Epiteelirakus jääb torukese valendiku poole apikaalne plasmamembraan (kaetud mikrohattudega) ja vere poole basolateraalne plasmamembraan (sissesopistised). Tagasi imendumine toimub mitmete mehhanismide abil: primaarne aktiivne transport, kandja-vahendatud sekundaarne aktiivne transport, lahustunud ainete kaasahaaramine vee poolt ja passiivne difusioon. Esinevad kotransporterid, kanalid, vahetajad, aktiivsed pumbad. Proksimaalses tuubulis toimub Na + transport enamasti Na+K+ ATPaasi abil, mis asub basolateraalses membraanis - väljutab 3 Na+ ja võtab sisse 2 K+ iooni. See pump vähendab Na+ rakusisest kontsentratsiooni ja tõstab rakusisest K+ kontsentratsiooni. K+ saab difundeeruda mööda konts. gradienti rakust välja (rakk muutub seest vrdl väljaspoolega negatiivsemaks) – Na+ saab transportida kandjavalgu abil sekundaarse aktiivtranspordiga rakku. Toimub kotransport Na + ja teise aine (glükoos, AH, sulfaat, tsitraat) vahel
2) antiport - transporditavad ained liiguvad vastassuundades. *Seda tüüpi transport on oluline laenguta molekulide absorbeerimisel, samuti anioonide neeldumisel. [Prootonitega sümport nitraadi, kaaliumi, sulfaadi ioonidele ning ka aminohapetele, sahharoosile ja heksoosidele.] 5 *Iooniks kasutatakse prootonit, kuna seda on hulganisti H+-ATPaasi vahendusel välja transporditud ja kasutataksegi seda kotranspordis. Defineerige sekundaaraktiivne transport. Millised ained liiguvad taimerakkudesse sekundaaraktiivse transpordi vahendusel Sekundaaraktiivne transport ei kasuta otseselt ATP energiat, et aineid transportida, vaid elektrokeemiliste potentsiaalide erinevust. Nt Glükoosi transporditakse niimoodi rakku koos Na ioonidega. [*Seda tüüpi transport on oluline laenguta molekulide absorbeerimisel, samuti anioonide neeldumisel
pumbatakse läbi selle kompleksi elektroni ülekandel vabanenud energia arvel luumenisse Ensüümkompleks NADPH2 sünteesiks ferredoksiin NADP + reduktaas ATP süntaas - ensüümkompleks ATP sünteesiks 8. Peaksite membraani valgusreaktsiooni osasid kujutaval joonisel ära tundma FS I ja FS II, vett lagundava kompleksi, elektrontranspordiahelaga seotud kandja valgud, ATPaasi, NADPH reduktaasi PS = FS Oxygen-evolving complex = vett lagundav kompleks Elektrontranspordiahelaga seotud kandja valgud on plastokinoon(plastoquinone), plastotsüaniin(plastocyanin) ja ferredoksiin(ferredoxin) ATPaas = ATP synthase FNR - ferredoksiin NADP+ reduktaas 9. Miks on FSII valgustpüüdva kompleksiga seotud vett lagundav kompleks? FS II valgustpüüdva kompleksiga on seotud vett lagundav kompleks, et asendada ergastatud
Õhulõhede avanemisel valguses aktiveerub rakumembraani H+-ATP-aas, sekreteeritakse rohkem prootoneid ja membraanipotentsiaal hüperpolariseerub (muutub negatiivsemaks) Kirjutage põhjus-tagajärg ahel mis viib hommikul õhulõhede avanemisele. 1) Valguskvandid aktsepteeritakse fototropiinide PHOT1 ja PHOT2 (valgud, mille flaviinne component tajub sinist valgust) poolt, mis fosforüleerivad ülekandeahela, mis aktiveerib Prooton-ATPaasi 2) Prooton-ATPaas, transportsüsteem sulgrakkude membraanis, hakkab prootoneid sulgrakkudest välja transportima 3) membraan muutub negatiivsemaks (seespool negatiivseid laenguid rohkem) ehk hüperpolariseerub 4) avanevad membraani potentsiaali väärtuse poolt reguleeritavad K+-kanalid, kasvab K+ kontsentratsioon 5) prootonite välja pumpamisega saavad funktsioneerida ka kandjavalgus, mis transpordivad Cl- ja teisi anioone rakku
