aktiivsus, väheneda lahustuvus ning muutuda molekuli kuju. 3) Vahu moodustamine ja stabiliseerimine Valkude üheks funktsiooniks on vahu moodustamine stabiliseerimine. Ideaalne vahtu moodustuv ja stabiliseeriv valk on: a) Madala molekulkaaluga b) Suure pinna hüdrofoobsusega c) Hea lahustuvusega d) Väikese üldlaenguga toidu pH põhjal e) Kergesti denatureeritav 4) Geeli moodustamine Kahte sorti geele: a) Polümeersed võrkstruktuurid b) Agregeerunud dispersioonid 5) Emulgeeriv efekt emulsioonid on disperssed süsteemidühest või mitmest segunematust vedelikust Keemilised reaktsioonid Valkude bioloogiline väärtus väheneb: a) Asendamatute aminohapete lagunemisel b) Asendamatute aminohapete muundumisel derivaatideks, mis ei ole metaboliseeritavad c) Siseja vaheahelate ristsidumisel seeditavus väheneb 1) Ensüümkatalüütilised reaktsioonid a. Hüdrolüütilised reaktsioonid
Nii on igati võimalik, et keemilise kaitstuse geen on levis populatsioonis seeläbi, et ühe keemiliselt kaitstud, kuid kiskja poolt siiski tapetud (välja sülitatud) isendi sugulased, kellest paljudel oli olemas sama geeni koopia, pääsesid ärasöömisest seeläbi, et piirkonnas tegutsev kiskja(isend) sai selle ühe (või mõne) ärasöödu põhjal nii negatiivse kogemuse, et jättis teised samasugused puutumata. Selline seletus eeldab seda, et sugulased olid ruumiliselt agregeerunud (st ühe kiskja tegutsemispiirkonnas) , mis tekitab probleeme - vaevalt, et keemilise kaitseta elukad rühmadena elasid (st selliste "karjadena", nagu paljud tänapäevased keemiliselt kaitstud putukad, nt paljud liblikaröövikud), sest kiskjaid hirmutavate kaitsekohastumuste puudumisel pole (eelkõige putukate) rühmas elamine kasulik - võita pole midagi, aga kahjulik on see vähemalt seeläbi, et tõuseb kogu rühma leitavus kiskja seisukohalt). Siiski siiski - "päris"
spetsiifiline koloonia tüüp Hutchinson'i planktoni paradoks: (x) vastuolu planktilise keskkonna näilise homogeensuse ja liikide rohkuse vahel; () liikide suur biomass planktonis arvestades valguse kroonilist vähesust; () vetikatsengute tekkimine arvestades pidevat toitainetepuudust pindmises kihis; () vastuolu fütoplanktoni väikese biomassi ja herbivooride suure hulga vahel; () näiline vastuolu füsika seadusete ja planktiliste organismide agregeerunud ruumilise leviku vahel Monod võrrand: (x) kasvukiiruse sõltuvus toitainete kontsentratsioonist; () kasvukiiruse sõltuvus valguse intensiivsusest; () valguse intensiivsuse sõltuvus fütoplanktoni biomassist; () fütoplanktoni arvukuse sõltuvus toitainete kättesaadavusest; () liikide arvu sõtuvus ökoloogiliste nishide hulgast Logistiline võrrand: () liikide loogiline järgnevus suktsessioonis (r-strateegid ! K strateegid); ()
