piirkonda - lingu, mis paiknevad vastavate õlgade otstes. tRNA molekuli otsad asuvad lähestikku, nende paardumisel tekkiv kaksikahelaline osa kannab nimetust "aktseptor- õlg", selle 3' otsa paardumata nukleotiididele liidetakse estersidemega aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg (ka TC õlg) on saanud oma nime tänu modifitseerunud nukleotiididele, mis asuvad T-lingus. Need nukleotidid on ribosüültümidiin T ja pseudouridiin . T-õla pikkus on 5 aluspaari, T-lingu pikkus varieerub harilikult 7-9 nukleotiidi ulatuses. D-õlg on saanud nime temas leiduva modifitseeritud nukleotiidi dihüdrouridiini D järgi. D-õla pikkus on harilikult 4 aluspaari, D-lingu pikkus on varieeruv. Antikoodon-õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimestki on näha, sisaldab antikoodoni ling kolmest nukleotiidist antikoodonit mis vastab mRNA koodonile. Antikoodoni lingus on alati 7 nukleotiidi.Lisaks neile võivad paljud tRNA
õlg kannab nime aktseptoorne õlg. Viimase pikendus on üheahelaline osa 3’ otsas, millele liidetakse estersidemega karbonüülradikaali kaudu aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg on saanud oma nime modifitseeritud lämmastikaluste pärast, mis asuvad T-aasas. Need alused on ribosüültümidiin (tRNA sünteesi käigus on sellel kohal harilik U nukleotiid, mis muudetakse tümidiiniks juba tRNA koosseisus nn. post- transkriptsiooniline modifikatsioon) ja pseudouridiin (ka pseudouridiin tekib transkriptsioonijärgse modifitseerimise tulemusena). Antikoodon õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimi ütleb, sisaldab antikoodon ling kolme nukleotiidist antikoodonit, mis määrab tRNA koodoni spetsiifika. D-õlg, mis koosneb tavaliselt 4 aluspaarist ja kannab D-lingu, on saanud nime dihüdrouridiinjääkide (jällegi RNA sünteesijärgne modifikatsioon). Lisaks neile sisaldavad paljud tRNA molekulid lisaõlga. Valgusünteesi regulatsioon. 1
tRNASer ja eubakterite ning organellide tRNATyr. 7 T-õla (tähistatakse ka TΨC õlg) pikkuseks on 5 bp. 7 aluse pikkune T-ling sisaldab sageli modifitseeritud lämmastikalust ribosüültümidiin (tümiin paikneb riboosi küljes; nimetatakse ka 5-metüüluridiiniks, m5U). Teiseks modifitseeritud nukleotiidiks selles piirkonnas on pseudouridiin Ψ (uratsiil on liidetud riboosi külge C5 kaudu, mitte tavapärase N1 kaudu). tRNA molekuli pikkus varieerub tavaliselt 75-85 nukleotiidini, kuigi leidub ka erandeid. tRNA nukleotiidid on nummerdatud ühtse nomenklatuuri alusel: esimene nukleotiid on 5’ otsas, antikoodoni moodustavad nukleotiidid 34, 35, 36 ja 3’ otsa konserveerunud järjestus CCA kannab numbreid 74...76 olenemata sellest, mitu nukleotiidi konkreetses tRNA molekulis on
paiknevad vastavate õlgade otstes. tRNA molekuli otsad asuvad lähestikku, nende paardumisel tekkiv kaksikahelaline osa kannab nimetust "aktseptor-õlg", selle 3' otsa paardumata nukleotiididele liidetakse estersidemega aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg on saanud oma nime tänu modifitseerunud nukleotiididele, mis asuvad T-lingus. Need nukleotidid on ribosüültümidiin T ja pseudouridiin . T-õla pikkus on 5 aluspaari, T-lingu pikkus varieerub harilikult 7-9 nukleotiidi ulatuses. D-õlg on saanud nime temas leiduva modifitseeritud nukleotiidi dihüdrouridiini D järgi. D-õla pikkus on harilikult 4 aluspaari, D-lingu pikkus on varieeruv. Antikoodon-õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimestki on näha, sisaldab antikoodoni ling kolmest nukleotiidist antikoodonit mis vastab mRNA koodonile. Antikoodoni lingus on alati 7 nukleotiidi. Lisaks neile võivad paljud tRNA
paiknevad vastavate õlgade otstes. tRNA molekuli otsad asuvad lähestikku, nende paardumisel tekkiv kaksikahelaline osa kannab nimetust "aktseptor-õlg", selle 3' otsa paardumata nukleotiididele liidetakse estersidemega aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg on saanud oma nime tänu modifitseerunud nukleotiididele, mis asuvad T-lingus. Need nukleotidid on ribosüültümidiin T ja pseudouridiin . T-õla pikkus on 5 aluspaari, T-lingu pikkus varieerub harilikult 7-9 nukleotiidi ulatuses. D-õlg on saanud nime temas leiduva modifitseeritud nukleotiidi dihüdrouridiini D järgi. D-õla pikkus on harilikult 4 aluspaari, D-lingu pikkus on varieeruv. Antikoodon-õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimestki on näha, sisaldab antikoodoni ling kolmest nukleotiidist antikoodonit mis vastab mRNA koodonile. Antikoodoni lingus on alati 7 nukleotiidi. Lisaks neile võivad paljud tRNA
paiknevad vastavate õlgade otstes. tRNA molekuli otsad asuvad lähestikku, nende paardumisel tekkiv kaksikahelaline osa kannab nimetust "aktseptor-õlg", selle 3' otsa paardumata nukleotiididele liidetakse estersidemega aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg on saanud oma nime tänu modifitseerunud nukleotiididele, mis asuvad T-lingus. Need nukleotidid on ribosüültümidiin T ja pseudouridiin ψ. T-õla pikkus on 5 aluspaari, T-lingu pikkus varieerub harilikult 7-9 nukleotiidi ulatuses. D-õlg on saanud nime temas leiduva modifitseeritud nukleotiidi dihüdrouridiini D järgi. D-õla pikkus on harilikult 4 aluspaari, D-lingu pikkus on varieeruv. Antikoodon-õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimestki on näha, sisaldab antikoodoni ling kolmest nukleotiidist antikoodonit mis vastab mRNA koodonile. Antikoodoni lingus on alati 7 nukleotiidi. Lisaks neile võivad paljud tRNA
paiknevad vastavate õlgade otstes. tRNA molekuli otsad asuvad lähestikku, nende paardumisel tekkiv kaksikahelaline osa kannab nimetust "aktseptor-õlg", selle 3' otsa paardumata nukleotiididele liidetakse estersidemega aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg on saanud oma nime tänu modifitseerunud nukleotiididele, mis asuvad T-lingus. Need nukleotidid on ribosüültümidiin T ja pseudouridiin . T-õla pikkus on 5 aluspaari, T-lingu pikkus varieerub harilikult 7-9 nukleotiidi ulatuses. D-õlg on saanud nime temas leiduva modifitseeritud nukleotiidi dihüdrouridiini D järgi. D-õla pikkus on harilikult 4 aluspaari, D-lingu pikkus on varieeruv. Antikoodon-õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimestki on näha, sisaldab antikoodoni ling kolmest nukleotiidist antikoodonit mis vastab mRNA koodonile. Antikoodoni lingus on alati 7 nukleotiidi. Lisaks neile võivad paljud tRNA
aminohape. Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg on saanud oma nime modifitseeritud lämmastikaluste pärast, mis asuvad T-aasas. Need alused on ribosüültümidiin (tRNA sünteesi käigus on sellel kohal harilik U nukleotiid, mis muudetakse tümidiiniks juba tRNA 8 koosseisus nn. post-transkriptsiooniline modifikatsioon) ja pseudouridiin (ka pseudouridiin tekib transkriptsioonijärgse modifitseerimise tulemusena). Antikoodon õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimi ütleb, sisaldab antikoodon ling kolme nukleotiidist antikoodonit, mis määrab tRNA koodoni spetsiifika. D-õlg, mis koosneb tavaliselt 4 aluspaarist ja kannab D-lingu, on saanud nime dihüdrouridiinjääkide (jällegi RNA sünteesijärgne modifikatsioon). Lisaks neile sisaldavad paljud tRNA molekulid lisaõlga. 2. Ribosoomid ja valgusünteesi.
(joonis 7.3). Aktseptor-õlg on 7 aluspaari pikk. T-õlg (ka T C õlg) on saanud oma nime modifitseeritud lämmastikaluste pärast, mis asuvad T-aasas. Järjestus T C on tRNA T-aasas väga laialdaselt konserveerunud. Need alused on ribosüültümidiin - T (tRNA sünteesi käigus on sellel kohal harilik U nukleotiid, mis muudetakse tümidiiniks juba tRNA koosseisus nn. post- transkriptsiooniline modifikatsioon) ja pseudouridiin - (vt. joon. 9.4) (ka pseudouridiin tekib transkriptsioonijärgse modifitseerimise tulemusena). T-õlg on 5 aluspaarine, aga T-aasa pikkus võib varieeruda 7-9 nukleotiidi ulatuses. Antikoodon õlg on alati 5 aluspaari pikk ja nagu nimi ütleb, sisaldab antikoodon ling kolme nukleotiidist antikoodonit, mis määrab tRNA koodoni spetsiifika. Antikoodon lingus on alati 7 nukleotiidi. Ka antikoodon ling sisaldab modifitseeritud nukleotiide, mida käsitleme lähemalt allpool.