vedeliku hulk ning jämesool ei jõua seda adsorbeerida). (Osmootse toimega lahtistid - glütseriin, laktitool, laktuloos, makrogool, mannitool, sorbitool). 3. Väljaheite pehmendajad ja stimuleeriva toimega Selle rühma saab jagada omakorda veel: a) Difenüülmetaani derivaadid – fenoolftaleiin, bisakodüül, pikosulfaatnaatrium (Toimemehhanism ei ole täpselt teada – suurendab prostaglandiinide hulka, inhibeerib Na+K+- ATPaasi; bisakodüül toimib peensooles vähendades resorptsiooni ja jämesooles stimuleerides peristaltikat). b) Antrakvinoonid – rabarbrijuur, paakspuukoor, aaloe, sennalehed (Derivaadid toimivad peamiselt jämesooles. Seotud glükosiididega. Jämesooles hüdrolüüsuvad nad bakterite toimel ja vabanevad vabad antrakvinooni derivaadid, mis stimuleerivad plexus myentericus‘t). c) Lahtistid-surfaktandid – dokusaadid, poloksameerid, dihüdrokolaat, kastoorõli (Anioonsed
Punaste vereliblede moodustumine. Toimub punases luuüdis. 15.Monotsüütide ülesanne: Eriti tõhusad fagotsüteerijad. Kapillaaride seinte kudedes makrofaagideks. 16.Fibroosne kõhrkude moodustab: liigeskettad, meniskid, lülide vahekettad 17.Kas jõutreeningul suureneb luukoe tihedus: a) jah 18.Lihakiudude tüpiseerimine kineetilise kriteeriumi alusel: kiired-kiirelt väsivad, kiired-vastupidavad, aeglased-vastupidavad 19.Kõrgeim müosiini ATPaasi aktiivsus: b) glükolüütilistes lihaskiududes 20.Punased e oksüdatiivsed lihaskiud on: c) väsimusele hästi vastupidavad 21.Kaltsiumisoolade tähtsus luukoes: annavad luudele tugevuse 22.Motoorsete ühikute töölerakendamise põhimõte: minimaalne stimulatsioon motoorse neuroni poolt, mis kutsub esile vastasreaktsioon lihaskiudude poolt- erutuslaine 23.Närvi-lihassünapsi ülesanne: kanda edasi närviimpulsid närvirakkudelt lihasrakkudele 24
Sekundaarne sünaptiline pilu sünaptilised põiekesed Lihasraku tuum Skeletilihaskiudude tüübid · Punased lihaskiud - aeglased oksüdatiivsed lihaskiud (punane tingituna müoglobiini kõrgest tasemest) · Valged lihaskiud - kiired glükolüütilised lihaskiud (müoglobiini madal tase) · Lihaskiude jaotatakse ATPaasi aktiivsuse jt. tunnuste alusel kaheks tüübiks · I tüüp - aeglased (punased) lihakiud · IIa tüüp- kiirete lihaskiude alatüüp · IIb tüüp- kiirelt konrtahheeruvad (valged) lihaskiud Lihaskiudude tüübid · Enamus lihaseid on nende kolme lihakiudude tüübi segu · A- aeroobsed (punased) kiud · AN- anaeroobsed (valged) kiud · I intermediaarsed, vahepealse olemusega kiud Reaktsioon ATPaas'ile
kompleksidega. Troponiini kopleksid koosnevad troponiin T (TnT), troponii I (TnI) ja troponiin C (TnC) vormidest. Peene filamendi struktuur: tropomüosiin on superkeerdunud ümber F-aktiini heeliksi, kusjuures iga tropomüosiini dimeer interakteerub aktiini kuue järjestikuse monomeeriga. Troponiin T seostub tropomüosiinile "pea-saba" põhimõttel. Paksude filamentide struktuur: Müosiin - 2 rasket (230 kD), 4 kerget (2 paari erinevaid 20 kD ahelaid) ahelat. Raskete ahelate "peadel" on ATPaasi aktiivsus 2 ning lihaskontraktsioonid toimuvad hüdrolüüsi arvel. 4.) Sarkomeeri funktsioneerimise alused. Aktomüosiini kompleks. Libisevate filamentide mudel ja ATP roll aktomüosiini kompleksi töös. Närviimpulsid, jõudes lihasesse, kutsuvad esile aktsioonipotentsiaali, mis levib t- tuubulite võrgustiku kaudu üle kogu sarkolemmi membraani ja lihaskiu. Signaal läbib triaadi hargmikku ja indutseerib Ca2+ ioonide vabanemise sarkomeerist.
