ahelasse Et kaitsta faagi DNA-d restriktaaside eest, glükosüleeritakse see faagi glükosüültransferaasi poolt CRISPR – uus kaitsemehhanism bakteriofaagide vastu CRISPR – clustered, regulatory interspaced short palindromic repeats Segment bakteriofaagi genoomist integreerub bakteri kromosoomi spetsiifilisse CRISPR lookusesse CRISPR lookus sisaldab peaaegu identseid kordusjärjestusi ja nende vahele jäävaid vahealasid
reason one, gene/locus; A major/Mendelian, gene discrete phenotypes/ora; qualitative/large effect/little environmental effect; max 1 [6] 36. (i) endonuclease; cuts DNA; with sticky or blunt ends; at, palindromic/AW/specific/4 to 6 base pair/restriction, site; from bacteria; for cutting ‘phage DNA; max 3 (ii) 2 sources DNA; ref. sticky ends; complementary binding; H-bonds between bases; A to T and C to G; nicks in sugar-phosphate backbone sealed/AW; by ligase; max 4
Stabiliseeriva toime seisukohalt on oluline, et nende ette ei jääks üksikahelalist ala. mRNA-d stabiliseerivad ka molekuli 3' otsas mittetransleeritavasse alasse jäävad juuksenõelastruktuurid. Arvatakse, et eksonukleaaside kinnitumiseks 3' otsale on vaja üksikahelalist ala vahetult molekuli otsas. Lisaks võib mRNA 3' otsast sissepoole jääv sekundaarstruktuur nii stabiilne olla, et takistab eksonukleaasil mRNA edasist degradeerimist. REP järjestused REP Repetitive Extragenic palindromic sequences, võivad mood sekundaarstre. Pakinevad geenide vahel. Kui moodustub vahetult geeni lõpus siis võiks kaitsta 3' 5' degradeerimise eest. Osadel juhtudel on näidatud, et mRNA-d 3´otsast stabiliseeriva toimega REP järjestuses. Translatsioon RBS-i maskeeriv sekundaarstruktuur tekib mRNA enda järjestuse baasil. mRNA translatsiooni aktiveerib regulatoorne RNA, valk või temperatuuri tõus, mis harutab juuksenõela lahti ja vabastab RBS-i.
Genomics, felix. Appl Environ Microbiol 73: 20672078. 73: 255263. 36. Sharp KH, Eam B, Faulkner DJ, Haygood MG (2007) Vertical transmission of 24. Caburet S, Conti C, Schurra C, Lebofsky R, Edelstein SJ, et al. (2005) Human diverse microbes in the tropical sponge Corticium sp. Appl Environ Microbiol 73: ribosomal RNA gene arrays display a broad range of palindromic structures. 622629. Genome Res 15: 107985. 37. Lee OO, Chui PY, Wong YH, Pawlik JR, Qian PY (2009) Evidence for vertical 25. Srivastava M, Simakov O, Chapman J, Fahey B, Gauthier ME, et al. (2010) The transmission of bacterial symbionts from adult to embryo in the caribbean Amphimedon queenslandica genome and the evolution of animal complexity
Arvatakse, et eksonukleaaside kinnitumiseks 3' otsale on vaja üksikahelalist ala vahetult molekuli otsas. Lisaks võib mRNA 3' otsast sissepoole jääv sekundaarstruktuur nii stabiilne olla, et takistab eksonukleaasil mRNA edasist degradeerimist. 16 REP järjestused REP järjestused on lühend inglisekeelsest terminist "Repetitive extragenic palindromic sequences". Need on kõrgelt konserveerunud pöördkordusjärjestused, mis võivad mRNA-s olla aluseks juuksenõelastruktuuride moodustumisele. E. coli genoomis on REP järjestusi 500 - 1000 koopiat (1% genoomist). mRNA-dest sisaldab REP järjestusi 25%. Enamasti asuvad nad geenidevahelistes alades. Mõnedel juhtudel (näiteks his ja mal operonid, mis on vastutavad histidiini ja maltoosi transpordi eest) on REP järjestustel mRNA-d stabiliseeriv toime