Missugused biokeemilised protsessid on selle telomeerse vaigistamise taga? Kõigepealt (vb ei ole kah kõigepealt) peavad vaigistamisele mittekuuluvad histoonid saama hüperatsetüleeritud, mis takistaks SIR3 ja SIR4 seondumist sinna. Mitu koopiat Rap1 seob iga telomeerialas paiknevale korduvjärjestusele, seejärel seondub sinna Sir2, 3 ja 4 koosnev kompleks. Moodustuv heterokromatiinne struktuur ulatub Rap1-siduvate saitidega külgneva DNA ~4kb alale. DNA on selles konformatsioonis välistele valkude toimele ligipääsmatu. Mis biokeemilised protsessid selle taga on, seda ma ei tea. 26. Mis on nukleosoom? Kirjelda eksperimenti, mis võimaldaks teha kindlaks, et transkriptsiooniliselt aktiivne DNA on teisti pakitud, kui transkriptsiooniliselt inaktiivne DNA. Nukleosoom on histoonidest oktameer, mille ümber on keeratud umbes 146bp pikkune DNA jupp. 27
summa jagatud paaride arvuga. Eeldusel, et kehtib lõpmatute saitide mudel. 73. Milliseid näitajaid võrdleb Tajima D? Millele viitab positiivne (D > 2), negatiivne (D < -2), nullilähedane Tajima D väärtus? Tajima D võrdleb järjestuste keskmiste paariviisiliste erinevuste arvul (π) ja segregeeruvate saitide arvul (s) põhinevat teeta (Θ) hinnangut. Positiivne Tajima D esineb, kui on palju paariviisilisi erinevusi võrreldes segregeeruvate saitidega – tasakaalustav valik. Negatiivse D korral on vähe paariviisilisi erinevusi ja palju segregeeruvaid saite – positiivne valik ja/või populatsiooni suurenemine. Kui D on nullilähedane, siis paariviisiliste erinevuste ja segregeeruvate saitide arv on ligikaudselt võrdne – neutraalne evolutsioon. 74. Millised on Tajima D puudused selektsioonitestina? Tajima D väärtust mõjutavad geenipuu kuju ja sügavust kujundavad demograafilised tegurid
Histoonne kood tähistab kõiki histoonide N-terminuses toimunud modifikatsioone. Vaigistamine telomeersetes DNA alades - vaigistamisele mittekuuluvad histoonid saama hüperatsetüleeritud, mis takistaks SIR3 ja SIR4 seondumist sinna. Mitu koopiat Rap1 seob iga telomeerialas paiknevale korduvjärjestusele, seejärel seondub sinna Sir2, 3 ja 4 koosnev kompleks. Moodustuv heterokromatiinne struktuur ulatub Rap1-siduvate saitidega külgneva DNA ~4kb alale. DNA on selles konformatsioonis välistele valkude toimele ligipääsmatu. Nukleosoom on histoonidest oktameer, mille ümber on keeratud umbes 146bp pikkune DNA jupp. Kromosoomi struktuur - DNA kaksikheeliks keerdub 2x ümber histooni oktameeri moodustades nukleosoomid. Nukleosoomid on keerdunud solenoidideks (6 nukleosoomi pöördes), moodustades nii filamente. Filamendid omakorda moodustavad silmuseid, mis kinnituvad tuumamaatriksile. 18
Pärmi telomeeride vaigistamine (silencing). Mitu koopiat Rap1 seob iga telomeerialas paiknevale korduvjärjestusele (telomeerid on nukelosoomidevabad piirkonnad) (Ülal). See initseerib multivalkse kompleksi kokkupaneku (all), kus osalevad Rap1, Sir2, Sir3, Sir4, ja lähedusesasuvate histoonide H3 ja H4 hüpoatsetüleeritud N-terminused. * tähistab hüperatsetüleeritud histooni aminoterminusi. Moodustuv heterokromatiinne struktuur ulatub Rap1-siduvate saitidega külgneva DNA ~4 kb alale, olenemata DNA järjestusest. DNA on selles konformatsioonis välistele valkude toimele (nukelaasid, transkriptsiooni regulaatorid, etc) ligipääsmatu. Kõrgemat järku heterokromatiini struktuurist palju ei teata. RAP1 seondub DNA järjestustele, mida nimetatakse vaigistajaks (silencer). SIR aga tunneb ära histoonide H3 ja H4 N-terminusi. H3 ja H4 N-terminused on SIR2 aktiivsusest tingitult deatsetüleeritud vormis. Antikehadega
ahelad. Krossingover kas tekib või mitte. Lagundajaks on RuvC valk, valib, kumba lõigata. Kui lõikab vana ahelat, siis ei toimu midag. Kui juba vahetatud ahelat, siis toimub rekombinatsioon. 1. etapp: - sünteesida puuduvad DNA osad. - DNA süntees toimub nii rekombinatsioonil, reparatsioonil kui ka replikatsioonil 2. etapp: - RuvAB kompleks seondub Holliday ühendusega. - RuvB helikaas moodustab heksameerseid komplekse. RecBCD puhul sarnane olukord. Kui E. coli rakku satub hii saitidega DNA, siis ei jää RecBCD kompleks sinna pidama ja see kompleks lagundab selle DNA lõpuni. Teine funktsioon homoloogilisel rekombinatsioonil on replikatsioonikahvli katkemine. Tekib üheahelaline katkemine ja sealt ei saaks replikatsioon edasi toimuda. Kui on 84 ühes ahelas lihtsalt tömp ots. siis on taastumiseks vaja homoloogilist rekombinatsiooni. On tekkinud juba kaheahelaline katkestus. Toimumine: - RuvBCD liitub tömbile otsale
suhtluskanalist. See lähteülesanne tugineb järgmistele põhimõtetele: · muuta Flaami valitsus avatuks ja juurdepääsetavaks; · osutada paremaid, tõhusamaid ja rohkem kliendile suunatud teenuseid; · see eesmärk tuleks saavutada Flaami valitsuse sisemise korralduse parendamise teel. Flaami Kogukonna Ministeeriumi suunised organisatsioonitunnuste ja tehniliste normide kohta seoses sisevõrgu- ja Interneti-saitidega Flaami Kogukonna Ministeeriumi organisatsioonitunnuste abil püütakse luua veebisaidid, mille ülesehitus on ühtne ja teemakohane, selle asemel et organisatsioonilist ülesehitust täpselt jäljendada. See temaatiline ülesehitus peaks aitama Internetis surfijatel hõlpsamini ja tulemuslikumalt flaami kogukonna veebisaitidel navigeerida, eeldamata organisatsioonilise struktuuri tundmist. Kõigepealt on kirjeldatud tehnilisi nõudeid organisatsioonitunnustele. Nende kirjelduste
annaabi.ee 
