meditsiinipreemia Valkude kvaternaarstruktuur Moodustub individuaalsete polüpeptiidahelate subühikute omavahelisel assotsiatsioonil Subühikute assotsiatsioon enamast mittekovalentne Monomeerne, oligomeerne, multimeerne valk Dimeerne, trimeerne, tertameerne jne. Kõige laiemalt on levinud dimeerid Identsed või sarnased subühikud homo: Homodimeer, homotrimeer jne. Erinevad subühikud hetero: Heterodimeer, heterotrimeer jne. Ribonuclease A (C575H901N171O193S12)
Samuti on vaja B raku aktivatsiooniks kahte signaali. TI annab antigeeni seondumine mõlemad signaalid, TD annab antigeeniga seondumine ainult 1 signaali ja teise signaali jaoks on vaja T-rakku. Esimeseks signaaliks on seondumine B raku retseptoriga BCRga. Antigeen seondub IgM ja IgD pinnaretseptoritega B raku pinnal. B raku retseptor saadab signaali rakku edasi, kui kaks või enam molekuli on kõrvuti toodud, ehk siis cross-linked. Ig ja Ig moodustavad heterodimeer. Interakteeruvad IgM,IgD jt.trans membraanse osadega. Need kaks molekuli koos moodustavad B lümfotsüüt antigeeni kompleksi. Nende tsütopl.sabades on ITAM moodulid (türosiinid). Ig ja Ig-ga seonduvad src family kinaasid (Fyn, Blk, Lck). Aktiveerumine toimub läbi fosforüleerumise, loovad koha syc kinaasile, seejärel toimub syc aktivatsioon- ja käivitub rakusisene signaalide kaskaad. B-raku ko-retseptor koosneb kolmest membraanseotust valgust: TAPA-1 (CD81), CR2 (CD21),ja CD19.
(HU-HU) Lrp + + - AT-rikas 18 kDa Homodimeer Muk - + - Pole 175 kDa Homodiemeer B teada Fis + + + AT-rikas 11 kDa homodimeer H- - + - AT-rikas 15 kDa Homodimeer või NS heterodimeer StpA-ga IHF - - + AT-rikas 11 kDa Heterodimeer (IHF-IHF) Dps - - - Pole 19 kDa Monomeer või teada dodekameer StpA - + - AT-rikas 15 kDa Homodimeer või
väga kiirelt tuuma, aga mitu rada on ja iga raja tugevust tuunitakse. NF-kappaB nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells, nagu B rakkude kappa kerge ahela võimandav faktor, tegelikult on aga praktiliselt kõikide rakkudes, mitte ainult B rakkudes. Sisse lülitavad, käivitavad selle raja - Stress, tsütokiinid, vabad radikaalid, ultraviolettkiirgus, erinevad antigeenid, tol retseptorid, raku sees olevad retseporitd. Heterodimeer - Rel ja p50 TNF -toime TNF- tapab kasvajarakke, sai sealt selle nime, aga organismis, et kasvajaid tapaks siis vaja sellist kogust et tapab ka organismi. Kui on vähe – mõned üksikud rakud sekreteerivad, plasmas konts madal – muutused veresoonte läbilaskvuses, teatud adhesiooni molkulide eksrprseerumine, tatud neutrofiilide aktiv makrofaagide aktv – lokaalselt Rohkem- jõuab ka teisetsse oragnitesse – luuüdis käivitab vererakkude kiirema küpsemise, maksa
complex). T-lümfotsüüdi retseptor ei tunne antigeeni-koesobivusantigeeni kompleksi ära üksi. Püsiva ühenduse saamiseks T-lümfotsüüdi ja antigeeni esitleva raku või T-lümfotsüüdi ja märklaudraku vahel on vajalikud veel mitu T-raku pinnal olevat lisavalku. Iga T-rakk kannab oma pinnal ~30 000 identset antigeen-retseptorit (TCR). Iga T-raku retseptor on heterodimeer, mis koosneb kahest transmembraansest glükoproteiinahelast (α/β või γ/δ). Retseptoril eristatakse: Ekstatsellulaarosa hinge regiooni transmembraanset osa lühikest tsütoplasmaatiline osa Retseptori ekstatsellulaarosa koosneb kahest variaabelsest regioonist/domeenist (N-terminuse pool, T- raku membraanist kaugemal) ja kahest kontantsest regioonist/domeenist (T-raku membraanile lähemal)
Transkriptsiooni regulaatorid sisaldavad struktuurseid motiive, mis n.ö. loevad DNA nukleotiidseid järjestusi Seostumine nukleosoomides olevale DNA-le on nõrgem kui ‘paljale’ DNA-le (transkriptsiooni regulaatori seostumine DNA-le sõltub DNA kättesaadavusest) Transkriptsiooni regulaator seostub tugevalt kui ta on pidevalt dimeerses või heterodimeerses olekus Transkriptsiooni regulaator seostub nõrgemalt kui ta ei ole pidevalt dimeer või heterodimeer Cis-regulatoorsed järjestused – mittekodeerivad, peavad asuma samas kromosoomis, kus geenid, mida nad reguleerivad; sinna seostuvad transkriptsiooni regulatoorid (iga regulaator tunneb ära oma cis-regulatoorse järjestuse);— Iga geeni transkriptsiooni kontrollitakse kindla kogumi cis-regulatoorsete järjestustega trans-regulatoorsed järjestused – asuvad erinevas kromosoomis 50. Transkriptsiooni regulaatorid, kui transkriptsiooni kontrollivad
Kinesiin. Mootorvalk liigub tsütoskeleti valgu – otsa suunas. Millise mootorvalguga võiks olla tegemist. Düeniin. 10 ATP hüdrolüüs võimaldab müosiinil II liikuda 50-100nm kaugusele Mikrotorukesed Aktiini ja tubuliini võrdlus (mille poolest erinevad ja mille poolest sarnanevad) - Mõlemate filamentsed vormid koosnevad monomeeridest - Tubuliini polümeer on torujas, aktiini polümeer alfa-heeliksi sarnase struktuuriga - Tubuliini on heterodimeer, subühikuks alfa ja beeta tubuliin. Aktiini monomeer koosneb ühest subühikust. - Tubuliini iga subühik seob ühe GTP, kokku siis kaks. Aktiin seob ATP-d. - Mõlemad on polaarse ehitusega. Aktiinil + ja – ots, tubuliini puhul alfa ja beeta ots. Mis on treadmilling ja millistes tingimustes toimub On ühe konkreetse subühiku liikumine +otsast –otsa poole läbi filamendi.Toimub juhul kui subühikud liituvad + otsale sama kiiresti kui eemalduvad – otsalt.
Kuna mõlemad retseptoritel on väga lühike tsütoplasmaatiline domään, peavad nad assotsieeruma invariantsete signaali ülekande molekulidega, selleks, et genereerida rakusisene signaal. IgIg BCR jaoks ja CD3 TCR jaoks. BCR on raske ahel ja kappa või lambda ahel. BCR retseptoriks on antikeha. Multivalentsed antigeenid saavad otse seonduda BCR ja sellega põhjustada BCR cross-linki, mis tagab signaali ülekande. TCR on alfa, beeta või gamma ja delta ahelad. TCR on heterodimeer. Kaks ahelat on disulfiid sidemetega seotud t raku plasmamembraani külge. Geneetilise mitmekesisus- t rakud ei läbi somaatilist mutatsiooni ega Class switching, ei genereerita V(D)J rekombinastiooniga. Koretseptoritena kasutav BCR CD19 ja CD21 ja TCR CD4 ha CD8. B rakud ja T rakud tunnevad ära erinevad substante kui antigeeni. B rakk kasutab siis raku pinnal seotud immunoglobuliini kui retseptorit. BCR tunneb ära natiivse antigeeni. TCR tunneb peptide MHC kompleksi ära
Kinesiin. Mootorvalk liigub tsütoskeleti valgu otsa suunas. Millise mootorvalguga võiks olla tegemist. Düeniin. 10 ATP hüdrolüüs võimaldab müosiinil II liikuda 50-100nm kaugusele Mikrotorukesed Aktiini ja tubuliini võrdlus (mille poolest erinevad ja mille poolest sarnanevad) - Mõlemate filamentsed vormid koosnevad monomeeridest - Tubuliini polümeer on torujas, aktiini polümeer alfa-heeliksi sarnase struktuuriga - Tubuliini on heterodimeer, subühikuks alfa ja beeta tubuliin. Aktiini monomeer koosneb ühest subühikust. - Tubuliini iga subühik seob ühe GTP, kokku siis kaks. Aktiin seob ATP-d. - Mõlemad on polaarse ehitusega. Aktiinil + ja ots, tubuliini puhul alfa ja beeta ots. Mis on treadmilling ja millistes tingimustes toimub 25
Termin enhancesome (võimendi) tähistab suurt tuumset valk-kompleksi, mis assambleerub suurest hulgast transkriptsiooni faktoritest nende kooperatiivse sidumise tulemusena enhancer'il asuvatele regulaatorelementidele. 11 Heterodimeersed Jun/ATF-2, IRF-3, IRF-7, and NF-B (p50 ja p65 heterodimeer) seovad ~70-bp enhancer's neljale elemendile. TFite kooperatiivset sidumist võimendab HMGI, mis on sidunud DNA väiksesse vakku. cJun, ATF-2, p50, and p65 seovad kõik ka nende naabruses istuvat HMGd. Enhancer'i paindumine (bending), mis toimub HMGIga interaktsiooni tulemusena, on enhancesome' moodustamise eelduseks. Erinevad DNAd-painutavad (bending) valgud käituvad teistel enhancer'itel sarnaselt MGI seondub DNA väiksesse vakku