Ribosoomne RNA(rRNA) ribosoomi struktuuri ja funktsiooni alus Matriits RNA( mRNA) - vahendab geneetilist koodi Transpordi RNA( tRNA)- Kannab aminohappeid valgusünteesis Väike tuuma RNA( snRNA) - oluline eukarüootsete geenide esmaste transkriptide protsessingul küpseks mRNA ks enne eksporti tuumast tsütoplasmasse Väike interfereeriv RNA( siRNA) osaleb transkrriptsioonijärgses geenide vaigistamises RNA on disainitud kasutamiseks ja siis hävitamiseks Nukleaasid: Ensüümid, mis degradeerivad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid. Eksonukleaasid lagundavad nukleiinhappe ahelat kas 5' või 3' otsast (5'eksonukleaasid ja 3'eksonukleaasid). Endonukleaasid lagundavad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid ahelasiseselt Nukleiinhapete struktuurid: - Primaarstruktuur: Lämastikaluste järjestus polünukleotiidahelas - Sekundaarstruktuur : Polünukleotiidahela ruumilie struktuur
otsas on vaid üksikud mittepaardumised. Ainult üks ahel seondub RISCi. RISC kompleksiga seob ahela märklaud RNA'le. Kuna paardumine on mittetäielik, siis translatsioon represseeritakse (vms, ei saanud täpselt aru.) RNA interferents-põhjustatyd mRNAde degradatsioon. (interferentsist kuskil eespool) RISC lõikab märklaud mRNA, mis on täpselt komplementaarne üksikahelalisele siRNAle, ahela katki. Seega eksponeerub katkine mRNA nukleaasidele, mis ahela kiiresti degradeerivad (võiks ntks nii olla). Tsütoplasmaatiline polüadenüleerimine stimuleerib mõnede mRNAde translatsiooni. Selline protsess toimub tavaliselt varases embrüogeneesis ja närvirakkudes. mRNAd, millel on lühike poly(A) saba, on kehvalt PABPI'tede poolt stabiliseeritud ja translatsioon on ebaefektiivne. Teatud arengustaadiumis, tavaliselt vastusena välissignaalile, hakatakse nende mRNAde sabasid pikendama ja nii stimuleerides mRNAde translatsiooni. 52
komplementaarse RNA ahela; transkriptsiooni initsiatsiooniks seondub RNA polümeraas spetsiifiliselt promootorjärjestusega ning seejärel katkevad promootorpiirkonnas DNA ahelate vahelised vesiniksidemed. Ei vaja initsiatsiooniks praimerit, pöördtranskriptaas ehk revertaas – sünteesib RNA ahelale komplementaarse DNA ahela; vajab sünteesil praimerit, nukleaasid – ensüümid, mis degradeerivad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid. 49. DNA replikatsiooni kolm mudelit – konservatiivne, dispersiivne ja semikonservatiivne. Milline neist mudelitest leidis eksperimentaalselt kinnitust? Konservatiivne – algselt kaksikheeliksilt sünteesitakse uus; ühes DNA molekulis on koos vanad ja teised uued ahelad. Semikonservatiivne – matriitsiks on mõlemad DNA ahelad; mõlemas DNA molekulis on üks ahel uus ja teine vana. Dispersiivne mudel –
Sõeltorudega trummel Tornkasvatus Trumlis kasvatamine Kogu trumlit ja selle sisu pööratakse Homogeenne linnase kvaliteet Max. 25 t partii Probleemid temperatuuri regulatsiooniga, kui mitu trumlit samas ruumis Keeruline aereerida Galand´i trummel Topf´i süsteem 7. Idanemise eesmärk Idanemke käigus aktiveeruvad teras erinevad ensüümid , mis degradeerivad erinevate toitainete makromolekulid (tärklis ja valgud). 8. Linnaste kuivatamise eesmärk Eesmärk: ensümaatiliste protsesside lõpetamine ning linnaste värvi ja maitse ja aroomi ühendite kujunemine Kuivatamine toimub kahes etapis: Kuivatamise algul on õhu kogused suuremad, temperatuur 50 °C. Kui linnaste niiskus on 12-15%, hakatakse õhu temperatuuri tõstma 65- 75- C-ni. Linnaste lõplikuks kuivatamiseks hoitakse 1-2 tunni jooksul 80-85°C temperatuuri.
