Geeniperekonnad. Rühma duplitseeritud geene, mis kodeerivad aminohappejärjestuselt sarnaseid aga mitte identseid valke, nimetatakse geeniperekonnaks. Mittefunktsionaalne DNA. Ei kodeeri mRNAd ega ühtki muud organismile vajalikku RNAd ning ei oma mingit muud funktsionaalset tähtsust. Korduvjärjestused. Jaotuvad lihtjärjestusega DNAks (tsentromeersed alad) ja mõõdukalt korduvateks DNA järjestusteks (mobiilsed DNA elemendid). Tandemid. Tandeemselt korduvad geenid kodeerivad rRNAsid, tRNAsid ja histoone. Neid eristavad duplitseerunud geeniperekondadest identsed või peaaegu identsed valgulised või funktsionaalsed RNA-produktid. Tandemkordusega geenide paljusus on oluline, kuna rakul on vaja nende produkte suures koopiaarvus. Hajuskordused. Enamlevinud korduv-DNA vorm, nende hulgas on transposoonid, retrotransposoonid, mitte- LTR transposoonid ja protsessitud pseudogeenid. DNA "sõrmejäljed" ja nende määramine. Tekivad lihtsa järjestusega DNA järjestuste pikkuste erinevustest
Omadused 1. Endospoor on väga termoresistentne. Termoresistentsus tuleneb spoori väga väikesest veesisaldusest ja temas sisalduvast dipikoliinhappest. Spooride hävitamiseks tuleb söötmeid kuumutada autoklaavis 121oC juures. Kui autoklaavi ei ole, aitab tündaliseerimine 2. Spoor talub hästi kiirgust, kuivust ja toksikante. 3. Spoori metaboolne aktiivsus on madal. 4. Makromolekulide sünteesi spooris ei toimu. 5. Spoor sisaldab ühe koopia kromosoomi, ribosoome, tRNAsid ja osasid ensüüme (glükolüüsi ensüümid ja katalaas näiteks), varuvalke. Spooris on ka rohkesti fosfoglütseraati (PGA), mis on energeetiliseks varuaineks. 6. Spooris on rohkesti dipikoliinhapet. See esineb spooris Ca soolana ja sünteesitakse diaminopimeelhappest. Mutandid, kes ei sünteesi dipikoliinhapet, on kuumatundlikud. 7. Paks spoorikest koosneb peamiselt valgust (on
Talub hästi kuivust, kiirgust, toksikante Metaboolne aktiivsus on madal mRNA sisaldus on madal Makromolekulide sünteesi ei toimu Korteks sisaldab hõredalt kokkuõmmeldud peptidoglükaani Paks mitmekihiline kest · Koosneb valgust · Sisaldab sahhariide · Vähendab tundlikust lüsotsüümile ja peroksiididele Sisaldab rohkesti dipikoliinhapet · Vähendab kuumatundlikust Sisaldab ühe koopia kromosoomist, ribosoome, tRNAsid, osasid ensüüme ja varuvalke · Glükoosiensüümid on vajalikud ATP sünteesiks · Spooris on ka rohkesti fosforglütseraati, mis on energeetiliseks varuaineks Spoor on termoresistentne · Sest et on väike veesisaldus · Spooride hävitamiseks tuleb neid kuumutada 121°C juures autoklaavis · Kuiv kuumus kahjustab spoori DNA-d, niiske kuumus valke o Spooride säilumine: Võivad säiluda väga kaua, kui on kaitstud kiirguse eest
laterosporus. Endospoori omadused: 1. Endospoor on väga termoresistentne. Termoresistentsus tuleneb spoori väga väikesest veesisaldusest ja temas sisalduvast dipikoliinhappest. Spooride hävitamiseks tuleb söötmeid kuumutada autoklaavis 121oC juures. 2. Spoor talub hästi kiirgust, kuivust ja toksikante. 3. Spoori metaboolne aktiivsus on madal. 4. Spoori mRNA sisaldus on madal. 5. Makromolekulide sünteesi spooris ei toimu. 6. Spoor sisaldab ühe koopia kromosoomi, ribosoome, tRNAsid ja osasid ensüüme (glükolüüsiensüümid ja katalaas näiteks), varuvalke. Spooris on ka rohkesti fosfoglütseraati (PGA), mis on energeetiliseks varuaineks (hõlpsasti konverteeritav ATP- ks). Glükolüüsiensüümid on vajalikud ATP sünteesiks PGA arvel. 7. Spooris on rohkesti dipikoliinhapet. See esineb spooris Ca soolana ja sünteesitakse diaminopimeelhappest. Mutandid, kes ei sünteesi dipikoliinhapet, on kuumatundlikud. 8
