TTÜ Materjali- ja keskkonnatehnoloogia Instituut
KYF0280 Füüsikaline keemia
Üliõpilase nimi: Franz Mathias Ints
Töö nr: FK23
Töö pealkiri: Sahharoosi Ensüümreaktsiooni Kineetiliste Parameetrite MääramineTTÜ Materjali- ja keskkonnatehnoloogia Instituut
KYF0280 Füüsikaline keemia
Õpperühm: EANB31
Töö teostamise kuupäev: 21.10.2020
Töö pealkiri: Sahharoosi Ensüümreaktsiooni Kineetiliste Parameetrite MääramineTöö eesmärk (või töö ülesanne).
sahharoosi ensüümreaktsiooni kineetiliste konstantide Km ja vmax määramine Lineweaver-Burki
koordinaatides ehitatud graafiku abil (1/v sõltuvana 1/S).
Teooria
Ensüüm reaktsiooni kineetikat kirjeldab Michaelis-Menteni vôrrand:
kus v0 – reaktsiooni algkiirus; S0 – substraadi algkontsentratsioon; Km- Michaelis-Menteni konstant; vmax –
maksimaalne kiirus Konstandi Km sisuline tähendus: kui [S]0 = Km, siis v0 = ehk Km on substraadi
kontsentratsioon, mille juures reaktsiooni kiirus on pool maksimaalsest. Järeldus: mida väikesem on Km , seda
madalama substraadi kontsentratsiooni juures töötab ensüüm (ferment) efektiivselt. See kirjeldab produkti
moodustumise kiirust katalüüsi algperioodil. Väga kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel limiteerivad
reaktsiooni kiirust vaid ensüümi hulk (ja reaktsiooni tingimused). Kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel on
ensüüm täielikult reaktsioonis hõivatud.
Sahharoosi inversioonireaktsiooni (hüdrolüüsi) produktideks on glükoos ja fruktoos:
Reaktsioon kulgeb vesilahuses (kusjuures vee kontsentratsioon on tunduvalt suurem sahharoosi
kontsentratsioonist) esimest järku reaktsioonina. Inversioonireaktsiooni kiirus on neutraalses keskkonnas väga
väike, seetõttu kiirendatakse reaktsiooni katalüsaatorite – kas mineraalhapete või (antud töös)
ensüümkatalüsaatorite – abil. Reaktsiooni kiirust mõõdetakse lahust läbiva polariseeritud valguse
polarisatsioonitasandi pöördenurga ajalise muutuse kaudu. Seda võimaldab suhkru ja tema
lagunemisproduktide optiline aktiivsus. Sahharoos pöörab polarisatsioonitasandit paremale (eripööre [αeri] = eri] =
66,550 ), tema inversiooniproduktide segu aga vasakule, kuna glükoos pöörab paremale (eripööre [αeri] = eri] =
52,50 ), fruktoos aga vasakule ([αeri] = eri] = - 91,90 ). Seetõttu reaktsiooni kulgemisel polarisatsioonitasandi
pöördenurk väheneb, muutub võrdseks nulliga ja seejärel negatiivseks. Reaktsiooni lõppemisele vastab
konstantne negatiivne pöördenurga piirväärtus. Pöördenurk αeri] = sõltub eripöördest [αeri] = eri], lahusekihi paksusest
(toru pikkusest) l ja 2 vmax kontsentratsioonist c: αeri] = = f([αeri] = eri], l ,c). Polarisatsioonitasandi pöördenurka
mõõdetakse polarimeetri abil
Töövahendid.
Polarimeeter KRÜSS, kolb suhkrulahuse segamiseks
Töö käik.
