erinevused Valkude biosüntees ehk valgussüntees ehk translatsioon … määrab tunnused ja mis reaktsioonid toimuvad/ei toimu Geneetiline kood on vastavus mRNA kolme järjestikuse nukleotiidi ja ühe aminohappe vahel (valgussünteesi võti), näiteks: AUG.UUU… ↓ ↓ Met Phe Geneetiline kood koosneb koodonitest Koodon - kolm järjestikust mRNA nukleotiidi “Koodipäike” - süsteem, mis aitab lahti mõtestada geneetilist koodu (õp. lk. 23) - Valgussüntees toimub ribosoomides (karedapinnalises tsütoplasmavõrgustikus, ER-il - Vaja on: - Ensüüme - Energiat (ATP, UTP jne.) - Kõiki aminohappeid (valgud toidust) - tRNA molekule (ristikulehelaadne sekundaarstruktuur) - Translatsiooni käik (õp. lk. 24)
erinevused Valkude biosüntees ehk valgussüntees ehk translatsioon … määrab tunnused ja mis reaktsioonid toimuvad/ei toimu Geneetiline kood on vastavus mRNA kolme järjestikuse nukleotiidi ja ühe aminohappe vahel (valgussünteesi võti), näiteks: AUG.UUU… ↓ ↓ Met Phe Geneetiline kood koosneb koodonitest Koodon - kolm järjestikust mRNA nukleotiidi “Koodipäike” - süsteem, mis aitab lahti mõtestada geneetilist koodu (õp. lk. 23) - Valgussüntees toimub ribosoomides (karedapinnalises tsütoplasmavõrgustikus, ER-il - Vaja on: - Ensüüme - Energiat (ATP, UTP jne.) - Kõiki aminohappeid (valgud toidust) - tRNA molekule (ristikulehelaadne sekundaarstruktuur) - Translatsiooni käik (õp. lk. 24)
Kuidas:1)mRNA ühineb ribosoomiga, ribosoom hakkab mõõda seda liikuma 2)ribosoom jõuab koodonini AUG, algab valgutootmine 3)selle koodoni juurde liigub komplementaarse anti koodoniga tRNA koos AH-ga 4)teise koodoni juurde liigub teine tRNA koos aminohappega GUA 5)kahe AH vahele sünteesitakse peptiidside 6)esimene tRna lahkub ribosoomist, ribosoom liigub edasi UCU 7)vaba koodoni juurde liigub uus tRNA koos AH-ga ja kõik kordub 8)valgu tootmine kestab, kuni ribosoom jõuab üks Stopp koodonitest UAA 9)valgu molekul ja mRNA eralduvad ribosoomist Geenide avaldumine-avaldub kui tema järgi toodetakse RNA molekule, korraga u.10% geenidest.Erinevate geenide avaldumine, tekitab erinevused rakkude vahel Geenide avaldumisel reguleerivad regulaatorgeenid-nende järgi toodetud valgud mõjutavad teiste geenide avaldumist. 1.repressorvalk-kinnitub geeni algusesse ja ei lase ensüümil kinnituda->geen ei avaldu 2.aktivaator valk- geen avaldub->on vajalik selle avaldumisel
translokatsiooni mööda ribosoomi pärast iga polüpeptiidi elongatsioonitsükli lõppu. Terminatsioon Terminatsiooni käigus peab vabanema valmissünteesitud peptiidahel ja ribosoomid tuleb vabastada kõigist tema ligandidest. Terminatsiooni- (ehk nonsense) ehk STOP-koodoneid on 3: • UAG - amber • UAA - ochre • UGA - opal Kui ribosoomi A-saiti satub üks nendest koodonitest ja P-saidis on peptidüül-tRNA, siis algab terminatsioon. Peptiidi vabanemisfaktor ehk klass I polüpeptiidi vabanemisfaktor (RF ehk release factor) peab seonduma, tundes ära A-saidis oleva STOP-koodoni. Katalüüsib ka peptidüül-tRNA hüdrolüüsi. retsükleerumine Ribosoomide retsükleerimine tähendab ribosoomine viimist sellisesse seisu, et nad võiksid jälle alustada uue peptiidahela sünteesi. Ribosoomi retsükleerimine – ribosoomid
Ehk AT muteerumine GC-ks – toimub GC sisalduse suurenemine. GC alleelide fikseerumist juhib kallutatud geenikonversioon. • • Duonid • Duon on topelt tähendusega koodon genoomis. Duonid on koodonid, millele seostuvad transkriptsioonifaktorid ning mis lisaks kodeerivad valgu kooseisu minevaid aminohappeid. • Osadel koodonitel – duonitel – võib olla kaks tähendust, üks seotud valgu järjestusega ja teine seotud geeniregulatsiooniga. 15% inimese koodonitest on dual- use koodonit ehk duonid. Duonid määratlevad samaaegselt aminohappeid ja transkriptsioonifaktorite äratundmissaite. Duonid on väga konserveerunud ja on kujundanud valkude evolutsiooni. Duonite puhul aminohapete jaoks alternatiivsete koodonite kasutamine ei ole juhuslik ja kallutatud. Koodonkasutus sõltub parima sobivusega transkriptsioonifaktorit siduvast motiivist. • Meioosi ‘eesmärgid’ võrreldes mitoosiga
mutatsiooniga geeni, mis on mikroobide kasvuks vajalik – selektsiooniskeem – „viga parandab vea“ printsiip SupE transleerivad ühte stoppkoodonit UAG. 31 SupD transleerib üht stoppkoodonit UAG. (alleel suure tähega märgitud – „D“) SupF transleerib üht stoppkoodonit UAG. Sup – tRNA geeni lookus - Surpressor tRNA võib transleerida lõppkoodoni; parandada raaminihke mutatsioone st sünteesib 4-tähelistest koodonitest aminohappe ahela. Valgusüntees – dünaamiline protsess, mille kiiruse määravad ära substraatide kontsentratsioon ja ensüüm – substraatkomplekside tekke kiirus ja tasakaal. Eriti aa- tRNA valiku juures. Valgusünteesi täpsuse määrab põhiliselt ribosoomi A saidis toimuv aa-tRNA selektsioon vastavalt eksponeeritud mRNA koodonile. aa-tRNA selektsioon: 1) kolmikkomplekside seondumise tasemel (EF-Tu GTP aa-tRNA) 2) peale EF-Tu suunatud GTP hüdrolüüsi aga enne peptiidsideme sünteesi
annaabi.ee 