· kahte katseklaasi valasin kummassegi 2 ml munavalgu lahust · ühte katseklaasi lisasin 1 ml kontsentreeritud äädikhapet · mõlemaid katseklaase kuumutasin keeval vesivannil Tulemused ja järeldused: Puhtas lahuses valk denatureerus ja tekkis valge sade. Lahuses, kuhu oli lisatud äädikhapet ja pH alla viidud, ei toimunud valgu väljasadestumist. Võib järeldada, et pH muutmise tagajärjel valgumolekulid omandasid lahuses ühesuguse laengu ning peale seda enam ei agregeerunud, seetõttu ei toimunud ka lahusest väljasadenemist. 1.1.8 Valkude sadestamine orgaaniliste lahustitega Etanool, atsetoon jt. veega segunevad orgaanilised solvendid kutsuvad valgumolekulides esile aminohapete apolaarsete radikaalide pöördumise molekulide välispinnale. Toimub valgu dehüdratiseerumine, mistõttu valk sadestub lahusest välja. Kui sadestit ettevaatlikult lisada ja katseklaasi sisu pidevalt loksutada, denatureerub valk pöörduvalt
Bakterite kujurühmad 2011. Tiina Alamäe Teatud juhtudel jäävad rakud pärast pooldumist kokku ja moodustavad agregaate ehk kogumeid. Agregatsioon on oluline diagnostiline geneetiliselt määratletud tunnus. Agregaate kirjeldatakse kõige rohkem kokkidel, aga neid esineb ka batsillidel ja hiljuti on näidatud ka spirillide agregeerumist ketiks. Agregatsioon vähendab eripinda ja on kasulik näiteks rakkude kuivamise takistamiseks. Naha pinnal on näiteks palju agregeerunud kokke (stafülokokid, mikrokokid). Naha pind on kuiv keskkond! Mikrobioloogia I. Bakterite kujurühmad 2011. T Kokkide agregaadid Kui kokid poolduvad ühes tasapinnas ja moodustunud rakud jäävad kokku, siis moodustuvad agregaadid: kaksikkokid (diplokokid) ja ahelkokid (streptokokid). Diplococcus on kaksikkokk (diplokokk). Streptococcus (Diplococcus) pneumoniae on kaksikkokk. Agregaadi ümber ühine kapsel. Mikrobioloogia I. Bakterite kujurühmad 2011
Difusioon on iseeneslik protsess. Sedimentatsioon. Dispersse faasi osakeste settimine või pinnale tõusmine raskus või tsentrifugaaljõu toimel. Kui Browni liikumisel tekkivate põrgete tulemusena tekivad piisava raskusjõuga osakesed, settivad need kolloidlahusest välja. Liikuma panev jõud on raskusjõud ja osakeste settimist takistab sisehõõrdejõud, mis on proportsionaalne keskkonna viskoossusega. Algul agregeerunud osake liigub kiirenevalt raskusjõu mõjul. Suureneb ka takistusjõud, ühel hetkel nad on võrdsed, kui avaldame vastavad jõud, siis saame lõpuks sedimentatsiooni kiirust kirjeldava avaldise. Osakesed õhus settivad kiiremini kui vees, sest õhu viskoossus on mitu suurusjärku madalam võrreldes veega. Mida suurem osake, seda kiirem sedimentatsioon. Kui tahame aeglustada, siis tõstame dispersioonikeskkonna viskoossust. Sedimentatsiooni põhjal saab hinnata emulsioonide püsivust
o Magnettaksis magnetosoomid o Osmotaksis o Termotaksis · Postiive taksis atraktant · Negatiivne taksis - repellent Mikroorganismid võib jagada 4 põhirühma: · Kerabakterid e kokid Võivad esineda ühekaupa või agregaatidena (diplokokid, streptokokid, tetraadid, sartsiinid) · Pulkbakterid e batsillid Esinevad ainult agregaatidena (streptobatsillid, diplobatsillid) Ketti agregeerunud rakkudel võib olla ka ühine kapsel Nende rakkude otsad võivad olla: Teritunud Tömbid Hargnenud ellipsoidsed paljudel neist moodustuvad endospoorid, mis võivad paikneda: otsmiselt keskel külgmiselt · Kruvibakterid e spiraalsed bakterid (spirillid ja vibrioonid) jagatakse: vibrioonideks (1-1,5 keerdu) spirillideks (keerde rohkem) keti moodustumine on väga erandlik · Keeritsbakterid e spiroheedid
