Valgu molekulis on peptiidsidemetega ühendatud sadu või tuhandeid aminohappejääke. (Viikmaa, Hein 2003: 33) 4 2. VALKUDE STRUKTUURITASEMED 2.1. Primaarstruktuur Primaarstruktuuris seob aminohappejääke polüpeptiidahelaks kovalentne peptiidside. Paljud valgud sisaldavad ka kahe tsüsteiinjäägi baasil formeerunud kovalentseid disulfiidsidemeid (disulfiidsildu), mis on kas ahelasisesed või ahelatevahelised. Disulfiidsidemed esinevad enamikes sekreteeritavates ja membraansetes valkudes. Primaarstruktuur on aluseks valkude põhifunktsioonidele. (Zilmer jt 2001: 44-46) Joonis 2.1 Primaarstruktuuri mudel. 2.2. Sekundaarstruktuur Sekundaarstruktuur on peamiselt vesiniksideme abil fikseeritudruumikujund. Selle põhivormideks on -heeliks ja -struktuur. -heeliksit iseloomustab polüpeptiidahela paremale pöörduv helitaseerunud konformatsioon ja vesiniksidemete rohkus. -struktuuri
Prealbumiin: 0,1-0,42 g/l Albumiin: 34-50 g/l Funktsioonid: · kaitsefunktsioon (immuuboglobuliinid) · ensümaatiline funktsioon · (nõrk) puhver, pH aäilitamine · proteaaside inhibeerimne (hoiab aktiivsust tasakaalus, väldib nende liigset valkude lõhustamist) · antioksüdatiivne funktsioon · transport- albumiinid. -globuliine struktuur. Molekulil on kaks kergahelat (L-ahel) ja kaks raskahelat (H-ahel). Molekuli stabiliseerivad ahelatevahelised disulfiidsillad ja hüdrofoobsed sidemed. Ahelatel on varieeruvad ja konstantsed regioonid. Fab on antigeeni sidumise regioon, Fc interakteerub immuunsüsteemi teise konplemendiga. ,,Hing" lubab raskahelatel igas suunas käänduda. Di-, tri- ja pentameersed vormid koosnevad 2,3 ja 5-st monomeerist ja seondavast ahelast.
piiratult. Piiratud pundumisel võib polümeerist ekstraheeruda suhteliselt madalmolekulaarne fraktsioon. See viib piirilise pundumise vähenemisele. Piiramatul pundumisel polümeer lõpuks lahustub. Puudumine sõltub märgatavalt temperatuurist. Temperatuuri tõustes suureneb difusiooni kiirus ja järelikult ka puudumise kiirus. Teiselt poolt suureneb ka makromolekulide soojusliikumine. Selle tulemusena võivad katkeda ahelatevahelised sidemed ja piiratud pundumine läheb üle piiramata pundumiseks. Temperatuuri, kus piiratud pundumine läheb üle piiramata pundumiseks, nimetatakse pundumise kriitiliseks temperatuuriks. 20 13. Mis on pundumisaste ja kuidas seda määratakse? Pundumise iseloomustamiseks kasutatakse puudumisastet, mille all mõistetakse vedelikuhulka grammides, mis neeldub teatud pundumistasemel ja temperatuuril ühes grammis polümeeris. kus g1 - polümeeri kaal enne pundumist,
polüpropüleen, polüamiid, polüetüleen-tereftalaat (polüester). 2) Vedelkristalsed polümeerid: neis esinevad vedelas olekus korrastatud alad: ühedimensionaalne või kahedimensionaalne. Vedelkristalses olekus on näiteks täisaromaatsed polüestrid ja täisaromaatsed polüamiidid. 3) Termoaktiivsed polümeerid kõvastuvad kuumenemisel, kuid ei pehmene enne hävimist. Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised ristsidemed, mis enam ei katke. Näiteks reaktoplastid (fenool-formaldehüüdvaik ja melamiin-formaldehüüdvaik), kummid (saadakse elastomeeride vulkaniseerimisel). 4) Elastomeeridel on väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata. Lai elastse oleku piirkond ja suur elastne deformatsioon (väike elastsusmoodul). Pinge eemaldamisel taastavad oma esialgse pikkuse. Tähtsamad
korduvalt kuumutamisel pehmenevad ja jahtudes tahkestuvad. Võivad olla ja poolkristallilised Vedelkristalsed polümeerid: esinevad vedelas olekus korrastatud alad. Korrastus võib olla ühe- dimensionaalne või kahedimensionaalne. Vedelkristalses olekus võivad olla näiteks täisaromaatsed polüestrid ja täisaromaatsed polüamiidid.Termoreaktiivsed polümeerid: kõvastuvad kuumutamisel ja enam ei pehmene enne hävimist. Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised rist-sidemed, mis ei katke. Siia kuuluvad tõelised termoreaktiivid ehk reaktoplastid, nagu fenool-formaldehüüdvaik ja melamiini- formaldehüüdvaik. Elastomeerid: väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata. Lai elastne oleku piirkond ja suur elastne deformatsioon. Elastsusmoodul muutub mehaanilise pinge muutumisel. Pinge eemaldamisel taastavad nad oma esialgse pikkuse. Kummide termoreaktiivsus alvadub vastupanu kuumutamisel