1)
Esmalt täidetakse polarimeetri toru (toru pikkus l=100 mm) määratletud kontsentratsiooniga
suhkrulahusega
2)
valatakse suhkrulahus polameetri torust välja
3)
Reaktsioonisegu valmistamiseks lisatakse eraldi kolvis 25 ml-le suhkrulahusele 1 ml ensüümi (invertaas)
lahust, ning koheselt fikseeritakse reaktsiooni alguse aeg,
4)
Loputatakse polarimeetri toru ja täidetakse (mullideta!) reaktsioonisegust võetud prooviga. Toru asetatakse
polarimeetrisse ning mõõdetakse polarisatsioonitasandi pöördenurka
5)
Esimene mõõtmine võetakse lühimal ajahetkel, mis võimalik. Edasi teostatakse mõõtmisi kindla ajavahemiku
tagant (alguses tihemini ~2 min. või 5 min, järel, siis 10 min järel, ning mida aeg edasi, seda harvemini).
Töö eesmärk (või töö ülesanne).
sahharoosi ensüümreaktsiooni kineetiliste konstantide Km ja vmax määramine Lineweaver-Burki
koordinaatides ehitatud graafiku abil (1/v sõltuvana 1/S).
Teooria
Ensüüm reaktsiooni kineetikat kirjeldab Michaelis-Menteni vôrrand:
kus v0 – reaktsiooni algkiirus; S0 – substraadi algkontsentratsioon; Km- Michaelis-Menteni konstant; vmax –
maksimaalne kiirus Konstandi Km sisuline tähendus: kui [S]0 = Km, siis v0 = ehk Km on substraadi
kontsentratsioon, mille juures reaktsiooni kiirus on pool maksimaalsest. Järeldus: mida väikesem on Km , seda
madalama substraadi kontsentratsiooni juures töötab ensüüm (ferment) efektiivselt. See kirjeldab produkti
moodustumise kiirust katalüüsi algperioodil. Väga kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel limiteerivad
reaktsiooni kiirust vaid ensüümi hulk (ja reaktsiooni tingimused). Kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel on
ensüüm täielikult reaktsioonis hõivatud.
Sahharoosi inversioonireaktsiooni (hüdrolüüsi) produktideks on glükoos ja fruktoos:
Reaktsioon kulgeb vesilahuses (kusjuures vee kontsentratsioon on tunduvalt suurem sahharoosi
kontsentratsioonist) esimest järku reaktsioonina. Inversioonireaktsiooni kiirus on neutraalses keskkonnas väga
väike, seetõttu kiirendatakse reaktsiooni katalüsaatorite – kas mineraalhapete või (antud töös)
ensüümkatalüsaatorite – abil. Reaktsiooni kiirust mõõdetakse lahust läbiva polariseeritud valguse
polarisatsioonitasandi pöördenurga ajalise muutuse kaudu. Seda võimaldab suhkru ja tema
lagunemisproduktide optiline aktiivsus. Sahharoos pöörab polarisatsioonitasandit paremale (eripööre [αeri] = eri] =
66,550 ), tema inversiooniproduktide segu aga vasakule, kuna glükoos pöörab paremale (eripööre [αeri] = eri] =
52,50 ), fruktoos aga vasakule ([αeri] = eri] = - 91,90 ). Seetõttu reaktsiooni kulgemisel polarisatsioonitasandi
pöördenurk väheneb, muutub võrdseks nulliga ja seejärel negatiivseks. Reaktsiooni lõppemisele vastab
konstantne negatiivne pöördenurga piirväärtus. Pöördenurk αeri] = sõltub eripöördest [αeri] = eri], lahusekihi paksusest
(toru pikkusest) l ja 2 vmax kontsentratsioonist c: αeri] = = f([αeri] = eri], l ,c). Polarisatsioonitasandi pöördenurka
mõõdetakse polarimeetri abil
Töövahendid.
Polarimeeter KRÜSS, kolb suhkrulahuse segamiseks
Töö käik.
