GroEL molekulaarne mehanism -Ekvatoriaalne osa (243 AA) põhiliselt helikaalne- ATPd siduv domään - vaheosa lühike, hüdrofiilne osa- ruum ATP/ADP difusiooniks -apikaalne domään (191-376 AA) koosneb kahest B sheedist, välimised domäänid pole selgelt struktueerunud ja moodustavad hüdrofoobseid klastreid Valkude degradeerimine Ekstratsellulaarselt toimub valkude lagundamine proteaaside abil: endoproteaasid, eksoproteaasid Valkude vananemine: -keemiline vananemine Gln Asn deaminatsioon -Met Cys oksüdeerimine -Ratsemisatsioon Valkude eluiga determineeritud tema järjestusega Intratsellulaarne valkude degradatsioon: -Lüsosomaalne -Ubikvitiin-sõltuv Ubikvitiin sõltuv degradatsioon Toimub proteasoomides- ATPsõltuv proteaas- 1% koguvalgust- 76AA jääki, tsütosoolne 20S-4 heptameerset domääni
* ükski reaktsioon ei toimu eraldi ega üksikult ning reaktsiooniprodukt on lähteaineks järgmisele reaktsioonile; *ainevahetus on pidev protsess; *ainevahetus on kui "maanteedevõrk" oma ristmike, vahepeatuste, keelavate ja lubavate fooritulede, liiklusreeglitega (vahel nimetatakse ka voogude mudeliks) *kõik on kõigega seotud, muutused ühel ainevahetusrajal mõjutavad lõppkokkuvõttes kogu organismi 59. Katabolism- Energiat sisaldavate ühendite keemiline degradeerimine (lammutamine). 60. Anabolism - Biomolekulide süntees 61. Makroergiline ühend ühend, mille hüdrolüüsil vabaneb palju energiat. 62. Süsivesikute ainevahetust reg: insuliin, glükagoon, Glükokortikosteroidid 63. Lipiidide ainevahetust reg: adrenaliin, atsetüülkoliin, insulin, glükagoon 64. Valkude ainevahetust reg: somatroopne hormoon, kortikotropiin, glükokoidid
esimene tara valmis sai oli küüliku leviala juba möödas, nii ehitati teine ja lõpuks ka kolmas, kokku 3000 km piirdetara. Kuid piirdeaiad ei hoidnud küülikuid tagasi ja peagi oli kogu Austraalia nende poolt hõivatud. Küüliku kiire paljunemine ja levik on suur probleem pärismaistele liikidele, kuna küülikud tarvitavad sama toitu ja elupaiku, põhjustasid küülikud pärismaiste liikide väljasuremise. Kuigi küülik suutis palju probleeme tekitada (erosioon, põllumaa degradeerimine ja kohaliku taimestiku hävitamine) on küüliku arvukuse piiramine raskendatud, sest küülik on oluline loom rebase toidulaual, kes vastasel juhul sööks teisi kohalikke liike. (50pluss) 10 Joonis 4. Küülik (Oryctolagus cuniculus). Allikas: Wikipedia Küülikutõrjeks on proovitud erinevaid meetodeid, nagu pesapaikade hävitamine, jaht tulirelvadega või mürgitamine. 1950. aastal suudeti "küülikukatk" kontrolli alla saada laiali
valgete linnaosad, ühest rahvusest või sama usuga inimeste linnaosad, regioonid). Probleemid: gruppi taastootev sotsialisatsioon, probleemide politiseerumise oht, separatsiooni oht. b) inimeste üleminek ühest grupist teise sotsiaalset staatust muutmata (tööline läheb tööle teise tehasesse, direktorist saab teise ettevõtte direktor). II. vertikaalne sotsiaalne mobiilsus. a) inimeste sotsiaalse seisundi muutumine, millega kaasneb staatuse tõus (edutamine) või langus (degradeerimine). a-1) mobiilsus antud sotsiaalse grupi (kihi, klassi) sees (tööline tõuseb oskustööliseks, eestööliseks, brigadiriks), a-2) kihtidevaheline mobiilsus - üleminek ühest kihist teise (töölisest - omanikuks, haritlasest - tööliseks ). Kui kihtidevaheline mobiilsus on võimalik, on tegemist avatud, kui ei ole, siis - suletud ühiskonnaga. b) sotsiaalsete gruppide (kihid, klassid) positsiooni muutumine teiste gruppide suhtes (n.
