Deaminatsiooni ja oksüdatsiooni produktid parandatakse TDG glükosülaasi poolt mis on seotud BER mehanismiga. • • DNA hüdroksümetülatsioon: levik genoomides (mida tänaseks teada), roll(id) genoomide) funktsioonis. • TET – ten-eleven translocation ensüüm oksüdeerib 5-metüültsütosiini 5- hüdroksümetüültsütosiiniks. Hüpoteesi järgi on 5hmC intermediaat 5mC eemaldamisel. TET üleekspressioon vähendab 5hC taset ja TET kaotamine viib 5mC akumuleerumisele. 5hmC geenikehades viitab aktiivsele geeniekspressioonile. 5-hmC eksisteerib peamiselt CG kontekstis. 5hmC on rikastatud aktiivselt transkribeeritavate geenide geenikehades ning 5mC on vastupidiselt seotud negatiivselt geeniekspressiooniga. • • Ten-eleven translocation (TET) ensüümid; nende avastamise revolutsioonilisus • TET ensüümid viivad läbi 5-metüültsütosiini oksüdatsiooni ning tekib 5- hüdroksümetüültsütosiin
100 M 77. Ensüümi KM substraadi jaoks on 1,0 mM. Substraadi kontsentratsioon rakus on 70 mM, kas sellistes tingimustes on võimalik efektiivne regulatsioon substraadi tasandil? Põhjendage Ei ole, ensüümi Km peab olema suurem kui substraadi konsentratsioon 78. Rakus toimib biokeemiline rada A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Inhibeerides raja esimest ensüümi välditakse lisaks lõpp-produkti E akumuleerumisele ka lähteühendi A mõttetut tarbimist ja vaheproduktide B, C ja D moodustumist. 79. das võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. 80. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu inhibeerima ja aktiveerima, et saavutada
hindadega. Teisalt on tõusnud inimeste teadlikkus ja vastumeelsus reoveesette põllumajanduses kasutamise osas settes sisalduvate antropogeensete saasteainete tõttu. Kui raskmetallide ning patogeenide sisaldust on kontrollitud ja limiteeritud juba pikemat aega, siis üha rohkem on tähelepanu pöördunud hormoonide, ravimijääkide, antibiootikumide ning nano-osakeste sisaldusele ning nende võimalikule akumuleerumisele pinnases ja toidus. Nende vastastikuste suundumuste tõttu vähendatakse üldiselt sette otsest põllumajanduses kasutamist, kuid samas arendatakse põletamise ning settest fosfori ja lämmastiku rikastamise tehnoloogiaid (Lemmiksoo jt 2015)." Ajakirjas ,,Eesti Loodus" nr 2012/6-7 ilmus kokkuvõte kirjutab järgmist: ,,Eesti maaülikooli, Tartu ülikooli ja Tallinna tehnikaülikooli teadlased uurisid Eesti 10
a) 1 M b) 100 M c) 1,0 mM (võivad olla erinevad arvud) 79. Ensüümi Km substraadi jaoks on 1,0 mM. Substraadi kontsentratsioon rakus on 70 mM, kas sellistes tingimustes on võimalik efektiivne regulatsioon substraadi tasandil? Põhjendage. (võivad olla erinevad arvud). 80. Rakus toimib biokeemiline rada A B C D E Miks on otstarbekas reguleerida aine E kaudu just reaktsiooni A B katalüüsivat ensüümi? Inhibeerides raja esimest ensüümi välditakse lisaks lõpp-produkti E akumuleerumisele ka lähteühendi A mõttetut tarbimist ja vaheproduktide B, C ja D moodustumist. 81. Kuidas võiks toimida kõige efektiivsemalt regulatsioon tagasiside kaudu? Märkige juurde millise ühendi poolt ja kuidas peaks antud metabolismirada reguleerima. 82. Rakus on tegemist harukohta sisaldava metabolismirajaga. Rakul on vaja ühendeid F ja I võrdsetes hulkades. Milliste ühendite poolt ja milliseid etappe peaks tagasiside kaudu
kontsentratsioon peaks mitmekordselt ületama inimese poolt eeldatavasti omastatava doosi. Mitte alati pole aga sellised testid piisavad, sest teada on, et katseloomad ei pruugi reageerida katsetatavale ainele täpselt samal viisil ja samas mastaabis kui inimene. Erinevad võivad olla nii absorptsioon, jaotumine organismis kui ka metabolism. Väga suurte dooside kasutamine võib metaboolsete ja eritusteede küllastumise tõttu viia aine akumuleerumisele katselooma organismis. Selline probleem tekkis näiteks sahhariini testimisel, mistõttu muutus keeruliseks ka toksikoloogia andmete interpreteerimine. Kuigi tarbitavate toidulisandite kogused on väikesed, võib paljude inimeste korral olla see eluaegne, paljudel aga hoopis sporaadiline, mida kõike on raske simuleerida katseloomadega. Erinevate toidulisandite ning toidulisandi ja toidu mingi loomuliku komponendi vahel võib esineda ka ristreaktiivsus
operoni poolt. Geenide transkriptsioonitase on maksimaalne väliskeskkonna kõrge osmolaarsuse korral. Samuti võimendub otsAB geenide transkriptsioon statsionaarse faasi rakkudes, olles positiivselt mõjutatud statsionaarse faasi sigma faktori RpoS poolt. Samas on statsionaarse faasi rakkudes trehhaloosi kontsentratsioon siiski 7 korda madalam kui osmootse stressi korral. Seega ei taandu statsionaarse faasi rakkude osmotolerantsus üksnes trehhaloosi akumuleerumisele statsionaarses faasis. Kasvukeskkonna madalama osmolaarsuse korral võib trehhaloos olla ka energiaallikaks. Sel juhul transporditakse rakuväline trehhaloos rakku trehhaloosi-spetsiifilise PTS-i abil. Tsütoplasmas degradeeritakse trehhaloos-6-fosfaat trehhaloosi 6-fosfaadi hüdrolaasi toimel glükoosiks ja glükoos 6-fosfaadiks. Väliskeskkonna kõrge osmolaarsuse korral hüdrolüüsitakse trehhaloos periplasmaatilise trehhalaasi TreA toimel glükoosiks ning glükoos tuuakse rakku PTS-i abil
annaabi.ee 
