähimate intronite äralõikamise promootor Mis on HDAC ehk histooni deatsetülaas Ensüümiklass, mis eemaldab atsetüülgrupid epsilonNatsetüül lüsiin aminohappe histoonil. See teguviis on vastupidine histoon atsetüültransferaasile HDAC eemaldab need atsetüülgrupid, et suurendada positiivset laengut histoonide sabades ja soodustab suure afiinsusega sidumist histoonide ja DNA selgroo vahel. See protsess kondenseerib DNA struktuuri, hoides ära transkriptsiooni. HDAC tegeleb keskkonnast tuleneva info protsessimisega, rakuprotsessidega, raku kasvu ja surmaga, inimhaigustega ntx vähiga. Deatsetüleerimine muudab kromatiini resistentseks nukleaasidele ja moodustub kromatiin kiudstruktuur (väga kokkupakitud) Atsetüleeritud vormis DNA fosfaatrühma negatiivne laeng neutraliseerib lüsiini positiivset laengut.
Esitletakse antigeen. Th rakud tunnevad antigeen-MHCII kompleksi ära, mille tulemusena Th rakk aktiveerub. Th rakk ekspresseerib CD40L ja interaktsioon CD40 tagab teise signaali. B rakk hakkab tsütokiinide retseptoreid tootma ja Th tsütokiine. Seondumine nende vahel tagab signaali, mis on vajalikud B raku proliferatsiooniks ja diferantsiooni plasma ja mälurakkudeks. Tsütokiinidel on ka tähtis roll antikehade tüübi määramiseks, mida tootma hakatakse. TD korral toodetakse kõrge afiinsusega antikehi, see tuleb sellest, et annavad b rakule edasi signaali, et nad toodaksid kõrge afiinsusega antikehi. TI korral on madal afiinsusega antikehad. ANTIGEENIDE ESITLEMINE JA ÄRATUNDMINE T-RAKKUDE POOLT T rakk tunneb ära kompleksi (MHC+peptiid), mis on talle esitletud rakumembraani pinnal. Valguline antigeen peab olema degradeeritud peptiidideks (antigen processing). On kaks teed, endogeenne ja eksogeenne.
ATP-aasne aktiivsus, tuleb ta viia aktiivsesse konformatsiooni. Selleks on erinevaid võimalusi: 1) Aktivaatori fosforüleerimine. Näiteks NtrC puhul toimib NtrB-vahendatud fosforüleerimise kaskaad, fosforüleeritud NtrC-l suureneb afiinsus TE suhtes ja toimub valgu oligomeriseerumine; 2) Seondumine efektormolekuliga. E. coli rakus on 600-700 70 ja 100 54 molekuli. Samas on E. coli genoomis ainult 20 54sõltuvat promootorit. Seega on isegi madalama afiinsusega promootorid 54-holoensüümi poolt okupeeritud ja valmis aktivatsiooniks. Miks on nii vähe 54-sõltuvaid promootoreid? Arvatakse, põhjus on selles, et bakterigenoomis on geenidevahelised alad liiga lühikesed, et EBP-d saaksid seonduda reguleeritavast promootorist sobivale kaugusele, ilma et see häiriks teiste geenide tööd. Nii see, et transkriptsiooni aktivatsioon 54 tüüpi promootorilt saab toimuda ainult transkriptsiooni
Fagotsütoos esineb kõikidel organismidel Käsnadel on olemas võõra eristamise meh-id liigi tasemel. Kõrgemal tasemel eristatakse võõrast juba isendi tasemel. Kõigil selgroogsetel on T-ja B-rakud ning antikehad (alamatel liikidel vähem klasse). Omandatud ehk adaptiivne ehk spetsiifiline immuunsus on tõhusam kui kaasasündinud immuunsus. Selle tagavad imetajatel ja lindudel B- ja T- lümfotsüüdid, mis sünteesivad kõrge afiinsusega retseptoreid, mis tunnevad ära miljonit erinevat ligandit, enamasti peptiide. B- ja T-lümfotsüütidel on võtmeroll omandatud immuunsuses. Omandatud immuunsus vajab toimeks erilisis rakke ja organeid.Omandatu immuunsusel on kahte tüüpi vastust: Ühe reaktsioonina (humoraalne vastus) sekreteerivad B-lümfotsüüdid antikehasid ja teise reaktsioonina (rakuline vastus) tapavad tsütotoksilised T-lümfotsüüdid viirusinfekteeritud rakke 2. Loomuliku immuunsuse 4 kaitsemehhanismi
