Agregatsioon on oluline diagnostiline geneetiliselt määratletud tunnus. Agregaate kirjeldatakse kõige rohkem kokkidel, aga neid esineb ka batsillidel ja hiljuti on näidatud ka spirillide agregeerumist ketiks. Agregatsioon vähendab eripinda ja on kasulik näiteks rakkude kuivamise takistamiseks. Naha pinnal on näiteks palju agregeerunud kokke (stafülokokid, mikrokokid). Naha pind on kuiv keskkond! Mikrobioloogia I. Bakterite kujurühmad 2011. T Kokkide agregaadid Kui kokid poolduvad ühes tasapinnas ja moodustunud rakud jäävad kokku, siis moodustuvad agregaadid: kaksikkokid (diplokokid) ja ahelkokid (streptokokid). Diplococcus on kaksikkokk (diplokokk). Streptococcus (Diplococcus) pneumoniae on kaksikkokk. Agregaadi ümber ühine kapsel. Mikrobioloogia I. Bakterite kujurühmad 2011. Tiina Alamäe Kokkide agregaadid Neisseria meningitidis
Põhiline levik: Aafrika riikides Ebola Tungib endoteeli rakkudesse Kahjustab veresooni Veri ei hüübi enam Esialgu tekib hemorraagiline lööve Sisemised verejooksud Ebola Ravi Puudub standartne ravi ravi sümptomaatiline elektrolüütide tasakaalustamine asendatakse kaotatud hüübimisfaktorid vereülekanded hingamisaparaadid "Lihasööja bakter" A grupi streptokokk Anaeroobne bakter Kujult kerajas Kokkide perekond Toodab toksiine anaeroobses keskkonnas "Lihasööja bakter" Põhjustab mäda Koed hävivad Põletik levib luuni Võib haarata suuremaid piirkondi Naha sisselõiked ja antibiootikumravi Ravile allub halvasti Aitäh kuulamast Allikad http://emedicine.medscape.com/article/216288-overview www.nlm.nih.gov/.../ ency/fullsize/17160.jpg pubpages.unh.edu/ ~mpu24/IMAGES/ebola3.gif http://et.wikipedia.org/wiki/Bakterid ENE http://en.wikipedia
Vt joonis: propionaadi teke Maitse: · Laktoosist: Propioonhape ja äädikhape 2:1, piimhape · Proteolüüs tagab elastse juustumassi tekke: 1. Kümosiin: Valmimisel hüdrolüüsib peptiidsidemed s1 kaseiinis. Kümosiini toimel tekkinud peptiidid lagundatakse juuretise peptidaasidega edasi. Toime -kaseiinile väga nõrk. 2. Ekstratsellulaarsed proteinaasid (PrtP) 3. Rakusisesed peptidaasid (tri-, dipeptiidide, aminopeptidaasid). Kokkide ja laktobatsillide peptidaasid olulised järelvalmimisel (nt proliini peptidaas - Pro) Pärast kaseiini hüdrolüüsi kümosiini ja ekstratsellulaarsete proteinaasidega on laktokokkide peptidaasidega võimalik peptiidide täielik proteolüüs aminohapeteks. Järelvalmimise kiirendamine: 1. Ensüümmodifitseerimine ehk ensüümide lisamine. Kasutatakse mikroseente või
Oska nimetada vähemalt kümme tunnust kummastki rühmast. Mis on bakteri genoom? Kuidas saab genoomseid andmeid kasutada bakterite kirjeldamisel ja iseloomustamisel? Antonie van Leeuwenhoek, Louis Pasteur, Robert Koch, Sergei Vinogradski, Alexander Fleming, Craig Venter, Joseph Lister jt olulised mikrobioloogia. Delfti koolkonna mikrobioloogid. Kochi postulaadid. Louis Pasteur’i katse kurekaelaga kolviga. Bakterite kujuvormid. Oska nimetada ja joonistada bakterite põhilisi kujuvorme ja kokkide (kerabakterite) agregaate. Too näiteid vastavate agregaatidega bakteritest. Mida tead aktinobakteritest, müksobaktertest, klamüüdiatest ja mükoplasmadest? Oska nimetada struktuure, organelle ja omadusi, mis eristavad eu- ja prokarüootset rakku. Tuum, kromosoomid, ribosoomid, membraanide koostis: ester- ja eeterlipiidid, steroolid, histoonid ja rakuskeleti valgud, viburite ehitus, intronid geenides, membraansed organellid eukarüootidel.
