XIST RNA !!! seondub rakutuumas inaktiivse X-kromosoomiga (Barri kehaga). Inimese aktiivses X-kromosoomis on H4 histoon atsetüleeritud, inaktiivses X-is aga mitte (s.t., on vaikiv). CpG saarekeste metüleerumine kutsub esile geenide inaktivatsiooni. Aktiivsetel geenidel Barri kehas puuduvad CpG saared 11. Kuidas määratakse mRNA eluiga rakus? mRNA eluiga mõjutavad polü-A saba olemasolu (ilma polü-A-ta mRNA-d on väga lühiealised) ja 3' mittetransleeritavad regioonid (UTR). Eluiga mõjutavad RNA-sisesed järjestused, nagu Poly-A piirkond, mis on kaitstud PABP- valguga (kaitseks deadenüleerimise ja mRNA lagundamise eest). 3´UTR ala sisaldab lagundamiseks vajalikke signaale. Näiteks histoonide mRNA 3'UTR-s asub nn.juuksenõela struktuur, mis destabiliseerib ja põhjustab mRNA hulga .AU-rikkad järjestused mRNA-s mRNA stabiilsust. mRNA kodeeriva ala järjestused esimese 12 13 np ulatuses.
8 41. Inimese BDNFi geen on enam kui 80,000 aluspaari pikkune. BDNFi mazhoorsed transkriptid aga 1.8 ja 4.4 kb pikad. Millest selline geeni versus mRNAde pikkuse erinevus on tingitud? Kirjelda molekulaarseid protsesse, mis on selle pikkuste erinevuse taga. Esiteks on eestikeeles kasutuses sõna mazoorne, millele vastab ing.k major (suur). Põhjus, miks erinevus selline on, ei tea. Vb on transkriptil erakordselt pikk poly(A) saba või siis eriti pikad 3'UTR ja 5'UTR (mittetransleeritavad regioonid). Vot ei oska öelda. 42. Mida näitab rakule antud ajahetkes iseloomulik mRNA tase? Ilmselt seda, kui palju valke sünteesitakse. Mida rohkem mRNA'd seda rohkem translatsiooni ajahetkes (oleks ju loogiline). 43. Mis on RNA editing? Mis ensüümid katalüüsivad protsessi RNA editing? Kuidas nimetatud regulatsioonivorm muudab valku? Too näiteid. Editing on protsess, mille tagajärjel muudetakse pre-mRNA järjestust, st küpse mRNA järjestus erineb vastavast
7 LIISI KINK 8 VIROLOOGIA Kõikide segmentide 5'- ja 3'-mittetransleeritavad regioonid on suhteliselt lühikesed: 5' NTR on 12 b (S1 segment) kuni 32 b (S4 segment) pikkune; 3' NTR on 32 b (L1 segment) kuni 83 b (M1 segment) pikkune. NTR regioonides paiknevad signaalid mRNA pakkimiseks ja replikatsiooniks ning ka aktiivseks translatsiooniks (osaliselt ulatuvad need signaalid ka kodeerivasse regiooni). Kõikide genoomsete segmentide terminaalsed järjestused on kogu perekonnas konserveerunud.
hulkraksete ühisel eellasel juba olemas: Fox, Hox, Sox ja T-box perekonnad. 24. Kuidas on miRNAde juurdetulek evolutsioonis mõjutanud mitmekesistumist ja selle avaldumist? Läbi geoloogilise aja on miRNA-sid üha juurde tulnud. Vähemaks pole jäänud. Suurem jagu on neist valgugeenide intronites. Neid on ka ainuõõssetel ning taimedel. Kui miRNAd on olulised arengu kanaliseerijana - arengu variatsiooni stabiliseerijana. Mittetransleeritavad mikroRNAd reguleerivad väga paljusid rakuprotsesse läbi tranlatsiooni inhibeerimise või vastava mRNA lagundamise. On esitatud hüpoteese, et nad täpsustavad translatsiooni ja seega vähendavad evolutsioonilist plastilisust.