bioloogiliste protsessides. ATP võimaldab nii energiat üle kanda kui ka fosforüleerimisprotsesse läbi viia. ATP sünteesi mehhanism on sarnane nii bakterites, loomades kui taimedes. Taimedes saadakse ATP sünteesiks vajalik energia fotosünteesi valgusstaadiumist, kus kõrge redokspotentsiaaliga elektronide liikumisel tülakoidis toimuvate reaktsioonide tulemusel vabanevad vesinikioonid tekitavad prootongradiendi. Kõrge prootonite kontsentratsioon kloroplasti luumenis põhjustab prootonite liikumise läbi ATP süntaasi basaalse osa stroomasse, kus prootonite kontsentratsioon on madal. Prootonite liikumine läbi ATP süntaasi paneb ensüümi roteeruva kompleksi pöörlema ning varustab seeläbi ATP sünteesiks vajaliku energiaga. Reaktsiooni aktiveerimiseks peavad ADP ja fosfaatrühm liituma ATP süntaasi „avatud” saidiga. Seejärel toimub rotatsioon, mille tulemusena muutub aktiivsaidi struktuur ning ADP ja fosfaatrühm moodustavad ATP, eraldub vesi
B Fotosüntees Kirjutage elektronide liikumise rada alates e- doonorist kui lahuses on ühendid redokspotentsiaalidega +0.82, -0.05 ja -1,3 V -1,3-0,05+0,82 Redokspotentsiaal = elektronafiinsus Nimetage mõni fotosünteesi valgusreaktsioonides osalev ühend/kompleks mis paikneb kloroplastide luumenis Plastotsüaniin (asub luumenis et elektronid liiguks plastokinoonilt ikka Cytb6f-le,mitte plastotsüaniinile) Taimed kasutavad fotosünteesis millist valgust? Fotosünteetiliselt aktiivne valgus 400 700 nm. Loetlege viis sinist valgust absorbeerivat pigmentide rühma taimedes Klorofüll a Klorofüll b Karotinoidid Fütokroomid Krüptokroomid Nimetage fotosünteetiliselt aktiivse valguse lainepikkuste vahemik ja nimetage pigmendid mis fotosünteesis kasutatavat valgust absorbeerivad 400 700 nm.
36. Milliseid Calvini tsükli jaoks vajalikke aineid valgusreaktsioonides toodetakse? ATP ja NADPH 37. Miks on FSII valgustpüüdva kompleksiga seotud vett lagundav kompleks. 38. Mis funktsioon on tsentriklorofüllil. Millise lainepikkusega kvandid lükkavad fotosünteesi valgusreaktsiooni käima? 680nm u 39. Kumb fotosüsteem on seotud ATP ja milline NADPH tootmisega? NADPH FSI, ATP - FSII 40. Miks on vaja prootoneid läbi membraani stroomast luumenisse pumbata? - et luumenis oleks prootonite kontsentratsioon suurem kui stroomas 41. Peaksite teadma FS I ja FS II erinevusi. FS II FS I Tsentriklorofüll a neelab valgust Tsentriklorofüll a neelab valgust lainepikkusel 680nm lainepikkusel 700nm Tsentriklorofüll saab kaotatud Tsentriklorofüll saab kaotatud elektroni asemele uue elektroni elektroni asemele uue elektroni
II-st lagundavast kompleksis e veelt Tulemus Ergastunud elektron liigub otse Ergastatud elektroni energia arvel NADP-le, mille tulemusena tekib sünteesitakse ATPd NADPH Ergastatud elektroni energia arvel sünteesitakse ATPd elektrontranspordi ahelas vabanenud energia arvel tõmmatakse prootonid luumenisse, et luumenis oleks prootonite kontsentratsioon tunduvalt suurem kui stroomas. Seejärel voolavad nad läbi ATP sünteesi, määda kontsentratsiooni gradienti, tagasi stroomasse. Vabaneva energia arvel liidab ensüüm ATPaas ADP-le kolmanda fosfaatrühma e sünteesitakse ATP. 17. Kust tuleb molekulaarne hapnik (mida me hingame)? Molekulaarne hapnik tekib fotosünteesi käigus vett lagundava kompleksi jääkproduktina. 18. Täitke lüngad.