metabolism ei ole nii tõhus. Aeroobsete mikroorganismide muutumine anaeroobseteks Fakultatiivsed mikroorganismid on võimelised muutma oma metabolismi, vastavalt keskkonna tingimustele. Üleminekul aeroobselt anaeroobsele metabolismile või vastupidi kaasnevad muudatused. Näiteks E.Coli sünteesib kahte erinevat tsütokroomi oksüdaasi. Madala hapniku tingimustes on vaja terminaalse oksüdaasi kõrgemat afiinsust hapnikule, seetõttu on indutseeritud kõrgema afiinsusega tsütokroom-d kompleks ja madalama affinsusega tsütokroom-o kompleks on represseeritud. Anaeroobsetes tingimustes toodetakse lisaks veel vähemalt viite terminaalset oksüreduktaasi (nitraadi reduktaas, DMSO/TMAO reduktaas, TMAO reduktaas, fumaraadi reduktaas). Kui mitmed elektroni akseptorid on olemas üheaegselt, siis energeetiliselt rohkem soodustatud akseptoreid kasutatakse kõigepealt. Kogu see akseptorite süsteem on reguleeritud erinevate mehhanismide poolt. ArcAB süsteem
Km
substraadiga ([ES]=[E]t), seega Vmax= k2 [E]t
5.4 Kirjutage Michaelis-Menteni võrrand ja selgitage seda graafiku peal.
Mida näitavad Km ja Vmax väärtused? Mida näitab kcat? Mida näitab
kcat/Km?
Km – Michaelise konstant: substraadi kontsentratsioon, mille juures reaktsioonikiirus on ½
maksimaalkiirusest. Seostatakse ensüümi afiinsusega: mida väiksem on K m, seda suurem on
afiinsus. Samas kui on k2 <
või transportimisest. Põhimõtteliselt toimub sel viisil eelpoolkirjeldatud glütserooli soodustatud difusioon. Konkreetse substraadi rakku transportimiseks on mitu erinevat süsteemi välja kujunenud tavaliselt siis, kui vastav substraat on rakkude kasvu seisukohalt oluline, kuid selle kontsentratsioon võib ulatuslikult varieeruda. Sel juhul on üks süsteemidest konstitutiivne ning substraadi suhtes madala afiinsusega. 14. Bakterirakkude adapteerumine näljaga. Rakkude nälgimine (mille tulemusena rakkude kasv peatub ja nad püsivad statsionaarses kasvufaasis) kutsub esile üldise stressivastuse. Kui keskkonnatingimused muutuvad toitainete ammendumise tõttu ebasoodsamaks, vallandub rakkudes esmalt nn "stringent response" (SR). SR vallandub rakkudes vastusena aminohapete näljale ja võimaldab neil adapteeruda tingimustes, kus energiaressursid on väiksemad. Selle tulemusena pikeneb rakkude generatsiooniaeg
Kus saame hakata rääkima äratundmisest ja kaitsest. Bakterid-restriktaasid ja metülaasid (arhedel ka), oma DNAd ei restrikteerita, äratundmispiirkond palindroom (alati?). Seened-antibiootikumid, Aktinomütseedid ja linnud-biotiini kõrvaldamine. Avidiin ja streptavidiin. avidiin (linnumuna munavalged, vaba biotiin sealt ära) ja streptavidiin (streptomütses, kasutab kui antibiootikumi seda valku) – tetrameersed valfud, ülikõrge afiinsusega vitamiin biotiini suhtes. Ilma biotiinina ei saa keegi elada, võtada ära siis suurepärne kaitse. Mida madalam dissotsiatsioonikompleks seda madalamatel kontsidel moodustavad ühendid ja ei lahku üksteisest, kiiremini toimuvad reakstioonid, siin ääretult kõrge afiinsus Kd= 10-15 , teised valgud transpordivad vitamiini B12 – ei ole kaitsesüsteemi valgud, suur afiinsus samuti Kd= 10-15. Teistel bioloogilistel molekulidel on suuremad diss konstandid.
