DNA sünteesi käigus, mille läbi viivaks ensüümiks on DNA polümeraas. DNA paljundamiseks kasutab see PCR- meetodit. Reaktsiooni keskkonnaks on veetilga sarnane emulsioon(õlitilk), kus igas üksikus tilgas paljundatakse DNA lõiku. Iga nukleotiidi lisandumisel uude ahelasse vabaneb prüofosfaat. Pürosfaat on substraadiks erinevate reaktsioonide toimumiseks, mille tulemusel vabaneb valguskiirus, mis registreeritakse ja tänu millele saab järjestada terve ahela. Illumina Solexa tehnoloogia puhul algab töö genoomse DNA fragmeteerimisega ultraheli vahendusel, mille tulemusel saadakse suhteliselt ühtlase pikkusega DNA segu. Seejärel liidetakse nende DNA lõikude otstesse adapteroligonukleotiidid ja puhastatakse. Nüüd järgneb DNA amplifitseerimine, mis Illumina platvormi puhul toimub tahkele kandjale seotult. Selleks kasutatakse nn. Flow-Cell-i, kus paiknevad adapteritega komplementaarsed oligonukleotiidid, millele liidetakse DNA fragmendid
lõpetab DNA-fragmendi sünteesi kas A-, G-, C- või T-terminaatoriga. Ahela terminaatoritena kasutatakse enamasti ddTNP-sid, kus puuduvad 3-OH rühmad. 32. Kirjeldage pürosekveneerimise protseduuri. 4:15-22. DNA mass- sekveneerimise meetod, kus erinevalt Sangeri didesoksüribonukleotiididega DNA-ahela sünteesi terminatsioonist kasutatakse sünteesiga järjestamist, mispuhul detekteeritakse nukleotiidide lülitamisel toimuvat pürofosfaadi vabanemist. 33. Kirjeldage Illumina sekveneerimise protseduuri. 4:23. 5:5-10. Kiibil on nukleotiidid ja DNA polümeraas. Need nukleotiidid on fluorestsentsiga märgistatud, kus teatud värv vastab alusele. Neil on ka terminaator, nii et lisatakse ainult üks nukleotiid korraga. Kiipidest tehakse pilt. Igas lugemiskohas on fluorestsentssignaal, mis näitab lisatud nukleotiidi. Seejärel valmistatakse kiip ette järgmiseks tsükliks. Terminaatorid eemaldatakse, et saaks lisada järgmist nukleotiidi
heterokromatinisatsioon) uurimine. 9. Genoomika tüübid Funktsionaalne genoomika Võrdlev genoomika Arvutigenoomika Metagenoomika a. Struktuurne genoomika b. Personnaalne genoomika 10. Mikrokiiptehnoloogia DNA-mikrokiiptehnoloogia (ingl. DNA microarray technology)- Molekulaarbioloogias kasutatav multiplekstehnoloogia, kus tahkele kandjale (klaas, silikon Affymetrix-kiipidel või kuulikestele Illumina platformil) kovalentselt kinnitatud kümneid tuhandeid spetsiifilisi oligonukleotiidseid järjestusi hübriiditakse spetsiifiliste cDNA- või cRNA-proovidega. 11. Immuunsüsteemid immuunsüsteem (ingl. Immune system)- Organismide bioloogiliste struktuuride ja protsesside süsteem, mis kaitseb organismi haiguste eest, tappes patogeene ja kasvajarakke. Kemikaalid, viirused, kiirgused, bakterid. 12. Kaasasündinud immuunsus Kaasasündinud immuunsus a
496 Chapter 28 psychrotroph. After ingestion of large The organism grows on simple laboratory numbers of this organism, the susceptible media in the pH range between 5 and 9. On person can develop fever, abdominal pain, solid agar, the colonies are translucent, dew- and diarrhea, with nausea and vomiting drop-like, and bluish when viewed by 45° occurring less frequently. More serious intes- incident transmitted light (Henry’s illumina- tinal disorders include enteritis, terminal tion step). Biochemically, this organism can ileitis, and mesenteric lymphadenitis. Extr- be confused with such organisms as aintestinal infections of Y. enterocolitica Lactobacillus, Brochothrix, Erysipelohrix, have been reported, including septicemia, and Kurthia. A variety of biochemical tests arthritis, erythema nodosum, sarcoidosis, have been devised to separate L. monocyto- skin infection, and eye infection
annaabi.ee 
