pärinevad, ei pea täitma sarnaseid funktsioone (homoloogid vs. analoogid) Valgud jagatud perekondadesse vastavalt struktuurihomoloogiale -liigisisene -liikidevaheline Järjestuste homoloogia võimaldab seondada erinevad valgud evolutsiooniliselt Valkude pakkimise info on tema järjestuses Valkude pakkimine (folding) Valkude pakkimine natiivseteks toimub posttranslatsiooniliselt: -valk peab saavutama natiivse 3D struktuuri -valk peab siduma kofaktorid -valgud modifitseeritakse ensümaatiliselt -valgud peavad komplekseeruma teiste alaühikutega Selle efektiivsus on tagatud spetsiaalsete valkude- molekulaarsete Valkude kõrgemad struktuurid on kodeeritud tema järjestusse Eukarüootidel vähemalt 2 suuremat klassi chaperone Hsp60 ja Hsp 70 Nende perekondade liikmed on
Metalloensüümide ja metall-aktiveeritavate ensüümide mõisted. Metalliioonid annavad osadele ensüümidele suurema aktiivsuse reaktsiooniks. Metallide üheks rolliks on toimimine elektrofiilsete katalüsaatorina, stabiliseerides elektrontihedust või katalüüsi käigus tekkivaid negatiivseid laenguid. Metalli ioonide teiseks rolliks on genereerida võimsaid nukleofiile neutraalse pH juuures. Ensüüme mis seovad metalli tugevalt ja vajavad neid stabiilse natiivse komformatsiooni säilitamiseks nimetatakse metalloensüümideks. Ensüüme mis seovad metalle nõrgalt ning ainult katalüütilise tsükli käigus nimetatakse metall- aktiveeritud ensüümideks. 4. Näiteid erinevate ensüümide katalüüsimehhanismidest: aspartaat-proteaasid, lüsotsüüm. Aspartaat-proteaasid · Sisaldavad kahte Asp jääki aktiivtsentris · Aktiivsed happelises keskkonnas
· Rasvhapete vabanemine eriti tähtis kõvades Itaalia juustudes, sinihallitusjuustudes 1. Starterkultuuride ekstratsellulaarsed lipaasid -> rasvhapped -> metüülketoonid. Lenduvad rasvhapped Camembertis: äädikhape, butüürhape, kaproiinhape; Limburgeris isovaleriaanhape. Lipiidide oksüdatsioonil ketoonid: 2-nonanoon, 2- undekanoon 2. Mesofiilne mikrofloora hüdrolüüsib di- ja monoglütseriide. Triglütseriidide lagundamine põhiliselt piima natiivse lipaasi toimel, tagades substraadine di- ja monoglütseriide 3. termofiilsed bakteriaalsed juuretised lipolüütiliselt aktiivsemad Lipolüütiliselt kõige aktiivsemad on mikroseened (vt skeemilt metüülketoonide moodustumist mütseelis ja spoorides) Sinihallitusjuustud · Roquefort lambajuust · Lambapiimas rasva 8%, , pH 6,8 Tootmine · Toorpiimale ei lisata põhijuuretist (Külmal perioodil 0,2% juuretise kultuuri)
DNA denaturatsioon kõrgematel temperatuuridel soodustatud DNA denaturatsioon on pöörduv Temperatuuri alandamisel omandab denatureerunud DNA oma esialgse natiivse struktuuri DNA denaturatsioon on kooperatiivne protsess Tm ehk DNA "sulamistemperatuur" Temperatuur mille juures 50% DNA molekulidest on denatureerunud Mida kõrgem GC sisaldus, seda kõrgem Tm DNA tertsiaarstruktuur DNA molekul võib olla lineaarne või tsirkulaarne
a) iseseisvalt kokkupakkuv polüpeptiidahela osa Domeen on kompaktne, lokaalselt kindla korrapära järgi kokkupakitud piirkond valgu tertsiaarstruktuuris. 55. Millises valgu struktuuri tasandis sisaldub valgu kokkupakkumiseks vajalik informatsioon? Valgu ruumilist struktuuri määrav informatsioon sisaldub valgu aminohappelises järjestuses ehk primaarstruktuuris. 56. Kas denatureerunud valk on funktsionaalne? Põhjendage. Denatureerunud valk ei ole funktsionaalne, sest ta on kaotanud oma natiivse ruumilise struktuuri ja koos sellega oma spetsiifilised omadused. 57. Millised faktorid soodustavad valgu kokkupakkumist? a) konformatsiooniline entroopia - soodustab denaturatsiooni b) polüpetiidahela siseste vesiniksidemete moodustumine c) hüdrofoobne efekt d) polüpeptiidahela ja solvendi vaheliste vesiniksidemete moodustumine 58. Kas valkude termilise denaturatsiooni käigus katkevad ka disulfiid sillad? Ei katke. 59
Multimeer e. polümeer – ühend, mis koosneb paljudest monomeeridest. Merkaptoetanool – HS-CH2-CH2-OH; kasutatakse S-S e. väävelsildade lõhkumiseks. Uurea e. karbamiid – H2N – C(=O)- NH2; ühend, mille koostis viiakse organismist välja üleliigne lämmastik; kasutatakse ka valkude denatureerimiseks? Anfinseni eksperiment – Anfinsen tõestas eksperimentaalselt, et denatureeritud natiivsed valgud taastavad iseeneslikult(!) oma natiivse konformatsiooni, kui denatureerivad ained eemaldada. Järeldus: info valkude õigete sekundaar- ja terstiaalstruktuuride moodustamise kohta peab sisalduma juba primaarstruktuuris e. primaastruktuuri järgi peab olema võimalik tuletada valgu ruumilist struktuuri (aga ei osata...veel). Müoglobiin ja hemoglobiin – mõlemad on heemi prosteetilise rühmana sisaldavad valgud ja füsioloogiline tähtsus seisneb võimes siduda hapnikku (heem otseselt seotud hapnikuga).
Renatureerimine on aeglane protsess võrreldes valgusünteesi käigus toimuva struktuuri tekkega. Renatureerumist kiirendavad mitmed ensüümid (valgu disulfiid isomeraas, peptidüül-prolüül isomeraasid), mis kiirendavad disulfiidsidemete vahetust või proliini konformatsiooni muutust. Valkude renatureerimist kiirendavad molekulaarsed chaperonid. 11 Valkude natiivne pakkimine, chaperonid Valkude pakkimine natiivseteks toimub posttranslatsiooniliselt: -valk peab saavutama natiivse 3D struktuuri; -valk peab siduma kofaktorid; -valgud modifitseeritakse ensümaatiliselt; -valgud peavad komplekseeruma teiste alaühikutega Valkude kõrgemad struktuurid on kodeeritud tema järjestuses. Valkude pakkimine natiivseteks toimub posttransaltsiooniliselt. Pakkimine algab vahetult pärast polüpeptiidi väljumist ribosoomist. Efektiivsus on tagatud spetsiaalsete valkude – molekulaarsete tšaperonidega. Ilma tšaperonideta toimuks paljude valgudomeenide vahestruktuuride agregatsioon
võrdselt, keha püsib muutumatuna) või negatiivne (kehasse jääb rohkem kui väljutatakse, keha areneb) Võimaldab hinnata kataboolset ja anaboolset staatust · Näiteks elukaare kontekstis (noor täiskasvanu vana) · Treeningu (operatsiooni etc) kontekstis Testosterooni / Kortisooli suhte asemel Valgumolekuli 4 struktuurset tasandit De- ja renaturatsioon · Kõrgema taseme struktuuride natiivse vormi muutus Temperatuur Keskkonna keemiline toime · Primaarstruktuuri säilumisel esialgne struktuur taastub (renaturatsioon) pöörduv denaturatioon N. tertsiaarstruktuuri tasemel pH muutus toimib kui valgulise ensüümi aktiivsuse regulaator · Primaartstruktuuri lõhkumisel valk hävineb Asendatavad ja asendamatud AH'd · 20'st DNA's kodeeritud Asendamatud Asendatavad Isoleutsiin Alaniin
trombiin. Seriin on osa ,,katalüütilisest triaadist" seriin, histidiin, aspartaat. Asp-102 rolliks on orieteerida His- 57; His-57 toimib nagu üldine alus ja hape; Ser-195 moodustab kovalentse sideme peptiidiga, mida ta lõikab. 3. Metalliioonide katalüüs. Paljud ensüümid vajavad metalli ioonide juuresolekut maksimaalse aktiivsuse saavutamiseks. Metalloensüümideks nim ensüüme, mis seovad metalle tugevalt või vajavad neid stabiilse natiivse konformatsiooni säilitamiseks. Metall-aktiveeritud ensüümideks nim ensüüme, mis seovad metalle nõrgalt ning ainult katalüütilise tsükli käigus. + mehhanism loeng8/slaid19. 4. Koeensüümide komponendid või eelühendid on vesilahustuvad vitamiinid v.a vit C. Vitamiin koeensüüm (bioloogiline roll): Tiamiin (B1) tiamiin pürofisfaat (oluline süsivesikute metabolismis)
Kantakse üle üks prooton. ,,Spetsiifilises" hape-alus katalüüsis osaleb kas H+ või OH-, mis difundeerub katalüütilisse tsentrisse. ,,Üldine" hape-alus katalüüs hõlmab ka teisi happeid ja aluseid peale H+ ja OH-. 3. Metalliioonide katalüütiline roll. Metalloensüümide ja metall-aktiveeritavate ensüümide mõisted. Ensüüme mis seovad metalle tugevalt või vajavad neid stabiilse natiivse konformatsiooni säilitamiseks nim metalloensüümideks. Ensüüme mis seovad metalle nõrgalt ning ainult kataüütilise tsükli käigus, nim metall- aktiveeritud ensüümideks. 4. Koensüümid mõiste, roll ensüümireaktsioonides ja seos vitamiinidega. Koensüümide komponendid on vesilahustuvad vitamiinid. VII. KATALÜÜSI REGULATSIOON. (Õpik lk 88-93,115-127) 1. Ensüümide spetsiifilisus milles avaldub ja millele baseerub.
· Arrheniuse võrrand Ensümaatiliste reaktsioonide sõltuvus temperatuurist - kiirus sõltub toimuva keemilise reaktsiooni aktivatsioonienergiast ja (teiselt poolt) ensüümi struktuuri koos hoidvate nõrkade vastasmõjude stabiilsusest. Optimum on tavaliselt veidi kõrgem kui ensüümi loodusliku keskkonna tavaline temperatuur. pH mõjutab reaktsiooni kiirust muutes aktiivtsentri aminohappejääkide protonisatsiooniastet. Optimum vastab tavaliselt ensüümi natiivse keskkonna pHle. pH sõltuvus: Multisubstraatsed reaktsioonid korrastatud ja juhuslik ning ping-pong mehhanism. Ensüümreaktsioonide liigitus substraatide ja produktide arvu järgi: Järjestikuline rekatsioon kahe substraadiga: Järjestikuse mehhanismi järgi toimuva ensümaatilise reaktsiooni korral peavad mõlemad substraadid seostuma ensüümiga enne reaktsiooni toimumist reaktsioon kahe substraadiga võib toimuda korrastatud või juhusliku
· snRNA väike tuuma RNA, oluline eukarüootsete geenide esmaste transkriptide protsessingul küpseks mRNA'ks enne eksporti tuumast tsütoplasmasse · siRNA väike interfereeriv RNA, osaleb transkriptsioonijärgses geenide vaigistamises RNA ja DNA erinevus Tsütosiin desamineerub spontaalselt uratsiiliks. DNA vigu parandavad ensüümid tunnevad ära sellised mutatsioonid ja asendavad uratsiilid tsütosiinidega. Et ei oleks vaja teha vahet natiivse U ja mutatsioonilise U vahel, siis on DNA sisaldab uratsiili asemel tümiini, seega kõik DNA's leiduvad uratsiilijäägid pärinevad mutatsioonidest ning kuuluvad asendamisele tsütosiinidega. RNA kõrvutiasetsevad 2' ja 3' OH-rühmad muudavad RNA vastuvõtlikuks hüdrolüüsile, DNA on aga 2'-OH puudumise tõttu stabiilsem. Organismide jaotus energia- ja süsinikuallika ning hapnikutarbe järgi Energia ja süsinikuallika järgi: · autotroofid kasutavad süsiniku allikana CO2
Katalüüs metalli ioonide osavõtul Metalli ioonide osalemise viisid: * elektrofiilsete katalüsaatoritena: vahendavad redoksreaktsioone tänu metalli iooni oksüdatsiooniastme pöörduvale muutumisele * stabiliseerivad või varjestavad katalüüsi käigus tekkivaid negatiivseid laenguid * seostuvad substraatidele, orienteerides neid reaktsiooniks õigesse asendisse Metalloensüümid sisaldavad tugevalt seotud metalli ioone, vajavad neid stabiilse natiivse konformatsiooni säilitamiseks Metall-aktiveeritud ensüümid - seovad metalle nõrgalt ning ainult katalüütilise tsükli käigus Seriinproteaasid - segu kovalentsest ja üldisest hape/alus katalüüsist Aspartaat-proteaasid - näited üldisest hape/alus katalüüsist · Proteolüütilised ensüümid, mida leidub nii loomades, seentes kui kõrgemates taimedes. · Kõik sisaldavad aktiivtsentris kahte Asp jääki.
54. Mis on domeen? a) iseseisvalt kokkupakkuv polüpeptiidahela osa b) sarnaste dihedraalsete nurkadega polüpeptiidahela osa c) teise polüpeptiidahelaga interakteeruv polüpeptiidahela osa 55. Millises valgu struktuuri tasandis sisaldub valgu kokkupakkumiseks vajalik informatsioon? a) primaar- b) sekundaar- c) tertsiaar- d) kvaternaar- 56. Kas denatureerunud valk on funktsionaalne? Põhjendage. V: Ei ole, kuna kaotab oma spetsiifilisuse. Denatureerudes kaotab valk oma natiivse ruumilise struktuuri ja koos sellega ka oma spetsiifilised omadused. 57. Millised faktorid soodustavad valgu kokkupakkumist? a) konformatsiooniline entroopia b) polüpetiidahela siseste vesiniksidemete moodustumine c) hüdrofoobne efekt d) polüpeptiidahela ja solvendi vaheliste vesiniksidemete moodustumine 58. Kas valkude termilise denaturatsiooni käigus katkevad ka disulfiid sillad? V: Säilivad puutumatuna ka denatureerunud valgus piirates mingil määral struktuuritu lingu
195 amiidrühma vesiniku ja substraadi karbonüülrühma hapniku vahel 3. Metalliioonide katalüütiline roll. Metalloensüümide ja metall-aktiveeritavate ensüümide mõisted. Näiteid erinevate ensüümide katalüüsimehhanismidest: aspartaatproteaasid, lüsotsüüm. Paljud ensüümid vajavad metalli ioonide juuresolekut maksimalse aktiivsuse saavutamiseks. Ensüüme, mis seovad metalle tugevalt või vajavad neid stabiilse natiivse konformatsiooni säilitamiseks nimetatakse metalloensüümideks. Ensüüme, mis seovad metalle nõrgalt ning ainult katalüütilise tsükli käigus, nimetatakse metall-aktiveeritud ensüümideks. Metallide üheks rolliks on toimimine elektrofiilsete katalüsaatoritena, stabiliseerides elektrontihedust või katalüüsi käigus tekkivaid negatiivseid laenguid. Metalli ioonide teiseks potentsiaalseks rolliks on genereerida võimsaid nukleofiile neutraalse pH juures (metalli iooni
TCR on alfa/beeta/gamma/delta ahelad. TCR on heterodimeer. Kaks ahelat on disulfiid sidemetega seotud T-raku plasmamembraani külge. Geneetilise mitmekesisus T-rakud ei läbi somaatilist mutatsiooni ega Class switching, ei genereerita V(D)J rekombinastiooniga. Koretseptoritena kasutav BCR CD19 ja CD21 ja TCR CD4 ha CD8. B rakud ja T rakud tunnevad ära erinevad substante kui antigeeni. B rakk kasutab siis raku pinnal seotud immunoglobuliini kui retseptorit. BCR tunneb ära natiivse antigeeni. TCR tunneb peptiid-MHC kompleksi ära. TCR vajab, et talle esitletakse peptiidi koos MHC klass molekulidega. Üheks sarnasuseks võiks lugeda selle, et nad mõlemad annavad signaali edasi türosiinkinaaside abil st vajavad türosiinkinaase vastavalt t raku või b raku aktivatsiooniks. NK RAKUD Organismis on veel ka lümfotsüütidele lähedasi rakke, mida kutsutakse NK- rakkudeks. (NK- natural killer) . Need
RNA's asuvad kõrvuti 2' ja 3' OH-rühmad ning on hüdrolüüsile vastuvõtlikumad, kuna mRNA on loodud kasutamiseks ja seejärel hävitamiseks. Leeliseses keskkonnas võib nukleofiil ehk antud juhul OH- tõmmata ära 2' OH-rühmalt H+, nõnda tekib 2'-O-, mis atakeerib (nö. ründab) +P fosfodiestersidemes. DNA, RNA üldiseloomustus 2. Millised on DNA molekulide võimalikud sekundaarstruktuuri vormid? Milles on nende erinevused? Milline on natiivse DNA sekundaarstruktuuri põhivorm? DNA sekundaarstruktuur on tavaliselt jaotatud biheeliksiks, biheeliksi ahelad kulgevad mitteparalleelselt, komplementaarsete aluspaaride vahel on vesiniksidemed. Suhkur-fosfaat põhiskelett väljaspool; lämmastikalused seespool. Paremakäeline kaksikheeliks jätab aluspaaride omavaheliseks kauguseks 3,4 Å. Lineaarsel biheeliksil on kolm vormi: A-vorm: paremakäeline, lühike ja lai 2,3 Å, 11 bp pöörde kohta.
aminohapped) arginiin, isoleutsiin, fenüülalaniin, asparagiin, valiin Pinnal: arginiin, aspargiinhape (hüdrofiilsed) Sisemuses: isoleutsiin, fenüülalaniin, valiin (hüdrofoobsed) 55. Mis on domeen? a) iseseisvalt kokkupakkuv polupeptiidahela osa 56.Millises valgu struktuuri tasandis leidub vajalik informatsioon valgu kokkupakkimiseks. a) primaar 57. Denatureerunud valk ei ole funktsionaalne, sest on kaotanud oma natiivse ruumilise struktuuri ja koos sellega ka oma spetsiifilised omadused. 58. Millised faktorid soodustavad valgu kokkupakkumist? c) hüdrofoobne efekt d) polüpeptiidahela ja solvendi vahelise vesiniksideme moodustumine 60. Struktuuritu ling on struktuuritu ling on kindla struktuurita polüpeptiidahela osa. 61. Kas valkude termilise denaturatsiooni käigus katkevad ka disulfiid sillad ei katke 62. Mitu % valgumolekulidest on denatureerunud olekus, kui temperatuur on võrdne Tmga? 50% 63
Südamiku mõlemis otsas paiknevad 19S ’mütsikesed’. Iseloomustage chaperon’id(Hsp70 rühm) ja nimetage protsesse milles osalevad. Valgud, mis stabiliseerivad ebastabiilsed konformatsioonid, kiirendavad oligomeeride teket, valkude lagunemist ja tagavad lokalisatsiooni kindlates raku piirkondades. Hoiavad valke lahustunud kujul, mis on valmis kokkukeerdumiseks. Kaitsevad proteolüüsi eest. Vajalik ATP. On olulised rakkude liikumisel läbi membraanide. Paljud valgud omandavad natiivse konformatsiooni ainult seda tüüpi valkude abil. Iseloomustage chaperonin´id ja nimetage protsesse milles osalevad. Tagavad valkude kokkukeerdumise. Mõjuvad struktuuri tekke hilisematel staadiumitel. On oligomeersed valgud, mis moodustavad sisemusse kanali, kus valgu konformatsiooni teke toimub. Vajalik ATP. Reguleerib oligomeersete komplekside teket.
vabaenergias). pH mõjutab, sest laeng-laeng interaktsioonid võivad ära kaduda detergendid molekulid, mis omavad hüdrofiilset ja hüdrofoobsed osa. Valkudes on hüdrofoobsed osad valgu sees, detergendid aga stabiliseerivad ka denatureerunud olekus valke. Kaotroopsed ühendid mood vesiniksidemeid 63 Pöörduv denaturatsioon- esineb tasakaal natiivse ja denatureerunud oleku vahel. Näidatud on, et valgu denaturatsioon on pöörduv, kui tingimused tagasi viia loomulikku vahemikku, siis valk omandab natiivse struktuuri. ND Valgu kolmemõõtmelise struktuuri kohta käiv info sisaldub valgu primaarstruktuuris. Esineb seos valgu primaarstruktuuri ja ruumilise struktuuri vahel. Enamasti denatureeruvad pöördumatult väikesed valgud. Pöördumatu denaturatsioon enamasti suured valgud. Pöörduvus ja pöördumatus võib sõltuda keskkonnast
TCR on alfa, beeta või gamma ja delta ahelad. TCR on heterodimeer. Kaks ahelat on disulfiid sidemetega seotud t raku plasmamembraani külge. Geneetilise mitmekesisus- t rakud ei läbi somaatilist mutatsiooni ega Class switching, ei genereerita V(D)J rekombinastiooniga. Koretseptoritena kasutav BCR CD19 ja CD21 ja TCR CD4 ha CD8. B rakud ja T rakud tunnevad ära erinevad substante kui antigeeni. B rakk kasutab siis raku pinnal seotud immunoglobuliini kui retseptorit. BCR tunneb ära natiivse antigeeni. TCR tunneb peptide MHC kompleksi ära. TCR vajab, et talle esitletakse peptiidi koos MHC klass molekulidega. Üheks sarnasuseks võiks lugeda selle, et nad mõlemad annavad signaali edasi türosiinkinaaside abil st vajavad türosiinkinaase vastavalt t raku või b raku aktivatsiooniks. 23. NK rakud Organismis on veel ka lümfotsüütidele lähedasi rakke, mida kutsutakse NK- rakkudeks. (NK- natural killer) . Need osalevad kasvajarakkude
Südamiku mõlemis otsas paiknevad 19S 'mütsikesed'. Iseloomustage chaperon'id(Hsp70 rühm) ja nimetage protsesse milles osalevad. Valgud, mis stabiliseerivad ebastabiilsed konformatsioonid, kiirendavad oligomeeride teket, valkude lagunemist ja tagavad lokalisatsiooni kindlates raku piirkondades. Hoiavad valke lahustunud kujul, mis on valmis kokkukeerdumiseks. Kaitsevad proteolüüsi eest. Vajalik ATP. On olulised rakkude liikumisel läbi membraanide. Paljud valgud omandavad natiivse konformatsiooni ainult seda tüüpi valkude abil. Iseloomustage chaperonin´id ja nimetage protsesse milles osalevad. Tagavad valkude kokkukeerdumise. Mõjuvad struktuuri tekke hilisematel staadiumitel. On oligomeersed valgud, mis moodustavad sisemusse kanali, kus valgu konformatsiooni teke toimub. Vajalik ATP. Reguleerib oligomeersete komplekside teket.
NB!NB!NB!NB!>>>>> kuna Väljamäe ei osanud faili korrigeerida, siis ei saanud kopida ja kuna ma olen laisk, siis palun, kirjutage ise õige nr juurde nii küsimus kui ka siis vastus:) 56.Millises valgu struktuuri tasandis leidub vajalik informatsioon valgu kokkupakkimiseks. a) primaar b) sekundaarc)tertsiaar d)kvarternaarstruktuuris 57. Denatureerunud valk ei ole funktsionaalne, sest on kaotanud oma natiivse ruumilise struktuuri ja koos sellega ka oma spetsiifilised omadused. 58. Millised faktorid soodustavad valgu kokkupakkumist? a)konformatsiooniline entroopia b) polüpetiidahela siseste vesiniksidemete moodustumine c) hüdrofoobne efekt d) polüpeptiidahela ja solvendi vahelise vesiniksideme moodustumine 59. Joonisel on toodud denatureerunud valgu osakaalu sõltuvus temperatu on valgu Tm väärtus ja kuidas te selle leiate? Joonis 7.20
12 võimatu konformeeride kui stabiilsete isomeeride eraldamine teineteisest (spektraalsete meetoditega saab C2 = C 2 konformeere siiski tuvastada). In situ püüab molekul C 1 alati võtta stabiilseima (natiivse) konformatsiooni, C1 = milline on tema funktsiooni aluseks. 17 Atsükliliste orgaaniliste ühendite konfor- Joon. 13 matsioonid OH Konformeeride ehitust saab esitada graafiliselt, nt
Kõik biopsiamaterjalist isoleeritud pärmseened loetakse haigustekitajateks. Hallitusseente isoleerimisel tuleb arvestada materjali kontaminatsioonivõimalusega ja hinnata konkreetse hallitusseene võimet tekitada oportunistlikke infektsioone. Diagnoosimine ALGMATERJALI MIKROSKOOPIA on üks kiiremaid võimalusi diagnoosi püstitamiseks. Seened on bakteritest oluliselt suuremad. Rögas või mädas võib sageli näha juba surnud seene elemente. Kasutusel on • KOH-ga natiivse ja erinevate värvimismeetodite abil värvitud preparaatide valgusmikroskoopia (vaata tabel); • faaskontrastmikroskoopia; • fluorestsentsmikroskoopia. Tušipreparaat (ingl. india ink) valmistatakse juhul, kui liikvori mikroskoopial (Grami värving, Calcofluor white vm) on leitud pärmirakke. Cryptococcus-infektsiooni korral on preparaadis tumedal taustal näha suured, 5–20 µm läbimõõduga pärmirakud, mida ümbritseb iseloomulik heledam limakapsel.
annaabi.ee 