või RNA ahel) RNA polümeraas sünteesib DNA ahelale komplementaarse RNA; seondub spets. promootorjärjestusega ; praimerit pole vaja Pöördtranskriptaas ehk revertaas sünteesib RNA ahelale komplementaarse DNA; vajab sünteesil praimerit · Muud ensüümid: DNA helikaas katalüüsib DNA ahelate üksteisest eraldumist Nukleaasid degradeerivad nukleiinhappeid, lõhkudes fosfodiestersidemeid Eksonukleaasid lagundavad nukleiinhappeid kas 5' või 3' otsast Endonukleaasid lõhuvad fosfodiestersidemeid ahelasiseselt DNA ligaas ensüüm, mis liidab DNA ahelate otsad, katalüüsides fosfodiestersideme moodustumist 5' fosfaadi ja 3' -OH rühma vahele 49. DNA replikatsiooni kolm mudelit konservatiivne, dispersiivne ja semikonservatiivne.
Küpsedes efektorrakkudeks, hakkavad Tc- rakud ära tundma viirusega infitseeritud rakke. Interferoon alpha ja beeta (Tüüp I) IFN, IFNß: Toodetakse viirusega infekteeritud rakkude poolt, difundeerub naaberrakkudele ja soodustab nendel antiviraalsete valkude tootmist (antiviral proteins -AVPs). Peamised tüüp I IFN tootjad on pDC, epiteeli rakud ja fibroblastid. IFN/ süntees peatab viiruse replikatsiooni (inhibeerivad translatsiooni, degradeerivad RNA-d, indutseerivad apoptoosi) ja muudab naaberrakud viirusresistentseks. Interferoon gamma (Tüüp II) IFN: Toodetakse lümfotsüütide (Th1), NK ja MQ poolt. Akiveerib neutrofiile ja makrofaage. Interferooni poolt indutseeritud viiruse vastased mehhanismid- restriktsiooni faktorid (RF): inhibeerivad viiruse replikatsiooni. RF on näiteks raku sisesed membraan-seoselised PRRs, TLRs (toll like receptors) või raku sisesed tsütoplasmaatilised NLRs (NOD like receptors).
Mõõdukalt kordistunud DNA piirkonnad (12,5 % genoomist) on sellised, kus igat lõiku on 104 - 105 koopiat. Siia kuulub geneetilist infot mittekodeerivaid alasid, mis asetsevad genoomis rühmiti (tandeemsed kordused) või ka hajusalt laiali (hajuskordused ehk polündroomsed kordused). Palindroomsed - geneetilised laused, kus teatud sümmeetriateljest paremale ja vasakule lugedes on järjestus sama. 93. Restriktaasid. Ekso- ja endonukleaasid. Nukleaasid - ensüümid, mis degradeerivad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid. Restriktaasid - rõngasmolekulist lineaarse vormi tagasi moodustumine alusspetsiifilise endonukleaasi toimel. Eksonukleaasid- eemaldavad nukleotiide DNA ahela otsast (lagundavad nukleiinhappe ahelat kas 5' või 3' otsast (5'eksonukleaasid ja 3'eksonukleaasid) Endonukleaasid- atakeerivad ja võtavad ära nukleotiide DNA ahela seest. 94. DNA polümeraas I omadused. Kornbergi polümeraas
Inimesed on juhuslikud peremehed. Rickettsia liigid jagatakse tähnilise palaviku (Eesti kandis, Euroopas üldse pole, v.a. R. akari) ja tüüfuse gruppi. Rakuseinastruktuurid tüüpilised G–: peptidoglükaan (õhuke), LPS (nõrga endotoksiiniaktiivsusega). Värvitakse Giemsa või Gimeneze järgi. Rangelt intratsellulaarsed, leiduvad vabalt tsütoplasmas. Rakku sisenevad, stimuleerides fagotsütoosi, siis degradeerivad fagosoomi membraani (toodavad fosfolipaasi). Paljunevad aeglaselt pooldumisel (generatsiooniaeg 9…12 h). Orientia ja tähnilise palaviku grupi Rickettsia kasvavad tsütoplasmas ja tuumas, vabanevad pidevalt rakust. Tüüfuse grupi liikmed aga akumuleeruvad ja vabanevad rakumembraani lüüsil. Fundamentaalne erinevus seisneb ilmselt rakusiseses liikuvuses: tähnilised suudavad rakus aktiini polümeriseerida. Bakterid on küll võimelised ATPd tootma, kuid kasutavad raku varusid, kuni võimalik
