prootonite väljapumpamisel ja sel juhul toimub ATP hüdrolüüs. Kirjeldatud on ka P-tüüpi ATPaase, mis vastutavad K+, Ca+ või Mg2+ transpordi eest. Osmootse stressi korral osaleb K+ transpordil näiteks Kdp-ATPaas. K+ on bakterirakus oluline katioon. Lisaks normaalse pH ja osmootse rõhu säilitamisele on ta oluline kofaktor paljudele ensüümidele. E. coli's on kaks K+ transportsüsteemi. Kdp süsteem on kõrge afiinsusega, ATP-d tarbiv ja indutseeritav kaaliumi limitatsiooni korral. teine süsteem, Trk süsteem, on pidevalt olemas, kuid madala afiinsusega (kõrge Km, 2 mM). Omaette alamklassi moodustab ATP-d tarbiv substraadiga seonduvate valkude kaudu vahendatud transportsüsteem (binding protein-dependent system). Periplasmaatilised valgud seonduvad spetsiifiliste substraatidega nagu näiteks sulfaadid, aminohapped, suhkrud ja kannavad need sobivatele membraanseoselistele kompleksidele. Edasi toimub nende transportimine tsütoplasmasse läbi
surnud taimede lagunemine --- P; fotosüntees tõstab pH sette pinnal --- P; vähendavad turbulentsi; anaeroobsed tingimused --- P; resuspensioon ja P difusioon takistatud --- P; omastavad toiteaineid pigem settest kui veest; mõju sesoonne --- taimed neelavad P intensiivse kasvu ajal, P vabaneb sügisel ja talvel N/P suhe, limitatsioon - Fosforilimitatsioon tekib, kui molekulaarne N:P > 20:1. Suurtes madalates ja häguse veega järvedes varjutab valguslimitatsioon P- limitatsiooni Limitatsioon võib olenevalt rakkude jagunemise staadiumist ja valgustingimustest või temperatuurist erineda 2-4 korda, samuti on see ka liigiti erinev. Sinivetikad eelistavad N/P suhet < 10, samas võimelised P rakkudesse tagavaraks koguma ning võivad domineerida ka väga kõrge suhte juures Räni esinemine magevees - Lahustunud ränihapped [Si(OH)4] (esinevad Si väga kõrgel kontsentratsioonil), Partikulaarne (osakestega seotud) räni; Elusorganismide koostises peamiselt
RecA (DNA rekombinatsioon, reparatsioon, kõrvaldab repressori nende promootorite eest, mis kontrollivad DNA polümeraasi ja rekombinatsiooni) promootoril on heksameeride vaheala 16 bp transkriptsioonitase suureneb DNA positiivse supespiralisatsiooni korral. Näit. külmashoki puhul suureneb RecA valgu kogus rakus positiivse superspiralisatsiooni tõttu. 4. Selgitage mõne näite varal regulatoorseid mehhanisme bakterirakus, mis käivituvad aminohapete limitatsiooni korral. Transkriptsiooni regulatsioon attenuatsiooniga Enamasti on klassikaliseks attenuatsiooni näiteks toodud trp operoni transkriptsiooni regulatsioon. Operoni mRNA liiderjärjestuses on 4 regiooni, mille baasil võivad moodustuda alternatiivsed sekundaarstruktuurid. Regioonide 3 ja 4 paardumisel moodustub rho-sõltumatu transkriptsiooni terminaator. Omavahel võivad paarduda ka regioonid 1 ja 2 või 2 ja 3. Just regioonide 2 ja 3 paardumine takistab teminaatorstruktuuri moodustumist
Sigma70 abil ekspresseeritakse E. coli's enamikke geene. Teised, nn alternatiivsed sigma faktorid, on ekspresseeritud spetsiifilise stressi korral. Kõige üldisem alternatiivne 70 sigma faktor on S (38), mis vastutab üldise stressivastuse geenide transkriptsiooni aktivatsiooni eest. SigmaS ekspresseerub rakkudes kasvu aeglustumise faasis. Lämmastiku limitatsiooni vastuse geenide avaldumise eest vastutab N (54), raua limitatsiooni vastuse geenide avaldumise eest vastutab I. Kuumasoki ning pH soki vastuse geenide avaldumise eest vastutab H (32) ning liikumise (viburi) geenide avaldumise eest vastutab F (28). Sigma faktorid jagunevad tavaliselt kahte suurde perekonda. Suurem ja üldisem on sigmaD perekond, millest on evolutsiooni käigus tekkinud palju alternatiivseid sigma faktoreid, nagu S, H , F. Nendel sigma faktoritel on peale
annaabi.ee 
