PRIMAARPRODUKTSIOON e. ESMASPRODUKTSIOON (primary production) on koosluse poolt fotosnteesil seotud energia hulk. Puhasproduktsioon (net production) on energia , mis jb seotuks kui autotroofide hingamine nende koguproduktsioonist (gross production) maha arvata. Keskkonnamikrobioloogia konspekt 2005; Tri Kolledz 4. Mageveekogude mikroobikooslus. Infot on rohkem jrvede kui jgede mikroobikoosluse kohta. Levinumad liigid jrvedes on perekondadest Achromobacter, Flavobacterium, Brevibacterium, Micrococcus, Bacillus, Pseudomonas, Nocardia, Streptomyces, Micromonospora, Cytophaga, Spirillum, Vibrio. Autotroofsed bakterid: tsanobakterid (Microcyctis, Anabaena, Aphanizomenon); purpursed ja rohelised fotosnteesivad bakterid (Chlorobiaceae, Chromatiaceae); kemolitotroofid osalevad N-, S-, Fe-ringes (Nitrosomonas, Nitrobacter, Thiobacillus). Caulobacter ja Hyphomicrobium koloniseerivad erinevaid pindasid. Jgede puhul on osa
Kultiveeritavate bakterite koosluse struktuur toorpiimas: 1. GP kokid: Micrococcus Streptococcus Lactococcus Staphylococcus 2. GP pulkbakterid: Microbacterium Lactobacillus Corynebacterium Arthrobacterium Kurthia Bacillus 3. GN pulkbakterid: Pseudomonas Acinetobacter Flavobacterium Alcaligenes 3 Klebsiella Enterobacter Escherichia 4. Juhuslik mikrofloora: Streptococcus Pärmid, mikroseened Piima saastumine: 1. Mastiit Saastumine streptokokkidega: S.agalactiae, S.dysgalactiae, S.uberis Corynebacterium pyogenes (suvel) 2. Kolivormne mastiit E
coli´t!). Jah 4. Tikartsilliin 1. G- mikroobid (nosokomiaalinfektsioonid: 1. Piperatsilliin 4. Ureidopenitsilliinid (lai Pseudomonas, Acinetobacter, Klebsiella, 2. Aslotsilliin toimespekter) Flavobacterium). 3. Meslotsilliin 1. Amoksitsilliin/klavulaanhape 1. Streptokokid (-hemol). 2. Meningokokid. 3. G+ 5. -laktaamid koos - 2. Ampitsilliin/sulbaktaam aeroobid (enamik). 4. Stafülokokid. 2. Osa G-
redutseerivad nitraadid gaasiliseks lämmastikuks (denitrifikatsioon), taimed omastavad biogeene veest, selgrootud (ja osa kalu) toituvad vetikatest, selgrootuid tarbivad toiduks kalad. Osa reoaineid kaob veekogust edasikandumise ja põhjasetteisse ladestumise tagajärjel. Heitveega saastunud veekogude põhjas võib esineda reoveeseen- paljudest liikidest koosnev mikroobikooslus (bakterid: Sphaerotilus natas, Zooglea spp., Beggiatoa alba, Flavobacterium spp., seened: Geotrichum candidum, Leptomitus lacteus; algloomad, vetikad).Looduslikud veed. Looduslikud veed on elukeskkonnaks paljudele mikroorganismidele. Seal saavad nad toituda, võtta osa süsiniku, lämmastiku, väävli, raua ja teiste elementide ringest ning paljuneda. Looduslike vete mikroorganismide arv ja liigiline koostis on väga kõikuv Põhjaveed. Põhjavee mikrofloora arvukus ja liigiline koostis sõltub peamiselt vettkandva kihi sügavusest ning tema saastumise kaitstusest
