1. Oksüdoreduktaasid Redoksreaktsioonid Laktaadi · dehüdrogenaasid · elektronide, prootonite ülekandmine dehüdrogenaas · oksüdaasid · elektronide otsene ülekanne O2-le (LDH) · reduktaasid · H-aatomite ülekandmine · peroksüdaasid · e, p ülekandmine H2O2-le · katalaasid · H2O2 lõhustumine · oksügenaasid · O2 liitumine substraati 2. Trasferaasid Funktsionaalsete gruppide ülekanne Alaniin · aminotransferaasid · aminorühma ülekanne transminaad · kinaasid · fosfaatrühma ülekanne (ALT)
coli rakkudes on jälgitav Fis valgu taseme järsk tõus. Fis - mutantidel on väga pikk lag periood. SurB mutandid on samuti tundlikud statsionaarsest faasist väljumise suhtes. Statsionaarse faasi faktor S. S, geeni rpoS produkt (tuntud ka kui RpoS) on üks olulisi faktoreid nende geenide avaldumiseks, mida bakterid vajavad tingimustes, kus nende kasv on pärsitud. RpoS-i poolt on mõjutatud paljud bioloogilised protsessid: 1) Stressi taluvus Oksüdatiivse stressi vastus (katalaasid, glutatiooni reduktaas, superoksiidi dismutaas); Dps Trehhaloosi süntees; trehhaloos on osmoprotektant ja tagab kuumataluvuse; Happe resistentsus Etanooli resistentsus 2) Rakkude programmeeritud suremine (enteritsidiini lookus ecnAB kodeerib antidoot/toksiin süsteemi. 3) Rakukest, morfoloogia RpoS mõjul on rakud väiksemad, sfäärilisemad (soodustab bolA transkriptsiooni, bolA reguleerib pBP6 avaldumist. PBP6 on karboksüpeptidaas, mis on vajalik raku
Eeldab valkude lahtipakkimist. Signaaljärjestus seostub retseptoriga välismembraanil ning translokaator aktiveerub. Seondumine TIM kompleksiga toimub kohe, kui välimine membraan on läbitud. Transport lõppeb signaaljärjestuse eemaldamise ja valgu pakkimisega mitokondrites. ● Tsütosool – peroksüsoomid (transmembraanne) kasutavad hapnikku orgaaniliste ainete oksüdeerimiseks tekitades vesinikperoksiidi H2O2. Katalaasid kasutavad tekkivat H2O2 mitmete ainete – fenoolid, sipelghape, formaldehüüd, alkohol, oksüdeerimiseks. Transport toimub signaaljärjestuse alusel, membraani translokaatorite vahendusel, ei vaja lahtipakkimist, on posttranslatsiooniline. ● Tsütosool – ER (transmembraanne), transpordiks on vajalik ER signaaljärjestus, lisaks on vajalik signalrecognition particle SRP, mis tunneb ära ühelt poolt ER-I
Neil oksüdoreduktaasidel, mida vajatakse nii aeroobsetes kui ka anaeroobsetes tingimustes, on Fe2+ asemel aktiivtsentris Zn2+. Superoksiidi dismutaasid on esindatud peaaegu kõigis aeroobsetes bakterites. Leitud on nii Fe3+ kui ka Mn3+ seoselisi ensüüme. Bakteris E. coli on olemas mõlemad SOD-id. Fe-seoseline SOD ekspresseerub nii aeroobsetes kui ka anaeroobsetes tingimustes, Mn-seoseline (SodA) on aga indutseeritud ainult rakkude aeroobse kasvu korral. Katalaasid on esindatud nii aeroobsetes kui ka fakultatiivselt anaeroobsetes bakterites. Bakteris E. coli asuvad reaktiivse hapniku kahjutustamisel osalevaid ensüüme kodeerivad geenid kahes oksüdatiivse stressi modulonis, mida kontrollivad SoxS ja OxyR. SoxS modulon soxSR geenid on vastassuunaliselt transkribeeritavad. SoxR on FeS-sisaldav valk, mis kontrollib SoxS geeni transkriptsiooni. SoxR aktiveerub vastusena signaalile, milleks on kas O 2- või NO. Seejärel aktiveerib