Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse

Kordamisküsimused geneetikas bioloogia õppesuuna üliõpilastele loeng 11 kohta (0)

5 VÄGA HEA
Punktid
Lastele - Kõige pisematele meeldivad vahvad luuleread väga, millega saab neid rahulikult unemaale saata

Esitatud küsimused

  • Kus asuvad geeniekspressiooni kontrollpunktid transkriptsiooni tasandil?
  • Millised mehhanismid on eukarüootidel mRNA lagundamiseks?
  • Miks ja kirjelda kuidas toimub X kromosoomi inaktivatsioon imetajatel?
  • Kuidas määratakse mRNA eluiga rakus?
  • Kuidas toimub geeniekspressiooni kontroll translatsiooni tasandil?
Kordamisküsimused geneetikas bioloogia õppesuuna üliõpilastele loeng 11 kohta:
  • Sõnasta molekulaarbioloogia tsentraaldogma? Võib ka joonisena esitada. Geneetilise informatsiooni ülekandumine rakus toimub kindlates suundades: DNAlt RNAle ja RNAlt DNAle ja RNAlt valgule.
  • Nimeta geenide avaldumise kontrolli tasandid (2)? RNA tasand – kontroll transkriptsiooni tasandil. valgu tasand – - kontroll translatsiooni tasemel, - post-translatsiooniline kontroll.
  • Kus asuvad geeniekspressiooni kontrollpunktid transkriptsiooni tasandil? Esimesel tasandil - kontroll mRNA tekkel ehk transkriptsiooniline kontroll – promootor , enhancerid jt. DNA järjestused transkriptsiooni kontrolliks + trans – elemendid (regulaatorvalgud) – transkriptsiooni käivitamise tasand, kontroll mRNA protsessingu tasemel, kontroll mRNA transpordi tasemel tuumast tsütoplasmasse, kontroll mRNA lagundamise ehk degradatsiooni tasemel
  • Kirjelda, kuidas toimub geenide avaldumise regulatsioon tuumas transkriptiooni initsiatsiooni tasandil? Sobib ka joonistena.
  • Millised mehhanismid on eukarüootidel mRNA lagundamiseks? Mrna lagundamine e degradatsioon . mRNA lagundamise mehhanismid eukarüootides: - tsütoplasmas 5´ → 3´ ja 3´ →5` suunaliselt (eksonukleaasidega). - lagundamine tuumas vahetult peale sünteesi. - endonukleaasne lagundamine - lõhutakse molekulisiseseid sidemeid . - nonstop – mediated decay (3` → 5`), organellis eksosoom. - nonsense – mediated decay
  • Milliseid nukleotiidseid järjestusi lagundatakse nonsense mediated decay mehhanismiga? Selle mehhanismi kasutamisega lagundatakse: Enneaegsete stop-koodonitega mRNAd. Upstream ORF asub mRNA 5´UTR (mitte-transleeritavas) regioonis. Liiga pikk 3´UTR (RNA polümeraas on ülesünteesinud mRNA-d). mRNAd, kus kasutatakse korraga erinevates lugemisraamides valgusünteesi initsiaatorkoodoneid. NMD toimub enamasti enne, kui on katkenud mRNA füüsiline side tuumaga . Enneaegset stop-koodonit sisaldav mRNA molekul , mis on jõudnud tsütoplasmasse, pääseb suure tõenäosusega lagundamisest. NMD on alati seotud lagundatava mRNA translatsiooniga - NMD toimumiseks on vajalik translatsiooni terminatsioon enneaegsel stop-koodonil.
  • Regulaatorvalkude olulisemad alaklassid pro- ja eukarüootsel geeniregulatsioonil? Heeliks -pööre-heeliks motiiviga valgud . Homeodomääni valgud. Tsinksõrme sisaldavad valgud. Aluselised leutsiini-tõmblukku sisaldavad valgud. Aluselised heeliks-ling-heeliks valgud. POU-domääni valgud. Steroidhormoonide retseptorid
  • Iseloomusta heelix–ling–heelix regulaatorvalgu ehitust joonisena ja kirjelda funktsiooni? Kaks α-heeliksit [polüpeptiidahela spiraalne sekundaarne struktuur], mis on ühendatud pikema, painduva aminohappelise linguga. Selline ehitus võimaldab heeliksite vaba ruumilist liikumist. Aluselised valgud – seondumine DNA-ga toimub 15 aminohappe pikkuse aluselise piirkonna kaudu. Homodimeersed (seondunud on 2 ühesugust valgumolekuli) helix -ling-helix valgud ei seondu hästi DNA-ga, vaid positiivsete või negatiivsete regulaatorvalkudega, stimuleerides või inhibeerides transkriptsiooni. esinevad eu- kui ka prokarüootides. suur perekond - sisaldab sadu valke eu- ja prokarüootidel. 2 α (alfa)-heeliksit ja 1 lühike aminohappe ahel - “pööre”. heeliksid paigutatud fikseeritud nurga all – iseloomulik!. Esinevad dimeeridena (kaksikmolekulidena), mõlema dimeeri üks heeliks osaleb dimeeride vahelise sideme tekkes, teine heeliksite paar moodustab käärisarnase struktuuri, mille otsad paiknevad DNA kahes kõrvutiasetsevas suures vaos.
  • Iseloomusta homeodomääni valgu ehitust (joonis) ja funktsiooni? Olulised, määramaks keha eesmise ja tagumise telje arengut. Organismi sümmeetrilisuse tagamiseks – kindlustab kehapoolte identsuse. Homeodomään on 60-aminohappeline järjestus, mis esineb helix-pööre-helix motiivina . 17-aminohappeline kolmas heeliks ulatub DNA suurde vakku. Seondumine VÄGA SPETSIIFILINE . Juba 1 aminohappe muutus mõjutab DNA-ga seondumist (seon dub mõne teise promootori/enhanceriga).
  • Põhjenda miks ja kirjelda kuidas toimub X – kromosoomi inaktivatsioon imetajatel? Kahekordne X-kromosoomide geenide produktid oleksid rakkudele letaalsed. Igas imetaja rakus inaktiveeritakse üks X-kromosoomidest. Barri kehake – replitseerub hilises S-faasis ja valdavat osa DNA-st ei transkribeerita. See, kas arengu käigus inaktiveeritakse isalt või emalt saadud X- kromosoom , on juhus. Inaktiveeritud X-kromosoom inaktiveeritakse ka tütarrakkudes – inaktivatsiooni pöördumatus . CpG-saared inaktiivses X-kromosoomis on suuremas osas metüleeritud. Metüleerimine on mehhanism transkriptsiooni peatamiseks. XIC – X-kromosoomi inaktivatsiooni tsenter . Selle ala peal on geen XIST. See geen on aktiivne vaid inaktiivsel X- kromosoomil . XIST geen ei kodeeri ühtki valku. XIST RNA !!! seondub rakutuumas inaktiivse X-kromosoomiga (Barri kehaga ). Inimese aktiivses X-kromosoomis on H4 histoon atsetüleeritud, inaktiivses X-is aga mitte (s.t., on vaikiv). CpG saarekeste metüleerumine kutsub esile geenide inaktivatsiooni. Aktiivsetel geenidel Barri kehas puuduvad CpG saared
  • Kuidas määratakse mRNA eluiga rakus? mRNA eluiga mõjutavad polü-A saba olemasolu (ilma polü-A-ta mRNA-d on väga lühiealised) ja 3’ mittetransleeritavad regioonid (UTR).
    Eluiga mõjutavad RNA- sisesed järjestused, nagu Poly-A piirkond, mis on kaitstud PABP-valguga (kaitseks deadenüleerimise ja mRNA lagundamise eest). 3´UTR ala – sisaldab lagundamiseks vajalikke signaale. Näiteks histoonide mRNA 3’UTR-s asub nn.juuksenõela struktuur, mis destabiliseerib ja põhjustab mRNA hulga  .AU-rikkad järjestused mRNA-s –  mRNA stabiilsust. mRNA kodeeriva ala järjestused esimese 12 – 13 np ulatuses. Stabiilsust reguleerivad valgudtrans – faktorid (mõjutavad mRNA ga seondudes – PABP valk).
  • Hormoonide toime geeniekspressiooni kontrollis ?
  • Kuidas toimub geeniekspressiooni kontroll translatsiooni tasandil?
  • Milliseid mehhanisme kasutatakse valkude post – translatsiooniliseks modifitseerimiseks ja töötlemiseks eukarüootses rakus? II chaperonid ja heat – shock valgud, mis abistavad valgu pakkimisel. III valkude inaktivatsiooni mehhanismid. lagundamine – tavaliselt lüsosoomides ja ER-s. IV valgu eluea reguleerimine rakus ensüümidega, mis modifitseerivad N-terminust. NB! I aminohape N-terminuses mõjutab valgu iga. Näiteks Met – stabiliseeriv am hape ; Asp, Glu ja Arg on destabiliseerivad am happed . V valkude suunamine raku erinevatesse kompartmentidesse ehk osadesse, toimub signaaljärjestuste alusel: rakutuuma – NLS signaal , mitokondrisse – N-ter 15 – 30 am happeline järjestus, mis võtab membraanides heeliksi kuju, tsütoplasmasse (ER-i) – SRP (signaali äratundmise kompleks ). VI valkude splaising ehk lõikamine ja valgu erinevate osade kombineerimine
    Mõisted 11:
    Eksosoom - on väikesed, lipiidse kaksikmembraaniga vesiikulid. Rakud sekreteerivad neid väliskeskkonda. Palju eksosoome on veres ja imetajate piimas. Neis sisalduvad miRNA osalevad vastsündinute immuunsuse tekitamisel.
    Nonsense mediated decay – toimub kõikides eukarüootsetes rakkudes. Selle mehhanismi kasutamisega lagundatakse: Enneaegsete stop-koodonitega mRNAd. Upstream ORF asub mRNA 5´UTR (mitte-transleeritavas) regioonis. Liiga pikk 3´UTR (RNA polümeraas on ülesünteesinud mRNA-d). mRNAd, kus kasutatakse korraga erinevates lugemisraamides valgusünteesi initsiaatorkoodoneid
    Eukromatiin - dekondenseerub interfaasi tuumas. Eukromatiin on kromatiini osa. See on lõdvalt pakitud kromosoomi ala, mille pealt toimub transkriptsioon .
    Heterokromatiin - ehk kondenseerunud kromatiinaine on tuumas inaktiivne ja mikroskoobis nähtav tumedate aladena. Sisaldab põhiliselt mittetranskribeeritavaid struktuurgeene ja kordusjärjestusi. Paikneb tuuma perifeerias. Heterokromatiin – kui lihtsaim mehhanism geeniekspressiooni reguleerimiseks. Heterokromatiin – kondenseerunud ka mitooside vahel. Heterokromatiin – konstitutiivne ja fakultatiivne
    Fakultatiivne heterokromatiin - võimaldab rakkudes teatud eluetappidel teatud geene maha suruda
    Konstitutiivne heterokromatiin - asub alati samas kohas ja mõlemal paariskromosoomil (tsentromeeride piirkonnas, on inaktiivne läbi rakutsükli)
    mRNA poolestusaeg - aeg, mille jooksul laguneb ½ rakus olevast mRNA-st
    eksonukleaasne lõikamine
    endonukleaasne lõikamine – lõhutakse molekulisisesed sidemed
    deadenüleerimine - poly-A järjestus lüheneb
    chaperonid – abistavad valgu pakkimisel
  • Kordamisküsimused geneetikas bioloogia õppesuuna üliõpilastele loeng 11 kohta #1 Kordamisküsimused geneetikas bioloogia õppesuuna üliõpilastele loeng 11 kohta #2 Kordamisküsimused geneetikas bioloogia õppesuuna üliõpilastele loeng 11 kohta #3
    Punktid 100 punkti Autor soovib selle materjali allalaadimise eest saada 100 punkti.
    Leheküljed ~ 3 lehte Lehekülgede arv dokumendis
    Aeg2013-11-16 Kuupäev, millal dokument üles laeti
    Allalaadimisi 17 laadimist Kokku alla laetud
    Kommentaarid 0 arvamust Teiste kasutajate poolt lisatud kommentaarid
    Autor kkristel Õppematerjali autor

    Sarnased õppematerjalid

    Molekulaarbioloogia II osa
    8
    docx

    Molekulaarbioloogia II osa

    1. Mis on sidumissait? Mille poolest ta a) sarnaneb, b) erineb TATAbox- st? 2. Sidumissait - regioon (valgus, DNA-s jne), mis on spetsiifiliseks seostumiseks teistele molekulidele, ioonidele. It is a region on a protein, DNA, or RNA to which specific other molecules and ions -- in this context collectively called ligands, or more specifically, protein ligands -- form a chemical bond. 3. TATA-box ­is a DNA sequence (Cis-regulatory element) found in the promoter region of most genes in eukaryotes. It is the binding site of either transcription factors or histones and is involved in the process of transcription by RNA polymerase. It has the core DNA sequence 5'- TATAAA-3' or a variant, which is usually followed by three or more adenine bases and has been highly conserved through evolution. The TATA box is usually located 25 base pairs upstream to the transcription site. 4. Nimeta peamised DNAd siduvad domäänid, mis on iseloomulikud transkript-sioonif

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    Molekulaar- ja rakubioloogia KT II
    10
    docx

    Molekulaar- ja rakubioloogia KT II

    1 MOLEKULAAR- JA RAKUBIOLOOGIA | YTM0011 II KONTROLLTÖÖ KORDAMISKÜSIMUSED | MIHKEL HEINMAA TTÜ YAGB31 | 08/10/10 TRANSKRIPTSIOON JA GEENI REGULATSIOON 1. Missuguseid geneetilise infovahetuse protsesse tähistavad a) transformatsioon, 2) transkriptsioon 3) translatsioon. Transformatsioon on geneetilise info ülekandumine ühest bakterirakust teise rakust isoleeritud DNA abil. Transkriptsioon ehk RNA süntees on DNA ühe ahela (matriitsahel) alusel komplementaarse RNA ahela süntees. Translatsioon on mRNA põhjal ribosoomides valguahela süntees. 2. Võrdle transkriptsiooni initsiatsiooni protsesse prokarüootidel ja eukarüootidel. Prokarüoodi transkriptsiooni initsiatsioon: RNA polümeraas seondub ühega paljudest spetsiifilistes tranksriptsiooni faktoritest (-fa

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    MOLEKULAARBIOLOOGIA-ja RAKUBIOLOOGIA
    54
    pdf

    MOLEKULAARBIOLOOGIA ja RAKUBIOLOOGIA

    1 MOLEKULAARBIOLOOGIA. 1. Kui aatom loovutab elektroni täielikult teisele aatomile, missugused keemilise sidemega on tegemist? Ioonside, sellised ained lahustuvad hästi, kuna ioonide hüdratatsioonienergia on suurem kui kristalli võreenergia 2. Miks vesi on hea lahusti (solvent)? Vesi on hea lahusti, sest ta lahustab nii tahkeid, vedelaid kui ka gaasilisi aineid. Vee molekul moodustab dipooli ning aatomid omandavad osalise laengu. Polaarsete ühenditega moodustab vesiniksidemeid, mis tagavad stabiilsust. 3. Termodünaamika II seadus. Kõik protsessid kulgevad tasakaalu e. minimaalse potentsiaalse energia poole e. entroopia kasvu suunas. Entroopia (S) on korrastamatuse mõõt [J/mol*K], korrastatud ­ madal entroopia. Isoleeritud süsteemid püüavad korrastatud olekust korrastamata poole. Tasakaal on siis, kui entroopia on maksimaalne.Entroopia muutus on null pöörduvate

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    Geneetika I kordamisküsimused-2012
    18
    doc

    Geneetika I kordamisküsimused (2012)

    Tertsiaarstruktuur- funktsionaalsetel valkudel 3D struktuur Kvaternaarstruktuur- mitme valgumolekuli kompleks Alguskoodon- AUG, lõppkoodon- UGA, UAA, UAG 7. Geneetika mõisted (alleel, monogeenne tunnus jne.) Geen- Täielik nukleiinhapete järjestus, mis on vajalik funktsionaalse geeniprodukti(polüpeptiid, RNA) sünteesiks. pärilikkuse elementaarüksuse, DNA lõik, mis määrab ära RNA molekuli sünteesi: määrab ühe valgu järjestuse. Struktuurgeenid- info RNA ehituse kohta (mRNA, tRNA, rRNA) Regulaatorgeenid- kontrollivad struktuurgeenide aktiivsust ja avaldumist Kromosoom- pärilikkuse salvestaja, geenide materiaalne kandja. Kormosoomid paiknevad rakutuumas ja koosnevad DNAst. DNA on seotud struktuursete valkudega(histoonid) ja regulatoorsete valkudega(transkriptsioonifaktorid, replikatsioonivalgud). Sisaldab 3 funktsionaalset elementi: replikatsiooni origin-punktid, tsentromeer, telomeersed järjestused.

    Geneetika
    Kordamisküsimused geneetikas loeng 9 kohta
    3
    doc

    Kordamisküsimused geneetikas loeng 9 kohta

    Kordamisküsimused geneetikas loeng 9 kohta: 1. Defineeri mõiste transkriptsioon. Selle üldine toimumine eukarüoodil? Transkriptsioon on matriits DNAst lähtuv mRNA süntees. Toimub alati suunas 5'-3'. Protsess, mille käigus geneetilise koodi salvestatud informatsioon kantakse üle kindlale RNA tüübile. Eukarüoodil kontrollitakse iga geeni transkriptsiooni eraldi. Aktivatsioonil osalevad abistavate faktoritena organismi signaalmolekulid. I initsiatsioon ­ kromatiini avamine CRC tegevuse tulemusena, TF seondumine promootorile. H sideme lõhkumisel osalevad teatud transkipstioonifaktori, RNA sünteesi viib läbi RNA polümeraas (I;II;III). Transkriptsiooni käivitamisel osalevad nii NH kui valgud (cis, trans) initsiatsioon-elongatsioon- terminatsioon 2. Kuidas, millest ja kus moodustub tuumake? Tuumakese funktsioon?. 3. Kuidas toimub eukarüoodil transkriptsiooni initsiatsioon? Millised faktorid on vajalikud? Vt eelmist. Eukarüootne transkriptsioon e