Probleemid: gruppi taastootev sotsialisatsioon, probleemide politiseerumise oht, separatsiooni oht. b) inimeste üleminek ühest grupist teise sotsiaalset staatust muutmata (tööline läheb tööle teise tehasesse, direktorist saab teise ettevõtte direktor). II. vertikaalne sotsiaalne mobiilsus. a) inimeste sotsiaalse seisundi muutumine, millega kaasneb staatuse tõus (edutamine) või langus (degradeerimine). a-1) mobiilsus antud sotsiaalse grupi (kihi, klassi) sees (tööline tõuseb oskustööliseks, eestööliseks, brigadiriks), a-2) kihtidevaheline mobiilsus - üleminek ühest kihist teise (töölisest - omanikuks, haritlasest - tööliseks ). Kui kihtidevaheline mobiilsus on võimalik, on tegemist avatud, kui ei ole, siis - suletud ühiskonnaga. b) sotsiaalsete gruppide (kihid, klassid) positsiooni muutumine teiste gruppide suhtes (n. kodanlik revolutsioon tõstis kodanluse ja langetas
linnaosad, regioonid). Probleemid: gruppi taastootev sotsialisatsioon, probleemide politiseerumise oht, separatsiooni oht. b) inimeste üleminek ühest grupist teise sotsiaalset staatust muutmata (tööline läheb tööle teise tehasesse, direktorist saab teise ettevõtte direktor). II. vertikaalne sotsiaalne mobiilsus. a) inimeste sotsiaalse seisundi muutumine, millega kaasneb staatuse tõus (edutamine) või langus (degradeerimine). a-1) mobiilsus antud sotsiaalse grupi (kihi, klassi) sees (tööline tõuseb oskustööliseks, eestööliseks, brigadiriks), a-2) kihtidevaheline mobiilsus - üleminek ühest kihist teise (töölisest - omanikuks, haritlasest - tööliseks ). Kui kihtidevaheline mobiilsus on võimalik, on tegemist avatud, kui ei ole, siis - suletud ühiskonnaga. b) sotsiaalsete gruppide (kihid, klassid) positsiooni muutumine teiste gruppide suhtes (n
linnaosad, ühest rahvusest või sama usuga inimeste linnaosad, regioonid). Probleemid: gruppi taastootev sotsialisatsioon, probleemide politiseerumise oht, separatsiooni oht. b) inimeste üleminek ühest grupist teise sotsiaalset staatust muutmata (tööline läheb tööle teise tehasesse, direktorist saab teise ettevõtte direktor). II. VERTIKAALNE sotsiaalne mobiilsus. a) inimeste sotsiaalse seisundi muutumine, millega kaasneb staatuse tõus (edutamine) või langus (degradeerimine). a-1) mobiilsus antud sotsiaalse grupi (kihi, klassi) sees (tööline tõuseb oskustööliseks, eestööliseks, brigadiriks), a-2) kihtidevaheline mobiilsus - üleminek ühest kihist teise (töölisest - omanikuks, haritlasest - tööliseks ). Kui kihtidevaheline mobiilsus on võimalik, on tegemist avatud, kui ei ole, siis - suletud ühiskonnaga. b) sotsiaalsete gruppide (kihid, klassid) positsiooni muutumine teiste gruppide suhtes (n. kodanlik
ühest rahvusest või sama usuga inimeste linnaosad, regioonid). Probleemid: gruppi taastootev sotsialisatsioon, probleemide politiseerumise oht, separatsiooni oht. b) inimeste üleminek ühest grupist teise sotsiaalset staatust muutmata (tööline läheb tööle teise tehasesse, direktorist saab teise ettevõtte direktor). II. vertikaalne sotsiaalne mobiilsus. a) inimeste sotsiaalse seisundi muutumine, millega kaasneb staatuse tõus (edutamine) või langus (degradeerimine). a-1) mobiilsus antud sotsiaalse grupi (kihi, klassi) sees (tööline tõuseb oskustööliseks, eestööliseks, brigadiriks), a-2) kihtidevaheline mobiilsus - üleminek ühest kihist teise (töölisest - omanikuks, haritlasest - tööliseks ). Kui kihtidevaheline mobiilsus on võimalik, on tegemist avatud, kui ei ole, siis - suletud ühiskonnaga. b) sotsiaalsete gruppide (kihid, klassid) positsiooni muutumine teiste gruppide suhtes (n.; maareform võib tõsta talupoegade sotsiaalset staatust)
