N-alused - DNA glükosülaasid tunnevad ära ebahariliku N-aluse, põhjustavad N-aluse ja 2- desoksüriboosi vahelise glükosiidsidemekatkemise, tekitades apuriin- või apurimidiinsaidi. AP sait tuntakse ära AP endonukleaaside poolt, mis koos fosfodiesteraasidega lõikavad välja suhkrufosfaatgrupid vastavst saidist. Dna polümeraas täidab puuduva nukleotiidi. DNA ligaas muudab ahela intaktseks. Nukleotiidi puhul - Eksonukleaas. E- colil on vaja kolme geeni (uvrA, uvrB, uvrC) produkte. Kahe uvrA polüpeptiidi ja ühe uvr B polüpeptiidi kompleks tunneb ära DNAs oleva defekti, seondub sellega ATP enegria arvel. UvrA dimeer vabaneb ja seondub uvrC. UvrB põhjustab 3'-poolse ja UvrC 5'-otsmise fosfodiestersideme katkemise. DNA helikaas II kõrvaldab väljalõigatud dodekameeri. DNA polümeraas I täidab tühiku. DNA ligaas muudab ahelad intaktseks. Inimesel eksinukleaasi aktiivsus vajab 17 polüpeptiidi. Välja lõigatakse 29 nukleotiidne lõik. 145
paardunud A nii A/G kui A/GO puhul. Kahjustuste kõrvaldamine võib toimuda ka valesti. Näiteks, kui A vastu lülitub GO, võib MutY DNA ahelast kõrvaldada hoopis A ning kui järgmise replikatsioonitsükli käigus lülitub GO vastu C, toimub selle tulemusena asendus AT CG. III. Nukleotiidide DNA ahelast väljalõikamine Pikk reparatsioonirada - kõrvaldatakse 1500 nt, osaleb DNA pol I. Lühike reparatsioonirada - kõrvaldatakse 12 - 13 nt, osalevad UvrABC ekstsinukleaas ja UvrD. UvrA (kahjustust tundev valk) ning UvrB (helikaas) tunnevad DNA-d skanneerides ära defekti. Kahjustuse kohal toimuvad valkudes konformatsioonilised muutused, mille tagajärjel UvrA dissotseerub ning UvrB ja defektse ala kompleksiga seostub UvrC. UvrB-l on endonukleaasne aktiivsus, ta tekitab katke 5-ndasse fosfodiestersidemesse kahjustusest 3´ suunas. 8-nda fosfodiestersideme katke kahjustusest 5´suunas teostatakse UvrC poolt
Osalevad paljud samad ensüümid mis replikatsiooniski DNA reparatsioonisüsteemid: Tüüp ⁞ viga ⁞ ensüümid: 1) valepaardumine ⁞ replikatsiooni viga ⁞ MutS, MutH, MutL 2) fotoreaktsioon (otsene parandamine) ⁞ Td alküleerimine ⁞ DNA fotolüaas 3) BER aluse eemaldamise repatatsioon ⁞ Lämmastikaluste modifikatsioon lõigatakse välja ⁞ DNA glükosülaas ja lämmastikalus lahkub 4) nukleotiidide väljalõikamine (tähtsaim) ⁞ (Py)2; aluse modifitseerimine ⁞ UvrA, B, C, D + XPO, XPA, XPD 5) kaheahelaliste katkestuste parandamine ⁞ kaheahelalised katked ⁞ RecA, RecB, C, D 6) rekombinatsiooni reparatsioon ⁞ massilised kahjustused, mõlemad ahelad lagundatakse ⁞ UmuC (DNA polümeraas IV ja V) Fotoreaktsioon on omane taimedele, imetajatele mitte. Fotoreaktsioon – otsene parandamine. Pürimidiini-dimeeride eemaldamine rakus, teeb DNA fotolüaas (ensüüm AlkB). BER – base edition reparatsioon – DNA glükosidaas lõikab glükosiidsideme,
Näiteks, kui A vastu lülitub GO, võib MutY DNA ahelast kõrvaldada hoopis A ning kui järgmise replikatsioonitsükli käigus lülitub GO vastu C, toimub selle tulemusena asendus AT CG. GO reparatsiooniensüümide homolooge on leitud ka eukarüootsetest rakkudest. Nukleotiidide DNA ahelast väljalõikamine Pikk reparatsioonirada - kõrvaldatakse 1500 nt, osaleb DNA pol I. Lühike reparatsioonirada - kõrvaldatakse 12 - 13 nt, osalevad UvrABC ekstsinukleaas ja UvrD. UvrA (kahjustust tundev valk) ning UvrB (helikaas) tunnevad DNA-d skanneerides ära defekti. Kahjustuse kohal toimuvad valkudes konformatsioonilised muutused, mille tagajärjel UvrA dissotseerub ning UvrB ja defektse ala kompleksiga seostub UvrC. UvrB-l on endonukleaasne aktiivsus, ta tekitab katke 5-ndasse fosfodiestersidemesse kahjustusest 3´ suunas. 8-nda fosfodiestersideme katke kahjustusest 5´suunas teostatakse UvrC poolt
MutM kõrvaldab DNA ahelast GO. MutY kõrvaldab valesti paardunud A nii A/G kui A/GO puhul. GO reparatsiooniensüümide homolooge on leitud ka eukarüootsetest rakkudest. Nukleotiidide DNA ahelast väljalõikamine Bakterites on kirjeldatud kaks reparatsioonirada: 1) Pikk reparatsioonirada - kõrvaldatakse 1500 nt, osaleb DNA pol III. 2) Lühike reparatsioonirada - kõrvaldatakse 12 nt, osalevad UvrABC ekstsinukleaas (excinuclease, väljalõikenukleaas) ja UvrD. UvrA (kahjustust tundev valk) ning UvrB (helikaas) tunnevad DNA-d skanneerides ära defekti. Kahjustuse kohal toimuvad konformatsioonilised muutused, mille tagajärjel UvrA dissotseerub ning UvrB ja defektse ala kompleksiga seostub UvrC. UvrC-l on endonukleaasne aktiivsus, ta tekitab katke 5-ndasse fosfodiestersidemesse kahjustusest 3´-suunas ja 8-nda fosfodiestersideme katke kahjustusest 5´-suunas.
MutM kõrvaldab DNA ahelast GO. MutY kõrvaldab valesti paardunud A nii A/G kui A/GO puhul. GO reparatsiooniensüümide homolooge on leitud ka eukarüootsetest rakkudest. Nukleotiidide DNA ahelast väljalõikamine Bakterites on kirjeldatud kaks reparatsioonirada: 1) Pikk reparatsioonirada - kõrvaldatakse 1500 nt, osaleb DNA pol III. 2) Lühike reparatsioonirada - kõrvaldatakse 12 nt, osalevad UvrABC ekstsinukleaas (excinuclease, väljalõikenukleaas) ja UvrD. UvrA (kahjustust tundev valk) ning UvrB (helikaas) tunnevad DNA-d skanneerides ära defekti. Kahjustuse kohal toimuvad konformatsioonilised muutused, mille tagajärjel UvrA dissotseerub ning UvrB ja defektse ala kompleksiga seostub UvrC. UvrC-l on endonukleaasne aktiivsus, ta tekitab katke 5-ndasse fosfodiestersidemesse kahjustusest 3´-suunas ja 8-nda fosfodiestersideme katke kahjustusest 5´-suunas.
annaabi.ee 
