(temperatuur, pH, kontsentratsioon, Km ja Vmax väärtused) Ensüümide inhibiitorid, inhibeermise tüübid, nende analüüs. Ensüümide inhibiitorid on vahendid, mis madaldavad reaktsooni kiirust (võimaldades neid paremini kontrollida). Nad moodustavad ensüümiga kovalentse sideme (pöördumatud) või mittekovalentse sideme (pöörduvad). Pöörduva inhibeerimise tüübid: - konkurentne: inhibiitor seondub ainult E, mitte ES kompleksiga ehk I ja S konkureerivad sama sidumistsentri pärast aktiivtsentris - mittekonkurentne: inhibiitor seondub mõlemaga nii E kui ka ES kompleksiga (I sidumine ensüümile ei mõjuta S sidumist, kuna neil on erinevad sidumistsentrid. Inhibiitor ei mõjuta Km- i, kuid vähendab Vmax väärtust) - ebakonkurentne: inhib. seondub ainult ES kompleksiga (hüpoteetiline) Esineb ka segatüüpi mittekonkurentne inhibeerimine ehk inhibiitori sidumine ensüümile mõjutab
- Mis on isosteerid? - Omadused erinevad, kuid suurus, polaarsus, elektronide jaotus on sama. - Nt: Fluor on Süsiniku isosteer, kuna neil on sarnased mõõtmed teised omadused o C-F side on stabiilsem kui C-H side. - Nt Amiidi asendamine pürrooliga, selektiivsem D3 suhtes, ja ei seondu D2- le (kõrvalefektid). Antipsühhootilise ravim. - - - Valgu (ensüümi substraadi või inhibiitori ning retseptori ligandi sidumistsentri) struktuurist lähtuv ravimidisain - Looduslike inhibiitorite najal. - ACE inhibiitorit vaja, blokkida angiotensiin II süntees, mis kutsub esile vererõhu tõusu. - Inhibiitor annab vajalikud sidemed aktiivtsentriga. Peptiidside aga puudub ja ensüüm jääb inhibeerituks, kuni inhibiitor asub aktiivtsentris. - Aktiivtsentris sisalduvad Zn2+ aatom ja arginiin; - Eeldati, et inhibiitoris peaks olema suktsiinhappe element;
(substraadid A, B,C jne., produktid P, Q, R jne.) Inhibiitor on aine või faktor, mis vähendab keemilise reaktsiooni kiirust või takistab reaktsiooni. Tehislikud inhibiitorid on kasutusel kui ravimid - näiteks proteaaside inhibiitorid HIV infektsiooni vastu. Konkurentsed inhibiitorid: seostuvad ensüümi aktiivtsentrisse ja välistavad substraadi seostumise kas blokeerides substraadi sidumistsentri või kutsudes esile valgu konformatsioonimuutuse, mis välistab substraadi sidumise. Mittekonkurentsed inhibiitorid: seostudes ensüümile võimaldavad substraadi sidumist (kolmikkompleks moodustub) kuid ei võimalda reaktsiooni toimumist (i.e. EIS ei ole reaktsioonivõimeline). Ebakonkurentsed (un-competitive) inhibiitorid: seostuvad ainult ensüüm-substraat kompleksiga, aga mitte vaba ensüümiga. Suhteliselt harvaesinev inhibeerimise tüüp -
Kuivõrd nii glükolüüsil kui TCA tsüklis toimub energia esialgne salvestamine NAD+ konverteerimisega NADHks, on see vaja retsükleerida. Vastasel juhul seiskub glükolüüsi glütseeraldehüüd-3-fosfaadi dehüdrogenaasi reaktsioon, kus NAD+ tarbitakse. Anaeroobsetes tingimustes redutseeritakse püruvaat laktaadiks; samaaegselt reoksüdeeritakse NADH NAD+ks. GLÜKOLÜÜTILISTE ENSÜÜMIDE STRUKTUUR JA KATALÜÜSI MEHHANISM 1. Kirjeldage NAD+ sidumistsentri struktuuri dehüdrogenaaside molekulides. 2. Heksokinaasi molekuli struktuursed muutused (induced-fit). Induced fit seisneb ulatuslikus struktuurses muutuses, mis järgneb substraadi sidumisele. See on vajalik kuna väheneb keskkonna polaarsus aktiivtsentris. 3. Olulisemad mehhanismid glükolüütiliste reaktsioonide katalüüsis: a. Aldolaas Schiffi alus Substraat seondub. FBP karbonüül reageerib Lys aminorühmaga, tekib imiinimkatioon (Schiffi alus).
termofiilsete bakterite ensüümid 85°C juures on kõrge aktiivsusega. Ensüümireaktsioonide inhibeerimine Pöördumatud inhibiitorid interakteeruvad ensüümiga läbi kovalentsete sidemete E + I EI Pöörduvad inhibiitorid interakteeruvad ensüümiga läbi mittekovalentsete sidemete E + I EI Pöörduva inhibeerimise tüübid: Konkurentne inhibeerimine inhibiitor (I) seondub ainult E, mitte ES kompleksiga I ja S kokureerivad sama sidumistsentri pärast aktiivtsentris. Kui [S] on lõpmatult suur (1 / [S] = 0) siis inhibiitori lisamine reaktsiooni Vmax ei mõjuta. Mittekonkurentne inhibeerimine inhibiitor (I) seondub kas E või ES kompleksiks ,,puhas" mittekonkurentne inhibeerimine I sidumine ensüümile ei mõjuta S sidumist, kuna nendel on
annaabi.ee 
