Peiteaeg Vaktsiin olemas - AIDS Levikuviis seksuaalkontakt, veri, kehavedelikud Haigusenähud immuunsüsteemi nõrgestamine Peiteaeg väga pikk Vaktsiin - puudub - Esimesena avastati tubaka mosaiikviirus, avastati täna elektronikroskoobi kasutuselevõtule 1941 - Viiruse suurus 0,01-0,3 mikromeetrit( väiksel 1 geen, suurtel paarsada) - Viirus on parasiitgeen // Viirus on nukleiinhappe ja valgukompleks - Viirused liigitatakse selle järgi, missugune nukleiinhape tema ehituses on DNA viirused RNA viirused Tuulerõuged Gripp Ohatis Pülümeriid e. lastehalvatus Ajukelmepõletik Leetrid Soolatüükad Mumps Marutõbi Tubaka mosaiikviirus
puuduvad.Operaator- negatiivne geenireg piirkond (bakteris). Repressor- DNAd siduv valk mis represeerib transkriptsiooni.cDNA- complementary DNA- küpsest mRNAst (RNA sõltuvast DNA polumeraasi abil ) sünteesitud DNA. Enhansereid vaja transkriptsiooniks. microRNAs (miRNA) üheahelalised RNA molekulid 21-23 nukleotiidi pikad. Reguleerivad geeniekspressiooni. miRNAd kodeerib geen mis on transkribeeritud DNAlt kuid ei ole transleeritud valguks ( mittekodeeriv DNA)Mediaatori funkts: (valgukompleks 50 erinevast valgust). Tähtis koaktovaator, Transkriptsiooni kontroll PolI ja II kaudu, transkriptsiooni aktiveerimine. Aitab edastada signaale PolII-te ja transleerida aktiivsuse tõstmiseksKromosoom-pärilikkuse salvestaja, geenide materiaalne kandjaMobiilne DNA- DNA, mis saab ringi liikuda genoomi siseselt: transposoomid (retro-, DNA transposoomid, lisajärjestused), plasmiidid, bakteriofaagid, II rühma intronid. Transkrip Faktor- tugeva seostumisvõimega valgud st
polümeraas). DNA polümeraas lisandub RNA praimerile, et sünteesida okazaki fragment. Mahajääval ahelal liigub replikatsiooni kahvel 5'--- 3'suunal seepärast peabki toimuma süntees katkendlikult * DNA polümeraasi ja klambervalgu seostumine ja vabanemine viivisahelal (Liug)klamber hoiab DNA polümeraasi kopeeritava ahelaga tugevalt seotuna ning ei lase sel dissotseeruda ehk eralduda. Klambri asetab DNA-le libiseva klambri laadija, valgukompleks, mis katalüüsib klambri avamist ja asetamist DNA-le, kasutades ATP hüdrolüüsi energiat. Liugklamber hoiab DNA polümeraasi kopeeritava ahelaga tugevalt seotuna ning ei lase sel dissotsieeruda ehk eralduda. Klambri asetab DNA-le libiseva klambri laadija, see on valgukompleks, mis katalüüsib klambri avamist ja asetamist DNA-le, kasutades ATP hüdrolüüsi energiat. * DNA replikatsiooni algatamine bakterite rakus Valgud, mis algatavad bakterites DNA replikatsiooni
saab oma energia ATP hüdrolüüsilt. Transkriptsiooni- initsiatsiooni kompleksi moodustumine. 11. Mediaator PILT on suur valgukompleks, koosneb 20-30 subühikust. Mediaator on samuti väga sageli transkriptsiooni aktivaatorite sihtmärgiks: püüdes kinni Mediaatori, saab promootorile tuua ka RNA polümeraasi. Mediaator ongi vahelüli transkriptsiooni aktivaatorite ja RNA polümeraasi vahel. PolII - koosneb 12-st subühikust (Rpb1-12), millest suurimad on Rpb1 ja Rpb2. 12. PolI-sõltuv transkriptsioon: koos seonduvad UBF (upstream binding factor) ja SL1 (promoter selectivity factor). SL1 koosneb TBP-st ja kolmest TAF-ist
kaotab oma kõrgemat järku struktuurid, seda nimetatakse denaturatsiooniks. Lisaks temperatuurile võivad valke denatureerida ka mehhaanilised tegurid, happed, raskmetalliühendid, ioniseeriv ja UV kiirgus. Aminohappejääkidevahelised peptiidsidemed denaturatsiooni käigus ei katke. Denatureeriva mõju lakkamisel võivad valgud taastada sekundaar ja tertsiaalstruktuuri, seda pöördprotsesse nim renaturasiooniks. Valgud võivad ühineda ka teiste org ainetega, mood liitvalgud: Valgukompleks nukleiinhapetega nim nukleoproteiinideks (eukarüootide kromosoomid) Lipiidedega lipoproteiionid(rakumembraani koostis) Oligosahhariididega glükoproteiionid(membraan) 1) Valkude ensümaatiline funktsioon: Ensüümis reageerivad biokeemiliste reaktsioonide kiirust, ensüümid on VÄGA spetsiifilised. Mõdede ensüümide aktiveerumiseks on vajalik vitamiinide olemasolu rakus. 2) Ehituslik funktsioon: rakuorganellide koostis, karvad, suled, sõrad jne 3)transportfunktsioon:
MHC VALGUD on kõrgelt polümorfsete geenide produktid, mida ekspresseeritakse erinevate rakkude pinnal. Koosneb ca 100 geenist. Indiviidide vahel erinevad alleelide DNA järjestused 5-10 % st. eri indiviidide poolt ekspresseeritavad geeniproduktid on unikaalset struktuuri erinevustega. MHC alleelide vahel võivad aminohapete erinevused olla kuni 20 aa. MHC molekulid, mida antud indiviidil ekspresseeritakse, ei muutu elu jooksul. Koesobivusantigeen I (MHC I) - raku pinnal asuv valgukompleks, millega seonduvad rakus sünteesitavate valkude fragmendid. On glükoproteiinid, mida ekspresseeritakse kõigi tuumadega rakkude pinnal. Sisaldavad kahte peptiidahelat: · raske e. -ahel sisaldab 3 domääni: i. 1 ii. 2 iii. 3 Igaüks neist sisaldab ca 90 aa, lisaks veel: i. 25 aa membraanset osa (hüdrofoobne) ii. tsütoplasmaatilist saba (30aa) · kerge e
Kollakeha folliikuli jäänused, milles munarakk esineb selgroogsetel loomadel, sealhulgas ka on ovulatsiooni käigus väljunud. inimesel. Kombinatiivne muutlikkus geneetilise (päriliku) Kvaternaarstruktuur (neljandat järku struktuur) muutlikkuse vorm, mis tuleneb vanemate erinevate mitmest polüpeptiidahelast koosnev geenialleelide ümberkombineerumisest järglaste valgukompleks. genotüüpideks. Alleelide ümberkombineerumine Kõldkest (koorion) loodet ümbritsev välimine toimub meioosi ja viljastumise käigus. lootekest. Esineb selgroogsetel loomadel, Kommensalism on ühele liigile kasulik, teisele sealhulgas ka inimesel. pole sellest kooselust kasu ega kahju.
3) N-alused heeliksi teljega risti, aluste vahe ca 3,4A. Ühel heeliksi pöördel 10,4 alust. 4) Heeliksi diameeter 20A. 6. DNA tertsiaarne struktuur. Nukleosoomid ja histoonide roll nende kujunemisel. Kromosoomide formeerumise etapid. Kromosoomi struktuur. DNA tertsiaarstruktuurid susperspiraalid. Prokarüootide genoom koosneb ühest kromosoomist, mis esineb tsirkulaarse DNA kujul. Nukleosoomid DNA ja histoonide valgukompleks. 7. RNA liigid, nende bioloogiline roll, struktuur ja lokalisatsioon rakkudes. DNA ja RNA ahela erinevused. tRNA ja rRNA tertsiaarne struktuur. Ribosoomid mõiste, koostis, roll rakkudes. RNA kõrgemad struktuurid: Matriits RNA (mRNA) primaarstruktuur; prokarüootides sisaldab üks mRNA informatsiooni paljude valkude sünteesiks. Ribosoomi RNA (rRNA) eristatakse primaar-, sekundaar-, tertsiaar- ja kvaternaarstruktuure.
pinnal. koosneb ca 100 geenist (2000kb hiire DNA-l ja 4000 kb inim. DNA-l). Indiviidide vahel erinevad alleelide DNA järjestused 5-10 % st. eri indiviidide poolt ekspresseeritavad geeniproduktid on unikaalset struktuuri erinevustega. MHC alleelide vahel võivad aminohapete erinevused olla kuni 20 aa.). MHC molekulid, mida antud indiviidil ekspresseeritakse, ei muutu elu jooksul. Koesobivusantigeen I (MHC I)-raku pinnal asuv valgukompleks, millega seonduvad rakus sünteesitavate valkude fragmendid. On glükoproteiinid, mida ekspresseeritakse ca kõigi tuumadega rakkude pinnal. Sisaldavad kahte peptiidahelat raske e. -ahel (45kD) sisaldab 3 domääni : (1; 2 ja 3) - igaüks neist sisaldab ca 90 aa, lisaks veel 25 aa membraanset osa (hüdrofoobne)+ tsütoplasmaatilist saba (30aa) kerge- (12kD)= 2-mikroglobuliin (ei kodeerita MHC lookuses); invariantne (st. muutumatu), seondub mittekovalentselt -ahela ekstratsellulaarse osaga
kõrgemat järku struktuurid, seda nimetatakse denaturatsiooniks. Lisaks temperatuurile võivad valke denatureerida ka mehhaanilised tegurid, happed, raskmetalliühendid, ioniseeriv ja UV kiirgus. Aminohappejääkidevahelised peptiidsidemed denaturatsiooni käigus ei katke. Denatureeriva mõju lakkamisel võivad valgud taastada sekundaar ja tertsiaalstruktuuri, seda pöördprotsesse nim renaturasiooniks. Valgud võivad ühineda ka teiste org ainetega, mood liitvalgud: Valgukompleks nukleiinhapetega nim nukleoproteiinideks (eukarüootide kromosoomid) Lipiidedega lipoproteiionid(rakumembraani koostis) Oligosahhariididega glükoproteiinid(membraan) Funktsioon: 1) Valkude ensümaatiline funktsioon: Ensüümis reageerivad biokeemiliste reaktsioonide kiirust, ensüümid on VÄGA spetsiifilised. Mõnede ensüümide aktiveerumiseks on vajalik vitamiinide olemasolu rakus. 2) Ehituslik funktsioon: Rakuorganellide koostis, karvad, suled, sõrad jne. 3)Transportfunktsioon:
masinas, elusolendis ja ühiskonnas. Kunstlik valik - inimese huvidele vastavate tunnustega isendite ebateadlik või teadlik (geneetikaseadustel põhinev) valimine sordi või tõuaretuse ning sobimatute isendite paljundusest kõrvaldamine. Kusekott (allantois) - üks lootekestadest, mis esineb selgroogsetel loomadel, sealhulgas ka inimesel. Kvaternaarstruktuur (neljandat järku struktuur) - mitmest polüpeptiidahelast koosnev valgukompleks. Laguahel - heterotroofsetest organismidest koosnev toiduahela osa, milles looduses leiduvad orgaanilised ained oksüdeeritakse järkjärgult lihtsama ehitusega ühenditeks ja mille lõppproduktiks on anorgaanilised ühendid. Laguahel - toiduahel, mis algab elutegevuse jääkidest ja surnud organismidest ning lõpeb mikroorganismidega (seente, bakterite või protistidega) Lagundaja (destruent) - surnud organismide koostisaineid lagundav heterotroofne organism (bakter, seen, selgrootu loom).
Mahajääval ahelal liigub kahvel 5’→ 3’ suunas, mistõttu ei saa mahajäävat ahelat replikatsioonikahvli liikumise suunas pidevalt sünteesida. Mahajääv ahel sünteesitakse fragmentide kaupa. 17. DNA polümeraasi ja klambervalgu seostumine ja vabanemine viivisahelal Klamber hoiab DNA polümeraasi kopeeritava ahelaga tugevalt seotuna ning ei lase sel dissotsieeruda ehk eralduda. Klambri asetab DNA-le libiseva klambri laadija – valgukompleks, mis katalüüsib klambri avamist ja asetamist DNA-le, kasutades ATP hüdrolüüsi energiat. Viivisahelal võib jääda laadur kogu sünteesi ajaks kompleksiga kokku Eksonukleaas lõikab RNA praimeri välja ja DNA ligaas seob DNA ahela kokku 18. DNA replikatsiooni algatamine bakterite rakus Üks alguspunkt, helikaas liigub piki mahajäävat ahelat 1) Initsiaatorvalgud seostuvad spetsiifilisele DNA järjestusele replikatsiooni
Inimese geenide transkriptsioon algab peaaegu alati mediaatorkompleksi vahendusel. Seonduvad üldised transkriptsioonifaktorid. Lisaks seonduvad aktivaatorvalgud – spetsiifilised ja on igal geenil erinev kombinatsioom Mediaatorkompleks – suur kompleks, mis seondub transkriptsiooni aktivaatoritega ja on 2-domäänilised valgud. Üks domään seondub DNA-ga, teine mediaatoriga. Teisel üks DNA-ga, teine aga kromatiini ümbermodelleerimise kompleksiga. Keeruline valgukompleks. Lisaks on spetsiaalne TF, mis koosneb kahest moodulist. Üks domään tunneb ära DNA järjestuse ja teine seondub mediaatorkompleksiga. TF terminatsioonid määravad geeni avaldumise. Valkkompleks, mis remodelleerib kromatiini. Histoone atsetüleeritakse. TATA kõverdumine aitab üksteisest kaugel olevaid osi üksteisele lähedale tuua. Aktivaatorpiirkond peab olema promootorile piisavalt lähedal. Mediaatorkompleks vahendab interaktsiooni.
Näiteks risosfäärne G(-) bakter Rhodospirillium centenum muutub metaboolselt inaktiivseks ja moodustab tsüsti, kui keskkonnas väheneb tugevalt toitainete hulk. Tsüsti moodustumine on reguleeritud klassikalise kemotaksise signaalraja modifitseeritud kaskaadiga Che3. See koosneb sensorist CheS3 ja vastuseregulaatorist CheY3. Lisaks on oluline veel teine sensorvalk CheA3, mis modifitseerib signaali ülekannet CheS3-lt CheY3-le. Tegelikult on sensorvalk CheA3 valgukompleks, mille koosseisus on: metüül-kemoretseptorvalk MCP 3, metüültransferaasid CheR3 ja CheB3, linkervalgud CheW3a ja CheW3b ja histidiinkinaas CheA3. Kui rakkudes deleteeriti cheS3 või cheY3 geen, siis moodustas R. centenum alati tsüste. Samas, kui rakud on CheA3-defektsed, siis R. centenum oli alati vegetatiivse rakuna. See näitab, et CheA 3 reguleerib signaali ülekandumist CheS3-lt CheY3-le. Kui rakkude AEC on kõrge, siis on CheS 3 histidiinkinaasne domeen (HWE)
annaabi.ee 