polüstürool, polüvinüülkloriid) ja poolkristallilised (polüetüleen, polüpropüleen, polüamiidid jt). Vedelkristalsed polümeerid: esinevad vedelas olekus korrastatud alad. Korrastus võib olla ühedimensionaalne või kahedimensionaalne. Vedelkristalses olekus võivad olla näiteks täisaromaatsed polüestrid ja täisaromaatsed polüamiidid. Termoreaktiivsed polümeerid: kõvastuvad kuumutamisel ja enam ei pehmene enne hävimist. Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised ristsidemed, mis ei katke. Siia kuuluvad tõelised termoreaktiivid ehk reaktoplastid, nagu fenool-formaldehüüdvaik ja melamiini- formaldehüüdvaik. Termo polü hulka kuuluvad ka kummid, mis saadakse elastomeeride vulkaniseerimisel. Elastomeerid: väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata. Lai elastne oleku piirkond ja suur elastne deformatsioon. Elastsusmoodul muutub mehaanilise pinge muutumisel. Pinge eemaldamisel taastavad nad oma esialgse pikkuse.
moodustub ribosoomis nende vahele kovalentne side, mida nimetatakse peptiidsidemeks. Valgu molekulis on peptiidsidemetega ühendatud sadu või tuhandeid aminohappejääke (Viikmaa, Hein 2003: 33). 1.1.3. Valkude struktuuritasemed Primaarstruktuuris seob aminohappejääke polüpeptiidahelaks kovalentne peptiidside. Paljud valgud sisaldavad ka kahe tsüsteiinjäägi baasil formeerunud kovalentseid disulfiidsidemeid (disulfiidsildu), mis on kas ahelasisesed või ahelatevahelised. Disulfiidsidemed esinevad enamikes sekreteeritavates ja membraansetes valkudes. Primaarstruktuur on aluseks valkude põhifunktsioonidele. (Zilmer jt 2001: 44-46). Sekundaarstruktuur on peamiselt vesiniksideme abil fikseeritud ruumikujund. Selle põhivormideks on -heeliks ja -struktuur. -heeliksit 5 iseloomustab polüpeptiidahela paremale pöörduv helitaseerunud konformatsioon ja vesiniksidemete rohkus
Joon.1.41 Sõltuvalt sellest kas skeemitehnilisest lahendusest tulenevalt on tagasisdepinge värdeline väljundpingega (joon.1.40) või võrdeline väljundvooluga (joon.1.41). Peale toodud liigituse liigitatakse veel tagasisidet tahtlikuks ja parasiitseks. Tahtlik tagasiside on loodud seadme projekteerimisel, eesmärgiga mõjutada soovikohaselt võimendi omadusi. Parasiitne tagasiside tekib seadmeis vastu soovile, parasiitahelate kaudu, milleks võivad olla ahelatevahelised parasiitmahtuvused, trafode puisteinduktiivsused ja toiteallika sisetakistus. Parasiitne tagasiside mõjutab samuti võimendi omadusi, kuid see võib sageli olla ettenägematu ja ebasoovitava suunaga, kuna ta avaldub ja ilmneb alles seadme valmimisel. Tagasiside kasutuse eesmärgiks on üldiselt võimendi omaduste muutmine vastavalt soovile. Vaatame tema toimet võimendi võimendustegurile . Negatiivse tagasiside korral:
Võimenduse langus negatiivse tagasiside korral kompenseeritakse võimenduse suurendamisega eelvõimendis, kuna seal väikese signaali amplituudi tõttu praktiliselt mittelineaarmoonutusi ei teki. Peale eespool toodud liigituste liigitatakse tagasisidet veel tahtlikuks ja parasiitseks. Tahtlik tagasiside on loodud seadme projekteerimisel, eesmärgiga mõjutada soovikohaselt võimendi omadusi. Parasiitne e. soovimatu tagasiside tekib lülitustes parasiitahelate kaudu, milleks võivad olla ahelatevahelised parasiitmahtuvused, trafode puisteinduktiivsused ja toiteallika sisetakistus. Ka parasiitne tagasiside mõjutab võimendi omadusi, ning see mõju võib sageli olla ettenägematu ja ebasoovitava suunaga, kuna ta avaldub alles seadme valmimisel. 6.5.3 Tagasisidelülituste praktilisi näiteid Lihtsaima negatiivse tagasiside lülituse saame, kui jätta ära ÜE-lülituse emittertakistusega paralleelselt olev kondensaator (joon.6.17).
Esinevad ka vedelkristalsed polümeerid. Neis esinevad vedelas olekus korrastatud alad. Korrastus võib olla ühedimensionaalne (nemaatilised) või kahedimensionaalne (smektilised) (joonis 8-8). Vedelkristalses olekus võivad olla näiteks täisaromaatsed polüestrid (polüarülaadid) ja täisaromaatsed polüamiidid (polüaramiidid). 8.3.2 Termoreaktiivsed polümeerid Kõvastuvad kuumutamisel ja enam ei pehmene enne hävimist (degradeerumist). Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised ristsidemed, mis enam ei katke. Termoreaktiivsete polümeeride hulka kuuluvad ka kummid, mis saadakse elastomeeride vulkaniseerimisel. Elastomeeridel on väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata. Neil on lai elastse oleku piirkond ja suur elastne deformatsioon (väike elastsusmoodul). Pinge eemaldamisel taastavad nad oma esialgse pikkuse. Kummide termoreaktiivsus avaldub vastupanus kuumutamisele (ei pehmene enne degradeerumist). Kummid saadakse
Esinevad ka vedelkristalsed polümeerid. Neis esinevad vedelas olekus korrastatud alad. Korrastus võib olla ühedimensionaalne (nemaatilised) või kahedimensionaalne (smektilised) (joonis 8-8). Vedelkristalses olekus võivad olla näiteks täisaromaatsed polüestrid (polüarülaadid) ja täisaromaatsed polüamiidid (polüaramiidid). 8.3.2 Termoreaktiivsed polümeerid Kõvastuvad kuumutamisel ja enam ei pehmene enne hävimist (degradeerumist). Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised ristsidemed, mis enam ei katke. Termoreaktiivsete polümeeride hulka kuuluvad ka kummid, mis saadakse elastomeeride vulkaniseerimisel. Elastomeeridel on väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata. Neil on lai elastse oleku piirkond ja suur elastne deformatsioon (väike elastsusmoodul). Pinge eemaldamisel taastavad nad oma esialgse pikkuse. Kummide termoreaktiivsus avaldub vastupanus kuumutamisele (ei pehmene enne degradeerumist). Kummid saadakse
Primaarstruktuur on kovalentne peptiidsidemetega seotud aminohappejääkide kindel järjestus antud valgu polüpetiidahelas(-tes) . Aminohappejääke seob polüpeptiidahelaks kovalentne peptiidside. Paljudes valkudes esineb ka kovalentseid disulfiidsidemeid (S-S sidemeid). Need tekivad endoplasmaatilises retiikulumis, esinedes nii enamikes sekreteerivates ja membraansetes valkudes. Disulfiidsidemed luuakse kahest tsüsteiinjäägist - ahelasisesed (tugevdavad primaarstruktuuri) või ahelatevahelised (aitavad siduda polüpeptiidahelaid).Peptiidsidemed ja disulfiidsidemed on kovalentsed. Valkude primaarstruktuur on molekulaaraluseks: - valkude spetsiifilisusele/mitmekesisusele - kõrgemate struktuuritasemete kujunemisele - molekulaarhaiguste patogeneesile Spetsiifilisus on valkude olulisim tunnus. See on aluseks valkude põhifunktsioonidele (katalüütiline, regulatoorne). Nt. Valguline antikeha seostub spetsiifiliselt vastava antigeeniga. Valkude spetsiifilisuses eristatakse:
olla ühedimensionaalne (nemaatilised) või kahedimensionaalne (smektilised) (vt joonis 9-8). Vedelkristalses olekus võivad olla näiteks täisaromaatsed polüestrid (polüarülaadid) ja täisaromaatsed polüamiidid (polüaramiidid). Poolkristalse, amorfse ja vedelkristalse polümeeri olekute võrdlus vedelas ja tahkes olekus on toodud joonisel 9-9. 9.3.2 Termoreaktiivsed polümeerid Kõvastuvad kuumutamisel ja enam ei pehmene enne hävimist (degradeerumist). Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised ristsidemed, mis enam ei katke. Siia kuuluvad tihedal ristsidumisel tekkivad võrestikstruktuuriga tõelised termoreaktiivid ehk reaktoplastid, nagu näiteks fenool-formaldehüüdvaik (fenoplast) ja melamiin-formaldehüüdvaik. Termoreaktiivsete polümeeride hulka kuuluvad ka kummid, mis saadakse elastomeeride vulkaniseerimisel. Elastomeeridel on väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata
(joonis 8-8). Vedelkristalses olekus võivad olla näiteks täisaromaatsed polüestrid (polüarülaadid) ja täisaromaatsed polüamiidid (polüaramiidid). Poolkristalse, amorfse ja vedelkristalse polümeeri olekute võrdlus vedelas ja tahkes olekus on toodud joonisel 8-9. 8.3.2 Termoreaktiivsed polümeerid Kõvastuvad kuumutamisel ja enam ei pehmene enne hävimist (degradeerumist). Esmakordsel kuumutamisel tekivad ahelatevahelised ristsidemed, mis enam ei katke. Siia kuuluvad tihedal ristsidumisel tekkivad võrestikstruktuuriga tõelised termoreaktiivid ehk reaktoplastid, nagu näiteks fenool-formaldehüüdvaik (fenoplast) ja melamiin- formaldehüüdvaik. Termoreaktiivsete polümeeride hulka kuuluvad ka kummid, mis saadakse elastomeeride vulkaniseerimisel. Elastomeeridel on väga paindunud, keerdunud ja pikk lineaarne ahel, mida on kerge sirgeks tõmmata. Neil on lai elastse oleku piirkond ja suur
PCR-i käigus on reaktsiooni läbi viiv ensüüm, DNA polümeraas, võimeline „tootma“ mõnesajast (tehniliselt kas või ühest) DNA molekulist miljoneid koopiaid. Sealjuures on PCR-iga võimalik uurida paarikümne kuni mitmetuhande nukleotiidi pikkuseid regioone. PCR-i tööpõhimõte – DNA „paljundamine“ toimub tsükliliselt kolmes etapis: 1) Tsükli esimeses etapis toimub DNA kaksikahelate denatureerimine – kõrge temperatuuri (95°C) toimel katkevad ahelatevahelised vesiniksidemed ja tekib 2 üheahelalist DNA molekuli; 2) Teises etapis seonduvad mõlemale tekkinud üheahelalisele DNA molekulile neile vastavad praimerid (56 °C); 3) Kolmandas etapis sünteesitakse ensüümi töötemperatuuril (~72 °C) uued DNA ahelad, kasutades lahuses olevaid vabu nukleotiide. Sellist temperatuuride tõstmise ja langetamise skeemi korratakse 30-40 korda selleks, et analüüsi jaoks sünteesitaks piisavalt DNA-d (uute ahelate süntees on eksponentsiaalne
22. 98 Sõltuvalt sellest kas skeemitehnilisest lahendusest tulenevalt on tagasisidepinge võrdeline väljundpingega (joon.7.21) või võrdeline väljundvooluga (joon.7.22). Peale toodud liigituse liigitatakse veel tagasisidet tahtlikuks ja parasiitseks. Tahtlik tagasiside on loodud seadme projekteerimisel, eesmärgiga mõjutada soovikohaselt võimendi omadusi. Parasiitne tagasiside tekib seadmeis vastu soovile, parasiitahelate kaudu, milleks võivad olla ahelatevahelised parasiitmahtuvused, trafode puisteinduktiivsused ja toiteallika sisetakistus. Parasiitne tagasiside mõjutab samuti võimendi omadusi, kuid see võib sageli olla ettenägematu ja ebasoovitava suunaga, kuna ta avaldub ja ilmneb alles seadme valmimisel. Tagasiside kasutuse eesmärgiks on üldiselt võimendi omaduste muutmine vastavalt soovile. V aatame tema toimet võimendi võimendustegurile . Negatiivse tagasiside korral
väljundpingega (joon.7.21) või võrdeline väljundvooluga (joon.7.22). Peale toodud liigituse liigitatakse veel tagasisidet tahtlikuks ja parasiitseks. Tahtlik tagasiside on loodud seadme projekteerimisel, eesmärgiga mõjutada soovikohaselt võimendi omadusi. Parasiitne 71 tagasiside tekib seadmeis vastu soovile, parasiitahelate kaudu, milleks võivad olla ahelatevahelised parasiitmahtuvused, trafode puisteinduktiivsused ja toiteallika sisetakistus. Parasiitne tagasiside mõjutab samuti võimendi omadusi, kuid see võib sageli olla ettenägematu ja ebasoovitava suunaga, kuna ta avaldub ja ilmneb alles seadme valmimisel. Tagasiside kasutuse eesmärgiks on üldiselt võimendi omaduste muutmine vastavalt soovile. V aatame tema toimet võimendi võimendustegurile . Negatiivse tagasiside korral