Pildil kett Thiomargarita rakkudest. Thiomargarita namibiensis'e nimetus tähendab Namiibia väävlipärli. Vistrike põhjusteks on ka suur stafülokokkide hulk nahal. 11.Pulkbakteril kirjeldada, kas on tömbid otsad, kitsad või paksud, tähelepanelikult kirjeldada. Batsillidel esinevad ainult ahelataolised agregaadid - streptobatsillid ja diplobatsillid. Pikki kette moodustavad paljud perekonna Bacillus, Clostridium ja Bacterium esindajad. Pseudomonaadid on sageli diplobatsillidena. Ketti agregeerunud rakkudel võib olla ka ühine kapsel. Siberi katku tekitajate pulkbakterite Bacillus anthracis rakud moodustavad kette. Rakkudes näha heledad värvumata endospoorid. Pulkbakterite rakuotsad võivad olla teritunud (Cytophaga), harunenud (Corynebacterium, Mycobacterium), tömbid (B. anthracis) või ka ellipsoidsed (enamik batsille). 12.Mida tead aktinomütseetidest? Arvati, et tegu on seentega, Tglt prokarüoot. Levinud mullas. Võimelised lagundama raskesti lagundatavaid orgaanilisi aineid
Karboksüoome Aerosoome (magnetosoome) (parasporaalkehasid) Karboksüsoomid on bakteri organellid, mis sisaldavad Calvini tsükli võtmeensüümi ribuloos-1,5-difosfaadi karboksülaasi agregeerunud molekule (reaktsioon näidatud punase noolega). Esinevad peamiselt obligaatselt autotroofsetel bakteritel. St neil bakteritel, kes orgaanilisi aineid ei omasta. ON hulknurksed valgulise membraaniga struktuurid. ( nt. nitrifitseerivad bakterid, tsüanobakterid, tiobatsillid.) Gaasipõiekesed ehk aerosoomid On sigarikujulised põiekesed, mille funktsioon on sarnane kala ujupõie omale. Põiekestel on hüdrofoobne valguline membraan, mis ei lase vett läbi, kuid laseb läbi gaase
aktivaatorvalguga ja ATP hüdrolüüs. Ilma aktivaatorita on promootor inaktiivne. Seega on 54-sõltuvad geenid kas vaikivas olekus või kõrgel tasemel ekspresseeritud. 32 konkureerib 70-ga. Kuna 32 ja 70 on RNA polümeraasi suhtes ühesuguse afiinsusega, toimub regulatsioon faktorite aktiivsuse kaudu. 70 on RNA polümeraasi subühikutest temperatuurile kõige tundlikum. Temperatuuritõusu tagajärjel on 70 inaktiivne, agregeerunud vormis. Nii saab RNA polümeraasi apoensüüm siduda teist faktorit. DnaJ, DnaK ja GrpE moodustavad 32-ga stabiilse kompleksi, eksponeerides teda proteaasidele (membraanseoseline ATP-sõltuv proteaas FtsH e. HflB ning tsütoplasmaatilised ClpAP, SslVU ja Lon). HS tagajärjel on shaperonid hõivatud denatureerunud valkude kõrvaldamisega rakust. Selle tagajärjel vabaneb 32 shaperonidest ning seondub RNA polümeraasi apoensüümiga, olles seal paremini kaitstud ka proteaaside eest
- suunalised mootorvalgud düneiinid rakkude kooreosas membraani all tõmbavad astraalseid mikrotorukesi kaugemale (pooluste kaugenemine). Anafaas A's toimub liikumine mikrotorukeste otsa poole siis võivad osaleda düneiinid. 149. Tsentrioolide funktsioonid rakutsüklis, tsentrioolide tsükkel. Tsentrioolid on seotud mitootilise värtna organiseerimisega ning tsütokineesi lõpetamisega. Tsentriool on väike silindrikujuline organell mille seina moodustavad 9 kolmekaupa agregeerunud mikrotorukest. 150. Defineerige tsentrosoom, tsentromeer, kinetohoor. Tsentrosoom on valgulist materjali sisaldav piirkond, mis ümbritseb tsentrioole ja tagab interfaasis mikrotorukeste moodustumise. Tsentromeer on kromosoomi DNA järjestus, millele seostub kinetohoor. Seob omavahel õdekromatiidid. Kinetohoor on valguline kompleks, mis seostub kromatiidi tsentromeeri piirkonnaga ja tagab mikrotorukeste seostumise kromatiidi külge mitoosivärtna moodustumisel. 151