ABA, PYR/RCAR -> G valgud -> fosfolipaas C, JP3 + DAG B Fotosüntees 1. Kirjutage elektronide liikumise rada alates e- doonorist kui lahuses on ühendid redokspotentsiaalidega +0.82, -0.05 ja -1,3 V Liikumine toimub alati väiksemat suuremale: -1,3, -0,05 ja siis +0,82 Mida negatiivsem redokspotentsiaal, seda parem elektronide doonor 3. Nimetage mõni fotosünteesi valgusreaktsioonides osalev ühend/kompleks mis paikneb kloroplastide luumenis Tülakoidi membraanides asuvad valgust neelavad fotosüsteemid I ja II (PSI ja PSII) ja nendevahelised elektronikandjad plastokinoon, tsütokroom b6f, plastotsüaniin, samuti ka NADP reduktaas ja ATP süntaas 4. Taimed kasutavad fotosünteesis millist valgust? (Kirjutage lainepikkuste vahemik) Fotosünteesil kasutatakse nähtavat valgust 400 700 nm punases (650-680 nm) ja sinises valguses (430-470 nm, nn Soret riba)
Sünteesib ühe täispöörde kohta 3 ATP molekuli. Membraanis on neli suuremat kompleksi: Fotosüsteemid I ja II, nende vahel elektrone piki membraani edasiandev ja samal ajal prootoneid risti membraani läbi kasndev tsütokroom b6f ja ATP süntaas, mis prootonid uuesti välja laseb ja nende energia arvel ATPd sünteesib. PSII ja Cyt b6f vahel kannab elektrone membraani sees difundeeruv plastokinoon, Cyt b6f ja PSI vahel aga kannab elektrone luumenis difundeeruv plastotsüaniin. Kokku jääb iga elektroni kohta luumenisse kolm prootonit (3H+/e-), millest üks eraldus vee lagundamisel ja kaks seoses plastokinooli oksüdeerimisega Cyt b6f kompleksil. Nelja elektroni kohta transporditakse 12 H+, mis võimaldavad sünteesida 3 ATP. Niiviisi, koos nelja elektroni jõudmisega transportahela lõppu (2 NAPH sünteesiga) sünteesitakse paralleelselt ka 3 ATP, stöhhiomeetriliselt vajalik hulk ühe CO 2 sidumiseks.
mis on asendatud võrreldes glükolüüsiga. Katalüüsiv bisfosfataas on allosteeriline ensüüm. 3. Vaba glükoosi süntees Enamikes kudedes vaba glükoosi ei sünteesita. Eelmises reaktsioonis tekkinud fruktoos-6P muutub glükoos-6P ning see kasutatakse glükogeeni sünteesiks. Vaba glükoos sünteesitakse peamiselt maksas, kuna maks hoiab vere glükoositaset ning viib tekkinud vaba glükoosi rakust välja, verre. Glu-6P hüdrolüüsitakse ER luumenis, kus glükoos-6-fosfataas seda reaktsiooni läbi viib. Glükoneogeneesi ja glükolüüsi reguleerimine Kui üks rada on suhteliselt inaktiivne, on teine aktiivne. Cori tsükkel Lihasrakkudes toodetud laktaat viiakse maksa ümbertöötlemiseks.
neutraliseerib ise. Kuidas pannakse kokku valgu Asn jäägile seotav oligosahhariidne kompleks ER membraani tsütoplasma poolsel küljel toimub kõigepealt kahe N-atsetüülglükoosamiini (GlcNAc) seostumine membraanis paikneva dolihoolfosfaadi külge. Järgneb viie mannoosi jäägi liitumine. Seejärel toimub dolihhooli liikumine ER luumeni poolsele küljele fosfolipiidi translokaasi e flipaasi toimel. Luumenis lisatakse täiendavad 4 Man ja 3 Glc jääki ja kompleks Glc 3Man9GlcNAc2 on moodustunud dolihhooli küljes. Glükoosi jäägid on signaaliks, et oligosahhariid on ‘valmis’. Miks on sekreteeritavate valkude glükosüülimine vajalik Vajalik N-seoselist sahhariidset jääki sisaldavate valkude õige konformatsiooni moodustumisel. Ainult õigesti voltunud valgud liiguvad ER-st Golgi kompleksi. Mis määrab A, B, O vererühmad.
7. Kuidas pannakse kokku valgu Asn jäägile seotav oligosahhariidne kompleks ER membraani tsütoplasma poolsel küljel toimub kõigepealt kahe N-atsetüülglükoosamiini (GlcNAc) seostumine membraanis paikneva dolihoolfosfaadi külge. Järgneb viie mannoosi jäägi liitumine. Seejärel toimub dolihhooli liikumine ER luumeni poolsele küljele fosfolipiidi translokaasi e flipaasi toimel. Luumenis lisatakse täiendavad 4 Man ja 3 Glc jääki ja kompleks Glc3Man9GlcNAc2 on moodustunud dolihhooli küljes. Glükoosi jäägid on signaaliks, et oligosahhariid on `valmis'. 8. Miks on sekreteeritavate valkude glükosüülimine vajalik Vajalik N-seoselist sahhariidset jääki sisaldavate valkude õige konformatsiooni moodustumisel. Ainult õigesti voltunud valgud liiguvad ER-st Golgi kompleksi. 9. Mis määrab A, B, O vererühmad.
