Replikatsioon, transkriptsioon, translatsioon - Protsesside mõisted, toimumiskohad rakus, ensüümid, toimumiskäigud (0)
1. Põhikursuses õpitud molekulaargeneetika kordavalt – replikatsioon, transkriptsioon,
translatsioon. Nende protsesside mõisted, toimumiskohad rakus, ensüümid,
toimumiskäigud. (vt esitlusi Translatsioon ja Transkriptsioon)
REPLIKATSIOON- kromosoomide koostisaine DNA kahekordistumine. Saadakse ühest
DNA molekulist kaks identse järjestusega DNA molekuli. (protsess eelneb raku jagunemisele
nt mitoosile). Viib läbi ensüüm DNA-polümeraas.
● TOIMUB: eeltuumsetel tsütoplasmas; päristuumsetel rakutuumas, mitokondrites,
kloroplastides.
● KOMPLEMENTAARSUS: A=T; G=C
● DNA-polümeraas keerab DNA biheeliksi järk-järgult lahti ja kummagi esialgse ahela
kõrvale sünteesib uue ahela.
TRANSKRIPTSIOON- DNA ühe ahela alusel komplementaarse RNA molekuli süntees.
Tuumas.Viib läbi ensüüm RNA- polümeraas.
● ETAPID:
1) lisandub RNA-polümeraas;
2) RNA-polümeraas seondub DNA ahela promootor piirkonnaga;
3) ensüüm keerab DNA biheeliksi lahti;
4) RNA- polümeraas sünteesib ühe DNA ahela lõiguga komplementaarse RNA
molekuli;
5) RNA- polümeraas jõuab terminaatorini;
6) lõpeb mRNA, tRNA ja rRNA süntees;
7) DNA omandab uuesti biheeliksi kuju;
8) RNA liigub raku tuumast välja tsütoplasmasse
TRANSLATSIOON- RNA alusel valgu süntees tsütoplasmas paiknevatel ribosoomidel:
RNA-lt valk. Lõpeb, kui ribosoom jõuab ühe stoppkoodonini.
● VAJALIKUD TINGIMUSED: ribosoomid; mRNA, tRNA; aminohapped; energia
(ATP,GTP); ensüümid aminohapete aktiveerimiseks, nende seostumiseks tRNA-ga ja
peptiidahela sünteesiks
mRNA primaarstruktuur määrab ära valgu primaarstruktuuri
● KOODIPÄIKE: initsiaatorkoodon- AUG mRNA-s; stoppkoodon- ei kodeeri
aminohappeid (UAA, UAG, UGA)
○ koodon- mRNA-s
○ antikoodon- tRNA-s
● ETAPID:
1) mRNA ühineb ribosoomiga;
2) mRNA molekuli initsiaatorkoodoniga (AUG) seondub esimene tRNA molekul;
3) ribosoomi siseneb teine tRNA molekul, tuues endaga kaasa järgmise mRNA
koodonile vastava aminohappe;
4) ribosoomis kahe kõrvuti asetseva tRNA molekuli otstes olevate aminohapete vahel
sünteesitakse ensüümide abil peptiidside;
5) dipeptiid vabaneb initsiaator-tRNA-st ning jääb teisena ribosoomi sisenenud tRNA
molekuli külge;
6) tRNA nihkub koos mRNA-ga ribosoomi suhtes edasi ja teeb ruumi uuele (III) tRNA-le;
7) ribosoomi siseneb kolmas tRNA;
8) kahe kõrvuti asetseva tRNA molekuli otstes olevate aminohapete vahel
sünteesitakse peptiidside;
9) …
10) Stoppkoodon -> sünteesitud valk vabaneb, eralduvad ribosoomi alamüksused ja
mRNA
2. Geeni struktuur (promootor, RNA sünteesipiirkond, terminaator) ja geneetilise info
edastamine. Intronid, eksonid, RNA splaising, pöördtranskriptsioon ja pöördtranskriptaas (õp
lk 37, 40), genoomipank (lk 39). DNA sekveneerimine – mõiste. Vt esitlust Transkriptsioon
(geeni struktuur) ja õpikust lk 40 ning üldist, kogu materjali esitlust (Rakendusbioloogia,
lõpuosa slaidid) + vihikist tunni materjalid.