osakesi transporditakse need teisele poole membraani, kus on neid samu osakesi niigi rohkem). Kuna see protsess pole spontaanne (G>0), siis vajab selle toimumine lisaenergiat. Energiaallikaks võib olla ATP, valgus või ioonigradientides salvestatud energia. Primaarseks aktiivseks transpordiks nimetatakse transpordiprotsessi, mis tekitab gradiendi membraanivalgu ja ATP abil. Primaarse aktiivse transpordi näiteks saab tuua Na+, K+-ATPaasi ja H+, K+ -ATPaasi. Na+, K+-ATPaas transpordib rakust välja Na+ ioone ning raku sisse K+ ioone, kasutades seejuures 3 Na+ välja viimiseks ja kahe K+ raku sisse transportimiseks ära ühe ATP. Kui Na+, K+-ATPaas seob endaga ATP, siis muudab ta oma kuju (konformatsiooni), mille tagajärjel suudab ta siduda kolme Na+ molekuli ja transportida need rakust välja.Kuna Na+ ioonide kontsentratsioon väljaspool rakku on niigi suurem
prantoprasool Kineetika: Manustatakse hommikuti rohke vedelikuga. Biosaadavus esmasel annustamisel 35 %, hiljem tõuseb 60%-ni, poolväärtusaeg 40 min. 95% seondub vereplasma valkudega. Laguneb happelises keskkonnas (kapslid, kaetud tabletid). Metaboliseerub maksas ja 80% metaboliititest eritatakse uriiniga. Toimemehhanism: Osa imendunud ühendist tungib mao limaskesta. Mao limaskesta parietaalrakkudes aktiveerub tsükliliseks sulfeenamiidiks (pH <4). Seob H+/K+- ATPaasi sulfiidsidemega pöördumatult, blokeeritakse H+-ioonide transport läbi parietaalraku sekretoorse membraani maovalendikku, inhibeerib H+/K+-ATPaasi. Pärssiv toime maohappe produktsiooni sõltub annusest, toime on kiire ja avaldub nii basaal- kui stimuleeritud sekretsioonile stiimuli päritolust sõltumata. Ei toimi AcK ja histamiiniretseptoritesse. Kasutamine: • Maohaavandid (paranemine tavaliselt 8 nädalat) • Kaksteistsõrmiksoole haavandid (paranemine tavaliselt 4 nädalat) K
Ioongradiendi stabiilsust saavutatakse aktiivsete transpordiprotsessidega: membraanivalgud transpordivad läbi membraani kontsentratsiooni- või elektrilisele gradiendile vastupidises suunas, kasutades selleks metabolismienergiat. 105. Mis on K+-Na+ -pump? See on membraanide süsteem, mis toob esile ainete transpordi, mille järel toimub molekulide ülekandmine väiksema kontsentratsiooniga alalt suurema kontsentratsiooniga piirkonda. Kasutades ATPaasi molekulide energiat pump toob Na-ioone rakust välja ja viib K-ioone sisse. 106. Kuidas töötab K+- Na+-pump? Mis ta toimetab rakku, rakust välja? Na-Ka-pump ühe ATPaasi molekulide energiat toob Na-ioone rakust välja ja viib K-ioone sisse. 107. Mitu iooni eemaldatakse ja mitu saadakse ühe tsükliga? Na-Ka-pump ühe ATPaasi molekuli energia arvel viib välja 3 Na+ ja toob rakku 2 K+, eemaldades ühe laengu. 108. Millised rakukanalid on avatud puhkeolekus? K-iooni kanalid 109
Kõrgemate IAA kontsentratsioonide pärssivat toimet venivuskasvule seletatakse kasvuinhibiitor etüleeni sünteesi kiirenemisega IAA kõrgematel kontsentratsioonidel. (IAA aktiveerib ACC sünteesi, mis on etüleeni sünteesiahela vaheühend). JAA toime lag periood on ~10 min, st ei ole seotud uue valgu sünteesiga. Kasvu maksimum saabub ~1 tunni möödudes ja kestab ~1 ööpäev. IAA toime mehhanism venivuskasvule on käsitletud hüdraulilise kasvu peatükis. Lisaks H+-ATPaasi aktiveerimisele suureneb IAA toimel teatud taimedes osmootselt aktiivsete ainete neeldumine välislahusest ja rakuseina materjali sekreteerimine Golgi kompleksi vahendusel. IAA mõjul on leitud ka H+-ATPaasi valgu sünteesi. Fototropism Tropismideks nimetatakse kindlasuunalise ärritaja poolt esile kutsutud kasvuliikumisi st liikumine on põhjustatud taime erinevate piirkondade erinevast kasvukiirusest. Reageerivad ainult noored kasvavad taimeosad.