1)
Esmalt täidetakse polarimeetri toru (toru pikkus l=100 mm) määratletud kontsentratsiooniga
suhkrulahusega
2)
valatakse suhkrulahus polameetri torust välja
3)
Reaktsioonisegu valmistamiseks lisatakse eraldi kolvis 25 ml-le suhkrulahusele 1 ml ensüümi (invertaas)
lahust, ning koheselt fikseeritakse reaktsiooni alguse aeg,
4)
Loputatakse polarimeetri toru ja täidetakse (mullideta!) reaktsioonisegust võetud prooviga. Toru asetatakse
polarimeetrisse ning mõõdetakse polarisatsioonitasandi pöördenurka
5)
Esimene mõõtmine võetakse lühimal ajahetkel, mis võimalik. Edasi teostatakse mõõtmisi kindla ajavahemiku
tagant (alguses tihemini ~2 min. või 5 min, järel, siis 10 min järel, ning mida aeg edasi, seda harvemini).
Töö eesmärk (või töö ülesanne).
sahharoosi ensüümreaktsiooni kineetiliste konstantide Km ja vmax määramine Lineweaver-Burki
koordinaatides ehitatud graafiku abil (1/v sõltuvana 1/S).
Teooria
Ensüüm reaktsiooni kineetikat kirjeldab Michaelis-Menteni vôrrand:
kus v0 – reaktsiooni algkiirus; S0 – substraadi algkontsentratsioon; Km- Michaelis-Menteni konstant; vmax –
maksimaalne kiirus Konstandi Km sisuline tähendus: kui [S]0 = Km, siis v0 = ehk Km on substraadi
kontsentratsioon, mille juures reaktsiooni kiirus on pool maksimaalsest. Järeldus: mida väikesem on Km , seda
madalama substraadi kontsentratsiooni juures töötab ensüüm (ferment) efektiivselt. See kirjeldab produkti
moodustumise kiirust katalüüsi algperioodil. Väga kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel limiteerivad
reaktsiooni kiirust vaid ensüümi hulk (ja reaktsiooni tingimused). Kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel on
ensüüm täielikult reaktsioonis hõivatud.
Sahharoosi inversioonireaktsiooni (hüdrolüüsi) produktideks on glükoos ja fruktoos:
Reaktsioon kulgeb vesilahuses (kusjuures vee kontsentratsioon on tunduvalt suurem sahharoosi
kontsentratsioonist) esimest järku reaktsioonina. Inversioonireaktsiooni kiirus on neutraalses keskkonnas väga
väike, seetõttu kiirendatakse reaktsiooni katalüsaatorite – kas mineraalhapete või (antud töös)
ensüümkatalüsaatorite – abil. Reaktsiooni kiirust mõõdetakse lahust läbiva polariseeritud valguse
polarisatsioonitasandi pöördenurga ajalise muutuse kaudu. Seda võimaldab suhkru ja tema
lagunemisproduktide optiline aktiivsus. Sahharoos pöörab polarisatsioonitasandit paremale (eripööre [αeri] = eri] =
66,550 ), tema inversiooniproduktide segu aga vasakule, kuna glükoos pöörab paremale (eripööre [αeri] = eri] =
52,50 ), fruktoos aga vasakule ([αeri] = eri] = - 91,90 ). Seetõttu reaktsiooni kulgemisel polarisatsioonitasandi
pöördenurk väheneb, muutub võrdseks nulliga ja seejärel negatiivseks. Reaktsiooni lõppemisele vastab
konstantne negatiivne pöördenurga piirväärtus. Pöördenurk αeri] = sõltub eripöördest [αeri] = eri], lahusekihi paksusest
(toru pikkusest) l ja 2 vmax kontsentratsioonist c: αeri] = = f([αeri] = eri], l ,c). Polarisatsioonitasandi pöördenurka
mõõdetakse polarimeetri abil
Töövahendid.
Polarimeeter KRÜSS, kolb suhkrulahuse segamiseks
Töö käik.
1)
Esmalt täidetakse polarimeetri toru (toru pikkus l=100 mm) määratletud kontsentratsiooniga
suhkrulahusega
2)
valatakse suhkrulahus polameetri torust välja
3)
Reaktsioonisegu valmistamiseks lisatakse eraldi kolvis 25 ml-le suhkrulahusele 1 ml ensüümi (invertaas)
lahust, ning koheselt fikseeritakse reaktsiooni alguse aeg,
4)
Loputatakse polarimeetri toru ja täidetakse (mullideta!) reaktsioonisegust võetud prooviga. Toru asetatakse
polarimeetrisse ning mõõdetakse polarisatsioonitasandi pöördenurka
5)
Esimene mõõtmine võetakse lühimal ajahetkel, mis võimalik. Edasi teostatakse mõõtmisi kindla ajavahemiku
tagant (alguses tihemini ~2 min. või 5 min, järel, siis 10 min järel, ning mida aeg edasi, seda harvemini).