Kuid neuroleptikumid kiirendavad DA metabolismi! Arvid Carlsson postuleeris, et neuroleptikumid blokeerivad DA-retseptorid, käivitades tagasisidemehhanismi abil DA-neuronite kiirenenud laenglemise - jääb tagajärjetuks, kuna retseptorid on blokeeritud. Kuna neuroleptikumide afiinsus retseptori suhtes on oluliselt suurem kui DA-l, ei suuda virgats tavalistel tingimustel retseptoreid hõivata. Positrone kiirgava süsiniku isotoobi lisamine suure afiinsusega D2-retseptoritele seonduvale raklopriidile võimaldab inimese ajus retseptorid nähtavaks muuta - neid on eriti tihedalt basaaltuumades. Annusest sõltuv konkurents aripiprasooliga retseptorite pärast näitab seondumise spetsiifilisust. Amfetamiin suudab vähendada [123I]IBZM seondumist DA-retseptoritele, massiivse DA vabanemise esilekutsumisega - see efekt on suurem SCH- patsientidel haigushoo ajal, kuid mitte remissioonis. Närvikoe arenguhäire seletamaks skisofeeniat
· Koliini ja m-retseptorite agonistide manustamine ei aita · ACh inhibitorid: takriin (1993) vajab sagedast manustamist ja on raskesti talutav + pöörduv maksakahjustus · Uuemad: rivastigmiin on parem kui takriin, galantamiin veel parem, donepesiil kõige paremini talutav · Glutamaadiretseptorkompleksi mõjustajad (memantiin): vähendavad glutamaadi püsimõju ja suurendavad sellega erutustransmissiooni tõhusust MEMANTIIN: Mõõduka afiinsusega NMDA-retseptorite mittekonkureeriv antagonist, mille seondumine sõltub voltaazhist (ta on voltaazhitundlik) ja on kiiresti muutuv · 28-nädalases uuringus 20 mg päevas (kahes osas) aeglustas oluliselt Alzheimer'i tõve arengut platseeborühmaga võrreldes · Kognitiivsed võimed paremad memantiiniga ravimisel ka vaskulaarse dementsusega patsientidel · Kõrvaltoimed: kõhulahtisus, unetus, peapööritus, peavalu, hallutsinatsioonid
1) esmalt toimub reoviiruse antiretseptori seondumine siaalhappe jäägile; 2) järgneb seondumine spetsiifiliste valk-valk interaktsioonide kaudu (selles osaleb antiretseptori "pea"-struktuur). Seega on võimalik, et retseptori seondamises osalevad erinevad 1 valgu domäänid (vt. ülal). Funktsionaalsete retseptoritena on reoviiruse peremeesrakkudel seni identifitseeritud mitmed (afiinsuse poolest erinevaid) retseptori kandidaate: kõige kõrgema afiinsusega on 67 kDa glükoproteiin (sarnaneb struktuurilt - adrenergilise retseptoriga); teised glükoproteiinid (EGF-retseptor (54 kDa), 47 kDa glükoproteiin) on madalama afiinsusega. Reoviiruse sisenemine rakku toimub clathrin'ist sõltuva retseptor-vahendatud endotsütoosi teel (ca. 20-30 min. peale infitseerimist). Viirus sattub moodustuvatesse endo- ja lüsosoomidesse, milles toimub pH taseme langus. pH langusega endosoomis kaasneb reoviiruse virioni valkude
jäävad mõneks päevaks lümfisõlme. Siin see paljuneb ja APC-lt saadud vihjete alusel diferentseeruvad järglasrakud erinevate funktsioonidega efektorrakkudeks. CD8- T-rakud omandavad võime tappa sihtmärkrakke. CD4- T-rakud võivad diferentseeruda mitut erinevat tüüpi efektorrakkudeks, sh nendeks, mis võivad aktiveerida makrofaage, CD8- T- rakke ja B-rakke. B-rakud lümfisõlmes Lümfisõlmes B-rakud aktiveeritakse ja diferentseeritakse kõrge afiinsusega antikehasid sekreteerivateks plasmarakkudeks. B-raku aktiveerumine vajab nii antigeeni seondumist B-raku BCR-retseptorile kui ka otsest kontakti aktiveeritud Th- rakuga. Mõlemad sündmused on tagatud lümfisõlme anatoomiaga. B-rakud erinevad T-rakkudest selle poolest, et nende retseptorid saavad ära tunda vaba antigeeni. B-rakk kohtub antigeeniga tavaliselt folliiklis. Kui tema BCR seondub antigeenile, aktiveerub B-rakk osaliselt ning ,,neelab alla" ja protsessib selle antigeeni.