Bakterites on kirjeldatud üle 20 RNaasi, mis osalevad tRNA-de ja rRNA protsessingul. Mõned neist osalevad ka mRNA degradatsioonil. Vastavalt sellele, kas nad lõikavad RNA molekulide sisemistesse järjestustesse, lõhkudes fosfodiestersidemeid või lagundavad RNA molekule otsast, jaotatakse RNaase endo- ja eksoribonukleaasideks. Eksoribonukleaasid Erinevalt eukarüootidest on bakteritel kirjeldatud ainult 3' 5' suunas mRNA-d lagundavaid eksoribonukleaase. Põhilised mRNA-d degradeerivad eksoribonukleaasid on polünukleotiidi fosforülaas ja RNaas II. Juhul, kui degradatsiooni käigus ei tule ette ületamatuid sekundaarstruktuure, jäävad algsetest mRNA molekulidest järele ainult lühikesed, 10 20 nt-pikkused oligonukleotiidid molekulide 5' otstest. Tekkinud oligod degradeerib RNaas I. Paljudel mRNA-del on 3' otsas juuksenõelastruktuur, mis on mRNA-d stabiliseeriva toimega. Arvatakse, et see juuksenõelastruktuur ei pruugi alati sugugi olla
Alfa ahelal on kaks domeeni, mis seostuvad tsütosooli valgust pärit proteiiniga. Kuna MHC I klassi molekulid esitavad peptiide, mis on pärit tsütosooli proteiinist, kutsutakse seda presentatsiooni rada ka tsütosooli või endogeenseks rajaks. Peptiidid toodetakse peamiselt tsütosoolis proteasoomide poolt. Viimased on proteolüütilise aktiivsusega makromolekulid, mis degradeerivad intratsellulaarseid proteiine väiksemateks peptiidideks, mis seejärel vabastatakse tsütosooli. Peptiidid liiguvad tsütosoolist endoplasmaatilisse retiikulumi, et nad kohtuks seal MHC I klassi molekulidega. MHC I klassi molekul edastab info rakule, millel on CD8 ja TCR ehk siis tsütotoksilisele T- lümfotsüüdile (Tc-rakk). Kuna viirused nakatavad rakku tsütoplasmasse sisenedes selle tsütosooli, siis MHC I-st sõltuv antigeeni
Toimub transkriptsioon. Transkriptsiooni initsiatsiooniks seondub RNA polümeraas spetsiifiliselt promootorjärjestusega ning seejärel katkevad promootrorpiirkonnas DNA ahelate vahelised vesiniksidemed. Ei vaja initsiatsiooniks praimerit. 3. Pöördtranskriptaas e. revertaas ensüüm, mis sünteesib RNA ahelale komplementaarse DNA ahela. Vajab sünteesil paimerit. Nukleaasid Ensüümid, mis degradeerivad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid. 1. Eksonukleaasid lagundavad nukleiinhappe ahelat kas 5' või 3' otsast. 5'eksonukleaasid 3'eksonukleaasid 2. Endonukleaasid lagundavad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid ahelasiseselt Restriktsioonilised endonukleaasid e. restriktaasid DNA ligaas ensüüm, mis liidab DNA ahelate otsad, katalüüsides fosfodiestersideme moodustumist 5' fosfaadi ja 3'-OH rühma vahel.
Toimub transkriptsioon. Transkriptsiooni initsiatsiooniks seondub RNA polümeraas spetsiifiliselt promootorjärjestusega ning seejärel katkevad promootrorpiirkonnas DNA ahelate vahelised vesiniksidemed. Ei vaja initsiatsiooniks praimerit. 3. Pöördtranskriptaas e. revertaas ensüüm, mis sünteesib RNA ahelale komplementaarse DNA ahela. Vajab sünteesil paimerit. Nukleaasid Ensüümid, mis degradeerivad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid. 1. Eksonukleaasid lagundavad nukleiinhappe ahelat kas 5' või 3' otsast. 5'eksonukleaasid 3'eksonukleaasid 2. Endonukleaasid lagundavad nukleiinhapet, lõhkudes fosfodiestersidemeid ahelasiseselt Restriktsioonilised endonukleaasid e. restriktaasid DNA ligaas ensüüm, mis liidab DNA ahelate otsad, katalüüsides fosfodiestersideme moodustumist 5' fosfaadi ja 3'-OH rühma vahel.
annaabi.ee 