Töö eesmärk (või töö ülesanne).
sahharoosi ensüümreaktsiooni kineetiliste konstantide Km ja vmax määramine Lineweaver-Burki
koordinaatides ehitatud graafiku abil (1/v sõltuvana 1/S).
Teooria
Ensüüm reaktsiooni kineetikat kirjeldab Michaelis-Menteni vôrrand:
kus v0 – reaktsiooni algkiirus; S0 – substraadi algkontsentratsioon; Km- Michaelis-Menteni konstant; vmax –
maksimaalne kiirus Konstandi Km sisuline tähendus: kui [S]0 = Km, siis v0 = ehk Km on substraadi
kontsentratsioon, mille juures reaktsiooni kiirus on pool maksimaalsest. Järeldus: mida väikesem on Km , seda
madalama substraadi kontsentratsiooni juures töötab ensüüm (ferment) efektiivselt. See kirjeldab produkti
moodustumise kiirust katalüüsi algperioodil. Väga kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel limiteerivad
reaktsiooni kiirust vaid ensüümi hulk (ja reaktsiooni tingimused). Kõrgetel substraadi kontsentratsioonidel on
ensüüm täielikult reaktsioonis hõivatud.
Sahharoosi inversioonireaktsiooni (hüdrolüüsi) produktideks on glükoos ja fruktoos:
Reaktsioon kulgeb vesilahuses (kusjuures vee kontsentratsioon on tunduvalt suurem sahharoosi
kontsentratsioonist) esimest järku reaktsioonina. Inversioonireaktsiooni kiirus on neutraalses keskkonnas väga
väike, seetõttu kiirendatakse reaktsiooni katalüsaatorite – kas mineraalhapete või (antud töös)
ensüümkatalüsaatorite – abil. Reaktsiooni kiirust mõõdetakse lahust läbiva polariseeritud valguse
polarisatsioonitasandi pöördenurga ajalise muutuse kaudu. Seda võimaldab suhkru ja tema
lagunemisproduktide optiline aktiivsus. Sahharoos pöörab polarisatsioonitasandit paremale (eripööre [αeri] = eri] =
66,550 ), tema inversiooniproduktide segu aga vasakule, kuna glükoos pöörab paremale (eripööre [αeri] = eri] =
52,50 ), fruktoos aga vasakule ([αeri] = eri] = - 91,90 ). Seetõttu reaktsiooni kulgemisel polarisatsioonitasandi
pöördenurk väheneb, muutub võrdseks nulliga ja seejärel negatiivseks. Reaktsiooni lõppemisele vastab
konstantne negatiivne pöördenurga piirväärtus. Pöördenurk αeri] = sõltub eripöördest [αeri] = eri], lahusekihi paksusest
(toru pikkusest) l ja 2 vmax kontsentratsioonist c: αeri] = = f([αeri] = eri], l ,c). Polarisatsioonitasandi pöördenurka
mõõdetakse polarimeetri abil
Töövahendid.
Polarimeeter KRÜSS, kolb suhkrulahuse segamiseks
Töö käik.
1)
Esmalt täidetakse polarimeetri toru (toru pikkus l=100 mm) määratletud kontsentratsiooniga
suhkrulahusega
2)
valatakse suhkrulahus polameetri torust välja
3)
Reaktsioonisegu valmistamiseks lisatakse eraldi kolvis 25 ml-le suhkrulahusele 1 ml ensüümi (invertaas)
lahust, ning koheselt fikseeritakse reaktsiooni alguse aeg,
4)
Loputatakse polarimeetri toru ja täidetakse (mullideta!) reaktsioonisegust võetud prooviga. Toru asetatakse
polarimeetrisse ning mõõdetakse polarisatsioonitasandi pöördenurka
5)
Esimene mõõtmine võetakse lühimal ajahetkel, mis võimalik. Edasi teostatakse mõõtmisi kindla ajavahemiku
tagant (alguses tihemini ~2 min. või 5 min, järel, siis 10 min järel, ning mida aeg edasi, seda harvemini).
Jrk nr
Kellaaeg
1
10:43
2
1.45
2
10:45
4
1.33
3
10:47
6
1.22
4
10:49
8
1.09
5
10:51
10
0.98
6
10:56
15
0.71
7
11:01
20
0.48
8
11:06
25
0.29
9
11:11
30
0.14
10
11:16
35
-0.04
11
11:21
40
-0.07
12
11:26
45
-0.14
13
11:31
50
-0.2
14
11:41
60
-0.28
15
11:51
70
-0.34
16
12:01
80
-0.37
17
12:11
90
-0.4
18
12:21
100
-0.41
19
12:41
120
-0.43
20
1447
-0.46
2) reakts algkiirus
Ajahetk:
t = 10 min
Pöördenurk:
Konsenstratsioon ajahetkel: St = 0.0527
Algkiirus:
Aeg reaktsiooni
algusest, min
Polarimeetri
näit, αeri] =
Järgmine päev
10:34
[𝑆_0 ]=(2,4∗1000)/(100∗342)=0,07 𝑚𝑜𝑙/𝑙
𝛼_10=0,98
𝑣_0=(𝑆_0−𝑆_𝑡)/𝑡=(0,07−0,0527)/(10∗60)
= 28,8*10^-6 mol/l*s
Katse temperatuur:
23.1C
Suhkrulahuse konsentratsioon:
2.4%
Katalüsaator:
Invertaas
Suhkrulahuse lähtepöördenurk αeri] = 0:
1.62
Reaktsiooni alguse kellaaeg:
10:41
1) Kalibreerimine:
1.45
0.07
αeri] = =
-0.46
S=
0
0.07
14.29
28.8*10^6
0.82
1.22
7.38E-05
αeri] = 0=
S0=
3) Km ja Vmax leidmine
S0
1/S0
v0
[𝑆_0 ]=(2,4∗1000)/(100∗342)=0,07 𝑚𝑜𝑙/𝑙
-1
-0.5
0
0.5
1
1.5
2
0
0.01
0.02
0.03
0.04
0.05
0.06
0.07
0.08
f(x) = 0.036649214659686 x + 0.016858638743456
Kalibreerimisgraafik
αeri] =
S
,
m
o
l/
l
0.00
2.00
4.00
6.00
8.00
10.00
12.00
14.00
16.00
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
35000
40000
f(x) = 1620.199952 x + 11574.2864
Kiiruse pöördväärtuse sõltuvus kontsentratsiooni pöördväärtusest
1/S0, l/mol
1
/v
0
,
l*
s/
m
o
l
1.62
0
0.00
2.00
4.00
6.00
8.00
10.00
12.00
14.00
16.00
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
35000
40000
f(x) = 1620.199952 x + 11574.2864
Kiiruse pöördväärtuse sõltuvus kontsentratsiooni pöördväärtusest
1/S0, l/mol
1
/v
0
,
l*
s/
m
o
l
1/𝑣_𝑚𝑎𝑥 =11574⇒ 𝑣_𝑚𝑎𝑥=0,0000864=8,64∗ 〖 10 〗 ^(−5) 𝑚𝑜𝑙/(𝑙∗𝑠)
𝐾_𝑚/𝑣_𝑚𝑎𝑥 =1620,2⇒ 𝐾_𝑚=0,139 M
4) Michaelis-Menteni graafik
0.07
0.139
34720
13550.14
1/v0
-1
-0.5
0
0.5
1
1.5
2
0
0.01
0.02
0.03
0.04
0.05
0.06
0.07
0.08
f(x) = 0.036649214659686 x + 0.016858638743456
Kalibreerimisgraafik
αeri] =
S
,
m
o
l/
l
0.00
2.00
4.00
6.00
8.00
10.00
12.00
14.00
16.00
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
35000
40000
f(x) = 1620.199952 x + 11574.2864