põhjal van Helmont: avastas mitme õhutaolise aine olemasolu, võttis kasutusele termini gaas, uuris puidu põlemisel tekkivat süsihappegaasi, sai reaktsioonides ka lämmastikoksiidi, vääveldiokiidi jm, imal neid uurimata.Üritas tõestada, et taimed koosnevad ainult veest Glauber: esimesi, keda võib pidada õigustatule keemikuks.mõistis, et soolad tekivad happe-aluse reaktsioonil, selgitas reaktsioone keemilise afiinsusega. Täiustas paljude ainete saamismeetodeid. Tootis keemilisi ravimeid ja pani oma meetodid, retseptid täpselt kirja. Stahl: flogistoniteooria looja, leidis, et puidu põlemine ja metallide roostetamine on analoogsed protsessid. Põlevad ained on rikkad flogistoni poolest Boyle: avastas, et õhu ruumala on pöördvõrdeline rõhuga, väljendas oma teoses ,,skeptiline keemik", et aine on element, kui seda ei õnnestu enam lihtsamateks aineteks lagundada
(4) 27. Immuunvastuse regulatsioonimehhanismid. Immuunvastuse regulatsioonis osalevad: • Tsütokiinid (autonoomne-, sünergistlik- ja antagonistlik toime). • Idiotüüp/antiidiotüüpne võrgustik (Ig-d, TCR) • Supressorid • Kontrasupressorid (ehk regulatoorsed T-rakud) Tsütokiinid. Tsütokiinid on erilised mediaatorid, mis tagavad rakkudevahelise kontakti immuunreaktsiooni, põletiku ja reparatsiooni korral. Rakupinna spetsiifiliste kõrge afiinsusega retseptoritega seostumise tõttu stimuleerivad tsütokiinid rakkude diferentseerumist, proliferatsiooni ja funktsionaalset aktiivsust. Erinevalt hormoonidest on tsütokiinide toime lokaalne. Tsütokiinid on valgud või glükoproteiinid. Neid produtseerivad eri liiki rakud, kuid kõige sagedamini leukotsüüdid. Tsütokiinid avaldavad toimet vastavate rakuretseptoritega seostudes, kusjuures ühel rakuliigil on retseptorid mitme tsütokiini jaoks.
transpordis osalevad valgulised kompleksid. Elektronide liikumisel NADH/FADH2-lt hapnikule iga vaheülekandja kõigepealt redutseerub omandades elektroni ja seejärel oksüdeerub, andes elektroni järgmisele vaheühendile. Seega iga ülekandja esineb vaheldumisi oksüdeerunud ja redutseerunud vormis, mida nimetatakse redokspaariks. Mis määrab redokspaaride järjekorra elektronide ülekandes, sõltub redokspaari afiinsusest elektroni suhtes. Väiksema afiinsusega redokspaar annab elektronid suurema afiinsusega redokspaarile. mtETA- s toimub seega elektronide liikumine negatiivsema redokspotentsiaaliga redokspaaridelt positiivsema redokspotentsiaaliga paaridele. - NADH-CoQ reduktaasne kompleks (nn kompleks I) - Suktsinaat-CoQ reduktaasne kompleks (kompleks II) - CoQH2-cyt c reduktaasne kompleks (kompleks III) - Cyt c oksüdaasne kompleks (kompleks IV)
osalevad valgulised kompleksid. Elektronide liikumisel NADH/FADH2-lt hapnikule iga vaheülekandja kõigepealt redutseerub omandades elektroni ja seejärel oksüdeerub, andes elektroni järgmisele vaheühendile. Seega iga ülekandja esineb vaheldumisi oksüdeerunud ja redutseerunud vormis, mida nimetatakse redokspaariks. Mis määrab redokspaaride järjekorra elektronide ülekandes, sõltub redokspaari afiinsusest elektroni suhtes. Väiksema afiinsusega redokspaar annab elektronid suurema afiinsusega redokspaarile. mtETA-s toimub seega elektronide liikumine negatiivsema redokspotentsiaaliga redokspaaridelt positiivsema redokspotentsiaaliga paaridele. - NADH-CoQ reduktaasne kompleks (nn kompleks I) - Suktsinaat-CoQ reduktaasne kompleks (kompleks II) - CoQH2-cyt c reduktaasne kompleks (kompleks III) - Cyt c oksüdaasne kompleks (kompleks IV) Mis toimub elektronide transpordi ja oksüdatiivse fosforüleerumise lahutamisel? Tooge näiteid.