G+ : Kuni 40 kihti peptidoglükaani, ühtlane struktuur, peptiidahelad, peptidoglükaaniga(muraamhappega) on kovalentselt seotud teihhuuhapped (olulised antigeensed determinandid. (E. Coli) G- : Mitmekihiline, peptidoglükaankiht on 1-3 kihiline, tetrapeptiidid seotud otse, rakukestas on lisakiht välismembraan, milles on spetsiiifiliseks komponendiks lipopolüsahhariidid, välismembraanis ka proiinid(valgud, mis on agregeerunud moodustama hüdrofiilseid poore), välismembraani ja rakumembraani vaheline ruum periplasma. (Bacillus Polymyxa) 2. Prokarüoodi raku ja genoomi suurus ~2 8µm Prokarüootses rakus esineb ainult üks rõngaskromosoom. Geenide hulk 400 4000. 3. Eukarüoodi raku ja genoomi suurus ~20 µm Geenide hulk 10 000 40 000. Suurem osa DNA-st mittekodeeriv. 4. Nimetage prokarüoodi (eubakter) ja eukarüoodi raku peamised erinevused
1. Monopolaarne monotrihh (Caulobacter, Vibrio) 2. Monopolaarne polütrihh (lofotrihh, Pseudomona, Thiospirillum, Helicobacter) 3. Bipolaarne monotrihh (Wolinella succinogenes) 4. Peritrihh (E. coli, Salmonella typhimurium, Bacillus subtilis, Erwinia carotovora, Proteus mirabilis) 5. Bipolaarne polütrihh (Halobacterium halobiom, Spirillum) Viburi valgud Viburi niit koosneb valgust- flagelliinist. Niidi keskel on kanal. Kokku on viburiniidis ca 20000 helikaalselt agregeerunud flagelliini monomeeri. Arhedel on viburivalgud glükosüülitud. Viburivalk on happeline - Asp ja Glu rikas. Flagelliin on struktuurilt sarnane lihaste müosiiniga. Viburi niit on konksu abil ühendatud basaalkeha külge (viburi mootor). Basaalkeha koosneb valgulistest ketastest, mis ümbritsevad telgvarrast. Viburi basaalkeha kettaid tähistatakse nende lookuste järgi, kus nad paiknevad. MS (membraanne-
transkribeeritavad normaalsel temperatuuril, P3 HS vastusena (E kontrolli all) ja P5 on reguleeritud cAMP poolt. Promootorite P4 ja P3 ees on DnaA boxid. 61 32 konkurents 70-ga 32 konkureerib 70-ga. Kuna 32 ja 70 on RNA polümeraasi suhtes ühesuguse afiinsusega, toimub regulatsioon faktorite aktiivsuse kaudu. 70 on RNA polümeraasi subühikutest temperatuurile kõige tundlikum. Temperatuuritõusu tagajärjel on 70 inaktiivne, agregeerunud vormis. Nii saab RNA polümeraasi apoensüüm siduda teist faktorit. DnaJ, DnaK ja GrpE moodustavad 32-ga stabiilse kompleksi, eksponeerides teda proteaasidele (membraanseoseline ATP-sõltuv proteaas FtsH e. HflB ning tsütoplasmaatilised ClpAP, SslVU ja Lon). HS tagajärjel on shaperonid hõivatud denatureerunud valkude kõrvaldamisega rakust. Selle tagajärjel vabaneb 32 shaperonidest ning seondub RNA polümeraasi apoensüümiga, olles seal paremini kaitstud ka proteaaside eest
annaabi.ee 