Mageveekogudes saab haigust diagnoosida sümtomaatiliselt, riimvees esineb paljudel karplastel,ahvenal,kohal,rääbisel,siial. Haugide lapihaigus esineb kudeajal, suremus võib olla väga kõrge. Läänemeres haugi ,lesta jt kalade keha pinal haavanditeesinemist seostatakse A. salmonicida atüüpiliste vormidega. Flavobakterioosid Flavobakterioosid (fleksibakterioosid) on lõhelaste noorjärkudel sagedased bakteriaal haigused, mille tekitajaiks on müksobakterid Flavobacterium psychrophilum ja Flavobacterium columnare. Eelsoodumuseks haigestumisele on vee suur lämmastiku ühendite sisaldus ning vähene hapnikusisaldus, hüpovitaminoosid ja kalade kehapinna vigastused, aga ka ülenormatiivne paigutustihedus ning teised stressi tekitavad asja olud. Haigus esineb tavaliselt sügisest kevadeni, veetemperatuuril 412 °C. Haiguse korral esinevad septitseemia tunnused, tugevad aneemianähud ja põrna märgatav suurenemine. Maimude suremus on 5080%. F
On antibiootikumidele vastupidavad ja resistentsus areneb kergelt. Reovee puhastamine Aktiivmuda helbed koosnevad bakterirakkudest ning anorgaanilistest ja orgaanilistest osakestest. Suurte aktiivmuda helveste sisemuses on hapniku kontsentratsioon madal ja see on elupaigaks anaeroobsetele bakteritele. Kokku on leitud üle 300 eri bakteri liigi. Aktiivmuda osakeste baktereid iseloomustab kiire kasv ja suur metaboolne aktiivsus: Pseudomonas, Enterobacter, Flavobacterium, Zooglea, Sphaerotilus. Nitrifitseerivad bakterid:Nitrosomonas, Nitrobacter. L isaks bakteritele leidub aktiivmudas veel algloomi (ripsloomad, viburloomad, amööbid). Aktiivmuda osakestele on iseloomulikud niitjad bakterid, kuid kui nende arvukus suureneb üle teatud piiri, siis aktiivmuda ei setti enam, tekib vaht. Ammoniaaki oksüdeerivate bakterite liigiline mitmekesisus on aktiivmudas suur. Peamised nitriti oksüdeerijad on Nitrospira-sarnased bakterid, keda ei ole seni suudetud
Pärmidel on ka ainete transport rakku kohanenud selle keskkonnaga, kus nad elavad. Halofiilid- mikroobid, kes eelistavad kõrge soolsusega keskkonda. Vajavad Na transportsüsteemide tööks, viburi töölepanekuks ja osa ka rakukestade stabiliseerimiseks. Paljud halofiilid on punaselt pigmenteerunud. Halofiilid jagunevad: 1. Mõõdukad halofiilid. Kasvavad hästi [NaCl] 5-10%. Alcaligenes, Acinetobacter, Flavobacterium, Vibrio, Pseudomonas. Arenevad sooldunud mullas, merevees, soolatud toiduainetes. 2. Äärmuslikud halofiilid. Taluvad hästi väga kõrget soolsust (15-32%). Sellise soolsusega on soolajärvede vesi. Neid on isoleeritud ka soolatud toiduainetest ja soolatud loomanahkadest ja tahkest keedusoolast. On proteolüütilised ja põhjustavad soolatud produktide riknemist. Äarmusliku halofiilid on Ectothiorhodospira halophila,
processed or refrigerated. The specific micro- preservation method. It ensures the destruc- bial associations in refrigerated raw meats tion of pathogens and spoilage microorgan- are nonfermenting Gram psychrotrophs such isms and allows foods to be easily handled as Pseudomonas, Alcaligens, Flavobacterium, and transported. In addition, canning pro- Shewella, and Moraxella. When the meat is vides food for various distribution types: cured, such as with sausages or other previ- retail in small can sizes (250 to 500 ml) for ously processed meats treated with nitrates, domestic purposes; wholesale (750 ml to 1 L)