elektronide transpordis osalevad valgulised kompleksid.: Elektronide liikumisel NADH/FADH2 lt hapnikule iga vaheülekandja kõigepealt redutseerub omandades elektroni ja seejärel oksüdeerub, andes elektroni järgmisele vaheühendile. Seega iga ülekandja esineb vaheldumisi oksüdeerunud ja redutseerunud vormis, mida nim redokspaariks. Mis määrab redokspaaride järjekorra elektronide ülekandes, sõltub redokspaari afiinsusest elektroni suhtes. Väiksema afiinsusega redokspaar annab elektronid suurema afiinsusega redokspaarile. Afiinsuse mõõduks on redokspotentsiaal, mida väljendatakse voltides. Mida negatiivsem on redokspotentsiaal, seda väiksem on afiinsus elektroni suhtes ja seda parem elektroni doonor redokspaar on. mtETAS-s seega elektronide liikumine toimub negatiivsema redokspotentsiaaliga redokspaaridelt positiivsema redokspotentsiaaliga paaridele. NADH-CoQ reduktaasne kompleks (nn kompleks I),
glutamiini ja ATP-d, siis GlnB inhibeerib glutamiini süntetaasi GlnE kaudu. Kui - ketoglutaraadi/glutamiini vahekord läheb liiga suureks, siis GlnB-le pannakse külge UMP ning glutamiini süntetaas aktiveeritakse GlnE kaudu. Peale GlnB 48 seondub -ketoglutaraat GlnK-ga, mis on GlnB homoloog, ja aktiveerib ammooniumi transportsüsteemi AmtB. AmtB kaudu ammooniumi transport on energiat kulutav ning kõrge afiinsusega ammooniumi transportsüsteem. GlnK kaudu AmtB aktiveerimisega reguleeritakse rakus väga täpselt N-allika olemasolu. Nendest seostest tulenevalt võib -ketoglutaraati pidada E. coli 's keskseks metaboliidiks, mis reguleerib C:N tasakaalu, aktiveerides N-assimilatsiooni ning pärssides C-allika lagundamist läbi Crp-cAMP signaali ning peale selle - ketoglutaraat otseselt inhibeerib PTS-i kaudu glükoosi transporti rakku. Aminohapete transport ja metabolism
Redutseerumine toimub astmeliselt, igal astmel seotakse 2 elektroni. N = N NH=NHH2N-NH2 2NH3 39. Kuidas tagatakse anaeroobne keskkond nitrogenaasse kompleksi funktsioneerimisel, miks see on vajalik? Mügarat ümbritseb parenhüümsete rakkude kiht, mis on hapnikule raskesti läbitav. Rakkudes on vaja hapnikku, et saaks toimuda energia tootmine (ATP süntees mitokondriaalses ETA-s). Hapniku transport ahelasse toimub leghemoglobiini vahendusel. bakteroidi tsütokroomi oksüdaas seob O2 madala afiinsusega. Fe ja MoFe valgu katalüütiline aktiivsus pärsib O2 sisaldus keskkonnas. 40. Millisel kujul on omastavad taimed mullast lämmastikku? Võivad omastada nii ammooniumioonina kui nitraatioonina. Kui pH on aluseline või nõrgalt happeline, siis on eelistatud nitraatide omastamine, kuna nitrifitseerijad bakterid konverteerivad ammoniaagi nitraadiks. Happelises keskkonnas on nitrifitseerijate bakterite elutegevus pärsitud ja taimed omastavad rohkem ammooniumioone. 41
10 mg/kg. Toksiline ja letaalne konts vereplasmas on vastavalt 0,2 ja 1,0 g/ml. fütoöstrogeenid · Paljud taimed sisaldavad fütoöstrogeene, mille suurtes kogustes söömine (näiteks lutserni või ristiku koosseisus) võib rohusööjatel põhjustada viljatust ning isaste feminiseerumist. Nende konts taimes on suurim õitsemise ajal. · Fütoöstrogeenid seonduvad imetajarakus samade retseptoritega, millega östradiool, kuid 20-200 korda väiksema afiinsusega. Seetõttu on nende östrogeenset efekti esile kutsuv toime in vivo 500-10 000 korda nõrgem kui endogeensel östrogeenil. ning nad saavadõ takistada imetajate endogeensete steroidsete östrogeenide toimet ning suuremates doosides indutseerida antigonadotroopseid efekte hüpotalaamuse, hüpofüüsi e. ajuripatsi ning gonaadide tasemel mõlemast soost indiviidide korral. · Fütoöstrogeenid on paljud isoflavonoidid (genisteiin, glütseteiin, daidzeiin), nende
