Mittetäielikele valkudele lisatakse C-otsa eriline aminohapete järjestus, mis on valgu lagundamise (degratatsiooni) signaaliks ja sellist järjestust (järjestuse märge, sequence tag) kandev peptiid lõhutakse proteaaside poolt aminohapeteks. Kui ribosoomi A saiti satub katkenud mRNA st. ei ole normaalset kolmenukleotiidist koodonit, siis seondub ribosoomiga eriline RNA, 10Sa RNA. Viimane molekul täidab üheaegselt nii tRNA kui mRNA funktsioone ja seda nimetatakse seepärast tmRNA'ks. tmRNA sarananeb osaga tRNA'st, nimelt selle aktseptoorse ja T-õlaga, mis moodustavad nii tmRNA's kui harilikes tRNA'des liitunud heeliksi (vt. tRNA struktuur). tmRNA sisaldab aminohappe alaniiniga liitumiseks 29 vajalikke nukleotiide (RNA determinante) ja on seega substraadiks alanüül-tRNA süntetaasile. Lisaks tRNA'ga sarnanevale osale sisaldab tmRNA ka mRNA järjestust ja üleminekujärjestusi
mitusada nukleotiidi pikk, on aminoatsüleeritav). Sisaldab tRNA sarnast struktuuri. tRNA-l on T₃N₇₀ ja A nukleotiid terminaatori otsas. Aminoatsüleeritakse alaniiniga (esinevad Ala identsuselemendid). Moodustab nagu tRNA-gi: EF-Tu-ga komplekse ja seostub ribosoomi A-saiti, kui mRNA-d pole (A-saidis pole koodonit). - „Ribosoomi rämps“ translokeeritakse A-saidist P-saiti, millele järgneb pööre → muu teeb tRNA-st mRNA. ssrA geeni produkt on tmRNA (transport messenger). tmRNA-s on palju Ala koodoneid. C-terminusse pannakse 11 AH-d. Sellised valgud, millel on see järjestus, lagundatakse. Poolik mRNA vabaneb tmRNA-ga liitudes ribosoomist. TmRNA-l on UAA stoppkoodon ja translatsioon lõppeb. Ribosoom dissotseerub, vigane valk lagundatakse. Valku ei sünteesi ribosoom üksi, teda abistavad: tRNA, mRNA, translatsioonifaktorid (valgulised): initsiatsioon – määrab õige lugemisraami, elongatsioon – ahela
valesti volditud või organismile võõraid valke. 2. Regulatoorne funktsioon hoidmaks teatavate valkude hulk rakus madal kas pidevalt või muuta valkude ekspressioonitaset vastusena keskkonna signaalidele (näiteks nälg) 3. Komplekssete struktuuride nagu viburid ja fimbriad süntees Valkude proteolüüs: 1. Pidev, konstitutiivne 2. Reguleeritud Reguleeritud proteolüüs trans-translatsiooni kaudu Protsessis osaleb tmRNA ssrA valgu poolt kodeeritud väike stabiilne RNA, hübriid millel on tRNA ja mRNA omadused, on transleeritav. Alaniiniga laetud tmRNA liigub kompleksis teiste valkudega ribosoomi, kui valgusüntees on peatunud, tekkinud on viga ja ribosoom enam edasi ei liigu. Originaalne mRNA vabaneb ning valgusüntees jätkub tmRNA matriitsilt. Valgu C-terminaalsesse otsa liidetud SsrA peptiidi tunneb ära SspB ja valk degradeeritakse proteaaside (näiteks ClpXP) poolt. tmRNA võimaldab
motiivid ja tertsiaarstruktuur loob katalüütiliseks reaktsiooniks sobiva mikrokeskkonna 6. Keemiliselt ja bioloogiliselt labiilne • • RNA liigid mRNA – informatsiooni RNAd, kodeerib valku rRNA – osaleb translatsioonil, moodustades mikrokeskkonna katalüütiliseks reaktsiooniks. tRNA – osaleb translatsioonil, transpordib aminohappeid ribosoomidesse tmRNA – transfer messenger RNA, päästab stoppama jäänud ribosoomid snRNA – small nuclear RNA ehk U-RNAd, paiknevad tuumas Cajal kehades, osalevad splaissimisel snoRNA – small tuumakese RNA, modifitseerivad teisi RNAsid miRNA – mikro RNA, osaleb geeniregulatsioonis siRNA – small interfering RNA, osaleb geeniregulatsioonis piRNA – piwi-interacting RNA, peamiseks funktsiooniks on transopsoonide kaitse