H+-ATPaas aktiveerub valguse, eriti sinise (aga ka punane valgus)valguse toimel. Valguse aktseptoriks on sensorvalgud PHOT1 ja PHOT2, mis on Ser tüüpi proteiinikinaasid ja toimub autofosforüülumine, mis põhjustab 14-3-3 valgu seostumist H+-ATPaasiga ja selle aktiveerumist. 52. Õhulõhede avanemisel sulgrakkude membraan hüperpolariseerub/depolariseerub (õige variant alla kriipsutada). Miks? Prootonite sekreteerimine H+-ATPaasi toimel põhjustab membraani hüperpolariseerumist (membraaniopotentsiaal muutub negatiivsemaks nt -50 mV-80 mV) ja Kin+ kanalid avanevad, ja kaalium siseneb. 53. Kirjutage põhjus-tagajärg ahel mis viib hommikul õhulõhede avanemisele. Hommikul õhulõhed avanevad, sest fotosünteesi algusega päikese tõustes väheneb süsihappegaasi kontsentratsioon rakuvaheruumides
tsütoplasmasse. Klatriin dissotsieerub ja retsükliseeritakse. Tekkinud lahtiriietunud vesiikul ühineb teiste sarnaste vesiikulitega ja moodustub nn varajane (primaarne) endosoom. Endosoomis on kergelt happeline keskkond, seal algab endotsüteeritud materjali lagundamine. Varajased endosoomid muutuvad hilisteks (sekundaarseteks) endosoomideks. Muutumise käigus toimub põhiliselt 2 protsessi: endosoomi sisemus hapustub H+-ATPaasi funktsioneerimisel ja seejuures vabanevad retseptorid, mis võivad retsükliseeruda ning endosoomis langeb pH ning toimub selle muutumine küpseks lüsosoomiks Teiseks autofaagia. Selle protsessi käigus lagundatakse raku enda vananenud komponendid. Lagundamisele minev organell ümbritsetakse membraaniga, tekib autofagosoom. See ühineb endosoomiga ning muutub autofagolüsosoomiks. Autofaagia on täpselt reguleeritud vastavalt raku vajaduste muutustele
pinnalaengu jaotusega. 12 Hsp 70 molekulaarne mehhanism valkude pakkimisel Valke aitavad õigesti pakkida molekulaarsed chaperonid. Eukarüootidel on 2 suuremat klassi chaperone (Hsp 70 –toimivad valgu varajases eas ja Hsp 60- toimib pärast valgu sünteesi lõppu). Kõik molekulaarsed chaperonid on ATPaasid ehk nad katalüüsivad ATP hüdrolüüsi. Hsp 70 (heat shock protein) asub tsütosoolis ja mitokondriaalses. Tavaolekus on Hsp 70 kui ATPaasi aktiivusus madal, kuid kui valk väljub ribosoomist, tunneb Hsp 70 substraati siduv domeen ära valgus olevad hüdrofoobsed alad ja seondub nendega. Selle tegevuse käigus stimuleeritakse tema kui ATPaasi aktiivsust ja suureneb ATP hüdrolüüs. ADP- seotud olekus Hsp 70 afiinsus substaadiga on kõrge ja ta seob endaga polüpeptiidahela kokkupakkimata alad, eriti hüdrofoobsed alad. Kaitstes niimoodi valku kuni produktiivse pakkimiseni. Edasise ATP hüdrolüüsi kiirenemise eest
happelise väliskeskkonnaga, siis ta omandab prootoni ja muutub neutraalseks. Neutraalse molekulina saab ta rakku siseneda. Rakust väljuda saab auksiin ainult basaalses osas, kus on tema spetsiifiline kandjavalk. 40. Auksiin soodustab rakkude venivuskasvu. Millist Lockharti võrrandi komponenti auksiin mõjutab ja kuidas? Plastilisuskoefitsenti (m). Muudab rakud kergemini deformeeritavaks ristseoseliste glükaanide (GAX) lagundamisega. IAA muudab rakuseinad plastilisemaks (aktiveerib H+ATPaasi, aktiveeruvad rakuseinas hüdrolüütilised ensüümid, mis lagundavad ristseoselised glükaanid. 41. Statoliidid on tärkliseterad, mis on statotsüütidest raskusjõu mõjul väljasadenenud statotsüüdid on amüloplaste sisaldavad rakud 42. Mis on apikaalne domineerimine Kui tipupung inhibeerib külgpungade arengut. Kui tipupung eemaldada, siis hakkavad külgmised kasvama jõudsalt. Tipupungades kõrge IAA konts see muudab ta tarbivaks piirkonnaks, kuhu toimub toitainete juurdevool
3 Pernitsioosne aneemia saaks iseloomustada gastrointestinaal autoimmuunse haigusena, mis viib kobalamiini enk vitamiin B12 malarbsorptsiooniks, millega omakorda esineb megaloblastiline aneemia (Song 2013: 200). Peamiseks etioloogiliseks faktoriks on kroonilise gastriidi korral esinev maoseina limakesta atroofia seoses antikehade aktiivsusega parietaal rakkude vastu. Käsitledes lähemalt, patoloogia väljendub antikehadega indutseeritud H +/K+ ATPaasi ensüümi ja parietaal rakkudega poolt proditseeritud sisemise faktori ehk Intrinsic factor (IF) glükoproteiini destruktsioonis. Koos ensüümi puudusega langeb ka maohape koostises oleva soolhape tootmine, mis vastutab kobalamiini vabastusest toidust. (Briani 2013: 4525). Mao inflammatoorsed protsessid tihti assotsieeruvad Helicobacter pylori'ga, millele järgneb eelnevalt kirjeldatud kõrvalekalde (Lahner 2009: 5121).
