[EC:4.1.2.13]; K01623 fructose-bisphosphate aldolase, class I (N)" starting "atgacagata" Site: Positions: AatI agg|cct none AatII gacgt|c none Acc16I tgc|gca 15, 372, 567 AccII cg|cg 114, 361, 482, 933 AccIII t|ccgga none AclI aa|cgtt none AcvI cac|gtg none AfaI gt|ac 170, 913 AfeI agc|gct none AflII c|ttaag none AgeI a|ccggt 662 AhlI a|ctagt none Alw441 g|tgcac none AluI ag|ct 82, 248, 574, 830 Aor51HI agc|gct none ApaI gggcc|c none ApaLI g|tgcac none AscI gg|cgcgcc none
U paardub A või G I (Inosiin) Paardub A, U, või C I = posttranskriptoorne modifitseeritud puriin TTT TCT TAT TGT TTC TCC TAC TGC TTA TCA TAA TGA Geneetilised koodid TTG TCG TAG TGG CTT CCT CAT CGT CTC CCC CAC CGC CTA CCA CAA CGA CTG CCG CAG CGG ATT ACT AAT AGT ATC ACC AAC AGC ATA ACA AAA AGA ATG ACG AAG AGG GTT GCT GAT GGT GTC GCC GAC GGC GTA GCA GAA GGA GTG GCG GAG GGG PHE SER TYR CYS PHE SER TYR CYS LEU SER STOP STOP LEU SER STOP TRP LEU LEU LEU LEU PRO HIS ARG PRO HIS ARG PRO GLN ARG PRO GLN ARG ILE THR ASN SER ILE THR ASN SER ILE THR LYS ARG MET THR LYS ARG VAL ALA ASP GLY VAL ALA ASP GLY PHE SER TYR CYS NEUTRALPOLAR BASIC
Tavaline mõõtühik on DPI (pikslit tolli kohta). · Kaadrisagedus: Näitab, kui tihti ekraan oma andmeid uuendab, Pilt ekraanil aga ei muutu sama tihedalt, kuna andmetöötlus ja piksli oleku muutmine nõuavad lisaaega. Mõõtühik herts (Hz, võnget/korda sekundis). 5 · Reageerimisaeg: Aeg, mis kulub pikslil ühest värvist teise muutumiseks. Mõõdetakse nii gtg (hallist-hallini) kui btb (mustast-mustani) aega, mistõttu tulemused pole alati võrreldavad. Mõõtühik millisekund (ms). · Vaatenurk: Minimaalne ja maksimaalne kaldenurk, kus 180° on paralleelne vaatajaga. Kuidas töötab LCD monitor (pildil) ELEKTRONKIIRETORU EHK CRT Tööpõhimõte Optiline kujutis saadakse peene elektronkiire põrkumisel vastu ekraani, mille luminofooriga kaetud kiht jätab elektronkiire liikumise teest nähtava jälje
Maksimaalne lahutus on 1000-1250 vööti genoomi kohta. Üks vööt sisaldab tavaliselt 2-5 Mb DNA-d. Eukromatiini diferentsiaalvärvimine Eukromatiini värvimiseks on Q-, G- ja R-vöötide meetodid. Q-vöötide meetod töötati välja 1968. aastal. Selle meetodi puhul värvitakse kromosoome lühiajaliselt fluorokroomiga ja analüüsitakse seejärel fluorestsentsmikroskoobis. Töötluse tulemusena vahelduvad alad tuhmi hiilgusega aladega. G-vöötide meetod ehk GTG-meetod töötati välja 1971.aastal Seabright´i poolt. Meetod hõlmab endas kromosoomide lühiajalist mõjutamist trüpsiiniga ja värvimist Giemsa värviga. Piki kromosoomi saadakse tumedate ja heledate vöötide muster, mis langeb kokku Q-vöötide hiilgavate ja tuhmide alade vaheldumisega. Arvatakse, et vöödistus tuleneb kromosoomide erinevast kokkupakkimisastmest. R-vöötide meetod ehk RFA- või RHG-meetod töötati välja 1971. aastal Dutrillaux ja Lejeune poolt.
on tegemist 0,2 ml PCR katsutitega, mis sisaldavad lõppreaktsiooni mahu tingimustes (25 µl) alljärgnevaid komponente: • ~1,5 U Taq-DNA polümeraasi; • 10 mM Tris-HCL (pH 9,0); • 50 mM KCL; • 1,5 mM MgCl2; • 200 µM igat dNTP; Töö käik. 1. Lisa katsutisse, mis sisaldab PCR kuulikest, reagendid alljärgnevas järjestuses: 1.1. 2 µl praimerit ERIC1 R (5’-ATG TAA GCT CCT GGG GAT TCA C-3’); 1.2. 2 µl praimerit ERIC1 F (5’-AAG TAA GTG ACT GGG GTG AGC G-3’); 1.3. 10 µl kuumutatud bakterite suspensiooni; 1.4. Lisa steriilset destilleeritud vett kuni lõppmahuni 25 µl. 2. Sulge katsutid korgiga ja märgista 3. Sega katsutite sisu vortexil tagamaks PCR kuulikeste sulamist. Vajadusel võib kasutada steriilset pipetti. PCR kuulike peab olema täielikult sulanud! 4. PCR reaktsiooni teostamine termotsükleris. Kasutada on kas Eppendorf Mastercycler® gradient või Mastercycler. PCR reaktsiooni etapid on järgmised: 1
Kliiniline näide : sirprakkuline aneemia - autosoomne retsessivne haigus, mida põhjustab hemoglobiin beeta valgus punkt mutatsioon (SNP). Geen asub11 kromosoomi lühikese õla (p) 15.5 regioonis. Hemoglobiin beeta valk on 146 ah pikk ja molekulaarkaal on ~15,867 Da. SRA puhul asendab HBB valgu kuuendas positsioonis hüdrofoobne valiin hüdrofiiliset glutamiinhapet • Seda tingib SNP, mille puhul kuuenda koodoni keskel T asendab A • SNP muudab GAG koodoni (kodeerib Glu) GTG koodoniks (kodeerib Val) Leukotsütaarne valem ehk leukogramm A. Granulotsüüdid Neutrofiilsed granulotsüüdid 40-75 % Eosinofiilsed granulotsüüdid 1-6 % Basofiilsed granulotsüüdid 0-1 % B. Agranulotsüüdid Lümfotsüüdid 15-45 % (T- ja B-lümfotsüüdid) Monotsüüdid (makrofaagide eelkäijad) 2-10 % 23 Kliiniline näide: diapedees ehk ekstravasatsioon - endoteliaalsed
PCR amplification, cloning and sequencing different runs were normalized, so that the mean of the intensities The ITS region including ITS1, 5.8S gene and ITS2 was in a sequence would be as close as possible to 1000 units. Then to amplified using the primers 18Sfw: 59-TAC ACA CCG CCC obtain the expected values, the mean value among clones for a GTC GCT ACT A and 28S59rev: 59-GAC GTG CCT TTC particular nucleotide in each position was found. The normaliza- CAG GTC AAC TT. The primers were designed to include the tion was needed also because different primers were used for invariant sequence before the heterogenic positions in the sequencing the clones, so any particular nucleotide in the rDNA amplicon