Kiiruse pöördväärtuse sõltuvus kontsentratsiooni pöördväärtusest
1/S0, l/mol
1
/v
0
,
l*
s/
m
o
l
𝑣_0=(8,64∗ 〖 10 〗 ^(−5)∗0,07)/(0,139+0,07)=0,000028=28,8∗ 〖 10 〗 ^(−6) 𝑚𝑜𝑙/(𝑙∗𝑠)
𝑆_0
𝑆_0=𝐾_𝑚
𝑣_0
= 28,8*10^-6
𝑣_0
= 𝑣_𝑚𝑎𝑥/2= 4,32*10^-5
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
-9.99999999999995E-06
5.42101086242752E-20
1.00000000000001E-05
2E-05
3E-05
4E-05
5E-05
6E-05
7E-05
8E-05
9E-05
Michaelis-Menteni graafik
S0
v
0
𝑣_𝑚𝑎𝑥
𝐾_𝑚
𝑣_0
" = " 𝑣_𝑚𝑎𝑥/2
0.00
2.00
4.00
6.00
8.00
10.00
12.00
14.00
16.00
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
35000
40000
f(x) = 1620.199952 x + 11574.2864
Kiiruse pöördväärtuse sõltuvus kontsentratsiooni pöördväärtusest
1/S0, l/mol
1
/v
0
,
l*
s/
m
o
l
9.6E-06
1.728E-05
2.88E-05
4.32E-05
5.76E-05
6.48E-05
6.912E-05
𝑣_0=(8,64∗ 〖 10 〗 ^(−5)∗0,07)/(0,139+0,07)=0,000028=28,8∗ 〖 10 〗 ^(−6) 𝑚𝑜𝑙/(𝑙∗𝑠)
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
-9.99999999999995E-06
5.42101086242752E-20
1.00000000000001E-05
2E-05
3E-05
4E-05
5E-05
6E-05
7E-05
8E-05
9E-05
Michaelis-Menteni graafik
S0
v
0
𝑣_𝑚𝑎𝑥
𝐾_𝑚
𝑣_0
" = " 𝑣_𝑚𝑎𝑥/2
0.017375
0.03475
0.0695
0.139
0.278
0.417
0.556
Järeldus
2.4% sahharoosilahuse reaktsiooni algkiiruseks sain 28,8*10^-6 mol/l*s ning v,max tuli
8,64∗ 〖 10 〗 ^(−5) 𝑚𝑜𝑙/(𝑙∗𝑠)
ja Km = 0,139 M
Kirjandusliku allika põhjal: Km = 150 mM => 0.150 M
V,max = 1 mM/min = 1.66*10^-5 mol/s
Kasutatud allikad: -õppejõu poolt praktikumi juhend moodles
Järeldus
2.4% sahharoosilahuse reaktsiooni algkiiruseks sain 28,8*10^-6 mol/l*s ning v,max tuli
8,64∗ 〖 10 〗 ^(−5) 𝑚𝑜𝑙/(𝑙∗𝑠)
ja Km = 0,139 M
Kirjandusliku allika põhjal: Km = 150 mM => 0.150 M
V,max = 1 mM/min = 1.66*10^-5 mol/s
Kasutatud allikad: -õppejõu poolt praktikumi juhend moodles
Siia tuleb lisada (skaneeritult või fotona) õppejõu poolt antud tööülesanne ja õppejõu poolt allkirjastatud originaalkatseandmete leht.
Siia tuleb lisada (skaneeritult või fotona) õppejõu poolt antud tööülesanne ja õppejõu poolt allkirjastatud originaalkatseandmete leht.
Document Outline
- Tiitelleht
- Teooria ja töö käik
- Arvutused, tabelid ja graafikud
- Järeldus
- Originaalkateseandmed
Kõik kommentaarid