    Geneetika
    Molekulaarbioloogia teise KT vastused
    8
    doc

    Molekulaarbioloogia teise KT vastused

    1. Transformatsioon - geneetilise informatsiooni ülekandumine ühest bakterirakust teise rakku isoleeritud DNA abil. Transformatsioon võib toimuda ka looduslikes tingimustes. Sel juhul kandub elusrakkudesse surnud rakkudest vabanenud DNA. Transkriptsioon ­ ümberkirjutamine, DNA ühe ahela alusel komplementaarse RNA molekuli süntees. Translatsioon ­ mRNA põhjal ribosoomides valguahela sünteesimine ehk lihtsamalt öeldes valgu süntees. (RNA alusel valgu süntees tsütoplasmas paiknevatel ribosoomidel.) Translatsiooniprotsess loob geneetilise koodi ehk vastavuse mRNAde nukleotiidahelate ja valkude polüpeptiidahelate vahel. 2. Initsiatsioon prokarüootidel: transkriptsioon algab sellega, et protsessi läbiviiv ensüüm RNA polümeraas kinnitub struktuurgeenide ees asuvas promootoris sisalduvatele transkriptsiooni algussignaalidele. RNA polümeraas ei vaja transkriptsiooni initsiatsiooniks praimerjärjestust nagu seda vajas DNA polümeraas. Promootori piirkonnas, 10np transkriptsi

    Molekulaar - ja rakubioloogia loengud
    Genoomi struktuur ja funktsioon
    74
    docx

    Genoomi struktuur ja funktsioon

    seonduvaid DNA piirkondi nim SAR-iks (scaffold associated region). 30 nm fiiber moodustab loop’e, mis on umbes 300 nm pikad. 300 nm fiibrid surutakse kokku tihedalt pakitud spiraaliks ning moodustub 700 nm fiiber. Ning 700 nm fiiber keritakse tihedalt kokku metafaasi kromosoomi kromatiidiks (1400 nm). 2 Kriitika – kas 30 nm fiibrid eksisteerivad ka in vivo? On mitmeid töid 30 nm fiibri eksisteerimise kohta in vitro katsetes, kuid mitu tööd ka, mis kummutavad 30 nm fiibri olemasolu in vivo. Krüo-EMga külmutatud inimese mitootilisi rakke vaadates ei ole näha 30 nm kromatiini fiibreid kromosoomis. • Genoomi ‘pakkumine’ kromosoomidesse – uus ‘polümeeri sulam’ (‘polymer melt’) mudel, selle tõendusmaterjal ja funktsionaalsed eelised. Mitootiliste kromosoomide nukleosoomi fiibrid ja aktiivsed interfaasi

    Geneetika
    Rakutuum
    12
    doc

    Rakutuum

    tsükliseerunud DNA nagu prokarüootides.) Telomeerid seovad kromosoomid tuuma lamiinidega rakutuuma ümbrises. Samuti on telomeer seotud rakujagunemiste arvu kontrolliga. DNA igal replitseerumisel rakutsüklis uus sünteesitud DNA on umbes 100 bp lühema telomeeriga. Selle põhjuseks on asjaolu, et DNA mahajääva (ingl lagging) ahela sünteesil Okazaki fragmentidena 5' ots ei saa olla täispikkusega, sest kromosoomi lõpus ei ole kohta RNA primeri sünteesiks viimase Okazaki fragmendi jaoks. Seega umbes 100 mitootilise jagunemise järel telomeer on kadunud. Edasisel DNA replitseerumisel lähevad kaotsi geenid alates kromosoomi otstest.Kui vastsündinu rakud viia rakukultuuri kunstlikku toitekeskkonda, siis sellised rakud jagunevad umbes 100 korda ja siis surevad. Kui võtta rakud täiskasvanud ~ 60 a vanuselt inimeselt, siis rakud jagunevad ehk paarkümmend korda ja siis surevad. Seega

    Rakubioloogia




    Meedia

    Kommentaarid (0)

    Kommentaarid sellele materjalile puuduvad. Ole esimene ja kommenteeri



    Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun