Biokeemia teine test (0)

Teine test 3.10 esmaspäev
Teemad:
fermentatsioonireaktsioonid
pentoosfosfaadi rada
uurea tsükkel
transaminaasid
lipiidede oksüdatsioon
NADH, NADHP, FADH2, tiamiinpürofosfaat, püridoksaalfosfaat
15 min (pikem)
Fermentatsioonireaktsioonid – toimub tsütoplasmas
Fermentatiivsete anaeroobsete) reaktsioonide ainsaks eesmärgiks on muuta NADH NAD+-iks (et hiljem seda glükolüüsis kasutada).
- Energiat ei teki
- Märkimisväärne erinevus – fermentatiivse metabolismi (anaeroobne) korral - toodetakse 2 ATP, aeroobsel hingamisel - 36 ATP-d
eesmärk – kulutada püruvaati, samas toota NAD+
miks – hapniku puudumisel on see ianuke võimalus toota NAD+ ja ATPd
Alkoholi fermentatsioon – esineb pärmis ja erinevates bakterites

• Fermentatsiooni produkt – alkohol – on organismile toksiline
  

Piimhappeline fermentatsioon – esineb inimeses, teistel imetajatel ja ka nt. piimhappebakteritel

• Piimahappelise fermentatsiooni produkt – laktaat – on toksiline nii imetajatele kui ka bakteritele
  

Glükolüüsil moodustuv NADH tuleb reoksüdeerida tagasi NAD+-ks

Anaeroobsetes tingimustes redutseerib NADH lihastes püruvaadi laktaadiks (homolaktaalne fermentatsioon)

Pärmis püruvaat dekarboksüleeritakse, moodustavad CO2 ja atseetaldehüüd , viimane redutseeritakse NADH poolt etanooliks ( alkohoolne fermentatsioon)

Aeroobse metabolismi korral oksüdeeritakse NADH hingamisahelas, protsess seotakse 2.5 ATP sünteesiga
pentoosfosfaadi rada
Pentoosfosfaadi (PF) rada leiab aset raku tsütosoolis ning selle käigus toodetakse NADPH ja sünteesitakse pentoos-suhkruid (5C).
PF rajal on kaks eristatavat faasi:

• esimene on oküdatiivne faas, kus toodetakse NADPH
  
• teine on mitte-oksüdatiivne, kus sünteesitakse erinevaid 5-süsinikulisi suhkruid. See rada on ka alternatiiv glükolüüsile. Kuna PF rada hõlmab endas glükoosi oksüdeerimist, on tema primaarne roll pigem anaboolne kui kataboolne
  

Oksüdatiivne rada
Üldine reaktsioon :
Glucose 6- phosphate + 2 NADP+ + H2O → ribulose 5-phosphate + 2 NADPH + 2 H+ + CO2
Mitte-oksüdatiivne rada
uurea tsükkel 9. loeng
Uurea tsükkel . tsütosoolis, mitokondris

Aminohapete aminorühmad muudetakse karbamiidiks ehk uureaks (NH2CONH2) maksas ja väljutatakse sellisel kujul neerude abil. Kolmandas tsüklis – aldimiin -> quinonoid intermediate + h+ (kinoidne intermediaalne)
transaminaasid
Aminohapete koosseisust kantakse lämmastik glutamaadi koosseisu transaminaside abil, kust järgnevalt eemaldatakse glutamaadi dehüdrogenaasi poolt. Transaminaaside tulemusel muutuvad aminohapped ketohapeteks. Sellistes reaktsioonides osaleb kofaktorina PLP.
glutamaadi dehüdrogenaasi reaktsioon
mõlemal juhul vabaneb üks lämmastikammoodium. (tähtis ka seriini ja treoniini dehüdrataasid – aga ei pea teadma)
ketoglutaraat – tsitraaditsükli 3nda reakts tulemus
lipiidide oksüdatsioon

NADH, NADHP, FADH2, tiamiinpürofosfaat, püridoksaalfosfaat
(radade rekatsioonid, substraadid, ensüümid on tähtsad)
NADH dehüdrogenaas ( kompleks I)
Katalüüsitav protsess:
NADH+5H+(M)+UQ -> NAD++UQH2+4H+(IMS)
Suktsinaadi dehüdrogenaas ( kompleks II)
Katalüüsiv reaktsioon:
Suktsinaat+UQ -> fumaraat UQH2