protoneeritud = dissotseerumata kujul. Dissotseerumata kujul on auksiin membraane läbiv. Tsütoplasmas on aga aluseline pH ning seal on auksiin dissotseeritud → auksiin ei läbi enam vabalt membraane. St auksiin kuhjub rakkudes (antiport prootonitega ja saab sealt välja). Auksiin soodustab rakkude venivuskasvu. Millist Lockharti võrrandi komponenti auksiin mõjutab ja kuidas? Auksiin mõjutab raku seinte plastilisuse komponenti. IAA aktiveerib H+-ATPaasi → väliskeskkond hapustub → aktiveeruvad rakuseina hüdrolüütilised komponendid (pH optimum on happelises keskk) → muutub rakuseina struktuur. Üheks hüdrolüütiliseks ensüümiks, mis niimoodi aktiveeritakse on XET, mis lagundab ristseoseliste glükaanide glükosiidsidemeid ning seeläbi muutub rakusein plastilisemaks. ΔV/ Δt*V = Lm/(L+m) * (π -Y) Valemist lähtub, et relatiivne kasvukiirus sõltub relatiivsest hüdraulilisest juhtivusest,
1. Aeroobne hingamine (oksüdatiivne fosforüleerimine) kõige efektiivsem energia genereerimise viis. Rakumembraanis töötab elektronide transpordi ahel (hingamisahel), kus terminaalseks elektroniaktseptoriks on molekulaarne hapnik. Elektronide transpordi käigus viiakse läbi tsütoplasm membraani prootoneid H+, mille tulemusena tekib elektrokeemiline gradient (prootonpotentsiaal). Prootonite läbi tsütoplasma membraani tagasipumpamisel sünteesitakse F1F0 ATPaasi abil ATP-d 2. Anaeroobne hingamine membraanis toimuv elektronide ülekandmise protsess. Kasutab hapnikule alternatiivseid elektronaktseptoreid nagu nitraat, nitrit, fumaraat, dimetüülsulfoksiid (DMSO) ja trimetüülamiin N-oksiid (TMAO) 3. Fermenteerimine e. käärimine toimub anaeroobsetes tingimustes terminaalsete elektronaktseptorite puudumisel. Energiat genereeritakse substraadi tasemel fosforüleerimisel.
18.Iseloomustage K/Na-ATPaas-i ja nimetage mõni protsess, mille läbiviimisel on oluline. Loomsetes organismides on sümpordis transporditavaks iooniks tavaliselt Na, sest Na+/K+- ATPaas tekitab suure Na gradiendi (vähe rakus ja palju väliskeskkonnas). Näiteks glükoosi transport rakkudesse toimub sümpordis Na+-ga. Taimedes konkreetse aine (iooni) transport kandjate vahendusel toimub sageli sümpordis või antipordis prootonitega, mis on rakkudest välja viidud H+-ATPaasi vahendusel. 19 Millise membraanipotentsiaali juures avanevad pingesõltuvad K kanalid närvirakkudes?K- kanalid avanevad, kui membraanipotentsiaal on positiivne. 20. Loetlege närviimpulsside tekkimises ja edasiliikumises osalevad transportvalgud. Neurotransmitteriteks võivad olla keemiliselt struktuurilt suhteliselt erinevad ained, üheks enimlevinumaks on atsetüülkoliin. Ergastavad neurotransmitterid avavad Na kanalid ja põhjustavad Na sisenemist ning seega membraani depolariseerumist
siseneb 2 mooli atsetüülkoensüüm A-d? 0 40. Pärast aktsioonipotentsiaali tekkimist taastub neuroni puhkeseisundile omane membraanipotentsiaal K+ ioonide väljumise arvel 41. Membraanipotentsiaalist sõltuvate Na+ kanalite puhke- (refraktsiooni) periood on oluline Aktsiooni potentsiaali ühesuunaliseks liikumiseks 42. Kuidas on võimalik vältida H+ATPaasi funktsioneerimisega kaasnevat membraani hüperpolariseerumist? Nii katioonide impordi kui anioonide ekspordiga TEST 10 1. 2,4 DNP (2,4 dinitrofenool) teeb mitokondrite membraanid prootonitele läbitavaks ja kaotab prootonite kontsentratsiooni erinevuse membraani eri pooltel. Mis juhtub loomaga, kellele on süstitud DNP lahust mitmel korral eksperimendi jooksul? Sünteesib vähem ATP-d 2. Rasvhape oksüdeerub 10-ks AcCoA molekuliks
