Näide : katalüüsita reaktsioon: BX+Y -> BY+X Kovalentne katalüüs: BX+Y+E -> E:B+Y+X-> E+BY+X Selle mõte on vähendada aktivatsiooni energiat reaktsioonil. Nukleofiilse katalüüsi puhul ensüümi mõni nukleofiilne tsenter (amiin, hüroksüül etc...) atakteerib substraadi elektrofiilset tsentrit. Tekib side substraadi ja ensüümi vahel. 2. Hape-alus katalüüsi põhimõte, ,,spetsiifiline" ja ,,üldine" hape-alus katalüüs. Seriinproteaasid - esindajad, ,,katalüütiline triaad" ja selle roll katalüüsis. · "Spets"Happe-alus katalüüsis osaleb kas H+ või OH-, mis difundeerub katalüütilissse tsentrisse. · "Üldises"Happe-alus katalüüs hõlmab teisi happeid ja aluseid peale H+ ja OH- · Muud happed-alused soodustavad H+ õlekannet siirdeseisundis · Üldine happe-alus katalüüs kiirendab reaktsiooni kuni 100 korda.
katalüüsi korral näiv kiiruskonstant ei sõltu puhvri kontsentratsioonist, üldisel sõltub. · metalli-ioonide katalüüs paljud ensüümid vajavad metalliioonide juuresolekut maksimaalse aktiivsuse saavutamiseks. Metallid toimivad elektrofiilsete katalüsaatoritena, stabiliseerides elektrontihedust või katalüüsi käigus tekkivad negatiivsei laenguid. Metalliioonid on võimelised genereerima võimsaid nukleofiile neutraalse pH juures · seriinproteaasid segu kovalentsest ja happe-alus katalüüsist. Katalüütilisse triaadi kuuluvad Ser, His, Asp. Asp aktiveerib His, His toimib nagu üldine alus ja hape, Ser moodustab kovalentse sideme. Koensüümid Toimivad ensüümide aktivaatoritena ja on peamiselt sünteesitud B-grupi vitamiinidest. · Tiamiin tiamiin pürofosfaat (TPP), oluline süsivesikute metabolismis · Niatsiin NAD+ ja NADP+, elektronide ülekandjad
iooni oksüdatsiooniastme pöörduvale muutumisele * stabiliseerivad või varjestavad katalüüsi käigus tekkivaid negatiivseid laenguid * seostuvad substraatidele, orienteerides neid reaktsiooniks õigesse asendisse Metalloensüümid sisaldavad tugevalt seotud metalli ioone, vajavad neid stabiilse natiivse konformatsiooni säilitamiseks Metall-aktiveeritud ensüümid - seovad metalle nõrgalt ning ainult katalüütilise tsükli käigus Seriinproteaasid - segu kovalentsest ja üldisest hape/alus katalüüsist Aspartaat-proteaasid - näited üldisest hape/alus katalüüsist · Proteolüütilised ensüümid, mida leidub nii loomades, seentes kui kõrgemates taimedes. · Kõik sisaldavad aktiivtsentris kahte Asp jääki. · Kaks Asp jääki töötavad koos üldiste hape-alus katalüsaatoritena. · Aspartaat-proteaasid lõikavad peptiidsidet eelistatult kahe hüdrofoobse aminohappe jäägi vahelt.
- Vasokonstriktsioon - Punase trombi teke, vere hüübimine e. koagulatsioon - Vigastuse sidekoestumine NB! Faaside eristamine on tinglik, sest faasid ei ole ajaliselt ega ruumiliselt eraldatud, vaid pigem üksteisega tihedasti läbipõimunud Hüübimise "loogika" · Vereplasmas paiknevad inaktiivses vormis hüübimisfaktorid. Paljud faktorid toimivad aktiivses vormis proteolüütiliste ensüümidena (seriinproteaasid) ja on võimelised peptiidfragmendi eemaldamise läbi aktiveerima mõnd teist süsteemi valku. · Teatud tingimuste toimel toimub faktorite kindlas järjekorras aktiveerumine, mis resulteerub vigastuskohal punase trombina (kujutab enesest fibriinniidistikku kinni jäänud vererakke), mis ajutiselt täidab vigastusest tingitud sooneseina defekti. Vere hüübimise klassikaline skeem (IX/XX sajandi vahetus)
Põletiku reaksioonis osalevad teised mediaatorid kiniin süsteem - kallikreniin bradükiniin hüübimiskaskaad - fibriin fibrinolüütiline süsteem - plasmiin komplemendi süsteem prostaglandiinid,tromboksaanid tsütokiinid Põletikureakstioonides osalevad kaskaadid. Kiniin –kallikreiin süsteem Inimesel 15 erinevat geeni, tüüpiliselt hulk erinevaid splaisingu variante (eri spetsiifikaga)- olemuselt seriinproteaasid Lõikavad kiniinie, üks levinuimad on – Bradükiniin, koosneb: Arg - Pro - Pro - Gly - Phe - Ser - Pro - Phe – Arg. Bradükiniini retseptor B1 avaldub ainult kudede kahjustuse korral, sellega kaasneb krooniline valu. Kiniinid määravad silelihaste pinge, verevarustusega seotud midagi. Näiteid kallikreiinidest Kallikreiin 1- vasoaktiivset (lisaks lüsiin - veel) Lys-bradükiniini Kallikreiin 3 - prostata spetsiif.antigeen (PSA), kasutatakse prostata vähi diagnostikas
annaabi.ee 
