4., parandatud tr. New York: Wiley-Liss inc. , 715 lk. 2. Zuckerman, M., Roitt, I.M., Mims, C.A., Goering, R.,Dockrell, H., Wakelin, D. 2004. Medical Microbiology. 3., parandatud tr.London: Mosby, 648 lk. 3. Wong, S.M., Alugupalli, K.R., Ram, S., Akerley, B.J. The ArcA regulon and oxidative stress resistance in Haemophilus influenzae. Molecular microbiology 2007 June; 64(5): 13751390. 4.Lee, J.W., Helmann, J.D. The PerR transcription factor senses H2O2 by metal-catalysed histidine oxidation. Nature 2006 March; 440: 363-367. 5.Imlay,J.A. How obligatory is anaerobiosis? Molecular microbiology 2008 May;68(4):801-804. 6. Paustian, T. Summary of Catabolism. ( http://dwb.unl.edu/Teacher/NSF/C11/C11Links/ www.bact.wisc.edu /microtextbook/metabolism/SummaryCatab.html) 7. Todar, K. Todar's Online Textbook of Bacteriology. (http://www.textbookofbacteriology.net/)
B., Wickens, C., Khan, M., Cowen, L. E., Federspiel, N., Jones, T. & Kohn, L.M. 2001. Infrequent genetic exchange and recombination in the mitochondrial genome of Candida albicans. Journal of Bacteriology 183: 865-872. Awadalla, P., Eyre-Walker, A. & Smith, J. M. 1999. Linkage disequilibrium and recombination in hominid mitochondrial DNA. Science 286: 2524-2525. Brinkman, F. S., Macfarlane, E. L., Warrener, P. & Hancock, R. E. 2001. Evolutionary relationships among virulence-associated histidine kinases. Infection and Immunity 69: 5207-5211. Brown, J. R. & Doolittle, W. F. 1999. Gene descent, duplication, and horizontal transfer in the evolution of glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases. Journal of Molecular Evolution 49: 485-495. Garcia-Vallve, S., Romeu, A. & Palau, J. 2000. Horizontal gene transfer of glycosyl hydrolases of the rumen fungi. Molecular Biology and Evolution 17: 352-361. Carbone, I., Anderson, J.B. & Kohn, L.M. 1995
membraani sise- ja väliskülje vahel Na+ ioonide potentsiaal. Energiaallikaks on näiteks oksaloatsetaat. Selline süsteem on kirjeldatud bakteril Klebsiella pneumoniae. Mõnikord on ka PTS toodud ka primaarsete transporterite alla. Transpordi käigus toimub fosfoenoolpüruvaadi PEP hüdrolüüs. Kui suhkur seondub transporteriga, ta fosforüleeritakse. Fosforüülrühm pärineb PEP-ilt ja kantakse üle proteiini kinaasi Ensüüm I (EI) ning fosfoaktseptorvalkude HPr (Histidine Protein) ja Ensüüm II (EII) abil. EI ja HPr on kõigi PTS-de puhul ühised, EII on substraadile spetsiifiline. Sekundaarne transportsüsteem võimaldab molekulidel läbida membraani olemasoleva, primaarse transportsüsteemi abil loodud ioongradiendi arvelt, kasutades näiteks prootonpotentsiaali (mõnikord ka Na +- ioonide potentsiaali). Üheks kõige paremini iseloomustatud süsteemiks on laktoosi transport rakku laktoosi permeaasi LacY abil
PEP hüdrolüüs. Substraadi transportimisega rakku kaasneb selle keemiline modifitseerimine, kus substraat fosforüülitakse. Praeguseks on iseloomustatud üle 20 erineva süsteemi, mis võimaldavad rakku tuua erinevaid suhkruid või nende alkohole (näiteks mannitool, glükoos, mannoos). Kui suhkur seondub transporteriga, ta fosforüleeritakse. Fosforüülrühm pärineb PEP-ilt ja kantakse üle proteiini kinaasi Ensüüm I (EI) ning fosfoaktseptorvalkude HPr (Histidine Protein) ja Ensüüm II (EII) abil. EI ja HPr on kõigi PTS-de puhul ühised, EII on substraadile spetsiifiline. EII-l on identifitseeritud 3 autonoomset domääni. Hüdrofiilne domään IIA (varem tuntud ka nimetuse all EIII või III) sisaldab esimest fosforüleerimise saiti (P~His). Hüdrofiilne domään IIB sisaldab teist fosforüleerimise saiti (P~Cys, mõnedel ensüümidel ka P~His). Membraanseoseline hüdrofoobne transporterdomään IIC võib osade substraatide puhul (näiteks mannoos)
18 Chapter 1 calcium, sodium, and potassium pumps to that is involved in increasing the tenderness function; and (4) an increasing inability of of fresh meat and in influencing fresh meat the cell to maintain reducing conditions. All water-holding capacity (Huff-Lonergan and these changes can have a profound effect on Lonergan 2005). Because μ-calpain and numerous proteins in the muscle cell. The m-calpain enzymes contain both histidine role of energy depletion and pH change have and SH-containing cysteine residues at their been covered in this chapter and in other active sites, they are particularly susceptible reviews (Offer and Trinick 1983; Offer and to inactivation by oxidation (Lametsch et al. Knight 1988a). What has not been as thor- 2008). Therefore, oxidizing conditions in oughly considered is the impact of other postmortem muscle lead to inactivation or
annaabi.ee 