GEENI STRUKTUUR: transkriptsiooni alguses kinnitub ensüüm DNA-polümeraas geeni
algusossa. Seal paikneb kindla järjestuse ja struktuuriga DNA lõik (promootor). Kui ensüüm
kinnitunud, algab transkriptsioon. Promootorpiirkonale järgneb RNA sünteesipiirkond. See
määrab ära sünteesitava RNA nukleotiidse järjestuse.Transkriptsioon lõpeb, kui RNA-
polümeraas jõuab DNA järjestuseni, mida nimetatakse terminaatoriks. Seal ensüüm ja
mRNA vabanevad ning DNA biheeliks keerdub kokku tagasi.
PÖÖRDTRANSKRIPTAAS- revertaas, mis avastati retroviirusest. Ensüüm, mis katalüüsib
DNA sünteesi RNa järgi (st RNA kopeerimine DNA-ks).
INTRON- mittekodeeritav lõik, mida bakteride ‘’ei oska’’ välja lugeda
EKSON- kodeeriv DNA (inimese genoomis u 2%)
GENOOMIPANK- bakterikloonides säilitatav inimese genoomi DNA-fragmentide kogum;
kasutatakse kindlate fragmentide (geenide) paljundamiseks, uurimiseks ja siirdusmaterjali
saamiseks.
RNA splaising- RNA transkriptist eemaldatakse intronid ja liidetakse eksonid
PÖÖRDTRANSKRIPTSIOON- geneetilise info ülekanne RNA-lt DNA-le. DNA süntees RNA
järgi, tekib cDNA.
DNA sekveneerimine- protsess, mille käigus selgitatakse DNA nukleotiidne järjestus
3. Geenivektor, selle loomise protsess, ligaas, restriktaas (ja tekkivad „kleepuvad otsad"),
rekombinantne DNA. Õp lk 37 – 39. Plasmiid. Viirusvektor, plasmiidne geenivektor. - õp lk
38.
Rekombinantne DNA- DNA molekul, milles ühendatud eri liikidelt pärit DNA-fragmendid.
RESTRIKTAAS- ensüümid, mis lõikavad DNA molekuli kaksikahelat kindlate järjestuste
kohalt. Enamik lõikab DNA mõlemat ahelat vastava järjestuse eri otstest. Kui sama
restriktaasiga töödelda erinevat päritolu DNA-d, siis on tekkinud fragmentidel
komplementaarsed üheahelalised (kleepuvad otsad). Kui need fragmendid lahuses kokku
viia, siis paardumisel nad ühinevad.
LIGAAS- selle ensüümi toimel ühinevad ahelate otsad ka kovalentsete sidemetega ja
rekombinantsed molekulid ongi moodustunud.
GEENIVEKTOR- ehk siirdaja, DNA konstrukt. Kui soovitud geen on välja lõigatud,
ühendatakse ta selisesse DNA-sse, mis saab siseneda rakku ja integreeruda selle genoomi.
Geenivektorina saab kasutada bakterite plasmiide, viiruste DNAd või RNAd ja muid molekule.
PLASMIID- rõngas DNA-d, milles sageli antibiootikumiresistentsust andev geen.
VIIRUSVEKTOR- viirustel põhinev geenide ülekandesüsteem ehk viib soovitud geenid rakku
(viiruse genoomi kantakse soovitav geen, mille viirus viib oma genoomiga peremeesrakku)
PLASMIIDNE GEENIVEKTOR- siiratav geen ühendatud plasmiidi elementidega.
4. Geneetikas enimuuritud liigid (eri organismirühmadest), nende valiku kriteeriumid. (vt
esitlus Geeniotehnol_enimuuritud).
GM taimed:
● kahjuritele vastuvõtmatud kultuurtaimed nt ümarusse ‘’tõrjuvad’’ banaan, riis, kartul
● seemnete produktsiooni kasv, biomassi kiirem kasv
● pestitsiidikindlad kultuurtaimed
GM loomad: sead, lambad, kodulinnud, pärdikud, kalad, putukad
● Lehmapiima toitainesisalduse tõstmine
● Kanamunades kasvajavastased valgud
● Malaariatekitaja vastaseid valke tootvad putukad
● Probleem: tõstetud kokaiinisisalduse kokapuu Kolumbias
● Tubakataimed ‘’söövad’’ lõhkeaineid
● Valgesilmsele äädikakärbsele punasilmsuse geen
● Bioplaste lagundavad bakterid
5. PCR (polümeraasne ahelreaktsioon) - kuidas protsess toimub, mida tarvis, mis on millegi
ülesanne? Praimer. Vt üldist, kogu materjali esitlust ja õp lk 52-53)
POLÜMORFISM- mitmekujulisus, varieeruvus isenditi.
PCR- laialdaselt kasutatav meetod mingi kindla DNA lõigu paljundamiseks. Mitmeetapiline
DNA süntees, kus eelnevates etappides sünteesitud ahelad on aluseks uute ahelate
tootmisele järgnevates etappides.
● Paljundamine toimub eksponentsiaalselt: 2,4,8,16,32,64,128
PCR-i VAJALIKUD KOMPONENDID:
● uuritav DNA, mille piirkonda soovitakse paljundada
● nukleotiidid (kõik 4 erinevat)- uute DNA ahelate moodustamiseks
● praimerid (vasak- ja parempoolne)- lühikesed DNA lõigud, mis piiritlevad
paljundatava piirkonna kogu DNA-st, märgistavad sünteesi alguskoha
Erinevaid praimereid saab sünteesida vastavalt soovitavale DNA lõigule
6. Isiku molekulaarbioloogiline tuvastamine, DNA sõrmejälgede metoodika. Polümorfsed
markerid; Tandem(kordus)järjestus (STR) ja SNP (ühenukleotiidne erisus/varieeruvus).
Konspekt + Õp lk 50 - 56. Tuvastamine: vt vihikust STR, SNP jms.
DNA sõrmejälgede metoodika- põhineb nähtusel, et iga inimese sõrmejärljed on
kordumatud. Genoomis palju muutlikke piirkondi, mida saab eristada fragmentide pikkuse
järgi. Genoomi restriktaasidega töödeldes saadakse eri pikkusega DNA-fragmendid, mille
pikkusemuster on eri indiviididel erinev.
POLÜMORFSED MARKERID- kahe või enama alleelina esinev tunnus
STR- lühike kordusjärjestus; suur varieeruvus, et iga indiviid on teistest eristatav. Analüüsi
käigus kordistatakse proovis kindlaid DNA järjestusi.
SNP- üksiku nukleotiidi polümorfismid. Haigusi ei põhjusta enamasti, kuid aitavad kindlaks
määrata haigestumise tõenäosust.
7. Transgeensed organismid, GMO (geneetiliselt muundatud organismid - õp lk 38-46),
positiivsed küljed ja ohud. (vt üldine, kogu materjali esitlus). Geneetiliselt muundatud
organismide loomise eesmärgid: näited taimedest, loomadest, bakteritest (nendega
saavutatust) - õp . Konspekt, üldine, kogu materjali esitlus ja õp lk 38 – 46.
TRANSGEENSED ORGANISMID- organism, kelle genoomi on molekulaarsete meetoditega
viidud võõr-DNA. Loomine põhineb rekombinantse DNA tehnoloogial. Siiratav geen tuleb
ühendada niisugusesse DNA- või RNA- kompleksi, mis saab siseneda rakku ja integreeruda
selle genoomi.
GMO- transgeensed organismid, millel ilmneb mingi uus tunnus.
GMO- vastupidine transgeneesile, neil rikutakse mingi kindla geeni struktuur suunatud
mutatsiooni abil. Funktsioon kaotatakse. (Geeninokaut)
TRANSGEENSED TAIMED: põllumajanduslikel ja kultuurilistel eesmärkidel (parem kvaliteet,
taluvus, vastupidavus jms)
8. Geenitehnoloogia seos meditsiiniga, geeniteraapia (õp lk 49-50). Geeninokaut,
geenivaigistus (lk 47 ja 50). Konspekt ja õp lk 47 – 50.
GEENINOKAUT- suunatud mutageneesiga tekitatav geenirike, mis geeniavaldumise välistab.
GEENIVAIGISTUS- kindlad mRNA-molekulide blokeerimine/ kiire lammutamine, mille
tulemusena geen ei avaldu.
GEENITERAAPIA- geenravi seisneb normaalselt talitleva geeni siirdamises raske geneetilise
puudega inimese mingi koe rakakudesse.
REPLIKATSIOON- kromosoomide koostisaine DNA kahekordistumine. Saadakse ühest
TRANSLATSIOON- RNA alusel valgu süntees tsütoplasmas paiknevatel ribosoomidel: RNA-lt valk. Lõpeb, kui
PÖÖRDTRANSKRIPTSIOON- geneetilise info ülekanne RNA-lt DNA-le. DNA süntees RNA järgi, tekib
GEENIVEKTOR- ehk siirdaja, DNA konstrukt. Kui soovitud geen on välja lõigatud, ühendatakse ta selisesse DNA-sse, mis saab siseneda rakku ja integreeruda selle genoomi.