Toidust saadavate valkude lagundamine algab maos, kuhu sekreteeritakse proensüümi pepsinogeeni. Pepsinogeen konverteeritakse pepsiinA-ks. Enamus lagundmisest toimub kaksteistsõrmikus pankrease poolt sekreteeritud ensüümide poolt. Nende proteaaside hulgas on nii ekso- kui endoensüüme ja nende kombineeritud toimel tekivad aminohapped, dipeptiidid ja tripeptiidid. Kõik need hüdrolüüsi produktid adsorbeeritakse limaskesta rakkude poolt. 2. Kirjeldage kus toimub aminohapete degradeerimine imetajate organismis. Algab maos. Enamus lagundamisest toimub kaksteistsõrmikus pankrease poolt sektreteeritud ensüümide poolt. 3. Analüüsige aminotransferaaside poolt katalüüsitavat reaktsioone. Katalüüsis osalev kofaktor ja reaktsioonietapid. Schiffi aluse struktuur. Seletage kuidas toimub -aminorühma eemaldamine seriini ja treoniini koosseisust. Aminohapete koosseisust kantakse lämmastik glutamaadi koosseisu transaminaaside abil, kust järgnevalt
Protospeisser ligeeritakse liiderjärjestusega külgnevale kordusele ja üheahelaline pikendamine parandab CRISPRi ja duplitseerib järjestust. crRNA protsessimine ja interferents toimub erinevaid teid pidi. Primaarset CRISPR transkripti lõigatakse cas geenide poolt et toota crRNAd. Küpsed crRNAd seonduvad cas valkudega ja moodustavad interferentsi kompleksi mille kaudu toimub sissetunginud DNA degradeerimine. • • RNP ehk ribonukleoproteiin on kombinatsioon RNAst ja valgust – RNA-valk kompleks. Nt ribosoomid, telomeraas, hnRNP-d ja snRNP-d. RNP-d on olulised geeniekspressioonil ja selle regulatsioonil. Peale transkriptsiooni seotakse pre- mRNAd erinevate valkude poolt, erinevas staadiumis mRNAga seotud erinevad valgud määravad mRNA saatuse. Pre-mRNA läbib protsessingu mida viivad läbi erinevad RNPd, nt U-rikas väike tuuma RNP (U snRNP), mis moodustavad
metaboolsed, onkogeensed, oksüdatiivne stress). Rakutsükli regulatsioon hõlmab hädavajalikke protsesse raku ellujäämiseks, kaasa arvatud pärilikkusmaterjali kahjustuste tuvastamine ja parandamine kontrollimatu rakujagunemise ennetamisena. Molekulaarsed sündmused, mis kontrollivad rakutsüklit, on järjestatud ja suunatud, mis tähendab, et iga protsess ilmneb järjestikuselt ja rakutsüklit on võimatu ümber pöörata. Valkude reguleeritud fosforüülimine ja degradeerimine kui rakutsükli kontrollimismehanismid - tsükliin-CDK hüperfosforüleerib Rb ning E2F transkriptsioonifaktor vabaneb. Tsükliinide roll mitoosi regulatsioonis - määravad ära raku edasijõudmise läbi rakutsükli. Kui CDK-d on tsükliini seondumisega aktiveeritud, viivad nad läbi tavapärast biokeemilist reaktsiooni, fosforüleerimist. See aktiveerib või inaktiveerib sihtmärgiks olevaid valke, mis koordineerivad rakutsükli järgmisesse faasi liikumist.
