3. Eadie-Hofstee: V versus V/[S] V = Vmax KM(V/[S]) Ensüümkineetika andmete analüüs Kui tulemuseks on sirge siis kehtib Michaelis Menteni võrrandile vastav kineetika Vmax ja KM on leitavad sirge parameetritest (tõus ja vabaliige) Kui [E]t on teada siis saame Vmax väärtusest leida ka kcat väärtuse Mitmesubstraatsed reaktsioonid Valdav osa ensüümkatalüüsitavaid reaktsioon toimub rohkem kui ühe substraadi osavõtul Tõelised ühesubstraatsed reaktsioonid isomerisatsioonireaktsioonid Milleks nii palju vaeva ühesubstraatsete reaktsioonide analüüsile? Enamus kahe- või rohkema substraatsete reaktsioonide kineetika on analüüsitav analoogselt ühesubstraatsete reaktsioonide kineetikale, kui me hoiame ühe substraadi kontsentratsiooni konstantse ja varieerime ainult teise substraadi kontsentratsiooni Ensüümkineetika allub ikka Michaelis-Meteni võrrandile Saadud ensüümkineetika parameetrid on näilised ja sõltuvad konstantsena hoitud substraadi kontsentratsioonist
· dekarboksülaasid · CO2 ellimineerimine · dehüdrataasid · veemolekuli elimineer · hüdrataasid · veemolekuli liitmine · süntaasid · kondensatsioonireakts (ei vaja ATP energiat) · aldolaasid · aldehüüdi teke 5. Isomeraasid Isomerisatsioonireaktsioonid (funktsionaalsete Metüülamalonüül- · ratsemaasid, epimeraasid rühmade molekulisisene ülekanne isomeeride CoA mutaas · isomeraasid tekkega) · osa mutaase 6. Ligaasid Sünteesreaktsioonid ATP jt otsesel osalusel Püruvaadi · süntetaasid karboksüülimine sünteesi käigus kaboksülaas · karboksülaasid Omadused
informatiivne). Klassifikatsioon (lähtuvalt inimkehas toimuvatele ensüümreaktsioonidele) Katalüüsitavate reaktsioonide alusel jaotuvad 6 klassi : 1. oksüdoreduktaasid redoksreaktsioonid 2. transferaasid funktsionaalsete gruppide ülekanne 3. hüdrolaasid hüdrolüüsireaktsioonid 4. lüaasid sideme C-C, C-O, C-N, C-S lõhustumine 5. isomeraasid isomerisatsioonireaktsioonid (molekulisisesed ümberkorraldused) 6. ligaasid sünteesireaktsioonid Omadused Valguliste biokatalüsaatoritena on ensüümidel nii valkude kui ka katalüsaatorite üldomadused. Ensüüm kui valk on - kõrgmolekulaarne ühend - hüdrofiilne amfoteerne polüelektrolüüt - denatureeruv - kristalliseeruv Ensüüm kui katalüsaator - ei muuda reaktsiooni suunda - katalüüüsib termodünaamiliselt võimalikke reaktsioone
Ensüümid on spetsiaalsed liht-või liitvalgud, milledel on biokatalüütiline aktiivsus. Ensüümid jagunevad kuude klassi: Oksüdoreduktaasid redoksreaktsioonid Transferaasid fn gruppide ülekanne Hüdrolaasid hüdrolüüsireaktsioonid Lüaasid sidemete C-C, C-O, C-N ja C-S lõhkumine Isomeraasid isomerisatsioonireaktsioonid Ligaasid sünteesireaktsioonid. Ensüümid tõstavad alandavad reaktsiooni kiirust limiteerivat energeetilist barjääri. 15. Ensüümide toimemehhanism, substraat, ensüümaktiivsus, aktiivtsenter, koensüüm. Ensüümreaktsiooni toimumiseks peab ensüüm siduma ja muundama ühendit (substraati). Ensüümimolekulil on selleks vastav pinnaala (aktiivtsenter). Aktiivtsenter seob spetsiifiliselt substraadi ja teostab tema katalüüsi produktiks
järgmistes tingimustes 1. Vajalik on eelkõige sünteesida riboos-5-fosfaati; 2. Vajalik on eelkõige sünteesida NADPH; 3. Vajalik on sünteesida nii riboos-5-fosfaati kui ka NADPH-d. 1. 5 Glükoos-6-fosfaati + ATP 6 Riboos 5-fosfaati + ADP 2. Glükoos-6-fosfaadi dehüdrogenaas. Glükoos-6-fosfaat + NADP+ 6-Fosfoglükonolaktoon + NADPH + H+. 3. Kirjeldage, millised on isomerisatsioonireaktsioonid pentoosfosfaadi rajas. 4. Võrrelge tiamiin pürofosfaadi poolt läbiviidavat katalüüsi transketolaasi ja püruvaadi dehüdrogenaasi reaktsioonides RASVHAPETE LAGUNDAMINE JA SÜNTEES. KETOKEHAD Rasvhapped ja nende -oksüdatsioon 1. Nimetage rasvhapete 3 olulist füsioloogilist funktsiooni. Energeetiline funktsioon, soojusisolaatorid rasvkude oluline külma kliimaga, oluline osa membraanide
kiiresti. Ensüümid ei muuda reaktsiooni suunda, ei muuda tasakaaluseisundit vaid kiirendavad selle saabumist, ei lõhustu reaktsiooni käigus. Klassifiatsioon: 1. Oksüreduktaasid katalüüsivad redoksreaktsioone 2. Transferaasid Funktsionaalsete rühmade ülekanne 3. Hüdrolaasid katalüüsivad hüdrolüüsi 4. Lüaasid Kaksiksidemete (nt. C-C, C-O,C-N, C-S) lõhustamine 5. Isomeraasid Isomerisatsioonireaktsioonid 6. Ligaasid sünteesireaktsioonid 15.Ensüümide toimemehhanism, substraat, ensüümiaktiivsus, aktiivtsenter, koensüümid Toimemehhanism ensüümide poolt katalüüsitud reaktsioonide aktivatsiooni alandamine saadakse ensüümi ja substraadi (ES) kompleksi moodustamise abil: E + S ES -> E +P (produkt) ES kompleksi tekkes osalevad vesiniksidemed, hüdrofoobsed ja elektrostaatilised vastaktoimed. Reeglina pöörduv.