termodünaamika. Termodünaamika teine printsiip väidab, et suletud süsteemis on protsesside kulgemisel mingi kindel suund. Termodünaamika teisel printsiibil on mitmeid samaväärseid sõnastusi. · Termodünaamiline süsteem--soojusvahetuses olevate kehade süsteem. · Tsükliline protsess--protsess, kus termodünaamiline keha või süsteem väljub algolekust, läbib lõpmata hulga (pidevalt paiknevaid) vaheolekuid ja jõuab algolekusse tagasi. Seejuures läbitakse vaheolekuid vaid üks kord. Tsüklit kirjeldab nii pV-,pT-,kui ka TV- teljestikus kinnine joon. · Väljumistöö--töö, mis tuleb teha ühe osakese lahkumiseks vedeliku või tahkise pinnalt. · Vedelkristallid--vedelikud, milles molekulide paiknemisel korrapära. · Ülekandenähtused--difusioon, soojusjuhtivus ja sisehõõre. Kolm nähtust, mis on sisuliselt omavahel seotud molekulide kaootilise liikumisega ja molekulidevahelise vastastikmõjuga.
ensüümiga. See kovalentne side katkeb katalüüsi käigus. Side ensüümiga on Schiffi aluse kujul, mis tekib peptiidi struktuuri kuuluva lüsiini jäägi ε-aminorühma ja koensüümi aldehüüdi vahel. Püridoksaalfosfaat osaleb reaktsioonides, mis on seotud α-aminohapete metabolismiga. Vastav aminorühm moodustab katalüütilise tsükli käigus omakorda koensüümiga Schiffi aluse, mis stabiliseerib mitmesuguseid vaheolekuid. Schiffi aluse moodustamine on pööratav protsess vesilahuses. Süsinik- hapniku vaheline kaksikside võib lihtsalt asenduda süsinik-lämmastik kaksiksidemega. Püridoksaalfosfaadiga seotud ensüümid on näiteks aspartaadi aminotransferaas ja seriini hüdroksümetüültransferaas. Aspartaadi aminotransferaas on ensüüm, mis kuulub aminorühma vahetajate hulka. Seriini hüdroksümetüültransferaas on seotud aminohapete metabolismiga ja vastav reaktsioon on oluliseks süsiniku allikaks
2. L-glutamaadi dehüdrogenaas (kõigis organismides) 3. -ketoglutaraadi transamineerimine 8. Püridoksaalfosfaat aminohapete biosünteesi reaktsioonides. Kofaktor transamineerimise reaktsioonis. Vit B6. Püridoksaalfosfaat osaleb reaktsioonides, mis on seotud -aminohapete metabolismiga. Vastav aminorühm moodustab katalüütilise tsükli käigus omakorda koensüümiga Schiffi aluse, mis stabiliseerib mitmesuguseid vaheolekuid. 9. THF struktuur, derivaadid, tekkereaktsioonid, funktsioonid metabolismis. Tetrahüdrofolaat THF on koensüüm. Folaat konverteeritakse tetrahüdrofolaadiks dihüdrofolaadi reduktaasi toimel. (Metüül-THF on põhiline veres ringlev vorm.) Teostab ühesüsinikuliste jääkide ülekannet paljude biomolekulide sünteesil. (Glütsiin, seriin, trüptofaani lagundamine, histidiini lagundamine, puriini ja pürimidiini biosüntees.) 10
L = T(M); M = (,Q,delta,Q0,F)
Q = {q0, .., qn}
Kõigi stringide hulk, mis viivad automaadi olekust qi olekusse qj:
Rij = {w | (w, qi) * (e,qj)}
Kuna automaadi poolt aktsepteeritav keel on selliste stringide hulk (ühend, kus qi
kuulub algolekute, qj lõppolekute hulka), piisab näidata, et iga i,j
Gibbsi potentsiaal on vaba energia ja korrutise pV summa: G = F + pV. TD printsiipide lühisõnastused: 25 TD I : Te ei saa võita Ei saa teha tööd, kulutamata energiat. TD II : Te ei saa viiki mängida Ei saa muuta kogu soojust kui energiat tööks. Osa läheb kaotsi. Ringprotsess e. Tsükkel. TD protsess, kus süsteem väljub algolekust, läbib lõpmata hulga pidevalt paiknevaid vaheolekuid ja jõuab tagasi algolekusse. Seejuures on nõutav, et iga vaheolekut läbitakse vaid üks kord. Sellist protsessi kujutab näit. P V teljestikus suletud kõver, sellest ka nimetus ringprotsess. Ringprotsessi kasulik töö on töö, mida on võimalik kätte saada soojuse muundamisel tööks, kasutades selleks TD süsteemiga teostatud ringprotsessi. Kasulikku tööd on võimalik saada vaid päripäeva töötava ringprotsessi korral, st
nukleotiide keeratakse ringi. Iga modifikatsioon tehakse eraldi. Kolm pseudouridiini on 54 tähtsad bakterite elus, teised pole. Pseudouridiini ensüüm on ka samaaegselt ribosoomi chaperoniks. Ta pakib ribosoomi õigesti kokku. Ilma selleta on ribosoomi efektiivsus tohutult väiksem. 30S rRNA sünteesil tekivad juuksenõelastruktuurid väga täpselt ja kontrollitult. Lõpp-struktuur tekib nende vahevormide kaudu. Ruumiline lõplik struktuur vajab eelnevaid vaheolekuid. Geneetilise info ülekandmise täpsus Kontrollmehhanismid: 1) Odav vigadeparandus sünteesi ajal – RNA polümeraasil kineetiline veerulugemine (proofreading). Kui vaja, hüdrolüüsitakse üks nukleotiid otsast ära ning pannakse uuesti, kus peab olema 2) Kallis mehhanism (editing) e. toimetamine. Produkt lagundatakse täielikult, kui midagi on valesti. Kontrollitakse RNA dupleksi õigsust, Lagundab degradosoom. DNA polümeraasidele on omane oma vigade sagedus. DNA sünteesi täpsused: