Transport ise aga on ühesuunaline. Transpordi suund on import(eksport)kompleksi kiire dissotsiatsiooni tagajärg pärast seda, kui ta on tuumaplasmasse jõudnud. Selle tulemusena moodustub importkargokompleksi grandient läbi NPC: see on suhteliselt kõrgem tsütoplasmas, kus kompleks moodustub, ja suhteliselt madalam tuumas, kus ta dissotseerub. Antud kontsentratsioonigradient on see, mis teeb tuumaimpordi ühesuunaliseks protsessiks. 55. Mis on genoom? proteoom? transkriptoom? reguloom? Genoom on ühes liigiomases kromosoomikompleksis sisalduv geneetiline materjal. Proteoom on kõik valgud, mis on genoomi, raku, koe või organismi poolt ekspresseeritud (antud ajahetkel ja tingimustes). Transkriptoom on kõigi RNA molekulide kogum produtseeritud ühes rakus või rakuhulgas. Terminit võib laiendada ka kogu organismi RNAde kogumile. Reguloom on kõigi regulaarsete komponentide kogum rakus
difusioon toimib läbi NPC ilma takistuseta, ei vaja spetsiaalseid kandjaid ega energiat. Tuumapoori kompleks koosneb umbes 3000-5000 poorist, iga poor koosneb u 100st valgust, millest enamik on tähistatud erineva numbriga nukleoporiinina. Tsütoplasmapoolsel osal poorist jäävad väljaulatuvad filamendid, sissepoole jääb tuuma korv. Poori moodustavad valgukompleksid on seotud ka tuuma lamiinidega. 5. Millised valgumolekuli osad tagavad tuumaimpordi ja -ekspordi valkudele, mille suurus ületab tuumapoori difusioonipiiri? Kirjelda neid lühidalt. Tuumaimpordi tagab valkudele NLS signaaljärjestus (nuclear localization signal) ja ekspordi NES ehk nuclear export signal. Mõlemad on lühikesed aminohappelised järjestused. Ei lõigata kohe ära, sest võib korduvkasutuseks vaja minna. Valgud ei pea olema lahti keerdunud. 6. Kuidas liigitatakse karüoferriine ning mis on rakus nende ülesandeks?
läbi NPC ilma takistuseta, ei vaja spetsiaalseid kandjaid ega energiat. Tuumapoori kompleks koosneb umbes 3000-5000 poorist, iga poor koosneb u. 100st valgust, millest enamus on tähistatud erineva numbriga nukleoporiinina. Tsütoplasmapoolsel osal poorist jäävad väljaulatuvad filamendid, sissepoole jääb tuuma korv. Poori moodustavad valgukompleksid on seotud ka tuuma lamiinidega. 5. Millised valgumolekuli osad tagavad tuumaimpordi ja -ekspordi valkudele, mille suurus ületab tuumapoori difusioonipiiri? Kirjelda neid lühidalt. Tuumaimpordi tagab valkudele NLS signaaljärjestus (nuclear localization signal) ja ekspordi NES ehk nuclear export signal. Mõlemad on lühikesed aminohappelised järjestused. Ei lõigata kohe ära, sest võib korduvkasutuseks vaja minna. Valgud ei pea olema lahti keerdunud. 6. Kuidas liigitatakse karüoferriine ning mis on rakus nende ülesandeks?