Sarnased õppematerjalid
7
docx
BIOTEHNOLOOGIA
1. Bakteri plasmiidiga – plasmiidse vektori abil
2. Viirustega – viirusvektori abil
3. Kullapüstoliga – Au kuulikesele on kinnitatud DNA, see “tulistatakse” rakku
4. Taimedesse Agrobakteriga – taimi kergesti nakatav bakter
5. Homoloogiline rekombinatsioon – Dna molekuli homoloogiliste piirkondade vaheline
ristsiire, kus rekominantne DNA asendab olemasoleva
Erinevate DNA-de liitmisel same rekombinantse DNA.
Kuidas DNA-d lõigata?
Restriktaasid on ensüümid, mida toodavad bakterid enesekaitseks. Restriktaase on erinevaid,
igaühel oma “äratundmiskoht” DNA-l. Restritaasid lõikavad DNA sagely nii, et tekivad
üheahelalised otsad - “kleepuvad otsad”. Selliste otstega DNA lõike on komplementaarsuse tõttu
võimalik mugavalt liita.
Kuidas kergesti aru saada, et soovitud geen on
üle kandunud?
- üle viidavale geenile on markergeen
külge pandud (GFP-geen).
Miks bakterirakus ei hakka inimese geen kohe
tööle?
8
doc
Biotehnoloogia kontrolltöö nr 1
Kasutatakse ka psühholoogias ja pedagoogikas. Biokeemiat ja biofüüsikat kasutatakse
elusolendite koostise ja talutuse keemilisi ja füüsikalisi aluseid. Teine seos on rakenduslik,
selle alla kuulub meditsiin, veterinaaria, põllumajandus ja toiduainete töötlus.
Põllumajandus- * bakterid silo valmistamisel
*mügarbakterid küntakse mulda
*biotõrje: linnud hävitavad kahjureid, seente ensüümid peletavad
putukaid ja seenhaigusi.
Toiduainetes- *hapendamine (kurk, kapsas)
*bakterijuuretis (vein, juust)
Ravimitööstuses- *antibiootikum (ravimid, mida kasutatakse bakterhaiguste raviks)
*vaktsiinide tootmine
*insuliin
Energeetikas- *kütused (metaan ja etanool)
*biogaas (loomasõnnik, erinevate taimede jäägid)
*pesuvahendid (pesupulbrid, geelid jne)
26
ppt
REPLIKATSIOON, TRANSKRIPTSIOON, TRANSLATSIOON
html
DNA struktuuri avastamine
1953. a. kirjeldasid James Watson ja
Francis Crick DNA ruumilist
struktuuri.
Watson ja Crick
Replikatsioon on DNA kahekordistumine enne raku
jagunemist.
DNA ahel koosneb nukleotiididest:
lämmastikalus:
fosfaatrühm A; G; C või T
suhkur: desoksüriboos
Lämmastikalused
A adeniin G - guaniin
T tümidiin C - tsütosiin
Kus toimub replikatsioon?
Seal, kus leidub DNA-d
tuumas,
tuumapiirkonnas,
kloroplastides,
mitokondrites.
Uus DNA ahel sünteesitakse vastavalt
komplementaarususele.
A -T G-C
T-A C-G
A T G G C A C G C T G A A C C A T G C
T A C C G T G C G A C T T G G T A C G
Ensüüm helikaas tekitab ahelate laialimineku.
Kumbki ahel moodustab ensüümi DNA-polümeraas
toimel enda komplementaarse koopia.
DNA kaksikheeliks
DNA polümeraas
helikaas
Replikatsiooni etapid:
50
docx
Geenitehnoloogia eksami kordamisküsimused
lagunemine madalamat järku struktuuriks
(muna keetmisel munavalge tahkub).
Vastupidine on renaturatsioon (juuksed
tõmbavad pärast sirgendamist mingi hetk uuesti lokki)
Ensüüm – valgulise ehitusega katalüsaator,
mis kiirendab biokeemilisi reaktsioone
kehas.
Valkude ülesanded:
Ensümaatiline (reguleerivad reaktsioonide kiirust – amülaas lagundab tärklist)
Stuktuurne (küüned, karvad, kõõlused, suled)
Kaitsefunktsioon (antikehad, verehüübimisvalgud)
Varuaine (munavalge)
2
odt
Pärilikkus ja DNA
DNA polümeraas toodab uue DNA ahela
Replikatsiooni etapid:
Ensüüm helikaas lõhub DNA biheeliksi kaheks ahelkas.
Ensüüm DNA polümeraas sünteesib mõlema DNA ahelaga komplementaarsed uued DNA ahelad.
Replikatisooni tulemusena tekib ühest DNA molekulist kaks identset DNA molekuli.
Replikatsiooni alguspunkti nimetatakse replikoniks.
DNA reparatsioonis ehk DNA polümeraasi vigadeparanduses polümeraas kontrollib, kas uus
sünteesitud ahel on komplementaarne vana ahelaga.
RNA süntees ehk transkriptsioon:
Transkriptsioon on DNA ühe ahela alusel komplementaarse RNA süntees.
Transkriptsiooni komplementaarsus A=U T=A G=C C=G U- uratsiil
Transkriptsioon algab promootor piirkonnas.
Transkriptsioon lõppeb terminaator piirkonnas.
Transkriptsiooni etapid:
Lisandub ensüüm RNA polümeraas, mis seondub DNA ahela promootor piirkonnaga.
Ensüüm keerab DNA biheeliksi lahti.
RNA polümeraas sünteesib 1 DNA ahela lõiguga ehk geeni komplementaarse RNA molekuli.
32
doc
Geenitehnoloogia kordamisküsimuste vastused
kahe antiparalleelse omavahel komplementaarse ahela kujul (st kohakuti paiknevad
ahelate A ja T ning G ja C nukleotiidid), sest lämmastikaluste vahel moodustuvad
komplementaarsusprintsiibist lähtudes vesiniksidemed. DNA süntees toimub
tavaliselt replikatsiooni teel, mida viib läbi DNA polümeraas. DNA lagundamine
toimub nukleaaside abil (vt endonukleaas, eksonukleaas, restriktaas, apoptoos).
DNA sekundaarstruktuuri muutvad ensüümid on DNA ligaasid, helikaasid, güraasid.
Päriliku info säilitamine ja selle täpne ülekanne tütarrakkudele. Nukleiinhapete
sünteesil on kindel suund: 5´ (prim) ots + 3´ (prim) ots. Ahelad on antiparalleelsed:
üks ahel:-5´ ots, teine-3´ots ja komplementaarsed A=T, C=G. Kõiki DNA molekule
rakus sünteesib DNA polümeraas.
DNA´l on kolm struktuuri:
DNA esmane struktuur -esineb rakus sünteesiprotsessides ja teatud
viirustes.
16
pdf
DNA ja RNA
Suhkur: riboos
A- adeniin, G- guaniin, C- tsütosiin, U-uratsiil
-U-C-A-G-U-A-G-C-
-A-G-U-C-A-U-C-G
A-U; T-A; C-G; G-C
DNA, GEEN
DNA on päriliku info kandja.
Geen on DNA- molekuli lõik, mis osaleb organismi ühe või mitme tunnuse
kujunemises
Geenides sisalduva info alusel sünteesitakse organismis erinevate omadustega valgud,
mis osalevad organismi tunnuste kujunemises
Kromosoomid koosnevad DNAst ja sellega seotud valgumolekulidest
Mis on replikatsioon?
Replikatsioon on DNA kahekordistumine enne raku jagunemist.
tulemusena saadakse ühest DNA molekulist kaks ühesuguse nukleotiidse järjestusega
DNA molekuli.
Replikatsiooni etapid:
1. Ensüüm helikaas lõhub vesiniksidemed lämmastikaluste vahel ja keerab kaksikspiraali
lahti
Praimer - lühike (DNA või RNA) järjestus, mis on komplementaarne DNA järjestusega.
2. Ensüüm DNA-polümeraas seondub DNA ahelaga (vajab töö alustamiseks praimerit,
2
doc
Molekulaargeneetika alused
Seejuures ei
saa keskkonnatingimused ilma vajalike geenideta tunnust välja arendada. Kui inimesel on pärilik
kurtus, ei saa teda kuulma õpetada. Samas rasvtõbi ei pruugi olla päritav.
6. Mille poolest erinevad genotüüp ja fenotüüp?
Genotüüp on ühele isendile omaste geenide ja nende erivormide kogum. Fenotüüp on ühe isendi
vaadeldavate tunnuste kogum.
7. Mis on replikatsioon?
Replikatsioon on matriitssüntees, mille tulemusena saadakse ühest DNA molekulist kaks ühesuguse
nukleotiidse järjestusega DNA molekuli. See tagab rakujagunemise käigus päriliku info võrdse
ülekande lähterakust tütarrakkudesse.
8. Mis on transkriptsioon?
Transkriptsioon on matriitssüntees, mille käigus saadakse DNA molekuli ühe ahela nukleotiidse
järjestusega komplementaarne RNA molekul. Selle käigus saadakse mRNA, rRNA, tRNA molekulid.
9. Mis on translatsioon?
Meedia
Kommentaarid (0)
Kõik kommentaarid