Politsei on keskkonnakuritegude kohtueelne menetleja. Põllumajandusamet tegeleb GMO-de ja taimestiku kaitsega. Päästeamet kontrollib kemikaaliseaduse täitmist ja teeb keskkonnaohtlike ettevõtete järelevalvet. Tarbijakaitseamet teeb järelevalvet pakendiseaduse ja kemikaaliseaduse üle. Terviseamet teeb järelevalvet GMO-de, veeseaduse, välisõhu kaitse seaduse üle. Veeteede Amet kontrollib laevade nõuetele vastavust ja sadamaseaduse täitmist. Veterinaar- ja Toiduamet jälgib GMO-dega kauplemist, samuti loomakaitseseaduse, veeseaduse ja pakendiseaduse nõuded. Keskkonnaamet: Valitsusasutus, mis tegutseb Keskkonnaministeeriumi valitsemisalas. Ülesanne on viia ellu riigi keskkonnakasutamise, looduskaitse poliitikat ning osaleda kõikvõimalike keskkonnaalaste õigusaktide ja muude ametlike dokumentide väljatöötamises ning täiustamises
sealhulgas kaevandamisele sätestatud ohutusnõuete täitmist ja markšeideritöö vastavust nõuetele Terviseamet – teeb järelevalvet GMO-de, veeseaduse, välisõhu kaitse seaduse, pakendiseaduse ning kemikaaliseaduse normide täitmise üle Veeteede Amet – kontrollib laevade nõuetele vastavust ja sadamaseaduse nõuete täitmist Veterinaar- ja Toiduamet – jälgib GMO-dega kauplemist, samuti loomakaitseseaduse, veeseaduse ja pakendiseaduse nõudeid. Kalapüügijärelevalve raames kontrollib kalatöötlemisettevõtteid LOODUS- JA KESKKONNAKAITSE VALITSUSVÄLISED ORGANISATSIOONID (VVO) ELF – Eestimaa Looduse Fond (asutatud 1991. aastal; Eesti looduse ja mitmekesisuse hoidmine)
käitlevaid suurõnnetuse ohuga ettevõtteid (SEVESO). Samuti kontrollib inspektsioon kaevandamisseaduse ja selle alusel kehtestatud õigusaktide nõuetest kinnipidamist, sealhulgas kaevandamisele sätestatud ohutusnõuete täitmist ja markšeideritöö vastavust nõuetele. -Terviseamet teeb järelevalvet GMO-de, veeseaduse, välisõhu kaitse seaduse, pakendiseaduse ning kemikaaliseaduse normide täitmise üle. -Veeteede Amet kontrollib laevade nõuetele vastavust ja sadamaseaduse nõuete täitmist. -Veterinaar- ja Toiduamet jälgib GMO-dega kauplemist, samuti loomakaitseseaduse, veeseaduse ja pakendiseaduse nõuded. Kalapüügijärelevalve raames kontrollib amet kalatöötlemisettevõtteid. Mida keskkonnakaitseinspektor võib teha oma pädevuse piires • Kontrollib keskkonnakaitse- ja -kasutusalaste õigusaktide nõuetest kinnipidamist; • Teeb suulisi korraldusi ja ettekirjutisi- seaduslikkuse tagamiseks
rändetõkked, kudealade vähesus ja halb kvaliteet. Lisaks tuleks parandada ja arendada ka selektiivsete püüniste kasutamist ning optimeerida püügivahendite arvu vastavalt püügivõimalustele. Väikesadamad ja lossimiskohad Rannasadamaid oli 2012. aastal 136, sisevete sadamaid 36. Kala lossiti ranna- ja sisevete ääres 477 lossimiskohas. Sadamad ja lossimiskohad on üldjoontes halvas tehnilises seisukorras ega vasta sadamaseaduse nõuetele ja mereohutuse tingimustele. Amortiseerunud on kaid ja tehnilised seadmed kala lossimiseks ja esmatöötlemiseks. Hooned, kus kala säilitada või hoida püügivarustust, on lagunenud või puuduvad üldse. Palju on sadamaid, kus puuduvad elektri- ja veevarustussüsteemid. Euroopa Kalandusfondi toel alustati 2010. aastal kalasadamate uuendamist, mille tulemusena on 2015. aasta lõpuks planeeritud uuendada 60 kalasadamat ja lossimiskohta. 2012.a