nukleotiide või seonduvad DNA-ga ning indutseerivad katkeid või ristsidemeid DNA ahelates. 6)Vead DNA replikatsioonis. Kõik DNA polümeraasid teevad vigu, mille nad küll tavaliselt ise ära parandavad, kuid osad jäävad need siiski alles ning tekitavad olukorra, kus DNA erinevatel ahelatel on omavahel mittepaarduvad nukleotiidid. DNA reparatsioonisüsteemid DNA ahelal olevate vigastuste parandamiseks on kolm peamist süsteemi: Base excision repair (BER), mille käigus eemaldatakse DNA ahelast üksik kahjustatud nukleotiid mis asendatakse uuega. Nucleotide excision repair (NER), mille käigus asendatakse DNA kahjustuse ümbrusest umbes 30 nukleotiidi pikkune üheahelaline DNA lõik. Mismatch repair (MMR) kõrvaldab vigastused, mis on tekkinud DNA replikatsiooni või rekombinatsiooni käigus. Nendel juhtudel pole kumbki DNA ahel otseselt vigane, kuid nad ei paardu omavahel.
Dubstep & Liquid dnb Sanna-Marcelle Ots 11B Dubstep Elektrooniline tantsumuusika London (20.saj lõpp-21.saj algus) Kaheosalises taktimõõdus rütm või soolotrumm Rõhuvaid ja tumedaid helisi esiletoov bass Tempo üldiselt 140 lööki minutis Löögi asetsemine 3. taktil Dubstepi artiste Srillex Flux Pavilion Deadmau5 Excision Nero Knife party Dubstepi näide https://www.youtube.com/watch?v=yp3UeCgu VVI 2,40 https://www.youtube.com/watch?v=3Q9rewn LFYw Dnb e. drum and bass Elektrooniline tantsumuusika Välja arenenud jungle muusikast 1990. aastate algus Kiire tempi, keeruka bassikäiguga 160-180 lööki minutis Dnb artiste Netsky Sigma Tiesto Pendulum
Alles aastal 2002 tuli kasutusele dubstepi termin. 2003 hakati BBC Radio 1 kanalil mängima esimesi lugusi, 2004 aasta lõpuks sai dubstep juba Inglismaal üsna populaarseks. 20052008. aastatel hakkas see levima ka väljaspool Inglismaad. 2009 aastast alates on dubstep mõjutanud nii öelda "mainstream" muusikat ja on üldse kogu maailmas tuntuks saanud. Tuntuimad artiste : Borgore, Benga, Flux Pavilion, Doctor P, Nero, Knife Party, Zeds Dead, Datsik, Excision, Emalkay, Mt. Eden, Skrillex Tunnusjooned Dubstep on elektrooniline muusikastiil, mille tempo on üldjuhul 138142 lööki minutis. Bass toob esile tumedaid helisid ja soolotrummi löök asetseb kolmandal löögil, teistel elektromuusika stiilidel on see aga neljandal löögil. Veel iseloomustab dubstepi võbisev bass. On üsna tavaline et bass kukub ("drops") 55. sekundil loos, aga see pole ega ei pea alati nii olema. Näited : http://www.youtube.com/watch
1. Aluspaari väljalõikamisega seotud reparatsioon. DNA ühel ahelal olevate vigastuste parandamiseks on kolm peamist süsteemi: · Base excision repair (BER), mille käigus eemaldatakse DNA ahelast üksik kahjustatud nukleotiid mis asendatakse uuega. BER-i kasutatakse peamiselt oksüdeeritud, alküleeritud, hüdrolüüsitud ja deamineeritud nukleotiidide väljavahetamiseks. · Nucleotide excision repair (NER), mille käigus asendatakse DNA kahjustuse ümbrusest umbes 30 nukleotiidi pikkune üheahelaline DNA lõik. NER tunneb ära vigastusi, mis tekitavad suuremaid muudatusi DNA üldises struktuuris. Sellisteks on näiteks tümiini dimeerid ja DNA üheahelalised katked. NER jaotub kaheks alaliigiks: 1) transcription-coupled repair (TCR), mis aktiveerub, kui RNA polümeraas "avastab" DNA kahjustuse ning jääb seetõttu
[3,4] CT may be less specific though, since it detects more lesions, many of which may be nonneoplastic. It would make sense to use CT scan as a screening test. However, it is less readily available, more expensive, and requires general anesthesia, which increases risk to the patient and cost to the owner. Therefore, radiographs are still more commonly used. However, situations exist where CT scan should be strongly considered. For example, prior to thoracotomy for pulmonary mass excision, CT scan should be recommended to better characterize lymph node size and determine the presence of smaller lesions, since both findings strongly affect prognosis.[5] In general, less expensive, less invasive, and less risky tests are offered first, although owners should be made aware that more expensive, more invasive tests may follow if diagnosis is not achieved. For example, fine needle aspiration and cytologic evaluation are often recommended prior to surgical removal and biopsy of a mass
* DNA kahjustuste kõrvaldamise viisid/mehhanismid sh kaks põhilist DNA parandamise viisi DNA kahjustuste kõrvaldamise viisid: 1) Kahjustatud või valede lämmastikaluste asendamine 2) DNA-ahelate katkemiskohtade parandamine DNA kahjustuste kõrvaldamise mehhanismid: 1) Otsesed keemilised pöördreaktsioonid (kahjustatud koha kõrvaldamine ja algse oleku taastamine, näitek T-T dimeeri kõrvaldamine) 2) Kahjustuste kõrvaldamine väljalõikega (ingl.k. excision repair) a) lämmastikaluste väljalõige b) nukleotiidide väljalõige c) valepaardumise parandamine 3) Rekombinatsioonist sõltuv parandamine a) homoloogne rekombinatsioon b) mittehomoloogne DNA otste ühendamine 3. Kaks viisi kuidas parandada mõlema DNA ahela samaaegseid katkeid * Mittehomoloogne- ja homoloogne DNA otste ühendamine' Mittehomoloogne DNA otse ühendamine toimub enne DNA replikatsiooni. Kui
Aktiivne DNA metülatsioon toimub läbi metüülrühma otse eemaldamise, DNA replikatsioonist olenemata. Imetajates toimub globaalne ehk ülegenoomne demetülatsioon. Esineb ka lookus-spetsiifilist demetüleerimist – nt genoomne imprinting jne. Aktiivne demetülatsioon võib toimuda läbi otsese 5mC eemaldamise või edasi modifitseeritud tsütosiini läbi. Otsene eemaldamine on nt aluspaari eemaldamine ja mittemetüleeritud aluse inserteerimine base excision repair mehanismi kaudu (BER). Või eemaldatakse terve DNA lõik mis täidetakse nukleotiididega nukleotide excision repair (NER) poolt. Edasi modifitseeritud tsütosiini puhul tekib oksüdatsiooni käigus hüdroksümetüültsütosiin, mis deaminaaside poolt deamineeritakse, nt AID/Apobec, TET. Deaminatsiooni ja oksüdatsiooni produktid parandatakse TDG glükosülaasi poolt mis on seotud BER mehanismiga. •
reverteerumissageduste mõõtmisel tingimustes, kus bakterite kasvukeskkonda on lisatud uuritavaid kemikaale. Mida mutageensem on kemikaal, seda suuremal hulgal tekib bakteripopulatsiooni revertante (bakterirakke, kes on võimelised kolooniaid moodustama histidiini-vabas keskkonnas) 76. Põhilised DNA reparatsioonimehhanismid rakkudes. Valgusest sõltuv fotoreaktivatsioon Väljalõikereparatsioon (excision repair) Replikatsioonijärgne valepaardumisi kõrvaldav DNA “mismatch” reparatsioon MMR (mismatch repair) Rekombinatsiooniline reparatsioon 77. SOS vastus bakterites. Bakteris E. coli põhjustab SOS mutageneesi vigaderohke DNA polümeraas V, mis jätkab kahjustuse kohal peatunud DNA polümeraasi III asemel vigaderohket DNA sünteesi. See mehhanism käivitub ebasoodsates oludes. Vigaderohke DNA sünteesi tõttu toimub palju
tuhandeid nukleiinhappeid. Mõned vead kaasnevad DNA replikatsiooni ja transkriptsiooniga. Rakus on olemas mitmeid ensüüme, mis tegelevad nende vigade parandamisega. Selle eest vastutavad ensüümid on evolutsioonis püsinud samasugustena st nad on samasugused bakteril, äädikakärbsel, pärmil, inimesel. Parandusensüümid jagatakse nelja suurde gruppi: 1. Kahjustuse tagasimuutmine (damage reversal) 2. Väljalõike parandamine (excision repair) 3. Kaksikahela katkemise parandamine (mittehomoloogiline otste ühendmaine ja homoloogiline rekombinatsioon- homoloogse kromosoomi järjestusel) 4. Replikatsioonijärgne parandamine paranduspolümeraasid. Homoloogise DNA abil parandamine. RecA valk seostub ssDNA ja sunnib seda rekombineeruma teise ahelaga. DNa polümeraas sünteesib õige ja ligaas kleebib.
(kaubamärgid: Podocon-25, Podofin) või trikloroäädikhapet (kaubamärk: Tri Chlor), peab manustama arst. Imikvimoodi sisaldavat kreemi (kaubamärk: Aldara), podofiloksi lahust (kaubamärk: Condylox) või fluorouratsiili sisaldavat kreemi võib arsti korralduse kohaselt kodus manustada. Neid ravimeetodeid võib kord nädalas korrata, kuni tüükad kaovad. · Elektrokirurgiline lingektsisioon (ingl loop electrosurgical excision procedure, LEEP). Selle suguelundite tüügaste kirurgilise eemaldamise meetodi kasutamisel viib arst terava aasataolise instrumendi tüüka alt läbi ja lõikab selle nahakoest välja. · CO2-laserkirurgia. Suguelundite piirkonna suurte tüügaste täielikuks eemaldamiseks võib olla vaja laserkirurgiat. · Interferoon. Kui suguelundite tüükad ei kao pärast erinevate ravimeetodite kasutamist, võib arst katsetada interferooni süstimist tüükasse
Kui kiiritada DNA-d ultraviolettkiirgusega, võivad DNA-s moodustuda omavahel kovalentselt seotud tümiini dimeerid. Fotolüaas seondub spetsiifiliselt tümidiini dimeeridele ning lõhub valgusenergiat kasutades tümiinide vahelise sideme. Fotolüaas on võimeline tümiini dimeeridele seonduma ka siis, kui hoida bakterirakke pimedas, kuid sel juhul ei katalüüsi ta sideme katkestamist. Väljalõikereparatsioon - kas kahjustatud lämmastikaluste väljalõikamisega (base excision repair) või nukleotiidide väljalõikamisega. Uratsiil DNA glükosülaas on väga spetsiifiline ja kõrvaldab DNA ahelast ainult uratsiili. Uratsiil tekibtsütosiini deamineerimise tulemusena. Sellel ensüümil AP endonukleaasne aktiivsus puudub. DNA "mismatch" reparatsioon MMR - üldiselt on DNA ahelad rakus metüleeritud. Peale DNA replikatsiooni on uus DNA ahel veel metüleerimata, DNA ,,mismatch" reparatsioon MMR korrigeerib DNA järjestust peale replikatsiooni, kõrvaldades