kehalisel tööl: fosfokreatiini varude mahtuvus ja ammendumine skeletilihases, laktaadi kuhjumine lihasrakku, pH langus, selle mõju glükogenolüüsi raja ensüümide aktiivsusele, aktomüosiini ATP-aassele aktiivsusele, Ca2+ ioonide sidumisele troponiini poolt, Na+-K+ -ioonide transpordile läbi rakumembraani: Väsimus anaeroobsel alaktaatsel tööl: 1) fosfokreatiini varude ammendumine lihases; 2) Ca²+ ATPaasi funktsiooni langus, muutused eelkõige kiiretes glükolüütilistes lihaskiududes. Väsimus anaeroobsel laktaatsel tööl: 1) ainevahetusproduktide, eelkõige laktaadi kuhjumine lihasesse; 2) pH langus lihasrakus NAD/NADH + H+ kontsentratsioonide suhte muutus, H+ ja Ca²+ ioonide konkureerimine troponiini Ca-siduvate kohtade pärast, Ca²+ ATPaasi funktsiooni langus, Na+ K+ ATPaasi funktsiooni langus. 3) glükogeeni varude vähenemine;
mis sisaldab enamuse GTF'dest. Arvatakse, et selline kompleks istub DNA'le ühe sündmusena. 9. Missugused TAFid on TBPga vahetus interaktsioonis? (TBP on eukarüootse transkriptsiooni faktori TFIID alaühik: TBP + 16 TAF'i = TFIID). Nime järgi võiks oletada, et kõik on. GTF'dest aga TFIIA. 10. Missugune TFII valk hüdrolüüsib ATPd ja mis protsessiga on tegu? TFIIH kahel alaühikul on helikaasi ja ATPaasi aktiivsus. Sellega aitab ta luua transkriptsioonimulli. TFIIH helikaasne aktiivsus saab oma energia ATP hüdrolüüsilt. Selle energia abil keerataksegi START-saidi piirkonnas DNA dupleksi lahti. (TFIIH ühe teise sub-kompleksi roll on fosforüleerida RNA polümeraasi suurima subühiku C-terminaalset domääni (CTD), mis on vajalik polümeraasi vabanemiseks PIC-ilt (pre-initsiatsiooni kompleks) ning transkriptsiooni üleminekul elongatsioonifaasi). 3 11
hapnikule; tekib H2O. Elektronid võivad pärineda ka oksüdeeritavatelt C-allikatelt nagu suktsinaat, laktaat, glütserool ning elektronide ülekannet hingamisahela ensüümidele vahendavad siis spetsiifilised dehüdrogenaasid. Elektronide transpordi käigus viiakse läbi tsütoplasms membraani prootoneid H +, mille tulemusena tekib elektrokeemiline gradient (prootonpotentsiaal). Prootonite läbi tsütoplasma membraani tagasipumpamisel sünteesitakse F1F0 ATPaasi abil ATP-d. 2. Anaeroobne hingamine on samuti membraanis toimuv elektronide ülekandmise protsess, kuid kasutab hapnikule alternatiivseid elektronaktseptoreid nagu nitraat, nitrit, fumaraat, dimetüülsulfoksiid (DMSO) ja trimetüülamiin N-oksiid (TMAO), mis saavad elektrone spetsiifiliste terminaalsete reduktaaside kaudu. Elektronid pärinevad kas glütseroolilt, formiaadilt (sipelghape), NADH-lt või
2) võrgustik-filamendid ristuvad (a-aktiniin, filamiin, spektriin) 131. Aktiini mootorvalkude müosiinide - struktuur Keemilist energiat motoorseks muutev valk e mehhanokeemiline ensüüm. Koosneb rasketest ja kergetest ahelatest. Raskeid ahelaid 1-2, sõltuvalt tüübist. Koosneb kolmest domeenist: 1 Pea, N-terminaalne, seostumiskohaks aktiinile nim ka P-ling. Seostumiskohaks ATPle, omab ATPaasi aktiivsust, toodab mehhaanilist jõudu 2 Kael, ümbritsetud kergete ahelatega ja võib olla seotud regulaatorvalkudega 3 Saba, C-terminaalne, sisaldab seostumiskohti mis annavad spetsiifilisuse kerged ahelad seovad Ca2+ 132. Peamised etapid müosiin-aktiin interaktsioonis. Ensümaatiliselt aktiivne müosiini pea teostab ATP hüdrolüüsi. Konformatsioonilised muutused müosiinimolekulis, mis libistavad aktiini müosiini suhtes edasi poole(alati - ots
