Geneetika
GENEETIKA
Geenide klassifikatsioon
1. Seoste alusel määravate tunnustega
:
a) 1 geen 1 tunnus nn monogeensed tunnused.
Alternatiivsed tunnused süsteemis +/- , millel on vähene fenotüübilise muutlikkuse aste. Nt.
Vererühmad, osa immuunfaktoreid.
b) mõned geenid 1 tunnus (alla 10 geeni)
Oligogeensed tunnused. Nt. Mitmest polüpeptiidist koosnevad valgud.
c) palju geene 1 tunnus
Tunnused, millel populatsioonis on suur muutlikkuse aste ja lai reaktsiooni norm. Nt. IQ, kasv,
kaal, nahapigment jne.
d) 1 geen osaleb paljude tunnuste määramises.
Geenil on polüfeenne toime. Nt. Pigmendisünteesi määrav geen. See avaldub juustel, nahal, silma
vikerkestas ja mujal. Geen määrab ära valkude esmase e. primaarstruktuuri, ülejäänud struktuurid
formeeruvad iseseisvalt, valkude baasil.
2. Struktuur- ja modifikaatorgeenid
:
a) struktuurgeenid määravad ära polüpeptiidahelate sünteesi, mis otseselt või kaudselt osalevad
vastavate tunnuste kujunemises,
b) regulaatorgeenid kontrollivad ja mõjutavad struktuurgeenide avaldumist.
3. Terviklikud ja mosaiiksed geenid
:
a) terviklik – puuduvad mitteinformatiivsed nukleotiidsed järjestused;
b) mosaiikne (katkendlik) – informatiivsed järjestused vahelduvad mitteinformatiivsetega, mis
iRNA-st välja lõigatud.
Geenide omadused
Geeni ekspressiivsus s.o geeni poolt määratud produkti fenotüübilise avaldumise aste.
Erinevates rakkudes ekspresseeruvad erinevad geenid. Kui geen ei ekspresseeru, siis ta on
penetrantne. Nt kiilaspäisuse geen naistel.
Geene iseloomustab 2-kordistumine DNA replikatsioonis.
Geene iseloomustab muutlikkus – nii mutatsiooniline kui kombinatiivne.
Geene iseloomustab konservatiivsus st. muutuste vältimine.
Geene iseloomustab pleiotroopsus – 1 geen osaleb üheaegselt paljude tunnuste kujunemisel.
Alleel – geeni eri vorm (id) (mõiste alleelsed geenid)
Dialleelsus – diploidsest organismist lähtuvalt st. et diploidses organismis on antud geenil 2
samasugust või erinevat alleeli, mis paiknevad homoloogiliste kromosoomide paari liikmete
samades asukohtades.
Polüalleelsus – iseloomustab liiki, populatsiooni jne. Organismirühmas võib 1geen esineda
rohkem kui 2 alleelse vastandina.
Dominantsus – s.o alleelsete geenide vastasmõju, mille puhul fenotüübis alati ilmnevat tunnust
määravat alleeli nim dominantseks.
1
Geneetika
Retsessiivne – alleel, mis: a) avaldub fenotüübis, kui puudub vastav dominantne alleel st.
mõlemad vaadeldavad alleelid on retsesiivsed
b) avaldumist surutakse dominantse alleeli poolt alla ja seda juhul kui
1 alleel on dominantne ja teine retsesiivne.
Lookus – geeni asupaik kromosoomis.
Homoloogilistes kromosoomipaari samades lookustes paiknevad alleelsed geenid, mis võivad olla:
a) ühesuguste alleelidega
b) erinevate alleelidega
Homosügootsus – olukord, kus homoloogiliste kromosoomide samades lookustes paiknevad ühe
geeni samad alleelid (mõlemad retsessiivsed või dominantsed)
antud alleelipaaride suhtes homosügootne isend toodab ühte tüüpi
sugurakke
antud alleelipaaride suhtes homosügootsete isendite ristamisel
järglaskonnas selle suhtes lahknemist ei toimu.
Heterosügootsus - olukord, kus homoloogiliste kromosoomide samades lookustes paiknevad ühe
geeni erinevad alleelid - üks retsessiivne teine dominantne (alleelide paiknemine on vaba)
antud alleelipaaride suhtes heterosügootne isend toodab võrdse
tõenäosusega erinevaid sugurakke (50% retsesiivseid ja 50%
dominantseid alleele)
antud alleelipaaride suhtes heterosügootsete isendite ristamisel
ilmneb järglaspõlvkonnas selle tunnuse osas lahknemine
heterosügootsuse aste tõuseb seoses sellega, mida erinevama
geneetilise materjaliga isendid ristuvad
Genotüüp – raku, organismi kõigi pärilike faktorite kogu ja koostoime.
Kitsas mõiste: tuumas paiknevad pärilikkusfaktorid
Lai mõiste: - nii tuuma kui tütoplasma pärilikkus
-
tuumaväline (nii mitokondrite kui kloroplastide DNA)
Sügoodi varases staadiumis ka ooplasma segregatsioon e. munaraku tsütoplasma mõju geeni
transkriptsioonile.
Fenotüüp – s.o raku, organismi kõigi tunnuste kogusumma.
Nii mikro- kui makroskoopilised, nii sise- kui välistunnused. Konkreetne fenotüüp ei pärandu,
fenotüüp on määratud: 1) genotüübiga 2) ümbritseva keskkonna poolt
Genoom – haploidne kromosoomistik:
-
inimesel üks saadud isalt, teine emalt
-
naisel on 2 sarnast, mehel 2 erinevat genoomi (sugukromosoomid!)
Genoom ja genotüüp on 2 erinevat mõistet: genoom on struktuurne, genotüüp aga informatiivne
mõiste, genoom on mahuliselt väiksem
Geenifond – alleelide kvalitatiivne erinevus ja kvantitatiivne suhe organismirühmas, mis kujundab
selle organismirühma geneetilise struktuuri. Iseloomustab liiki, rassi, populatsiooni, mitte üksikut
organismi!
Feenifond – organismirühmale iseloomulike tunnuste spekter, mis on määratud selle
organismirühma geenifondi ja konkreetsete elutingimuste poolt.
2
Geneetika
KLASSIKALINE GENEETIKA e
heterokromosomaalne pärilikkus
Klassikalise ja molekulaargeneetika kujunemine
Geneetika on suhteliselt noor teadus. 19. sajandi keskel uuris Brnos (Tsehhimaal) augustiinlaste kloostri munk
Gregor Mendel (1822-1884), kes oli ka loodusteadlane ja kooliõpetaja, milliste seaduspärasuste alusel kanduvad
organismide tunnused üle järglastele. Mendel katsetas erinevate taimedega ja isegi mesilastega, kuid edu saavutas ta
siiski eeskätt aedhernestega. Katsed hernestega olid lõpule viidud juba 1863. aastaks. Mendel kulutas veel paar aastat
tulemuste analüüsimiseks, kuid kahjuks ei pälvinud tema artikkel tähelepanu selle sajandi alguseni.
Kuigi pärilikkuse põhilised seaduspärasused esitas Gregor Mendel aastal 1865, tuleb geneetika sünniks lugeda siiski 20-
nda sajandi algust. Alles siis taasavastati Mendeli ideed, mis said aluseks klassikalisele geneetikale. Tõendid selle
kohta, et DNA kannab geneetilist informatsiooni, saadi 20-nda sajandi keskel. Aastal 1900 otsisid sõltumatult kolm
botaanikut
Hugo de Vries Hollandist,
Carl Correns Saksamaalt ning
Eric von Tschermak-Seysenegg Austriast
varem publitseeritud andmeid, mis kinnitaksid nende endi katsetulemusi pärilikkuseteoorias ja leidsid, et Gregor
Mendel oli samad seaduspärasused kirjeldanud juba 35 aastat tagasi. Nüüd levisid Mendeli ideed kiiresti ja seda eeskätt
tänu inglise bioloogi
William Batesoni aktiivsele tutvustustööle. Pärilikkuseteaduse asemel võeti kasutusele uus termin
geneetika (tuleneb kr. keelsest sõnast tähendusega “tekitama”).