vaheaegadega korduvkuumutamine. Esimese kuumutamisega 100 kraadi juures hävitatakse vegetatiivsed rakud ja ergutatakse endospoorid idanema, seejärel hoitakse materjali soojas, et idanemine oleks täielik ning siis keedetakse uuesti. 2. Talub hästi kiirgust, kuivust ja toksikante 3. Metaboolne aktiivsus on madal 4. mRNA sisaldus on madal 5. Makromolekulide sünteesi ei toimu 6. Sisaldab ühe koopia kromosoomi, ribosoome, tRNAsid ja mõningaid valke. Rohkesti fosfoglütseraati, mis on energeetiliseks varuaineks. 7. Spooris on rohkesti dipikoliinhapet, mida sünteesitakse diaminopimeelhappest. 8. Paks spoorikest koosneb peamiselt valgust, on ka sahhariide. 9. Korteks sisaldab hõredalt kokku õmmeldud peptidoglükaani, teihhuhappeid seal pole. 58. Kui kaua säiluvad endospoorid idanemisvõimelised ja millest säilumine sõltub? Võivad säiluda idanemisvõimelised väga kaua
1. Endospoor on väga termoresistentne. Termoresistentsus tuleneb spoori väga väikesest veesisaldusest ja temas sisalduvast dipikoliinhappest. Spooride hävitamiseks tuleb söötmeid kuumutada autoklaavis 121oC juures. Kui autoklaavi ei ole, aitab tündaliseerimine 2. Spoor talub hästi kiirgust, kuivust ja toksikante. 3. Spoori metaboolne aktiivsus on madal. 4. Makromolekulide sünteesi spooris ei toimu. 5. Spoor sisaldab ühe koopia kromosoomi, ribosoome, tRNAsid ja osasid ensüüme (glükolüüsi ensüümid ja katalaas näiteks), varuvalke. Spooris on ka rohkesti fosfoglütseraati (PGA), mis on energeetiliseks varuaineks. 6. Spooris on rohkesti dipikoliinhapet. See esineb spooris Ca soolana ja sünteesitakse diaminopimeelhappest. Mutandid, kes ei sünteesi dipikoliinhapet, on kuumatundlikud. 7. Paks spoorikest koosneb peamiselt valgust (on proliini ja tsüsteiinirikas). Kestas on ka sahhariide
polümeraasikompleksi sisaldavad kahte suurt ja kahte väiksemat kompleksi valku, milledel on suur homoloogia E. coli RNA polümeraasi , ' ja alaühikutega. Lisaks sisaldavad kõik 3 kompleksi ka hulgaliselt väiksemaid alaühikuid. Mõnesid väiksemaid alaühikuid need kompleksid jagavad, mõned on unikaalsed. RNA polümeraas I sünteesib ainult pre-rRNAd. RNA polümeraas II sünteesib mRNAsid and mõnesid väikseid tuuma RNAsid, mis osalevad mRNA splaisingus. RNA polümeraas III sünteesib tRNAsid, 5S rRNAsid, and mitmeid suhteliselt lühikesi stabiilseid RNAsid (U6, splaisingus; 7S, transpordis). Trankriptsiooni initsiatsiooni käigus fosforüülitakse RNA polümeraas II suurima alaühiku karboksüterminaalne domään (CTD), korduv heptapeptiidne järjestus, mis jääb fosforüülituks kuni matriitsilt transkriptsiooni lõpuni. Sarnaselt bakteri RNA polümeraasiga, initseerib RNA
geenid mis on tekkinud geeniduplikatsiooni tulemusena sama liigi piires Kas EF-Tu/eEF1A/aEF1A on ortoloogid/paraloogid IF2/eIF5B/aIF5B on ortoloogid/paraloogid EF-G/eEF2/aEF2 on ortoloogid/paraloogid RF3/eRF3 on ortoloogid/paraloogid Järgmiste valkude funktsioon 26 EF-Tu/eEF1A/aEF1A-Toimetab aa-tRNAsid ribosoomi. aa-tRNA*EF-Tu*GTP on tuntud kui kolmikkompleks EF-G/eEF2/aEF2- EF-G'd kutsutakse ka "translokaasiks". Katalüüsib pep-tRNA liikumist A sidist P saiti. Samas liiguvad ka P saidis olev deats-tRNA E saiti ja seal olnud deats-tRNA lahkub ribosoomist. A sait vabaneb, valmis uueks koodoni äratundmiseks. SelB/eSelB/aSelB- Transpordib selenocysteinyl-tRNA ribosoomi. eIF2γ/aIF2γ -Arhetes ja eukarüootides viib fMet-tRNAfMet seondumist läbi