inhibeerida (näiteks LexA) või mõnede geenide puhul stimuleerida ja teiste puhul inhibeerida (näiteks Lrp leucine response protein). Osa regulone on kontrollitud alternatiivsete sigma faktorite poolt (näiteks 32 regulon). Regulatsioon võib toimuda mitmel erineval viisil: 1) regulaatori kovalentne modifitseerimine enamasti fosforüleerimine/defosforüleerimine (PhoB, NtrI), 2) negatiivse regulaatori degradeerimine (näit. LexA), 3) sigma faktori rakulise hulga tõstmine (32), 4) valgu konformatsiooni muutmine ligandi sidumisel. Bakteris E. coli on kirjeldatud ligikaudu 1000 erinevat operoni ning paarsada erinevat reguloni. Erinevatesse regulonidesse kuuluvad operonid või geenid võivad kuuluda modulonidesse. Samasse moduloni kuuluvaid geene/operone kontrollib lisaks nende erinevatele regulaatoritele ka ühine globaalne regulaator (näiteks cAMP retseptorvalk CRP e. CAP).
riigiaparaadi mitteseisuslik personal). Refereeritud teenistusastmete süsteemile kui absolutismi iseloomustavale nähtusele on omane juba terve kompleks tunnuseid, mis seonduvad hilisemal, bürokraatia ajastul avaliku teenistuse nn. karjäärisüsteemi e. personali teenistussüsteemiga: 1) süsteem koosneb hierarhilisest teenistusastmestikust; 2) karjääri tegemine madalamalt astmelt kõrgemale, kusjuures sanktsioonina on võimalik degradeerimine ehk viimine madalamale astmele või üldse süsteemist väljalülitamine; 3) karjääri võimalus on saavutuse motiivi stimuleeriv tegur; 4) igale astmele on oma nõuded; 5) iga aste evib oma sotsiaalse positsiooni, staatuse; 6) vastavasse astmesse arvamine eeldab teenistuja olemist teenistuses (tööl, tegevuses) mingis konkreetses riigiaparaadi institutsioonis (samas võimaldas teenistusaadli süsteem praktikas:
muutustega, mida viib läbi allosteeriline regulatsioon. Aeglasem vastus keskkonnast tulnud signaalile on geenide ekspresseeritavuse muutmine, mis sisaldab endas mitut kontrollpunkti. Geenide avaldumist saab reguleerida transkriptsiooni initsiatsiooni ja transkriptsiooni enneaegse terminatsiooniga ehk attenuatsiooniga ning post-transkriptsiooniliselt RNaaside abil reguleerides RNA eluiga. Samuti on oluline kontrollpunkt translatsioon ning post-translatsiooniline valkude pakkimine ning degradeerimine. 68 Keskkonnast vastuvõetud signaalile võib bakter reageerida erinevalt, muutes ainult ühe geeni avaldumist või reguleerides mitme või isegi sadade geenide avaldumist korraga. Selleks, et toimuks geenide avaldumine, on esmalt vaja geene transkribeerida RNA-ks. Transkriptsioon jaguneb initsiatsiooniks, elongatsiooniks ning terminatsiooniks.