erinevalt mitokondriaalsetest pakitakse peroksüsomaalsed valgud tsütosoolis; transport nõuab ATP energiat (sarnasus), kuid mitte elektrokeemilist gradienti (erinevus). 12. Millised valgud on võimelised tuuma sisenema passiivse transpordiga? Madalmolekulaarsed, kuni 17000 Da puhul suhteliselt kiire difusioon. 13. NLS - nuclear localization signal, vajalik aktiivseks transpordiks suuremate kui 60 kDa valkude puhul, tunneb ära tuumaimpordi retseptori, ja NES sama, mis NLS, ainult ekspordi puhul, tuumatranspordi mehhanism NLSi või NESiga valk seondub tugevalt importiini või eksportiiniga ja see kompleks liigub läbi tuumapoori ja energeetilised aspektid GTP ja GDP. 14. Ran valkude tsükkel, nende osa transpordil impordi puhul: Ran-GTP liitub tuumas eelnevalt tekkinud kompleksiga, see vabastab valgu importiinist ja Ran-GTP/importiini kompleks liigub läbi poori tuumast välja
erineva numbriga nukleoporiinina (NUP). Poore on tuumamembraanis 3000-5000. Elektronmikroskoobiga saadud tulemustele toetudes on leitud, et tuuma poori tsütoplasma poolsel küljel asuvad välja sirutunud filamendid ning tuuma sisemuse poole jääb nn tuuma korv (korvi seina moodustava filamendi pikkus ca 100 nm). Poori moodustavad erinevad valgukompleksid on lisaks seotud tuuma lamiinidega. Millised valgumolekuli osad tagavad tuumaimpordi ja -ekspordi valkudele, mille suurus ületab tuumapoori difusioonipiiri? Kirjelda neid lühidalt. Tuuma poori avaust täidavad tuumapoori valkude sabad, kus paiknevad vaheldumisi hüdrofoobsed a- happejäägid (FG – fenüülalaniin ja glütsiin) ja hüdrofiilsed aminohappejäägid, moodustades seeläbi geelja struktuuri. On postuleeritud, et see keskkond on sobitunud just tuuma transportvalkudele, mis tänu oma keemilistele omadustele suudavad geeljat keskkonda kergelt läbida. Vastavat
tähistatud erineva numbriga nukleoporiinina (NUP). Poore on tuumamembraanis 3000-5000. Elektronmikroskoobiga saadud tulemustele toetudes on leitud, et tuuma poori tsütoplasma poolsel küljel asuvad välja sirutunud filamendid ning tuuma sisemuse poole jääb nn tuuma korv (korvi seina moodustava filamendi pikkus ca 100 nm). Poori moodustavad erinevad valgukompleksid on lisaks seotud tuuma lamiinidega. 5. Millised valgumolekuli osad tagavad tuumaimpordi ja -ekspordi valkudele, mille suurus ületab tuumapoori difusioonipiiri? Kirjelda neid lühidalt. Tuuma poori avaust täidavad tuumapoori valkude sabad, kus paiknevad vaheldumisi hüdrofoobsed a-happejäägid (FG fenüülalaniin ja glütsiin) ja hüdrofiilsed aminohappejäägid, moodustades seeläbi geelja struktuuri. On postuleeritud, et see keskkond on sobitunud just tuuma
25. Millised valgud on võimelised tuuma sisenema passiivse transpordiga? Tuumapoorikompleks- koosneb rohkem kui 50 valgust nukeloporiinidest- 3000-4000 poori Madalmolekulaarsed lähevad läbi Kuni 17 000Da suhteliselt kiire diffusioon 26. NLS, ja NES, tuumatranspordi mehhanism ja energeetilised aspektid. Suuremad kui 60 000Da ei läbi- peab olema aktiivne transport-NLS NLS- 4-8 AH järjestused, Lys Arg rikkad NLS tunneb ära tuumaimpordi retseptori NLS nuclear localisation signal , NES nuclear export signal. Energeetiline aspekt on see, et nad on GTPaasse aktiivsusega. Ran-GEF interakteerub ja fosforüleerib Ran-GDP-d, tõrjub valgu küljest ära, aitab valku vabastada. Ran-GAP interakteerub Ran-GDP-ga ehk siis defosforüleerib. 27. Ran valkude tsükkel, nende osa transpordil. Ran'id seonduvad valkudega, millel on tuumalokalisatsiooni signaal ning aitavad nad tuuma transportida ning tuumast välja transportida.