eksteiini peptiidsidemega. Nad on väga võimekas proteiini splisingus. Intron on eukarüootse geeni mittekodeeriv piirkond, mis transkribeeritakse RNA molekuliks, ent seejärel lõigatakse sealt splaisingu tulemusena välja.Vahe on selles, et intronid lõigatakse välja ja eksonid (inteiinid) liidetakse kokku. 47. Peaagu kõik mRNAd sisaldavad järjestust AUAAA, mis asub polü(A) sabast 10-35bp ülavoolu. Kui see AUAAA ära muteerida, siis RNA transkriptide polüadenüülimist peaagu ei esine. Muteerimisel need polü(A)-sabata transkriptid kogunevad tuuma ning suunatakse lagundamisele. 360kDa lõikamis-ja polüadenüülimis-spetsiifiline faktor (CPSF), mis koosneb neljast erinevast valgust, moodustab kõigepealt AAUAAA järjestusest ülavoolu seonduva ebastabiilse kompleksi. Seejärel seonduvad sellele CPSF-RNA kompleksile vähemalt kolm
reaktsioonimehhanismi uurimiseks. Eelistada tuleb konservatiivseid asendusi Glu, Asp - Gln, Asn; Ser - Ala jne.. Näide: Asp102 rolli seriinproteaasides eeldati tema läheduse tõttu His57le. W. Rutter valmistas trüpsiini, kus Asp102 oli asendatud asparagiiniga - mutandi aktiivsus oli 10 000 korda madalam kui natiivsel ensüümil. Mis juhtub kui muteerida kogu katalüütiline triaad? "Jääkensüüm" ilmutab ikkagi mõningast katalüüsivõimet - sidumisvõime ja aktiveeritud olekut solvateerivad rühmad jäid ju alles. · keskkonnaefektid, · substraadi struktuuri mõju, · inhibiitoranalüüs. · Ensüümkatalüüsi teooriad. · Ensüümide spetsiifilisust ja katalüütilist aktiivsust määravad tegurid.
transkriptsiooniregulaatori märklaud geenid. Heat-shock geenid - Nende geenide ekspressiooni regulatsiooni mehhanism on evolutsiooniliselt kujunenud selliseks, et ekstremaalsetes tingimustes on transkriptsiooniks kõik olemas, st pole vaja kromatiini lahti pakkida ega transkriptsiooni preinitsiatsiooni kompleksi kokku panna. Peaagu kõik mRNAd sisaldavad järjestust AUAAA, mis asub polü(A) sabast 10-35bp ülavoolu. Kui see AUAAA ära muteerida, siis RNA transkriptide polüadenüülimist peaagu ei esine. Muteerimisel need polü(A)-sabata transkriptid kogunevad tuuma ning suunatakse lagundamisele. 1. mitokonder 2 membraani, oma DNA. Raku hingamine, toitainete lagundamine (ensüümide ja hapniku abil), moodustub vesi, süsihappegaas, energia ATP kujul. 2. rakukest (taimed, seened, bakterid)eraldab väliskeskkonnast,kaitseb, taimedes tugifunktsioon. Selle kaudu toimub diffusioon ja osmos 3
sünteesitud RNA 5'otsas paiknevate ribooside 2'oksügeenidele. pre-mRNAde 3'lõikamine ja polüadenüülimine on omavahel tihedalt seotud protsessid Eukarüoodis on kõigil mRNAdel, v.a. histoonide mRNAd, 3' polü(A) saba. Primaarse transkripti 3' lõikamine eelneb polüadenüülimisele. Peaagu kõik mRNAd sisaldavad järjestust AUAAA, mis asub polü(A) sabast 10- 35bp ülavoolu. Kui see AUAAA ära muteerida (vaid AUUAAA puhul toimub ka), siis RNA transkriptide polüadenüülimist peaagu ei esine. Muteerimisel need polü(A)-sabata transkriptid kogunevad (akumuleeruvad) tuuma ning suunatakse lagundamisele. On leitud ka üks teine 3' lõikamiskohast allavoolu esinev signaal, mille intaktsus on vajalik lõikamiseks ja polüadenüülimiseks. See signaal ei ole teatud kindel järjestus, vaid pigem GU-rikas või U-rikas piirkond 3' lõikamiskohast allavoolu asuva 50bp pikkuse ala sees. Lõikamiseks ja
Avatud kompleksi ülemineku heaks näiteks on E. coli gal operon, mille promootorist üles ja allavoolu seondub repressor GalR operaatoritele. Repressiooniks on vaja histoonilaadse valgu HU seondumist, selle tulemusena DNA paindub, ning GalR dimeerid seonduvad omavahel ning moodustub stabiilne DNA luup, mille keskel olevale promootorile RNAP seonduda ei saa. Kuid isegi siis, kui HU ei seondu DNA- ga ega moodustu stabiilset DNA luupi (isegi siis kui geenipoolne GalR operaator muteerida nii, et sellele ei seondu enam GalR) gal-operoni ei transkribeerita. Piisab ühest GalR operaatorile repressori seondumisest, et represseerida transkriptsioon. Arvatakse, et see toimub avatud kompleksi moodustumise takistamisega. Transkriptsiooni saab represseerida ka RNAP liikumise takistamisega elongatsioonifaasi ehk promootori vabastamisega. Bacillus subtilis'e faagi 29 promootorite modifitseerimisega laboris, konstrueeriti promootor, mille