Regulatsioon Rakk on piltlikult võrreldav tööstusettevõttega · Vabrik Rakk · Toorained Lähteained · Valmistoodang Lõpp-produktid · Vaheproduktid metabolismi vaheühendid · Tööpink Ensüüm · Tootmisliin Metabolismirada Vabriku töö peab olema reguleeritud: erinevate tööpinkide läbilaskevõime koordineerimine erinevate tootmisliinide läbilaskevõime koordineerimine tooraine jaotus erinevate tootmisliinide vahel turu nõudlus erinevate valmistoodete järele Vabrikus on insenerid ja ülemused Rakkudes toimib rida erinevaid regulatsioonimehhanisme Reguleeritakse ensüümkatalüüsitavate reaktsioonide toimumise kiiruseid:
Põhjendage. (võivad olla erinevad arvud). Ei ole, sest ensüümi KM peab olema suurem kui substraadi kontsentratsioon. 80. Rakus toimib biokeemiline rada A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Sest siis ei akumuleeru vaheühendid, mis ei ole vajalikud. 81. Kuidas võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. A B C D E Kui ühendit E saab liiga palju, siis tema akumuleerimine inhibeerib A-B reaktsiooni. 82. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu inhibeerima ja aktiveerima, et saavutada olukord, kus F ja I esineksid võrdsetes hulkades ja samuti oleks kontrollitud F + I summaarne hulk rakus?
78. Rakus toimib biokeemiline rada A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Inhibeerides raja esimest ensüümi välditakse lisaks lõpp-produkti E akumuleerumisele ka lähteühendi A mõttetut tarbimist ja vaheproduktide B, C ja D moodustumist. 79. das võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. 80. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu inhibeerima ja aktiveerima, et saavutada olukord, kus F ja I esineksid võrdsetes hulkades ja samuti oleks kontrollitud F + I summaarne hulk rakus? 81. Millised väited on õiged allosteerilise ensüümi kohta? Allosteeriline ensüüm on reeglina multimeerne
Põhjendage. (võivad olla erinevad arvud). 80. Rakus toimib biokeemiline rada A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Inhibeerides raja esimest ensüümi välditakse lisaks lõpp-produkti E akumuleerumisele ka lähteühendi A mõttetut tarbimist ja vaheproduktide B, C ja D moodustumist. 81. Kuidas võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. 82. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu inhibeerima ja aktiveerima, et saavutada olukord, kus F ja I esineksid võrdsetes hulkades ja samuti oleks kontrollitud F + I summaarne hulk rakus? Produkt F peab inhibeerima CD katalüüsivat ensüümi ja/või aktiveerima CG katalüüsivat ensüümi. Ja sama I-ga.
muudab oma kuju ja selle tulemusel reaktsioon aeglustub. 88. Rakus toimib biokeemiline rada: A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Sest siis ei akumuleeru vaheühendeid, mis ei ole vajalikud. 89. Kuidas võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. A B C D E Kui ühendit E saab juba liiga palju siis tema akumuleerumine inhibeerib A > B reaktsiooni 90. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu inhibeerima ja aktiveerima, et saavutada olukord, kus F ja I esineksid võrdsetes hulkades ja samuti oleks kontrollitud F + I summaarne hulk rakus? D E F A B C G H I
produkti seostumine sünteesi katalüseeriva valguga, mis muudab oma kuju ja selle tulemusel reaktsioon aeglustub. 88. Rakus toimib biokeemiline rada: A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Sest siis ei akumuleeru vaheühendeid, mis ei ole vajalikud. 89. Kuidas võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. A B C D E Kui ühendit E saab juba liiga palju siis tema akumuleerumine inhibeerib A > B reaktsiooni 90. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu inhibeerima ja aktiveerima, et saavutada olukord, kus F ja I esineksid võrdsetes hulkades ja samuti oleks kontrollitud F + I summaarne hulk rakus? D E F A B C G
transkriptsiooni. Kui glükoosi keskkonnas pole, toimub valgu HPr alternatiivne fosforüleerimine PTS ensüümi EI poolt valgu 15-ndas positsioonis asuvast histidiinist (His15) ning operonide transkriptsioon on aktiveeritud. 45 Pseudomonas spp. bakteritel klassikalist glükoosi poolt vahendatud kataboliitset repressiooni ei toimu. Neil on ka glükoosi metabolismirada erinev. Kui E. coli rakkudes toimub glükoosi kasutamine läbi EMP (Embden-Meyerhof-Parnas) raja, kus glükoos 6-fosfaat konverteeritakse püruvaadiks, siis pseudomonaadides metaboliseeritakse glükoos Entner-Doudoroff'i raja kaudu, mida E. coli's kasutatakse glükonaadi lagundamiseks. Rajas on 2 esüümi, 6-fosfoglükonaadi dehüdrataas, mis on kodeeritud geeni edd poolt ja 2-keto-3-deoxy-6-fosfoglükonaadi (KDPG) aldolaas, mis on kodeeritud eda geeni poolt. E.
RNAP transkribeerib korraga, nimetatakse operoniks ning sellist RNA-d, mis sisaldab mitme geeni RNA-d, nimetatakse polütsistroonseks RNA-ks. Tavaliselt on ühes operonis sellised geenid, mis on seotud sama funktsiooni või mehhanismiga. Näiteks tihti on sekundaarsete C-allikate katabolismi geenid ühes operonis. Geene, mis vastutavad sama C-allika metabolismi eest on efektiivne transkribeerida korraga ühe promootori alt, sest sellisel juhul aktiveeritakse kogu metabolismirada korraga ning aktivatsiooniks on vaja geenide transkriptsiooni reguleerida ainult ühe promootori kaudu, mis on energeetiliselt efektiivne. Reguloniks nimetatakse neid operone ja geene, mida reguleerib üks regulaatorvalk, näiteks arginiini regulon. Moduloniks nimetatakse regulone, operone ja geene, mida reguleerib globaalne regulaatorvalk nagu näiteks Crp. Erinevus regulonidest on signaali ulatus. Moduloni korral on muudetavate