lagundamisel. Toksiliste hüdrofoobsete ühendite detoksifikatsioon toimub keemilise modifitseerimise teel, mille abil muudetakse ühendid vees kergemini lahustuvaks. Tänu sellele on neid kergem rakust välja transportida. Siledapinnalist ERi on rakkudes vähem kui rERi. Seevastu maksarakkudes on sERi rohkesti. Sarkoplasmaatiline retiikulum on oluline kaltsiumi kontsentratsiooni regulatsioonis. Selle luumenis on palju kaltsiumiga seonduvaid proteiine, mis teevad võimalikuks kaltsiumi hoiustamise ERis. Kaltsium pääseb luumenisse tänu membraanis olevatele kaltsium-ATPaasidele. Enne kui sekreteeritavad valgud transporditakse ERist nende sihtmärk piirkonda, toimub tsütoplasmavõrgustikus nende muutmine ehk modifitseerimine. 30. Lüsosoomide funktsioon. Lüsosoomid on ühekordse membraaniga ümbritsetud põiekesed, mis sisaldavad ensüüme
tekkimisel Veepuudus tekib, kui mulla vesilahuse veepotensiaal on madalam kui taimes. Vesi liigub kõrgema vabaenergiaga piirkonnast madalama poole. ABA toimel... (vt eespool). B. Fotosüntees 1. Kirjutage elektronide liikumise rada alates e- doonorist kui lahuses on ühendid redokspotentsiaalidega +0.82, -0.05 ja -1,3 V -1,3 - 0,05 0,82 2. Nimetage mõni fotosünteesi valgusreaktsioonides osalev ühend/kompleks mis paikneb kloroplastide luumenis MSP - vett lagundav kompleks (PS II-s), plastotsüaniidid (PC). 3. Nimetage fotosünteetiliselt aktiivse valguse lainepikkuste vahemik ja nimetage pigmendid mis fotosünteesis kasutatavat valgust absorbeerivad Klorofüllidel Chla ja Chlb on kaks tugevamat neeldumisriba. Punases valguses 650-680 nm ja sinises (Soret riba) 430-470 nm. 4.Kuidas sõltub kvandi energiasisaldus footoni lainepikkusest? Kirjutage valem. Sõltub pöördvõrdeliselt: E=hc/ 5
ETA-s, kui palju ATP-d on võimalik selle arvel sünteesida? 8 prootonit. 2-3 ATP-d. Kui H2O oksüdeerumisel tekib kaks elektroni ja vabaneb 8 elektroni, kas siis kahe H20 (H2Od on ju kaks molekuli) redutseerumisel ei transpordita 16 prootonit? Stroomast luumenisse kokku 12 H+ -i, ATPaas sünteesib ATP u 3-5 H+ ga. Sõltuvalt subühikute arvust promootoris. Seega 12 H+ -st umbes 3 ATP-d + O2 120.Pmf suurus kloroplastides.~8 stroomas ja ~5 luumenis > pH = 3 -0,03-0,06*3=-0,21V=-210mV 121. Fotosünteesi biokeemiline staadium, millised faasid eristatakse. Millises faasis on vajalik ATP ja NADPH, milleks? ? Biokeemiline staadium: CO2 ainevahetuses. Faasid: Süsihappegaasi seostumine ja redutseerimine sahhariidideks toimub ainult valguses (valgusstaadium) ja Calvini tsükkel(Calvin - Benson Bassham tsükkel) (fotosünteesi pimereaktsioonid). Milleks ATP ja NADPH: valguses tekib ATP ja NADPH mis on vajalikud Calvini tsükli toimumiseks
Signaaljärjestuse interaktsiooniks ER membraaniga on vaja kahte valku: SRP ja SRP retseptor. Translokalisatsiooni põhjustab ribosoomi liikumine mRNA-l ja sellest tulenev polüpeptiidahela liikumine ribosoomist välja. Polüpeptiid liigub ER luumenisse läbi translokoni. GTP hüdrolüüsi tulemusena tekkiv konformatsioonimuutus vabastab SRP ja rSRP kompleksi. 5. Millal ja kus toimub signaaljärjestuse lõikamine ja valkude pakkimine ER valkudel ERis (luumenis) pärast sinna suunamist signaaljärjestuste järgi vahetult pärast sünteesi algust. 6. Transmembraansete valkude membraani suunamine signaalankurjärjestus on signaaliks SRPle ja peatab translokalisatsiooni ja "stop-transfer" ankurjärjestus peatab translokalisatsiooni. 7. Kuidas viiakse membraani intra- N-terminusele lähim hüdrofoobne järjestus initsieerib vastsünteesitud ahela sisestamise ER membraani nii, et N-terminus on tsütosooli
