PolII - koosneb 12-st subühikust (Rpb1-12), millest suurimad on Rpb1 ja Rpb2. 12. PolI-sõltuv transkriptsioon: koos seonduvad UBF (upstream binding factor) ja SL1 (promoter selectivity factor). SL1 koosneb TBP-st ja kolmest TAF-ist. TIFIA (transcription intermediary factor) seondub SL1 ja Pol I-ga. Pol I seondub ka veel vähemalt kahe faktoriga TIFIC ja TFIIH. PolII-sõltuv transkriptsioon: vajalik fakrot - TFIID. Pol I ja Pol III promootoritel moodustub PIC üldjoontes sarnaselt Pol II promootoritega, kuid erinevaid faktoreid on vähem. PolIII-sõltuv transkriptsioon: vajalik fakrot - TFIIIC. promootorid on reeglina transkribeeritava ala sees. Promootorit tunneb ära TFIIIC (5 subühikut), mis toob kohale TFIIIB (koosneb TBP-st ja kahest TAF-ist) TFIIIB toob kohale Pol III. 13. Transkriptsioon - on RNA molekuli süntees, mis toimub rakutuumas interfaasi ajal + tsütoplasmas. Transkriptsioonifaktorid paiknevad tuumas. 14
· Sündmuste asukoht · Võimu asukoht · Ennustatavus ja rutiinsus · Uudissündmuste lähedus auditooriumile · Sündmuste värskus ja aktuaalsus · Ajastus seoses uudistetsükliga 41. Suhtekorraldus ja uudiste käitlus Mõnes valdkonnas on uudistemeedia ja allikate sulandumine peaaegu täielik nt poliitika, riigivalitsemine ja kohtuvõim. Sellele aitab kaasa professionaalsete suhtekorraldusagentuuride tegevus. Ürituste promootoritel on võimalik kontrollida sündmusi puudutavaid teateid ja saavutada juurdepääsu meediale, sealjuures oma tingimusi esitades. Neil on väidetavalt juurdepääs uudiste kogujatele või nad kasutavad oma võimu selleks, et takistada teiste ligipääsu ja luua meedia tähelepanu köitmiseks ise pseudosündmusi. Protsess, mille käigus püütakse mõjutada uudiseid, on hoogustunud seoses kampaaniate korraldamise kaasaegse tehnikaga ja arvamusuuringutega
Kromosoomi struktuur, histoonid: Prokarüootidel puuduvad valgud kromosoomis, seepärast regulatsioon vahetu sidumine DNAga. Eukarüootidel kromosoomis DNA seotud histoonidega; see takistab transkriptsiooni, sest ei lase valkudel seonduda DNAga ja aktiveerida geene. Tõestatud DNase I tundlikkusega: DNaas I degradeerib transkriptoorselt aktiivset DNA-d; Histoonid katavad mitte- transkribeerivat DNA-d DNaas I eest. Kui lisada histoone, siis konkureerivad histoonid sidumisega promootoritel ja inhibeerivad transkriptsiooni. Järelikult transkriptoorselt aktiivsed geenid on nõrgemalt histoonidega seotud kui inaktiiivsed. Histoonid modifitseeruvad nii fosforüleerimise kui atsetüleerimise teel, mis muudab nende sidumisvõimet DNA-ga. Enhanseriga seonduvad valgud konkureerivad ja blokeerivad histoone ja TF-valk komplekse. RNA polümeraas ja TF peavad minema mööda histoonidest. Kui see juhtub, algab transkriptsioon.
2ßß` - apoensüüm - koosneb neljast subühikust ja on võimeline katalüüsima RNA sünteesi. ülesandeks on apoensüümi assambleerumine (N-terminus) ja interaktsioon TF-dega või promootori UP-elemendiga (C-terminus). Sageli on transkriptsiooni initsiatsiooniks vajalik ka spetsiifiliste TF-de olemasolu. Kui transkriptsiooni kontrolliv järjestus -35 on vaevu äratuntav on vajlikud transkriptsiooni aktivaatorid. Miks ei ole konsensus igalpool? vaja geeniregulliks. Aktiveeritavatel promootoritel on -35 heksameer konsensusjärjestusest TTGACA märkimisväärselt erinev konsensusjärjestusest ja sel juhul soodustab aktivaator polümeraasi seondumist promootorile. Lisaks TF-dele toimub transkriptsiooni regulatsioon ka erinevate faktorite kaudu. RNA polümeraasi subühikud on eraldivõttes inaktiivsed. Ainult ß`on võimeline DNA-ga mittespetsiifiliselt seonduma. Seetõttu seondub ka RNA polümeraasi apoensüüm DNA-ga mittespetsiifiliselt. faktori lisandumisel