1944. aastal kirjeldasid Avery ja ta kolleegid katseid, kus nad uurisid bakterite (Streptococcus pneumoniae)
transformatsiooni puhastatud DNA-ga. Hersey ja Chase poolt aastal 1952 avaldatud tulemused kinnitasid seda, et DNA
on pärilikkuse kandja. Nad näitasid, et bakteriviiruse T2 geneetiline informatsioon säilub DNA-s. 1953-ndal aastal
avaldasid James Watson ja Francis Crick DNA kaksikhelikaalse struktuuri. Need avastused ja geneetilise koodi
deshifreerimine said aluseks molekulaargeneetika sünnile. Uute molekulaarsete meetodite väljatöötamine 70-ndatel ja
80-ndatel aastatel on võimaldanud kasutusele võtta rekombinantse DNA tehnoloogia, täiustusid meetodid, mis
võimaldavad määrata nukleiinhapete primaarstruktuuri. 1985-nal aastal Kary Mullise poolt väljatöötatud PCR
(polümerase chain reaction) meetod võimaldab lühikese ajaga amplifitseerida spetsiifilisi DNA segmente väga väikesest
algmaterjali kogusest. Uute meetodite arsenal kasvab pidevalt, võimaldades üha täpsemalt selgitada geeneetiliste
protsesside toimumist molekulaarsel tasemel. Ka geeni definitsioon on alates Mendeli poolt kasutatud ?pärilikkuse
ühikust? (siis veel terminit ?geen? ei tuntudki) pidevalt täiustunud.
MENDELI SEADUSED
Põhipostulaadid:
kujutab endast alleelipaaride ümberjaotamist sugulisel sigimisel, mis on põhjustatud
homoloogiliste kromosoomide lahknemisest meioosis ja nende juhudlikust kombineerumisest
viljastumise käigus;
lähtub kombineeritud muutlikkuse II alatasemest. Ristsiire puudub;
interkromosomaalses pärilikkuses on pärilikud faktorid üksteisest sõltumatud s.t nad ei liitu ega
kao vaid lahknevad ja ühinevad uutesse kombinatsioonidesse.
Kromosoome vaadeldakse antud geeni suhtes kui tervikut s.t kehtib seaduspära:
1 tunnus = 1 geen = 1 kromosoom
Eeltingimused nende seaduste kehtimiseks:
1. lähtevormid peavad olema homosügootsed uuritavate geenide suhtes;
2. kõikide gameeditüüpide teke peab toimuma võrdse tõenäosusega ja gameetide eluvõime võrdne
ühega;
3. viljastumine peab olema absoluutselt võrdne protsess;
4. tekkinud sügoodid peaks olema võrdse elujõuga.
3
Geneetika
Mendel kasutas hübridiseerimismeetodit s.t ristas erinevate pärilike omadustega organisme ja
uuris nende tunnuste avaldumist ja päritavust järglastel. Oma katsetes kasutas ta herneid ja
hunditubakat.
Mendeli edu tulenes õnnestunud objekti valikust. Aedherne eripäraks on see, et tema õite
kroonlehed on allapoole tihedalt suletud, vältimaks tolmuterade väljumist ja võõraste sisenemist.
Selline süsteem tagab
iseviljastumise, kus nii munarakk kui ka seemnerakk pärinevad samast õiest.
Erinevalt teistest bioloogidest, kes püüdsid korraga jälgida mitmete väga erinevate tunnuste
pärandumise seaduspärasusi, kontsentreerus Mendel vähestele hästieristuvatele parameetritele –
taimede pikkus, seemnete värvus.
Mendel ristas kõrgekasvulisi hernetaimi kääbuskasvulistega. Järglaskond oli kõrgekasvuline sõltumata sellest,
kas tolmuterad, mida kasutati viljastamiseks, pärinesid kõrgekasvuliselt hernelt ja tolmendati kääbuskasvulise taime õisi
või vastupidi. Kõrgekasvulise järglaskonna puhul toimus iseviljastumine ning järgmises põlvkonnas ilmnes tunnuste
lahknemine. 1064-st järglasest 787 olid kõrgekasvulised ja 277 kääbused, lahknemissuhe oli ligikaudu 3:1. Mendel
märkas, et kääbuskasv võib hübriidides esineda latentsena, olla varjutatud faktori poolt, mis määrab taimede kõrge
kasvu. Latentne faktor oli retsessiivne ja avalduv faktor dominantne. Mendel järeldas, et hübriidsete taimede
järglaskonnas pidi olema toimunud dominantse ja retsessiivse faktori lahknemine. Kuidas teisiti oleks võimalik seletada
kääbuskasvuliste järglaste ilmumist.
Mendel kordas katseid aedhernega ka teiste tunnuste pärandumise seaduspärasuste uurimiseks. Ta viis läbi
seeria monohübriidseid ristamisi erinevate vastandlike tunnuste suhtes, jälgides seemnete tekstuuri, värvust, kaunade
kuju ja värvust, õite värvust ja asukohta. Kõigil juhtudel avaldus hübriidsete taimede tunnuste puhul üks vastandlikest
omadustest ning hübriidide iseviljastumise tulemusena saadud järglaskonnas toimus faktorite lahknemine suhtega 3:1.
Hiljem, 1909. aastal võttis Taani taimearetaja W. Johannsen nende faktorite asemel kasutusele termini geen, mille
retsessiivseid ja dominantseid vorme hakati nimetama alleelideks (kr. keeles “üks teisest”).
Mendel tegi oma katsetulemustest ka teise olulise järelduse: geenid esinevad paaridena. Taimed, mida ta kasutas
ristamiseks, sisaldasid kahte identset geenikoopiat. Kaasaegse terminoloogia kohaselt olid need taimed diploidsed ja
homosügootsed. Gameetides säilus aga ainult üks geenikoopia, need rakud olid kaasaegse terminoloogia põhjal
haploidsed. Geenide diploidsus taastus sügoodi moodustumisel. Kui munarakk ja seemnerakk pärinesid geneetiliselt
erinevatelt taimedelt, sisaldas sügoot kahte erinevat alleeli, millest üks pärines isalt ja teine emalt. Selline järglaskond
oli heterosügootne.
Mendel uuris 9 tunnuspaari pärandumist nii kvalitatiivselt kui kvantitatiivselt:
kvalitatiivselt - seemnete värv, õite värv, seemnete pind;
kvantitatiivselt – varte ja kaunade pikkus
Selleks, et tähistada pärilikkusefaktoreid, kasutas Mendel sümboleid. Geneetiliste sümbolite
kasutamise kõige üldisemad printsiibid on tänapäevani säilunud.
sümbolid:
P – partens – vanemad
F – filia – tütar, filiales – poeg
F1 – I põlvkond
F2 – II põlvkond
♀ - peegel & lauake – emane
♂ - kilp & oda – isane
X – ristamine
AaBbCc – geenivalem
Genotüüp tähekombinatsioonidena
Fenotüüp paigutatakse genotüübi alla sõnadega
Näiteks taimede kasvu mõjutavaid alleele märgitakse järgmiselt: d – kääbuskasv (d pärineb inglise keelsest
sõnast “dwarfness”, kääbusus); D - dominantne kõrget kasvu määrav alleel. Üldiselt lähtutaksegi sellest, et alleeli
tähistus tuleneb retsessiivsest tunnusest. Seega märgitakse kõrgekasvuliste ja kääbuskasvuliste taimede alleelset koostist
e. genotüüpi vastavalt DD ja dd. Tunnuste ilmetüüpi, antud juhul siis kõrget või kääbuskasvu, nimetatakse isendite
fenotüübiks.
Ristamises osalenud vanemaid (inglise keeles “parents”) tähistatakse tähega P – P
generatsioon. Nende hübriidset järglaskonda tähistatakse F1, tähistus tuleneb ladinakeelsest
4
Geneetika
terminist. F1 põlvkond on genotüübilt Dd ja fenotüübilt kõrgekasvuline nagu DD genotüübiga
vanematel. F1 järglased produtseerivad kahte tüüpi gameete – D ja d genotüübiga, alleelid D ja d
lahknevad e. segregeeruvad teineteisest sõltumata. Iseviljastumise tagajärjel liituvad gameedid
erinevates kombinatsioonides, produtseerides nelja tüüpi sügoote: DD, Dd, dD ja dd. Munarakust
pärinev alleel märgitakse tavaliselt esimesena. Kuna D on dominantne alleel, siis on kolme esimese
genotüübi puhul järglaskond ühesuguse fenotüübiga – kõrgekasvuline. Ainult genotüübi dd korral
avaldub kääbuskasv. Seega on iseviljastumise teel saadud järgmine generatsioon F2 kas
kõrgekasvuline või kääbuskasvuline lahknemissuhtega 3:1. Alleelide segregeerumise bioloogiliseks
aluseks on homoloogiliste kromosoomide paardumine ja sellele järgnev lahknemine tütarrakkudesse
meioosiprotsessis.
Seega kehtivad Mendeli poolt teostatud monohübriidsetel ristamistel kaks printsiipi:
1.
Dominantsuse printsiip – heterosügootides esineb üks alleelidest varjatud kujul.
2.
Segregeerumise printsiip – kaks erinevat alleeli segregeeruvad heterosügootide gameetide
moodustumisel.
Neid kahte printsiipi tuntakse ka Mendeli I ja II seadusena:
Mendeli I seadus e. ühetaolisuse seadus – Erinevate homosügootsete isendite ristamisel on
esimese põlvkonna järglased F1 kõik ühetaolised heterosügoodid sõltumata ristamise suunast.
Mendeli II seadus e. lahknemisseadus – Heterosügootide (hübriidide) järglaskonnas toimub
geneetiline lahknemine, nii et kindlates sagedussuhetes tekivad nii homosügootsed kui ka
heterosügootsed isendid.
MONOHÜBRIIDNE RISTAMINE
Jälgitakse ühe geenipaari pärandumist, mis fenotüübilt avaldub tunnuste edasikandumises
järgmisse põlvkonda. Eeltingimuseks vanemvormide homosügootsus antud tunnuspaaride suhtes.
Jälgime herneseemne värvusgeeni, mis esines 2 alleelina:
A – kollane, a – roheline
MENDELI I SEADUS e ühtlikkusseadus:
Sugurakud kombineeruvad vabalt ja täiesti
juhuslikult.
P: AA x aa
kollane roheline
A A a a
F1: Aa
kollane
Homosügootsete vanemate monohübriidsel ristamisel on hübriidpõlvkond ühetaoline.
Genotüübilt on heterosügoodid
Fenotüübilt :a) ühtlikud ühe vanemaga domineerimise korral
c) vanemate vahepealsed intermediaarsuse või kodomineerimise korral
MENDELI II SEADUS:
5
Geneetika
Organism moodustab võrdse tõenäosusega
mõlemat tüüpi sugurakke.
Sugurakud kombineeruvad vabalt ja
sõltumatult.
Liikmed korrutatakse omavahel läbi.
F1: Aa x Aa
kollane kollane
A a A a
F2: AA Aa Aa aa
kollane roheline
1 : 2 : 1 genotüüp (kokkuleppel dom. ees)
1: 3: 1 fenotüüp
Esimese põlvkonna hübriidide (F1) omavahelisel ristamisel ilmneb teises hübriidpõlvkonnas
(F2) lahknemine nii, et moodustuvad kõigi vanemvormide (P, F1) taolised isendid
genotüübilise suhtega 1:2:1 ja fenotüübilise suhtega 3:1.
Mendeli seadusest lähtuv alleelide koostoime:
1.
Intermediaarsus
– vanemorganismiga võrreldes vahepealsete tunnuste ilmnemine.
Imelill
P: valged x punased
(kroonlehed)
roosa x roosa
1 valge : 2 roosat : 1 punane
s.o alleelide vahelise koostoime effekt.
Tavaliselt retsetiivne alleel häirib dominantse alleeli täielikku avaldumist
minorka tõugu kanad
P: valge (emane ♀) x must (isane ♂)
sinakashall x sinkashall
andaluusia kanad
1 valge : 2 sinakashalli : 1 must
2.
Kodominantsus
– hübriididel ilmnevad mõlema vanema tunnused üheaegselt.
Karusloomad: naaritsa ja rebasetõud
P: valge x must
F1: mustavalgekirju x mustavalgekirju
F2: 1 valge : 2 kirjut : 1 must
ABO vererühmasüsteem
P: AA x BB
(A-rühm) (B-rühm)
F1: AB x AB
F2: 1 AA : 2 AB. : 1 BB
3.
Analüüsiv ristamine
– tundmatu genotüübiga isendi tagasiristamine kaksikretsetiivse
genotüübiga isendiga (uuritavat tunnust määravate geenide suhtes).
6
Geneetika
See on valdavalt seotud põllumajandusega.
Aa ja AA fenotüübilt ühesugused. Tõuloomade puhul obligatoorne AA – tõutunnuseid määravad
geenid peavad olema homosügootsed.
Oluline, sest:
P: AA x Aa
tõuloom
tavaline
F1: AA Aa AA Aa →fenotüübilt tõuloomad
P: Aa x Aa
tavaline
tavaline
F1: AA Aa Aa aa→25% defektseid isendeid
Eriti oluline loomade puhul, sest põlvkonnas on vähe isendeid ja isendid omavad materiaalset
väärtust.
30-ndatel osteti Taanist sugupull Adolf, kes oli heterosügoot karvatuse suhtes. ¼ järglasi letaalsed.
Analüüsiv ristamine:
P: AA x aa
uuritav isend
F1: 4 Aa
Lahknemist ei toimu
P: Aa x aa
F1: 2 Aa 2aa
I-põlvkonnas lahknemine 1:1
POLÜHÜBRIIDNE RISTAMINE
Dihübriidne ristamine:
sõltumatu lahknemise seadus e. vaba kombineerumise seadus (Mendeli III seadus)
Mendel viis läbi ka selliseid ristamisi, kus taimed erinesid teineteisest rohkem kui ühe
tunnuse osas. Ta ristas kollaste ja siledate seemnetega herneid roheliste ja krobeliste seemnetega
hernestega. Katse eesmärgiks oli kontrollida, kas kaks tunnust, seemnete värvus ja tekstuur
päranduvad sõltumatult. Kuna F1 põlvkonna taimede seemned olid kollased ja siledad, olid vastavad
alleelid dominantsed. F1 põlvkonnas ilmnesid neli erinevat fenotüüpi: vanematega sarnased kollased
ja siledad ning rohelised ja krobelised ja kaks uut kombinatsiooni – rohelised ja siledad ning
kollased ja krobelised. Seega olid värvus ja tekstuur kontrollitud erinevate geenide poolt, mis
kandusid järglaskonda sõltumatult. Toimus ka mõlemate geenide alleelide lahknemine. Sellist kahe
tunnuse suhtes jälgitavat ristamist nimetatakse dihübriidseks ristamiseks.
Jälgitakse kaht tunnust määravate geenide pärandumist ja kombineerumist (tunnused
sõltumatud).
A kollane
a roheline
värvusgeen
B sile
bkrobeline
pinnase kuju
Näide: Vanemad on antud geenide suhtes homosügoodid
P: AABB x aabb
kollane, sile roheline, krobeline
AB
ab
7
Geneetika
F1: AaBb x AaBb
kollane, sile kollane, sile
AB Ab aB ab AB Ab aB ab
Homosügoot toodab ühte tüüpi sugurakke.
Esindatud on kõik genotüübis leiduvad
alleelid ühes korduses. Kombineeruvad vabalt
ja sõltumatult.
Isend moodustab kõikvõimalikke sugurakke
erinevates kombinatsioonides, kusjuures
arvestada tuleb kõiki variante. Kuna
sugurakud kombineeruvad vabalt ja
sõltumatult (4x4), tekib 16 erinevat
kombinatsiooni
Lahknemine F2 põlvkonnas dihübriidsel ristamisel.
AB
Ab
aB
ab
AB
AABB
AABb
AaBB
AaBb
kollane, sile
kollane, sile
kollane, sile
kollane, sile
Ab
AABb
AAbb
AaBb
Aabb
kollane, sile kollane, krobel.
kollane, sile
kollane, krobel.
aB
AaBB
AaBb
aaBB
aaBb
kollane, sile
kollane, sile
roheline, sile
roheline, sile
ab
AABb
Aabb
aaBb
aabb
kollane, sile kollane, krobel.
roheline, sile
roheline, krobel.
F2 fenotüüp: 9: 3: 3: 1
Dihübriidne ristamine on vaadeldav tegelikult 2 sõltumatu monohübriidse ristamisena.
12 kollast : 4 rohelist
3:1
12 siledat : 4 krobelist
3:1
fenotüübi järgi: (3:1) x (3:1) = 9: 3: 3: 1
genotüübi järgi: (1:2:1) x (1:2:1) = 1:2:1:2:4:2:1:2:1
9 genotüübiklassi
MENDELI III SEADUS:
Kui homosügootsed ristatavad vanemisendid erinevad rohkem kui ühe tunnuse poolest, siis
moodustub F2 hübriidpõlvkonnas nende tunnuste kõikvõimalikud kombinatsioonid vastavalt
geenipaaride vabale ja sõltumatule kombineerumisele.
M III s kehtivus on piiratud: korraga saab sõltumatut pärandumist jälgida põhimõttel 1 geen 1
kromosoom süsteemis. Sõltumatult päranduvate tunnuste arv = homoloogiliste kromosoomipaari
arvuga genotüübis.
GEENIDE KOOSTOIME
Komplementaarsus – kahe või enama, tavaliselt dominantse geeni koosmõjul tekib uus tunnus.
8
Geneetika
Epistaas – ühes lookuses asuvad geenid suruvad alla või varjutavad teises lookuses asuvate
geenide fenotüübilise avaldumise.
Duplikaatsus – kahe või enam geeni toimivad tunnusele ühteviisi, kuid tunnuse avaldumine ei
olene toimivate geenide arvust e ei olene geeni doosist.
Polümeersus – mitu geeni mõjutavad ühte sama tunnust samasuunalislet, kusjuures
fenotüübiline efekt sõltub geenide hulgast e geenidoosist. Nt pigment taimedel ja
loomadel.
Geenide modifikatsiooniline toime - tunnuse kujunemist määravad põhigeenid ja
modifitseerunud geenid kas tugevdavad või nõrgendavad, kas suruvad täielikult alla
või ainult koosmõju tulemusena lubavad fenotüübis avalduda (s.o eelmise 4
kokkuvõte).
Genotüüp on koostoimiv integraalne süsteem.
POLÜHÜBRIIDSE RISTAMISE SEADUSPÄRASUSED
1. Alleelipaaride arv – 1,2,3,n
2. Gameeditüüpide arv - 2, 2², 2³
3. Gameedi kombineerumise arv - 4, 4², 4³
4. Genotüüpide arv - 3, 3², 3³
5. Fenotüüpide arv – 2, 2², 2³, 2ⁿ
Reaalselt läheb asi harva trihübriidse ristamiseni.
INTRAKROMOSOMAALNE PÄRILIKKUS
e. Morgani seadus
Üheks sajandivahetuse nimekamaks tsütogeneetikuks oli USA teadlane Thomas Hunt
Morgan.
Tema uuringute lemmikobjektiks olid äädikakärbsed. Nende väikeste putukate diploidses
kromosoomistikus on neli paari kromosoome ning nad paljunevad äärmiselt kiiresti. Järglaste suur
arvukus hõlbustab geneetikutel pärilikkuse statistiliste seaduspärasuste selgitamist. Morgan leidis,
et äädikakärbsetel on küllaltki palju selgelt väljendunud päriliike tunnuseid. Et aga kromosoome on
ainult neli paari, siis ei saa neid tunnuseid määravad geenid paikneda kõik erinevates
kromosoomides. Paratamatult peavad seetõttu ühes kromosoomis paiknevad geenid päranduma
järglastele edasi üheskoos.
Oma hüpoteesi kontrollimiseks tegi Morgan katseid äädikakärbestega, kellel esinesid erinevad
tunnused. Ta märkas, et tavaliselt on nendel putukatel hall keha ja pikad tiivad, kuid siiski õnnestus
tal öeida ka mõned mustakehalised lühikeste tiibadega kärbsed. Ta ristas neid omavahel ning sai
esimeses põlvkonnas hallikehalised pikatiivalised järglased. Esimese põlvkonna hübriidide
ristamisel ei saanud ta aga nelja erineva fenotüübiga järglasi oodatud suhtes 9:3:3:1, vaid peamiselt
kahesuguseid kärbseid: halle pikatiivalisi ja msuti lühitiivalisi. Lisaks nendele sai ta vaid väheseid
ümberkombineeritud tunnustega isendeid: halle lühitiivalisi ja musti pikatiivalisi. Mitmete
kontrollkatsetega jõudis Morgan järeldusele, et kehavärvust ning tiivapikkust määravad geenid
peavad paiknema ühes kromosoomis ja päranduvad seetõttu aheldunult.
Kui aga ühes kromosoomis asuvad geenid päranduvad tingimata koos, siis peaks hall
kehavärvus alati kaasnema pikkade tiibadega ning must kehavärvus lühikeste tiibadega. Paraku
leidis Morgan äädikakärbeste hulgast ka mõned halli kehaga lühitiivalised ning mustakehealised
9
Geneetika
pikkade tiibadega järglased. See viis teda mõttele kromosoomide võimalikkust katkemisest.
Hilisemad uuringud tõestasid tema arvamuse õigsust. Nähtust hakati nimetama kromosoomide
ristsiire ehk krossingover. Kuigi mitte igas meioosis ei toimu vaadeldavate geenide vahel ristsiiret,
rikub see ometi nende aheldatust.
Aheldunud geenide pärandumise seaduspärasust nim. ka Morgani seaduseks.
Morgani seadus:
Ühes kromosoomis asuvad geenid on lineaarses ahelduses ning päranduvad järglastele
reeglina koos e aheldunult. Nende geenide koos pärandumise sagedus on seda suurem, mida
väiksem on geenide vahemaa kromosoomis.
1. Mida kaugemal on geenid üksteisest, seda suurem on tõenäosus, et nad võivad sattuda crossing
ower käigus erinevatesse kromosoomidesse ja päranduda eraldi.
2. Mida lähemal on geenid üksteisele, seda suurem on tõenäosus, et nad võivad jääda crossing
ower käigus samasse kromosoomi ja päranduda koos s.t aheldunult.
Geenide aheldatus rikutakse meioosi 1 profaasis toimuva crossing oweri käigus, kus toimub
homoloogiliste kromosoomide lähenemine ja vastastikkune osade vahetus. Crossing ower toimub
sugurakkudes. Erandina esineb ka mitootiline crossing ower . Üldjuhul toimub crossing ower alati
kõigi kromosoomipaaride vahel. Tavaliselt crossing ower toimub ühes punktis, harva 2-s, 3-s kohas.
Täieliku aheldatuse korral moodustab polüheterosügoot vaadeldavate tunnuspaaride suhtes
kahte tüüpi sugurakke. Kui crossing ower toimub, siis polüheterosügoot moodustab mitut eri tüüpi
sugurakke, kuid rekombineerunud sugurakkude arv on alati väiksem võrreldes aheldunud
pärandumisel tekkinud sugurakkudega.
AHELDATUSE BIOLOOGILINE TÄHTSUS
1. Aheldatus säilitab geneetilise materjali teatava konservatiivsuse, kusjuures välditakse
kõikvõimalikke kombinatsioonide teket, millest osa võivad olla letaalsed.
2. Aheldatus kindlustab teatud vajalikke tunnuseid määravate geenide koospärandumise.
Nt. Polüpeptiidsetest ahelatest koosnevad valgud. Neid määravad geenid päranduvad alati koos
e aheldunult.
KROMOSOOMI TEOORIA PÕHISEISUKOHAD
Geenid paiknevad kromosoomis kindlates asukohtades e lookustes;
Geenide paiknemine kromosoomis on lineaarne;
Geenid võivad päranduda aheldunult s.t koos. Sellega kindlustatakse geneetilises süsteemis
konservatiivsus ja vajalike olemasolevate geenikombinatsioonide säilumine.
Crossing ower käigus toimub geneetilise materjali rekombineerumine suuremal või vähemal
määral, millega rikutakse geenide aheldunud pärandumise printsiip. See kindlustab
kombinatiivse muutlikkuse, mis omakorda on põhiline materjal LV-le.
SOO GENEETIKA
10
Geneetika
Inimese 46 kromosoomi jaotatakse 23 paariks. Üks nendest paaridest osaleb inimese soo
määramises. Neid nim.
sookromosoomideks. Ülejäänud 22 paari kromosome, mis ei seostu
inimese soolise määratlusega, nim
autosoomideks.
Inimese soo määramine:
Naise keharakkudes on kaks X-
kromoomis, mehel X ja Y-kromosoom.
Meioosi käigus jääb sugurakkudesse
naisel X ja mehel kas X või Y kromosoom.
Viljastumise momendil määratakse
uue organimsi sugu
P: XY x XX
X Y X X
XY
XX
XY
XX
Mendeli seaduste kasutamine inimese geneetikas
Mendeli seadusi hakati laiemalt kasutama varsti pärast nende üleavastamist käesoleva
sajandi algul. Inimese pärilikkuse geneetilise analüüsi aluseks on informatsioon, mis on saadud
sugupuude uurimisest. Põhilised raskused seisnevad selles, et järglaskond on väike, sugupuud sageli
ebatäielikult koostatud, alati pole kirjas õige isa. Oluline on ka ajafaktor - mõned haigused ilmnevad
alles keskeas. Sellegipoolest on tänaseks geneetiliselt iseloomustatud palju erinevaid haigusi ning
indiviidide väliseid tunnuseid. Mõned näited: dominantsed tunnused on kääbuskasv,
brahhüdaktüülia (lühikesed sõrmed), Huntingtoni tõbi (neuroloogiline defekt), lokkis juuksed.
Retsessiivsed tunnused on albinism (pigmendi puudumine), alkaptonuuria, tsüstiline fibroos,
Duchenne lihasdüstroofia, fenüülketonuuria, sirprakne aneemia.
Sugupuud on diagrammid, mis näitavad perekonnas olevaid sugulusastmeid. Meessoost
indiviide tähistatakse ruutudega ja naissoost indiviide ringidega. Ringi ja ruutu ühendav
horisontaalne joon näitab ühist järglaste saamist. Järglased näidatakse pealt ühendatud joonega,
esmasündinu on kõige vasakpoolsem. Need indiviidid, kellel avaldub uuritav omadus, näidatakse
värvitud või viirutatud sümbolitega. Põlvkonnad on tavaliselt tähistatud rooma numbritega.
Tavaliselt avalduvad dominantsed alleelid ka järgmistes põlvkondades. Dominantne alleel võib
ilmuda perekonda ka mutatsiooni tagajärjel, kuid selle sündmuse tõenäosus on väga harv – üks
miljonist. Need dominantsed tunnused, mis vähendavad fertiilsust ja elujõulisust, on populatsioonis
väga harvad. Seega on selliseid tunnuseid kandvad inimesed enamasti vastava alleeli suhtes
heterosügootsed.
Retsessiivseid tunnuseid on märksa raskem identifitseerida, sest vanematel ei pruugi need
avalduda. Siiski on praeguseks kirjeldatud üle 4000 retsessiivse tunnuse. Retsessiivsed tunnused
avalduvad sagedamini siis, kui vanemad on omavahel suguluses.
Mendeli seadusi on võimalik kasutada arvutamaks, millise tõenäosusega sünnib vanematel
haige laps. Näiteks on mõlemad vanemad heterosügootsed retsessiivse alleeli suhtes, mis põhjustab
tsüstilist fibroosi. Kui perekonda sünnib 4 last, on võimalikud 5 erinevat varianti:
kõik lapsed on normaalsed,
1 on haige,
2 on haiged,
3 last 4-st on haiged
kõik lapsed on haiged.
Loogiline oleks arvata, et kõige tõenäolisemalt realiseerub variant 3 normaalset ja 1 haige laps.
Konkreetse sünni puhul on ¾ tõenäosusega laps normaalne. Tõenäosus, et kõik lapsed oleksid
11
Geneetika
normaalsed, on seega ¾ x ¾ x ¾ x ¾ = (¾)4 = 81/256. Võimalus, et 1 konkreetne laps sünnib
haigena, on ¼. Seega tõenäosus, et kõik lapsed sünniksid tsüstilise fibroosiga, on (¼)4 = 1/256.
Tõenäosus, et 3 last on normaalsed ja 1 haige, arvutatakse järgmiselt. Sõltuvalt haige lapse
sünnijärjekorrast on 4 erinevat võimalust: NNNA, NNAN, NANN, ANNN, kus N = normaalne, A =
haige. Iga võimalus realiseerub tõenäosusega (3/4)3 x ¼. Tõenäosus, et 1 laps 4-st sünnib haigena
hoolimata laste sünnijärjekorrast on 4 korda suurem, 4 x (3/4)3 x ¼. Tõenäosus, et 2 lastest sünnivad
tervena ja 2 haigusega, on 6 x (3/4)2 x (1/4)2, sest sel juhul on laste sünnijärjekorda arvestades 6
erinevat võimalust.
Inimese geneetiline kaart
80-ndate aastate lõpul käivitati inimese genoomi projekt HUGO (Human Genome Project) mille
peamiseks eesmärgiks on konstrueerida iga kromosoomi detailne kaart. Esmalt kaardistatakse
konkreetsed segmendid, seejärel leitakse nende asukohad kromosoomides ning lõpuks määratakse
nende segmentide nukleotiidne järjestus. Inimesel on ligikaudu 100000 geeni, mida identifitseerida.
Kokku tähendab see ligi 3 miljardi nukleotiidi sekveneerimist. Praeguseks on identifitseeritud üle
5000 inimese geeni ja umbes pooltel neist on teada täpne asukoht kromosoomis. Enamus seniseks
iseloomustatud geenidest on seotud kas mingi haigusega või geneetilise defektiga. Märksa raskem
on aga konkreetseid geene seostada selliste normaalse muutlikkusega tunnustega nagu kasv, kaal,
naha pigmentatsioon, juuste värvus, vastupanu haigustele
Kromosoomid kui pärilikkuse kandjad
Kromosoomid
Kromosoomid avastati 19. sajandi teisel poolel saksa tsütoloogi
W. Waldeyeri poolt.
Kasutades erinevaid värvimistehnoloogiaid on nad kõige paremini jälgitavad jagunevates rakkudes.
Interfaasis ei ole individuaalsed kromosoomid eristatavad, difuusset materjali, mis värvub,
nimetatakse
kromatiiniks. Kromatiini erinevad regioonid värvuvad erinevalt – nõrgemini
eukromatiin ning tugevamini
heterokromatiin, kus DNA kondensatsiooniaste on suurem.
Kromosoomide arv
Liigisiseselt on kõigil isenditel kromosoome kindel põhiarv n korduses. Tavaliselt on
kordsusaste 2. Inimese kromosoomide põhiarv on 23: sugurakkudes on 23 kromosoomi (22
autosoomi + X või Y kromosoom) -
haploidse genoom (n) ning somaatilistes rakkudes 46
kromosoomi –
diploidne genoom (2n). Mõnedes maksarakkudes on kordsusaste 4 – sel juhul on
tegemist
tetraploidse genoomiga (4n) ning sel juhul on rakus 92 kromosoomi. Kromosoomide
põhiarv erineb liigiti, kuid ei sõltu organismi keerukusastmest. Näiteks muntjakil (Aasias elutsev
hirv) on 3 kromosoomi, aga osadel sõnajalgadel on neid mitusada. Enamikel juhtudel jääb see arv
10 ja 40 vahele.
Sugukromosoomid
Sugukromosoomide arv võib liigiti varieeruda. Rohutirtsudel on emastel üks
sugukromosoom rohkem kui isastel: emastel on kaks X kromosoomi ning isastel üks. Seega on
emased tsütoloogiliselt XX ning isased XO (O tähistab kromosoomi puudumist). Emaslooma
rakkude meiootilise pooldumise käigus X kromosoomid paarduvad (konjugeeruvad) ja seejärel
lahknevad ning kõigisse sugurakkudesse jääb üks X kromosoom. Isaslooma organismis jäävad aga
pooled seemnerakud ilma X kromosoomita. Munaraku viljastamisel moodustuv sügoot sisaldab
seega kas üks või kaks X kromosoomi, andes aluse kas isaste või emaste tirtsude arenguks.
12
Geneetika
Paljudel teistel loomadel ning ka inimesel on mõlemal sugupoolel võrdne arv
sugukromosoome. Isaste (XY) sugukromosoomid lahknevad meioosi käigus, produtseerides võrdsel
arvul X ja Y kromosoomi sisaldavaid gameete. Inimese puhul peaks viljastumise tulemusena
tekkima teoreetiliselt XY ja XX sügoote. Tegelikult on Y kromosoomi sisaldavatel seemnerakkudel
võrreldes teistega viljastamisel väike eelis – nii on XY:XX suhe 1,3:1. Kuna XY embrüod on
võrreldes XX embrüotega vähem eluvõimelised, on sünnimomendiks see suhe juba 1,07:1 ning
paljunemisikka jõudmisel on meeste ja naiste suhe 1:1.
Inimese Y kromosoom on X kromosoomist morfoloogiliselt eristatav: ta on tunduvalt lühem
ning Y kromosoomi tsentromeer paikneb ühe kromosoomi otsa lähedal. Ühist geneetilist materjali
on X ja Y kromosoomil vähe.
Pärilikkuse kromosoomiteooria
Eksperimentaalsed tõendid selle kohta, et geenide päritavus on seotud kromosoomidega
Selle sajandi algul näitas
Thomas Morgan, et teatav äädikakärbse Drosophila
melanogaster silmavärvust mõjutav geen paikneb X kromosoomis. Tegemist oli silmade valget
värvust põhjustava retsessiivse mutatsiooniga, mis avaldus ainult isastel kärbestel. Valgesilmsete
mutantsete (w) isaste ristamisel homosügootsete (w+) emastega olid mõlemast soost järglased
punaste silmadega, kuid hübriidide järgmises põlvkonnas olid kõik emased endiselt punaste
silmadega, isastest aga ainult pooled. Morgan järeldas, et punast silmavärvust andev geen paikneb
X kromosoomis. Kui on tegemist X kromosoomis paikneva geeniga ning isased on saanud
mutantne alleeliga X kromosoomi, on kõik sellised isased valgete silmadega. Kuna tegemist on aga
retsessiivse mutatsiooniga, siis on heterosügootsed emased punasesilmsed, sest kannavad lisaks
mutantsele ka metsiktüüpi alleeli. Organismi, mis sisaldab ainult ühte geenikoopiat, nimetatakse
hemisügootseks. Heterosügootsete emaste ristamisel valgesilmsete isastega saadi ka valgesilmseid
homosügootseid emaseid, kes sisaldasid mõlemas X kromosoomis mutantset alleeli.
Geenid paiknevad kromosoomides lineaarselt
Morgani grupp uuris geenide paiknemist äädikakärbse kromosoomides. Olles lokaliseerinud
hulgaliselt erinevaid mutatsioone, leiti, et erinevad geenid asetsevad kromosoomis teatavates
kohtades –
lookustes. Edasi oli võimalik juba koostada geneetilisi kaarte ning arvutada
geenidevahelisi suhtelisi kaugusi. Nii tuldi välja
pärilikkuse kromosoomiteooriaga, mille kohaselt
kõik geenid paiknevad kromosoomides ning Mendeli seadused tulenevad sellest, milliste
seaduspärasuste alusel toimub kromosoomide lahknemine sugurakkudes ning sattumine
järglaskonda.
Kromosoomide mitteeraldumine raku jagunemisel
Morgani tudeng
Bridges näitas, et ebanormaalne arv sugukromosoome XXX, XXY, XO või
YO põhjustab äädikakärbsel muutusi fenotüübis. Ta ristas mutantseid homosügootseid
valgesilmseid emaseid (ww) punasesilmsete isastega (w+) ning leidis, et ebaootuspäraselt oli
järglaskonnas ka üksikuid valgesilmseid emaseid ning punasesilmseid isaseid. Teoreetiliselt oleksid
pidanud kõik emased järglaskonnas olema punasesilmsed ning isased valgesilmsed. Neil vähestel
eranditel oli kahe sugukromosoomi asemel kas kolm või üks. Sugukromosoomide ebanormaalset
arvu järglaskonnas põhjustas X kromosoomide mittelahknemine meioosiprotsessis. Selle tagajärje
tekkisid kahte X kromosoomi sisaldavad ja X kromosoomita munarakud. Selliste munarakkude
viljastamisel moodustusidki XXY sügoodid, millest arenesid valgesilmsed emased ning XO
sügoodid, millest arenesid punasesilmsed isased, kes olid sigimisvõimetud. Viljastamisel tekkis ka
XXX ja YO sügoote, millest ei tulnud eluvõimelist järglaskonda. Seega olid ka Bridges’e
katsetulemused heaks tõendusmaterjaliks pärilikkuse kromosoomiteooriale. Lisaks näitasid
Bridges’e katsed X kromosoomi tähtsust Drosophila soo määramisel (XXY järglased on emased!).
Selleks, et organism oleks vitaalne, on vajalik vähemalt ühe X kromosoomi olemasolu, sest YO
sügootidest ei arenenud eluvõimelisi järglasi.
13
Geneetika
Mendeli seadused lähtudes kromosoomiteooriast
Lahknemisseadus
Raku esimese meiootilise jagunemise käigus homoloogilised kromosoomid paarduvad. Üks
homoloog on pärit emalt, teine isalt. Kui ema on homosügootne alleeli A suhtes ja isa sama geeni
alleeli a suhtes, on järglaskond Aa. Anafaasis, pärast esimest meiootilist jaotumist liiguvad Aa
heterosügootide kromosoomid, mis sisaldavad alleele A ja a, raku erinevatele poolustele ning
satuvad tütarrakkudesse
Sõltumatuse seadus e. sõltumatu lahknemisseadus
Ka see seadus baseerub anafaasis toimuval lahknemisel. Kui AA BB emaseid ristata näiteks
aa bb isastega, on järglased Aa Bb. Esimese meioosi profaasis paarduvad kromosoomid alleelidega
A ja a ning B ja b. Metafaasis reastuvad nad homoloogiliste paaridena kahel võimalikul viisil, kas
A/a B/b või A/a b/B. Sõltuvalt sellele, kuidas on toimunud reastumine, liiguvad anafaasis
erinevatele poolustele koos A ja B alleeliga ning a ja b alleeliga kromosoomid või hoopis alleele A
ja b ning a ja B kandvad kromosoomid. Mõlemad võimalused realiseeruvad võrdse tõenäosusega.
Pärast meiootilisi jagunemisi sisaldavad pooled gameetidest vanematega identset
alleelikombinatsiooni, pooled aga uut (A b või a B). Nii moodustubki heterosügootsetel järglastel
(F1 põlvkond) neli tüüpi gameete. Seega tagab kromosoomide lahknemine meioosis geenide
sõltumatu lahknemise.
Suguliitelised geenid inimesel
X-liitelised retsessiivsed alleelid on märksa kergemini tuvastatavad kui retessiivsed autosoomsed
alleelid.
Hemofiilia
Hemofiiliat põhjustab X-liiteline mutatsioon, mille kandjatel ei sünteesita vere hüübimiseks
vajalikku faktorit. Ilma terapeutilise vahelesegamise võib hemofiilikutel ka tühisem haav
põhjustada verest tühjaks jooksmist. Peaaegu kõik selle puudega indiviidid on mehed. Hemofiilia
juhtumeid esines ka Venemaa tsaari Nikolai II perekonnas. Tal oli 4 tütart ja üks poeg. Poeg
Aleksei kannatas hemofiilia all, olles vastava alleeli saanud oma emalt, kes oli heterosügoot.
Tsaarinna Aleksandra oli Inglismaa kuninganna Victoria tütretütar ning ka Victoria ise oli
hemofiilia alleeli kandja.
Värvipimedus
Inimesel on värvuse tajumine vahendatud kolme valgust neelava valgu poolt – üks neist
neelab sinist valgust, teine rohelist ja kolmas punast. Ükskõik, milline neist valkudest on defektne,
tagajärjeks on värvipimedus. Kõige klassikalisem värvipimeduse näide on võimetus eristada
rohelist ja punast värvust. Neid värve ei suuda eristada ligikaudu 10-15% meestest ning alla 1%
naistest. X kromosoomis on leitud 2 geeni, millest üks kodeerib rohelise valguse retseptorit, teine
punase valguse retseptorit. Sinise valguse retseptorit kodeeriv geen on autosoomis.
Fragiilne X
Paljud vaimse alaarenguga nähud on seotud muutustega X-liitelistes geenides. Fragiilse X-i
sündroom avaldub lastel sagedusega 1:2000. Fragiilne X on X-liiteline dominantne kahjustus
mittetäieliku penetrantsusega. Puuetega (vaimse alaarenguga) on heterosügootsed naised ja
hemisügootsed mehed. On ka üksikuid erandeid, kus sümptomid ei avaldu. Haigust põhjustab
geeniga FMR1 külgneva DNA järjestuse CGG kordistumine X kromosoomi otsa lähedal. Kui
normaalses kromosoomis on 5-60 CGG kordust, siis mutantses kromosoomis on seda kordust DNA
replikatsiooni tagajärjel kuni 1000 koopiat, mis mõjutab kordusega külgnevate geenide avaldumist.
14
Geneetika
Fragiilse X-i sündroomi põhjustav mutatsioon on metafaasi kromosoomidel tsütoloogiliselt jälgitav.
Tundub, nagu oleksid kromosoomi otsad murdumas.
Y kromosoomi-spetsiifilised geenid
Teatakse ainult väheseid. Üks neist kodeerib H-Y antigeeni. On teada ka geen, mis kodeerib
testiste arenguks ning mehe seksuaalsete tunnuste väljakujunemiseks vajalikku faktorit TDF.
Geenid, mis paiknevad mõlemas sugukromosoomis
Mõned geenid on olemas nii X kui ka Y kromosoomis, paiknedes enamasti lühikese õla otsa
lähedal. Nende geenide poolt kodeeritud tunnused päranduvad järglastele samal viisil nagu
autosoomsete geenide poolt kodeeritud tunnused. Sellepärast nimetatakse neid geene ka
pseudoautosoomseteks geenideks.
Soo määramine sugukromosoomide poolt
Soo määramine inimesel
Erinevalt äädikakärbsest määrab inimesel ja teistel imetajatel soo Y kromosoomi olemasolu.
XO indiviidid on naissoost ja XXY indiviidid meessoost. Y kromosoomis paiknev geen SRY
kodeerib faktorit TDF (testis-determining factor). Selle geeni homoloog on leitud ka hiirel. TDF on
regulaatorvalk, mis seondub DNA-ga, kontrollides nii teiste geenide avaldumist, mis on vajalikud
testiste arenemiseks. Pärast testiste formeerumist kutsub testosterooni sekretsioon esile meessoole
iseloomulike tunnuste väljakujunemise. Testosteroon on hormoon, mis seondub paljude rakutüüpide
retseptoritele. Juhul, kui testosterooni signaalsüsteem on häiritud, need tunnused ei ilmne ning
arenevad välja hoopis naissoole iseloomulikud tunnused.
Soomääramine teistel loomadel
Kui isasloomal on kaks erinevat sugukromosoomi, X ja Y, nimetatakse tema sugu ka
heterogameetseks. Emased, kes kannavad kahte X kromosoomi, on
homogameetsed. Lindudel,
liblikatel ja ka mõnedel roomajatel on olukord vastupidine: isased on homogameetsed (ZZ) ja
emased heterogameetsed (ZW).
Mesilastel on sugu määratud ploidsusega e. kordsusega. Diploidsed embrüod, mis arenevad
viljastatud munarakust, arenevad emasteks, haploidsed embrüod, mis pärinevad viljastamata
munarakkudest, aga isasteks. Vastse toitmisest sõltub, kas emane valmik saab olema viljakas
(emamesilane) või steriilne (töömesilane). Et haploidsuse-diploidsuse süsteem jääks kehtima ka
järglaskonnas, toimub munarakkude valmimine läbi meioosiprotsessi, seemnerakkude valmimine
aga mitootilise jagunemise teel.
X-liiteliste geenide doosi kompensatsioon
Kui emastel indiviididel on kaks X kromosoomi ning isastel ainult üks, siis kuidas
saavutatakse see, et X-liiteliste geenide avaldumise tase on mõlemal juhul võrdne?
Drosophila
X-liiteliste geenide hüperaktivatsioon isastel
Juhul, kui geeni Sxl produkti rakus pole (isased), seondub teatav valkkompleks paljudesse
kohtadesse X-kromosoomil ja võimendab X-liiteliste geenide avaldumise taset kaks korda. Kui
rakus on ka Sxl geeni produkti piisavalt, takistab see valkkompleksi seondumist ja seega ka geenide
aktiivsuse tõusu.
X-liiteliste geenide inaktivatsioon imetajatel
15
Geneetika
Emastel on üks X kromosoomidest rakkudes inaktiivses olekus. Valik on juhuslik – seega
on osadel juhtudel inaktiivne isalt päritud X, osadel aga emalt saadud X kromosoom. Seega
sisaldavad nad võrdsel hulgal mõlemat tüüpi rakke, olles seetõttu X kromosoomi suhtes
geneetilised mosaiigid. Emasloom, kes on heterosügootne X-liitelise geeni suhtes, võid omada
samaaegselt kahte erinevat fenotüüpi. Näiteks kassidel ja hiirtel avaldub fenotüübiline mosaiiksus
karva pigmentatsioonis. Kassidel kodeerib üks alleel tumedat pigmenti ning teine alleel oranzhi
pigmenti. Heterosügootsed emakassid on laigulised, kilpkonna värvi.
X kromosoomi pikas õlas on piirkond, millest geenide inaktivatsioon levib mõlemas suunas.
Vastavat initsiaatorkohta nimetatakse
X-inaktivatsiooni keskuseks XIC (X-inactivation center).
See keskus on väga lähedal geenile XIST, millel arvatakse olevat oluline roll inaktivatsiooni
protsesis. Inaktiveeritud X kromosoom erineb teistest kromosoomidest, kuna inaktiivse X
kromosoomi DNA on tugevalt keemiliselt modifitseeritud, metüleeritud. Lisaks on ta tugevamalt
kondenseerunud, moodustades intensiivselt värvuvaid
Barri kehakesi (nimetatud tsütoloogi
Murray Barr järgi, kes need kehakesed esmakordselt tsütoloogiliselt tuvastas). Barri kehake
kinnitub tuumamembraani sisepinnale ning tema replikatsioon ei ole teiste kromosoomidega
sünkroonne. Sugurakke tootvates kudedes on ta reaktiveeritud, sest oogeneesis on vajalik, et
mõnede X-liiteliste geenide mõlemad geenikoopiad oleksid aktiivsed.