Inimene - väiksem e. 40S alaüksus (33 valku + 18S rRNA); suurem e. 60S alaüksus (49 valku + 28S rRNA + 5.8S rRNA + 5S rRNA); 80S ribosoom. 125. tRNA struktuur. Lingud. CCA järjestus. tRNA: 70-80 nukleotiidi pikad (väikesed nn. lahustuvad RNA-d). Sünteesitakse pikkade prekursoritena, mida posttranskriptsiooniliselt protssesitakse (ensümaatilised valjalôikamised ja täpsustamised, metüleerimine jne.). Posttranskriptsiooniliselt moodustatakse ebaharilikke nukleotiide inosiin, pseudouridiin, 1-metuulguanosiin, ribotumidiin (ainuke T RNA-d koosseisus) jt. 3'-otsas CCA-OH järjestus, mille külge tuleb aminohape. Ristikulehe kujuline sekundaarstruktuur, kolm lingu, millest keskmine - antikodoon-ling. Tertsiaarne str-r peab omama ôiget antikodooni järjestust, tundma ara ôige aminoatsüül-tRNA-süntetaasi, seonduma ribosoomi ôiges saidis. 126. Translatsiooni initsiatsioon prokarüootidel. Initsiatsioonifaktorid. 30S ribosoomi alaüksuses on A e
Akseptorõlg – akseptorheeliks – 3’ terminaalse A külge kinnitub aminohape. D-õlg, mille otsas on D-ling. Esineb alati (D) dihüdroolidiin. D-lingu vastas on D-õlg. Akseptorõlg on 7 aluspaari (ei pea tingimata omavahel paarduma) Antikoodonõlg – antikoodonheeliks - T-õlg: (modifitseeritud lämmastikaluste pärast nimi). Lämmastikalused paiknevad T-aasas. Järjestus TU*C on tRNA T-aasas konserveerunud. Need alused on ribosüültümidiin – T ja pseudouridiin – U*. 5 aluspaariline. 16 T-ling ja vastavalt T-õlg – rohkem konserveerunud, T – tümidiin (5-metüül- ribotümidiin). tRNA-s esinevad modifitseeritud nukleosiidid: - aluspaari ei saa moodustada. Antikoodonlingus esineb sageli valesti modifitseeritud nukleosiid, et saaks kerge vaevaga paarduda mitme lämmastikalusega. Antikoodonlingus kaks nukleotiidi modifitseerimata. Ala spetsiifiline tRNA – pannakse otsa alaniin.
tRNA molekulid on väikesed, 70-80 nukleotiidi pikkused molekulid, mille sekundaarstruktuur on ristikheina lehe kujuline (kolm juuksenõelastruktuuri ja vars). Kolmemõõtmeline struktuur on L-tähe kujuline. Antikoodooni ling asub molekuli keskel. tRNA geenid kodeerivad tRNA-de prekursormolekule, mis transkriptsioonijärgselt lõigatakse lühemaks, viiakse õigesse konformatsiooni, metüleeritakse. Valmis tRNA molekulid sisaldavad ka mitmeid ebatavalisi nukleotiide nagu näiteks inosiin, pseudouridiin, dihüdrouridiin, 1-metüülguanosiin jne., mis lülitatakse RNA koostisesse kas transkriptsiooni käigus või saadakse transkriptsioonijärgselt ensümaatiliste reaktsioonide abil. Eksperimentaalsed tõendid selle kohta, et aminoatsüül-tRNA kompleksi koodoni-spetsiifilisus on tagatud tRNA ja mitte aminohappe poolt, saadi sel viisil, et muudeti tsüsteüül-tRNA Cys koostises olev tsüsteiin
tRNA molekulid on väikesed, 70-80 nukleotiidi pikkused molekulid, mille sekundaarstruktuur on ristikheina lehe kujuline (kolm juuksenõelastruktuuri ja vars). Kolmemõõtmeline struktuur on L-tähe kujuline. Antikoodooni ling asub molekuli keskel. tRNA geenid kodeerivad tRNA-de prekursormolekule, mis transkriptsioonijärgselt lõigatakse lühemaks, viiakse õigesse konformatsiooni, metüleeritakse. Valmis tRNA molekulid sisaldavad ka mitmeid ebatavalisi nukleotiide nagu näiteks inosiin, pseudouridiin, dihüdrouridiin, 1-metüülguanosiin jne., mis lülitatakse RNA koostisesse kas transkriptsiooni käigus või saadakse transkriptsioonijärgselt ensümaatiliste reaktsioonide abil. Eksperimentaalsed tõendid selle kohta, et aminoatsüül-tRNA kompleksi koodoni-spetsiifilisus on tagatud tRNA ja mitte aminohappe poolt, saadi sel viisil, et muudeti tsüsteüül-tRNA Cys koostises olev tsüsteiin