osmoosi teel, nii et kui osmootselt aktiivsed ioonid (Na+, Cl-) absorbeeritakse, järgneb neile vesi. Nii samuti võib vesi ka sekreteeruda läbi rakkude kui ka läbi rakkudevahelise ruumi. Jämesooles resorbeerub vesi osmoosi teel. Na+ resorptsioon on väga ulatuslik. Peensooles on aktiivsed ja passiivsed Na+ resorptsiooni mehhanismid: a) Elektrogeenne Na+ transport: Na+ toimetatakse läbi basolateraalse membraani intertsellulaarruumi Na+- pumba abil, mis saab energiat Na+- K+ATPaasi tööst. 21 Gradiendid põhjustavad vee liikumise valendikust rakku. Kuna tiheühendused on suhteliselt läbilaskvad, voolab Na+ pärast resorptsiooni osaliselt valendikku tagasi. b) Na+- sümpordi abil liiguvad koos Na+-ga ühise kandja abil rakku ka D-heksoosid (glükoos), L- aminohapped, veeslahustuvad vitamiinid ja sapphapped. c) Neutraalse NaCl transpordi korral liiguvad Na+ ja Cl- rakku sümpordi teel; protsess
maomahla. Maonõre sekreteeritakse 2-3h pärast söömist, siis kui maos toitu seeditakse. Enamik maomahlast toodetakse maokehas ja maopõhjas. HCl omadused: * muundab proensüümi pepsinogeeni pepsiiniks * hapendab mao sisu (vaja pepsiini tööks) * lagundab side- ja lihaskudet, aitab suuremaid tükke väiksemateks lagundada * tapab mikroorganisme, mis tulevad allaneelatud toiduga kaasa HCl sekretsioon - parietaalrakkudes tekib H+ H2CO3 dissotsiatsioonil (H2CO3 ↔ H+ + HCO3-). H+/ K+ ATPaasi pump pumpab H+ parietaalrakust näärme valendikku ja samal ajal pumbatakse rakku K + vastu. Samal ajal HCO3- läheb verre. Ehk pärast sööki tõuseb venoosse vere pH. Toimub just siis, kui süüakse valgurikast toitu (sekreteeritakse rohkem HCl). Pepsinogeeni sekretsioon – pearakud sünteesivad ja hoiustavad pepsinogeeni proensüümina. Kui pepsinogeen puutub kokku happelise maosisuga, siis muutub aktiivseks pepsiiniks. Neil on autokatalüütiline aktiivsus st
Iseärasused: Silelihastes puudub troponiin; Ca-ioonid seostuvad kalmoduliiniga (Ca retseptor). Tekkinud kompleks aktiveerib müosiini kinaasi, see kannab ATP-st fosfaatrühma müosiini peasse. Fosforüülitud müosiini pead hüdrolüüsivad ATP, aktiveeruvad ja seonduvad aktiiniga → aktiini ja müosiini “libisemine” üksteise suhtes. Kui raku stimulatsioon raugeb → Ca +2 eraldub kalmoduliinist ja pumbatakse tagasi → müosiini kinaasi aktiivsus ↓. Müosiin kaotab oma ATPaasi aktiivsuse ja ei seostu enam aktiiniga. Silelihase rakk lõtvub. 4.13. Südamelihase struktuur, aktsioonipotentsiaali ja kontraktsiooni iseärasused. Struktuur vöödiline nagu skeletilihasel. Hästi arenenud risttuubulite süsteem ja sarkoplasmaatiline retiikulum. Ei väsi. Iseärasused: AP levib rakult rakule. Kontraktsiooniks on vajalik nii rakuväline Ca +2 kui Na+. Südamelihasel on ainult üksikkontraktsioonid ja tetaanilist kontraktsiooni tal kunagi ei teki -
paari erinevaid 20 kD ahelaid Raskete ahelate "peadel" on ATPaasi aktiivsus ning lihaskontrakt- sioonid toimuvad ATP hüdrolüüsi arvel. Müosiini molekulide pakkimise paksus filamendis
Кастла) • Verest difundeerub parietaalrakku CO2 • CO2 ja H2O reageerivad, moodustub süsihape • Süsihappe dissotsieerub, tekivad H+ ja vesinikkarbonaat • Vesinikkarbonaat viiakse rakust interstitsiaalvedelikku (vahetatakse Cl- vastu) • H+,K+-ATPaas kasutab ATP hüdrolüüsil saadud energiat, et viia H+ välja, tuua K+ sisse • Samaaegselt viiakse maovalendikku ka Cl- (K+, Clsümport) • Koos Cl--ga väljavisatud K+ siseneb rakku H+,K+- ATPaasi abil 48 Maonõre: muud komponendid • Proteolüütilised ensüümid e pepsiinid – Sekreteeritakse pearakkude poolt pepsinogeenidena (mitteaktiivne pepsiini eellane) – Happelises keskkonnas muudetakse pepsiiniks – Pepsiinil suurim proteolüütiline aktiivsus keskkonnas, mille pH alla 3.0 • Seesmine faktor (intrinsic factor) – Sekreteeritakse parietaalrakkude poolt