Lister võtab kasutusele fenoollahuse, opiasjade jt puhastamiseks. 9.Leidke nimistust need organellid, mida prokarüootidel ei ole. Prokarüootidel ON ribosoomid ja valgu süntees toimub ka. 70S tüüpi. Rakusisaldiste järgi. Puudub tuumamembraan, tõelised histoonid (valgud, mis hoiavad DNAd koos), diploidne kromosoomistik, üldjuhul steroolid rakumembraanis, 80S ribosoomid, tsütoplasmavõrgustik, mitokondrid, plastiidi, Golgi kompleks, tsentrioolid, mikrotuubulid. 10.Joonista kokkide agregaadid ja too näited. Kerakujuline. Slaidil üksik kokk, esinevad ka gruppidena. Athrobacter. Megashaera, halococcus - soola sees kerakujuline baakter -, veillonella, enterococcus - soolestikus olev bakter. Pildistatud naha pinnal, see kokk võib põhjustada haavanakkusi. Kõige lihtsam on kaksikkokk - diplococcus. Slaidil hoiab kahte koos rakukesta väliskiht Ahelkokk v streptokokk - ühes tasapinnas, kokku jööb ikka kaks rakku. Streptokokid eritavad lima, tekib polüsahhariidi kest.
Avastab penitsilliini. · Robert Hook leiutas või täiustas baromeetrit, anemomeetrit ja hügromeetrit. Konstrueeris uut tüüpi kaheläätselise mikroskoobi. · Joseph Lister võtab kasutusele antisepsise. Võtab kasutusele lahja fenoolilahuse instrumentide, ruumide ja opipesu töötlemiseks. Opijärgne surevus vähenes pärast neid meetmeid kiiresti. 23. Bakterite kujuvormid. Oska nimetada ja joonistada bakterite põhilisi kujuvorme ja kokkide (kerabakterite) agregaate. Too näiteid. · Kerabakterid e. kokid · Pulkbakterid e. batsillid (E. Coli) · Kruvibakterid e. spiraalsed bakterid (spirillid ja vibrioonid) (kooleratekitaja) · Keeritsbakterid e. spiroheedid (borrelioosi tekitaja) Kokkide agregaadid: Üksikult esinevad kokid (enterococcus), Diplokokk (meningokokk põhjustab meningiiti), Ahelkokk (Streptokokk)(Thiomargarita), Tetraad (tetrakokk)(thiopedia), kuupkokk
Endo testiga. BGLB. β-galaktosidaasi testi. Nitrofenool – kollane ühend. 16. Kas saame võrdustada β-galaktosidaasi testi laktoosil happe moodustamise testiga? Ei saa, ensüümi aktiivsust näitab vaid β-galaktosidaasi test. 17. Mida näitab nn oksüdaastest? Kas redutseerunud cytc annab elektronid molekulaarsele hapnikule → tekib vesi ja hapnik. 18. Milliste mikroobirühmade (gramreaktiivsus) eristamisel on oluline oksüdaastest? GN pulkbakterite ja kokkide eristamiseks 19. Kuidas toimub indofenoolsinise tekkimine oksüdaastestis? kunstlik substraat oksüdeerub oksüdaasi ja hapniku juuresolekul indofenoolsiniseks. 20. Milliseid hingamistüüpe tunned ja mille poolest nad erinevad? elektroni lõppakseptori poolest. Aeroobne ja anaeroobne hingamine, kääritajad. 21. Mis on denitrifikatsioon? Lämmastikuringe lüli, kus nitraadid redutseeritakse gaasilisteks ühenditeks. 22
milles on olulised: β-laktaami tsükkel, vaba 4-COOH, bitsüklite süsteem ja säilitatud külgahelate stereokeemia. Tsefolosporiin C-st saadakse analooge. Kuigi penitsilliinid on aktiivsemad, on tsefalospiriinidel laiem toime. Süstides on head. Gram-neg omandavad resistentsuse kiiremini: Tsefalotiin - efektiivsem kui PEN-G Tsükloseriini toodab Streptomyces gram(+)batsillide ja kokkide suhtes, garyphalus ning toimib tsütoplasmas ka gram(-)batsillide S.aureus ja E.coli kahe D-alaniini NAM-ga liitumist vastu. Vasupidav eelmise inhibeeritdes. penitsillaasile. Vähe allergiline. Puudused: halvasti imenduv, metaboliseerub kiirelt inaktiivseks, ei tööta Pseudomonas aeruginosa vastu. Tsefaloridiin - vastupidavam, vees Vancomütsiin on glükopeptiid ja lahustuv, positiivse laenguga, hea takistab disahhariidi väljumist
· · Raku kuju tagab tugev rakukest. Kui bakterilt rakukest eemaldada, siis ta võtab isotoonilises lahuses kera kuju, sõltumata tema eelnevast kujust. · · Lisaks bakterite põhirühmadele on ka teisi kujusid: · Niitjad bakterid · Aktinomütseedid · Müksobakterid · Mükoplasmad · Punguvad ja jätketega bakterid · · Agregaat ehk kogum. Agregaate kirjeldatakse kokkidel ja batsillidel ja on näidatud ka spirillide agregeerumist ketiks. · · KOKKIDE AGREGAADID: Kui rakud pooldusid ühes tasapinnas, siis moodustuvad kaksikkokid ehk diplokokid ja ka ahelkokid ehk streptokokid Kui pooldumine toimub kahes teineteisega ristuvas tasapinnas, siis moodustuvad plaatjad agregaadid ja tetraadid ( kobarkokk ehk stafülokokk) Kui pooldumine toimub kolmes teineteisega ristuvas tasandis, siis moodustuvad kuupkokid ehk sartsiinid. · · Ümarate bakterite eelised ja puudused:
eristamiseks, kuna näiteks liikide eristamiseks ei ole tal piisavalt ,,lahutusjõudu. Bakteri liigi määratlemine DNA homoloogia (sarnasuse) kaudu. Tüvedel vähemalt 70% homoloogia. Louis Pasteur, Robert Koch, Antonie van Leeuwenhoek, Sergei Vinogradski, Alexander Fleming jne. Kochi postulaadid. Louis Pasteur'i katse kurekaelaga kolviga. Vt. Vihikust. Bakterite kujuvormid. Oska nimetada ja joonistada bakterite põhilisi kujuvorme ja kokkide (kerabakterite) agregaate. Too näiteid selliste agregaatidega bakteritest. Kerabakterid e. Kokid Halococcus, Veillonella Diplokokk rakud poolduvad ühes tasapinnas Streptococcus Pneumoniae, Neisseria meningitidis, Moraxella cattarhalis Tetraad pooldumine toimub kahes teineteisega ristuvas tasapinnas Deinococcus, Aerococcus, Planococcus, Lampropedia, Thiopedia Kuupkokid ehk sartsiinid Micrococcus, Sarcina, Pediococcus Pulkbakterid e
Süljesekretsiooni ja mäletsemise kestust on võimalik suurendada koresööda osa suurendamisega ratsioonis. Oluline ka söötade struktuur - granuleeritud sööt, tselluloosirikka ratsiooni kiire asendamine süsivesikuterikka söödaga põhjustab pH langust. Vatsas intensiivistub ka piimhappe käärimine ning tõuseb piimhappe sisaldus, is tõstab vatsavedeliku osmootset rõhku 3-4 korda. Vedelik liigub veresoonkonnast vatsa, tekib dehüdratatsioon. Happesuse süvenemine soodustab kokkide ja piihappebakterite arengut vatsas. Tekitab eesmao limaskesta põletikukahjustusi kuni erosioonide ja haavanditeni. Areneb vatsa atoonia isutus, apaatia, kerge tümpaania, roe roheline, ka koolikud, maaslamamine. Vatsavedelik hallikas piimjas, pH < 6.karjas korraga mitu haigusjuhtu, kulg alaäge, krooniline. Verre imendunud happed tekitavad metaboolse atsidoosi. Põletikuprotsess võib eesmao limaskestalt levida libedikku ja soolde. Loomadel teikb profuusne, sageli verine kõhulahtisus. 3
kokid 2. Pulkbakterid e. batsillid 3. Kruvibakterid e. spiraalsed bakterid (lühemad (vibrioonid) ja pikemad (spirillid)) 4. Keeritsbakterid (spiroheedid) Niitjad bakterid, viljakehi moodustavad bakterid, mütseeli moodustavad bakterid (aktinobakterid), paljukujulised (pleomorfsed). Jätkedega bakterid. RAKUKUJUD JA NENDE EELISED NING PUUDUSED KESKKONDADES Kokid- kerakujulised bakterid. Esinevad ühekaupa, kuid mõned liigid moodustavad ka püsivaid agregaate. Kokkide eelised ja puudused Väiksem eripind. Vastupidavamad kuivusele ja osmootse rõhu muutustele keskkonnas. Mullas, kus keskkonnatingimused on väga muutlikud (toitainete konstentratsioon mullalahuses muutub, muld kuivab sageli läbi jne.) on sageli rohkesti kokke. Kuna toitumisel liiguvad ained läbi raku pinna, siis on ainete transpordimahud kokkidel suhteliselt väikesed- aeglasem kasv. Ei ole head pinnale kleepuvad- tasase pinnaga vähe kokkupuutepinda. Seda võiks parandada
hapnik pääses kolbi. Välisõhus sisalduvad mikroorganismid sadenesid kolvikaelas. Kui kolbi kallutada ja pesta kaelas sadenenud mikroobid puljongisse või kael lõhkuda, algas puljongis kohe kiire rakkude paljunemine. Pasteuril oli õnne, et ta kasutas oma kurekaelaga kolvis puljongit, mitte heinatõmmist, milles alati on batsillide spoore, mis kuumutamisel ei hävi. 6. Bakterite kujuvormid. Oska nimetada ja joonistada bakterite põhilisi kujuvorme ja kokkide (kerabakterite) agregaate. Too näiteid vastavate agregaatidega bakteritest. kerabakterid e. kokid Agregaadid: 1) stafülokokid e kobarkokid (Staphylococcus aureus) 2) kuupkokid e sartsiinid (Micrococcus, Sarcina, Pediococcus) 3) tetrakokid e nelikkokid (Deinococcus radioduran) 4) kaksikkoidid e diplokokid (Streptococcus pneumoniae) 5)
1928. aastal avastab Penicillium notatumi poolt toodetava stafülokokke pärssiva ühendi penitsilliini. 33. Delfti koolkonna mikrobioloogid. 1. Antonie van Leeuwenhoek (1632-1723) 2. Martinus Willem Beijerinck (1851-1931) 3. Albert Jan Klyuver (1888-1956) 4. Cornelius van Niel (1897-1985) VI 34. Bakterite kujuvormid. Oska nimetada ja joonistada bakterite põhilisi kujuvorme ja kokkide (kerabakterite) agregaate. Too näiteid vastavate agregaatidega bakteritest. Kerabakterid e. Kokid Halococcus, Veillonella Ahelkokid ehk streptokokid Thiomargarita namibiensis, Streptococcus Üksikult esinevad kokid: Arthrobacter, Megasphaera, Halococcus, Veillonella, Enterococcus Diplokokk rakud poolduvad ühes tasapinnas Streptococcus Pneumoniae, Neisseria meningitidis, Moraxella cattarhalis
Mittemädased. • Reumaatiline palavik – südame põletikulised muutused, põletikulised muutused liigestes (artralgia-artriit), veresoontes, subkutaansetes kudedes. Krooniline kulg võimalik. Seotud farüngiidiga. Tõusnud ASO tiiter. Sagedasim kooliealistel lastel, esineb tavaliselt sügisel, talvel. • Äge glomerulonefriit – nefrogeenne GABHS tüvi, esineb impetiigo ja farüngiidi järgselt, lastel hea prognoosiga. Diagnostika. • Mikroskoopia: nahal G+ ahelatena paiknevate kokkide leid diagnostiline, kurgus mitte. • Antigeeni test: farüngiitide skriiningus laialdaselt kasutusel. Seisneb antikehade kasutamises grupispetsiifilise süsivesiku määramiseks. • PCR on saadaval, kuid kallis. • Bakteriaalne külv. • Antikehad. ASO tiiter reumaatilise palaviku või glomerulonefriidi diagnoosi kinnitamiseks. Ravi ja profülaktika. Penitsilliin on valikravim, resistentsust täheldatud pole. Penitsilliinravi kestus 10 päeva, efekt on olemas ka lühemate kuuridena
Berliini ja Koch ,,vaktsineeris" neid. Paraku ei toimunud paranemist, mõnikord pigem olukord halvenes. 1891. a tunnistas Koch, et tegemist on tuberkuloositekitajate kultuuri seguga zelatiinis. (Asjast sai küll teatav varase diagnoosimise vahend von Pirquet 1907. a kasutusele võetud test kannab ka Mantoux testi nime.) Oli veel ilmseid nakkushaigusi, mille toimest ei saadud aru eriti käivad siia alla kõikvõimalikud reumaatilised palavikud (sarlakid nt). 1882 Ogston eraldab kokkide kultuuri streptokokid. Neid batsille leiti patsientide kõrist ja nahalt, kuid mitte verest ja südamest nt. 1934. a saadi aru, et palaviku näol peab olema tegemist organismi immuunreaktsiooniga streptokokkide vastu. 19. sajandi lõpuks tehti kindlaks nakkushaiguste mikroobne olemus, defineeriti enamus sellistest haigustest. See kõik omakorda andis tõuke aseptika ja hügieeni arengule (vt eelnevalt käsitlemist leidnud Lister, Bergmann, Zoege-Manteuffel jt).
Ritsiin Ei levi Suur võimatu; Aerosoolid päev mõni tund Sabotaazi- Stafülo Mõni aktid veeva- Toetav ravi; kokkide päev kuni rustuses või Ei levi Väike mõni päev kuni enterotok- mõni toiduaine mõni nädal siin B nädal tööstuses, aerosoolid