Ümberkorraldused kromosoomide struktuuris
Ümberkorraldused kromosoomides võivad muuta segmendi positsiooni kromosoomis või
viia ta teise kromosoomi.
Inversioonid
Inversiooniga on tegemist sel juhul, kui
segment kromosoomist on ülejäänud osa suhtes 180
suhtes ümber pööratud. Laboritingimustes saab selliseid ümberkorraldusi kunstlikult esile kutsuda
röntgenkiirtega kiiritades, mis põhjustab kromosoomide fragmenteerumist. Mõnikord võivad
segmendid uuesti ühineda, kuid nende orientatsioon võib olla muutunud. Inverteerumist võivad
põhjustada ka
transponeeruvad elemendid – DNA järjestused, mis on võimelised liikuma
genoomi ühest osast teise.
Tsütogeneetikas eristatakse kahte tüüpi inversioone:
peritsentrilised inversioonid kaasavad
tsentromeeri,
paratsentrilised aga mitte. Peritsentrilise inversiooni tagajärjel võivad muutuda
kromosoomi õlgade pikkused, nii võib akrotsentrilisest kromosoomist tekkida peritsentriline
kromosoom. Seetõttu on peritsentrilisi inversioone lihtsam tuvastada kui paratsentrilisi.
Juhul, kui üks homoloogilistest kromosoomidest sisaldab inversiooni, teine aga mitte,
toimub nende paardumine sel viisil, et inversiooni sisaldav regioon on teisel kromosoomil sama
orientatsiooni saavutamiseks linguna ümber pööratud. Inversiooni sisaldava ala otstes on
kromatiidid pinge all ja see võib viia neis kohtades sünapsi katkestamisele. Enamasti on meioosi
käigus inversioonidest põhjustatud linge tsütoloogiliselt praktiliselt võimatu jälgida. Siin tulevad
jällegi appi polüteenkromosoomid, mis paarduvad ka somaatilistes rakkudes. Tänu spetsiifilisele
vöödilisuse mustrile on linguna paiknevaid inverteerunud alasid kerge identifitseerida.
Translokatsioonid
Kui
segment kromosoomist satub temaga mittehomoloogilisse kromosoomi, on tegemist
translokatsiooniga. Ka translokatsioone saab stimuleerida röntgenkiirtega ning protsessis võivad
osaleda ka transponeeruvad elemendid. Kui kaks mittehomoloogilist kromosoomid vahetavad
võrdsel hulgal geneetilist materjali, on tegemist
retsiprookse translokatsiooniga. Meioosis võivad
retsiprookset translokatsiooni sisaldavad muus osas mittehomoloogilised kromosoomid lisaks
homoloogiliste kromosoomidega paardumisele ka omavahel paarduda, moodustades ristikujulisi
16
Geneetika
struktuure. Kuna ristikujuliselt paardunud struktuuril on 4 tsentromeeri, võib homoloogiliste
kromosoomide lahknemine olla häiritud ja moodustuvad aneuploidsed gameedid.
Liitkromosoomid (Compound Chromosomes). Robertsoni translokatsioonid
Mõnikord ühineb kromosoom oma homoloogiga või liituvad tütarkromatiidid, moodustades
ühe geneetilise üksuse. Liitkromosoomid püsivad stabiilselt seni, kuni neil on üks tsentromeer.
Liitkromosoomid võivad moodustuda ka homoloogiliste kromosoomide segmentide ühinemisel.
Näiteks äädikakärbsel on kirjeldatud liitkromosoomi, mis moodustus kromosoomi number 2
homoloogide paremate õlgade liitumise tulemusena. Sellist kromosoomi nimetatakse
isokromosoomiks, kuna tema
mõlemad õlad on samad. Liitkromosoomide moodustumine erineb
translokatsioonidest selle poolest, et liitkromosoomid moodustuvad üksnes homoloogiliste
kromosoomide baasil, translokatsioonide puhul liitub aga geneetiline materjal, mis pärineb
mittehomoloogilistelt kromosoomidelt.
Mittehomoloogiliste kromosoomide puhul võib kromosoomiosade liitumine toimuda ka
tsentromeeride vahendusel, nii et moodustub struktuur, mida nimetatakse
Robertsoni
translokatsiooniks. Sel juhul moodustuvad pikkade õlgadega metatsentriline kromosoom ning
väike lühikeste õlgadega, mis läheb kergesti kaotsi. Evolutsiooni käigus on selliseid kromosoomide
liitumisi toimunud üsna sageli.
Kromosoomid võivad liituda ka otste vahendusel, mille tulemusena moodustub kahe
tsentromeeriga struktuur. Juhul, kui üks tsentromeeridest inaktiveerub, jääb liitunud kromosoom
stabiilseks. Selline liitumine on ilmselt toimunud ka meie endi liigi evolutsiooni käigus. Inimese 2.
kromosoom on metatsentriline, tema õlad vastavad kahele erinevale akrotsentrilisele kromosoomile
ahvidel. Teatavasti on inimesel 46 kromosoomi, shimpansil aga 48.
Kromosoomides toimunud geneetilise materjali ümberkorraldustest tulenevad fenotüübilised
muutused
Homosügootses olekus on mitmeid geene haaravad deletsioonid peaaegu et alati letaalsed,
sest ei toodeta mõnda organismi ellujäämiseks vajalikku geeniprodukti. Homosügootsete
duplikatsioonide fenotüübiline efekt ei ole nii drastiline. Heterosügootses olekus mõjutavad nii
deletsioonid kui ka duplikatsioonid fenotüüpi sel viisil, et muutunud on teatavate geenide
ekspressioonitase. Fenotüübiline efekt on seda tugevam, mida suuremat kromosoomisegmenti
ümberkorraldus hõlmab. Samuti sõltub muudatuse toime organismi vitaalsusele sellest, millist
piirkonda muudatus hõlmab. Mõnikord võivad isegi kitsast regiooni hõlmavad deletsioonid ja
duplikatsioonid olla letaalsed ning seda ka heterosügootses olekus. Sel juhul jäävad sinna regiooni
geenid, mille puhul on väga oluline doos – juba üks geeni lisakoopia või teise geenikoopia
puudumine on organismile letaalne. Selliseid geene, mille inaktivatsioon heterosügootses olekus on
letaalse toimega, nimetatakse
haplo-letaalseteks. Geenid, mille duplikatsioonid on organismile
letaalsed, on
triplo-letaalsed.
Ka inversioonid ja translokatsioonid mõjutavad fenotüüpi. Kromosoomid võivad katkeda
keset geene, inaktiveerides need. Isegi siis, kui terve geen satub uude konteksti, võib tema
avaldumistase muutuda ja mõjutada selle läbi organismi fenotüüpi. Näiteks äädikakärbse
silmavärvust kontrolliv geen white satub X kromosoomis toimunud inversiooni tagajärjel
heterokromatiini sisaldava tsentromeeri lähedale, mistõttu selle geeni avaldumine on häiritud. Selle
tulemusena on kärbse silma pigment ebaühtlaselt jaotunud. Põhjus on selles, et heterokromatiini
sisaldavad alad jäävad tugevalt kondenseerunud olekusse kogu rakutsükli vältel.
17
Document Outline
- 1. Dominantsuse printsiip – heterosügootides esineb üks alleelidest varjatud kujul.
- 2. Segregeerumise printsiip – kaks erinevat alleeli segregeeruvad heterosügootide gameetide moodustumisel.
- AAbb
- Kromosoomid kui pärilikkuse kandjad
Kõik kommentaarid