perekonda, mille liikmed osalevad rakkude elus hoidmises ja jagunemises. NGF on oluline ka neuronite regeneratsioonil ning on potentsiaalseks Alzheimer'i tõve ravimiks. NGFl arvatakse olevat ka teisi füsioloogilisi funktsioone, eeskätt immuunsüsteemis. NGFil on kaks retseptorit TrkA ja p75(NTR). NGFi signaali edastav retseptor on türosiinkinaasne TrkA ja mõnedes rakkudes indutseerib p75 programmeeritud rakusurma (apoptoosi). NGFi kõrge afiinsusega sidumiseks on vaja mõlemat retseptorit. Sidumise tulemusena retseptori türosiinkinaas aktiveerub ja indutseerib signaalsete kaskaadide tekke. Üheks signaali rajaks on phospholipaas C aktiveerumine, kusjuures vabaneb DAG ja IP3 ning aktiveeritakse assotseeritud rajad, nagu näiteks proteiinkinaas C rada. Teiseks NGF-aktiveeritud rajaks on ras-seoseline MAP kinaaside kaskaad. See rada aktiveerib TFi AP-1. Lisaks sellele TFile on NGFi radade märklaudadeks ka Egr ja CREB
Inimese organismis on raud seotud valkudega hemoglobiini ja müoglobiiniga, transferriiniga jne. Inimkehas on kokku u 4g rauda, sellest lõviosa on seotud hemoglobiiniga. Kui haigetele rauapreparaate manustada, võidakse saavutada soovimatu efekt stimuleerida haigustekitaja arengut. Aneemia on organismi kaitsereaktsioon. Mõned patogeenid saavad aga raua kätte ka nt transferriinilt, heemist ja hemoglobiinist. 12 Bakterite siderofooridest on kõige suurema afiinsusega rauale enterobaktiin. Enterobaktiinile sarnane siderofoor on batsillibaktiin mis on avastatud batsillidel. Inimese immuunsüsteem sünteesib valku siderokaliin, mis seob enterobaktiin/raud ja batsillibaktiin/raud komplekse, et bakterid ei saaks neid rakku transportida. Sedorokaliini nim ka siderofooride tolmuimejaks. Eksoensüümid suured orgaanilised molekulid pääsevad rakku alles siis, kui nad on väljaspool rakku hüdrolüüsitud koostisosadeks, mis on suutelised läbima rakumembraani
tertsiaarstruktuuris (kolmemõõtmeline struktuur ühe subühiku piires). Siin on rohkem parameetreid, sest kasutatakse erinevaid dissotsiatsioonikonstante erinevate olekute jaoks kõigile olekuletel pole sama dissotsiatsioonikonstant, see annab suurema võimaluse võrrandeid paindlikuks teha. Diagnostiline test KNF mudelile on negatiivse kooperatiivsuse esinemisele. Negatiivne kooperatiivsus järgnevad ligandid seostuvad vähema afiinsusega, seega ligandi konts tõustes läheb seondumine vähem afiinsemaks. Konformatsiooniline muutus, mis indutseeritakse naabersubühikus, see on halvem ja afiinsus väheneb. Neg koop võib segi minna eeleksisteeriva ebavõrdusega, kus valgu subühikutel ongi kohe erinev afiinsus substraadi suhtes, ligandist sõltumata ongi valk selline. Siis on olukord, et kõrgema afiinsusega subühikud täidetakse ennem jne, näeb välja nagu negatiivne kooperatiivsus.