Ühe valgu seondumine promootoralale võib soodustada teiste transkriptsiooni aktivatsioonil osalevate valkude seondumist DNA-le.Valkude kooperatiivsel seondumisel DNA-le on oluline, et nad oleksid üksteisega interakteerumiseks seondunud DNA-le samas faasis. Kui kahe seondumissaidi vaheline kaugus ei ole täispöördeline, ei pruugi valkudel transkriptsiooni aktivatsioonile efekti olla. Aktiveeritavatel promootoritel on -35 heksameer konsensusjärjestusest TTGACA märkimisväärselt erinev ja sel juhul soodustab aktivaator polümeraasi seondumist promootorile. Sama aktivaator võib erinevate promootorite transkriptsiooni aktivatsioonil toimida erinevalt. Aktivatsiooni mehhanism sõltub sellest, kui kaugele regulaator promootorist seondub. CRP (cAMP Receptor Protein), tuntakse ka nimetuse all CAP (Catabolite Gene Activator Protein), on
seonduma basaalsed transkriptsioonifaktorid. Erinevate RNA polümeraaside puhul on promootorelemendid ja sinna seonduvad transkriptsioonifaktorid erinevad. Järgnevalt tuleb põhjalikumalt juttu transkriptsiooni initsiatsioonist RNA polümeraas II puhul. Nii nagu bakterirakus, on ka eukarüoodirakus transkriptsiooni initsiatsiooniks vajalik DNA ahelate lokaalne teineteisest eemaldumine. RNA polümeraasi II poolt äratuntavatel promootoritel on mitu konserveerunud elementi. Transkriptsiooni alguskohale kõige lähemal paikneb TATA element (ingl. k. TATA box), mille konsensusjärjestus on TATAAAA ja mille keskmine nukleotiid paikneb transkriptsiooni alguspunktist keskmiselt 30 nukleotiidi kaugusel. Järgmine konserveerunud element CAAT konsensusjärjestusega GGCCAATCT asub kaugusel 80 nukleotiidi transkriptsiooni alguspunktist. Lisaks on promootoralas sageli
elongatsiooni puhul. Tekib keerde sisse (supervindid + ja – pidi) – topoisomeraasid. TATA box - TATAXAX ( X = A/T) äratundmispiirkond – kui sellest mööda saab, siis transkriptsioon võib pihta hakata. TFIID – koosneb paljudest valkudest. Võib ära tunda erinevaid piirkondi promootoril, sest on palju subühikuid. Oluline on eukarüootsete promootorite puhul start sadi ümbruses. Kui 1. nukleotiid lülitatakse 5’ otsa mRNA-l. Oma konsensusjärjestus, mis bakteriaalsetel promootoritel pole. Need esinevad ka kodeeriva järjestuse sees. Põhi polümeraas II promootor koosneb 4-st järjestuselemendist – TF II B, TBP, TF IID, TF II A Polümeraasi kokkupanek: 1) on geen, promootor ja TATA box 2) pärast TATA-t seondub TF II A 3) esimesena seostub faktor TF IID ja TBP (data binding protein). Üle selle tunneb ära TATA box-i 4) siis seonduvad veel 2 TF IIB ja TF IID. 5) siis saab seonduda RNA polümeraas II –
seonduma basaalsed transkriptsioonifaktorid. Erinevate RNA polümeraaside puhul on promootorelemendid ja sinna seonduvad transkriptsioonifaktorid erinevad. Järgnevalt tuleb põhjalikumalt juttu transkriptsiooni initsiatsioonist RNA polümeraas II puhul. Nii nagu bakterirakus, on ka eukarüoodirakus transkriptsiooni initsiatsiooniks vajalik DNA ahelate lokaalne teineteisest eemaldumine. RNA polümeraasi II poolt äratuntavatel promootoritel on mitu konserveerunud elementi. Transkriptsiooni alguskohale kõige lähemal paikneb TATA element (ingl. k. TATA box), mille konsensusjärjestus on TATAAAA ja mille keskmine nukleotiid paikneb transkriptsiooni alguspunktist keskmiselt 30 nukleotiidi kaugusel. Järgmine konserveerunud element CAAT konsensusjärjestusega GGCCAATCT asub kaugusel 80 nukleotiidi transkriptsiooni alguspunktist. Lisaks on promootoralas sageli
RelA sünteesib pppGpp (guanosiinpentafosfaati), mille katalüüsib ppGpp-ks guanosiinpentafosfaadi fosfohüdrolaas GppA. Selle geeni transkriptsioon on tugevalt represseeritud kui DNA globaalne negatiivne superspiralisatsioon väheneb. Seega, kui rakud sisenevad statsionaarsesse kasvufaasi, siis ppGpp süntees väheneb. Kui valkude süntees on stabiliseerunud (piisavalt aminohappeid ribosoomide kohta), siis SpoT lagundab (p)ppGpp. Alarmoonist sõltuvatel promootoritel on iseloomulik diskriminaatorjärjestus, mis on -10 elemendi ja transkriptsiooni alguspunkti vahel olev GC-rikas järjestus. Diskriminaatori abil pärsitakse avatud kompleksi avanemist ning transkriptsiooni initsiatsiooni, sest GC-rikas ala takistab ahelate lahtisulamist, mis päädib RNAP dissotseerumisega DNA-lt. Ühe hüpoteesi kohaselt ppGpp seondub diskriminaatorjärjestuses olevate C-nukleotiididega ning takistab sedasi promootori vabastamist.
annaabi.ee 