on pakitud hoidmissignaali kandvad valgud. 6. Mitokondrid. Ehitus ja talitlus Mitokonder on ümbritsetud kahe membraaniga: välimine (VM) ja sisemine (SM). Kahe membraani vahel esineb membraanidevaheline ruum ja sisemembraan ümbritseb maatriksit. Võrreldes VM-ga on SM on rohkem valikuliselt läbitav. Mitokonder sisaldab oma mtDNA-d ja ribosoome - arvatakse, et on tekkinud endosümbioosi teel. Sisemembraani sissesopistised on kristad. Sisemembraan on ETA ja ATPaasi asukohaks, kus toimub oksüdatiivne fosforüleerimine ehk ATP süntees kasutades koensüümide oksüdeerimise käigus vabanevat energiat. Maatriksis toimub tsitraaditsükkel (püruvaadi oksüdatsioon CO2ni, tekivad koensüümid NADH ja FADH2) ja sünteesitakse makroergilisi ühendeid (ATP). Mitokondri fn-iks on energia tootmine. 7. Kudede mõiste ja klassifikatsioon Kude (textus) on ühesuguse tekke, ehituse ja talitlusega rakkude ning rakuvaheaine kogum. Taimekoed
suunas ning teine gradiendi vastu. Gradiendi suunas liikuva aine gradient on siiski tekitatud pumpade mõjul ning ATP hüdrolüüsil vabanevat energiat kasutades. Tegemist on kandjavalguga. Näiteks glükoos-naatrium-kotransport süsteemi glükoosi transport rakku, vastu gradienti ning Na transport rakku grandiendi suunas. Taimerakkudes võib erinevate ainete/ioonide transport olla sümpordis või antipordis prootonitega, mis on rakkudest välja viidud H-ATPaasi vahendusel. 18.Iseloomustage K/Na-ATPaas-i ja nimetage mõni protsess, mille läbiviimisel on oluline. Pumpab ühe ATP molekuli hüdrolüüsi energia arvel 3 Na iooni välja ja 2 K iooni sisse. Tegemist on P-klassi pumbaga koosneb kahest erinevast valgust, alfa ja beeta subühikust. Alfa subühik transpordi käigus fosforüleerub ja defosforüleerub. Membraanipotenstiaali tekkimine, glükoosi transpordiks vajaliku Na ioonide gradiendi tekitamine.
mitmekesisustest looduses. Mitmekesisus: feneetiline ssteem, numbriline taksonoomia- bakterite liikideks rhmitamine phineb morfoloogilistel ja biokeemilistel tunnustel Molekulaarsetest markeritest kasutatakse mikroobide mitmekesisuse uurimisel kige rohkem ribosomaalse operoni geene (16S rDNA, 5S rDNA), samuti ribosomaalsete geenide vahelist intergeenset piirkonda, samuti kasutatakse DNA graasi B alahiku GyrB , .70 RNA polmeraasi faktori, elongatsioonifaktori geeni EF-Tu ja ATPaasi b alahiku jrjestusi. Molekulaarsetest markeritest saadud informatsiooni phjal jaotatakse elusorganismid kolme domeeni: eubakterid, arhed ja euakroodid. Bakterite flogeneetiline puu koosneb vhemalt 18 alamjaotusest ehk himkonnast (uues Bergey mrajas on 23 himkonda), arhede puu kolmest himkonnast. Bakterite puhul on kokku leitud 56 suuremat alamjaotust, nendest 26 on kultiveeritavate esindajatega. Puudub korrelatsioon flogeneetiliste rhmade ja fenotbiliste tunnuste (feneetilise ssteemi) vahel.
coli NhaA abil tuuakse rakku 2 H+ ja viiakse rakust välja 1 Na+. Prootonite sissetoomine toimub väga suure transmembraanse potentsiaali () abil, sest raku sisemus on negatiivselt laetud. Kui rakud on keskkonnas, kus on Na+ väga vähe või vastupidi, väliskeskkonna Na+ ioonide kontsentratsioon on väga kõrge, siis on K + antiporteritel suurem tähtsus. Bakterid transpordivad prootoneid sisse kaalium-prooton antiporterite abil. G(+) bakter E. hirae inaktiveerib ja represseerib V1V0-ATPaasi väga aluselises keskkonnas. Samuti on väga kõrge pH väärtuse juures aktiivne kaalium-prooton antiporter ning naatrium-prooton antiporter NapA on aktiivne pigem vähem aluselises keskkonnas. NhaA on E. coli'l hädavajalik valk, kohanemaks leeliseliste tingimustega kui keskkonnas on piisavas hulgas naatriumi. NhaA on väga kiire transportvalk, ühe minuti jooksul NhaA katalüüsib 105 Na+/2H+ vahetust. NhaA on tugevasti pH- sõltuv valk