Kovalentsete ristsidemete teke (DNA ahelasiseselt või ahelate vaheliselt) 26. DNA kahjustuste kõrvaldamise viisid/mehhanismid sh kaks põhilist DNA parandamise viisi 1) Kahjustatud või valede lämmastikaluste asendamine 2) DNA ahelate katkemiskohtade parandamine Mehhanismid: Otsesed keemilised pöördreaktsioonid (kahjustatud koha kõrvaldamine ja algse oleku taastamine (nt T-T dimeeri kõrvaldamine) Kahjustuste kõrvaldamine väljalõikega (excision repair) a. Lämmastikaluste väljalõige b. Nukleotiidide väljalõige c. Valepaardumise parandamine Rekombinatsioonist sõltuv parandamine a. Homoloogne rekombinatsioon b. Mittehomoloogne DNA otste ühendamine 27. Mittehomoloogne- ja homoloogne DNA otste ühendamine Mittehomoloogne DNA otste ühendamine: Toimub enne DNA replikatsiooni Keskne roll on Ku valgul → haarab katkise kromosoomi, hoiab neid koos, kuni
Ames'i testi tulemusena selgus ka, et mitmed sigareti suitsus olevad komponendid võivad stimuleerida raaminihke mutatsioonide teket. DNA reparatsioonimehhanismid Kõigil elusorganismidel on selleks, et ära hoida liiga kõrget mutatsioonisagedust, mitmeid erinevaid DNA reparatsioonisüsteeme. Bakteri E. coli puhul on põhilisteks reparatsioonisüsteemideks valgusest sõltuv fotoreaktivatsioon, väljalõikereparatsioon (excision repair), replikatsioonijärgne valepaardumisi kõrvaldav DNA "mismatch" reparatsioon MMR (mismatch repair) ja rekombinatsiooniline reparatsioon. Sarnased reparatsioonisüsteemid (v.a. fotoreaktivatsioon) on välja kujunenud ka imetajatel. Inimese puhul on leitud, et osa vähivorme on seotud DNA reparatsiooni defektsusega. Fotoreaktivatsioon 86 Fotoreaktivatsioonil osaleb valgustundlik ensüüm fotolüaas
Ames'i testi tulemusena selgus ka, et mitmed sigareti suitsus olevad komponendid võivad stimuleerida raaminihke mutatsioonide teket. DNA reparatsioonimehhanismid Kõigil elusorganismidel on selleks, et ära hoida liiga kõrget mutatsioonisagedust, mitmeid erinevaid DNA reparatsioonisüsteeme. Bakteri E. coli puhul on põhilisteks reparatsioonisüsteemideks valgusest sõltuv fotoreaktivatsioon, väljalõikereparatsioon (excision repair), replikatsioonijärgne valepaardumisi kõrvaldav DNA "mismatch" reparatsioon MMR (mismatch repair) ja rekombinatsiooniline reparatsioon. Sarnased reparatsioonisüsteemid (v.a. fotoreaktivatsioon) on välja kujunenud ka imetajatel. Inimese puhul on leitud, et osa vähivorme on seotud DNA reparatsiooni defektsusega. Fotoreaktivatsioon Fotoreaktivatsioonil osaleb valgustundlik ensüüm fotolüaas. Kui kiiritada DNA-d ultraviolettkiirgusega,
50 seda aeglaselt sünteesida, aga kopeeritavasse ahelasse on sisestatud mittekomplementaarsed nukleotiidid, põhjustades mutatsioone. Fotoreparatsioonisüsteem- fotolüaas ja VALGE VALGUS- lagundab tümidiindimeerid, taastades normaalse olukorra. Peale kiiritamist rakke hoida pimedas tekib rohkelt mutatsioone. Rakkudes eksisteerivad ka pimedas töötavad (valgustamisest sõltumatud) DNA reparatsioonimehhanismid: näiteks NER (nucleotide excision repair), milles teatud valgud tunnevad ära kahjustatud (näiteks ka tümidiindimeeridega DNA) ja seostuvad sellele. See algatab protsessi, milles kahjustatud ahela lõik lõigatakse DNAst välja endonukleaasidega ja seejärel sünteesitakse selle asemele uus ahel, kasutades matriitsina vastasahelat. Need reparatsioonimehhanismid on eri organismidel erineva efektiivsusega, seega on osa organisme kiirgusresistentsemad, kui teised.
annaabi.ee 