kuni 40 %. Cryptocotyle concava metatserkaare leiti lôpustes kuni 70% juhtudest. Anisakidae g. sp. (summaarselt R. acus´e ja C. osculatum´i) larve leiti maksas ja mesenteeriumis kuni 23% aastatel 1984-1988 ning kuni 64% aastatel 1990-1994. P. laevis´e larve esines aastatel 1984-1986 sisustesse kapseldunult 17% ja aastatel 1990- 1994 kuni 70%. P. laevis´e imaago (täiskasvanud) isendid olid kinnitunult soolestiku seinas ja luumenis. Neid esines 1984. a kuni 10% ja aastatel 1990-1994 kuni 25%. Corynosoma sp. larvid peaaegu puudusid aastatel 1986-1991, kuid nende levik hakkas aastatel 1992-1994 püsivalt, kuid aeglaselt tôusma. Sama täheldati ka Dichelyne (Cucullanellus) minutus´e larvide ja täiskasvanud isendite osas. Kümneaastase perioodi vältel suurenes lesta nakatumine magedaveeliste parasiitidega. Ka esines erinevusi noorte lestade (+1) ja vanemate lestade parasitofauna vahel.
muutumine tänu madalale pH-le. Lisaks sellele soodustab madal pH pooride sulgumist. Madal pH põhjustab OmpF-i monomeeride järjestikuse sulgumise tänu konformatsioonilistele muutustele, mis toimuvad rakuvälises osas olevatele silmustele. 31 E. coli OmpF-i sulgeb ka kadaveriin, polüamiin, mida bakter hakkab tootma eriti madalal pH-l. Kadaveriin seondub OmpF-i luumenis oleva L3 silmusega ning initsieerib poori sulgumise. Arvatakse, et sedasi muudab bakter välismembraani vähem läbilaskvaks, et kaitsta ennast madala pH eest. Välismembraani läbilaskvus ja antibiootikumiresistentsus LPS omadustest tulenevalt moodustub G(-) bakterite välisküljele tugev hüdrofiilne barjäär (O-antigeen ja polüsahhariidide südamik), samas lipiid-A suurem hulk küllastunud rasvhappeid moodustavad tugeva hüdrofoobse barjääri keskkonnas olevatele ainetele
Ühel 8 antikeha molekulil on 2 seostumise kohta antigeeniga. Antikeha on seegabivalentne. Igat antikeha iseloomustab peale spetsiifilisuse ka afiinsuskonstant reageerimises antigeeniga. See võib olla väga varieeruv ning jääb vahemikku 105-1011 liiter/mool. 7.)Kuidas pannakse kokku valgu Asn jäägile seotav oligosahhariidne kompleks. . ER luumenis paiknevad ensüümid lisavad sahhariidsed jäägid Asn, Ser ja Thr jääkidele. Kui valgu ahel on sünteesitud, ribosoomid vabanevad. N seoselised oligosahhariidid on seotud üle lämmastiku, valgu Asn jäägi amiidrühmale atsetüülglükoosamiini (GlcNac) vahendusel, sahhariidses ahelas on palju mannoosijääke ja hargnemisi, ahel lõpeb siaalhappe (N- atsetüülneuramiinhape - NANA) jäägiga, ahela süntees algab 14 suhkrujääki sisaldava oligosahhariidse kompleksi seostumisega
Surub maha väga paljude mutantsete geenide avaldumise. Valkude kotranslatsiooniline transport - levinud bakterites, arhedes ja eukarüootides - süntees membraani küljes - valk liigub kohe läbi membraani - esimesed 10-20 sünteesitavat AH-d on signaaliks transpordile - ribosoomides tekib translatsiooniline arest kui signaalosa tuleb nähtavale - ribosoomid seostuvad membraanida ja valk sünteesitakse luumenisse - signaaljärjestus lõigatakse ära luumenis - Sec 61 võimaldab valgul liikuda ka „külje-ukse“ kaudu, millega valk läbib membraani. Põhiline osaline kotranslatsioonilises transpordis. Ko-translatsiooniline transport 42 Mis saab valguga, kui ta on valmis sünteesitud. Valku transporditakse lõplikku kohta kompleksis chaperonidega. Ko-translatsioonilise transpordil suunatakse endoplasmaatilise retiikulumi luumenisse. Läheb translatsiooni ajal läbi membraani.