Botulismitoksiin, selle toime, ohtlikkus ja kasutamine. Kuidas on võimalik hävitada endospoore? Endospooritaolised säilitus ja paljunemisrakud: tsüstid, aktinomütseetide ja hallitusseente koniidid, tsüanobakterite akineedid, müksobakterite müksospoorid. Endospoori omadused o Termoresistentne o Spoor talub hästi kiirgust, kuivust ja toksikante o Makromolekulide sünteesi spooris ei toimu o Spoor sisaldab ühe koopia kromosoomi, ribosoome, tRNAsid ja mõningaid valke o Spooris on rohkesti dipikoliinhapet o Paks spoorikest koosneb peamiselt valgust o Korteks sisaldab hõredalt kokku õmmeldud peptidoglükaani S Tunnus Vegetatiivne rakk Endospoor p
• B: ekstsentrilise nukleokapsiidiga küps virion (nt. hiire rinnanäärme kasvaja viirus) • C: tsentraalselt paiknev nukleokapsiid • D: nukleokapsiid on silinderjas. Struktuur. Retroviirused on enamvähem kerajad, diameeter 80…120 nm. Ümbrises on viiruse glükoproteiinid, ümbris saadakse pungumisel. Ümbris ümbritseb kaht identset koopiat +RNAd sisaldavat nukleokapsiidi. Virionis on ka 10…50 koopiat pöördtranskriptaasi, integraasi ja 2 rakulist tRNAd. Neid tRNAsid kasutatab RT praimerina. Genoomil on 5’ cap ja 3’ polüA saba. Genoom sarnaneb küll mRNAle, kuid ei ole iseseisvalt infektsioosne. Lihtsate retroviiruste genoom koosneb 3 peamisest geenist, mis kodeerivad polüproteiine järgmiste ensüüm- ja struktuurvalkude tarvis: • Gag: grupispetsiifiline antigeen. Kapsiidi, maatriksi ja nukleiinhapete seostusvalgud. • Pol: polümeraas, proteaas, integraas. • Env: ümbrise glükoproteiinid.
31 Seejärel hoitakse materjali soojas, et idanemine oleks täielik ning siis keedetakse uuesti. Keetmine hävitab spooride idanemisel moodustunud vegetatiivsed rakud. 2. Talub hästi kiirgust, kuivust ja toksikante. 3. Metaboolne aktiivsus madal. 4. Makromolekulide sünteesi ei toimu spooris. 5. Spoor sisaldab ühe koopia kromosoomi, ribosoome, tRNAsid ja mõnigaid valke, näiteks varuvalgud ja mõned glükolüüsiensüümid. Kromosoom on valkudega seotud, see stabiliseerib DNAd. Spooris on ka AMPd ja ADPd (need on stabiilsemad kui ATP) ja rohkesti fosfoglütseraati (PGA), mis on energeetiliseks varuaineks nende arvel sünteesitakse ATPd, mida on spoori idanemisel vaja. 6. Palju dipikoliinhapet. See esineb spooris Ca soolana ja sünteesitakse diaminopimeelhappest (kuulub peptidoglükaani)
leutsiini (leutsiini väikse sagedusega) – erakordne. Taimemitokondris on UGK (erinev inimesest): Stop → UAA, UAG, AGA, AGG Met → AUA, UAU Ile → AUC, GAU, AUU DNA – tRNA – mRNA – valk A T T C T A C G A A G A T G T C G A T C G A T C T A T T C DNA U A A G A U G C U U C U A C A G C U A G C U A G A U AA G mRNA (siit loed vastavaid AHsid) A UU C U A C G AA G A U G U C G A U C G A U C U A UU G tRNA tRNAde standardiseerimine – sünteesitakse väiksel arvul tRNAsid ja nii säästetakse energiat. Ohtralt avalduvad geenid kasutavad väikest arvu koodoneid. Rakk saab vähema energiavaruga hakkama. Koodonite järgnevus pole juhuslik ja 3. täht sõltub järgmisest koodonist. Ribosoomis tunneb tRNA antikoodon ära koodoni. rRNA nukleotiid kompab väikeses vaos aluspaari geomeetriat. 2. tähe äratundmine – tekib võrgustik, palju vesiniksidemeid 3. tähe äratundmine – „wobble“ lubatud, aluspaari geomeetriat ei kontrollita,
annaabi.ee 