Toksiline ja letaalne konts vereplasmas on vastavalt 0,2 ja 1,0 g/ml Paljud taimed sisaldavad fütoöstrogeene, mille suurtes kogustes söömine (näiteks lutserni või ristiku koosseisus) võib rohusööjatel põhjustada viljatust ning isaste feminiseerumist. Nende konts taimes on suurim õitsemise ajal. Fütoöstrogeenid seonduvad imetajarakus samade retseptoritega, millega östradiool, kuid 20-200 korda väiksema afiinsusega. Seetõttu on nende östrogeenset efekti esile kutsuv toime in vivo 500-10 000 korda nõrgem kui endogeensel östrogeenil. ning nad saavadõ takistada imetajate endogeensete steroidsete östrogeenide toimet ning suuremates doosides indutseerida antigonadotroopseid efekte hüpotalaamuse, hüpofüüsi e. ajuripatsi ning gonaadide tasemel mõlemast soost indiviidide korral. Fütoöstrogeenid on paljud isoflavonoidid (genisteiin, glütseteiin, daidzeiin), nende glükosiidid
rauda omastama. Lisaks transpordile transferriin väldib Fe kasutamise võimalust bakterite poolt Fe on seotud transferriiniga (sulundatud) ja pole bakterite poolt kasutatav > Fe on bakteritele vaja ensüümsüsteemidele ja patogeenuseks. Teatud bakterid, näiteks Staphylococcus aureus, sekreteerivad Fe seostuvaid valke siderofoore, mis peale veres oleva Fe sidumist "pöörduvad tagasi" bakteri pinnal oleva retseptorini. Siderofoorid on suurema afiinsusega Fe suhtes, kui transferriinid pidev konkurents siderofoor versus transferritiin. Organism seevastu toodab laktoferriini, mis on veelgi afiinsem võrreldes siderofooridega, "eemaldades" omakorda Fe bakteritelt. Teisesed kaitsebarjäärid Mitteadaptiivse immuunsüsteemi rakud - koe fagotsüüdid, makrofaagid, eosinofiilid, neutrofiilsed granulotsüüdid fagotsüteerivad, patogeene surmavad, põletikku indutseerivad, spetsiifilises
Nerve growth factor (NGF) kuulub neurotrofiinide perekonda, mille liikmed osalevad rakkude elus hoidmises ja jagunemises. NGF on oluline ka neuronite regeneratsioonil ning on potentsiaalseks Alzheimer'i tõve ravimiks. NGF arvatakse olevat ka teisi füsioloogilisi funktsioone, eeskätt immuunsüsteemis. NGFil on kaks retseptorit TrkA ja p75(NTR). NGFi signaali edastav retseptor on türosiinkinaasne TrkA ja mõnedes rakkudes indutseerib p75 programeeritud rakusurma (apoptoosi). NGFi kõrge afiinsusega sidumiseks on vaja mõlemat retseptorit.Sidumise tulemusena, retseptori türosiinkinaas aktiveerub ja indutseerib signaalsete kaskaadide tekke. Üheks signaali rajaks on, phospholipase C aktiveerumine, kusjuures vabaneb DAG ja IP3ning aktiveeritakse assotseeritud rajad, nagu näiteks protein kinase C rada. Teiseks NGF-aktiveeritud rajaks on rasseoseline MAP kinaaside kaskaad. See rada aktiveerib TFi AP-1. Lisaks sellele TFile i on NGFi radade märklaudadeks ka Egr ja CREB
- odasaba – erinevates segmentides (lülides) avalduvad eri geenid eri tugevusega - Pax61 geen – silmageen, avaldub rakkudes, millest tekib liitsilm. Kui pax61 geen panna jalgade arengut määrava geeni asemele, siis jala peal on silm st geeni ümbertõstmisel on tulemused dramaatilised organismi tasemel (äädikakärbes). - võimendid on olulised geeni ekspressiooni mustri avaldumisel, ta võimaldab paremini kontrollida geeni mustri avaldumist. - kui on kõrgema afiinsusega transkriptsiooni aktiveeritud sidumiskohad, siis on teatud rakkude hulk suurem. - selleks, et saada keerulist ja komplekset organismi, ei pea olema palju geene. Loevad geeni regulaatorid, aktivaatorid, võimendid. Box geenide avaldumine äädikakärbsel ja hiirel - selgroogne justkui „tagurpidi“ putukas - box geenid (homeaatilised) määravad ära, milline geenikomplekt avaldub vastavas kehasegmendis Inimese kõnet määrav geen FOXP2 - leidub ainult see üks geen
annaabi.ee 
