DNA
reparatsioon DNA reparatsioon ehk DNA parandamine on protsess, mille käigus eemaldatakse DNA-s
erinevatel põhjustel tekkinud kahjustusi. DNA-s tekib pidevalt kahjustusi, mis kinnistuvad
järgmise replikatsioonitsükli jooksul mutatsioonidena.
Mutatsioonid on muutused organismi
genoomse DNA nukleotiidses järjestuses, mis kinnituvad ja millega võivad kaasneda
vaadeldava kogumi tunnuste muutused. Looduses on
mikroorganismide
kasv
limiteeritud,
kuna
keskkonnatingimused on enamasti ebasoodsad. Põhilised
kasvu limiteerivad tegurid on ebasoodne temperatuur, pH ja
osmolaarsus . Samuti on piiratud toitainete kättesaadavus.
Seega ei saa
bakterid looduses pidevalt paljuneda ja on
puhkavas seisundis ehk statsionaarses faasis. Sellises
olukorras on eelistatud bakterid, kes suudavad piisavalt kiiresti
kohaneda
olemasolevate
keskkonnatingimustega.
Mutatsioonide tekkesageduse tõusu põhjustavad näiteks
erinevad
kemikaalid , kiirgus, oksüdatiivsed kahjustused. Et
toime tulla erinevate DNA kahjustustega, on
mikroorganismidel
välja
kujunenud
mitmeid
reparatsioonisüsteeme, et tekkinud vead parandada. Samuti on neil olemas vigaderohked
DNA polümeraasid, mis on võimelised sünteesima üle DNA kahjustuste ja seetõttu
replikatsioon ei peatu.
DNA kahjustuste allikad.DNA-d kahjustatakse pidevalt nii rakusiseste protsesside kui ka välistegurite poolt.
Hinnanguliselt toimub inimese igas rakus iga päev 10000 kuni
1000000 DNA kahjustamise
sündmust, mis üldjuhul kõik ära parandatakse. Peamised DNA kahjustuste põhjustajd on:
1)
Oksütatiivne stress . Seda põhjustavad keemiliselt aktiivsed ja ebastabiilsed hapnikuühendid
Üldiselt on rakkudes süsteemid, mille ülesandeks on nende vaheühendite lagundamine ja
neutraliseerimine, aga sellele vaatamata pääsevad mõned DNA-d kahjustama. 2)
UV kiirgus,
mis põhjustab
ristsidemeid DNA ahelas kõrvutiasetsevate pürimidiinide vahel. 3)
Ioniseeriv kiirgus põhjustab DNA kaheahelalisi katkeid. Ainuüksi loodusliku
radioaktiivsuse fooni tõttu
saab meie keha iga päev umbes 200 miljonit korda kiiritada. 4)
DNA aluste hüdrolüüs jakõrgendatud temperatuur viivad DNA aluste eemaldamiseni või nende keemiliste omaduste
muutuseni.5) Samuti võib
kokkupuutumine erinevate kemikaalidega, mis modifitseerivad
nukleotiide või seonduvad DNA-ga ning indutseerivad katkeid või ristsidemeid DNA
ahelates. 6)
Vead DNA replikatsioonis. Kõik DNA polümeraasid teevad vigu, mille nad küll
tavaliselt ise ära parandavad, kuid osad jäävad need siiski alles ning tekitavad olukorra, kus
DNA erinevatel ahelatel on omavahel mittepaarduvad
nukleotiidid .
DNA reparatsioonisüsteemidDNA
ahelal olevate vigastuste parandamiseks on kolm peamist süsteemi:
Base excision repair (BER), mille käigus eemaldatakse DNA
ahelast üksik
kahjustatud
nukleotiid mis asendatakse uuega.
Nucleotide excision repair (NER), mille käigus asendatakse DNA kahjustuse
ümbrusest umbes 30 nukleotiidi
pikkune üheahelaline DNA lõik.
Mismatch repair (MMR) kõrvaldab vigastused, mis on tekkinud DNA
replikatsiooni või rekombinatsiooni käigus. Nendel juhtudel pole kumbki DNA
ahel otseselt
vigane , kuid nad ei paardu omavahel.
Kõik kommentaarid